SEPARACIÓN DE BIOMOLÉCULAS. 1) Suponga que desea

CÁTEDRA: BIOQUÍMICA
Carreras: Farmacia
Profesorado en Química
Licenciatura en Química
Licenciatura en Alimentos
SEPARACIÓN DE BIOMOLÉCULAS.
1) Suponga que desea purificar por cromatografía de intercambio iónico una
enzima del metabolismo del ADN, cuyo sustrato es precisamente ADN.
¿Seleccionaría una resina de intercambio aniónico o catiónico? ¿Por qué?
2) La cromatografía de filtración en gel o de tamiz molecular es un método de
separación proteica basado en el tamaño (o, más precisamente, en el radio
efectivo en solución, el cual es proporcional, para proteínas esféricas, a la raíz
cúbica del peso molecular). Una solución proteica se coloca en una columna
empacada con pequeñas esferas de polímeros suficientemente hidratados y
entrecruzados (Sephadex). Las proteínas de tamaños diferentes varían en su
capacidad de penetrar los poros hidratados de las esferas. Las proteínas
pequeñas penetran en estos poros y a medida que bajan en la columna lo
hacen más lentamente que las proteínas de mayor tamaño. Una segunda
técnica de separación de proteínas es la electroforesis en disco: aquellas se
someten a un campo eléctrico en un soporte en gel de poliacrilamida. Cuando
se lleva a cabo la electroforesis en presencia de un agente desnaturalizante, el
dodecil sulfato de sodio (SDS), las moléculas proteicas se separan por tamaño
(Las más pequeñas migran más rápidamente). (El SDS desnaturaliza las
proteínas uniéndose a ellas en forma no específica y dándoles una relación
constante de carga/masa).
Ambos procedimientos separan a las proteínas según el tamaño y utilizan
polímeros entrecruzados como medio de soporte. ¿Cómo es posible que en la
filtración en gel las moléculas pequeñas se retardan con respecto a las
mayores, mientras que en electroforesis en gel de poliacrilamida ocurre lo
contrario?
3) Usted tiene una mezcla de tres proteínas A, B y C, con pI de 3,5, 6,5 y 10,0
respectivamente, y quiere separarlas por una columna de DEAE-celulosa.
Teniendo en cuenta que el grupo DEAE tiene un pKa = 9,5. ¿Qué pH usaría
para la separación? ¿Qué orden de elución esperaría encontrar si agrega un
gradiente de KCl entre 0 a 1 M?
4) La carboximetilcelulosa es una resina de intercambio catiónico con un pKa
de 4,5. Ud. tiene tres proteínas A, B y C de pI 5, 8 y 10 (no estrictamente en
ese orden). Al sembrarlas en esta resina y aplicando un gradiente de pH de
menor a mayor eluyen en el siguiente orden: B- A- C. Estas mismas proteínas,
en una columna de Sephadex G-100 eluyen como de un peso molecular de
50.000, 100.000 y 75.000 y en el siguiente orden: A, B y C. En un gel con SDS
A y C presentaron una única banda de PM 50.000 y B presentó dos bandas de
PM 50.000 y 25.000. Identifique A, B y C.
5) Escriba el orden de elución de las siguientes proteínas al aumentar el
gradiente salino. Se utilizan columnas de intercambio iónico: a) citocromo c (pI=
10,5), lisozima (pI= 11,0), albúmina de huevo (ovoalbúmina, pI= 4,6),
1
mioglobina (pI= 7,0), de una columna de intercambio aniónico. b) citocromo c
(pI= 10,5), pepsina (pI= 1,0), ureasa (pI= 5,0) y hemoglobina (pI= 6,8) de una
columna de intercambio catiónico. Explique sus respuestas.
6) Tres proteínas de puntos isoeléctricos 5,2 , 7,3 y 6,3 se denominaron con las
tres primeras letras del alfabeto griego según su posición en un
isoelectroenfoque, siendo alfa la más cercana al ánodo y gamma la más
cercana al cátodo. a) ¿Cuál es el pI de cada una? b) ¿Cuál de las proteínas
eluirá primero durante una cromatografía en carboximetilcelulosa a pH 6? ¿Por
qué? c) Si alguna proteína quedara retenida, ¿cuál o cuáles serían y cómo las
eluiría? d) Durante una electroforesis en poliacrilamida en condiciones
desnaturalizantes a pH 8, beta presentó la mayor movilidad electroforética. ¿Es
posible? ¿Por qué?
7) Las proteínas denominadas histonas juegan un papel clave en el
empaquetamiento del ADN. Este se enrolla alrededor de las histonas para
formar los nucleosomas, partículas engarzadas como las cuentas de un collar.
Una mezcla de tres proteínas globulares, entre ellas la histona H4, presenta la
siguiente composición de aminoácidos:
Proteína
A
B
C
Asp y Glu
90
50
6
Número de Residuos
Arg, Lys e His
5
10
27
Otros AA
105
60
69
Mediante un isoelectroenfoque se determinaron los puntos isoeléctricos de las
tres proteínas obteniéndose los siguientes valores: 3,0, 5,5 y 9,5. Los pesos
moleculares obtenidos por cromatografía de exclusión molecular fueron de 15
kDa, 11,3 kDa y 21,5. a) lndique el punto isoeléctrico, el peso molecular y el
orden de elución en la columna cromatográfica de las tres proteínas. b) En
base a sus conocimientos, ¿podría decir cuáI de las tres proteínas es H4?
Fundamente su respuesta.
8) Usted necesita separar una mezcla de tres péptidos con actividad biológica.
Los mismos poseen la siguiente secuencia:
I.
Asp-Gly-Glu-His-Pro-Ala-Ala-Asp-Ser-Thr
II.
Gly-Tyr-Ile-Ala-Phe-Gly-Leu-Val-Trp-Ala
III.
Gly-Ala-His-Lys-Ser-Gln-Thr-Asn-Lys
Para ello cuenta con los siguientes soportes para realizar cromatografía líquida:
DEAE-celulosa (-O-CH2-CH2-N+(C2H5)2H), sulfometilcelulosa (-O-CH2SO3-),
Butil Sepharosa (-CH2-CH2-CH2-CH3) y Sephadex G-50.
Describa un protocolo adecuado para la separación de estas tres biomoléculas
e indique el fundamento de su decisión.
9) Ud. está buscando afanosamente una sustancia presente en el espárrago
violeta de la Antártida, que cura (según dicen) el resfrío de los guanacos. En
sus estudios termina purificando 2 proteínas que no le curan el resfrío a nadie,
pero que dan cristales violetas muy bonitos. Ambas proteínas tienen el mismo
peso molecular en condiciones nativas (40.000), pero la composición de
aminoácidos es muy distinta, salvo para las cisteínas. Tanto la proteína A como
2
la B tienen 2 cisteínas. El análisis de la proteína A pura indica que tiene un solo
tipo de aminoácido N-terminal (treonina), pero el análisis de la proteína B reveló
la existencia de 2 tipos de extremos N-terminales (alanina y serina).
a) ¿Qué le sugiere que las proteínas corridas en un gel PAGE-SDS, no teñido
con azul de Coomassie, den bandas de color violeta?
b) ¿Qué le indica la presencia de un solo tipo N-terminal en la proteína A y de
dos tipos N-terminales en la proteína B?
Cuando Ud. trata a la proteína A con urea, ya sea en presencia o en ausencia
de mercaptoetanol, ésta da una única banda de 40.000 Daltons en un gel de
poliacrilamida con SDS. La proteína B, en cambio, se descompone en 2
subunidades (una de 30.000 y otra de 10.000 Daltons) sólo cuando se la trata
con urea y mercaptoetanol. Ni la urea ni el mercaptoetanol solos la disocian.
c) ¿Qué infiere de estos resultados respecto de la estructura terciaria y
cuaternaria de las proteínas A y B?
d) ¿Por qué es tan diferente la respuesta al mercaptoetanol pese a que
ambas proteínas tienen 2 residuos de cisteína?
e) ¿Por qué no basta la urea para disociar la proteína B? ¿Por qué no basta el
mercaptoetanol para disociar la proteína B?
10) Una proteína en su estado nativo tiene un peso molecular de 115.000.
a) Deduzca su estructura cuaternaria (número de subunidades, PM de cada
una de ellas, uniones que las estabilizan y glicosilación de subunidades) a partir
de los resultados de los siguientes geles de poliacrilamida en los que se
sembró la proteína pura, la cual fue previamente sometida a tres tratamientos
(por separado) que se indican abajo. Al final de la corrida electroforética, los
geles fueron teñidos con Coomassie Blue, que es un colorante azul que tiene
afinidad por las estructuras peptídicas.
Tratamientos previos:
SDS
mercaptoetanol
ENDO-H (corta la unión
proteína-azúcar)
1
SI
NO
NO
2
SI
SI
NO
3
SI
SI
SI
b) La sensibilidad del Coomassie Blue es tal que es capaz de detectar a partir
de aproximadamente 0,2 µg de proteína/banda. ¿Cree Ud. que es correcto
afirmar que una proteína está pura si da una sola banda en un gel teñido con
ese colorante?
3
11) Un investigador letón tiene serios problemas para caracterizar una enzima
que ha purificado y la acción que tiene sobre ella el compuesto X, un aparente
activador. En la Fig. 1 se ve una migración en un gel nativo de poliacrilamida,
teñido con azul de Coomassie. En la calle 1, la proteína se incubó previamente
con el compuesto X; en la 2, no.
Figura 1
Con el material proteico eluido a partir de cada una de las tres bandas del gel
nativo (A, B y C), él hizo un ensayo de actividad, en presencia y en ausencia
del compuesto X (Tabla 1).
Tabla 1
Fuente de enzima
utilizada
Banda C
Banda A
Banda B
Actividad enzimática
medida con X
100
100
2
Actividad enzimática
medida sin X
2
100
2
Ya bastante confundido, el científico letón decidió correr esos polipéptidos
anteriormente extraídos a partir de cada una de las bandas (A, B y C) en un gel
de poliacrilamida, pero esta vez con SDS (Fig. 2). Luego de ver el resultado,
respiró aliviado:
Figura 2
4
a) ¿Cómo es la estructura de la proteína y cómo la afecta el compuesto X?
b) ¿Cómo explica que la banda A haya migrado más rápido que la B en el gel
nativo?
12) La proteína heterodimerina está formada por 2 subunidades unidas por
puentes disulfuro según se indica en la figura. Se muestran también parte de la
secuencia aminoacídica de la subunidad B, correspondiente a su porción
carboxi-terminal, y un esquema del mRNA que la codifica con una porción de
secuencia nucleotídica correspondiente.
a) ¿Cuántas bandas y de qué tamaño observaría en dos electroforesis (una
con y otra sin tratamiento previo de la muestra con mercaptoetanol) en gel de
poliacrilamida con SDS de la heterodimerina pura? Justifique. La enfermedad
hereditaria heterodimerosis es causada por una mutación en el gen B que
produce una terminación prematura de la traducción del RNA mensajero de la
subunidad B en el punto donde indica la flecha.
b) ¿Cuántas bandas y de qué tamaño observaría en dos electroforesis (una
con y otra sin tratamiento previo de la muestra con mercaptoetanol) en gel de
poliacrilamida con SDS de la heterodimerina pura de un paciente homocigota
para la mutación arriba mencionada? Justifique.
c) ¿Cuántas bandas y de qué tamaño observaría en dos electroforesis (una con
y otra sin tratamiento previo de la muestra con mercaptoetanol) en gel de
poliacrilamida con SDS de la heterodimerina pura de un paciente heterocigota
para la mutación arriba mencionada? Justifique.
13) Un grupo de investigadores dedicados al estudio de diversos tipos de
anemias hereditarias detectó una hemoglobina con la movilidad electroforética
alterada. Una digestión con tripsina de esta hemoglobina demostró que la
alteración se hallaba en la cadena  estando ausente el péptido amino terminal
normal (Val-His-Leu-Thr-Pro-Glu-Glu-Lys). Se encontró un nuevo péptido
tríptico formado por 6 residuos de aminoácidos, siendo Val su residuo amino
terminal.
a) ¿Qué sustituciones de aminoácidos son consistentes con estos datos?
5
b) ¿Qué cambio en una sola base en la secuencia del ADN puede ocasionar
estas sustituciones de aminoácidos? La secuencia del ADN que codifica para la
región amino terminal normal es 5´-GTGCACCTGACTCCTGAGGAGAAG-3´.
c) ¿Cómo será la movilidad electroforética a pH 8 de esta hemoglobina
comparada con la de la hemoglobina normal?
d) Cuando se hace una electroforesis en gel de poliacrilamida en condiciones
desnaturalizantes de la cadena  de la hemoglobina normal se encuentra que
migra con una relación de frente de 0,65 ¿Qué relación de frente espera
encontrar para la cadena  de la hemoglobina alterada?
e) La hemoglobina normal (PM 64.500) y la mutada fueron sometidas a una
filtración molecular en una columna previamente calibrada. Las proteínas
marcadoras y los volúmenes de elución se indican en la tabla; el volumen total
de la columna fue de 260 ml y el volumen de exclusión determinado con azul
de dextrano fue de 100 ml. ¿Qué volúmenes de elución espera para los 2 tipos
de hemoglobinas?
Proteína marcadora
Ribonucleasa
Quimotripsinógeno
Ovoalbúmina
Albúmina
Aldolasa
Catalasa
Volumen de elución
(ml)
250
230
210
195
165
150
MM (kDa)
13,7
25,0
43,0
67,1
158,2
231,9
14) El cromatograma de una muestra de proteínas en Sephadex G-200 fue el
siguiente:
G licera ld e h id o
3 -P -d e sh id ro g e n asa
C o n ce n tra ción
d e p ro te ína
e n e l e lu íd o
A ldo la sa
M iog lo b in a
C ata lasa
O vo a lbú m .
159
213
234
24 4
2 85
N º d e fra cció n
Las proteínas marcadoras fueron las siguientes:
Proteína
PM (x10-4) N° de fracción
Aldolasa
16
159
Catalasa
6
213
Ovoalbúmina
4
234
Mioglobina
1,6
285
Kav = Ve - Vo
Vt - Vo
Se recogieron fracciones de 1,6 ml y el volumen vacío de la columna
previamente determinado con azul de dextrano fue de 200 ml. Vt = 500 ml.
6
Se quiere determinar el PM de la gliceraldehido-3-P-deshidrogenasa.
Utilizando la misma columna, en las mismas condiciones se observó que la
enzima aparece en la fracción 244. Indique el peso molecular de la misma.
15) Se purificó a homogeneidad una inmunoglobulina G (IgG), la cual posee
cuatro cadenas polipeptídicas, dos de 215 residuos de aminoácidos y dos de
500 residuos de aminoácidos. Estas 4 cadenas están unidas por puentes
disulfuro. Esta IgG es sometida a una electroforesis desnaturalizante (SDSPAGE) en presencia de 2 mercaptoetanol. Las proteínas marcadoras y sus
movilidades en dicho gel se indican en la tabla. El colorante migró 5,3 cm
desde el punto de siembra.
Proteína marcadora
Inhibidor de tripsina
Anhidrasa carbónica
Gliceraldehido 3-P-deshidrog.
Albúmina de huevo
Albúmina sérica bovina
Fosforilasa B
Migración (cm)
4,4
3,5
3,0
2,5
1,6
1,0
PM
20000
29000
36000
45000
66000
90000
a) ¿Cuál será la movilidad para cada subunidad de la IgG?
b) ¿Cuál es la masa aparente de la IgG?
c) ¿Cuántos nucleótidos codifican para esta proteína?
16) Usted tiene tres muestras de tres proteínas distintas a las que quiere
caracterizar. Con este objeto las siembra separadamente en una columna de
Sepharosa 6-B previamente calibrada con las siguientes proteínas:
Proteínas
Ribonucleasa de páncreas bovino
Quimotripsinógeno A
Ovoalbúmina
Albúmina de suero bovino
Aldolasa de músculo de conejo
Catalasa de hígado bovino
Ferritina de bazo de caballo
Tiroglobulina bovina
Ve (ml) MM (kDa)
250
13,7
230
25
210
43
200
67
170
158
150
232
130
440
116
669
El volumen de exclusión determinado con azul de dextrano fue de 100 ml y los
volúmenes de elución de las proteínas fueron A: 134 ml, B: 120 ml y C: 134 ml.
El volumen total de la columna fue de 260 ml. Posteriormente con muestras de
las proteínas se realizó una electroforesis en condiciones desnaturalizantes
(SDS-PAGE). Los resultados fueron:
Proteína
PEPC de maíz
Albúmina
Ovoalbúmina
Quimotripsinógeno
Migración
(cm)
0,4
2,8
4,8
7,4
kDa
110
67
43
25
7
Ribonucleasa
A (5 bandas)
10,2
13,7
2,2
3,4
5,6
7,8
10,0
B (2 bandas)
3,6
9,8
C (1 banda)
0,8
En base a estos datos caracterice a A, B, y C lo mejor que pueda teniendo en
cuenta que la corrida del frente es de 12 cm.
17) Ud. tiene 5 ml de una mezcla de triacilglicéridos y una proteína pura. Una
alícuota de 0,1 ml se agitó en benceno:agua (3 ml:2 ml). a) En qué fases se
distribuyen los distintos componentes de la mezcla?
Se sembró una alícuota de la fase que contenía la proteína en una columna
de Sepharosa 6-B previamente equilibrada. Se recogieron fracciones de 2 ml.
Las proteínas marcadoras fueron de pesos moleculares 160, 90, 60, 40, 16 kDa
y valores de Kav de 0,18; 0,36; 0,47; 0,60 y 0,87, respectivamente. El valor de
Kav de la muestra se calculó en 0,32. Además, se corrió una electroforesis con
SDS en las siguientes condiciones: I) La proteína se hirvió sin DTT (agente
reductor), II) La proteína se hirvió previamente con agente reductor. El patrón
electroforético se muestra en la figura.
b) Indique el peso molecular de la proteína nativa. c) Infiera la composición
cuaternaria de la proteína.
II
kDa Prot. testigo I
Por otro lado se dosó la concentración de
72
proteína espectrofotométricamente a 280 nm,
utilizando un testigo de BSA de 0,5 mg / ml, con
60
una alícuota de 1 ml y una cubeta de 0,5 cm de
40
paso óptico. Se obtuvo una Abs. de 0,400 para
el testigo y de 0,295 para la muestra. d)
Teniendo en cuenta que toda la proteína pasó a
la
fase
correspondiente,
determine
la
concentración de la misma en la mezcla original.
16
SDS PAGE
18) Se quiere estudiar la estructura cuaternaria de una proteín-quinasa (PKasa)
dependiente de cAMP, purificada de hepatocito de rata. Una alícuota de PKasa
pura (daba una sola banda proteica en electroforesis en gel de poliacrilamida
en condiciones nativas) se cromatografió en una columna de exclusión
molecular (Superosa 4 B). La columna tenía un volumen de exclusión, medido
con azul de dextrano, de 50 ml y un volumen total de 130 ml. La columna había
sido calibrada con proteínas de peso molecular conocido mostradas en la
siguiente tabla. El volumen de elución para la PKasa purificada usando esta
columna fue de 73 ml.
8
Testigo
Albúmina
Aldolasa
Catalasa
CF1
Ve (ml)
110
85
75
59
PM
65.000
160.000
230.000
440.000
Con otra aIícuota de la PKasa se realizó una electroforesis en gel de
poliacrilamida en presencia de dodecil sulfato de sodio (SDS), observándose
dos bandas proteicas teñidas con igual intensidad que migraron 2,0 cm y 7,7
cm. La tabla muestra la migración electroforética de distintas proteínas de peso
molecular conocido corridas en paralelo con el mismo gel.
Testigo
PEP carboxilasa
Fosforilasa a
Albúmina
Quimotripsina
Migración
(cm)
0,6
1,1
4,2
11,1
PM
110.000
96.000
65.000
25.000
En base a estos datos: a) Calcule el peso molecular de la PKasa y la
composición en subunidades de la estructura cuaternaria de la enzima. b) Si la
actividad específica de la PKasa purificada, determinada en condiciones
óptimas, es de 208 µmol/min/mg de proteína y la enzima tiene un sitio activo
por subunidad pequeña, calcule el índice de recambio.
19) Las enzimas M y X tienen las siguientes propiedades:
M es un heteropentámero (aIfa3- beta2) formado por 3 subunidades aIfa y dos
beta. El peso molecular de alfa y beta es 50.000 y 15.000 respectivamente. El
punto isoeléctrico de M es de 7,8 y tiene un sitio activo por subunidad grande.
X es un homodímero de peso molecular 50.000. Su punto isoeléctrico es 5,2
y tiene un sitio activo por subunidad.
Una mezcla de M (con actividad específica de 90 µmol/min/mg) y X (con
actividad específica de 200 µmol/min/mg) fue resuelta por los diferentes
procedimientos separativos mostrados en las siguientes figuras:
La figura A muestra el perfil proteico de elución al pasar la mezcIa por una
columna de Sephadex G-100 a pH 8,5.
La figura B corresponde al perfil de elución obtenido al cromatografiar la
mezcla en una columna de DEAE-celulosa realizada a pH 7,5.
La figura C muestra los resultados de las bandas proteicas obtenidas al
resolver la muestra por electroforesis en gel de poliacrilamida (PAGE) en
condiciones nativas realizada a pH 8.2.
La figura D corresponde a una PAGE de la mezcla realizada a pH 8,2 y en
presencia de dodecil sulfato de sodio (condiciones desnaturalizantes).
a) Identifique cada pico o banda de las figuras en base a las propiedades y
condiciones antes descriptas. b) Calcule el índice de recambio para M y X.
9
20) A fin de caracterizar una enzima purificada, Ud. somete su preparación a
cromatografía de exclusión molecular en columna de Sephacryl S300 (SS300)
y a electroforesis en gel de poliacrilamida en presencia de SDS (SDS-PAGE).
Los resultados obtenidos son los siguientes:
a) Volumen de elución de la proteína de interés en SS300: 70 ml
b) SDS-PAGE: dos bandas de igual intensidad  y  (ver figura 1)
La columna de SS300 tenía un Vo de 50 ml y un Vt de 130 ml y fue calibrada
con proteínas de PM conocido como muestra la Tabla 1.
La calibración de los geles de SDS-PAGE se muestra en la Figura 1.
Tabla 1
Estándar
Figura 1
Ve (ml)
PM
Ovoalbúmina
108
43.000
Albúmina ser.
100
66.000
Fosforilasa
92
100.000
Aldolasa
82,5
158.000
Catalasa
75
232.000
Apoferritina
66
440.000
Origen






β
116 .0 0 0
9 7 .4 0 0
7 0 .7 0 0
4 8 .5 0 0
2 9 .0 0 0
Frente
10
Calcule el PM y la composición en subunidades de la enzima en estudio.
Cuando Ud. mide la actividad en una cubeta de 1 cm de camino óptico y 1 ml
de capacidad, obtiene un cambio en la concentración de sustrato de 0,2
mM/min cuando usa 10 µg de la proteína purificada. Calcule:
a) La actividad específica de la enzima.
b) El índice de recambio de la enzima. (La enzima posee un mol de Mg2+ por
mol de subunidad grande donde se localiza el sitio activo, participando el catión
en el proceso catalítico).
RESPUESTAS
Prob 1: a) Resina de intercambio catiónico. b) Al pH que se trabaja se podría
suponer que el sitio activo de la enzima tiene carga neta positiva.
Prob 2: La matriz entrecruzada de cada esfera de Sephadex, bajo ciertas
condiciones de fabricación, excluye las proteínas grandes pero admite las
proteínas pequeñas. Por consiguiente, las proteínas mayores pueden pasar
entre las esferas. Las proteínas pequeñas pasarán a través del volumen total
de la columna. Mientras más grande sea la proteína, menor es el tiempo que se
retiene en las esferas y, como consecuencia, se eluye más rápidamente.
En el soporte para la electroforesis en gel de poliacrilamida no hay espacios
inter-esferas y todas las proteínas deben pasar por la matriz entrecruzada.
Mientras más pequeña sea la proteína, más rápidamente migrará a través de la
matriz.
Prob 3: pH= 8,0 , luego pH= 5,0, por último 3,0. C – B – A.
Prob 4: Prot A: PM 100.000; Homodímero; pI= 8,0.
Prot B: PM 75.000; Heterodímero, con una subunidad de PM= 50.000
y otra con PM= 25.000; pI= 5,0.
Prot C: PM 50.000; Monómero; pI= 10,0.
Prob 5:
a) lisozima- citocromo C- mioglobina- ovoalbúmina.
b) pepsina- ureasa- hemoglobina- citocromo C.
Prob 6: a) alfa: pI= 5,2
beta: pI= 6,3
gamma: pI= 7,3.
b) alfa; a pH 6 carga neta (-).
c) beta y gamma; aumentando la fuerza iónica ó gradualmente el pH del buffer
de elución.
d) Porque es la más pequeña de las tres.
Prob 7: a) A: pI= 3,0 MM 21,5 kDa
B: pI= 5,5 MM 15,0 kDa
C: pI= 9,5 MM 11,4 kDa
b) H4 es C.
Orden 1º.
Orden 2º.
Orden 3º.
Prob 9: a) Sugiere la presencia de un catión presente en la estructura de las
proteínas.
11
b) Que A tiene una sola cadena polipeptídica (PM 40.000) y B dos (PM 30.000
y 10.000 unidas por puentes disulfuro).
c) Que A es un monómero y B es un heterodímero.
d) Que A tiene un enlace disulfuro intracadena y B tiene un enlace disulfuro
intercadena.
e) Porque la urea actúa sobre interacciones hidrofóbicas y puentes de H2, no
sobre enlaces covalentes. Porque el betamercaptoetanol no puede ingresar
dentro de las subunidades de esta proteína para cortar el enlace disulfuro.
Prob 10: a) Heterotrímero. Subunidades de 60, 30 y 25 kDa. Las subunidades
de 60 kDa y 30 kDa están unidas por puente disulfuro. La subunidad de 30 kDa
está glicosilada con un hidrato de carbono de 10 kDa.
b) Es incorrecto. En un gel se siembra normalmente de 1 a 2 ug de proteína
supuestamente pura. En el caso de menor cantidad (1 ug) se tendrían 20 % de
impurezas y no serían detectables.
Prob 11) a) Proteína C: heterodímero con 2 subunidades: A, catalítica de 50
kDa de masa molecular y B regulatoria de 30 kDa. El compuesto X separa la
subunidad B de A, de esta forma se observa actividad enzimática.
b) En un gel en condiciones nativas el corrimiento electroforético depende de la
carga neta de la proteína a ese pH y de la masa de la misma. Seguramente
q/m de A fue mayor que B. (Diferenciar que sucedió cuando a las mismas
subunidades se las hizo correr en un gel con SDS)
Prob 12) a) Sin betamercaptoetanol: banda de 920 AA x 110 Da
Con betamercaptoetanol: 2 bandas: 400 y 520 AA x 110 Da
b) Sin betamercaptoetanol: 2 bandas: 400 y 500 AA x 110 Da
Con betamercaptoetanol: igual que el anterior.
c) Sin betamercaptoetanol: 3 bandas: 920, 400 y 500 AA x 110 Da
Con betamercaptoetanol: 3 bandas: 520, 500 y 400 AA x 110 Da
Prob 13: a) Lys por Glu.
b) AAG por GAG.
c) Menor.
d) Aproximadamente el mismo.
e) 198 ml.
Prob 14: PM 34.000.
Prob 15: a) Movilidad : 3,8 cm; 1,8 cm b) Masa aparente: 157.300 Da c) 2.145
(645 + 1500)
Prob 16:
A: PM: 400.000 c/ subunidades de PM= 70.000; 58.000; 36.000;
22.000; 14.000 (dos de cada una).
B: PM: 560.000 c/subunidades de PM= 55.000 y 15.000 (ocho
de cada una).
C: PM 400.000 c/4 subunidades de PM= 100.000.
Prob 17: a) Fase acuosa: proteína; Fase bencénica: triacilglicéridos.
b) PM 100.000.
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c) Heterotrímero; 2 subunidades de PM= 30.000 y una subunidad de
PM= 40.000 (las subunidades de 30.000 están unidas entre sí por puentes
disulfuro).
d) 7,5 mg/ml.
Prob 18:
a) PM= 250.000 Heterotetrámero con 2 subunidades
85.000 y 2 subunidades de PM= 40.000.
b) Índice de recambio: 26.000/min.
de PM=
Prob 19: a) FIG A: 1º pico: M; 2º pico: X.
FIG B: 1º pico: M; 2º pico: X.
FIG C: 1º banda: PM= 180.000 (Prot M); 2º banda: PM= 50.000
(Prot X).
FIG D: 1º banda: PM= 50.000; 2º banda: PM= 25.000; 3º banda:
PM=15.000.
b) Índice de recambio de M= 5.400/min.
Índice de recambio de X= 5.000/min.
Prob 20: PM= 314.000. Heterotetrámero 22 c/ subunidades de PM 89.000
() y 68.000 ().
a) Actividad específica: 20 U/mg.
b) Índice de recambio: 3.140/min.
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