BIOLOGÍA MOLECULAR: GENÓ GENÓMICA, MICA PROTEÓ PROTEÓMICA Y METABOLÓ METABOLÓNICA T-traducción (1) (2) (3) Proteina Genoma Transcriptoma Proteoma Metabolitos y macromoléculas Metaboloma BIOLOGÍA MOLECULAR: toda la informació información está está en el DNA T-traducción y en base a ella se sintetizan los RNAs y despué después las proteinas (1) (1) (2) (2) (3) (3) (3) Traducción del mRNA: síntesis del proteínas (µµ-grafía) T-traducción El DNA se transcribe y a continuación el mRNA se traduce en los ribosomas (rRNA) y con los AA que transporta el tRNA se sintetizan las proteínas Síntesis de proteínas: Elementos que citoplasma participan y DIFERENCIAS ENTRE PROCARIOTAS Y EUCARIOTAS PROCARIOTAS transcripción traducción inmediata 5’ proteína ribosoma naciente DNA RNA transcrito = mRNA EUCARIOTAS traducción 3’ citoplasma transcripción 1 núcleo 2 1: maduración o procesamient postranscripc del RNA 2: transporte 5’ 5’ proteína naciente DNA mRNA RNA transcrito primario ribosoma T-traducción Organizaci ón celular de eucariotas Organización celular de eucariotas Síntesis de proteínas (esquema) rRNA T-transcripción mRNA Los tres tipos de RNA participan en la síntesis de proteínas El mRNA se traduce en los ribosomas (rRNA) para la síntesis de proteínas con los AA que transporta el tRNA rRNA tRNA Síntesis de proteínas: •El mRNA que Elementos que participan tiene el mensaje •el tRNA que lleva a los AAs •los ribosomas T-traducción •AAs •Algunas enzimas •Algunos factores rRNA rRNA tRNA mRNA Síntesis de proteínas, FASES: (0)Activación, (1)iniciación, (2)elongación y (3)terminación Resumen de la traducción T-traducción N aa activación N aa-tRNA iniciación N–1 1 complejo de iniciación un polipéptido de N aminoácidos necesita N – 1 enlaces peptídicos 1 N-1 ciclos de elongación terminación 1 polipéptido = (aa)N N–1 Síntesis de proteínas: Activación de AAs o síntesis de aminoacil-tRNA T-traducción PPi AMP ATP aa aa 1) activación aa AMP 2) unión tRNA aminoacil-tRNA sintetasa aminoacil-tRNA Síntesis de proteínas: Reacción de activación de AAs o síntesis de aminoacil-tRNA T-traducción Enzima = aminoacil-tRNA sintetasa = aminoácido-tRNA ligasa (EC 6.1.1.x) Resumen de las reacciones Primera reacción: activación del aminoácido Mg2+ R-CH(NH2)-COOH + AMP-P-P + Enzima → Enzima-AMP-CO-CH(NH2)-R + PPi (aminoácido) (ATP) (aminoacil-AMP-Enzima) el grupo carboxilo del aminoácido se une con el grupo adenilato del ATP, que se hidroliza intermediario que permanece unido al centro activo el grupo amino permanece libre ∆Gº’ = -32,2 kJ/mol ambas reacciones son exergónicas Segunda reacción: unión con el tRNA Mg2+ Enzima-AMP-CO-CH(NH2)-R + tRNA-OH → tRNA-O-CO-CH(NH2)-R + AMP + Enzima (aminoacil-AMP-Enzima) (aminoacil-tRNA) el grupo aminoacilo se transfiere desde el intermediario hacia el tRNA el grupo amino permanece libre ∆Gº’ = +29,0 kJ/mol la reacción es endergónica Reacción total: Aminoácido + ATP + tRNA → Aminoacil-tRNA + AMP + 2 Pi el aminoacil-tRNA es una forma activada, de alta energía, del aminoácido ∆Gº’ = -36,6 kJ/mol la reacción neta es exergónica tRNAs se cargan con AAs (representaciones) El tRNA es el mediador entre el mensaje del mRNA y la secuencia de aminoácidos del polipéptido que se está sintetizando: 3’ brazo del 5’ aminoácido ribosoma tRNA T-traducción interacción con un aminoácido Por eso le llaman: 2º código genético brazo del anticodón interacción con el mRNA Tripletes: codón y anticodón mRNA (codones) Localización de la síntesis de proteínas: RIBOSOMAS y sus lugares T-traducción Cada ribosoma tiene 2 subunidades: grande = 50S y Pequeña = 30S En el ribosoma hay 3 lugares donde puede unirse un tRNA (regla mnemotécnica: EPA, leído de 5’ a 3’ del mRNA) sitio E (exit, salida) ribosoma sitio P (peptidilo) sitio A (aminoacilo) 5’ 3’ mRNA 1ª fase de la síntesis de proteínas: iniciación T-traducción El tRNA iniciador, cargado con MET (F), se une al codón de inicio, triplete en el mRNA; unido a su vez con la subunidad 30S del ribosoma. Complejo de iniciación 30S Formado por la subunidad 30S del ribosoma, unido al mRNA y en el codón de inicio unido el tRNA cargado con MET Tripletes: codón y anticodón mRNA (codones) Iniciación T-traducción Sigue con la unión de la subunidad 50S del ribosoma, donde se localizan los lugares A y P; A: aminoacilo y P: peptidilo P Complejo de iniciación 70S Formado por las dos la subunidades del ribosoma, el mRNA y el tRNA de la MET unido al codón de inicio A 2ª fase de la síntesis de proteínas: elongación En el lugar A se une un nuevo aminoácido (el que codifique el triplete siguiente) y se forma un enlace peptídico catalizado por la peptidil-transferasa T-traducción P P A A peptidil-transferasa 2ª fase de la síntesis de proteínas: translocación El ribosoma se desplaza (TRANSLOCA) sobre el mRNA la distancia correspondiente a un triplete. T-traducción Como consecuencia, el peptidil-tRNA situado en el lugar A se transfiere o desplaza hasta el lugar P, haciendo que el tRNA que estaba en P salga del complejo (lugar E) P A 2ª fase de la síntesis de proteínas: T-traducción elongación Entrada de un nuevo AA-tRNA en el lugar A, el correspondiente al que codifique el siguiente triplete del mRNA para formar un nuevo enlace peptídico. P A Ciclos de Elongación El ciclo se repite, la cadena peptídica va creciendo hasta llegar a un triplete codón de terminación; ahí terminará el proceso. T-traducción Ciclo de Elongación: unión del aminoacil-tRNA, enlace peptídico, translocación y salida del tRNA T-traducción Unión del Aminoacil-tRNA Formación Enlace peptídico translocación Comienza un nuevo ciclo de elongación Disociación tRNA Factor elongación G T-traducción Síntesis de proteínas Iniciación Elongación Se aprecia la intervención de factores Y de GTP T-traducción Elongación y terminación Se aprecia la intervención de factores y De GTP 2ª fase de la síntesis de proteínas: T-traducción En todos los casos, Actúan factores proteicos: •Factores de iniciación •Factores de elongación •Factores de terminación y energía (GTP) . Terminación Orto modelo de Código genético para traducir el mRNA T-traducción Síntesis de proteínas *** animación T-traducción El proceso de síntesis requiere además de otros factores proteicos: •Factores de iniciación •Factores de elongación •Factores de terminación y de energía (GTP) . Síntesis de proteínas T-traducción Met aa GDP 1α α peptidiltransferasa (una ribozima: en procariotas es el rRNA 23S de la subunidad mayor; en eucariotas se supone que es el rRNA 28S) paso 5 TRANSPEPTIDACIÓN Met aa T-traducción Met aa GTP GTP translocasa paso 6 eEF2 ≡ eEF2 GTP TRANSLOCACIÓN Pi Met GDP aa ciclo del factor eEF-2 GDP GDP translocasa ≡ eEF2 eEF2 Met aa tRNAs libres Replicación, Transcripción y síntesis de proteínas en procariotas T44-transcripción T-traducción T-traducción Organización de genes y regulación de la síntesis de proteínas OPERON LACTOSA