PLATAFoRMAS TECNoLóGICAS - Ministerio de Ciencia

PLATAFoRMAS
TECNoLóGICAS
1
Plataforma Argentina de Biología Estructural y Metabolómica (PLABEM)
Argentine Platform of Structural Biology and Metabolomics
2
Plataforma para el Desarrollo de Nanobiomateriales y Dispositivos para Diagnóstico y Tratamiento
Platform for Development of Nanobiomaterials and Devices for Diagnosis and Treatment
3
Plataforma para Ensayos Biológicos con Animales de Laboratorio (EBAL)
Platform for Biological Assays with Laboratory Animals
4
Consorcio Argentino de Tecnología Genómica (CATG)
Argentine Consortium of Genomic Technology
5
Centro de Estudios Químicos y Biológicos por Espectrometría de Masa (CEQUIBIEM)
Center of Chemical and Biological Studies with Mass Spectrometry
6
Plataforma de Células Madre Reprogramadas Humanas (PLACEMA)
Human Induced Pluripotent Stem Cells Platform
7
Servicio de Descubrimiento, Diseño y Desarrollo Preclínico de Fármacos de la Argentina (SEDIPFAR)
Service of Drug Discovery, Design and Preclinical Development of Argentina
8
Plataforma Bioinformática Argentina (BIA)
Argentine Center of Bioinformatics
9
Centro de Transferencia e Investigación en Ingeniería de Software (CETIS)
Center of Transference and Research in Software Engineering
10
Investigación y Desarrollo de Productos y Procesos Farmoquímicos y Farmacéuticos (INDEFAR)
Research and development on fine chemical and pharma products and processes
Servicios de alta tecnología para el desarrollo
Las Plataformas Tecnológicas son unidades de apoyo a la investigación, el desarrollo y la innovación tecnológica, que cuentan con equipamientos de última generación y personal altamente
calificado. Estos centros de servicios tecnológicos de referencia altamente competitivos están
integrados por grupos de Investigación y Desarrollo (I+D) de referencia nacional e internacional en
el campo académico y técnico de cada plataforma, que proveen productos y servicios científicos y
tecnológicos de avanzada, necesarios para grupos de investigación, empresas de base tecnológica y servicios hospitalarios.
En la actualidad, en Argentina se encuentran trabajando diez plataformas tecnológicas financiadas por el Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación Productiva, en los campos de la bioinformática; las células madres reprogramadas; la proteómica; ensayos preclínicos con animales de
experimentación; genómica; materiales; biología estructural; ingeniería de software; desarrollo
racional de fármacos en fase pre-clínica y síntesis orgánica.
High-technology services for development, research
and innovation
The above-mentioned technological platforms are centers with last-generation equipment and
highly qualified staff, which provide support for research, development and technological innovation.
These highly competitive centers are integrated by groups of Research and Development (R+D)
with national and international reference in the academic and technical fields of each platform.
They provide scientific products and technological services of advanced level, which are necessary
for research groups, technology-based companies and hospitals.
The Ministry of Science, Technology and Productive Innovation of Argentina currently supports the
above-mentioned technological platforms, which are working in the following areas: bioinformatics,
stem cells, proteomics, genomics, preclinical studies in experimental animals, structural biology,
software engineering, and rational drug development in preclinical phase and organic synthesis.
1
Plataforma Argentina de Biología
Estructural y Metabolómica
(PLABEM)
Argentine Platform of Structural Biology and
Metabolomics
Director: Dr. Alejandro Vila
· Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario - Universidad Nacional de Rosario Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (IBR – UNR – CONICET).
· Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires - Fundación Instituto Leloir Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (IIBBA – FIL - CONICET).
www.plabem.gob.ar · [email protected]
Tel: (054341) 423-7070 int. 669 · (05411) 5238-7500 int. 2303
DESDE EL DESCUBRIMIENTO DE
MECANISMOS BIOLÓGICOS HASTA
EL DISEÑO DE NUEVAS DROGAS
PLABEM brinda una variedad de servicios calificados en Biología Estructural y Metabolómica,
de gran utilidad para la resolución de interrogantes de alta complejidad en biotecnología,
diseño de fármacos, biología y bioquímica.
Presta servicios de adquisición y análisis de
espectros de Resonancia Magnética Nuclear
(RMN), Metabolómica por RMN y Cristalografía
por difracción de rayos X, incluyendo el acceso
a las líneas de cristalografía de proteínas del
Sincrotrón SOLEIL de Francia.
FROM THE DISCOVERY OF BIOLOGICAL
MECHANISMS TO THE DESIGN OF NEW
DRUGS
PLABEM offers a range of qualified services in
structural biology and metabolomics, which
are necessary to elucidate complex problems
in biotechnology, drug design, biology and
biochemistry.
This platform provides services for the acquisition
and analysis of Nuclear Magnetic Resonance (NMR)
spectra, metabolomics by NMR spectroscopy
and crystallography by X-ray diffraction. It also
provides assistance for the access to the
protein crystallography beamlines at the SOLEIL
synchrotron facility in France.
Servicios
services
· Resonancia Magnética Nuclear: acceso a los espec-
· NMR spectroscopy: access to the NMR spectrometers of
·
·
·
·
trómetros de RMN de la plataforma, estudios dinámicos, metabolómica, cribado de plegamiento de
proteínas, cribado de bibliotecas de candidatos de
fármacos, resolución de estructuras y coordinación
de acceso a grandes centros de RMN.
Cristalogénesis y cristalografía: cribado de condiciones de cristalización, acceso al difractómetro de
rayos X de la plataforma, análisis de datos de difracción, resolución de estructuras tridimensionales y
coordinación de acceso a sincrotrones.
Metabolómica: determinación de perfiles metabólicos por RMN.
Espectroscopías de baja resolución: caracterización
biofísica previa a los estudios de alta resolución.
Medición de las constantes de asociación entre drogas/fármacos y sus proteínas diana. Determinación
de estabilidad de proteínas por medio de ensayo de
desplazamiento térmico.
Capacitación, entrenamiento y formación de recursos humanos.
·
·
·
·
PLABEM, protein dynamics, metabolomics, screening of
protein folding conditions, screening of libraries of drug
candidates, resolution of structures, and coordination
to access large NMR centers.
Crystallogenesis and Crystallography: screening
of crystallization conditions, access to the X-ray
diffractometer of PLABEM, diffraction analysis,
resolution of three-dimensional structures and
coordination for synchrotron access.
Metabolomics: metabolic profiling by NMR.
Low-resolution spectroscopy: biophysical characterization
prior to high-resolution studies. Measurement of
association constants between drugs and their
target proteins. Determination of protein stability
through thermal shift assay.
Training of human resources.
Equipamiento
EquipMENT
· Espectrómetros de RMN Bruker Avance II 600 MHz y
· Bruker Avance II 600 MHz and Bruker Avance III 700
·
·
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·
·
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·
·
Bruker Avance III 700 MHz.
Salas de RMN especialmente acondicionadas.
Difractómetro de Rayos X de microfoco Bruker D8
QUEST equipado con elemento de baja temperatura
y detector CMOS.
Robot de cristalización Honeybee 963.
Sala de cristalización termostatizada.
Microscopio Olympus SZX16 para observación y
manipulación de cristales.
Espectrómetro de fluorescencia.
Espectropolarímetro (Dicroismo circular).
Equipo de dispersión luminosa dinámica (DLS).
·
·
·
·
·
·
MHz NMR Spectrometers.
Specially adapted NMR rooms.
Bruker D8 QUEST Microfocus X-ray diffractometer,
equipped with low-temperature device and CMOS
detector.
Honeybee 963 crystallization robot.
Thermostated crystallization room.
Olympus SZX16 microscope for crystal observation
and manipulation.
Fluorescence spectrometer.
Spectropolarimeter (circular dichroism).
Dynamic Light Scattering (DLS).
2
Plataforma para el desarrollo de
nanobiomateriales y dispositivos
para diagnóstico y tratamiento
Platform for Development of Nanobiomaterials
and Devices for Diagnosis and Treatment
Director: Dr. Omar Azzaroni
· Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas - Consejo Nacional de
Investigaciones Científicas y Técnicas (INIFTA-CONICET).
· Instituto de Química Física de los Materiales, Medio Ambiente y Energía - Consejo
Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (INQUIMAE-CONICET).
· Centro Atómico Bariloche - Comisión Nacional de Energía Atómica (CAB-CNEA).
· Facultad de Ciencias Exactas - Universidad Nacional de La Plata (FCE - UNLP).
[email protected] · Tel: (054221) 425-7430
Creación de nuevos materiales,
dispositivos y sistemas
mediante el control de la
materia en la escala del
nanÓmetro
La plataforma brinda soluciones de alta
tecnología basadas en las propiedades
de los nanomateriales como sistemas de
transporte y liberación de compuestos bioactivos, fármacos y productos para contraste de imágenes, entre otros. Desarrolla también dispositivos e instrumental de
medición para diagnóstico y detección precoz de enfermedades. Su actividad se focaliza en la solución de problemas específicos
generando, adaptando y mejorando desarollos en fase piloto, prototipos o escalado
productivo.
DEVELOPMENT OF NEW MATERIALS,
DEVICES AND SYSTEMS BY THE
CONTROL OF MATTER IN THE SCALE
OF NANOMETERS
This platform offers high-technology solutions
based on the nanomaterial properties: transport
systems, bioactive compound liberation, drugs
and products for contrast images among
others. The platform also develops devices
and instruments for the diagnosis and early
detection of diseases. Its activity is focused
on solving specific problems by generating,
adapting and improving developments in pilot
phase, prototypes or productive scaling.
Servicios
services
· Diseño y síntesis de nanopartículas basadas en po-
· Design and synthesis of nanoparticles based on polymers,
· Desarrollo de métodos de diagnóstico en base a es-
· Development of diagnostic methods by impedance
límeros, metales y óxidos magnéticos funcionalizados a medida para sistemas de contraste de imágenes y transporte y dosificación de drogas.
pectroscopía de impedancia, SPR y AFM.
· Diseño y síntesis de nanopartículas, diseño y preparación de biosensores (biochips) para su uso en SPR.
· Construcción de substratos para la elaboración de
electrodos descartables y desarrollo de biosensores
basados en técnicas electroquímicas.
· Capacitación de personal técnico del sector empre-
metals and magnetic oxides, tailor-made for systems
of contrast images as well as for transport, delivery and
dosification of drugs.
spectroscopy, Surface Plasmon Resonance (SPR)
and Atomic Force Microscope (AFM).
· Design and synthesis of nanoparticles, and design
and preparation of biochips to be used in SPR.
· Construction of substrata for the construction of
disposable electrodes and development of biochips
based on electrochemical techniques.
sario a través de cursos y entrenamiento en el laboratorio. Facilidades para la formación de doctores
en proyectos conjuntos plataforma-empresa.
· Training of technical staff in the business area by means
· Asesoramiento a empresas y emprendedores so-
· Assessment to companies and entrepreneurs about
bre oportunidades y riesgos en el negocio de la nanomedicina.
· Generación de start-ups.
of courses and training in the laboratory. Training of
doctors for platform-company joint projects.
opportunities and risks of the nanomedicine business
· Generation of start-ups.
Equipamiento
Resonancia de Plasmón Superficial (SPR) · Dispersión de Luz Dinámica (DLS) · Equipo de Serigrafía · Microdispenser · Microscopía de fuerza atómica (AFM), de barrido de efecto túnel (STM), electrónica de transmisión (TEM), electrónico de barrido (SEM) · Multipotenciostato · Espectroscopía de fotoelectrones de rayos X
(XPS) y de electrones Auger (AES) · Espectrómetro para Raman y Micro-Raman NIR-VIS-UV · Potenciostáto
· Microbalanza de Cristal de Cuarzo · Equipo de cromatografía FPLC.
Equipment
Surface plasmon resonance (SPR) · Dynamic Light Scattering (DLS) · Screen Printing Equipment · Microdispenser
· Atomic Force Microscope (AFM), Scanning Tunneling Microscope (STM), Transmission Electron Microscope
(TEM), and Scanning Electron Microscope (SEM) · Multi Potentiostat · XX-ray photoelectron (XPS), Auger
electron (AES), and Raman spectroscopy · Micro-Raman NIR-VIS-UV · Quartz Crystal Microbalance (QCM) and
Fast Protein Liquid Chromatography (FPLC).
3
PLATAFORMA PARA ENSAYOS BIOLÓGICOS
CON ANIMALES DE LABORATORIO (EBAL)
Platform for Biological Assays with Laboratory
Animals
Director: Dra. Cecilia Carbone
· Laboratorio de Animales de Experimentación de la Facultad de Ciencias Veterinarias Universidad Nacional de La Plata (FCV-UNLP).
· Instituto de Investigaciones Farmacológicas - Consejo Nacional de Investigaciones
Científicas y Técnicas - Universidad de Buenos Aires (ININFA-CONICET-UBA).
· Cátedras de Patología y de Anestesiología y Algiología de la Facultad de Ciencias
Veterinarias - Universidad de Buenos Aires (FVET-UBA).
· Laboratorio de Ratones Transgénicos del Instituto de Investigaciones de Ingeniería
Genética y Biología Molecular - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y
Técnicas (INGEBI-CONICET).
www.ebal.com.ar · [email protected]
Tel: (054221) 4211-276
ANIMALES DE LABORATORIO: PIEZA
FUNDAMENTAL EN LAS CIENCIAS
BIOMÉDICAS
LAB ANIMALS: KEY TOOLS IN
BIOMEDICAL SCIENCES
Plataforma tecnológica dedicada a la producción de animales de laboratorio, la prestación
de servicios de asesoramiento para la construcción y mantenimiento de bioterios y la realización de ensayos pre-clínicos. Estos ensayos se realizan de acuerdo a la normativa de
la Administración Nacional de Medicamentos,
Alimentos y Tecnología Médica y a los criterios
fijados por la International Conference for the
Harmonization of Technical Requirements for
Registration of Pharmaceuticals for Human
Use empleando para ello animales de calidad
certificada.
This technological platform is dedicated to the
production of laboratory animals, technical
advice for the construction and maintenance
of animal facilities and for development of
preclinical tests, according to the normative of
the “National Administration of Drugs, Foods and
Medical Technology” of Argentina (ANMAT) and the
International Conference for the Harmonization
of Technical Requirements for Registration of
Pharmaceuticals for Human Use, using animals
with certified quality.
Servicios
services
· Producción y provisión de animales libres de patógenos.
· Realización de controles sanitarios en animales de
· Production and supply of Specific Pathogen-Free (SPF)
laboratorio.
· Diseño y producción de ratones transgénicos.
· Realización de ensayos preclínicos en el área far·
·
·
·
·
·
macológica.
Evaluación de protocolos de investigación preclínica.
Diseño de protocolos anestésicos y analgésicos
para la realización de estudios preclínicos en diferentes especies animales.
Patología general: necropsia y toma de muestras
(con práctica de eutanasia). Estudios histopatológicos y citológicos. Evaluaciones anatomopatológicas
completas (macro y microscópicas) protocolizadas.
Estudios de toxicidad aguda, subaguda y crónica.
Criopreservación de embriones de animales.
Asesoramiento a bioterios.
Capacitación de recursos humanos.
·
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·
·
·
·
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·
·
animals.
Sanitary controls of lab animals.
Design and production of transgenic mice.
Pharmacological preclinical assays.
Evaluation of preclinical research protocols.
Design of anesthetic and analgesic protocols for
preclinical studies in different animal species.
General pathology: necropsy and sampling (by means
of euthanasia). Histopathology and cytology. Complete
protocolized anatomopathological evaluations (macroand microscopic). Studies of acute, subacute and
chronic toxicity.
Cryopreservation of embryos.
Technical advice to animal facilities.
Training of human resources.
INSTALACIONES Y Equipamiento
FACILITIES AND EquipMENT
· Salas de producción; de experimentación; aislada
· Production and experimentation rooms that are
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
acústicamente y con ciclo luz-oscuridad establecido; de cultivo celular para líneas celulares o cultivos
primarios; laboratorio de anestesiología y algiología.
Micrótomo, criostato y micrótomo de congelación.
Contador de centelleo líquido.
HPLC con detección UV y electroquímico.
RT-PCR cuantitativa; campana de flujo laminar; incubadora y congelador de embriones; procesador
automático de tejidos.
Microscopio óptico, de fluorescencia e invertido con
óptica de Nomarski de larga distancia de trabajo y
micromanipulador.
Equipo de farmacocinética in vitro.
Procesador automático de tejidos.
Centro de inclusión modular.
Equipo de anestesia de alta complejidad y módulos
accesorios.
·
·
·
·
·
·
acoustically isolated and have a pre-established
light-dark cycle, rooms for cell culture for cell lines or
primary cultures, anesthesiology laboratory.
Microtome, cryostat and freezing microtome.
Liquid scintillation counter.
High-performance liquid chromatography (HPLC)
with UV and electrochemical detection.
Quantitative RT-PCR, laminar flow cabinet, incubator
and embryo freezer, automatic tissue processor.
Optical fluorescence and inverted microscope with high
resolution Nomarski optics and micromanipulation
equipment.
In vitro pharmacokinetics equipment.
Automatic tissue processor.
Modular tissue embedding center.
High complexity anesthesia equipment and accesory
parts.
4
CONSORCIO ARGENTINO DE TECNOLOGÍA
GENÓMICA (CATG)
Argentine Consortium of Genomic Technology
Director: Dr. Osvaldo Podhajcer
· Fundación Instituto Leloir (FIL).
· Instituto de Agrobiotecnología de Rosario - Consejo Nacional de Investigaciones
Científicas y Técnicas (IndeAR-CONICET).
· Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA).
www.tecnologiagenomica.org · [email protected]
Tel: (05411) 5238-7500 int. 4201
SERVICIOS TECNOLÓGICOS PARA
EL DESARROLLO DE PROYECTOS
GENÓMICOS A GRAN ESCALA
Equipamiento
· Secuenciadores NGS:
PGM (LifeTechnologies).
MiSeq (Illumina).
Ion Proton (LifeTechnologies).
HiSeq 1500 (Illumina).
El Centro Argentino de Tecnología Genómica es una plataforma de servicios
de genómica de alto rendimiento y última tecnología que presta servicios a
proyectos de Investigación, Desarrollo
e innovación (I+D+i) de aplicación fundamentalmente en el área de salud humana, agroindustria y medio ambiente.
· Escáner de microarreglos:
TECHNOLOGICAL SERVICES FOR
THE DEVELOPMENT OF LARGESCALE GENOME PROJECTS
EquipMENT
CATG is a platform of high-performance
services that supports I+D+i projects
applied in human health, agroindustry
and environmental areas.
Agilent (perfil de expresión de genes).
BeadXpress (análisis de variantes alélicas).
Sistema de PCR multiplex.
Access Array (Fluidigm).
· NGS sequencer:
PGM (LifeTechnologies).
MiSeq (Illumina).
Ion Proton (LifeTechnologies).
HiSeq 1500 (Illumina).
· Microarray Scanner:
Agilent (gene expression profile).
BeadXpress (allelic variants analysis).
PCR multiplex system.
Access Array (Fluidigm).
Servicios
services
· Secuenciación de novo de genomas completos bac-
· De novo bacterial whole genome sequencing.
·
·
·
·
·
·
terianos. Secuenciación de ADN de organelas, genomas complejos en animales y vegetales. Metagenómica ambiental.
Participación en consorcios internacionales de secuenciación de especies de interés.
Re-secuenciación de genomas completos, cromosomas, genes o regiones candidatas: caracterización de cepas microbianas; cuasiespecies virales,
exomas humanos; genomas y/o regiones genómicas de cultivos para determinación de diversidad
nucleotídica. Caracterización de variantes alélicas y
estructurales. Microbiomas humanos.
Secuenciación de ARN: secuenciación de novo de
transcriptoma completo, estudios de expresión génica. Estudios de ARN no codificantes.
Análisis de expresión diferencial de genes a partir de
microarreglos de oligonucleotidos. Diseño de ensayos a medida a partir de la impresión de microarreglos personalizados.
Inmunoprecipitación de cromatina acoplada a secuenciación y secuenciación de ADN metilado para
estudios de epigenética. Análisis de patrones de metilación y de unión de proteínas al ADN a gran escala.
Genotipificación de polimorfismos de un solo nucléotido mediante el uso de microarreglos a medida
para especies vegetales, forestales, animales, microorganismos y humanos.
·
·
·
·
·
·
Sequencing of organelle DNA, and animal and plant
complex genomes. Environmental metagenomics.
Collaboration in international consortia for the
sequencing of the genomes of relevant species.
Re-sequencing of whole genomes, chromosomes,
genes or candidate regions: characterization of
microbial strains, viral quasispecies, human exomes,
genomes and/or genomic regions of cultures to
determine nucleotide diversity. Characterization of
allelic and structural variations. Human microbiomes.
RNA sequencing: de novo whole transcriptome
sequencing, gene expression studies, non-coding
RNA studies.
Analysis of differentially expressed genes from
oligonucleotide microarrays. Design of custom assays
based on custom microarray printing.
Chromatin immunoprecipitation coupled with
DNA sequencing and methylated DNA sequencing
for epigenetic studies. Large-scale analysis of
methylation patterns and DNA-binding proteins.
Genotyping of single nucleotide polymorphisms using
microarrays in plants, trees, animals, microorganisms
and humans.
5
CENTRO DE ESTUDIOS QUÍMICOS Y
BIOLÓGICOS POR ESPECTROMETRÍA DE
MASA (CEQUIBIEM)
Center of Chemical and Biological Studies with
Mass Spectrometry
Director: Dra. Silvia Moreno de Colonna
· Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales –
Universidad de Buenos Aires - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y
Técnicas (IQUIBICEN-UBA-CONICET).
· Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires - Fundación Instituto Leloir Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (IIBBA-FIL-CONICET).
· Instituto de Biotecnología y Biología Molecular – Universidad Nacional de La Plata
(IBBM-UNLP).
www.qb.fcen.uba.ar/cequibiem · [email protected]
Tel: (05411) 4576-3300 int. 415
ESTUDIOS QUÍMICOS Y BIOLÓGICOS POR
ESPECTROMETRÍA DE MASA
CEQUIBIEM tiene como misión atender las necesidades de usuarios del ámbito I+D académico y privado, del área de las ciencias básicas,
de la salud y de la agrobiotecnología, en lo que
se refiere a análisis proteómicos cuali y cuantitativos de alta calidad, a costos accesibles y
con el valor agregado de la asesoría integral de
diseño experimental e interpretación de datos.
Esta plataforma es hoy referencia local en la
prestación de servicios analíticos proteómicos
y glicómicos; cuenta con experiencia en el servicio de espectrometría de masas para proteómica y sus técnicas periféricas, especialmente
en lo relacionado a la resolución e identificación de muestras complejas.
BIOLOGICAL AND CHEMICAL STUDIES BY
MASS SPECTROMETRY
CEQUIBIEM is aimed to provide solutions to the
problems of the I+D academic and private area,
basic sciences, health and agrobiotechnology in
regard to qualitative and quantitative proteomic
analysis of high quality. The services of this Center
have accessible costs and the added value of
an integral counselling service, which provides
experimental design and data interpretation.
This Center is now a local reference in providing
glycomics and proteomics analytical services. It
has experience in mass spectrometry services
for proteomics and peripheral techniques,
especially with regard to the resolution and
identification of complex samples.
Servicios
services
· Identificación de proteínas por el método de la hue-
· Protein identification by the peptide fingerprinting
·
·
·
·
·
lla peptídica. Incluye la digestión de la proteína con
tripsina. La proteína puede estar en solución o en un
fragmento de gel de poliacrilamida.
Identificación de secuencia de proteínas por espectrometría MS/MS combinada generalmente con la
huella peptídica para genomas secuenciados.
Caracterización de muestras proteicas: determinación de identidad, pureza, modificaciones post-traduccionales, análisis de glicosilación de proteínas.
Cuantificación de proteínas por técnica DIGE (electroforesis bidimensional): separación en función de
punto isoeléctrico y peso molecular, tinción con colorantes fluorescentes para su posterior cuantificación comparativa e identificación por MS. Purificación de proteínas por afinidad ( ÄKTA).
Biotipificación de bacterias del suelo por comparación de “huellas” moleculares específicas de género/especie inferidas de espectros MALDI-TOF de
lisados celulares totales.
·
·
·
method, involving protein digestion with trypsin. The
protein may be in solution or in a polyacrylamide gel
fragment.
Protein sequence identification by MS/MS spectrometry,
generally combined with peptide fingerprinting for
sequenced genomes.
Characterization of protein samples: determination
of identity, purity, post-translational modifications,
and protein glycosylation analysis.
ProteinquantificationbytheDifferenceGelElectrophoresis
(DIGE) technique (two-dimensional electrophoresis):
separation based on isoelectric point and molecular
weight, staining with fluorescent dyes for subsequent
comparative quantification and identification by MS.
Protein purification using ÄKTA purification system.
Biotyping of soil bacteria by comparing genus- or
species-specific molecular fingerprints inferred by
MALDI-TOF spectra of whole cell lysates.
Equipamiento
EquipMENT
· Espectrómetro de masa Maldi Tof Tof Ultraflex II
· Maldi Tof Tof Ultraflex II (Bruker) and Thermo
(Bruker) y Q Exactive Thermo Scientific acoplado a
nanoHPLC Proxion.
Scientific Q Exactive mass spectrometers coupled
to nanoHPLC Proxion.
· Robot Ettan Digestor de proteínas.
· Ettan Digester robot.
· Geles 2D-DIGE.
· Difference gel electrophoresis (2D-DIGE).
· ÄKTA-FPLC.
· ÄKTA-FPLC.
6
PLATAFORMA DE CÉLULAS MADRE
REPROGRAMADAS HUMANAS (PLACEMA)
Human Induced Pluripotent Stem Cells Platform
Director: Dr. Fernando Pitossi
· Fundación Instituto Leloir (FIL).
· Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia (FLENI).
www.placema.org.ar · Tel: (05411) 5238-7500 int. 4000
desarrollo de TECNOLOGÍA
NOVEDOSA bajo rigurosos
estándares de nivel
internacional
PLACEMA es una plataforma tecnológica que brinda servicios de alta complejidad en el área de las células madre
reprogramadas (CMR) humanas, siguiendo normativas internacionales de
Buenas Prácticas de Manufactura. Sus
servicios cubren las demandas del sector académico, de la industria farmacéutica y de la clínica.
DEVELOPMENT OF NOVEL
TECHNOLOGIES UNDER STRICT
INTERNATIONAL STANDARDS
PLACEMA is a technological platform
that offers high complex services in
the field of induced pluripotent stem
cells (iPSCs), following international
regulations of good manufacturing
practices (GMP). Its services include
demands of pharmaceutical, academic
and clinical areas.
Servicios
Producción de CMR humanas y derivados para:
· generación de modelos in vitro de estudio de enfermedades.
· generación de modelos celulares de testeo de toxicidad de drogas.
· uso en terapias regenerativas aplicadas a seres humanos.
services
Production of human iPSCs and their derivatives for:
· Generation of in vitro models for disease studies.
· Generation of cellular models for drug toxicity testing.
· Use in regenerative therapies applied to humans.
CONTROLES DE CALIDAD PARA LA GENERACIÓN
DE PRODUCTOS CELULARES
QUALITY CONTROLS FOR THE GENERATION OF
CELL PRODUCTS
· Silenciamiento de los transgenes de reprogramación.
· Caracterización de pluripotencia I (RT-PCR de RNA de
· Reprogramming transgene silencing.
· Characterization of Pluripotency I (RT-PCR of iPSCs
·
·
·
·
·
·
·
·
·
CMR para detectar la expresión de genes de pluripotencia: SOX2 - OCT4 - HGDF3 - Rex 1 - pH34 – Nanog).
Caracterización de pluripotencia II (inmunocitoquímica de CMR contra marcadores de pluripotencia:
Nanog - SSEA4 - OCT-4 - Tra 1-81).
Caracterización de pluripotencia III (generación de
cuerpos embrioides por diferenciación espontánea
a los tres linajes embrionarios, en ausencia de factores que promuevan el estado de pluripotencia).
Caracterización de pluripotencia IV (RT-PCR de genes específicos de los 3 linajes en cuerpos embrioides - Endodermo: AFP y CXCR4, Mesodermo: Brachyury y PECAM, Ectodermo: MAP2 y PAX6).
Caracterización de pluripotencia V (inmunocitoquímica de cuerpos embrioides contra marcadores correspondientes a los 3 linajes y analizadas
en microscopio de fluorescencia. Ectodermo: DCX y
BetaIII Tubulina, Mesodermo: Desmina y Troponina,
Endodermo: Gata 4 y AFP).
Viabilidad al descongelar.
Micoplasma.
Esterilidad de los clones de CMR congelados.
Cariotipo.
·
·
·
·
·
·
·
RNA to detect expression of pluripotency genes:
SOX2 - OCT4 - HGDF3 - Rex 1 - PH34 - Nanog).
Characterization of Pluripotency II (Immunocytochemistry
of iPSCs against pluripotency markers: Nanog - SSEA4 OCT-4 - Tra 1-81).
Characterization of Pluripotency III (Generation of
embryoid bodies by spontaneous differentiation into
the three embryonic lineages in the absence of factors
that promote a pluripotent state).
Characterization of Pluripotency IV (RT-PCR of
specific genes in specific genes of the three lineages
in embryoid bodies: Endoderm: AFP and CXCR4,
Mesoderm: Brachyury and PECAM, Ectoderm: MAP2
and PAX6).
Characterization of Pluripotency V (Immunocytochemistry
of embryoid bodies against markers corresponding to the
three lineages and analyzed in a fluorescence microscope.
Ectoderm: DCX and BetaIII Tubulina, Mesoderm: Desmina
and Troponina, Endoderm: Gata 4 and AFP).
Viability on thawing.
Mycoplasma.
Sterility of iPSC frozen clones.
Karyotype.
Equipamiento
EquipMENT
· Cabinas de bioseguridad biológica.
· Incubadoras con control automático de CO2 y O2.
· Ultrafreezer.
· Termo de nitrógeno líquido con control electrónico
· Biosafety Cabinets.
· CO2 /O2 Incubators.
· Ultrafreezers.
· Cryopreservation Systems.
· Inverted microscopes.
de alimentación.
· Microscopios invertidos.
7
SERVICIO DE DESCUBRIMIENTO, DISEÑO Y
DESARROLLO PRE-CLÍNICO DE FÁRMACOS
DE LA ARGENTINA (SEDIPFAR)
Service of Drug Discovery, Design and Preclinical
Development of Argentina
Director: Dr. Claudio Fernández
· Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario - Universidad Nacional de Rosario –
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (IBR-UNR-CONICET).
· Universidad Nacional de Córdoba (UNC).
· Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET).
www.sedipfar.com.ar · [email protected] · Tel: (054341) 423-7868
SERVICIOS ESPECIALIZADOS EN
DESARROLLO Y ANÁLISIS DE QUÍMICA
FARMACÉUTICA, DE BIOTECNOLOGÍA EN
SALUD HUMANA, ANIMAL Y VEGETAL
SEDIPFAR es una plataforma tecnológica de
última generación orientada hacia el descubrimiento, diseño racional y desarrollo preclínico
de sustancias químicas y biológicas con potencial terapéutico para combatir enfermedades
de alto impacto en la salud de la población a
partir del conocimiento de su blanco molecular.
Sus servicios son innovadores, integrados y de
alta tecnología, y están dirigidos a sectores de
I+D de entidades públicas y privadas.
SERVICES SPECIALIZED IN
DEVELOPMENT AND ANALYSES
OF MEDICINAL CHEMISTRY AND
BIOTECHNOLOGY FOR HUMAN,
ANIMAL AND PLANT HEALTH
SEDIPFAR is a next-generation technological
platform oriented towards the discovery, rational
design and preclinical development of chemical and
biological substances with therapeutic potential
against diseases that have high impact on the
population’s health.
Its services are innovative, integrated and of
high technology. They are aimed at I+D sectors
belonging to both public and private entities.
Servicios
services
· Consultoría, entrenamiento en el uso y alquiler de
· Consultancy, training for the use and rent of high-
·
·
·
·
·
equipamiento de alta tecnología para determinaciones fisicoquímicas, biofísicas, bioensayos y microscopía de avanzada.
Síntesis de compuestos químicos por encargo y optimización de las sustancias químicas identificadas
pre-existentes con el objeto de incrementar su eficacia y biodisponibilidad.
Screening de alto contenido de bibliotecas de compuestos químicos con potencial farmacológico por
metodologías in silico, in vitro e in vivo.
Diseño de la puesta a punto y ejecución de ensayos
para validar la eficacia de compuestos químicos y/o
biológicos sobre líneas celulares y modelos in vivo
de diferentes patologías.
Análisis biofísico, espectroscópico y estructural de
la unión de ligandos químicos a biomoléculas que
sean blancos moleculares para el tratamiento de
una determinada patología.
·
·
·
technology equipment for physicochemical and
biophysical measurements, bioassays and advanced
microscopy.
Synthesis of requested chemical compounds and
optimization of pre-existing chemical substances in
order to enhance their efficiency and bioavailability.
High throughput screening of chemical libraries with
pharmacological potential by in silico, in vitro and in
vivo methods.
Set up and performance of assays to validate the
efficiency of chemical and biological compounds by
using cellular lines and in vivo models of different
pathologies.
Biophysical, spectroscopic and structural analysis of
the binding of chemical ligands to biomolecules which
are targets for the treatment of certain pathologies.
Equipamiento
EquipMENT
· Espectrómetro de Resonancia Magnética Nuclear
· Nuclear Magnetic Resonance Spetrometer 600MHz
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de 600MHz con criosonda.
Espectrómetro de Dicroismo Circular.
Fotómetro de dispersión de luz dinámica (DLS).
Calorímetro de titulación isotérmica (ITC).
Espectrofluorómetro.
Lector fluorescente multiparamétrico de placas.
Microscopio invertido de fluorescencia confocal y de
fluorescencia automático con incubadora para control de atmósfera y temperatura para screening de
alto contenido en cultivos celulares.
Cromatógrafos analíticos y preparativos de alta eficiencia con serie de diodos y detector evaporativo
de luz dinámica: líquido (HPLC-UV-ELSD) y en contra corriente (HPCCC-UV-ELSD).
·
·
with CryoProbe.
Circular Dichroism Spectroscopy.
Dynamic Light Scattering (DLS).
Isothermal titration calorimetry (ITC).
Spectrofluorometer.
Multiparameter fluorescence plate reader.
Fluorescence inverted confocal and automatic fluorescence
microscope with atmosphere and temperature control
incubator for high content screening of cell cultures.
Preparative and analytical high performance counter
current chromatography with diodo array and
evaporative light scattering detection (HPCCC-UVELSD).
Preparative and analytical high-performance liquid
chromatography with diodo array and evaporative
light scattering detection (HPLC-UV-ELSD).
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PLATAFORMA BIOINFORMÁTICA
ARGENTINA (BIA)
Argentine Center of Bioinformatics
Director: Dr. Adrián Turjanski
· Facultad de Ciencias Exactas y Naturales - Universidad de Buenos Aires (FCEyN-UBA).
· Universidad Nacional de San Martín (UNSAM).
· Instituto de Agrobiotecnología de Rosario (IndeAR).
· Facultad de Ingeniería - Universidad Católica de Córdoba (FI-UCC).
www.biargentina.com.ar · [email protected]
Tel: (05411) 4576-3387 int. 123
Almacenamiento, procesamiento,
clasificación y análisis de
grandes bases de datos
STORAGE, PROCESSING,
CLASSIFICATION AND ANALYSIS OF
LARGE DATA BASES
La Plataforma Bioinformática Argentina brinda acceso a infraestructura computacional de
avanzada, desarrolla métodos, algoritmos y herramientas en diversas ramas bioinformáticas y
forma recursos humanos a través de cursos y
capacitación de personal, cubriendo necesidades identificadas del sector público y privado.
BIA gives access to advance computational
infrastructure. BIA develops methods, algorithms
and tools in different areas of bioinformatics.
Moreover, it offers training of human resources
through courses and training staff, covering
identified needs both of the public and private
sectors.
Servicios
ServicES
· Acceso a infraestructura computacional de avan-
· Access to advanced computational infrastructure:
·
·
·
·
·
·
zada: almacenamiento (storage); cómputo (highperformance computing)
Análisis de grandes volúmenes de datos biológicos:
datos de proyectos de Whole_genome de novo o
re-sequencing; transcriptómica y metagenómica;
diseño de experimentos de Microarrays; análisis de
datos de Microarrays; RNA-Seq; Chip-Seq; SNPs;
QTLs y marcadores moleculares. Métodos estadísticos-computacionales.
Búsqueda virtual de fármacos, diseño de proteínas
para uso biotecnológico, quimioinformática, modelos farmacocinéticos y análisis estructural de biomoléculas.
Desarrollo de bases de datos customizadas para
usos específicos.
Minería de bases de datos biotecnológicos.
Desarrollo de software: scripts y pipelines para automatizar procesos requeridos por el usuario; software a medida y optimización del producto; generación de interfaces.
Documentación y licenciamiento de software.
·
·
·
·
·
·
storage, high-performance computing.
Analysis of large-volume biological data: project
data of de novo whole genome or re-sequencing;
transcriptomics and metagenomics; design of
microarray experiments; analysis of microarray
data; RNA-Seq; Chip-Seq; SNPs; QTLs and molecular
markers. Computational-statistical methods.
Virtual search of drugs, protein design for biological
use, Chemoinformatics, pharmacokinetic modeling,
structural analysis of biomolecules.
Development of customized data sets for specific
uses.
Biotechnological data mining.
Software development: scripts and pipelines to automatize
processes required by the user; custom software and
product optimization; interface generation.
Software documentation and licensing.
Equipamiento
EquipMENT
· Cluster de procesamiento 816 cores y storage de
· Processing cluster of 816 cores and 100 TB storage.
· Processing cluster and storage for sequencing experiments.
· Development and analysis clusters for BioData Mining.
· Data base server.
100 TB.
· Cluster de procesamiento y storage para experimentos de secuenciación.
· Cluster de desarrollo y análisis de BioData Mining.
· Servidor de bases de datos.
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CENTRO DE TRANSFERENCIA E
INVESTIGACIÓN EN INGENIERÍA DE
SOFTWARE (CETIS)
Center of Transference and Research in
Software Engineering
Director: Dr. Sebastián Uchitel
· Facultad de Ciencias Exactas y Naturales – Universidad de Buenos Aires (FCEyN-UBA).
· Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET).
· Universidad Nacional de Córdoba (UNC).
www.cetis-software.com.ar · [email protected]
Tel: (05411) 4576-3390 int. 704
TECNOLOGÍA DE VERIFICACIÓN Y
VALIDACIÓN DE PUNTA
CETIS busca extender el estado del arte de
la ingeniería de software asistida por computadora, desarrollando productos y servicios innovadores que agreguen valor al sector productivo vinculado con el software.
El Centro además pretende formar agentes
de cambio, recursos humanos capaces de
lograr un salto cualitativo en las capacidades tecnológicas del software, permitiendo
que se produzca software más innovador,
de mayor calidad, más eficiente y con mayor
valor agregado.
LEADING TECHNOLOGY FOR
VERIFICATION AND VALIDATION
CETIS aims to extend the state-of-the-art
of computer-assisted software engineering,
by developing products and innovative
services which add value to government and
industry.
The center also aims to train human resources
that are capable of producing a qualitative
step in the technological capabilities of
software development, allowing the creation
of more innovative software, of higher quality,
more efficiently and with more added value.
Servicios
services
· Diagnóstico de prácticas de desarrollo: relevamiento
· Diagnosis of development practices: survey and
·
·
·
·
·
·
·
y evaluación de las prácticas de desarrollo de software tendientes a identificar fortalezas, debilidades
y oportunidades de mejora focalizadas en incorporación de tecnología del estado del arte.
Verificación y validación independiente: evaluación
de la calidad de artefactos vinculados al desarrollo
de software generados por el adoptante, provisión
de evaluaciones cuantitativas o cualitativas rigurosas de acuerdo a normas y estandares internacionales pactados.
Cursos del estado de práctica: capacitación para
“nivelar”, tendientes a definir un lenguaje común y
conocimientos de base como para poder comenzar
un ciclo de incorporación de tecnología del estado
del arte.
Cursos del estado del arte: capacitación teórica y
práctica, tanto de divulgación como con vistas a incorporación de tecnología, en técnicas de automatización de actividades de validación y verificación de
software.
Implantación de tecnología avanzada: selección y
aplicación de tecnología de punta de automatización, en el contexto de un proyecto de la organización adoptante que puede ser usuaria final de la
tecnología o desarrolladora de un servicio y/o producto sobre el conocimiento transferido.
Asesoría en I+D+i: confección conjunta de estrategias I+D+i con vistas a realizar desarrollos a mediano plazo en la automatización de actividades de
validación y verificación dentro de la organización o
para la provisión de servicios y productos.
Liderazgo de proyectos I+D+i: colaboración en proyectos de mediano plazo que generen resultados de
automatización y en donde existan desafíos científico-tecnológicos importantes.
·
·
·
·
·
assessment of software development practices designed
to identify strengths, weaknesses and opportunities for
improvement focused on incorporating state-of-the-art
technology.
Independent verification and validation: quality
assessment of software development products
(code, designs, etc.), providing rigorous quantitative
and qualitative assessments according to agreed
international standards.
State of practice courses: leveling courses aimed at
reaching a common language and knowledge base
to be able to initiate projects that introduce stateof-the-art technology.
State-of-the-art courses: theoretical and practical
training, both for the dissemination and adoption of
technology, in automated software verification and
validation technology.
Deployment of advanced technology: selection and
deployment of automation technology in the context
of a specific project in an organization that may be
the end user of the technology or the developer of a
service and/or product based on this technology.
I+D+i consulting: Elaboration of I+D+i strategies
for medium-term developments in automated
verification and validation within an organization.
I+D+i projects leadership: collaboration in the
development of medium-term projects aiming to produce
automated verification and validation technology.
Fotografía: INTI Comunicación
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Investigación y desarrollo de
productos y procesos farmoquímicos
y farmacéuticos (INDEFAR)
RESEARCH AND DEVELOPMENT ON FINE CHEMICAL AND
PHARMA PRODUCTS AND PROCESSES
Directora: Dra. María Julieta Comin
· Instituto Nacional de Tecnología Industrial (INTI).
· Unidad de Microanálisis y Métodos Físicos Aplicados a Química Orgánica (UMYMFORFCEyN-UBA – CONICET).
· Universidad Nacional de Quilmes (UNQ).
www.inti.gob.ar/quimica/indefar · [email protected]
Tel: (054001) 4724 6200/300/400. Interno 6989
SERVICIOS DE ALTA CALIDAD EN SÍNTESIS
QUÍMICA Y BIOTRANSFORMACIONES.
DESARROLLO ANALÍTICO Y DE
FORMULACIONES DE LIBERACIÓN
CONTROLADA.
HIGH QUALITY SERVICES IN CHEMICAL
SYNTHESIS AND BIOTRANSFORMATIONS.
ANALYTICAL AND CONTROLLED RELEASE
FORMULATIONS DEVELOPMENTS.
La Plataforma busca contribuir al acceso socialmente justo a los medicamentos y facilitar la transferencia de tecnología impulsando
la innovación. INDEFAR pretende potenciar las
capacidades y esfuerzos del sector público en
nuestro país y procurar el crecimiento, la diversificación y la competitividad del sector farmoquímico y farmacéutico
The platform aims to promote equitable access
to medicines and to facilitate technology
transfer to drive innovation. By enhancing skills
and efforts of the public sector INDEFAR seeks
to contribute to the growth, diversification and
competitiveness of pharma and fine chemical
companies.
Fotografía: INTI Comunicación
INDEFAR está integrada por un equipo multidisciplinario con amplia experiencia en gestión y probada trayectoria científico-tecnológica en los
campos de la síntesis orgánica, la química analítica y los sistemas de liberación controlada.
INDEFAR is integrated by a multidisciplinary
team with extensive management and
scientific experience in the fields of organic
synthesis, analytical chemistry and controlled
release systems.
SERVICIOS
services
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· Synthetic Process Develpment.
· Custom Synthesis.
· Synthesis of focused libraries.
· Biocatalysis and Biotransformations.
· Reactions optimization and scale up.
· HPLC and Method Development and Validation.
· Synthesis, isolation and identification of process
Desarrollo de procesos sintéticos.
Síntesis por encargo.
Síntesis de bibliotecas enfocadas.
Biocatálisis y biotransformaciones.
Optimización y escalado de reacciones.
Desarrollo, validación y transferencia de métodos analíticos de intermediarios de proceso, APIs y productos
terminados.
· Síntesis, aislamiento e identificación de impurezas de
Proceso y sustancias relacionadas.
· Determinación de compuestos en matrices biológicas.
· Diseño, desarrollo y caracterización de sistemas de
liberación controlada basados en tecnologías de micro/
nano encapsulación.
impurities and related substances.
· Identification of compounds in biological matrices.
· Design, development and characterization of
controlled release systems based on technologies
of micro-nano encapsulation.
EquipMENT
EQUIPAMIENTO
· Bruker AC-400 Nuclear Magnetic Resonance
· Espectrómetro de Resonancia Magnética Nuclear Bruker
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AC-400
CLAR-EM-EM Waters Quattro Premier XE
IPC-Masa Perkin Elmer Elan DRC II
CG-EM Shimadzu QP 2010 Ultra
Cromatógrafo Flash CombiFlash Rf-Teledyne Isco
CLAR Analítico y Preparativo Shimadzu LC- 8A
Microscopio óptico Carl Zeiss modelo AXIOLAB FL
Microscópio electrónico de barrido (SEM) Phillips 505 y
LEI Quanta 250.
Analizador de tamaño de partícula por difracción láser
(Mastersizer Micro, Malvern) y dispersión dinámica de la
luz (Zetasizer Nano ZS, Malvern).
Reactor de vidrio QVF (-45 a 150°C)
Reactor de acero vidriado 70L Pfauler (-15 a 150°C)
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Spetrometer
HPLC-MS-MS Waters Quattro Premier XE
Spectrometer
Perkin Elmer Elan DRC II ICP-Mass
GC-MS Shimadzu QP 2010 Ultra
Flash CombiFlash Rf-Teledyne Isco Chromatography
HPLC Shimadzu LC- 8 A Preparative Liquid
Chromatography
AXIOLAB FL Carl Zeiss Optical Microscope
Phillips 505 and LEI Quanta 250 Scanning Electron
Microscope
Particle size analyzers by laser diffraction and
dynamic light scattering (Mastersizer Micro,
Malvern) y dispersión dinámica de la luz (Zetasizer
Nano ZS, Malvern)
30L QVF Glass reactor (-45 to 150°C)
70L glass-lined Pfauler reactor (-15 a 150°C).
Godoy Cruz 2320 (C1425FQD)
Ciudad Autónoma de Buenos Aires - República Argentina
www.mincyt.gob.ar