Epidat 3.1
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Soly Santiago Pérez Dirección Xeral de Innovación e Xestión da Saúde Pública Junio 2011 Epidat: programa para análisis estadístico y epidemiológico de datos. Versión 3.1 Índice 1. ¿Qué es Epidat? 2. Objetivos de Epidat 3. Características de Epidat 3.1 – Entorno general – Contenido – Ayuda 4. Ejemplos 5. Resumen 3 1. ¿Qué es Epidat? 4 1. ¿Qué es Epidat? • Análisis epidemiológico y estadístico de datos • No gestiona bases de datos • Libre distribución 5 1. ¿Qué es Epidat? Trayectoria del programa Epidat 1.0 Diciembre 1994 Epidat 2.0 Junio 1997 Epidat 2.1 Junio 1998 http://dxsp.sergas.es 6 Epidat 3.0 Marzo 2004 Epidat 3.1 Enero 2006 Epidat 4.0 Abril 2011 2. Objetivos de Epidat 7 2. Objetivos • Aportar una herramienta de manejo sencillo y de utilidad para el análisis estadístico y epidemiológico de datos. • Apoyar y facilitar la docencia en epidemiología y estadística. • Fortalecer la capacidad analítica de los profesionales. • Servir como fuente para la formación autodidacta en zonas escogidas de la estadística aplicada a la epidemiología. 8 3. Características de Epidat 3.1 9 3. Características de Epidat 3.1 ENTORNO GENERAL CONTENIDO AYUDA IDIOMA 10 • • • • Español Gallego Portugués Inglés 3. Características de Epidat 3.1 Entorno general DISEÑO Entorno habitual de Microsoft Office, con barras de menús y herramientas 11 3. Características de Epidat 3.1 Entorno general MENU METODOS 12 módulos 91 ventanas 12 3. Características de Epidat 3.1 Entorno general ENTRADA DE DATOS • Entrada manual • Entrada automática: Excel, Access, Dbase 13 3. Características de Epidat 3.1 Entorno general RESULTADOS Cuadro de texto en cada módulo Calcular 14 3. Características de Epidat 3.1 Entorno general RESULTADOS • Ventana de resultados generales • Los resultados pueden guardarse en formato rtf 15 3. Características de Epidat 3.1 Contenido 1. Ajuste de tasas 2. Demografía 3. Muestreo 4. Distribuciones de probabilidad 5. Concordancia y consistencia 6. Pruebas diagnósticas 7. Tablas de contingencia 8. Inferencia sobre parámetros 9. Análisis bayesiano 10. Vigilancia en salud pública 11. Metaanálisis 12. Jerarquización 16 Epidat 4.0 3. Características de Epidat 3.1 Ayuda • Enfoque didáctico y crítico, incluyendo fundamentos estadísticos y epidemiológicos. • Disponible en formato pdf en la web de descarga del programa. 17 4. Ejemplos 18 4. Ejemplos 1. Ajuste de tasas 2. Demografía 3. Muestreo 4. Distribuciones de probabilidad 5. Concordancia y consistencia 6. Pruebas diagnósticas 7. Tablas de contingencia 8. Inferencia sobre parámetros 9. Análisis bayesiano 10. Vigilancia en salud pública 11. Metaanálisis 12. Jerarquización 19 4. Ejemplos Pruebas diagnósticas • Pruebas simples • Pruebas múltiples • Prueba de referencia imperfecta • Curvas ROC • Simples • Comparación de curvas • Curva de Lorenz 20 4. Ejemplos Pruebas diagnósticas 21 4. Ejemplos Nivel de confianza: 22 Pruebas diagnósticas 95,0% Prueba diagnóstica -------------------Positivo Negativo -------------------Total Prueba de referencia Enfermos Sanos Total --------- --------- --------45 6 51 2 28 30 --------- --------- --------47 34 81 ------------------------Sensibilidad (%) Especificidad (%) Índice de validez (%) Valor predictivo + (%) Valor predictivo - (%) Prevalencia (%) Valor ---------95,74 82,35 90,12 88,24 93,33 58,02 Índice de Youden Razón de verosimilitud + Razón de verosimilitud - 0,78 5,43 0,05 IC (95%) -------------------------88,91 100,00 68,07 96,64 83,01 97,24 78,41 98,06 82,74 100,00 46,66 69,39 0,64 2,62 0,01 0,92 11,24 0,20 4. Ejemplos Pruebas diagnósticas 23 4. Ejemplos Número de categorías: Nivel de confianza: Área ROC ---------0,8941 24 EE ---------0,0258 0,0274 4 95,0% Pruebas diagnósticas IC(95%) ------------------------0,8435 0,9446 0,8404 0,9477 Delong Hanley & McNeil 4. Ejemplos Tablas de contingencia Exposición‐enfermedad • Tablas 2×2 • Simples • Estratificadas • Tablas 2×N • Simples • Estratificadas Tablas generales • Tablas M×N • Regresión logística 25 4. Ejemplos Tablas de contingencia 26 4. Ejemplos Tipo de estudio : Cohortes Tipo de datos : Incidencia acumulada Nivel de confianza: 95,0% Tablas de contingencia Tabla -----------Expuestos No expuestos -----------Total 27 Enfermos -------202 81 -------283 Sanos -------2014 2811 -------4825 Total -------2216 2892 -------5108 ---------------------------------------Riesgo en expuestos Riesgo en no expuestos Riesgo relativo Diferencia de riesgos Odds ratio Estimación ---------0,091155 0,028008 3,254579 0,063147 3,480709 ---------------------------------------Fracción atribuible en expuestos Fracción atribuible poblacional ---------0,692741 0,494465 IC(95,0%) --------- --------2,530224 4,186305 0,049739 0,076555 2,672989 4,532505 2,674775 4,529406 --------- --------0,604778 0,761126 0,393302 0,578760 Prueba Ji-cuadrado de asociación ---------------------------------------Sin corrección Corrección de Yates Estadístico --------------95,5960 94,3932 Valor p --------0,0000 0,0000 4. Ejemplos Inferencia sobre parámetros • Una población • Media • Proporción • Percentiles • Correlación • Recuento • Tasa de incidencia • Dos poblaciones • Medias independientes • Medias emparejadas • Proporciones independientes • Proporciones emparejadas • Tasas de incidencia 28 4. Ejemplos Inferencia sobre parámetros 29 4. Ejemplos -------------------Media Desviación estándar Tamaño de muestra Inferencia sobre parámetros Muestra 1 ---------25,570 3,940 788 Muestra 2 ---------27,070 3,940 624 Prueba de comparación de varianzas Estadístico F -----------------1,0000 gl numerador --------------787 gl denominador --------------623 Diferencia de medias -------------------1,500 Varianzas ---------Iguales Distintas IC (95,0%) ---------------------1,086 1,914 1,086 1,914 Prueba de comparación de medias Varianzas Estadístico t ----------------------------------Iguales 7,1045 Distintas 7,1045 30 Valor p ------0,9977 gl Valor p ------- ------1410 0,0000 1336 0,0000 4. Ejemplos Meta‐análisis • • • • 31 Odds ratio Riesgo relativo Diferencia de riesgos Diferencia estandarizada de medias 4. Ejemplos Meta‐análisis 32 4. Ejemplos Meta‐análisis RESULTADOS INDIVIDUALES Y COMBINADOS Estudio ---------------------MCR-1 CDP MRC-2 GASP PARIS AMIS ISIS-2 ---------------------Efectos fijos Efectos aleatorios 33 Año ---1980 1982 1984 1986 1988 1990 1992 ---- n -----1239 1529 1682 626 1216 4524 17187 -----28003 28003 OR -----1,3894 1,4689 1,2455 1,2488 1,2529 0,8828 1,1174 -----1,1149 1,1412 IC(95,0%) ----------0,9440 2,0451 0,9870 2,1863 0,9408 1,6489 0,7584 2,0565 0,8674 1,8097 0,7284 1,0699 1,0355 1,2057 ----------1,0448 1,1898 1,0084 1,2915 Pesos(%) E. fijos E. al. ------------2,8235 8,2123 2,6677 7,8451 5,3594 13,2288 1,6957 5,3570 3,1200 8,8893 11,4199 20,7005 72,9137 35,7669 ------------- 4. Ejemplos Meta‐análisis 34 5. Resumen 35 5. Resumen • Epidat 3.1 es un programa de libre distribución desarrollado por instituciones públicas. • Está orientado al tratamiento de datos tabulados. • No permite la gestión de bases de datos. • Contiene técnicas específicas de epidemiología. • El manejo del programa es sencillo. • La ayuda es un elemento distintivo del programa. Soporte a usuarios: [email protected] 881 54 67 59 36
