COMPLEMENTARIEDAD CON ESTADO DE TRANSICIÓN

COMPLEMENTARIEDAD CON ESTADO DE TRANSICIÓN
INTERACCIONES DÉBILES ENTRE ENZIMA Y SUSTRATO EN ESTADO DE TRANSICIÓN
PROVEEN UNA GRAN CANTIDAD DE LA FUERZA NECESARIA PARA LA ACTIVIDAD
CATALÍTICA DE LAS ENZIMAS
CATÁLISIS ÁCIDO-BASE: ESPECÍFICA VS. GENERAL
3
AMINO ÁCIDOS EN CATÁLISIS GENERAL ÁCIDO-BASE
4
“
“Velocitá d’automobile”
Giacomo Balla
1913
ENZIMAS CINÉTICA
OBJETIVOS DE APRENDIZAJE:
Capítulo 6 // Secciones 6.3
1.  Entender como la concentración de sustrato afecta la tasa a la que ocurren las
reacciones catalizadas por enzimas.
2.  Analizar, interpretar y aplicar la expresión cuantitativa de la relación entre
concentración de sustrato y la tasa a la que ocurre la reacción.
3.  Entender y aplicar los parámetros cinéticos usados para comparar reacciones
enzimáticas. (“turnover number” y constante de especificidad)
4.  Analizar, interpretar y aplicar la expresión cuantitativa del efecto de los
diferentes tipos de inhibidores en la cinética enzimática.
5.  Entender y reconocer ejemplos de inhibidores irreversible.
ENZIMAS: AGENTES CATALÍTICOS QUE AUMENTAN LA TASA DE
LA REACCIÓN
(NO EL EQUILIBRIO)
INTERMEDIARIOS
http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/24/Induced_fit_diagram.svg/450px-Induced_fit_diagram.svg.png
DEPENDENCIA DE LA CONCENTRACIÓN DE SUSTRATO EN LA
TASA DE LA REACCIÓN
PASO LIMITANTE
ECUACIÓN MICHAELIS-MENTEN
EXPRESIÓN DE V
O
EN TÉRMINOS DE
PARÁMETROS
OBSERVABLES
PASO 1: FORMACIÓN Y DESCOMPOSICIÓN DE ES
PASO 2: SUPOSICIÓN DE ESTADO ESTABLE (STEADY-STATE ASSUMPTION)
PASO 3: RESOLVER POR ES
EXPRESIÓN DE V
O
EN TÉRMINOS DE
PARÁMETROS
OBSERVABLES
PASO 3: RESOLVER POR ES
= CONSTANTE MICHAELIS, Km
PASO 4: SUBSTITUIR V POR ES
O
ECUACIÓN MICHAELIS-MENTEN (TASA)
Expresión de la relación cuantitativa entre Vo, Vmax, la concentración
inicial de sustrato, todo relacionado por Km.
= CONSTANTE
MICHAELIS, Km
V
O
DEPENDE DE LA
[S]
VARIABILIDAD DE Km ENTRE ENZIMAS
GRÁFICA LINEWEAVER-BURK
DOBLE RECÍPROCO (BOX 6–1)
INTERPRETACIONES DE Km
k2 PASO LIMITANTE
k2 PASO LIMITANTE
INTERPRETACIONES DE Vmax
Kcat =Turnover Number
Numero de sustratos convertidos a producto en una unidad de tiempo por una sola enzima
cuando esta saturada por sustrato
Kcat/Km
CONSTANTE DE ESPECIFICIDAD (SPECIFICITY CONSTANT)
ENZIMAS CON MÚLTIPLES SUSTRATOS
HEXOKINASA
MECANISMO PING-PONG O DOBLE DESPLAZAMIENTO
ENZIMAS CON MÚLTIPLES SUSTRATOS
INHIBICIÓN
http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/4/42/COX-2_inhibited_by_Aspirin.png
INHIBICIÓN REVERSIBLE
INHIBICIÓN REVERSIBLE
INHIBICIÓN REVERSIBLE
TAREA PARA EL LUNES
CONVERTIRSE EN EXPERTOS
SECCIÓN 6.4 DEL LIBRO (FINAL DE 6.2)
1. 
2. 
3. 
4. 
5. 
6. 
QUIMOTRIPSINA
PROTEASA DE VIH
HEXOKINASA
ENOLASA
LISOZIMA
TRANSPEPTIDASA
TAREA PARA EL VIERNES
INHIBICIÓN IRREVERSIBLE
INHIBIDORES IRREVERSIBLES
DIISOPROPILFLUOROFOSFATO (DIFP)
INHIBICIÓN IRREVERSIBLE
INACTIVADORES SUICIDAS
INACTIVADORES BASADOS EN MECANÍSMO
Trypanosoma brucei rhodesiense
ENFERMEDAD DEL SUEÑO AFRICANO
ENFERMEDAD DEL SUEÑO AFRICANO
ANALOGO DE ESTADO DE TRANSICIÓN
ACTIVIDAD ENZIMÁTICA DEPENDE DEL pH