Desarrollo de un biobanco de microbiota intestinal para estudiar disbiosis

Desarrollo de un biobanco de microbiota intestinal para estudiar disbiosis
microbianas asociadas a cáncer colorrectal
Delgado-Palacio S.1, Isidro-Marrón P.2, Azcarate-Peril MA.3, Ronderos-López L. 2, VallinaÁlvarez A. 2, Iglesias-Besteiro N. 2, Astudillo-González A. 2
1Instituto
de Productos Lácteos de Asturias (IPLA-CSIC), Villaviciosa
2Biobanco
del Principado de Asturias (BPA), Oviedo
3 University
of North Carolina Microbiome Core Facility (UNC-MCF), Chapel Hill
INTRODUCCIÓN
El microbioma intestinal humano (microbiota endógena y sus genes) es
considerado un órgano más del cuerpo y su estudio es un campo de enorme
interés científico en la actualidad. Las heces constituyen el material biológico
de más fácil disponibilidad y más usado para su análisis.
Recientemente, se ha observado una importante relación entre determinadas
alteraciones del microbioma intestinal (disbiosis) y diversas enfermedades,
como el cáncer colorrectal (CRC), aunque es difícil determinar si las
modificaciones de la microbiota son la causa o la consecuencia. Es necesario
detectar y conocer qué microorganismos pueden ser indicadores del desarrollo
de CRC.
Para ello, el BPA y el IPLA-CSIC han desarrollado un biobanco de microbiota
intestinal que permita el estudio y seguimiento de los microorganismos
intestinales presentes tanto en heces como asociados a la mucosa colónica en
pacientes con CRC, así como en voluntarios de programas de cribado de CRC.
Se busca obtener un repositorio de la microbiota intestinal que permita estudios
prospectivos, de seguimiento, así como el posible descubrimiento de
biomarcadores microbianos de CRC en población de riesgo.
OBJETIVOS
1-Elaborar un procedimiento para optimizar las condiciones de recogida y
conservación de las muestras de heces y mucosa.
2- Extraer DNA microbiano total y amplificar con cebadores del ADNr 16S
bacteriano para llevar a cabo la pirosecuenciación de los amplicones derivados.
3- Una vez obtenido, purificado y analizado el componente microbiano, diseñar
un procedimiento de almacenamiento que preserve la mayor viabilidad celular
posible.
RESULTADOS
1-Se ha elaborado un protocolo de recogida-conservación realizado con 60
muestras.
2- En colaboración con el UNC-MCF, se analizó la microbiota asociada a tejido
dañado y sano de 20 pacientes con CRC, comparando los resultados obtenidos
con una población similar de EEUU.
3- Se ha establecido, parcialmente, un protocolo de almacenamiento basado en
la experiencia adquirida y en la literatura.