arginina 1 2 3 Fig. 9.a Fig. 9.b - Universidad Pablo de Olavide, de

Fisicoquímica de Biomoléculas 2006/2007. Hoja 2
Área de Química-Física. Universidad Pablo de Olavide
7.- ¿Qué diferencia hay entre una saponificación y una esterificación en los reactivos y en las condiciones
de reacción?
R: La saponificación parte de un poliéster para formar el polialcohol (ej. glicerol) y carboxilato. La
esterificación es la reacción en el sentido contrario, alcohol y ácido forman éster. La reacción de
saponificación es favorecida en medio básico mientras que la esterificación se lleva a cabo en medio ácido.
8.- Representar la D-(-)-arginina en la proyección de Fisher. ¿Se trata del estereoisómero R o S? ¿Se puede
generalizar este resultado obtenido a cualquier aminoácido?
NH2
H
N
H2N
OH
O
NH
R:
arginina
O
C
H
C
O
OH
C
NH2
H
OH
C
NH2
CH2
CH2
CH2
CH2
CH2
CH2
NH
NH
C
NH
COOH
C∗
C
NH2
2
1 H2N
NH
(CH2)3NHC(NH)NH2
3
NH2
El confórmero es R (gira en el sentido de las agujas de un reloj). Para otros aminoácidos, siempre que la
cadena lateral tenga menor prioridad que COOH, el D-aminoácido tendrá la conformación R y el Laminoácido por consiguiente la conformación S. Esto ocurre para 19 de los 20 aminoácidos más comunes,
con la excepción de la cisteína (cadena lateral CH2-SH). En las proteinas, siempre ocurren las formas L de
los aminoácidos (también en la cisteína).
9.- ¿Qué derivado de la D-(+)-glucosa esta representado en la Figura (9.a) a continuación? Completar la
proyección de Haworth de esta molécula en la Fig. (9.b).
CH2OH
H OH
H
O
OH
HO
H
H
H
H
HO
Fig. 9.a
O
H
H
OH
OH
R: Es la -D-glucopiranosa ( -D-Glc p)
H
OH
OH
Fig. 9.b
H
10.- Indicar los carbonos asimétricos de la vitamina C (ácido L-ascórbico):
OH
Fisicoquímica de Biomoléculas 2006/2007. Hoja 2
Área de Química-Física. Universidad Pablo de Olavide
OH
HO
HO
∗
∗
O
O
R:
OH
ácido L-ascorbico
11.- Se han encontrado en pescado seco tratado con sal y nitratos el mutágeno ácido 2-cloro-4metiltiobutanoico (CMBA). ¿De qué aminoácido se deriva?
Cl
H3C
S
H2
C
H2
C
CH
C
CMBA
O
OH
R: metionina
12.- La quiralidad tiene un papel muy importante en el desarrollo de nuevos fármacos. Las personas con la
enfermedad de Parkinson tienen niveles reducidos de dopamina en el cerebro. Para aumentar los niveles de
dopamina de los pacientes, se les administra el fármaco L-dopa que se convierte a dopamina en el cerebro.
L-dopa se comercializa en una forma enantioméricamente pura. (a) Indica la designación RS de la L-dopa
(b) ¿de qué aminoácido estan derivados L-dopa y dopamina?
O
HO
HO
O
H++
H
+CO2
NH3
H3N
HO
HO
L-dopa
R: (a) L-dopa es S (b) Deriva del aminoácido tirosina (pintado abajo):
O
H2N
CH
CH2
OH
C
OH
dopamina
13.-
Fisicoquímica de Biomoléculas 2006/2007. Hoja 2
Área de Química-Física. Universidad Pablo de Olavide
9
7
8
6
5
3
1
4
2
Se han omitido los hidrógenos de los átomos de nitrógeno de la figura. Los ángulos diédros de la figura son
los siguientes: (1235)=-47º; (3567)=-57º;(5679)=-48º
Decir si el enlace peptídico es cis o trans. Dar los ángulos y definidos en la figura. Para que la glicina
adoptara una estructura de plegamiento en el residuo 6, en cuál de los oxígenos 8 ó 9 se tendría que
formar un nuevo enlace peptídico?
R: El enlace peptídico esta sustituido en trans. (glicina del C2)=-47º; (glicina del C6)=-57º;
(5679)=-48º esta en la región de la -hélice (ver el plot de ramachandran). Dado que C COO son
coplanares, el ángulo (5678)=180+(-48)=132º. Esto corresponde al plegamiento .
14.- Explicar por qué los residuos de (1) glicina y (2) prolina no se encuentran comúnmente en -hélices.
R: La presencia de glicina en una -hélice desestabiliza la hélice debido a la gran libertad de movimiento
permitida por la pequeña cadena lateral. Por este motivo, muchas -hélices empiezan o acaban con una
glicina.
La prolina desfavorece a las -hélices por motivos estéricos. Porque la cadena lateral con el anillo es muy
grande y rígida, ocupa un espacio que debería estar ocupado por un residuo vecino en la hélice. Nota:
tampoco se encuentra la prolina mucho en plegamientos .