5.desequilibrio de ligamiento

Recombinación homóloga
Loci múltiples y equilibrio de ligamiento
•Cada gen está ligado a otros mediante asociaciones
físicas.
•Cuando dos genes se encuentran muy juntos en el
mismo cromosoma se dice que son ligados.
•Las frecuencias de los diferentes tipos de gametos
depende de la distancia entre los genes.
•Los alelos de los genes ligados se encuentran en
asociación no-aleatoria en los gametos.
La asociación no al azar de los alelos se llama
Desequilibrio de ligamiento (DL).
Biológicamente DL significa que la frecuencia del
genotipo A1B1 / A2B2 no es igual a la frecuencia del
genotipo A1B2 / A2B1.
A1
B1
A1
B2
A2
B2
A2
B1
no recombinante
recombinante
•frecuencia de A1B1 = P11
•frecuencia de A2B2 = P22
•frecuencia de A1B2 = P12
•frecuencia de A2B1 = P21
DL = P11 P22 - P12 P21
Si DL = 0
⇒ los alelos se distribuyen de manera independiente en
los gametos
⇒ Equilibrio de ligamiento (EL)
Equilibrio de ligamiento (EL)
Si DL = 0
cada locus se encuentra en equilibrio de HardyWeinberg (EHW).
El EHW se alcanza en una o pocas generaciones
mientras que el EL se alcanza gradualmente.
La frecuencia de recombinación, r, es la proporción de
gametos que llevan una combinación de alelos no presentes
en los cromosomas parentales.
0 <= r <= 0,5
r = 0 cuando los genes están completamente ligados.
r = 0,5 cuando los genes están muy lejos uno del otro en
el mismo cromosoma o están en cromosomas diferentes.
Ejemplo
•genes de los grupos sanguíneos humanos MN y Ss
(determinados
por
genes
muy
ligados
en
el
cromosoma 4).
•muestra de 1000 británicos
•Número de personas por tipo cromosomal:
MS: 474, Ms: 611, NS: 142, Ns: 773
DL = (474 x 773 - 611 x 142) / (2000)2 =
0,0699
¿Es DL = 0,0699 diferente de 0?
ρ = DL / √p1p2q1q2
X2 = ρ 2 * n
Frecuencias alélicas
M = 474 + 611 / 2000 = p1 = 0,543
N = 142 + 773 / 2000 = p2 = 0,458
S = 474 + 142 / 2000 = q1 = 0,308
s = 611 + 773 / 2000 = q2 = 0,692
ρ = DL / √p1p2q1q2
ρ = 0,0699 / √0,543 * 0,458 * 0,308 * 0,692
= 0,304
X2 = ρ2 * n = (0,304)2 * 2000 = 184,83
X2 = 184,83 con 1 g.l. = p < 0,0001
Respuesta
D = 0,0699
es estadísticamente diferente de 0, lo cual
significa que los genes para los grupos sanguíneos
MN y Ss están ligados.
DL es frecuentemente 0 o muy cercano a 0, a menos que
los genes estén separados por distancias menores a 100
kb.
DL es frecuentemente 0 o muy cercano a 0, a menos que
los genes estén separados por distancias menores a 100
kb.
Otras causas de DL
•genes que están presentes en dentro o muy cerca de
inversiones cromosomales,
•plantas que sufren regularmente auto-fertilización (la
endogamia
severa
recombinación),
reduce
las
oportunidades
de
Otras causas de DL
•poblaciones recién fundadas con muy pocos individuos,
•mezclas de dos poblaciones las cuales individualmente
están
en
EHW
pero
tienen
diferentes
frecuencias
alélicas,
•especies
(principalmente
microorganismos)
con
reproducción asexual (clonal),
•poblaciones en las cuales la selección natural favorece
ciertos genotipos en detrimento de otros.