EFECTO DE LAS VARIABLES PRE-ÁNALITICAS EN LA CALIDAD DE LAS

EFECTO DE LAS VARIABLES PRE-ÁNALITICAS EN LA CALIDAD DE LAS
MUESTRAS DE PLASMA ALMACENADAS EN LOS BIOBANCOS PARA SU
UTILIZACIÓN EN PROTEÓMICA
Albar JP.2, Blanco FJ.3, Corrales F.4, Elortza F.5, Iloro I.5, Marcilla M.2, Mateos J.3, Sanchez del
Pino M.6, Valero L.6, Carneiro I.1, Fernández V.7, Fortuño MA.8, García-Sánchez M.9, Martínez
R.10, Muñoz MA.11, Rodriguez C.12, Doménech N.1. ProteoRed y Grupo Derivados Hemáticos
de la RNBB.
1 Biobanco
A Coruña. Instituto Investigación Biomédica A Coruña (INIBIC), A Coruña.
Nacional de Biotecnología (CNB)-CSIC, Madrid
3 Instituto de Investigación Biomédica (INIBIC), A Coruña
4 Centro de Investigación en Medicina Aplicada (CIMA)-UN, Pamplona
5 Centro de Investigación Cooperativa (CIC)-Biogune, Bilbao
6 Universidad de Valencia (UV), Valencia
7 Biobanco del Hospital Clínico y Provincial de Barcelona-IDIBAPS, Barcelona.
8 Biobanco de la Clínica Universidad de Navarra, Navarra
9 Biobanco del Hospital Virgen Macarena, Sevilla
10 Biobanco del Hospital Virgen de La Arrixaca, Murcia
11 Biobanco del Hospital Gregorio Marañón, Madrid.
12 Biobanco Vasco/Centro Vasco de Transfusiones, País Vasco.
2 Centro
Introducción:
La analítica proteómica ha experimentado un enorme avance en la última
década y permite llevar a cabo importantes estudios de búsqueda de
biomarcadores diagnósticos o terapéuticos. Este tipo de análisis requiere la
utilización de un elevado número de muestras humanas en cuya recopilación,
procesamiento y almacenamiento van a estar directamente implicados los
Biobancos. Para ello necesitan disponer de herramientas de análisis de la
calidad muestral que permitan excluir del análisis todas aquellas muestras que
no cumplan los requisitos mínimos de calidad.
Objetivo:
Identificar indicadores adecuados para el control de calidad de las muestras de
plasma almacenadas en los biobancos con fines de investigación en
proteómica.
Materiales y métodos:
1) Se obtuvieron muestras de plasma de 100 donantes sanos divididos por
sexos y por edad.
2) Las muestras se procesaron en función de diferentes variables preanalíticas:
a) Ciclos de congelación-descongelación (1, 2 o 3) o b) Tiempo de demora en
la primera centrifugación tras la extracción de la sangre (4 y 24 horas).
3) Se realizó el análisis de las muestras mediante distintas técnicas
proteómicas: a) Geles monodimensionales y LC-MALDI-TOF/TOF, b) SPEMALDI-TOF, c) DIGE y d) Análisis mediante MRW.
Resultados:
En general, tras un análisis exhaustivo de los resultados obtenidos utilizando
los distintos análisis proteómicos no se han detectado claros indicios de
degradación proteica progresiva ni con el número de ciclos de congelacióndescongelación (1, 2 o 3) ni con la demora en la primera centrifugación (4h o
24 h). Solo se observan algunas pequeñas diferencias en dos posibles
marcadores: 1) ApoB100 (ciclos de descongelación) y 2) Hemoglobina
(demora en la centrifugación).
Conclusión:
Los datos indican que la existencia de hasta tres ciclos de congelacióndescongelación o el procesamiento tardío de las muestras sanguíneas
producen poco o ningún efecto en la estabilidad de las proteínas de las
muestras de plasma obtenidas.