SINTESIS PROTEICA código genético y traducción SINTESIS DE

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SINTESIS PROTEICA
código genético y traducción
Î
Código Genético
Î
Características del Código
Genético
Î
Síntesis proteica
Î
El mecanismo de la
traducción
Î
SINTESIS DE PROTEINAS
Î
La síntesis proteica ocurre de modo semejante
en todas las células
Î
Tres tipos de RNA desempeñan un papel
cooperativo
ÎmRNA transportador de la información
Î rRNA asociado a proteínas forma el
ribosoma
ÎtRNA portadores de aminoácidos, lectores
del mensaje
Î
El orden de los aminoácidos en la cadena
proteica (secuencia) está determinado por la
secuencia (orden) de nucleótidos
Î
El orden de los aminoácidos en la cadena
proteica (secuencia) determina la función de la
nueva proteína
Î
Es necesario un código bilingüe para pasar la
información de la secuencia de bases a
aminoácidos (código genético)
Antibióticos y traducción
1
2
Reglas de síntesis de moléculas informativas
El problema de la información
Elementos fundamentales a resolver en la síntesis proteica
Acidos nucleicos y proteínas
1. Pasaje de la información
2. El mecanismo enzimático
Formados por un número
limitado de subunidades
Las unidades son agregadas
secuencialmente formando
cadenas lineales
Información
(ADN)
Cada cadena tiene un punto de
inicio, avanza en una única
dirección y tiene un punto de
finalización
Los productos de la síntesis
primaria son modificados
previamente a cumplir su
función
4 bases
Intermediario
(ARN)
4 bases
Efector
(proteína)
20 Aminoácidos
Grupos de bases pueden simbolizar cada aminoácido
3
4
El problema del pasaje de información
El código genético
Hay 4 bases en el ARN (U, C, A, G) y deben especificar 20 aminoácidos.
Cuantas
bases = 1
Aa?
G G
ACGC UGA U AACCCG U C AG U U CC AACA U CG G U AA UCCGC C C AG AGC U
3 Bases?
2 Bases?
1 Base?
Un código en dobletes
especifica 4X4 =16 Aas.
U
1
C
2
A
3
G
4
4 < 20: No alcanza
Un código simple
implica sólo 4
Aas.
UC
UA
U G
U U
2
3
4
1
C U
CC C A
CG
6
5
7
8
AA
AU
AC
AG
9
11
12
10
GG
GC GA
GU
14
13
15
16
16 < 20: No alcanza
1968
19601960-1964
mRNA
Francis Crick
Robert Holley
H. G. Khorana,
Khorana,
Marshal Nirenberg.
Nirenberg.
4 Bases?...
Un código en tripletes especifica
4 x 4 x 4 = 64 Aas.
CODIGO GENETICO
UNIVERSAL
EN TRIPLETES
NO SOLAPADO
REDUNDANTE
NO AMBIGUO
DEGENERADO
U UG
U U U
U UC
U U A
2
1
3
4
CC U
CCC
C CA
CCG
6
5
7
8
AAU
AAC
AAA
AAG
9
10
11
12
G GA
GG U
GGC
etc...
14
15
13
64 > 20: Más que suficiente
5
6
Marcos de lectura
Código Genético
El código genético no es solapado pero puede leerse
en tres marcos diferentes de lectura
Sólo uno de estos marcos es el correcto para dar lugar
a una proteína dada
• En tripletes (codones)
• No solapado
• Sin puntuación
7
8
Ambigüedad y redundancia
Universalidad y excepciones
• No ambiguo (cada codón especifica
sólo un aminoácido)
• Redundante (distintos codones para
un aminoácido)
existen codones sinónimos
familias de codones:
XYPur
XYPyr
tRNA como adapatador
reconocimiento codón-anticodón
hipótesis del balanceo
Degenerado (codones sinónimos
pueden ser leídos por un mismo
anticodón)
9
10
Reconocimiento codóncodón-anticodón
El balanceo
tRNA como adapatador
Apareamientos de base
no standard ocurren entre
la tercera posición del
codón y la primera del
anticodón
reconocimiento codónanticodón
hipótesis del balanceo
codones sinónimos pueden ser
leídos por un mismo anticodón
11
12
Cambios en una secuencia de ADN
que codifica para una proteína...
Tienen diferentes efectos:
1. mutación silenciosa
...CCGCGTCAGACCGAAATTAACGCG...
...CCGCGTCAGACCGAGATTAACGCG...
CCGCGUCAGACCGAAAUUAACGCG
CCGCGUCAGACCGAGAUUAACGCG
P
R
Q
T
E
I
N
A
13
P
R
T
E
I
N
A
14
Tienen diferentes efectos:
2. cambio de sentido
Tienen diferentes efectos:
3. sin sentido
...CCGCGTCAGACCGCAATTAACGCG...
...CCGCGTCAGACCTAAATTAACGCG...
CCGCGUCAGACCGCAAUUAACGCG
CCGCGUCAGACCUAAAUUAACGCG
P
15
Q
R
Q
T
A
I
N
A
P
16
R
Q
T
*
Tienen diferentes efectos:
4. Inserción y corrimiento del marco de lectura
Tienen diferentes efectos:
5. Delección y corrimiento del marco de lectura
A
...CCGCGTCAGACCGAAATTAAACGCG...
...CCGCGTCAGACCGAAATTACGCG...
CCGCGUCAGACCGAAAUUAAACGCG
CCGCGUCAGACCGAAAUUACGCG
P
R
Q
T
E
I
17
La traducción es un proceso de decodificación
en dos pasos:
1 Cargado de los ARNt
19
K
R
P
R
Q
T
E
I
18
La traducción es un proceso de decodificación
en dos pasos:
2 Reconocimiento codóncodón-anticodón
20
T
R
Cargado de los ARNt
El adaptador molecular :
el ARNt
•
Cada ARNt es reconocido por
una AMINOACIL-tRNA-SINTETASA
específica
•
Estas enzimas reconocen el Aa
correcto y el ARNt correcto
brazo aceptor
Requerimientos
Requerimientos
20
20 aminoácidos
aminoácidos
aminoacyl-tRNA
aminoacyl-tRNA synthetases
synthetases
tRNAs
tRNAs
ATP,
ATP, Mg
Mg 2+
2+
GLn-tRNA
Aminoacil-tRNA-sintetasa
(tipo I)
anticodón
21
22
Síntesis de proteínas
Cargado de los ARNt
Requerimientos: mRNA
Aa-tRNA
ribosomas
Reacción en dos pasos:
1. La enzima une al Aa
consumiendo 1 ATP
2. La enzima une al ARNt y le
transfiere el Aa
Actividad
peptidiltransferasa
Ribosomas
Plataforma donde se realiza la síntesis
proteica
Requerimientos
Requerimientos
20
20aminoácidos
aminoácidos
aminoacyl-tRNA
aminoacyl-tRNAsyntetasas
syntetasas
tRNAs
tRNAs
ATP,
ATP,Mg
Mg2+
2+
23
Subunidad mayor: 3 ARNr y 49 proteínas
Subunidad menor: 1 ARNr y 33 proteínas
24
Salida del péptido recién
sintetizado
Estructura del ribosoma bacteriano
Composición del ribosoma
Ribosoma de T.termophilus
25
26
Iniciación traduccional
procariotas
El primer aminoácido
Reunir los elementos necesarios
Reconocer el sitio de inicio (AUG)
Proveer sitios para que se inicie la elongación
27
28
Iniciación traduccional
procariotas
Iniciación traduccional
eucariota
•Requerimientos
•Requerimientos
mRNA
mRNA
tRNA
tRNAmet
met
codón
codónde
deiniciación
iniciación
22subunidades
subunidadesribosomales
ribosomales
Factores
Factoresde
deiniciación
iniciación(IF-1,
(IF-1,IF-2,
IF-2,IF-3)
IF-3)
GTP,
GTP,Mg
Mg2+
2+
29
30
Requerimientos
Requerimientos
Elongación
•Agregado secuencial de Aa por una
actividad peptidil transferasa
•Traslocación
La elongación eucariota es similar
a la bacteriana
Ribosoma
Ribosomacompleto
completo(complejo
(complejode
deiniciacion)
iniciacion)
Aa-tRNAs
Aa-tRNAsespecificados
especificadospor
porcada
cadacodon
codon
Factores
de
elongacion
(EF-Tu,
EF-Ts,
Factores de elongacion (EF-Tu, EF-Ts,EF-G)
EF-G)
Actividad
peptidil-transferasa
(23s)
Actividad peptidil-transferasa (23s)
GTP,
Mg
2+
GTP, Mg 2+
Durante la elongación cada Aa-tRNA pasa por tres sitios en enl ribosoma
31
32
Terminación
Enlace peptídico
codón
codónde
determinación
terminación
factores
factoresde
deliberación
liberación
(RF
(RF11, ,RF
RF22, ,RF
RF33))
ATP
ATP
• Reacción central de la síntesis proteica
• La actividad peptidil-transferasa está en
el rRNA 23S
• El centro catalítico es altamente
conservado
• La traslocación ocurre luego de la
formación del enlace peptídico
33
• Proceso similar en
procariotas y
eucariotas
• Depende de
factores que
reconocen codón
stop y de hidrólisis de
peptidil-tRNA
34
Acoplamiento TranscripciónTranscripción-traducción en procariotas
Poliribosomas
La traducción simultánea por
múltiples ribosomas y su rápido
reciclado incrementa la eficiencia
de la síntesis proteica.
La traducción en bacterias se inicia
sobre transcriptos que aun no
terminaron su síntesis. Esta
coordinación entre ambos procesos
permite una regulación más precisa
de la síntesis proteica bacteriana
35
Requerimientos
Requerimientos
36
Destino celular de las proteínas
Antibióticos y síntesis proteica
• Mayoría son bacteriostáticos
• Selectividad debida a diferencias
entre ribosomas procariotas y
eucariotas
• Actúan a diferente nivel en la
síntesis proteica
Inhibidores de la iniciación
Aminoglicósidos:
estreptomicina, kanamicina,
gentamicina, neomicina
Unión irreversible a rRNA16S,
bloqueo en complejo 30SmRNA-tRNA
37
38
Inhibidores de la Elongación
El Papel de la hidrólisis de GTP
Tetraciclinas:
tetraciclina, minociclina
Unión reversible a la
subunidad 30S, inhibe la
unión del Aa-tRNA
•
se hidrolizan 2GTPs por cada aminoácido incorporado
•
La hidrólisis promueve cambios conformacionales esenciales
•
Se gastan 4 enlaces fosfato de alta energía por aminoácido
incorporado:
Acido
Fusídico
Unión a EF-G,
inhibe la
disociación
EF-G/GDP
CARGADO del ARNt-Aa con su aminoácido
1ATP (2 enlaces) / Aa
TRADUCCION
a. Iniciación
1GTP
b. Elongación
2 GTP / Aa
c. Terminación
1 GTP
Cloramfenicol:
Unión a subunidad 50s,
inhibe la actividad peptidi
transferasa.
Gasto Total:
Macrolidas: eritromicina, claritromicina
Inhibe la translocación.
40
2N
1
2(N-1)
1
____
4N*
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