María Caridad Cepero de García BIOLOGÍA DE HONGOS Silvia Restrepo Restrepo Ana Esperanza Franco-Molano Martha Cárdenas Toquica Natalia Vargas Estupiñán BIOLOGÍA DE HONGOS MARÍA CARIDAD CEPERO DE GARCÍA SILVIA RESTREPO RESTREPO ANA ESPERANZA FRANCO-MOLANO MARTHA CÁRDENAS TOQUICA NATALIA VARGAS ESTUPIÑÁN Biología de hongos / María Caridad Cepero de García… [et ál.]. -- Bogotá: Universidad de los Andes, Facultad de Ciencias, Departamento de Ciencias Biológicas; Ediciones Uniandes, 2012. 520 pp.; 21,5 x 28 cm Otros autores: Silvia Restrepo Restrepo, Ana Esperanza Franco-Molano, Martha Cárdenas Toquica, Natalia Vargas Estupiñán. 1. Micología 2. Hongos I. Cepero de García, María Caridad II. Restrepo Restrepo, Silvia III. Franco-Molano, Ana Esperanza IV. Cárdenas Toquica, Martha Emiliana V. Vargas Estupiñán, Natalia VI. Universidad de los Andes (Colombia). Facultad de Ciencias, Departamento de Ciencias Biológicas. CDD 589.25 SBUA BIOLOGÍA DE HONGOS Primera edición: junio del 2012 © María Caridad Cepero, Silvia Restrepo, Ana Esperanza Franco, Martha Emiliana Cárdenas, Natalia Vargas © Universidad de los Andes, Facultad de Ciencias, Departamento de Ciencias Biológicas Ediciones Uniandes Carrera 1ª núm. 19-27, edificio Aulas 6, piso 2 Bogotá, D. C., Colombia Teléfono: 339 4949, ext. 2133 http://ediciones.uniandes.edu.co/ [email protected] ISBN eBook: 978-958-695-794-6 Corrección de estilo: María Fonseca Diseño de cubierta y diagramación: Angélica Ramos Imágenes de cubierta: María Caridad Cepero, Natalia Vargas, TEHO, LAMFU Imágenes de portadillas: Édgar Medina, Jhon Jairo Colorado, Marleny Vargas, Natalia Vargas Impresión: Panamericana Formas e Impresos S. A. Teléfono: 430 21 10 Calle 65 núm. 95-28, Bogotá, D. C., Colombia Todos los derechos reservados. Esta publicación no puede ser reproducida ni en su todo ni en sus partes, ni registrada en o trasmitida por un sistema de recuperación de información, en ninguna forma ni por ningún medio sea mecánico, fotoquímico, electrónico, magnético, electro-óptico, por fotocopia o cualquier otro, sin el permiso previo por escrito de la editorial. CONTENIDO AGRADECIMIENTOS XVII INTRODUCCIÓN XVIII Microtúbulos Microfilamentos Microcuerpos Estructuras de reproducción BIBLIOGRAFÍA 1. GENERALIDADES 1 3. ECOLOGÍA 19 ORGANISMOS QUE ESTUDIAREMOS CARACTERÍSTICAS GENERALES BIBLIOGRAFÍA 2 3 4 2. ESTRUCTURAS FÚNGICAS 5 ESTRUCTURAS MACROSCÓPICAS Estructuras somáticas Estructuras de reproducción ESTRUCTURAS MICROSCÓPICAS Estructuras somáticas Hifa-micelio-modificaciones Septos Pared Membrana plasmática Organelos Núcleo Mitocondrias Hidrogenosomas Vesículas Vacuolas Ribosomas Aparato de Golgi o dictiosoma Retículo endoplasmático 6 6 7 8 8 8 9 10 13 13 13 14 14 14 15 15 15 15 ESTRATEGIAS O HISTORIA DE VIDA DE LOS HONGOS Modelo R-C-S PAPEL DE LOS HONGOS EN LOS ECOSISTEMAS HÁBITATS QUE LOS HONGOS PUEDEN OCUPAR Hábitats terrestres Acuáticos Hongos en ambientes extremos BIBLIOGRAFÍA 20 21 22 30 30 32 34 35 4. FISIOLOGÍA 39 CRECIMIENTO Crecimiento en hongos miceliales Zona de crecimiento apical Zona de absorción Zona de almacenamiento Zona de senescencia Crecimiento en hongos levaduriformes NUTRICIÓN Oxígeno e hidrógeno Carbono Nitrógeno Azufre Fósforo 40 40 41 43 43 43 44 45 45 45 46 47 47 ABREVIATURAS XV 15 16 16 16 16 VI BIOLOGÍA DE HONGOS Hierro Factores de crecimiento: vitaminas REQUERIMIENTOS FÍSICOS PARA EL CRECIMIENTO Temperatura Humedad Concentración de iones de hidrógeno Luz Aereación Digestión Celulosa Lignina Quitina Otras enzimas TRANSPORTE Traslocación de nutrientes METABOLISMO Metabolismo primario Producción de energía Glucólisis Respiración aeróbica Fermentación Respiración anaeróbica Gluconeogénesis: ruta anabólica Síntesis de lisina Metabolismo del nitrógeno Metabolismo secundario Poliquétidos Péptidos no ribosomales Terpenos Alcaloides DORMANCIA DE PROPÁGULOS GERMINACIÓN DE PROPÁGULOS DISPERSIÓN DIMORFISMO FOTOTROPISMO Efecto de la luz en el esporangióforo de Phycomyces blakesleeanus FISIOLOGÍA Y GENÓMICA BIBLIOGRAFÍA 47 48 48 48 49 49 49 50 50 51 51 51 51 52 52 53 54 54 54 55 55 55 55 56 56 56 56 56 57 57 58 59 60 60 62 5. REPRODUCCIÓN 67 REPRODUCCIÓN EN LOS HONGOS REPRODUCCIÓN SEXUAL Tipos de esporas de reproducción sexual Ascos y ascosporas Basidios y basidiosporas Cigospora Oospora BIBLIOGRAFÍA 68 69 69 69 74 77 78 81 62 62 63 6. REPRODUCCIÓN ASEXUAL 83 FISIÓN GEMACIÓN FORMACIÓN DE ESPORAS ASEXUALES FORMACIÓN DE CONIDIOS Origen del conidio Origen de la pared del conidio Orden de producción y arreglo de los conidios Proceso de proliferación de la célula conidiógena Características adicionales de las células conidiógenas y de los conidios PARASEXUALIDAD BIBLIOGRAFÍA 84 84 85 86 89 89 90 90 93 94 95 7. GENÉTICA DE HONGOS 97 INTRODUCCIÓN GENÓMICA ESTRUCTURAL GENÉTICA DE HONGOS INTERACCIONES GENÓMICAS Fusiones de hifas Tipos de apareamiento (mating types): el caso de Saccharomyces cerevisiae Meyen Mecanismos y análisis de recombinación durante la meiosis Segregación de genes durante el ciclo de división mitótico INTRODUCCIÓN A LA BIOTECNOLOGÍA DE HONGOS Métodos celulares y moleculares para la manipulación de hongos Aplicaciones biotecnológicas BIBLIOGRAFÍA 98 98 99 99 99 100 101 103 103 103 104 104 8. CLASIFICACIÓN Y TAXONOMÍA 105 CLASIFICACIÓN BIOLÓGICA Filogenia. Sistemática filogenética Conceptos importantes Sistemática filogenética (cladística) Cladograma Criterios de optimización Tipos de grupos TAXONOMÍA Y NOMENCLATURA Concepto de especie Concepto morfológico de la especie Concepto biológico de especie Concepto filogenético de especie INTRODUCCIÓN A LA SISTEMÁTICA DE LOS HONGOS (REINOS HONGOS, STRAMINIPILA O CHROMISTA Y PROTOZOA) Reino Hongos 106 106 107 107 108 110 110 110 111 111 111 112 112 112 CONTENIDO Reino Straminipila o Chromista Reino Protozoa EL PROYECTO ÁRBOL DE LA VIDA: CASO ESPECÍFICO DE LOS HONGOS CÓDIGO INTERNACIONAL DE NOMENCLATURA Y TIPIFICACIÓN BIBLIOGRAFÍA 9. HONGOS ANAMÓRFICOS, CONIDIALES, MITOSPÓRICOS O “DEUTEROMYCETES” INTRODUCCIÓN HISTORIA DE LA CLASIFICACIÓN DE LOS HONGOS ANAMÓRFICOS GRUPOS DE HONGOS ANAMÓRFICOS TRATADOS EN ESTE TEXTO HIFOMYCETES Géneros “moniliaceos” Género Acremonium Link ex Fr. Género Beauveria Vuill. Género Chrysosporium Corda Género Cylindrocarpon Wollenw Géneros Clonostachys Corda y Gliocladium Corda Género Clonostachys Género Gliocladium Corda Género Chrysonilia Arx Género Fusarium Link ex Fr. Género Lecanicillium W. Gams & Zare y Verticillium Nees Género Malbranchea Sacc. Género Metarhizium Sorokin Géneros Paecilomyces Bainier e Isaria Pers. Género Scepedonium Link Género Scopulariopsis Bainer Género Trichoderma Pers. Géneros “dematiáceos” Género Alternaria Nees Von Esenb. Ex Fries Género Aureobasidium Viala & G. Voyer Géneros Bipolaris Shoemaker, Drechslera S. Ito y Exserohilum K. J. Leonard & Suggs Género Botrytis P. Micheli ex Pers. Género Cladosporium Link Género Curvularia Boedijn Género Epicoccum Link Género Exophiala Carmichael Género Fonsecaea Negroni. Género Gilmaniella G. L. Barron Género Helminthosporium Link.ex Fries. Género Humicola Traaen Género Neoscytalidium (Penz.) Crous & Slippers Género Nigrospora Zimm. 115 116 116 116 117 119 120 121 123 123 123 123 124 124 124 125 125 126 127 127 129 129 130 131 132 132 132 133 133 135 135 136 137 137 138 138 138 138 139 139 140 140 Género Phialophora Medlar Género Pithomyces Berk & Broome Género Rhinocladiella Nannfeldt Género Scedosporium Sacc. ex Castell. Género Sporothrix Hektoen & C. F. Perkins Género Stachybotrys Corda Género Stemphylium Wallr. Género Thielaviopsis Went Género Ulocladium Preus Género Wallemia Johan-Ols Ecología de Hifomycetes MICELIO ESTÉRIL (MYCELIA STERILIA O AGONOMICETALES) Género Rhizoctonia D.C. Género Sclerotium Tode Género Sclerotinia Fuckel “COELOMYCETES” Género Cercospora Fresen. Género Colletotrichum Corda Género Pestalotia De Not. Pestalotiopsis Stey. y Truncatela. Stey. Género Pestalotiopsis Género Truncatella Género Phoma Saccardo Ecología de Coelomycetes LEVADURAS ANAMÓRFICAS Ecología de levaduras anamórficas Género Candida Berkhout Género Cryptococcus Vuill. Género Geotrichum Link Género Rhodotorula F. C. Harrison. Género Sporobolomyces Kluyver & C.B Niel. Género Trichosporon Behrend. USO DE CLAVES TAXONÓMICAS BIBLIOGRAFÍA 10. FILO ASCOMYCOTA FILO ASCOMYCOTA GENERALIDADES ESTRUCTURAS VEGETATIVAS REPRODUCCIÓN SEXUAl Desarrollo del asco y las ascosporas REPRODUCCIÓN ASEXUAL CLASIFICACIÓN TAXONÓMICA DE ASCOMYCOTA SUBFILO TAPHRINOMYCOTINA SYN.: ARCHIASCOMYCOTINA Clase Pneumocystidomycetes Orden Pneumocystidales Familia Pneumocystidaceae Clase Schizosaccharomycetes VII 140 141 142 142 143 143 144 145 145 145 146 146 147 147 148 148 148 149 149 151 151 152 152 153 153 153 155 155 156 156 156 157 158 163 164 164 166 166 167 168 168 170 170 170 170 171 VIII BIOLOGÍA DE HONGOS Orden Schizosaccharomycetales Familia Schizosaccharomycetaceae Clase Taphrinomycetes Orden Taphrinales Familia Taphrinaceae Género Taphrina SUBFILO SACCHAROMYCOTINA Clase Saccharomycetes Orden Saccharomycetales Familia Saccharomycetaceae Género Saccharomyces Meyen ex Reess. Género Kluyveromyces Van der Walt emend. Van der Walt. Familia Pichiaceae Género Pichia E.C. Hansen emend. Kurzman. Familia Saccharomycodaceae SUBFILO PEZIZOMYCOTINA Clase Dothideomycetes Subclase Dothideomycetidae Orden Capnodiales Familia Capnodiaceae Familia Mycosphaerellaceae Familia Piedraiaceae Orden Dothideales Familia Dothioraceae Orden Myriangiales Familia Elsinoaceae Género Elsinoë Racib. Subclase Pleosporomycetidae Orden Pleosporales Familia Phaeosphaeriaceae Familia Pleosporaceae Género Cochliobolus Drechsler. Género Lewia M.E. Barr & E.G. Simmons. Género Pleospora Rabenh. ex Ces. & De Not. Género Pyrenophora Fr. Género Leptosphaerulina McAlpine de ubicación incierta en la clase Dothidiomycetes Familia Venturiaceae Clase Eurotiomycetes Subclase Eurotiomycetidae Orden Coryneliales Familia Eremascaceae Orden Eurotiales Familia Trichocomaceae Género Aspergillus Micheli. Género Penicillium Link. Orden Onygenales Familia Ajellomycetaceae Familia Arthrodermataceae Género Arthroderma Currey. 171 171 171 172 172 172 173 173 173 174 174 175 175 175 175 176 176 177 177 177 177 177 178 178 179 179 179 179 180 180 180 180 180 181 181 181 181 182 182 182 182 183 183 184 184 186 186 188 188 Género Epidermophyton Sabouraud. Género Microsporum Gruby. Género Trichophyton Malmsten. Familia Ascosphaeraceae Familia Onygenaceae Clase Laboulbeniomycetes Orden Laboulbeniales Familia Ceratomycetaceae Género Ceratomyces Thaxter Familia Laboulbeniaceae Género Laboulbenia Mont. & C.P. Robin Familia Herpomycetacea Orden Pyxidiophorales Familia Pyxidiophoraceae Género Pyxidiophora Bref. & Tavel Clase Leotiomycetes Orden Erysiphales Orden Helotiales Familia Dermateaceae Familia Sclerotiniaceae Género Botryotinia Whetzel Género Monilinia Honey Género Sclerotinia Fuckel Familia Helotiaceae Género Chlorociboria Server: Ramamurthi, Korf & Batra. Clase Pezizomycetes Orden Pezizales Familia Ascobolaceae Género Ascobolus Pers. Género Saccobolus Boud. Familia Caloscyphaceae Género Caloscypha Boudier Familia Discinaceae Género Gyromitra Fries Familia Helvellaceae Género Helvella Linnaeus Familia Morchellaceae Género Morchella Dill. : Pers. Género Verpa Swartz. Familia Pezizaceae Género Peziza (L.) Fr. Familia Pyronemataceae Género Anthracobia Boudier Familia Sarcoscyphaceae Género Cookeina Kuntze Género Phillipsia Berk. Familia Tuberaceae Género Tuber P. Mich.: A. Wigg Familia Sarcosomataceae Género Plectania Fuckel 189 189 189 191 191 192 192 194 194 194 194 195 195 195 195 196 196 198 198 198 199 200 200 202 202 202 202 203 203 203 204 204 204 204 205 205 206 206 207 207 208 208 208 209 209 209 210 210 211 211 CONTENIDO Clase Sordariomycetes Subclase Hypocreomycetidae Orden Hypocreales Familia Bionectriaceae Género Bionectria Spegazzini Familia Clavicipitaceae Género Claviceps Tul. Familia Cordycipitaceae Familia Ophiocordycipitaceae Familia Hypocreaceae Género Hypocrea Fries Familia Nectriaceae Género Gibberella Saccardo. Género Haematonectria Samuels & Niremberg Género Albonectria Rossman & Samuels. Orden Microascales Familia Ceratocystidaceae Género Ceratocystis J. B. Ellis & Halsted Familia Microascaceae Familia Glomerellaceae de ubicación incierta en la subclase Hypocreomycetidae Subclase Sordariomycetidae Orden Diaporthales Familia Cryphonectriaceae Familia Diaphorthaceae Orden Ophiostomatales Familia Ophiostomataceae Género Ophiostoma Syd. & P. Syd. Orden Sordariales Familia Chaetomiaceae G. Winter Género Chaetomium Kunzen ex Fr. Familia Sordariaceae G. Winter Género Neurospora Shear & Dodge. Género Sordaria Cesati & De Notaris. Subclase Xylariomycetidae Orden Xylariales Familia Xylariaceae Tul. & C. Tul. Género Camillea Fr. Género Daldinia Ces. & De Not. Género Entonaema Moell. Género Hypoxylon Bull.:Fr. Género Kretzschmaria Fr. Género Phylacia Lev. Género Poronia Willd.: S. F. Gray. Género Rosellinia De Not. Género Thamnomyces Ehrenb.: Sprengel. Género Xylaria J. Hill : Schranck. Familia Magnaporthaceae de ubicación incierta en la clase Sordariomycetes Género Magnaporthe R.A. Krause & R.K. Webster 211 212 212 213 213 213 214 214 216 216 216 217 217 217 217 218 218 218 218 219 219 219 219 220 220 220 221 221 221 221 222 222 223 224 224 224 224 225 225 226 226 226 226 227 228 228 228 230 HONGOS LIQUENIZADOS Tipos de talo Reproducción Química y sustratos Clase Lecanoromycetes Subclase Acarosporomycetidae Orden Acarosporales Familia Acarosporaceae Subclase Ostropomycetidae Orden Baeomycetales Familia Baeomycetaceae Orden Ostropales Familia Coenogoniaceae Subclase Lecanoromycetidae Orden Lecanorales Familia Cladoniaceae Género Cladonia Hill ex. P. Familia Lecanoraceae Género Lecanora Ach. Familia Parmeliaceae Familia Ramalinaceae Género Ramalina Ach. Orden Peltigerales Familia Coccocarpiaceae Familia Lobariaceae Género Lobaria (Schreb) Hoffm. Género Sticta (Schreb) Ach. Familia Peltigeraceae Género Peltigera Willd. Clase Lichinomycetes Orden Lichinales Familia Peltulaceae BIBLIOGRAFÍA 11. FILO BASIDIOMYCOTA FILO BASIDIOMYCOTA GENERALIDADES CLASIFICACIÓN TAXONÓMICA DE BASIDIOMYCOTA SUBFILO AGARICOMYCOTINA Estructura y morfogénesis de los basidiocarpos Sistema hifal Desarrollo de los basidiocarpos Clase Agaricomycetes Subclase Agaricomycetidae Orden Agaricales Familia Agaricaceae Género Agaricus Fr. Género Bovista Pers. IX 230 231 231 233 234 234 234 234 234 235 235 235 235 235 235 236 236 236 236 237 237 237 237 237 238 238 238 238 239 239 239 239 239 247 248 248 250 250 252 252 254 254 254 255 256 258 258 X BIOLOGÍA DE HONGOS Género Calvatia Fr. Género Chlorophyllum Massee. Género Coprinus S. F Gray. Género Lepiota (Pers.) Gray. Género Leucocoprinus Patouillard. Género Lycoperdon Pers. Género Macrolepiota Singer Familia Amanitaceae Género Amanita Pers. Género Catatrama Franco-Mol. Género Limacella Earle. Familia Bolbitiaceae Género Bolbitius Fr. Género Panaeolus (Fries) Quélet. Familia Cortinariaceae Género Cortinarius Fr. Familia Entolomataceae Género Clitopilus Kummer. Género Entoloma Kummer. Género Leptonia (Fr.) Kumm. Familia Hydnangiaceae Género Hydnangium Wallr. Género Laccaria Berk. & Br. Familia Hygrophoraceae Género Hygroaste Singer. Género Hygrocybe (Fr.) Kummer Familia Hymenogastraceae Género Hymenogaster Vittad. Familia Marasmiaceae Género Crinipellis Pat. Género Gymnopus (Pers.) Roussel Género Marasmius Fr. Género Campanella Henn. Familia Mycenaceae Género Mycena (Pers. Ex Fr.) S. F. Gray. Género Xeromphalina Kühner & Maire. Familia Nidulariaceae Género Cyathus Haller ex. Pers. Género Nidularia Fr. & Nordholm. Familia Physalacriaceae Género Armillaria Fr. ex Fr. Género Gloiocephala Massee. Género Oudemansiella Speg. Familia Pleurotaceae Género Pleurotus (Fr.) P. Kumm. Género Hohenbuehelia Schulzer. Familia Pluteaceae Género Pluteus Fr. Género Volvariella Speg. Familia Psathyrellaceae Género Psathyrella (Fr.) Quél. 258 259 260 260 261 262 263 263 264 264 264 264 265 265 266 266 267 267 268 268 268 269 269 269 269 270 270 271 271 271 271 272 272 273 273 273 274 274 274 274 275 276 276 276 277 277 278 278 278 278 279 Familia Schizophyllaceae Género Schizophyllum Fr. ex Fr. Familia Strophariaceae Género Hypholoma (Fr.) Kummer Género Pholiota (Fr.) Kummer Género Psilocybe (Fr.) Kummer Familia Tricholomataceae Género Collybia (Fr.) Staude. Género Lepista (Fr.) W. G. Smith. Género Omphalina Quél. Género Tricholoma (Fr.: Fr.) Staude. Orden Boletales Familia Boletaceae Chevall. Género Austroboletus Corner (Wolfe). Género Boletus Fries. Género Leccinum S. F. Gray. Género Phylloporus Quél. Género Strobilomyces Berkeley. Género Tylopilus Karsten. Familia Calostomataceae Género Calostoma Desv. Familia Suillaceae Género Suillus S. F. Gray. Subclase Phallomycetidae Orden Geastrales Familia Geastraceae Género Geastrum Pers. Género Myriostoma Desv. Orden Gomphales Familia Gomphaceae Género Gomphus Persoon. Orden Cantharellales Familia Cantharellaceae Género Cantharellus Adans. ex Fr. Familia Clavulinaceae Género Clavulina J. Schröt.. Familia Hydnaceae Género Hydnum L. Orden Gloeophyllales Familia Gloeophyllaceae Género Gloeophyllum P. Karsten. Género Veluticeps (Cooke) Pat. Orden Hymenochaetales Familia Hymenochaetaceae Género Phellinus Quélet. Familia Schizoporaceae Género Hyphodontia J. Erikss. Orden Phallales Familia Phallaceae Género Phallus Junius ex L. 279 279 279 280 280 280 280 281 281 281 282 283 283 283 284 284 285 285 285 286 286 286 287 287 287 288 288 288 288 289 289 289 289 290 290 291 291 291 291 291 291 292 292 292 292 293 293 293 294 294 CAPÍTULO 7 GENÉTICA DE HONGOS INTRODUCCIÓN GENÓMICA ESTRUCTURAL GENÉTICA DE HONGOS INTERACCIONES GENÓMICAS INTRODUCCIÓN A LA BIOTECNOLOGÍA DE HONGOS INTRODUCCIÓN La genética es la disciplina que trata de entender la manera en la cual la información necesaria para reproducir un organismo es guardada dentro de él, y cómo esta información puede cambiar y reorganizarse antes de ser transmitida a la siguiente generación (Kendrick, 2000). Basándonos en esta definición, en este capítulo trataremos tres temas: genómica estructural, genética clásica e introducción a la biotecnología de hongos. El primer tema nos introducirá en la era genómica y más específicamente en la secuenciación de genomas de hongos y organismos relacionados. Conoceremos cuáles organismos han sido secuenciados, dónde está guardada la información y cómo y para qué podemos acceder a ella. En el segundo tema hablaremos de la genética de hongos haciendo un énfasis especial en aquellas características que hacen únicos a los organismos llamados hongos desde un punto de vista genético: heterocariosis, parasexualidad, recombinación mitótica, segregaciones aberrantes, entre otros temas. Finalmente, haremos una introducción a la biotecnología de hongos y, en particular, cómo el hombre puede “cambiar” y tomar provecho de la información genética de los hongos. GENÓMICA ESTRUCTURAL El término genómica apareció por primera vez hacia la década de los ochenta y tomó fuerza en la década de los noventa cuando se lanzaron los proyectos de secuenciación de genomas. El primer genoma de un organismo de vida libre que se secuenció fue el de Haemophilus influenzae (1,8 Mb) en 1995 (Freishmann et al., 1995). Siguieron otros microorganismos, plantas y en el 2001 se elaboró el primer borrador del genoma humano. En la actualidad se tiene la secuencia del genoma de más de setenta organismos incluyendo arquea, eubacteria y eucariontes (http://www.ebi.ac.uk/genomes/). La genómica suele subdividirse en estructural, comparativa y funcional. La genómica estructural estudia la organización y secuencia de los genomas, establece mapas citogenéticos, genéticos y físicos de los cromosomas. La genómica comparativa estudia la evolución y función de los genomas mediante comparaciones globales de genomas de organismos relacionados evolutivamente 98 GENÉTICA DE HONGOS o aun lejanos en la escala evolutiva. Finalmente, la genómica funcional pretende establecer la función de los genes presentes en un genoma. Sin embargo, antes de seguir adelante, definamos la genómica. El término genómica es difícil de explicar ya que su definición varía de científico a científico pero trataremos de dar un significado y definir sus alcances. La palabra genómica se deriva de genoma, que significa el contenido de ADN de una célula haploide o la mitad de este contenido en una célula diploide. No obstante, decir que la genómica es el estudio del genoma sería demasiado simplista. La genómica incluye secuenciar el ADN, analizar la secuencia, estudiar las variaciones del genoma dentro de una población y establecer los patrones del control transcripcional de los genes. La genómica maneja conjuntos enormes de datos y métodos de gran poder (en inglés se habla de high-throughput methods). En nuestro caso, la genómica incluirá los tópicos ya mencionados y, además, la proteómica o estudio del contenido total de proteínas de una célula, tejido u organismo en un momento dado. El sitio de referencia para la secuenciación de genomas de hongos es el Instituto Broad, que puede ser visitado en internet en la dirección: http://www.broad. mit.edu/. Según lo encontrado en la página web mencionada, dentro de los proyectos científicos del Instituto Broad se encuentra la Iniciativa Genómica de Hongos (Fungal Genome Initiative o FGI). En el marco de esta iniciativa se han secuenciado más de cincuenta organismos fúngicos importantes en medicina, agricultura e industria. El Instituto Broad trabaja de cerca con la comunidad de micólogos de tal manera que la decisión sobre cuál genoma secuenciar se toma en el seno de un comité que cuenta con especialistas en biología de hongos. La mayoría de los hongos secuenciados pertenecen a grupos de organismos filogenéticamente relacionados. Esta estrategia responde a la idea de que la información obtenida de cada organismo no sólo es importante por su impacto en áreas médicas agrícolas o industriales, sino que la comparación entre genomas y la correlación entre diferencias genómicas y diferencias fenotípicas (como por ejemplo grados de virulencia o patogenicidad) puede acelerar el descubrimiento de genes o regiones genómicas de importancia. Para acceder a la información genómica de los hongos se puede ingresar al enlace de la FGI o acceder a la página http://www.broad.mit.edu/annotation/fgi/, una vez allí, se sigue el enlace ofrecido por el nombre de cada hongo, lo que dirige a una nueva página donde podemos acceder a la secuencia completa del organismo; si 99 queremos podemos grabarla en nuestros archivos o podemos hacer uso de herramientas informáticas accesibles en la misma página. Con una de ellas podemos buscar si en la secuencia de un hongo disponible en la página FGI hay un gen en particular o una secuencia que está presente en otro organismo de interés particular. Si el lector no está familiarizado con las herramientas de bioinformática le recomendamos una guía muy buena y sencilla para el aprendizaje de la bioinformática básica, Bioinfórmate, un ambiente virtual de aprendizaje (AVA) que se puede consultar en la dirección http://bioinformate.uniandes.edu.co. GENÉTICA DE HONGOS El genoma de los organismos eucariontes está contenido en un organelo llamado núcleo y organizado en dos o más cromosomas. El tamaño del genoma de los Hongos y organismos relacionados es muy variable, alrededor de 25 millones de pares de bases para la mayoría de los hongos filamentosos y 240 millones de pares de bases para algunas especies del reino Chromista. La mayoría de los organismos fúngicos son haploides (poseen sólo un conjunto de cromosomas) lo cual representa una ventaja para los estudios genéticos ya que por un lado no habrá interacciones entre alelos (dominancia, recesividad, etcétera) y, por otro lado, cada gen puede ser potencialmente expresado en el fenotipo. Los únicos organismos diploides que serán considerados en este capítulo justamente corresponden al reino Chromista. INTERACCIONES GENÓMICAS Fusiones de hifas Como lo diremos reiteradamente en este libro, los hongos son organismos muy diversos en su estilo de vida. En particular, el papel de la reproducción sexual en el ciclo de vida de los hongos también es muy variable. Existen muchos organismos para los cuales nunca se ha descrito la reproducción sexual y hay muchas formas de sexualidad en las cuales se aporta información genética de cada organismo parental en un arreglo que eventualmente 100 BIOLOGÍA DE HONGOS produce un núcleo diploide que a su vez sufre meiosis con las consabidas segregación de cromosomas y recombinación genética típicas de los organismos eucariontes (Moore & Novak-Frazer, 2002). Antes de continuar debemos definir los términos homotálico y heterotálico pues los usaremos en lo que queda del capítulo. Una especie es considerada homotálica si el individuo puede completar el ciclo sexual por él mismo. El homotalismo implica autofertilización pero no se limita a ella ya que cepas homotálicas pueden entrecruzarse en la naturaleza o en el laboratorio. Al contrario, una especie heterotálica nunca presentará autofertilización y se caracteriza por la autoesterilidad o autoincompatibilidad. Estas especies requieren la interacción de dos individuos diferentes para completar el ciclo sexual. Heterocariosis es la presencia de núcleos diferentes en un mismo micelio. Al parecer es un mecanismo con el cual los hongos se adaptan a cambios ambientales inesperados (Maheshwari, 2005). Resulta de mutaciones en algunos núcleos dando origen a núcleos diferentes en la misma hifa o por la fusión de hifas (anastomosis) de cepas diferentes seguida de la migración de núcleos de una hifa a la otra. Así, visto de otra forma, anastomosis es la fusión de hifas o ramas hifales que implica el rompimiento de dos paredes celulares, unión de las membranas plasmáticas y un citoplasma continuo entre las dos hifas en fusión (Moore & Novak-Frazer, 2002). La heterocariosis y la eventual cariogamia o fusión de núcleos está bajo un control muy estricto. Si dos hifas van a fusionarse lo ideal es que sean muy parecidas para evitar problemas de incompatibilidad que pueden llevar incluso a la muerte celular. Por otro lado, si dos núcleos se van a unir para, por ejemplo, aprovechar las ventajas de la reproducción sexual, lo ideal es que los núcleos sean muy diferentes para aumentar la variabilidad en la descendencia. El control de estos eventos es genético y para el caso de hifas en fusión se habla de compatibilidad vegetativa (CV) y en el caso de fusión de núcleos, el proceso es regulado por genes llamados factores de tipo de apareamiento. La CV es controlada por uno o varios genes y limita el proceso de anastomosis entre cepas pertenecientes a grupos de compatibilidad vegetativa (VCG) diferentes. Es decir que sólo pueden hacer fusión cepas pertenecientes al mismo grupo de compatibilidad vegetativa y que poseen los mismos alelos de VCG. La fusión puede ser interrumpida en diferentes momentos durante el proceso pero en la mayoría de los casos se da la incompatibilidad posfusión. Tipos de apareamiento (mating types): el caso de Saccharomyces cerevisiae Meyen El control genético del apareamiento sexual se puede dar por la interacción de alelos de uno o varios loci en cuyos casos se llama incompatibilidad unifactorial (o bipolar) e incompatibilidad bifactorial (o tetrapolar) respectivamente. Es muy común que a los alelos alternativos de los tipos de apareamiento se les llame idiomorfos en vez de alelos ya que dichos alelos no comparten el grado de similaridad nucleotídica esperada entre alelos. Con el fin de explicar el sistema genético de tipo de apareamiento en hongos tomaremos el ejemplo de la levadura Saccharomyces cerevisiae que posee un sistema de tipo unifactorial y un ciclo de vida haplo-diplóntico, es decir, alternancia entre un estado haploide y un estado diploide. En este hongo, existen dos tipos de apareamiento, a y α que se conocen hormonas de tipo peptídico de los dos tipos de apareamiento: feromona a y feromona α. Igualmente, se han caracterizado receptores para los dos tipos de feromonas, es decir que una célula de tipo a tendrá receptores para la feromona α y viceversa. En el momento en que un receptor reconoce una feromona del tipo opuesto, se inicia una cascada de transmisión de señales dentro de la célula y ocurren tres eventos: 1. 2. 3. Las células receptoras producen una aglutinina que aumenta la adhesión de células de tipo de apareamiento opuesto. El ciclo mitótico para en G1 (v. cap. 4, fig. 4.4). La estructura celular es alterada de manera que se producen unas proyecciones por las cuales ocurrirá la fusión de las células de tipo de apareamiento opuesto. Las células diploides esporulan y forman una progenie formada de células a y α. El locus genético responsable del control de apareamiento se llama MAT en el cual hay dos genes ligados (a1 y a2 para el tipo de apareamiento a, y α1 y α2 para el tipo de apareamiento α). Las funciones de los productos de los genes son específicas en las células haploides y en las células diploides estos interactúan entre sí. Las funciones de los péptidos codificados por los genes son las siguientes: • Célula α: α1 activa la transcripción de genes específicos de células α, es decir la feromona α y el receptor de feromona a. GENÉTICA DE HONGOS α2: reprime expresión de la feromona a y del receptor de la feromona α. • Célula a: a1: reprime la producción del receptor genes de feromona a y de la feromona α. α2: función desconocida. • Célula a/α: a1 y α2 interactúan juntos y el dímero reprime genes específicos de células haploides, incluyendo el gen REM1 (que reprime la meiosis y la esporulación). Este dímero también reprime α1. a2 reprime la expresión de genes específicos de a. Adicionalmente, en las células haploides se expresan sin problemas los genes específicos haploides, entre los cuales RME1 es uno de ellos. Para mayor entendimiento ver figura 7.1, tomada y modificada de Herskowitz (1988). S. cerevisiae es heterotálico pero un clon de células haploides de un tipo de apareamiento dado puede esporular y dar una progenie con igual número de células a y α. Esto resulta por un fenómeno conocido como cambio en tipo de apareamiento y controlado por el gen HO (de homotálico) que existe en dos formas alélicas, HO dominante y ho recesivo y codifica para una endonucleasa (enzima que corta las cadenas de ácidos nucleicos). A cada lado del locus MAT están dos loci de reserva, HMR del lado derecho y HML del lado izquierdo y que corresponden a los tipos de apareamiento a y α respectivamente. Los genes HML y HMR, aunque contienen toda la información necesaria para los tipos de apareamiento, no se expresan debido a la estructura de cromatina particular que tienen y que resulta por secuencias silenciadoras a lado y lado de los loci HMR y HML. La endonucleasa HO crea un corte en la cadena donde se encuentra el locus MAT y esto favorece el intercambio de información entre MAT y HML o HMR. De hecho, el locus MATa va a recombinar preferencialmente con HML (correspondiente al tipo de apareamiento α) y MATα con HMR. De esta manera, se asegura el cambio de tipo de apareamiento y molecularmente este control se da por un activador de recombinación (RE) que favorece la recombinación preferencial entre MATa y HML y entre MATα y HMR. El cambio de apareamiento asegura que células que queden aisladas en un hábitat puedan llevar a cabo reproducción sexual. El cambio de apareamiento ocurre en una frecuencia baja en células con el alelo ho y en cada ciclo mitótico para células con alelo HO. El cambio de apareamiento ocurre de la siguiente manera: una célula recién formada por gemación no es capaz de cambiar 101 Célula α αsg α2 α1 asg Locus MAT α hsg Célula a αsg a1 asg Locus MAT a hsg a/α αsg α2 α1 asg a1 hsg Fig. 7.1. Sistema de factores de apareamiento en la levadura Saccharomyces cerevisiae. MAT: locus de apareamiento, las proteínas codificadas en este locus controlan la expresión de otros genes; αsg: genes específicos de α; asg: genes específicos de a; hsg: genes haploides específicos; a1: proteínas de fenotipo a. Fuente: traducido y modificado de Herskowitz (1988) el tipo de apareamiento pues la célula madre manda a la hija un ARNm, del gen Adhq que codifica para un inhibidor de la endonucleasa HO. Como resultado de esto, sólo la madre es capaz de cambiar su tipo de apareamiento y esto hace que a cada ciclo se tengan dos células de tipo de apareamiento opuesto. Mecanismos y análisis de recombinación durante la meiosis La meiosis que ocurre en los hongos sigue los patrones de meiosis de los demás organismos eucariotas. Acá debemos recordar que la meiosis en los organismos pertenecientes al reino Hongos ocurre luego de la fusión 102 BIOLOGÍA DE HONGOS (o cariogamia) de los núcleos opuestos que comienzan el proceso de reproducción sexual porque estos organismos son haploides en la mayor parte de su ciclo de vida. En el caso de los organismos diploides pertenecientes al reino Chromista, la meiosis ocurre en los gametangios (anteridio y oogonio) donde se forman los gametos haploides que procederán a la fertilización. El resultado de la meiosis es la formación de cuatro núcleos haploides. Los cromosomas segregan al azar durante la meiosis de manera que si los cromosomas poseen genes detectables, por ejemplo, por un fenotipo evidente, se pueden predecir las frecuencias de los genotipos en un conjunto de esporas tomadas al azar entre la progenie. Otro fenómeno que conocemos y que ocurre durante la meiosis es la recombinación (o crossovers, entrecruzamientos o quiasmata) de información entre cromátides no hermanas de cromosomas apareados. En este punto recordemos igualmente que la frecuencia de recombinación es una medida de la distancia entre dos genes. La recombinación ocurre cuando los cromosomas homólogos están apareados en el plano ecuatorial y en total hay cuatro cromátides, dos por cromosoma. El apareamiento sólo involucra dos cromátides, las otras dos resultan en no recombinación pero contribuyen a las frecuencias finales. De esta manera, una frecuencia de recombinación de 20% significa que 40% de las meiosis presentaron un entrecruzamiento (adaptado de Moore & Novak-Frazer, 2002). En algunas especies del filo Ascomycota, una mitosis sigue a la meiosis resultando en ocho ascosporas. Adicionalmente, en algunos géneros, Sordaria Ces. & De Not., Ascobolus Pers. y algunas especies Neurospora Shear & B.O. Dodge, las ocho esporas quedan ordenadas en el asco de manera que al estudiar el fenotipo o genotipo de las ascosporas se puede determinar la ocurrencia de entrecruzamientos. Los productos de la meiosis quedan arreglados en un orden lineal que depende solamente de los mecanismos de la meiosis, es decir, recombinación y segregación de cromosomas. Esto ocurre porque el asco es muy estrecho y todos los husos de división deben ubicarse a lo largo del eje longitudinal del asco. Tomemos un ejemplo para ilustrar todo esto. Tenemos el caso de algunas especies de Neurospora, Ascobolus y Sordaria, en las cuales el color de las ascosporas está dado por un gen con un par de alelos + (ascosporas negras) y w (ascosporas blancas) (Moore & Novak-Frazer, 2002). Realizamos un cruce entre una cepa de ascosporas negras con una cepa mutante con ascosporas blancas. En el caso de la segregación del carácter tendremos la proporción 4:4 (en el caso de las ocho ascosporas sería: ++++:wwww o wwww:++++) cuando no ocurrió la recombinación o entrecruzamiento (y también lo llamamos segregación de primera división o prerreduccional ya que la segregación de los caracteres ocurre antes de la primera división de la meiosis que es la división reduccional). En el caso de que haya entrecruzamiento de los cromosomas homólogos entre el centrómero y el carácter, tendremos la proporción 2:2:2:2 (ww:++:ww:++, ++:ww:++:ww, ww:++:++ww o ++:ww:ww:++) o proporción de segunda división o posreduccional. En este punto debemos recordar y repasar cómo se da físicamente el proceso de recombinación. Holliday (1964) propuso un modelo según el cual cuando los cromosomas homólogos están apareados y las cromátides que van a presentar entrecruzamiento se encuentran cercanas, las dobles cadenas de ADN se desdoblan en las dos cromátides no hermanas. Luego, ocurre un pequeño corte en una de las dos hebras de ADN en las dos cromátides que se entrecruzarán en puntos correspondientes. Estos cortes dejarán extremos libres en cada cromátide y esas hebras “libres” invaden la cadena de la cromátide opuesta con la cual está ocurriendo el entrecruzamiento. En este momento tenemos una estructura en X (intercambio recíproco de hebras sencillas de ADN) o estructura de Holliday. De esta manera, en un momento dado, las cromátides tendrán una hebra de ADN perteneciente a un cromosoma y la otra hebra de ADN perteneciente al otro cromosoma. Si las dos cromátides que se entrecruzaron tenían alelos diferentes, en esta zona se formará una molécula de ADN híbrida o heterodúplex y habrá en algunos sitios un mal apareamiento de bases, por ejemplo, una A con una G. Normalmente, esto es corregido por el sistema de reparación de la célula antes de la mitosis posmeiótica. Por otro lado, la estructura de Holliday debe resolverse pues si entendimos bien, como hubo intercambio de cadenas de ADN, los cromosomas homólogos están unidos. Es decir que debe ocurrir un corte en las cadenas de ADN para separar los cromosomas homólogos y que puedan segregar durante la meiosis. Ahora, recordamos esto porque fue gracias al entendimiento de estos procesos moleculares que se pudieron explicar algunas segregaciones aberrantes que se descubrían al azar durante el análisis de octadas (arreglo de ocho ascosporas). Segregaciones aberrantes son aquellas diferentes a las 4:4 o 2:2:2:2, y corresponden a 5:3, 6:2 o a un 4:4 aberrante. A la proporción 6:2 (o 2:6) se le llamó conversión génica ya que esta proporción se puede derivar de un 4:4 normal si un alelo es convertido al otro antes de la mitosis. La proporción 5:3 ocurre cuando hasta el final (después de la mitosis) se conserva el heterodúplex en una de las dos cromátides con heterodúplex, es decir que en una de las cromátides que sufrió recombinación GENÉTICA DE HONGOS no hubo reparación del heterodúplex. En otras palabras, la cromátide que llega a la mitosis está formada, como toda molécula de ADN, de una doble hebra pero cada hebra tiene información diferente, una para el alelo mutante y otra para el alelo silvestre. Ahora tratemos de entender lo que ocurrió en la conversión génica. En este caso el heterodúplex sí se corrigió pero en vez de repararse “hacia” el alelo que uno espera para una proporción 2:2:2:2 (por ejemplo ww:++:ww:++), se convierte al otro alelo y da un 6:2 (ww:ww:ww:++). El caso de la segregación aberrante 4:4 (++:+w:+w:ww) ocurre cuando no hay corrección del heterodúplex en ninguna cromátide después de la recombinación y éste se conserva hasta la mitosis. Segregación de genes durante el ciclo de división mitótico En algunos casos, durante el ciclo vegetativo del hongo, se presenta un ciclo parasexual, es decir, procesos genéticos que resultan en núcleos recombinantes con combinaciones genéticas diferentes a las de los núcleos originales. El ciclo parasexual no es excluyente del ciclo sexual y hongos que presenten ciclos sexuales pueden, adicionalmente, en el transcurso de su ciclo de vida, mostrar parasexualidad. Para los hongos a los que sólo se les ha demostrado un ciclo asexual, el ciclo parasexual trae todas las ventajas de la sexualidad (aumento de variabilidad genética). Así, en algunos casos, durante el ciclo vegetativo del hongo se presenta una cariogamia o diploidización, por ejemplo, después de un proceso de anastomosis cuando estamos en estado de heterocarión. En este caso resultaremos con un núcleo 2n o sea diploide que contiene dos conjuntos de cromosomas. La diploidización puede ocurrir naturalmente o ser inducida por agentes químicos (vapores de alcanfor, mitomicina o ácido nitroso) o por efectos físicos (luz ultravioleta o rayos X). Ahora, como el hongo es normalmente haploide en su ciclo de vida, este estado diploide debe revertir al estado haploide. A este proceso se le conoce como haploidización y se puede dar naturalmente o se puede inducir por algunos compuestos químicos como el fungicida Benlate (p-fluorofenilalanina). La haploidización se da por la no-disyunción de cromosomas en la división mitótica. La no-disyunción resulta cuando no hay separación de cromátides en la mitosis (algo que ocurre normalmente en mitosis). Al final tendremos un núcleo 2n + 1 y un núcleo 2n – 1 (a estos núcleos se les dice que tienen un número aneuploide de cromosomas). El núcleo 2n-1 es inestable y revertirá al 103 estado n por pérdida sucesiva de cromosomas (este núcleo sufrió haploidización). El núcleo 2n + 1 resultará en 2n por pérdida del cromosoma adicional. El proceso de haploidización resulta en aumento de variabilidad genética en los núcleos resultantes ya que la pérdida de cromosomas se da al azar entre los cromosomas que originaron la célula 2n que vienen de dos núcleos diferentes (recordemos que teníamos un heterocarión). Ahora en contexto, en el ciclo parasexual ocurre plasmogamia, cariogamia y haploidización pero no en un lugar o tiempo específico durante el ciclo de vida, ni con formación de estructuras sexuales. El ejemplo más conocido de este fenómeno es Aspergillus nidulans (Eidam) G. Winter. Adicionalmente, se puede dar un proceso de recombinación durante la mitosis de una célula 2n si se da el caso de un apareamiento de cromosomas homólogos, en ese caso decimos que hubo recombinación mitótica. Como es de esperar, este fenómeno resulta en una variabilidad genética en las células hijas. El fenómeno de conversión génica también ocurre durante los procesos de recombinación mitótica al igual que durante la meiosis debido a las formación de moléculas híbridas de ADN o heterodúplex seguida o no de reparaciones en estas moléculas. INTRODUCCIÓN A LA BIOTECNOLOGÍA DE HONGOS Una vez repasados los temas de genética de hongos, entraremos a dar un vistazo a la biotecnología de hongos y cómo el hombre ha tratado de manipular la información genética de los hongos para su provecho. Recordemos que esto es sólo una introducción al tema y trataremos sólo dos tópicos: métodos más comunes usados para el estudio y manipulación de hongos y principales aplicaciones biotecnológicas. Métodos celulares y moleculares para la manipulación de hongos Si hiciéramos una revisión de métodos usados en biotecnología de hongos la lista sería demasiado larga y ambiciosa para los objetivos de este libro, así que nos centraremos principalmente en un proceso: transformación genética. La transformación genética implica la 104 BIOLOGÍA DE HONGOS introducción a la célula fúngica de material genético propio o extraño. El tejido más usado para la transformación genética de hongos es el protoplasto o célula sin pared. La tecnología básica para la obtención de protoplastos es sencilla. El material fúngico, células, micelio o esporas es suspendido en una solución que contiene: • • • una mezcla de enzimas que digiere la pared del hongo, una sal inorgánica u otro soluto que ayude a mantener la isotonía con el citoplasma, un tampón o buffer. Una vez los protoplastos obtenidos y regenerados, se puede proceder a la introducción de una molécula de ADN. Algunos laboratorios han usado esporas o micelio intacto pero la gran mayoría usan los protoplastos. Algo común en los protocolos de transformación genética es el uso de polietilenglicol como estimulante de la toma de ADN. Se cree que este producto químico favorece la fusión de protoplastos y esto a su vez favorece la toma de ADN. Para una revisión completa de los mecanismos de transformación genética de hongos recomendamos la lectura del artículo publicado por Fincham (1989) y en el caso de Oomycetes ver Mcleod et al. (2008). Como se mencionó anteriormente, la transformación de un hongo se puede hacer con material genético proveniente del mismo hongo (transformación homóloga) o con material genético de otros hongos o incluso de organismos más distantes filogenéticamente (transformación heteróloga). Tradicionalmente, el hongo más usado para transformación genética y expresión de genes introducidos ha sido la levadura Saccharomyces cerevisiae. En el caso de los hongos filamentosos se ha usado preferencialmente el género Aspergillus con sus especies A. oryzae (Ahlb.) E. Cohn, A. níger Tiegh y más recientemente se ha usado Fusarium venenatum Nirenberg. Aplicaciones biotecnológicas La biotecnología de hongos ha sido bastante productiva para el hombre, siendo estos organismos usados para la producción de muchos compuestos y durante procesos industriales. La producción de alimentos se ha visto beneficiada: cultivo de champiñones, quesos madurados, industria cervecera, procesos que involucran fermentación, producción de proteína fúngica. Otros productos obtenidos de los hongos, con o sin manipulación genética son: alcaloides, antibióticos (penicilina principalmente), etanol, enzimas (hidrolasas, enzimas lignilolíticas, enzimas celulolíticas y muchas más), ácidos orgánicos, lípidos, giberilinas, vitaminas, polisacáridos e inmunomoduladores. Los procesos industriales en los cuales se usan los hongos son: control biológico de patógenos de plantas, tratamiento de basuras, biorremediación de suelos y aguas contaminadas, biofertilizantes, coloración y blanqueamiento de textiles. BIBLIOGRAFÍA Fincham, J. R. S. 1989. Transformation in fungi. Microbiological Reviews 53: 148-170. Freishmann, R.D, M.D Adams, O. White, R.A. Clayton , E.F. Kirkness, A.R. Kerlavage, C.J. Bult, J.F. Tomb, B.A. Dougherty, J.M. Merrick, K. Mckenney, G. Sutton, W. Fitzhugh, C. Fields, J. Gocayne, J. Scott, R. Shirley, L. Liu, A. Glodek, J. Kelley, J. Weidman, C. Phillips, T. Spriggs, E. Hedblom, M. Cotton, T. Utterback, M. Hanna, D. Nguyen, D. Saudek, R. Brandon, L. Fine, J. Fritchman, J. Fuhrmann, N. Geoghahgen, C. Gnehm, L. McDonald, K. Small, C. Fraser, H. Smith & J. C. Venter. 1995. Whole-genome random sequencing and assembly of Haemophilus influenzae Rd. Science, 269: 496-512. Herskowitz, I. 1988. Life Cycle of the Budding Yeast Saccharomyces cerevisiae. Microbiological Reviews, 52:536-553. Holliday, R. 1964. A mechanism for gene conversion in fungi. Genetical Research, 5: 282-304. Kendrick, B. 2000. The Fifth Kingdom. Focus Publishing, Newburyport., MA., E. U. Maheshwari, R. 2005. Fungi. Experimental Methods in Biology. Mycology, 24.CRC. Taylor & Francis, Boca Ratón, Florida. E. U. Mcleod, A., B. A. Fry, A. P. Zuluaga, K. L. Myers, & E. F. Toward. Improvements of Oomycete transformation protocols. Journal of Eukaryotic Microbiology, 55: 103-109. Moore, D. & L. A. Novak-Frazer. 2002. Essential Fungal Genetics. Springer - Verlag, New York, E. U. CAPÍTULO 8 CLASIFICACIÓN Y TAXONOMÍA Con la colaboración de Carolina Pardo y Camilo Salazar CLASIFICACIÓN BIOLÓGICA TAXONOMÍA Y NOMENCLATURA INTRODUCCIÓN A LA SISTEMÁTICA DE LOS HONGOS (REINOS HONGOS, STRAMINIPILA Y PROTOZOA) EL PROYECTO ÁRBOL DE LA VIDA CÓDIGO INTERNACIONAL DE NOMENCLATURA Y TIPIFICACIÓN Árbol de la vida de Darwin CLASIFICACIÓN BIOLÓGICA El proceso de clasificación biológica consiste en agrupar los organismos a partir de las características que tienen en común, mediante la asignación de categorías. La agrupación de los organismos sirve para organizar el conocimiento de una forma coherente y para evidenciar de forma clara las relaciones entre estos. Existen diferentes métodos empleados para realizar la clasificación biológica, sin embargo, los más empleados son la fenética y la sistemática filogenética (cladística). De la primera daremos una breve explicación mientras que para la segunda entraremos en detalle dada la importancia que ha adquirido en los últimos años. La fenética es un método basado en la medida de todas las similitudes encontradas en los organismos estudiados. Este método se destaca por incorporar la mayor cantidad de características o caracteres posibles, los cuales son evaluados sin ninguna jerarquía, es decir que todas tienen la misma importancia. Adicionalmente, este método no tiene en cuenta la historia evolutiva de los organismos. Filogenia. Sistemática filogenética Todos los organismos que existen en la tierra son el resultado de la evolución. Si la historia evolutiva, o filogenia, de un organismo se reconstruye, este organismo se conecta con linajes de otros organismos a través de ancestros comunes. Dado que nosotros estamos en un tiempo y espacio distinto a cuando las fuerzas evolutivas actuaron moldeando la diversidad que vemos ahora, nos resulta imposible entender del todo cómo ocurrieron los cambios genéticos que observamos actualmente en la naturaleza. Es así como la filogenia, método descrito por primera vez por Henning (1966) en su libro Phylogenetic Systematics, se ha convertido en una disciplina de uso común entre biólogos evolutivos con el objeto de dilucidar estas dicotomías ancestrodescendientes que nos permitan organizar y entender el cambio evolutivo. De esta manera, la filogenética se dedica a la búsqueda de caracteres morfológicos, comportamentales y moleculares, entre otros, que nos puedan contar o dar información de ancestría común y, por lo tanto, a una escala profunda de la historia de la vida. 106 162 BIOLOGÍA DE HONGOS —, B.C 1980. The Coelomycetes. Fungi Imperfecti with Pycnidia, Acervuli and Stromata. Common Wealth Mycological Institute Kew, Surrey. England. Thaung, M.M., 2008. Coelomycete systematics with special reference to Colletotrichum. Mycoscience. 49: 345-350. Webster, J. & E. Descals, 1981. Morphology, Distribution and Ecology of conidial Fungi in Fresh water habitats. En: Cole, G.T. & B. Kendrick. (Eds.). Biology of Conidial Fungi. Vol. 1. Academic Press. New York. Webster, J. & R. Weber, 2007. Introduction to fungi. Third Edition. Cambridge University Press. Wei, J.G. and Xu, T. (2004). Pestalotiopsis kunmingensis sp. nov., an endophyte from Podocarpus macrophyllus. Fungal Diversity 15: 247-254. Weresub, L. K. & K. A Pirozynski. 1979. Pleomorphism of Fungi as Treated in the History of Mycology and Nomenclature. Chapter 2. En: Kendrick, B. (Ed.). The Whole Fungus-Proceedings of Kananaskis II, Vol. 1. National Museum of Canada, Canada. Yarrow, D. 1999. Methods for the isolation, maintenance and identification of yeasts. En: The Yeasts: A Taxonomic Study. Fourth revised and enlarged edition. (Eds.) Kurtzman C.P. & Fell J.W. Elsevier. NY. E. U. pp. 77-100. CAPÍTULO 10 FILO ASCOMYCOTA GENERALIDADES ESTRUCTURAS VEGETATIVAS CLASIFICACIÓN TAXONÓMICA SUBFILO TAPHRINOMYCOTINA SUBFILO SACCHAROMYCOTINA SUBFILO PEZIZOMYCOTINA Subreino Dikaria (James et al., 2006) En este subreino se ubican los hongos filamentosos o unicelulares que presentan fase dicariótica y carecen de flagelos. Comprende dos filos: Ascomycota y Basidiomycota. La cariogamia no ocurre en seguida de la plasmogamia y, por tanto, la fase dicariótica puede ser corta como en los Ascomycota o larga como en los Basiodiomycota (Hibbett et al., 2007; Tehler et al., 2000). FILO ASCOMYCOTA GENERALIDADES Este filo es el de mayor número de especies dentro del reino, (aproximadamente 64,163) que corresponden al 75% de las especies de hongos descritas (Kirk et al., 2008). El nombre Ascomycota se deriva del griego askos que significa bolsa o saco y mykes que significa hongo, por esto podemos decir que en este grupo se ubican los hongos de saco. Su carácter diagnóstico principal es la presencia de este saco al que se denomina asco (fig. 10.1) dentro del cual se producen las esporas de origen sexual generalmente en número de ocho, denominadas ascosporas. La reproducción asexual se realiza por medio de conidios. La estructura vegetativa o somática puede ser unicelular como en el caso de las levaduras, o filamentosa como ocurre en los otros Ascomycota (Alexopoulos et al., 1996; Webster & Weber, 2007). La ocurrencia de estos hongos es muy amplia, pueden encontrarse en diferentes tipos de hábitats terrestres y acuáticos en todas las latitudes. En este grupo hay gran diversidad de formas de vida. Pueden ser saprótrofos, si se encuentran sobre estiércol, troncos, hojas y corteza de plantas muertas o enterrados en el suelo (hipogeos); parásitos biotróficos de plantas y animales como son los mildeos polvosos y algunos ectoparásitos de insectos. Algunos son parásitos facultativos de plantas, animales y el hombre. Muchos son endófitos de plantas monocotiledóneas y dicotiledóneas sin producir lesiones en ellas. Hay importantes simbiontes mutualistas como son los líquenes, que corresponden al 40% de los Ascomycota formando este tipo de asociación con algas y cianobacterias. Otros forman micorrizas entre las cuales se encuentran las trufas (Tuber spp.), muy apreciadas en culinaria (Alexopoulos et al., 1996; Deacon, 2006; Webster & Weber, 2007). 164 FILO ASCOMYCOTA 165 Fig. 10.1. Diferentes formas de ascos Fotografías: LAMFU y Agrodiágnostico (izq. centro) Los hongos de este filo tienen gran importancia como productores de metabolitos secundarios, como por ejemplo antibióticos, toxinas, inmunosupresores, etcétera. Otros son productores de enzimas como celulasas, proteasas, amilasas y lipasas. Se emplean en control biológico de insectos pues muchos pueden parasitar estos animales. Las levaduras por su capacidad fermentativa se usan en la fabricación de pan, vino, cerveza y alcohol. Varios son organismos de experimentación en genética, biología molecular y en medicina como Saccharomyces cerevisiae, Schizosaccharomyces pombe, Aspergillus nidulans y Neurospora crassa (Masuda et al., 2000; Momany et al., 2001; Galagan et al., 2005; Oliva et al., 2005; Laurila et al., 2005; Fulci & Macino, 2007). 166 BIOLOGÍA DE HONGOS A B C Fig. 10.2. A) Haustorio de Erysiphaceae; B) Apresorio de Colletorichum; C) Hifopodio: a. capitado, b. mucronado Esquema: Natalia Vargas ESTRUCTURAS VEGETATIVAS Los Ascomycota filamentosos se caracterizan porque presentan micelio compuesto de hifas delgadas (de 5 a 7 µm de diámetro) y septadas. Los septos, que dividen las hifas en segmentos (células) tienen un número variable de núcleos y son simples. Presentan un poro en el centro por el cual circula el contenido citoplasmático y los núcleos. En las hifas en crecimiento, a cierta distancia del poro, se ubican los corpúsculos de Woronin, que son estructuras proteicas, globosas o hexagonales rodeadas por una membrana. Con microscopía electrónica de transmisión se observan como zonas redondeadas densas a los electrones con un tamaño aproximado de 150 a 500 nanómetros. Cuando las hifas son senescentes o en caso de daño, estos corpúsculos taponan el poro, cerrando el flujo de citoplasma y separando zonas no viables o dañadas. Los cuerpos de Woronin han sido estudiados en N. crassa y se ha determinado que están compuestos por una zona central sólida de proteína Hex1 la cual lleva una señal blanco del peroxisoma, sugiriendo que son estructuras peroxisomales especializadas (Wendland & Walther, 2006; Webster & Weber, 2007). La pared de las hifas presenta quitina y glucano como los dos polisacáridos más importantes. En este grupo ocurre anastomosis de las hifas y esto resulta en el intercambio de núcleos, presentándose entonces el fenómeno de heterocariosis. La imposibilidad de establecer un heterocarión por medio de la anastomosis entre dos hogos de la misma especie es un fenómeno conocido como incompatibilidad heterocariótica o incompatibilidad vegetativa (Burnett, 2003; Webster & Weber, 2007). Algunos Ascomycota filamentosos forman estructuras especiales en el micelio como apresorios, haustorios e hifopodios (fig. 10.2). Estos últimos pueden ser capitados o mucronados. Otros forman trampas como anillos constrictores o mallas para atrapar nematodos (Alexopoulos et al., 1996). La pared de las levaduras de este grupo presenta principalmente manano y glucano, y un porcentaje muy pequeño de quitina que está presente únicamente en el septo primario de las levaduras que geman; algunas levaduras pueden presentar galactosa. El septo primario separa a la célula madre de la hija durante la reproducción asexual y a diferencia de los Ascomycota filamentosos, cada célula de levadura contiene un sólo núcleo (Alexopoulos et al., 1996; Roeijmans et al., 1999). REPRODUCCIÓN SEXUAL En la reproducción sexual de numerosos hongos de este grupo se presentan órganos sexuales denominados ascogonio y anteridio. La plasmogamia puede ocurrir mediante diferentes formas: contacto gametangial, copulación gametangial, espermatización o somatogamia. Antes de la formación de la espora de origen sexual los Ascomycota filamentosos presentan el estado dicarión, aunque éste nunca tiene una duración tan larga como en el filo Basidiomycota (v. capítulo 5) (Webster & Weber, 2007; Alexopoulos et al., 1996). La compatibilidad sexual es unifactorial o bipolar y está regulada genéticamente por un sólo locus. La mayoría de los Ascomycota son heterotálicos con un gen y dos FILO ASCOMYCOTA 167 Fig. 10.3. “Cambio de casete” de Saccharomyces cerevisiae Traducido y modificado de Herskowitz (1988) idiomorfos; por lo tanto, hay incompatibilidad homogénica y sólo ocurre la reproducción sexual al encontrarse los dos talos con los idiomorfos compatibles. En este grupo también puede presentarse incompatibilidad heterogénica somática o vegetativa y ésta depende de varios genes (Alexopoulos et al., 1996; Burnett, 2003). Algunos hongos pertenecientes a este grupo pueden realizar lo que se ha denominado “cambio de casete” (fig. 10.3) o rearreglo programado del locus de tipo de apareamiento, evento estudiado en Saccharomyces cerevisiae Meyen ex Hansen (Herskowitz, 1988). Los ascos se producen en diferentes tipos de cuerpos fructíferos (cleistotecio, gimnotecio, peritecio, apotecio, ascostroma y casmotecio) y estos cuerpos están formados por diferentes tejidos de plecténquima (seudoparénquima o prosénquima). Los ascos que no se producen en cuerpos fructíferos se denominan ascos desnudos, como ocurre en las levaduras y en algunos Ascomycota filamentosos (v. capítulo 5) (Kendrick, 2000; McGinnis, 1980; Kirk et al., 2001; Deacon, 2006). En las especies que presentan peritecios se han encontrado cuatro formas de desarrollo denominadas centro. El centro es la totalidad de las estructuras encerradas en las paredes del ascocarpo incluyendo los ascos y las estructuras estériles y así se habla de centro tipo diaporthe, tipo xylaria, tipo sordaria y tipo nectria (fig. 10.4) (Alexopoulos et al., 1996; Moore-Landecker, 1996; Kirk et al., 2001). Estas estructuras han sido empleadas para la descripción de nuevas especies de hongos fósiles (Taylor et al., 2005) y para su clasificación. Sin embargo, recientemente se ha demostrado que estos caracteres presentan un alto grado de homoplasia por lo cual no se emplean en estudios filogenéticos (Schmitt et al., 2005). Fig. 10.4. Tipos de centro: A) Centro tipo diaporte, B) Centro tipo xilaria, C) Centro tipo sordaria, D) Centro tipo nectria Esquema: Natalia Vargas Desarrollo del asco y las ascosporas Las ascosporas o meiosporas se producen en el asco por clivaje de su contenido. El asco en formación posee un sistema de doble membrana continua con el retículo endoplásmico, que se extiende envolviendo el núcleo diploide 2n formado por la cariogamia de dos núcleos compatibles (n + n). A continuación ocurre meiosis y una mitosis adicional dando como resultado ocho nucleos. Cada núcleo y una porción de citoplasma serán rodea- 168 BIOLOGÍA DE HONGOS Fig. 10.5. Forma como se liberan las ascosporas. A) y B) Opérculo, C) Hendidura y D) Poro Esquema: Natalia Vargas La morfología de las ascosporas es muy variable, pueden ser de diferentes tamaños y formas (alargadas, delgadas, globosas). También pueden tener pigmentos de color marrón (dematiáceas) o ser incoloras (hialinas). Su superficie puede ser lisa, rugosa, con surcos u ornamentada. Existen ascosporas unicelulares o de varias células y éstas pueden ser septadas transversalmente (fragmoascosporas) o poseer septos transversales y longitudinales (dictioascosporas) (fig. 10.6) (Alexopoulos et al., 1996; Kendrick, 2000). REPRODUCCIÓN ASEXUAL La reproducción asexual de los Ascomycota filamentosos se realiza por medio de conidios formados en los conidióforos que nacen directamente del micelio o dentro de cuerpos fructíferos o conidiomas. En las levaduras de este grupo la reproducción asexual se lleva a cabo por gemación o por fisión. En este capítulo se describirán las fases sexuales de algunos Ascomycota incluyendo los anamorfos Aspergillus, Penicillium y los relacionados con micología médica. Otros anamorfos son tratados en el capítulo 9. Fig. 10.6. Formas de algunas ascosporas presentes en levaduras y hongos filamentosos Esquema: Natalia Vargas dos por una doble membrana, una vez que esto ocurre se forma la pared primaria de la ascospora y luego las otras capas de la pared. Sin embargo, el número de ascosporas puede variar dependiendo del número de mitosis realizadas después de la meiosis; es así como se pueden encontrar ascos que poseen entre una y más de 1000 ascosporas (Webster & Weber, 2007). Los ascos pueden ser cilíndricos, globosos o en forma de bate (fig. 10.1) y según las características de las paredes pueden ser prototunicados, unitunicados o bitunicados (v. capítulo 5). En los ascos prototunicados la pared del asco es dehiscente en su madurez. En el caso de los unitunicados las dos capas de la pared, exotúnica y endotúnica, están adheridas durante todo el desarrollo, mientras que en los ascos bitunicados la endotúnica se expande hasta dos veces su tamaño original y la exotúnica se rompe. Los ascos uni- y bitunicados liberan las esporas por medio de un opérculo, de una ranura o de un poro (fig. 10.5) (Alexopoulos et al., 1996). CLASIFICACIÓN TAXONÓMICA DE ASCOMYCOTA Tomada de Hibbett et al. (2007), del National Center for Biotechnology Information (NCBI), Myconet (2006) y Lumbsch & Huhndorf (2007). Si se desea conocer todos los géneros ubicados en este filo consultar Lumbsch & Huhndorf (2007) en la página web: http://www.fieldmuseum.org/myconet/pdfs/Myconet_13a.pdf. Los nombres en negrita corresponden a las diferentes categorías taxonómicas hasta orden tratadas en este capítulo (fig. 10.7). Schoch et al. (2009) realizan un análisis molecular basado en seis genes y algunos caracteres morfológicos como el ascocarpo, la dehiscencia de los ascos, y aspectos nutricionales y ecológicos. A nivel taxonómico mantienen las quince clases propuestas por Hibbett et al. (2007). Sin embargo, para los rangos taxonómicos superiores a clase los autores utilizan nombres informales sin FILO ASCOMYCOTA Subfilo Pezizomycotina Clase Arthoniomycetes Clase Dothideomycetes Subclase Dothideomycetidae Orden Capnodiales Orden Dothideales Orden Myriangiales Subclase Pleosporomycetidae Orden Pleosporales Ordenes de la clase Dothideomycetes de ubicación incierta Orden Botryosphaeriales Orden Jahnulales Orden Hysterangiales Orden Patellariales Clase Eurotiomycetes Subclase Chaetothyriomycetidae Orden Chaetothyriales Orden Pyrenulales Orden Verrucariales Subclase Eurotiomycetidae Orden Coryneliales Orden Eurotiales Orden Onygenales Subclase Mycocaliciomycetidae Orden Mycocaliciales Clase Laboulbeniomycetes Clase Lecanoromycetes (Hongos Liquenizados) Subclase Acarosporomycetidae Reino Hongos - Subreino Dikarya Filo Ascomycota Orden Arthoniales Orden Laboulbeniales Orden Pyxidiophorales Orden Acarosporales Subclase Ostropomycetidae Orden Agyriales Orden Baeomycetales Orden Ostropales Orden Pertusariales Subclase Lecanoromycetidae Orden Lecanorales Orden Peltigerales Orden Teloschistales Ordenes de la clase Lecanoromycetes de ubicación incierta Orden Candelariales Orden Umbilicariales Clase Leotiomycetes Orden Cyttariales Orden Erysiphales Orden Helotiales Orden Rhytismatales Orden Thelebolales Clase Lichinomycetes (Hongos Liquenizados) Orden Lichinales Clase Orbiliomycetes Orden Orbiliales Clase Pezizomycetes Orden Pezizales Clase Sordariomycetes Subclase Hypocreomycetidae Orden Coronophorales Orden Hypocreales Orden Melanosporales Orden Microascales Subclase Sordariomycetidae Orden Boliniales Orden Chaetosphaeriales Orden Coniochaetales Orden Diaporthales Orden Ophiostomatales Orden Sordariales Subclase Xylariomycetidae Orden Xylariales Ordenes de la clase Sordariomycetes de ubicación incierta Ordenes del subfilo Pezizomycotina de ubicación incierta Subfilo Saccharomycotina Clase Saccharomycetes Subfilo Taphrinomycotina Clase Neolectomycetes Orden Lulworthiales Orden Meloliales Orden Phyllacorales Orden Trichosphaeriales Orden Lahmiales Orden Medeolariales Orden Tibilidiales Orden Saccharomycetales Orden Neolectales Clase Pneumocystidomycetes Orden Pneumocystidales Filo Basidiomycota Clase Schizosaccharomycetes Orden Schizosaccharomycetales (Capítulo XI) Clase Taphrinomycetes Orden Taphrinales Fig. 10.7. Clasificación taxonómica del filo Ascomycota 169 170 BIOLOGÍA DE HONGOS descripciones, utilizando la terminación –myceta, como lo hacen Ericsson & Winka (1997) para indicar superclases. Según Schoch et al. (2009) en su árbol filogenético, por ejemplo, consideran el nodo Dothideomyceta, que contiene las clases Dothideomycetes y Arthoniomycetes, y que está ubicado dentro de otra “superclase” Leotiomyceta. Asimismo, Sordariomyceta está ubicada dentro de la misma “superclase” y comprende las clases Sordariomycetes, Laboulbeniomycetes y Leotiomycetes. Saccharomyceta comprende los subfilos Saccharomycotina y Pezizomycotina. Este último subfilo lo mantienen al igual que Taphrinomycotina aunque a veces en su análisis lo denominan Taphrinomyceta. Por último, plantean Leotiomyceta que comprende seis clases: Lichinomycetes, Lecanoromycetes, Eurotiomycetes, Leotiomycetes, Sordariomycetes y Laboulbeniomycetes. SUBFILO TAPHRINOMYCOTINA SYN.: ARCHIASCOMYCOTINA Este subfilo comprende patógenos de plantas, biótrofos facultativos, algunas levaduras saprótrofas que hacen fisión y algunos parásitos obligados de animales superiores y del hombre. Son tan diversos en su morfología que es imposible encontrar características únicas y constantes para el grupo y por tanto su ubicación en el subfilo es el resultado de estudios moleculares (Hibbett et al., 2007; Webster & Weber, 2007), aunque Eriksson (2006) considera que posiblemente es un grupo parafilético y, por lo tanto, en el futuro sufrirá cambios. Según Kirk et al. (2008) en este subfilo se ubican las clases Pneumocystidomycetes, Schizosaccharomycetes y Taphrinomycetes. Clase Pneumocystidomycetes Orden Pneumocystidales Familia Pneumocystidaceae Son organismos que se dividen por fisión, algunas veces volviéndose de paredes gruesas, ovoides, que viven como células parecidas a quistes en los pulmones de animales superiores y el hombre. Estos quistes pueden ser a h b g c d f e Fig. 10.8. Ciclo de vida de Pneumocystis jirovecii. a) forma trófica (n); b) copulación; c) forma trófica (2n); d) forma trófica comenzando la meiosis; e) meiosis; f) mitosis adicional; g) formación de las ascosporas (n); h) ruptura del asco y liberación de las ascosporas Esquema: Natalia Vargas transformados en ascos con 4-8 ascosporas (fig. 10.8). Carecen de micelio, presentan células vegetativas de pared delgada de forma irregular, uninucleadas con extensiones de forma tubular que pueden entrar mediante invaginaciones a las células del pulmón. Pueden producir neumonía en individuos inmunocomprometidos (Hibbett et al., 2007; Eriksson & Winka, 1997; Webster & Weber, 2007; Cannon & Kirk, 2007). En esta clase sólo hay un orden con una sola familia y un género. Estos organismos fueron descritos por primera vez por Carlos Chagas en 1909 quien los consideró como uno de los estadios del ciclo de vida de Trypanosoma cruzi. Posteriormente, en Francia, en 1912, Delanoë & Delanoë los describieron en ratas igualmente como protozoarios. Fueron considerados como este tipo de organismos hasta 1988 cuando Edman y colaboradores, por estudios de DNA ribosomal encuentran que están más relacionados con los hongos. Hoy en día se acepta que pertenecen al reino Hongos (Hibbett et al., 2007; Ericsson & Winka, 1997; Taylor et al., 1994; González, 2007a). Actualmente se sabe que el género Pneumocystis P. Delanoë & Delanoë es parásito de numerosos mamíferos, ratas, ratones, caballos, cerdos, conejos (Pneumocystis carinii P. Delanoë & Delanoë) y el hombre (Pneumocystis jirovecii Frenkel), teniendo una amplia distribución mundial. Estos organismos no han podido ser cultivados y FILO ASCOMYCOTA 171 su diagnóstico se realiza mediante frotis coloreados con tinciones como plata metenamina o azul de toluidina-0, que tiñen la pared de los quistes en muestras clínicas. Como patógeno humano, Pneumocystis jirovecii, produce neumonía en pacientes inmunosuprimidos lo cual se puso de manifiesto con la pandemia del sida. Este hongo se une a las células epiteliales de los alvéolos pulmonares y eventualmente puede diseminarse a otros órganos (González, 2007a). Clase Schizosaccharomycetes Orden Schizosaccharomycetales Familia Schizosaccharomycetaceae En esta clase únicamente existe un orden y una familia con un sólo género y tres especies reconocidas (Webster & Weber, 2007). Éstas presentan células vegetativas cilíndricas. Proliferación tálica por fisión. Los ascos son de forma irregular y pueden presentar 4-8 ascosporas según la especie (Cannon & Kirk, 2007). En el género Schizosaccharomyces Linder están las levaduras que se reproducen asexualmente por fisión, generando dos células más o menos del mismo tamaño. Pueden ser aisladas a partir de suelo y agua, y con mayor frecuencia de sitios con poca disponibilidad de agua, exudados de plantas, frutas y sus productos derivados con altas concentraciones de azúcar. En los organismos de este grupo, el manano de su pared celular presenta unidades de galactosa simples unidas al esqueleto de manosa y no presentan quitina; adicionalmente, contienen α-glucano (Kreger-van Rij, 1984; Miller & Phaff, 1999). Algunas de las especies de este grupo son organismos de experimentación como Schizosaccharomyces pombe Lindner, utilizado como modelo en estudios de genética y biología molecular (Oliva et al., 2005), su genoma fue secuenciado completamente en el 2002. Otra especie, S. octosporus (fig. 10.9) Beijerinck, caracterizada por presentar ascos con ocho ascosporas y que fue aislado por primera vez en 1897 de higos secos, se utiliza frecuentemente en el laboratorio para mostrar ascos desnudos. En el ciclo de vida de este organismo la fase haploide es muy larga, sólo hay una pequeña fase diploide cuando se forma el cigoto dentro del asco (fig. 10.10). El cigoto inmediatamente hace meiosis generando las ascosporas haploides (Ericsson & Winka 1997; Barnett et al., 2000; Webster & Weber, 2007; Hibbett et al., 2007). Fig. 10.9. Ascos desnudos de Schizosaccharomyces octosporus Fotografía: LAMFU Fig. 10.10. Ciclo de vida de Schizosaccharomyces octosporus. a) y c) células vegetativas (n); b) reproducción asexual por fisión; d) plasmogamia; e) cariogamia; f) meiosis; g) mitosis adicional; h) asco con ocho ascosporas; i) ascosporas (n) que van a convertirse en células vegetativas Esquema: Marleny Vargas Clase Taphrinomycetes La clase la conforman diversos hongos parásitos biótrofos facultativos de plantas con flores que causan una gran variedad de lesiones (Hibbett et al., 2007; Webster & Weber, 2007). De acuerdo con Kirk et al. (2008) esta clase comprende el orden Taphrinales. 202 BIOLOGÍA DE HONGOS Familia Helotiaceae Whang et al. (2006) consideran que esta familia es polifilética pues en sus estudios las diferentes especies aparecen ubicadas en distintos clados. Esta familia se caracteriza por carecer de estroma y el ascocarpo es un apotecio de tamaño pequeño a mediano, muchas veces de colores brillantes. El excípulo está usualmente compuesto de hifas paralelas y entrelazadas con pocos septos, algunas veces es gelatinizado pero no en la capa externa; generalmente es glabro o pulverulento, con pocas proyecciones filiformes. Paráfisis presentes entre los ascos. Ascos cilíndricos con el ápice poco engrosado, amiloide o inamiloide, de pared delgada. Las ascosporas son hialinas, elipsoidales, elongadas, con septos o sin ellos. En general, son saprótrofos y se encuentran en madera y algunas especies son fungícolas (Kirk et al., 2001). Los anamorfos son muy variados y se conocen para muy pocos taxa (Cannon & Kirk, 2007). Según Lumbsch & Huhndorf (2007), la familia comprende noventa géneros de los cuales sólo describiremos el género Chlorociboria cuya distribución es mundial y se encuentra con frecuencia en los bosques de Colombia. Género Chlorociboria Server: Ramamurthi, Korf & Batra. Este género se caracteriza por teñir los sustratos donde crecen (troncos caidos en descomposición) de color azul-verde. Los apotecios emergen a través de la corteza (fig. 10.49). Los miembros del género no presentan estroma y sus apotecios que emergen a través de la corteza son solitarios o cespitosos, de tamaño mediano con apariencia glabra o velutinosa. El cuerpo fructífero es de color verde-azul cuando jóvenes y más oscuros al envejecer, pero al secarse se tornan negros. El estípite puede ser corto o largo y la base de éste es más oscura que el píleo. El excípulo medular tiene una textura entrelazada orientada más o menos de forma paralela a la superficie del píleo. El excípulo ectal es de textura prismática y entrelazada, orientado con un ángulo amplio con respecto a la superficie del píleo, y sus células son hialinas de pared gruesa y gelatinosa. Las células de la capa más externa a menudo tienen costras de color verde oscuro y las células terminales pueden estar libres y ser filamentosas, siendo sus paredes lisas o rugosas. Las paráfisis del himenio tienen la misma longitud de los ascos. Los ascos son cilíndricos, contienen ocho esporas y presentan un engrosamiento apical y un poro amiloide. Las ascosporas son de forma variable, con septos o sin ellos, a veces Fig. 10.49. Apotecios de Chlorociboria aeruginascens (Nyl.) kanouse emer- giendo de la corteza de una rama muerta Fotografías: TEHO (arriba); LAMFU (abajo) rodeadas por una cubierta gelatinosa y algunas veces geman y producen blastoconidios dentro del asco. Las especies del género son saprótrofas y crecen en troncos y ramas muertas. Chlorociboria aeruginascens (Nyl.) Kanouse es un buen ejemplo. Dothiorina Höhn. se ha registrado como anamorfo del género (Hanlin, 1998; Johnston & Park, 2005). Clase Pezizomycetes Orden Pezizales El grupo de hongos pertenecientes a esta clase y orden se separó en forma temprana del subfilo Pezizomycotina. El orden se caracteriza porque sus miembros presentan FILO ASCOMYCOTA ascos operculados que se consideran como un carácter derivado y compartido, aunque en algunos taxa se ha perdido su funcionalidad. Este opérculo puede ser terminal o excéntrico y a veces en lugar de éste, el asco libera las ascosporas por una ranura. Los cuerpos fructíferos que son generalmente de mayor tamaño, comparados con otros ascomycetes, son apotecios o en algunos taxa una estructura cerrada de varias formas, derivadas del apotecio. Los ascos generalmente son cilíndricos a ovoides y presentan paráfisis entre ellos. Las ascosporas generalmente son descargadas con fuerza. Según Hansen & Pfister (2006), dentro de este grupo se reconocen tres linajes: el linaje A en el cual están las familias Ascobolaceae y Pezizaceae; el linaje B en el que se encuentran las familias Discinaceae, Morchellaceae, Helvellaceae y Tuberaceae; y el linaje C que comprende las familias Ascodesmidaceae, Glaziellaceae, Pyronemataceae, Sarcoscyphaceae y Sarcosomataceae. Asimismo, las familias Rhizinaceae y Caloscyphaceae presentan linajes independientes. De las quince familias de este orden (Lumbusch & Huhndorf, 2007) trataremos las familias Ascobolaceae, Caloscyphaceae, Discinaceae, Helvellaceae, Morchellaceae, Pezizaceae, Pyronemataceae, Sarcocyphaceae, Sarcosomataceae y Tuberaceae. Muchos de los hongos pertenecientes a este orden son saprótrofos y crecen en sustratos lignocelulósicos y en estiércol, otros son micorrízicos, y algunos géneros son hipogeos y sus ascosporas son diseminadas por animales micofagos. Familia Ascobolaceae Los cuerpos fructíferos de los hongos de esta familia son apotecios, generalmente de consistencia carnosa, de colores brillantes y sin setas. El himenio se caracteriza por tener una capa mucilaginosa y amiloide extraascal. Los ascos pueden presentar paredes inamiloides o levemente amiloides, anchos, operculados, sobresaliendo del himenio cuando maduro. Las ascosporas uninucleadas y amiloides al principio son hialinas pero en la madurez se pueden tornar púrpura o a veces marrón, su pared es gruesa, ornamentada y no presentan gútulas. La mayoría son hongos coprófilos (Korf, 1972; Hansen & Pfister 2006). Comprende, según Kirk et al. (2008), seis géneros de los cuales nombraremos a Ascobolus y Saccobolus. Género Ascobolus Pers. Los ascocarpos de las especies del género son apotecios sésiles (fig. 10.50) aunque algunas veces pueden tener un estípite corto, ser superficiales o estar inmersos en 203 Fig. 10.50. Apotecio de Ascobolus sp. vista al microscopio Fotografía: LAMFU el sustrato. El diámetro puede ser hasta de 30 mm y su forma puede ser subglobosa, piriforme, obcónica, cupulada o en forma de bandeja. El disco himenial tiene tonos amarillo, naranja, rojizo, verde, verde oliva, gris o negro. La superficie externa del apotecio puede tener los mismos colores del disco himenial y puede presentar pústulas y pelos aseptados, hialinos y setosos que nacen de las células superficiales del excípulo externo; su apariencia, puede ser lisa, furfurácea, vellosa o pulverulenta. Las paráfisis son delgadas, cilíndricas, embebidas en una sustancia mucosa. Los ascos, pocos por apotecio, son unitunicados, operculados y amiloides, claviformes o cilíndricos, con un ápice redondeado o en forma de domo y sobresaliendo de la superficie del himenio cuando están maduros. Las ascosporas, generalmente ocho por asco, son unicelulares, de forma subglobosa a elíptica, de pared gruesa, algunas veces con una cubierta gelatinosa, y ornamentadas con pigmentos que se depositan externamente. Las paredes pueden ser lisas o rugosas y aunque en el asco no están en una sola hilera, son liberadas una a una. Las ascosporas son uninucleadas y poseen pigmento violeta en la epispora. El excípulo está compuesto por células globosas de paredes delgadas y a menudo entremezcladas con hifas. Las especies de este género son coprófilas, aunque A. carbonarius Karst. es fenicoide. Ascobulos furfuraceus Pers. es un buen ejemplo de género (Korf, 1972; Hanlin, 1992; Hansen & Pfister, 2006). Género Saccobolus Boud. Este género presenta apotecios de diferentes colores, con un diámetro de 1 a 2 mm, y se diferencia del género anterior porque las ascoporas son liberadas juntas como 204 BIOLOGÍA DE HONGOS un proyectil. El apotecio es sésil, de forma subglobosa a hemisférica, convexo a turbinado, cupulado pero poco profundo y unido por su parte central al sustrato. La textura es gelatinosa y el diámetro del himenóforo va desde 1 mm hasta 5 mm; el color del himenóforo puede ser blanco, rojo, naranja, amarillo, crema, marrón, verde y verde olivo. La superficie externa del apotecio es del mismo color del himenóforo, no presentan pústulas ni pelos. Los ascos presentan opérculo y son levemente amiloides. En el ascocarpo se forman numerosos ascos. El asco maduro al momento de descargar las esporas sobresale del himenóforo y todos los ascos no maduran al mismo tiempo, paráfisis no ramificadas entre los ascos y que no se anastomosan. Las ascosporas pueden tener una pared espinosa, verrucosa o estriada en forma longitudinal, y su color es púrpura antes de ser descargadas y se tornan marrón después de ser liberadas. La longitud de las ascosporas es de 8 a más de 25 μm. No presentan gútulas y su forma es ovoide, elipsoide, fusoide a naviculada, aplanada en uno de los lados y son liberadas en grupo. Saccobolus kerverni (Crouan) Bound., una especie de amplia distribución es un buen ejemplo del género y ha sido registrada para Trinidad, Venezuela y Panamá (Dennis, 1970). Las especies de este género son coprófilas (Korf, 1972; Hansen & Pfister, 2006). Familia Caloscyphaceae Harmaja (2002) creó la familia Caloscyphaceae para el género Caloscypha Boudier. Aunque Cannon & Kirk (2007) no la aceptan En este libro seguiremos a Lumbsch & Huhndorf (2007) que la presentan como una familia monogenérica. Género Caloscypha Boudier Este género presenta apotecios con un pigmento carotenoide, de color naranja amarillo brillante y tienen la característica de volverse verdes o azulosos con la edad o cuando son manipulados. Debido a las características citológicas de las esporas y a la presencia de los pigmentos carotenoides algunos sugieren que esta especie pertenece al linaje C de Hansen & Pfister (2006). El apotecio es estipitado en forma cupulada a discoide puede o no ser sésil y está unido al sustrato por la parte central. La textura es carnosa y el diámetro varía de 5 mm a 5 cm. El himenóforo es de color rojo, naranja, amarillo, lila, púrpura o azul. La superficie externa presenta los mismos colores que el himenóforo y no presenta pústulas, sino pelos lisos, hialinos, similares a hifas y de pared delgada. Los ascos son operculados, inamiloides con numerosos ascos en cada ascocarpo. Los ascos que presentan ocho ascosporas y tienen ápices marcadamente ramificados, se encuentran en diferentes estados de desarrollo en un mismo apotecio y entre ellos se encuentran las paráfisis. Las ascosporas son de paredes lisas, con una longitud menor de 8 μm, no presentan gútulas y su forma es esférica. El sustrato puede ser suelo y hojarasca, el apotecio puede estar parcialmente inmerso en el suelo. El anamorfo de esta especie es Geniculodendron pyriforme Salt., patógeno de abetos (Korf, 1972; Hansen & Pfister, 2006). Familia Discinaceae El ascocarpo es variable, puede ser epigeo o hipogeo. En los epigeos presentan formas cupuladas a estipitadas, la superficie del himenóforo color marrón y algunas veces con pliegues, cuando hay estípite presentan colores pálidos, presentan paráfisis ramificadas; cuando es hipogeo presenta formas irregulares. El himenio es persistente, formado por ascos y paráfisis. Los ascos son inamiloides, en forma sacciforme, dehiscentes en los taxa que tienen apotecio y no dehiscentes en los taxa que tienen pticotecio, presentan ochos ascosporas. Las paredes de los ascos son lisas y sin apículo u ornamentadas y con apículo. En los géneros con apotecios las ascosporas presentan una o dos gútulas en la madurez. En los taxa con pticotecio (ascocarpo parcialmente hipogeo, cerrado o cupulado y convoluto) las gútulas son visibles en las ascosporas jóvenes pero no en las maduras y la epispora puede estar ornamentada con espinas. Estas ascosporas son tetranucleadas usualmente con apéndices apicales gelatinosos. En los apotecios el excípulo puede ser o no ligeramente estratificado, la textura es intrincada o en algunos casos presenta una textura angular no muy bien definida. El excípulo (peridio) en las formas con pticotecio es típicamente estratificado; el excípulo ectal es de textura angular y el excípulo medular de textura intrincada. Algunos de los géneros de esta familia son Gyromitra y Hydnotrya (fig. 10.51) (O’Donnell et al., 1997; Pfister & Kimbrough, 2001). Género Gyromitra Fries Este género se caracteriza por tener apotecios grandes (fig. 10.52) y carnosos usualmente lobulados, enrollados, cerebriformes y estipitados y raramente como una silla de montar, lo que hace difícil distinguirlo del género Helvella. El himenóforo tiene de 2 a más de 5 cm de diámetro, usualmente de color blanco, crema o marrón. Los ascos, que van madurando poco a poco en el apotecio y son FILO ASCOMYCOTA 205 Fig. 10.51. Hydnotrya tulasnei (Berk.) Berk. & Broome. Fotografía: TEHO numerosos en cada cuerpo fructífero, tienen ocho esporas, opérculo y son inamiloides. Las paráfisis tienen ápices ramificados. Las ascosporas son apiculadas de forma ovoide a elipsoide, de paredes lisas y hialinas, de tamaño de 8 a 25 μm, y presentan una o dos gútulas. Gyromitra esculenta (Pers.) Fr. tiene el píleo globoso, subgloboso y cerebriforme, de color marrón oscuro o rojizo. Esta especie puede ser tóxica porque contiene gyromitrina, que es una toxina cancerígena soluble en agua y Gyromitra infula (Schaeff.) Quél. ha sido colectada en suelo en bosques altoandinos venezolanos. Los cuerpos fructíferos del género crecen sobre troncos, ramas, suelo u hojarasca (Dennis, 1970; Korf, 1972; Webster & Weber, 2007). Fig. 10.52. Gyromitra californica (W. Phillips) Raitv Fotografías: Roy E. Halling Familia Helvellaceae La familia se caracteriza por poseer ascocarpos sésiles, subsésiles y estipitados que en su mayoría son apotecios versiformes (cupulados, silla de montar, corrugados, etcétera) de color gris o marrón de diferentes tonalidades; algunas veces presentan ascocarpos cleistoteciodes (pticotecios, esterotecios). En los taxa con apotecios el himenio posee ascos y paráfisis y los ascos son inamiloides, cilíndricos a claviformes, dehiscentes y poseen ocho ascosporas cuando maduros. Las ascosporas, gutuladas en la madurez, son tetranucleadas, lisas a ligeramente verrucosas, a veces de pared irregularmente gruesa, hialinas o marrón. El excípulo o peridio está estratificado en excípulo medular de textura intrincada y excípulo ectal de textura angular. Los taxa cleistoteciales presentan himenóforo sólido, enrollado o con cámaras de tejido fértil separado por células indiferenciadas. Los ascos son globosos, sacciformes e indehiscentes. Helvella Linneus es el género tipo de la familia (O’Donell et al., 1997) para la cual no se conocen anamorfos (Cannon y Kirk, 2007). La familia comprende géneros epigeos e hipogeos ampliamente distribuidos, en su mayoría ectomicorrízicos, que forman apotecios como Helvella, Wynnella y Underwodia; géneros que forman ptitotecios como Barssia y Balsamia y algunas especies de Balsamia que forman esterotecios (O´Donell et al., 1997). El género Gyromitra, que por su parecido morfológico con Helvella estaba en esta familia, se ha ubicado en la familia Discinaceae según estudios moleculares (O’Donell et al., 1997; Cannon y Kirk, 2007; Kirk et al, 2008). Solo trataremos el género Helvella. Género Helvella Linnaeus Este género comprende los hongos denominados “silla de montar” (fig. 10.53). El cuerpo fructífero presenta estípite y píleo laminar con forma de silla de montar, aunque a veces puede ser cerebriforme o subgloboso. El ascocarpo puede ser solitario o gregario y de un tamaño hasta de 10 cm. La superficie himenial varía en color, pudiendo ser marrón, gris, negra o a veces de color crema o blanco. El estípite es de forma variable, cilíndrica, comprimida, acanalada y del mismo color que el píleo. El excípulo ectal de textura angular y el excípulo medular de textura 206 BIOLOGÍA DE HONGOS Fig. 10.53. Helvella lacunosa Fr. Fotografías: TEHO Fig. 10.54. Morchella sp. Fotografías: LAMFU intrincada. Presenta paráfisis delgadas con ápices claviformes. Los ascos son unitunicados, operculados, cilíndricos e inamiloides y contienen ocho esporas. Las ascosporas que poseen cuatro núcleos son hialinas, unicelulares, gutuladas, elipsoides, oblongas o fusiformes y de pared lisa a verrucosa o verrucosa-rugosa. Este hongo se encuentra en el suelo y ocasionalmente en madera en descomposición (Hanlin, 1992; O´Donnell et al.,1997). Helvella crispa (Scop.) Fr. es nuestro ejemplo. Familia Morchellaceae Esta familia presenta ascocarpos que nacen de estructuras subterráneas similares a esclerocios. Se caracteriza por presentar apotecios grandes sésiles o estipitados con un píleo campanulado semejante a una esponja y de color marrón claro u oscuro que, carecen de pigmentos carotenoides. Los ascos son cilíndricos, persistentes, inamilodes. Las ascosporas son elipsoidales, hialinas, capitadas, multinucleadas y a veces con un contenido amarillento (Korf, 1972). Según Lumbsch y Huhndorf (2007), esta familia comprende cinco géneros dos de los cuales necesitan de un mayor número de estudios para su ubicación definitiva. En este texto trataremos los géneros Morchella Hill. y Verpa Sw. (Hansen & Pfister, 2006). Los anamorfos son hifomycetos con conidióforos que emergen de hifas ornamentadas, oscuras y setosas, las células conidiógenas son cilíndricas con proliferación simpodial y con pequeños lentículos, los conidios son pequeños, hialinos y aseptados; los anamorfos pertenecen al género Costantinella Matr. Género Morchella Dill. : Pers. En este género los apotecios son erectos y estipitados; el píleo, que tiene un tamaño hasta de 15 cm, tiene apariencia FILO ASCOMYCOTA 207 de esponja o de colmenilla y su forma es subglobosa, ovoide o cónica, con puentes estériles que se anastomosan y separan las depresiones en las cuales se encuentra la superficie himenial (fig. 10.54) de color amarillo a marrón y con frecuencia los puentes son de color más pálido. El estípite es hueco, frágil, subcilíndrico a bulboso en la base; la superficie que ocasionalmente presenta surcos, es de color amarillento a crema-grisáceo. Las paráfisis presentan septos y a veces pueden ser ramificadas con ápices claviformes. Los ascos con ocho esporas, son unitunicados, inamiloides, operculados, subcilíndricos y más estrechos en la base. Las ascosporas son hialinas, de una sola célula, ampliamente elipsoides a oblongas-elipsoides, de paredes lisas y con varios núcleos. Los cuerpos fructíferos de este género son muy apreciados por ser comestibles y su precio es muy alto. Los miembros de este género pueden ser rudelares saprótrofos por un tiempo no muy largo (unos pocos años) o pueden hacer asociaciones micorrízicas con las raíces de algunos árboles y fructificar por largos períodos de tiempo (Hanlin, 1992; Webster & Weber, 2007). El género Morchella esculenta (L.) Pers. será nuestro ejemplo. Género Verpa Swartz. En este género el píleo de textura carnosa, es campanulado a cónico, de color marrón y su tamaño es relativamente pequeño, lo que lo hace ver desproporcionado con respecto al estípite (fig. 10.55). Los estípites son largos, gruesos, a veces aplanados y de color blanco. El píleo está unido al estípite por su parte central y el margen es libre. El himenóforo se encuentra en la superficie externa del píleo, puede ser liso u horizontalmente surcado y es concoloro con la superficie del píleo. Los ascos presentan opérculo, son inamiloides y numerosos en el apotecio, entre ellos hay paráfisis y no maduran al mismo tiempo. Las ascosporas de 12 a más de 25 μm son hialinas, de paredes lisas, no presentan gútulas, su forma es ovoide a elipsoide y uno de los lados usualmente es más aplanado. Es un hongo epigeo que crece sobre el sustrato, suelo y hojarasca. Como especies representativas tenemos a Verpa conica (O.F. Müll.) Sw. y Verpa bohemica (Krombh.) J. Schröt. (Korf, 1972; Alexopoulos et al., 1996). Familia Pezizaceae Es una familia monofilética que según los tres linajes de Hansem & Pfister (2006) pertenece al linaje A. Los ascocarpos son de formas variadas, algunos son epigeos, sésiles o estipitados, cupulados, discoides, turbinados o pulvinados. También hay taxa semihipogeos a hipogeos Fig. 10.55. Verpa conica. (O.F. Müll.) Sw. Fotografía: Roy E. Halling que son cerrados y doblados formando un ascostroma sólido, esparasoide. Los ascogonios pueden ser enrollados. Si presentan cleistotecio el ascocarpo presenta cámaras, puede ser hipogeo o emergente, puede presentar paráfisis las cuales pueden ser hinchadas y pigmentadas en el ápice. El tamaño del ascotroma varía desde pocos milímetros a más de 10 cm de diámetro y usualmente son carnosos, blandos y quebradizos. Ascos cilíndricos, algunas veces globosos en los que presentan cleistotecios, persistentes, operculados, con paredes amiloides o por lo menos en el ápice, presentan un sólo poro. Hay mucha diversidad en este grupo en cuanto a las características anatómicas y bioquímicas, así como los mecanismos de descarga de las ascosporas. Los ascos son amiloides y su forma, color, ornamentación, gutulación, pigmento de las paráfisis y estructura del excípulo varían en los diferentes géneros. Las ascosporas son elipsoides a globosas, uninucleadas, hialinas o marrón pálido, usualmente de pared lisa, delgada y pueden ser ornamentadas, de forma globosa, elipsoide o fusiforme, la mayoría son gutuladas. 208 BIOLOGÍA DE HONGOS Su hábitat natural es muy amplio y ocupa nichos ecológicos diversos, pueden fructificar en estiércol y madera y en todos los tipos de suelo, arenosos, arcillosos, calizos y suelos quemados. Algunos pueden crecer en suelos con pH alto y en algunos casos con bajo contenido de materia orgánica. Los miembros de esta familia se encuentran principalmente en regiones templadas y regiones boreales alpinas, aunque algunos pocos taxa son tropicales. Algunas especies han sido reportadas como micorrízicas pero no han sido bien estudiadas (Hansen et al., 2001). A unos pocos géneros se les conoce anamorfos los cuales son hifomycetos de colores brillantes. Los conidióforos son de proliferación simpodial, los conidios se forman en dentículos sobre los conidióforos. Dentro de los anamorfos se encuentran Chromelosporium Corda y Oedocephalum Preuss. Según Kirk et al. (2008) en la familia Pezizaceae se ubican 31 géneros; describiremos el género Peziza. Género Peziza (L.) Fr. El ascocarpo es generalmente epigeo, rara vez semihipogeo o hipogeo. Puede ser un apotecio discoide, cupulado o raramente, o un pticotecio. Son sésiles o con estípites muy cortos. El apotecio puede ser de color blanco, marrón y violeta entre otros. El excípulo ectal tiene una textura globosa o angular, las células presentan paredes delgadas con hifas más o menos interconectadas o células pequeñas globosas que se elongan a una forma hifoide hacia el exterior. El excípulo medular puede tener una, dos o más capas de textura globosa o angular; las células son grandes con paredes delgadas de hifas laxamente entrelazadas o paralelas. El himenóforo usualmente más pálido que la parte externa, puede ser liso. El himenio puede o no presentar paráfisis, que puede o no tener gránulos pigmentados y estar o no embebidas en una matriz granular. Los ascos son unitunicados, operculados, amiloides sólo en el ápice o a veces sobre toda la superficie. Presentan ocho ascosporas con forma elipsoide o fusiforme y pueden tener una, dos o más gútulas. El color de las esporas es marrón pálido y pueden ser o no ornamentadas. Si son ornamentadas presentan verrugas, surcos, retículos o apículos. Las esporas pueden ser descargadas violentamente y raramente en forma pasiva. Generalmente son saprótrofos, ectomicorrízicos, coprófilos, lignícolas o fenicoides. Se han descrito dos géneros de anamorfos Oedocephalum Preuss y Chromelosporium Corda. Como ejemplo nombraremos a Peziza badiofusca (Boud.) Dennis, entre las numerosas especies de este género (Hansen et al., 2001). Familia Pyronemataceae Según Hansen & Pfister (2006) esta familia pertenece al linaje C de la clase Pezizomycetes. En el análisis filogenético aparece como no monofilética ya que las familias Ascodesmidaceae y Glaziellaceae están incluidas dentro del mismo clado. Es la familia más grande de la clase Pezizomycetes y el orden Pezizales, comprende ochenta géneros (Kirk et al., 2008). Pueden presentar apotecio o cleistoctecio. Los apotecios son de tamaño variable, de pequeños a grandes, pueden ser de formas discoides a cupulados, pocas veces de otra forma y estipitados. Pueden presentar pelos en el apotecio con paráfisis ausentes o presentes. Las ascosporas pueden ser lisas u ornamentadas, con gútula o sin ella, hialinas a marrón, unicelulares e inamiloides. Los cleistotecios son grandes, hipogeos, de pared gruesa, sólidos o con cámaras. Los ascos son cilíndricos, persistentes, operculados, inamiloides con poros complejos, en los taxa que presentan cleistotecios los ascos son globosos; las ascosporas usualmente son hialinas a marrón, con cubierta o sin ella, uninucleadas, con un sólo septo, y pueden presentar gútula o no. Estos hongos se encuentran en varios tipos de suelos, maderas, restos vegetales y estiércol. La mayoría de las especies son saprótrofas, otras especies son parásitas de raíces de briofitas y algunas forman ectomicorrizas. La mayor cantidad de especies de esta familia se encuentran en zonas templadas y en las áreas alpinas boreales. Los anamorfos son hifomycetes (Korf, 1972; Hansen & Pfister, 2006; Cannon & Kirk, 2007). Trataremos el género Anthracobia. Género Anthracobia Boudier Este género presenta apotecios sésiles, discoides a cupulados poco profundos, unidos central o ampliamente al sustrato. El diámetro es pequeño, puede variar de 5 mm a 2 cm. El himenóforo puede ser de color amarillo, naranja, rojizo, crema o marrón, la superficie externa puede ser de color crema a marrón. Presenta paráfisis no ramificadas y mucho más delgadas que los ascos. Los ascos son operculados, inamiloides con ocho esporas y su desarrollo en el apotecio no es sincrónico. Las ascosporas son lisas, hialinas con dos gútulas y su forma es fusiforme a naviculada. La superficie externa del apotecio presenta pústulas y a veces pelos de color marrón, hifoides, de pared delgada o gruesa, sin septos que nacen de las células más periféricas de la superficie externa. Estos pelos se pueden unir o no en fascículos. El cuerpo fructífero puede estar parcialmente inmerso en el suelo en áreas FILO ASCOMYCOTA 209 quemadas, suelos esterilizados con vapor, o sobre estiércol. Mencionamos en este género a Anthracobia muelleri (Berk) Rifai (Korf, 1972). Familia Sarcoscyphaceae Esta familia comprende especies con apotecio de colores brillantes que a menudo contienen pigmentos carotenoides y pelos. Su consistencia puede ser corchosa, correosa y en algunas ocasiones gelatinosa debido a la presencia de una textura intrincada en el excípulo. Excípulo compuesto de células hifales con matriz gelatinosa, hialina o raramente melanizada. Los ascos son cilíndricos a claviformes con pared gruesa, suboperculados e inamiloides. Presentan paráfisis multinucleadas. En el apotecio los ascos de algunos géneros maduran sucesivamente y, en otros, al mismo tiempo. Las ascosporas son multinucleadas, hialinas, presentan un número variable de gútulas, pueden ser lisas, longitudinalmente estriadas o reticuladas, simétricas o asimétricas. Las asimétricas tienen un lado aplanado. La familia comprende trece géneros de los cuales trataremos Cookeina Kuntze y Phillipsia Berk. (Korf, 1972; Hansen & Pfister, 2006; Cannon & Kirk, 2007; Kirk et al., 2008). Género Cookeina Kuntze En este género los apotecios cupulados o discoides tienen estípite de longitud variable, su consistencia es cartilaginosa, correosa, corchosa, y su diámetro de 1 mm a 5 cm según la especie (fig. 10.56). La superficie interna del apotecio (himenóforo) es de color blanco, amarillo, naranja rojo, crema o marrón. La superficie externa es concolora con la interna, aunque a veces en tonos más claros que la superficie interna. La superficie externa del apotecio presenta pelos en fascículos, lisos y de color blanco a marrón. Los ascos son operculados, inamiloides y numerosos en el apotecio, con ochos esporas y no sobresalen del himenio en la madurez, desarrollándose todos al mismo tiempo. Presentan paráfisis setosas con los ápices ramificados y a veces haciendo anastomosis. Las ascosporas presentan una superficie reticulada o longitudinalmente estriada, hialina, inamiloide y no producen reacción de coloración con KOH al 3%. La longitud de estas esporas puede llegar a más de 25 μm y contener numerosas gútulas. Su forma es ovalada, fusoide o naviculada. El sustrato son troncos y ramas en descomposición. Las especies son comunes en las tierras bajas del trópico, y se han registrado para Centroamérica, Sudamérica, el Caribe, África y Asia. En Colombia se encuentra Cookeina speciosa (Fr.) Dennis en los departamentos de Fig. 10.56. Cookeina venezuelae. (Berk. & M.A. Curtis) Le Gal (arriba); Cookei- na tricholoma (Mont.) Kuntze. (centro); Cookeina speciosa, (Fr.) Dennis (abajo) Fotografías: Roy E. Halling (arriba y abajo.); TEHO (centro). Antioquia, Caquetá y Amazonas, y Cookeina tricholoma (Mont.) Kuntze en Caquetá y Amazonas (Korf, 1972; Franco-Molano et al., 2005). Género Phillipsia Berk. En este género el apotecio con forma de cojín es discoide, plano a cupulado unido por la parte central al sustrato; su consistencia es carnosa, cartilaginosa, correosa o corchosa (fig. 10.57). Su diámetro es variable, entre 1 mm hasta 5 cm y el himenóforo puede ser de color rojo, naranja, amarillo, crema, marrón, lila a púrpura o azul. La superficie externa del apotecio es blanca a crema y presenta pelos lisos que forman fascículos. Los ascos son 210 BIOLOGÍA DE HONGOS Fig. 10.57. Phillipsia domingensis Fotografía: TEHO operculados, inamiloides, numerosos con cuatro esporas y no sobresalen del himenio cuando están maduros. Entre los ascos se encuentran paráfisis con los ápices notoriamente ramificados, las cuales se anastomosan. Las ascoporas son estriadas longitudinalmente, hialinas y de 11 a 25 μm de largo, con numerosas gútulas. La forma de las esporas es ovoide, elipsoide, fusoide a naviculada. Su sustrato es la madera en descomposición y el cuerpo se forma sobre éste. Como ejemplo nombraremos a Phillipsia domingensis Berk. que se ha colectado en diferentes zonas tropicales como Centroamérica, el Caribe, Sudamérica, Madagascar, y en Colombia, se ha encontrado en diferentes lugares especialmente en el departamento del Caquetá (Korf, 1972; Franco-Molano et al., 2005). Familia Tuberaceae En esta familia los ascocarpos son pticotecios o esterotecios, globosos y ornamentados. El himenio puede estar presente o ausente; si está presente puede ser persistente y similar a una empalizada o transitorio y que se desorganiza a medida que los ascos se desarrollan; en este caso los ascos quedan embebidos al azar en el tejido del ascocarpo. Si no hay himenio, los ascos están aparentemente diseminados en la gleba desde el principio. Cuando el himenio está presente consiste de ascos y paráfisis o cadenas de células parecidas a las paráfisis pero que no tienen los ápices libres. Los ascos son inamiloides y presentan de una a ochos ascosporas en la madurez las cuales pueden ser variables dentro del ascocarpo, son indehiscentes y la porción esporógena varía de subcilíndrica a claviforme, en forma de bolsa, subesférica o esférica y puede tener o no pedicelo. En algunos taxa hay uncínulo (crozier) y en la base del asco hay dos cicatrices próximas, en otros taxa la base se describe en forma de tenedor pero no presenta uncínulo. Las ascosporas presentan un número variable de núcleos que en muchos casos son cuatro, y las gútulas de algunos taxa se observan antes de que el contenido del asco se oscurezca por las ornamentaciones. Las ascosporas pueden ser hialinas a marrón oscuro, las ornamentaciones pueden ser en forma de papilas, espinas, bacilares o retículo alveoladas, no presentan apículo. El excípulo o peridio es típicamente estratificado, el excípulo ectal varía de textura intrincada a textura angular y el excípulo medular es típicamente de textura intrincada. No se le conocen anamorfos (O’Donnell et al., 1997; Cannon & Kirk, 2007). Esta familia, según Kirk et al. (2008), comprende siete géneros de los cuales sólo trataremos el género Tuber Mich ex Wigg. Género Tuber P. Mich.: A. Wigg El ascocarpo de este género es hipogeo, cerrado, globoso a lobulado o de forma irregular, su consistencia es carnosa o cartilaginosa. El exterior puede ser liso o rugoso, usualmente de color marrón claro u oscuro, el interior del ascostroma (pticotecio o esterotecio) tiene un excípulo medular interno de textura intrincada y un excípulo ectal que es de textura intrincada a angular, con un diámetro de 1 a 8 cm. La gleba está compuesta por unas venas claras y oscuras que forman curvas tortuosas de un tejido paralelo o entrelazado. Los ascos son unitunicados, indehiscentes, inamiloides, piriformes, elipsoides o subglobosos con pedicelo largo o corto, y con una a ocho ascosporas. Las ascosporas son unicelulares amarillas a marrón, de tamaño variable. Su forma es elipsoide o globosa y presenta la superficie reticulada y espinosa. En algunas especies se presentan gútulas y en otras hasta cuatro núcleos. En este género se conocen alrededor de cien especies y son las que se denominan trufas verdaderas. Forman ectomicorrizas con árboles y arbustos de varias especies. Algunas especies de este género producen las trufas comestibles que se caracterizan por su sabor y aroma, y por esto son altamente apreciadas en culinaria y supremamente costosas. Es usual, en el sur de Francia y norte de Italia encontrar trufas de mayor valor comercial, Tuber melanosporum Vittad., o trufa negra del Périgord y T. magnatum Lév. o trufa blanca del Piedmont. El olor y el sabor de los cuerpos fructíferos atraen a numerosos animales micófagos que excavan para encontrarlos y comerlos, por esto se utilizan perros o cerdos para ubicar los cuerpos fructíferos en los bosques de estas regiones de Europa. Las trufas se han cultivado en plantaciones utilizando árboles de las especies apropiadas FILO ASCOMYCOTA de roble (Quercus spp.) o avellano (Corylus avellana) con las que hacen micorrizas, pero a pesar de esto la producción ha decaído durante el siglo XX. Se ha comprobado que dentro de los cuerpos fructíferos sanos de las trufas se pueden encontrar numerosos microorganismos, bacterias, levaduras y recientemente se ha reportado la presencia de algunos hongos filamentosos. Otras especies que podemos nombrar son Tuber rufum Pico y Tuber aestivum (Wulfen) Pers. (Hanlin, 1992; O’Donnell et al., 1997; Pacioni et al., 2007; Webster & Weber, 2007). Familia Sarcosomataceae La familia según Lumbcsh & Hundorf (2007) incluye once géneros de los cuales tres no están completamente soportados. Según Hansen & Pfister (2006) esta familia pertenece al linaje C que es el más numeroso y heterogéneo. Esta familia se caracteriza por presentar apotecios sésiles, correosos, oscuros, con pelos oscuros, debido a pigmentos melanínicos. Los peridios se forman de hifas a menudo en una matriz gelatinosa. Tanto el excípulo externo como el himenóforo carecen de pigmentos carotenoides y su consistencia es correosa y corchosa o a veces ligeramente gelatinosa debido a que el excípulo tiene una textura intrincada. Los ascos son suboperculados, cilíndricos; las paráfisis son uninucleadas y se anastomosan cerca de la base. Las esporas son multinucleadas, lisas, hialinas, con pliegues transversales, a veces rodeadas de una cubierta gelatinosa o verrucosas sin cubierta gelatinosa. La mayoría de las especies de la familia son de zonas frías del hemisferio norte pero unas pocas se encuentran en zonas cálidas de América (Korf, 1972; Medel & Chacon, 2000; Kirk et al.,2001; Cannon & Kirk, 2007). De los once géneros ubicados en esta familia, describiremos el género Plectania. Género Plectania Fuckel Este género presenta apotecio mediano a grande, con pelos de color marrón, de pared gruesa, rugosa y con septos. Su forma es convexa a turbinada o fuertemente cupulada. Puede o no presentar estípite y su hábito de crecimiento es gregario o solitario. El color del apotecio varía de negro-grisáceo a casi negro y se une central o ampliamente al sustrato, a veces la unión llega hasta el margen. La textura del apotecio es cartilaginosa, correosa o corchosa. El diámetro del himenóforo es de 5 mm a 5 cm, de color crema, marrón, gris o negro, y la superficie externa del apotecio puede ser roja, naranja, amarilla, crema, marrón, gris y negra o con gránulos de 211 color anaranjado. El margen es entero, ondulado o crenado. El excípulo medular es de textura intrincada y el excípulo ectal es de textura angular. Los ascos fusoides a naviculares son operculados, con pie, de pared gruesa y numerosos en el apotecio; contienen ocho esporas inamiloides que no maduran al mismo tiempo. Presentan paráfisis ramificadas en el ápice y pueden hacer anastomosis. Las ascosporas son hialinas, de forma elipsoide, subalantoide o globosa. Su pared es lisa, transversalmente estriada en un sólo lado y de un tamaño de 12 a 25 μm de largo, tienen o no gútulas y cuando están presentes son numerosas y pequeñas semejando espuma en el ápice. Crecen sobre el sustrato en forma epigea o parcialmente inmerso, y estos sustratos pueden ser troncos, ramas, suelo y hojarasca. Como especies nombraremos a Plectania rhytidia (Berk.) Nannf. & Korf reportada en Colombia, Jamaica, Puerto Rico y México (Korf, 1972; Medel & Chacón, 2000). Clase Sordariomycetes Esta clase es una de las que comprende mayor número de especies de hongos Ascomycota con más de seiscientos géneros y más de tres mil especies descritas. Los hongos de esta clase constituyen un grupo monofilético que presenta peritecio en forma de botella con ostiolo y algunos presentan cleistotecios; los ascos en su gran mayoría son unitunicados y algunos son prototunicados generalmente con ocho ascosporas. El ascocarpo puede ser solitario superficial y no está asociado a un estroma. También pueden ser gregarios, inmersos o sobre un estroma o tejido del sustrato. En esta clase están ubicados los antiguos “Pyrenomycetes”, que son hongos con peritecio, pero el término no se utiliza en la actualidad ya que los hongos con este tipo de ascocarpo, se ubican en más de una clase en las cuales también se ubican algunos hongos con ascos prototunicados. En esta clase también hay numerosos hongos anamórficos a los cuales no se les conoce fase sexual, pero por estudios filogéneticos quedan ubicados en este taxón. Esta clase comprende tres subclases Hypocreomycetidae, Sordariomycetidae y Xylariomycetidae (Samuels & Blackwell, 2001; Zhang et al., 2006). Los miembros de esta clase se encuentran en varios tipos de ecosistemas terrestres y acuáticos (marinos y de agua dulce); su distribución en estos ecosistemas es universal. Pueden ser patógenos y endófitos de plantas; algunos como Cordyceps s. l. (Fries) Link, están asociados REINO PROTOZOA. GRUPOS “EUMYCETOZOA” Y “CERCOZOA” comportamiento de las demás células. Bajo el control de las células del ápice, el agregado de amebas se elonga y crea una estructura erecta en forma de “dedo”. En Dictyostelium discoideum el seudoplasmodio migra hacia una fuente de luz, de calor y un gradiente de oxígeno; en otros géneros y especies no hay migración, y el seudoplasmodio se diferencia directamente en el cuerpo fructífero (Alexopoulos et al., 1996; Kessin, 2001; Webster & Weber, 2007). En las células del seudoplasmodio migrante comienza el proceso de diferenciación celular. Las células de la parte anterior, que corresponden al 20%, se denominan preestípite y las células posteriores, el 80% restante, corresponden a las preesporas. Las células preestípite son metabólicamente activas y realizan el movimiento que arrastra a las preesporas cuando el seudoplasmodio migra. Antes de ocurrir la diferenciación, ambos tipos de células son genéticamente iguales y haploides, y en ellas se encuentran los genes que regulan la expresión de preespora y preestípite (Álvarez-Curto et al., 2007; Gross, 2009). Cuando la migración cesa, el seudoplasmodio se vuelve globoso y comienza el proceso de transición a la culminación o cuerpo fructífero. Las células preestípite que quedan en la parte superior se elongan, producen celulosa y comienzan a empujar desde el interior de la masa de células hacia abajo. Cada vez más células de preestípite o pie se apilan constituyendo el estípite maduro y esto a su vez hace que las células preesporas comiencen a elevarse hacia la parte superior del estípite recién formado, donde se transformarán en esporas maduras (Alexopoulos et al., 1996; Webster & Weber, 2007). Antes de que las células lleguen a formar las esporas maduras ocurre la formación de la cubierta de la espora. Las vesículas de las células preesporas se fusionan con la membrana plasmática y se produce una exocitosis en respuesta a señales que provienen de células preestípite durante la culminación. La cubierta de estas esporas está constituida por galurano (polímero de galactosa y N-acetilglucosamina) y dos capas de proteínas separadas por una capa de celulosa. La pared protege las esporas de la desecación, del choque osmótico y de daños durante el paso por el tracto digestivo de animales (Kessin, 2001; Webster & Weber, 2007). La germinación de la espora depende de la edad y ocurre después de su dispersión. Las esporas que tengan pocos días de formadas no germinarán si se dispersan en un buffer sin nutrientes. Aquellas esporas que permanecen en el sorocarpo por varias semanas, se autoactivan y cuando son dispersadas, germinan (Alexopoulos et al., 1996; Kessin, 2001). 401 En el ciclo de vida de Dictyostelium discoideum (fig. 16.3) la formación del cuerpo fructífero se lleva a cabo mediante la reproducción asexual, sin embargo, cuando el alimento escasea, este organismo forma macroquistes como mecanismo de reproducción sexual. En la formación de macroquistes, dos amebas compatibles, respecto a su tipo de apareamiento, se fusionan para formar una célula gigante que puede alcanzar 50 μm de diámetro; la pared primaria que rodea el quiste en formación se asemeja a la cubierta mucilaginosa del seudoplasmodio. La célula gigante engolfa amebas cercanas y las encierra dentro de vacuolas llamadas endocitos que, a su vez, son utilizados como alimento por el cigoto del macroquiste. Dentro del macroquiste ocurre meiosis y divisiones mitóticas de los núcleos haploides; el citoplasma se segmenta progresivamente y se forman varias amebas haploides que salen del quiste rompiendo sus paredes, para comenzar nuevamente su fase somática (Erdos et al., 1973; Francis, 1998; Kessin, 2001; Álvarez-Curto et al., 2007). La formación de microquistes ocurre cuando el alimento escasea o cuando existe una presión osmótica alta en el medio y consiste en una ameba que bajo ciertas condiciones, se enquista produciendo una pared rígida de celulosa. La formación del quiste no involucra quimiotaxis, ni multicelularidad y es similar a la que ocurre en otras amebas de vida libre. Este fenómeno se ha observado principalmente en la especie Polysphondylium pallidum Olive, pero en D. discoideum no se conoce (O’Day, 1973; Alexopoulos et al., 1996; Kessin, 2001). Clase Myxomycetes (zool.: Myxogastria) Los organismos ubicados en esta clase son conocidos como los mohos mucilaginosos verdaderos o plasmodiales, su distribución es amplia y se encuentran fácilmente en lugares tales como bosques húmedos, frescos y sombreados pero también en hábitats diferentes como prados, cultivos de flores, troncos, etcétera, e incluso en el desierto y en regiones alpinas en el Ártico y la Antártida. Como mecanismo de dispersión, las esporas son llevadas largas distancias por insectos o en corrientes de aire y polvo (Alexopoulos et al., 1996; Webster & Weber, 2007; Stephenson et al., 2008a). La distribución y diversidad de algunas especies está definida por las características ecológicas del microhábitat, el clima y la vegetación. Dentro de los factores que determinan su ocurrencia son la temperatura y la humedad principalmente. En el desierto se han encontrado especies asociadas a restos de material vegetal y a excre- 402 BIOLOGÍA DE HONGOS Fig. 16.3. Ciclo de vida de Dictyostelium discoideum a) espora, b) espora germinando, c) mixameba, d) célula gigante dicariótica, e) macroquiste, f) agregación, g) seudoplasmodio, h) seudoplasmodio, i) culminación, j) comienzo de la formación del sorocarpo, k) sorocarpo Esquema: Marleny Vargas mentos en los cuales la humedad y los nutrientes que son temporales, favorecen el desarrollo de cuerpos fructíferos. En bosques tropicales la diversidad de mixomycetes está asociada a microhábitats aéreos del bosque, mientras que en zonas templadas parecen estar asociados a los suelos. Los cuerpos fructíferos que se producen en madera en descomposición son de tamaño suficiente para ser detectados a simple vista; caso contrario ocurre en microhábitats como corteza de plantas vivas, hojarasca y excrementos de herbívoros, donde los cuerpos fructíferos son inconspicuos y esporádicos, limitando su detección y, por ende, estudios sobre su diversidad. Estudios en hojarasca aérea, hojas atrapadas en las ramas u hojas muertas unidas a plantas de Heliconia, fueron llevadas a cámara húmeda sobre las cuales se formaron cuerpos fructíferos de mixomycetes antes no detectados. Asimismo, en Costa Rica y Ecuador han observado, con cierta frecuencia, cuerpos fructíferos formados en campo y en cámara húmeda en las inflorescencias de plantas herbáceas de los géneros Calathea y Heliconia (Stephenson, 1989; Schnittler & Stephenson, 2002; Stephenson et al., 2008a). Los registros fósiles que se tienen de algunos mixomycetes son raros por el carácter esporádico y frágil de sus cuerpos fructíferos; sin embargo, existen registros de la especie Stemonitis splendens Rostaf. y de cuerpos fructíferos del género Arcyria Hill ex. F. H. Wigg encontrados en una pieza de ámbar del Báltico del Eoceno que data de unos 50-35 millones de años. También se reporta el fósil de un plasmodio en depósitos de ámbar del período Eoceno-Oligoceno en República Dominicana (Dorfelt et al., 2003; Stephenson et al., 2008a). REINO PROTOZOA. GRUPOS “EUMYCETOZOA” Y “CERCOZOA” 403 Ciclo de vida de un myxomycete Los mixomycetes se caracterizan por presentar dos fases tróficas (fig. 16.4): 1) una ameba o mixameba haploide y uninucleada, o una célula flagelada o nadadora haploide, según las características del microambiente: y 2) una masa protoplasmática multinucleada, diploide, carente de pared celular llamada plasmodio. Las mixamebas y células nadadoras son interconvertibles, por ello, el término usado para referirse a cualquiera de estos dos tipos es célula ameboflagelada (Stephenson & Stempen, 1994; Alexopoulos et al., 1996). Las esporas que se producen en el cuerpo fructífero son dispersadas y cuando las condiciones son favorables germinan para producir una a cuatro células ameboflageladas, uninucleadas y sin pared. En presencia de agua predominan las células nadadoras y en condiciones secas predominan las mixamebas no flageladas. Las células ameboflageladas se alimentan por ingestión de bacterias, levaduras, materia orgánica o, en algunos casos, de esporas fúngicas. Cuando el alimento es abundante las mixamebas se dividen repetidamente por fisión binaria hasta alcanzar una gran población de células; por otro lado, las células nadadoras después de un período de movilidad deben retraer su flagelo y convertirse en mixamebas para dividirse por fisión binaria. Las células nadadoras en respuesta a condiciones ambientales desfavorables pueden retraer el flagelo y enquistarse. Este proceso se realiza por la secreción de una pared de galactosamina, la redistribución de los filamentos de actina y la producción de proteínas asociadas a choque térmico (Stephenson & Stempen, 1994; Alexopoulos et al., 1996; Stephenson et al., 2008a). Cuando hay una masa suficiente de células ameboflageladas puede ocurrir la fusión gamética de dos mixamebas o células nadadoras compatibles para formar el cigoto. La formación de éste involucra la fusión de los protoplasmas de las dos células (plasmogamia) y la fusión de los núcleos (cariogamia). Si las células que dieron origen al cigoto eran flageladas, el cigoto será flagelado y tiempo después retraerá su flagelo cambiando a un cigoto tipo ameboide (Stephenson & Stempen, 1994; Alexopoulos et al. 1996; Stephenson et al., 2008a). El cigoto crece, su núcleo realiza divisiones mitóticas sincrónicas y sucesivas sin citoquinesis, dando lugar a una estructura protoplasmática multinucleada, sin pared celular y movimiento ameboide, denominado plasmodio que en numerosas especies está rodeado de una cubierta gelatinosa de mucílago. Cuando el plasmodio es joven puede unirse con otros plasmodios o cigotos compatibles. Estudios en Didymium squamulosum Fuckel Fig. 16.4. Ciclo de vida de un mixomycete heterotálico, a) espora, b) espo- ra germinando, c) mixamebas, d) células nadadoras, e) y f) plasmogamia, g) cigoto, h) comienzo de formación del plasmodio, i) plasmodio, j) esclerocios, k) comienzo de la formación de esporangios, l) esporangio, m) esporangio maduro Esquema: Marleny Vargas sugieren que esta fusión está controlada por un sistema de dos loci poligénicos con alelos dominantes y recesivos; si los dos loci en dos plasmodios son idénticos ocurre una fusión exitosa, pero si son diferentes para uno o ambos loci, su fusión es temporal y se desencadena una reacción citotóxica (Ulloa, 1991; Alexopoulos et al., 1996; Clark, 2003). El plasmodio se alimenta de bacterias, algas, levaduras, esporas de hongos, protozoos y materia orgánica (fig. 16.5). En condiciones in vitro se puede alimentar de hojuelas de avena. Bajo condiciones no favorables, como sequedad y baja temperatura, pueden someterse a una transformación reversible en estructuras de resistencia llamadas esclerocios, que pueden permanecer en dormancia por períodos largos de tiempo y tienen la capacidad de transformarse en plasmodio, cuando las condiciones vuelvan a ser favorables (Alexopoulos et al., 1996; Stephenson et al., 2008a). 404 BIOLOGÍA DE HONGOS Fig. 16.5. Plasmodios sobre diferentes sustratos Fotografías: LAMFU En la fase reproductiva el plasmodio maduro sufre transformaciones para convertirse en uno o varios cuerpos fructíferos macroscópicos; por lo tanto, en un individuo no coexisten la fase somática y la reproductiva. Algunos de los factores que inducen fructificación son la luz, la temperatura, el pH, el agotamiento de alimento disponible y la humedad. El proceso de fructificación es irreversible y una vez el plasmodio fructifica produciendo el denominado esporocarpo, no continúa engolfando nutrientes y su crecimiento se detiene. El esporocarpo porta uno o varios esporangios dentro de los cuales se diferencian las esporas; en las esporas jóvenes ocurre la meiosis y al madurar germinan produciendo de una a cuatro células ameboflageladas (Alexopoulos et al., 1996; Stephenson et al., 2008a). Tipos de plasmodio De acuerdo con sus características los mixomycetes pueden presentar tres tipos de plasmodios: • • Protoplasmodio: es un plasmodio microscópico, que origina un sólo esporangio en la fase reproductiva. Presenta un protoplasma homogéneo, sin formación de filamentos protoplásmicos (venas), con corrientes que fluyen de manera lenta e irregular. Este tipo de plasmodio es característico de los miembros del orden Echinosteliales y algunos del orden Liceales, aunque también puede ocurrir en otros mixomycetes (Alexopoulos, 1973; Stephenson & Stempen, 1994; Alexopoulos et al., 1996; Ulloa & Hanlin, 2006). Faneroplasmodio: es un plasmodio macroscópico, conspicuo y generalmente de colores brillantes que origina varios esporangios en la fase reproductiva. Presenta un protoplasma reticulado, con corrientes • que fluyen de manera rítmica, reversible y rápida; es granuloso y forma filamentos protoplásmicos. Este plasmodio es típico de miembros del orden Physarales, como Physarum polycephalum Schwein. (Alexopoulos, 1973; Stephenson & Stempen, 1994, Ulloa & Hanlin, 2006). Afanoplasmodio: este plasmodio macroscópico a diferencia del faneroplasmodio es inconspicuo por el carácter fino, no granular y hialino de la red de filamentos protoplásmicos; al fructificar puede formar varios esporangios. Presenta un protoplasma con corrientes que fluyen de manera rápida, rítmica y reversible. Miembros del orden Stemonitales presentan este tipo de plasmodio (Alexopoulos, 1973; Stephenson & Stempen, 1994; Ulloa & Hanlin, 2006). Partes de un cuerpo fructífero en mixomycetes Los miembros del filo Myxomycota presentan producción de esporas endógenas formadas en esporangios con o sin capilicio, a excepción del género Ceratiomyxa J. Schröt. perteneciente a la clase Protosteliomycetes cuyas esporas son exógenas. A continuación describimos las partes principales de los cuerpos fructíferos de mixomycetes (fig. 16.6). El cuerpo fructífero de los mixomycetes endospóricos presenta un peridio delgado y delicado que puede ser dehiscente o persistente y a veces de consistencia dura; puede estar formado por una o varias capas y éstas pueden tener diferentes consistencias; algunos presentan depósitos de carbonato de calcio (Alexopoulos, 1973; Stephenson & Stempen, 1994; Ulloa & Hanlin, 2006). El estípite es la estructura sobre la cual se soporta la masa de esporas. Puede o no estar presente, y cuando está, su textura, longitud, grosor y color pueden variar; REINO PROTOZOA. GRUPOS “EUMYCETOZOA” Y “CERCOZOA” 405 sólo en algunos etalios y seudoetalios, particularmente, en especies del orden Liceales; (Alexopoulos, 1973; Stephenson & Stempen, 1994; Ulloa & Hanlin, 2006). Tipos de cuerpos fructíferos En la fase reproductiva, los mixomycetes pueden producir cuatro tipos de cuerpos fructíferos (fig. 16.7) (esporóforo o esporocarpo) con esporulación endógena. Un plasmodio puede producir uno o varios cuerpos fructíferos que contienen esporas de origen asexual. Los cuatro tipos de cuerpos fructíferos son: • Fig. 16.6. Partes de cuerpo fructífero. a) peridio, b) capilicio, c) seudocapili- cio, d) estípite, e) hipotalo Esquema: Natalia Vargas algunos pueden ser cilíndricos y huecos o ligeramente llenos de material fibroso o granular (Alexopoulos, 1973; Stephenson & Stempen, 1994; Ulloa & Hanlin, 2006). El estípite puede alcanzar la base del esporangio o puede continuar dentro del esporangio como una estructura similar al estípite llamada columela. Ésta presenta variaciones en forma, color y tamaño, dependiendo del género y la especie. La seudocolumela es una masa de carbonato de calcio que se forma en el centro del esporangio pero alejado del ápice del estípite, a veces está conectada al peridio en varios puntos por extensiones de una masa calcárea central (Alexopoulos, 1973; Stephenson & Stempen, 1994; Ulloa & Hanlin, 2006). El hipotalo es una membrana formada por el plasmodio en la base de las fructificaciones. Puede ser abundante o escaso hasta casi ausente, delgado, transparente, esponjoso, con depósitos de carbonato de calcio producidos por el plasmodio al momento de la esporulación (Alexopoulos, 1973; Stephenson & Stempen, 1994; Ulloa & Hanlin, 2006). El capilicio es un sistema de filamentos estériles, libres o anastomosados que se encuentran en el interior del esporangio y están unidos a otras estructuras como el peridio o la columela o simplemente como una malla. Se forma en el momento de la segmentación del protoplasma que forma las esporas. Esta estructura puede contener depósitos de carbonato de calcio. El seudocapilicio puede tener forma de filamentos irregulares de diferentes diámetros o forma de placas perforadas; ocurre • • • Esporangio: es un tipo de cuerpo fructífero rodeado de un peridio, con capilicio o sin él, dentro del cual se forman las esporas asexuales. Puede ser sésil o estipitado. Este tipo de cuerpo fructífero es característico del género Trichia (Alexopoulos, 1973; Ulloa & Hanlin, 2006). Etalio: es un cuerpo fructífero sésil, hemisférico o globoso, constituido por la fusión de varios esporangios. El esporocarpo resulta de la transformación total o parcial de la masa plasmodial, en la que varios esporangios quedan envueltos por un peridio común. El género Lycogala presenta este tipo cuerpo fructífero (Stephenson & Stempen, 1994; Alexopoulos et al., 1996; Ulloa & Hanlin, 2006). Seudoetalio: este cuerpo fructífero puede ser sésil o estipitado y resulta de la unión, mas no de la fusión, de varios esporangios. Metatrichia vesparium (Batsch) Nann.-Bremek. ex G.W. Martin & Alexop. presenta seudoetalio (Stephenson & Stempen, 1994; Ulloa & Hanlin, 2006). Plasmodiocarpo: su formación se da cuando el protoplasma se acumula en una de las venas principales del plasmodio convirtiéndose en una estructura que contiene las esporas (esporóforo). El cuerpo fructífero es sésil y conserva la forma reticulada o venosa del plasmodio que le dio origen y en algunos géneros el cuerpo fructífero tiene forma de cojín con superficie correosa. Hemitrichia serpula posee plasmodiocarpo (Stephenson & Stempen, 1994; Alexopoulos et al., 1996; Ulloa & Hanlin, 2006). Desarrollo del cuerpo fructífero Los cuerpos fructíferos presentan dos tipos de desarrollo: Estemonitoide y Mixogastroide. 406 BIOLOGÍA DE HONGOS a b c d Fig. 16.7. Tipos de esporocarpos: a) esporangio, b) etalio, c) plasmodiocarpo, d) seudoetalio Esquemas: Marleny Vargas (a); Natalia Vargas (b, c, y d) El desarrollo estemonitoide o epihipotálico (fig. 16.8) lo presentan miembros del orden Stemonitales y se caracterizan por la formación de un hipotalo subplasmodial que separa el plasmodio del sustrato; diferenciándose en montículos de protoplasma que van a originar los estípites. Los montículos aumentan de tamaño por el continuo depósito de material protoplásmico en su ápice, lo que hace que se elonguen y que la masa de protoplasma que se va a convertir en esporas, se eleve a la parte superior del estípite (Ross, 1973; Ulloa & Hanlin, 2006). El desarrollo mixogastroide o subhipotálico lo presentan miembros del orden Echinosteliales, Trichiales y Physarales. Se caracteriza por la formación de un hipotalo supraplasmodial, que se diferencia en primordios y en estípites; el protoplasma fluye hacia los primordios aumentado de tamaño, el ápice se expande, forma el esporangio y una constricción se forma en el punto de unión del esporangio con el estípite (Ross, 1973; Ulloa & Hanlin, 2006). La clase Mycetozooa comprende cinco órdenes (Kirk et al., 2008): Echinosteliales Liceales Physarales Stemonitales Trichiales Orden Echinosteliales La fase trófica de estos organismos es un protoplasmodio incoloro o rosado. Producen esporangios pequeños (hasta de 1,5 mm de altura), delicados, estipitados y columelados. La esporada es de color pálido, poco pigmentada pero en algunas especies es marrón; la pared de las esporas puede ser areolada, lisa o rugosa. En especies que presentan peridio delgado, éste desaparece en la madurez; mientras que en especies con peridio grueso, éste se rompe y sus fragmentos quedan adheridos a los ápices del capilicio (Alexopoulos & Brooks, 1971; Stephenson & Stempen, 1994; Alexopoulos et al., 1996; Kirk et al., 2008). En este orden se ubican los mixomycetes de tamaños más pequeños en el filo Myxomycota, distribuidos en dos familias: Clastodermataceae y Echinosteliaceae (Webster & Weber, 2007). Familia Clastodermataceae Estos mixomycetes presentan peridio parcial o totalmente persistente que se puede romper en la parte superior generando unos lóbulos similares a la forma de un pétalo como en el género Barbeyella Meylan, o se puede fragmentar en pequeñas secciones en forma de escamas REINO PROTOZOA. GRUPOS “EUMYCETOZOA” Y “CERCOZOA” 407 El género representante de esta familia es Echinostelium. E. minutum: de Bary presenta amplia distribución, crece sobre ramitas, hojarasca y corteza puestos en cámara húmeda; se ha registrado que en cultivo puede crecer en condiciones de pH moderadamente ácido (4,7-5,3) (Stephenson & Stempen, 1994; Stephenson, 1989; Stephenson et al., 2008b). Orden Liceales Fig. 16.8. Esquema del desarrollo: a) estemonitoide; b) mixogastroide Esquema: Natalia Vargas que cuelgan en los ápices de las ramas del capilicio, típico del género Clastoderma Blytt. La esporada es de color marrón (Alexopoulos & Brooks, 1971; Stephenson & Stempen, 1994; Fiore-Donno et al., 2008). El género representante de esta familia es Clastoderma, cuyos hábitats son corteza o troncos en descomposición, ramitas y hojarasca. C. debaryanum Blytt se ha registrado asociada a condiciones de pH moderadamente ácido (4,7-5,3); a veces ocurre sobre basidiocarpos viejos de hongos leñosos y perennes (Stephenson & Stempen, 1994; Stephenson, 1989; Stephenson et al., 2008b). Familia Echinosteliaceae Los integrantes de esta familia presentan esporangios pequeños, globosos, estipitados, de colores brillantes. El peridio es delicado a evanescente en estadios jóvenes y en estadios maduros el peridio usualmente persiste como un collar en la base del esporangio. La columela, usualmente presente, es cilíndrica, fusiforme o cónica. El capilicio está conformado por una red de filamentos ramificados. Las esporas en masa son blancas, crema, amarillo, rosado, grisáceas o raramente marrón-rosado (Martin & Alexopoulos, 1969; Alexopoulos & Brooks, 1971; Stephenson & Stempen, 1994). Los miembros de este orden habitan comúnmente corteza de árboles muertos. Pueden presentar los cuatro tipos de cuerpos fructíferos, los cuales carecen de depósitos de cal. La característica que distingue los miembros de este orden es la ausencia de un capilicio verdadero, pero con frecuencia hay seudocapilicio entre las esporas que se forman en los etalios. La esporada puede presentar color amarillo pálido, marrón pálido a rojo-marrón, nunca púrpura-marrón. La fase trófica de estos mixomycetes puede ser un protoplasmodio o un faneroplasmodio (Stephenson & Stempen, 1994; Alexopoulos et al., 1996; Herrera & Ulloa, 2004; Webster & Weber, 2007). Según Kirk et al. (2008) en este orden se ubican cinco familias Cribrariaceae, Dictydiaethaliaceae, Listerellaceae, Liceaceae y Tubiferaceae, de las cuales trataremos las dos últimas, ya que de éstas se han registrado varios géneros en el trópico. Familia Liceaceae Sus integrantes producen cuerpos fructíferos pequeños que no se pueden distinguir fácilmente en campo, aunque algunas especies pueden ser observadas en cultivo en cámara húmeda. Los plasmodiocarpos son pulvinados, vermiformes o ramificados; aunque algunas especies pueden presentar etalios o esporangios sésiles, hemisféricos a subglobosos y el peridio es persistente. Los esporocarpos no presentan capilicio ni columela. La esporada es hialina o de color marrón a oliváceo. La fase trófica usualmente es un protoplasmodio (Keller & Brooks, 1977; Stephenson, 1989; Stephenson & Stempen, 1994; Alexopoulos et al., 1996; Herrera & Ulloa, 2004). Esta familia es monogenérica. Las especies del género Licea Schrad habitan principalmente cortezas de árboles vivos o muertos, los cuerpos fructíferos se observan al poner el sustrato en cámara húmeda (Stephenson & Stempen, 1994). 408 BIOLOGÍA DE HONGOS Familia Tubiferaceae Los organismos de esta familia pueden presentar cuerpos fructíferos de tipo esporangio, seudoetalio o etalio; pueden o no presentar hipotalo, seudocapilicio o peridio. Presentan esporada de color amarillo, marrón, gris, ocre o rosado (Herrera & Ulloa, 2004). Según Kirk et al. (2008) esta familia comprende cuatro géneros, de los cuales trataremos el género Lycogala. Género Lycogala Pers. El cuerpo fructífero es de tipo etalio, usualmente de hábito gregario; presenta forma globosa, subglobosa o cónica, de tamaño variado (0,3-4 cm). El peridio es resistente y membranoso o rugoso. Presentan seudocapilicio ramificado, tubular, de color gris algunas veces hialino, en algunas especies el seudocapilicio permanece unido a la capa interna del peridio. La esporada es de color rosado o grisáceo y en estadios maduros se puede tornar ocre (Martin, 1967; Herrera & Ulloa, 2004). Según Stephenson & Stempen (1994) Lycogala epidendrum (J. C. Buxb. ex L.) Fr. es la especie más común y ampliamente distribuida de los mixomycetes; crece generalmente sobre madera en descomposición y presenta etalios de color amarillo a rojo coral (Stephenson et al., 2004). familia. El capilicio puede estar adherido o separado de las paredes del esporangio. Pueden presentar cuerpos fructíferos de tipo plasmodiocarpo o esporangio; estos últimos son estipitados o raramente sésiles (Alexopoulos, 1973; Stephenson & Stempen, 1994). Esta familia comprende diez géneros (Kirk et al., 2008); de los cuales trataremos a Hemitrichia, Perichaena y Trichia. Género Hemitrichia Rostaf. Las especies de este género presentan esporangios sésiles o estipitados, a excepción de la especie Hemitrichia serpula (Scop. Rostaf ), que presenta plasmodiocarpos reticulados de color amarillo brillante a marrón. Los esporangios son globosos a turbinados, amarillos u oliváceos. Presentan capilicio elástico constituido por una red apretada de filamentos, con bandas en forma de espiral. Las esporas son ligeramente reticuladas o espinulosas; la esporada es de color amarillo opaco. La fase trófica es un plasmodio rosado o hialino (Alexopoulos, 1973; Herrera & Ulloa, 2004). Este género crece sobre madera en descomposición o sobre restos de madera (fig. 16.9). Se ha observado que la especie H. serpula registrada en el trópico, necesita una alta humedad en el sustrato para su desarrollo (Stephenson & Stempen, 1994; Stephenson et al., 2004). Género Perichaena Fr. Orden Trichiales La mayoría de los organismos de este orden habitan troncos caídos y producen esporangios sésiles o estipitados, raramente plasmodiocarpos. Presentan un peridio persistente y los filamentos que constituyen el capilicio pueden ser sólidos o tubulares, lisos u ornamentados, libres o unidos. Las esporas presentan colores brillantes entre amarillo, rojo o naranja. La fase trófica de estos mixomycetes es un afanoplasmodio, un faneroplasmodio o un tipo intermedio (Stephenson & Stempen, 1994; Alexopoulos et al., 1996; Herrera & Ulloa, 2004; Webster & Weber, 2007). Este orden tiene tres familias: Dianemataceae, Arcyriaceae y Trichiaceae. De éstas trataremos la última por presentar géneros comúnmente encontrados en el trópico. Familia Trichiaceae El carácter tubular de los filamentos individuales con ornamentaciones conspicuas que conforman el capilicio es la característica que distingue los miembros de esta En este género los esporangios son sésiles en su mayoría, espaciados o apretados pero no amontonados, de color castaño, marrón oscuro a casi negro. El peridio es usualmente grueso y presenta dos capas: una interna membranosa y una externa con depósitos de carbonato de calcio. El capilicio está formado de eláteres (filamentos libres) delgados, simples o ramificados; el capilicio no presenta filamentos espiralados. La esporada es de color amarillo brillante o pálido (Alexopoulos, 1973; Stephenson & Stempen, 1994). Perichaena depressa Lib. se ha registrado en los trópicos por encima de los 3000 msnm. Crece en bosques de roble, sobre corteza en descomposición y madera; también ha fructificado sobre hojas y excrementos al colocarlos en cámara húmeda (Stephenson & Stempen, 1994; Rojas & Stephenson, 2007). Género Trichia Haller En el género se presentan esporangios sésiles o estipitados y usualmente dehiscentes, su forma varía de REINO PROTOZOA. GRUPOS “EUMYCETOZOA” Y “CERCOZOA” Fig. 16.9. Cuerpos fructíferos de Hemitrichia sp. mostrando capilicio sobre tronco 409 Fig. 16.10. Cuerpo fructífero de Trichia sp. Fotografía: LAMFU Fotografía: LAMFU globosos, subglobosos, ovalados, cilíndricos a elongados. El capilicio está formado por eláteres con ápices acuminados, con dos a cinco filamentos en espiral, lisos o espinulosos. Las esporas son reticuladas a ligeramente rugosas y la esporada es de color amarillo, ocráceo o naranja (Alexopoulos, 1973; Stephenson & Stempen, 1994; Herrera & Ulloa, 2004). Usualmente, las especies de este género crecen sobre madera en descomposición, aunque también sobre corteza y hojarasca (fig. 16.10). Trichia decipiens (Pers.) T. Macbr. muestra preferencia por hojarasca de coníferas (Stephenson, 1989; Stephenson & Stempen, 1994). Familia Didymiaceae Los géneros pertenecientes a esta familia presentan en el peridio depósitos de calcio granulares o cristalinos. Los cuerpos fructíferos pueden ser plasmodiocarpos o esporangios sésiles o estipitados. El capilicio consiste de túbulos que ocasionalmente exhiben depósitos de calcio cristalinos. La esporada es marrón, violácea a negra (Alexopoulos, 1973; Stephenson & Stempen, 1994; Herrera & Ulloa, 2004). Esta familia comprende siete géneros; trataremos el género Diderma y Didymium. Género Diderma Pers. Orden Physarales La característica más importante de los mixomycetes clasificados en este orden es la presencia de depósitos de cal (carbonato de calcio) en el peridio, capilicio o estípite del cuerpo fructífero. Los cuerpos fructíferos usualmente son esporangios (en algunas especies columelados), raramente producen plasmodiocarpos o etalios. La esporada presenta color oscuro, marrón-púrpura o violáceo. La fase trófica es un faneroplasmodio (Stephenson & Stempen, 1994; Herrera & Ulloa, 2004). En este orden, según Kirk et al. (2008) se ubican tres familias Didymiaceae, Elaeomyxaceae y Physaraceae. El cuerpo fructífero de estos mixomycetes pueden ser plasmodiocarpos o esporangios. El peridio está formado de dos capas y éstas a su vez están constituidas por cristales de calcio. El capilicio es abundante, formado de filamentos que pueden ser frágiles o persistentes sin depósitos de carbonato de calcio. La esporada es marrón oscura, violácea pálida u oscura a casi negra (Stephenson & Stempen, 1994; Herrera & Ulloa, 2004). Los cuerpos fructíferos se desarrollan sobre corteza en descomposición, ramitas u hojas muertas, algunas veces fructifican sobre material vegetal vivo. D. effusum (Link) Fr. ocurre principalmente sobre hojarasca (Stephenson & Stempen, 1994; Stephenson et al., 2008b). 410 BIOLOGÍA DE HONGOS Género Didymium Schrad. Los cuerpos fructíferos se desarrollan sobre corteza en descomposición, ramitas u hojas muertas. Presentan plasmodiocarpos o esporangios. El peridio es delgado, frágil, membranoso, con una capa de cristales de depósitos de calcio. El capilicio es simple o ramificado sin depósitos de carbonato de calcio. La columela está presente en la mayoría de especies, a menudo presenta forma globosa, de colores pálidos u oscuros (fig. 16. 11). La esporada es de color marrón, violáceo pálido a casi negro (Keller & Brooks, 1977; Stephenson & Stempen, 1994; Herrera & Ulloa, 2004). Familia Physaraceae Según Kirk et al. (2008) en esta familia se ubican nueve géneros de los cuales trataremos el género Physarum. Género Physarum Pers. Este género puede presentar esporangios o plasmodiocarpos. Los esporangios presentan color amarillo, grisáceo a verduzco. El peridio puede presentar una o dos capas; con depósitos de carbonato de calcio. El capilicio está formado de filamentos hialinos que conectan gránulos de carbonato de calcio. La esporada es de color grisáceo, marrón-violáceo a marrón oscuro; las esporas son punteadas, espinulosas a verruculosas. La fase trófica es un faneroplasmodio amarillo (Stephenson & Stempen, 1994; Herrera & Ulloa, 2004). Estos mixomycetes pueden crecer sobre madera en descomposición, sin embargo, algunos crecen sobre material vegetal vivo. Physarum melleum (Berk. & Broome) Massee crece principalmente sobre hojarasca (Stephenson & Stempen, 1994; Stephenson et al., 2004). Physarum polycephalum Schwein. ha sido estudiado extensamente en biología celular. Uno de los aspectos estudiados es la sincronización en la división nuclear, que ocurre en el plasmodio y está regulada por una proteína quinasa; esta última cataliza la fosforilación de las histonas H1, conduciendo a la condensación de los cromosomas. Otros estudios están enfocados en las corrientes protoplasmodiales del faneroplasmodio, demostrando que el pulso que causa dichas corrientes se da por la interacción (contracción) e inhibición de la interacción (relajación) de filamentos de actinamiosina que rodean las venas. Las miosinas tipo II, específicamente las subunidades de cadenas ligeras, están controladas por concentraciones de Ca+2: en concentraciones bajas de Ca+2 ocurre la contracción y en con- Fig. 16.11. Cuerpos fructíferos de Didymium sp. Fotografía: LAMFU centraciones altas hay relajación (Bradbury et al., 1974; Mathews, 1977; Nakamura & Kohama, 1999; Webster & Weber, 2007). Orden Stemonitales Familia Stemonitidaceae El cuerpo fructífero que predomina en los mixomycetes pertenecientes a este orden y familia es el esporangio estipitado y raramente presentan esporangios sésiles, etalios, seudoetalios o plasmodiocarpos. Presentan capilicio conformado de filamentos oscuros y lisos; el capilicio y el peridio no contienen depósitos de cal. La esporada presenta color púrpura-negro oscuro. La fase trófica de estos mixomycetes es un afanoplasmodio (Stephenson & Stempen, 1994; Alexopoulos et al., 1996). Este orden y familia comprende 15 géneros de los cuales trataremos Comatricha, Lamproderma y Stemonitis. Género Comatricha Preuss Estos mixomycetes presentan esporangios dispersos o gregarios, sin red superficial o raramente presente. El peridio puede o no persistir en los cuerpos fructíferos. La columela, al alcanzar la mitad o parte superior del esporangio,
