FACULTAD DE CIENCIAS ·Universidad de Córdoba· Edificio de Gobierno (Campus de Rabanales) 14071-Córdoba Curso académico: 2014 - 2015 DATOS BÁSICOS DE LA ASIGNATURA Titulación: Asignatura: BIOQUIMICA Código: BIOTECNOLOGIA Curso en el que se imparte: Carácter: 5ª Créditos: (Anual, 1er ó 2º cuatrimestre) Totales LRU 9 ECTS 8 Idioma en el que se imparte: 4993 Español ANUAL Tipo: Teóricos Dirección web asignatura: Optativa (Troncal, Obligatoria, Optativa, Libre elección) Prácticos http://www3.uco.es/moodle/ DATOS BÁSICOS DE LOS PROFESORES Responsable ó coordinador: Nombre y apellidos Departamento Ubicación Área de conocimiento Ángel Llamas Azúa Bioquímica y Biología Molecular Edif. Severo Ochoa Bioquímica y Biología Molecular David González Ballester Bioquímica y Biología Molecular Edif. Severio Ochoa Bioquímica y Biología Molecular Otros: DATOS ESPECÍFICOS DE LA ASIGNATURA Descriptores BOE Situación Desarrollo de la biotecnología y microorganismos. Técnicas moleculares útiles en biotecnología. Búsqueda de nuevos metabolitos y de cepas Microbianas. Biotransformación .Producción de Biomasa microbiana. Producción de proteínas, enzimas y productos. Producción de metabolitos Secundarios. Plantas transgénicas. Mejora vegetal por DNA recombinante. Animales transgénicos. Anticuerpos monoclonales. Obtención de Proteínas recombinantes Vacunas sintéticas. Patentes. Bioética. Prerrequisitos: no hay Contexto dentro de la Titulación: Los conocimientos y competencias a adquirir en esta asignatura se sitúan dentro del contexto de la Licenciatura capacitando para desarrollar los conocimientos de Biotecnología molecular y sus aplicaciones a situaciones concretas actuales. Competencia s Recomendaciones: Para un seguimiento y aprovechamiento óptimo de la asignatura, se recomienda conocer las bases de la ingeniería genética. Asimismo, es importante y obligatoria la asistencia del alumno a las distintas actividades de la asignaturas: clases, laboratorio, tutorías, seminarios, etc Transversales/genéricas: Capacidad de análisis y síntesis Conocimientos de informática relativos al ámbito de estudio Trabajo en equipo Uso de Internet como medio de comunicación y como fuente de información Capacidad de entender el lenguaje y propuestas de otros especialistas Específicas: Cognitivas (saber): - Conocer como se determinan en el laboratorio biotecnológico los marcadores genéticos, moleculares y bioquímicos asociados a las diferentes aplicaciones biotecnológicas, y ser 1 FACULTAD DE CIENCIAS ·Universidad de Córdoba· Edificio de Gobierno (Campus de Rabanales) 14071-Córdoba capaz de evaluar de forma crítica como pueden usarse en el diagnóstico y en el pronóstico de las enfermedades. - Conocer los principios de manipulación de los ácidos nucleicos, así como las principales técnicas que permiten el estudio de la expresión y función de los genes. - Poseer las habilidades “cuantitativas” para el trabajo en el laboratorio bioquímico y biotecnológico, incluyendo la capacidad de preparar reactivos para experimentos de manera exacta y reproducible. Procedimentales/instrumentales (saber hacer): -- Capacidad para trabajar de forma adecuada en un laboratorio biotecnológico con material biológico y químico, incluyendo seguridad, manipulación, eliminación de residuos biológicos y químicos, y registro anotado de actividades. -Destreza en el manejo de métodos de ingeniería genética -Manipular con seguridad materiales biológicos transgénicos. -Manejo de instrumentación estándar como la que se utiliza para investigaciones moleculares - Análisis informáticos de secuencias Actitudinales (ser): -Reconocer y valorar los procesos bioquímicos y biotecnológicos en la vida diaria.-Interpretar datos, plantear hipótesis y llegar a conclusiones -Contrastar críticamente la información del trabajo del laboratorio con el obtenido de distintas fuentes. -Reconocer y valorar los procesos moleculares de los organismos en la vida diaria. -Ordenar, priorizar, explicar conceptos e ideas de forma autónoma -Compromiso ético del trabajo molecular Objetivos Metodología Nº de horas de trabajo del alumno Esta asignatura tiene como finalidad el formar al alumno en las aproximaciones moleculares relacionadas con el material genético, su replicación, transcripción, traducción y reparación. Además es un objetivo fundamental el iniciar y formar en la metodología, y posibilidades de las técnicas de ingeniería genética que son de uso rutinario en biotecnología. Primer cuatrimestre (nº de horas): Clases teóricas: Clases prácticas: Exposiciones y seminarios: Tutorías especializadas (presenciales o virtuales): A) Colectivas: B) Individuales: Realización de actividades académicas dirigidas: A) Con presencia del profesor: B) Sin presencia del profesor: Otro trabajo personal autónomo: A) Horas de estudio: B) Preparación de trabajo personal: C) … Realización de exámenes A) Examen escrito: B) Exámenes orales (control del trabajo personal): C) Examen práctico: Segundo cuatrimestre (nº de horas): Clases teóricas: Clases prácticas: Exposiciones y seminarios: Tutorías especializadas (presenciales o virtuales): A) Colectivas: 2 FACULTAD DE CIENCIAS ·Universidad de Córdoba· Edificio de Gobierno (Campus de Rabanales) 14071-Córdoba B) Individuales: Realización de actividades académicas dirigidas: A) Con presencia del profesor: B) Sin presencia del profesor: Otro trabajo personal autónomo: A) Horas de estudio: B) Preparación de trabajo personal: C) Actividades de trabajo no presencial: Realización de exámenes A) Examen escrito: B) Exámenes orales (control del trabajo personal): C) Examen práctico: Técnicas Docentes Señalar con una X las técnicas que va a utilizar en el desarrollo de la asignatura Bloques temáticos Dividir el temario en bloques (sin nº máximo ni mínimo) Bibliografía Sesiones académicas teóricas X Sesiones académicas prácticas X Exposición y debate X Visitas y excursiones Tutorías especializadas X Otras (indicar) X Trabajo en el laboratorio de informática, para análisis de secuencias, genomas, estructuras, etc. INTRODUCCIÓN I. Tecnología del DNA recombinante II. Biotecnología microbiana III. Biotecnología vegetal IV.Biotecnología animal V. Otros aspectos de la Biotecnología VI. Aspectos sociales de la Biotecnología Bibliografía de Teoría BIOTECHNOLOGY APPLICATIONS AND RESEARCH, P. N. Cheremisinoff and R.P. Ouellette (eds.), Technomic Publishing Company Inc., Pensilvania, 1985 MOLECULAR BIOTECHNOLOGY, S.B. Primrose, 2nd ed. Blackwell, Oxford 1991 MOLECULAR BIOTECHNOLOGY. PRINCIPLES & APPLICATIONS OF RECOMBINANT DNA, B.R. Glick y J.J. Pasternak, ASM Press, Washington, 1994 BIOLOGIA MOLECULAR Y BIOTECNOLOGIA. J.M. Walker y E.B. Gingold, 2ª ed. 1997 ANTIBODIES: A PRACTICAL APPROACH, D. Catty, IRL Press, Oxford, 1988 BIOTECHNOLOGIE, R. Scriban, 4e ed. Technique et Documentation, Paris, 1993 BIOTECHNOLOGY. THE BIOLOGICAL PRINCIPLES, M.D. Trevan, S. Boffey, K.H. Goulding and P. Stanbury, Open University Press, Milton Keynes, 1987 BIOTECHNOLOGY. THE RENEWABLE FRONTIER, D.E. Koshland (ed.), AAAS Publications, Washington, 1986 BIOTECHNOLOGY PRINCIPLES, J.E. Smith, Van Nostrand Reinhold, Wokingham, 1985 BIOTECNOLOGÍA BÁSICA. J. Bu´lock y B. Kristiansen, Acribia, Zaragoza, 1991 BIOTECNOLOGÍA DE LA FERMENTACIÓN, O.P. Ward, Acribia, Zaragoza, 1991 COMPREHENSIVE BIOTECHNOLOGY. THE PRINCIPLES, APPLICATIONS AND REGULATIONS OF BIOTECHNOLOGY IN INDUSTRY, AGRICULTURE AND MEDICINE, M. Moo-Young (ed.), Pergamon Press, Oxford, 1985 3 FACULTAD DE CIENCIAS ·Universidad de Córdoba· Edificio de Gobierno (Campus de Rabanales) 14071-Córdoba CURRENT PROTOCOLS IN MOLECULAR BIOLOGY, F.M. Ausubel, R. Brent, R.E. Kingston, D.D. Moore, J.G. Seidman, J.A. Smith y K. Struhl, WileyInterscience, Nueva York, 1987 FORMULAIRE DE GÉNIE GÉNÉTIQUE, G. Lucotte, Technique et Documentation, Paris, 1993 HANDBOOK OF ENZYME BIOTECHNOLOGY. A. Wiseman, Ellis Horwood Ltd., Chichester, 1985 INTRODUCCIÓN A LA BIOTECNOLOGÍA, C.M. Brown, I. Campbell and F.G. Priest, Acribia, Zaragoza, 1989 LA BIOCONVERSIÓN DE LA ENERGÍA, J.M. Vega, F. Castillo and J. Cárdenas, Pirámide, Madrid, 1983 MOLECULAR CLONING: A LABORATORY MANUAL, J. Sambrook, E.F. Fritsch and T. Maniatis, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, 1989 MONOCLONAL ANTIBODIES: PRINCIPLES AND PRACTICE, J.W. Goding (ed.), Academic Press, London, 1986 NEW STUDIES IN BIOTECHNOLOGY, J.E. Smith, 2nd.ed., Edward Arnold, London, 1988 PCR PROTOCOLS, M.A. Innis, D.H. Gelfand, J.J. Sninsky y T.J. White, Academic Press, Nueva York, 1990 PRINCIPLES OF GENE MANIPULATIONS, R.W. Old and S.B. Primrose, Blackwell, Oxford 1989 PROTEOME AND PROTEIN ANALYSIS, R.M. Kamp, D. Kyriakidis, T. Choli-Papadopoulou (eds.). Springer, 2000 RECOMBINANT DNA, J.D. Watson, M. Gilman, J. Witowski and M. Zoller, Scientific American Books, New York, 1992 TECHNIQUES DE CLONAGE MOLÉCULAIRE, G. Lucotte, Technique et Documentation, Paris,1991 THE USES OF LIFE. A HISTORY OF BIOTECHNOLOGY, R. Bud, Cambridge University Press, Cambridge, 1993 Técnicas de evaluación Enumerar, tomando como referencia el catálogo de la guía común. Incluir criterios de evaluación y calificación (referidos a las competencias trabajadas durante el curso) El rendimiento en la asignatura se evaluará considerando el rendimiento en la materia teórica. Asimismo, se valorará el desarrollo por escrito de un proyecto de investigación en biotecnología. NUMERO DE PARCIALES Y PLAZO DE VALIDEZ DE LA CALIFICACION DE ESTOS PARCIALES Sin calificaciones parciales CRITERIOS DE EVALUACIÓN El rendimiento en teoría se determinará de la calificación de un examen de preguntas cortas sobre la materia y contribuirá en un 50% a la calificación global. El rendimiento en el Proyecto se determinará a partir del interés, factibilidad, desarrollo y propuestas consignadas en el mismo y contribuirá en un 50% a la calificación global. A) Introducción Programa de contenidos Teóricos: Con indicación de las competencias que se van a trabajar en cada lección Tema 1. La Biotecnología. Descripción y objetivos del curso. Introducción a la Biotecnología. Biotecnología clásica y nueva. B) Tecnología del ADN recombinante Tema 2. Clonación de genes. Estrategias para el aislamiento e identificación de genes. Bibliotecas genómicas y de cDNA. Utilización de genotecas en plásmidos, fagos, cósmidos, YACs, y BACs. Paseo cromosómico. Genotecas sustractivas. Tema 3. Expresión de genes clonados en procariotas. Expresión en procariotas a partir de promotores fuertes y regulables. Proteínas de fusión. Optimización de la expresión. 4 FACULTAD DE CIENCIAS ·Universidad de Córdoba· Edificio de Gobierno (Campus de Rabanales) 14071-Córdoba Tema 4. Producción de proteína recombinante en eucariotas. Expresión en Saccharomyces y en otras levaduras. Expresión en células de insectos. Expresión en mamíferos. Tema 5. Ingeniería de proteínas. Mutagénesis dirigida y al azar en la ingeniería de proteínas. Efectos de la mutagénesis en las propiedades estructurales, cinéticas, o biológicas de las proteínas: aplicaciones biotecnológicas. Tema 6. Aplicaciones moleculares clínicas y forenses. Diagnósticos por hibridación con sondas. Polimorfismos de fragmentos de restricción (RFLPs): Aplicaciones forenses. Diagnóstico molecular de enfermedades genéticas. RAPDS. Clonación de genes a partir de RAPDS. C) Biotecnología microbiana Tema 7. Cultivo de microorganismos. Requerimientos nutricionales y metabólicos. Cultivos continuos, mixtos y con mezclas de sustratos. Diseño y operación de los fermentadores. Optimización del proceso de fermentación. Tema 8. Inmovilización de enzimas y de células. Metodologías de la inmovilización de proteínas y células. Ventajas e inconvenientes. Ejemplos prácticos. Tema 9. Producción de biomasa microbiana. Microorganismos inoculadores. Insecticidas microbianos: B. thuringiensis y baculovirus, Cultivos iniciadores. Proteína unicelular. La biomasa como fuente de energía. Producción de amoniaco, hidrógeno y biogas. La fijación del nitrógeno molecular. Tema 10. Producción de metabolitos primarios. Estrategias para la producción y sobreproducción de metabolitos esenciales: aminoácidos, vitaminas y nucleótidos. Generación de productos metabólicos terminales: etanol, butanol, acetona, ácido láctico. Tema 11. Producción de metabolitos secundarios I. Biosíntesis de antibióticos: organismos productores, rutas y su control. Manipulación genética de las rutas de biosíntesis de antibióticos. Biosíntesis de antibióticos y su regulación. Tema 12. Producción de metabolitos secundarios Il. Producción de pigmentos. Producción de polisacáridos y polínieros microbianos. Producción de hormonas esteroides. Tema 13. Producción de proteínas, enzimas y productos farmacológicamente activos. Obtención de enzimas microbianas. Producción de proteínas con potencial terapeútico. Producción de vacunas. Tema 14. Biodegradación de sustancias tóxicas y contaminantes. Degradación de hidrocarburos alifáticos y aromáticos. Degradación de nitrofenoles. Biodegradación de celulosa y lignina. Tema 15. Biotecnología de la minería. Microorganismos implicados en la obtención de metales. Oxidación de sulfuros a sulfatos por Thiobacillus. Biolixiviación directa e indirecta: factores y dificultades del proceso. Eliminación de metales pesados. D) Biotecnología vegetal Tema 16. Cultivo in vitro de células de plantas y protoplastos. El crecimiento y desarrollo de las plantas. Cultivos in vitro. Medios y hormonas. Cultivo de tejidos y órganos de plantas. Cultivo de células vegetales. Obtención de protoplastos. Regeneración de plantas monocotiledóneas y dicotiledóneas. Aplicaciones del cultivo de células vegetales: Producción de compuestos complejos y plantas libres de patógeno. Micropropagación y propagación a gran escala. Tema 17. Mejora clásica. Importancia del germoplasma. Bancos de germoplasma. Programas de mejora por selección en plantas autógamas y alógamas: perspectivas. Variación somaclonal. Híbridos interespecíficos e intergenéricos. Fusión de protoplastos: perspectivas. Tema 18. El genoma vegetal. Características. Requerimientos para la expresión de proteínas foráneas en plantas. Promotores y terminadores. Especificidad tisular. Tema 19. Plantas transgénicas. Vectores de plantas. Uso de genes delatores (GUS, luciferasa, CAT, GFP). Bloqueo de la expresión con ARN antisentido. Tema 20. Aplicaciones biotecnológicas I. Resistencia a herbicidas en plantas. Resistencia a insectos. Resistencia a infección por virus. Plantas resistentes a hongos y bacterias. Plantas resistentes a la salinidad y estrés oxidativo. Tema 21. Aplicaciones biotecnológicas II – Modificación de la cantidad y calidad de proteínas de plantas. Expresión de anticuerpos en plantas. Ornamentación floral. Obtención de plantas androestériles. E) Biotecnología animal Tema 22. Cultivo in vitro de células de mamíferos. Equipos, medios de cultivo, antibióticos. Factores de crecimiento. Sueros. Líneas celulares. Cultivo de células. Obtención de células animales. Almacenamiento y conservación de las células. Cultivos a pequeña escala y a gran escala. Tema 23. Aplicaciones del cultivo de células animales. Producción de vacunas. Producción de proteínas de interés terapeútico. Clonación en células animales. Vectores. Producción de vacunas y sustancias terapeúticas por ingeniería genética. Tema 24. producción de anticuerpos monoclonales. Purificación del antígeno. Inmunización. Medios de cultivo y selección. Escrutinio (ELISA, RIA, Dot Blot, Western blotting). Congelación y descongelación de células. Generación de fluido ascítico. Tema 25. Purificación de anticuerpos monoclonales. Cuantificación de las inmunoglobulinas. Pureza y subtipo. Obtención de anticuerpos monoclonales por ingeniería genética. Tema 26. Aplicación de los anticuerpos monoclonales. Anticuerpos catalíticos. Aplicaciones en técnicas preparativas de purificación de proteínas y de compuestos de interés biológico-médico. Aplicación de los mAb en diagnóstico de enfermedades. Localización de tumores. Terapia con mAb. Tema 27. Animales transgénicos. Producción de animales transgénicos. Metodología de los ratones transgénicos: aplicaciones. Otros 5 FACULTAD DE CIENCIAS ·Universidad de Córdoba· Edificio de Gobierno (Campus de Rabanales) 14071-Córdoba animales transgénicos: terneros, cabras, ovejas, cerdos y peces. Tema 28. Terapia génica en humanos. Terapia génica ex vivo e in vivo. Sistemas de envío de genes. Oligonucleótidos antisentido como agentes terapeúticos. F) Otros aspectos de la Biotecnología. Tema 29. Cartografía y secuenciación de genomas. Cartografia de cromosomas. Métodos moleculares. La ciencia genómica. Secuenciación de genomas. Microchips de DNA.. Perspectivas futuras. Tema 30. La proteómica: Metodología y estrategias para el análisis del proteoma. Identificación de proteínas. Análisis de fosfopéptidos. Otros métodos de interés. G) Aspectos sociales de la Biotecnología Tema 31. Seguridad, patentes y ética en la investigación biotecnológica. Normas de seguridad y control de los procesos biotecnológicos. La seguridad de los productos desarrollados por biotecnología. Aspectos legales, ecológicos y éticos de la biotecnología. Patentes de productos y/o procesos biotecnológicos. Programa de contenidos Prácticos: Con indicación de las competencias que se van a trabajar: Mecanismo de Control y Seguimiento: Al margen de las contempladas a nivel general para toda la experiencia piloto, se recogerán aquí los mecanismos concretos que los docentes propongan para el seguimiento de cada asignatura 6 FACULTAD DE CIENCIAS ·Universidad de Córdoba· Edificio de Gobierno (Campus de Rabanales) 14071-Córdoba Distribución ECTS (a) 1 ECTS = 26,67 horas trabajo. (b) Estudio personal del alumno durante el curso 18 (cuatrimestral) o 36 (anual) semanas: 1,5 horas de estudio por cada hora de teoría y 0,75 horas de estudio por cada hora de prácticas. (c)Las tutorías se encuentran incluidas en el total de Actividades Académicamente Dirigidas. Actividad Actividad Docente Materia Evaluación Horas presenciales Horas no presenciales Horas ECTS a 42 h 60 h b 102 h - - - 20% 21 h 12 33 h 35% 6h 18 24 h - 6 11 16,5h 3h 33h 36 h 78 h 134 h 212 h Profesor Alumno Procedimiento Peso en la nota final Teoría Exposición de la Teoría. Apoyo con audiovisuales Tomar apuntes, copiar el material audiovisual Tipo de preguntas. Se valorará razonamiento y capacidad de síntesis 45 % Ejercicios y problemas Respuestas y soluciones Apuntes. Formulación de preguntas y dudas Problemas numéricos. Se valorarán razonamientos, unidades y convenios, resultados, lenguaje, etc. Clases en laboratorio Prácticas de laboratorio Presentación de normas. Explicación de las prácticas Cuaderno de laboratorio, anotaciones, experimentos, ejercicios, informe, etc. Evaluación continuada, cuaderno, ejercicios, informes, actitud Actividades dirigidasc Seminarios. Distribución de los trabajos, recomendar bibliografía, orientar Exposición del seminario en el aula Se valorará contenido, exposición, presentación, y preparación, etc.. Teoría y prácticas Discusión de las materias teóricopráctica de modo global y otros temas de interés a alumnos Preparar cuestiones y participar en la pagina web de la asignatuta Teoría y/o problemas Poner, vigilar y corregir el examen. Calificar globalmente al alumno Preparación de examen (22 horas) Realización de examen (2 horas) Clases en aula Tutorias Exámenes Es una actividad no evaluable TOTAL CARGA DOCENTE DEL ALUMNO 7 100%