RED NACIONAL UNIVERSITARIA UNIDAD ACADÉMICA DE SANTA CRUZ FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA BIOQUÍMICA Y FARMACIA SEXTO SEMESTRE SYLLABUS DE LA ASIGNATURA DE BIOTECNOLOGÍA Elaborado por: Ing. Miguel Angel Ercilla Salvador Gestión Académica I/2023 FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA Acreditada como PLENA mediante R. M. 288/01 VISIÓN DE LA UNIVERSIDAD Ser la Universidad líder en calidad educativa. MISIÓN DE LA UNIVERSIDAD Desarrollar la Educación Superior Universitaria con calidad y Competitividad al servicio de la sociedad Estimado(a) estudiante: El Syllabus que ponemos en tus manos es el fruto del trabajo intelectual de tus docentes, quienes han puesto sus mejores empeños en la planificación de los procesos de enseñanza para brindarte una educación de la más alta calidad. Este documento te servirá de guía para que organices mejor tus procesos de aprendizaje y los hagas mucho más productivos. Esperamos que sepas apreciarlo y cuidarlo. Aprobado por: Fecha: Agosto de 2022 SELLO Y FIRMA JEFATURA DE CARRERA U N I V E R S I D A D D E 2 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA SYLLABUS Asignatura: BIOTECNOLOGÍA Código: BTG-633 Requisito: BTG-534 Carga Horaria Horas Teóricas Horas Prácticas Créditos: 80 horas 40 horas 40 horas 8 I. OBJETIVOS GENERALES DE LA ASIGNATURA • Reconocer los procesos bioquímicos, moleculares, celulares y fisiológicos de los organismos útiles en biotecnología. • Analizar las aplicaciones prácticas de esta ciencia en sectores industriales que abarca, la industria alimentaria, química y farmacéutica. • Diseñar sistemas para la producción o modificación de productos de interés biotecnológico. . II. PROGRAMA ANALÍTICO DE LA ASIGNATURA. Tema 1 ¿Qué es la biotecnología? 1.1 La biotecnología tradicional 1.2 La biotecnología moderna 1.3 Las definiciones de "biotecnología" 1.4 El impacto de la biotecnología 1.5 Biotecnología y desarrollo 1.6 Cronología de algunos acontecimientos en la historia de la biotecnología Tema 2 Las células y los cromosomas 2.1 La célula como unidad de los seres vivos 2.2 Unidad estructural 2.3 Unidad funcional 2.4 Relación entre las estructuras celulares y su función 2.5 Las técnicas de laboratorio 2.6 Toda célula proviene de otra preexistente 2.7 Los cromosomas 2.8 La teoría cromosómica de la herencia 2.9 Las células y los cromosomas como agentes biológicos Tema 3 Los microorganismos 3.1 La diversidad microbiana 3.2 Las bacterias 3.3 Las eubacterias 3.4 Las arqueobacterias 3.5 Los protozoarios 3.6 Las algas 3.7 Los hongos 3.8 Los virus U N I V E R S I D A D D E 3 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA 3.9 Las técnicas de laboratorio 3.10 El cultivo y la identificación de microorganismos 3.11 Bioseguridad 3.12 Los microorganismos como agentes biológicos Tema 4 Las enzimas y los anticuerpos 4.1 Las proteínas 4.2 Estructura 4.3 Algunas técnicas de laboratorio 4.4 Las enzimas 4.5 La catálisis enzimática 4.6 Los diversos tipos de enzimas 4.7 Importancia económica 4.8 Los anticuerpos 4.9 La molécula de anticuerpo 4.10 La producción de anticuerpos en el organismo 4.11 La producción de anticuerpos en el laboratorio 4.12 El empleo de los anticuerpos Tema 5 Los ácidos nucleicos y los genes 5.1 Los ácidos nucleicos 5.2 La doble hélice 5.3 El código genético 5.4 La expresión génica 5.5 La regulación de la expresión génica 5.6 Células procariontes 5.7 Células eucariontes 5.8 La genómica 5.9 El genoma humano 5.10 Las herramientas básicas Tema 6 Aplicaciones de la Biotecnología I 6.1 Biotecnología y salud: Las Vacunas 6.2 Las vacunas y la prevención de enfermedades infecciosas 6.3 La vacunación 6.4 Los diferentes tipos de vacunas 6.5 La aprobación de una vacuna 6.6 La producción de vacunas 6.7 Las vacunas y la erradicación de la enfermedad 6.8 Las enfermedades emergentes 6.9 El bioterrorismo 6.10 Biotecnología y salud: Las Pruebas de Diagnóstico 6.11 Las pruebas de rastreo 6.12 La tipificación de tejidos 6.13 La práctica forense 6.14 El diagnóstico de las enfermedades infecciosas 6.15 El diagnóstico de las enfermedades genéticas Tema 7 Los procesos fermentativos 7.1 Los procesos fermentativos y la industria 7.2 Los microorganismos industriales 7.3 Nociones sobre el metabolismo 7.4 Las cepas industriales 7.5 La selección de la materia prima 7.6 Los procesos tradicionales 7.7 Los procesos sumergidos 7.8 Los fermentadores o biorreactores U N I V E R S I D A D D E 4 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA 7.9 El cambio de escala 7.10 La operación del proceso 7.11 La recuperación del producto 7.12 Los procesos fermentativos en la industria de biofertilizantes Tema 8 El cultivo de células y tejidos 8.1 La micropropagación de plantas 8.2 Las etapas 8.3 Los medios de cultivo 8.4 Las diferentes modalidades 8.5 El mejoramiento y la conservación de la biodiversidad vegetal 8.6 La difusión de la tecnología 8.7 El cultivo de células animales 8.8 La manipulación in vitro de las células animales 8.9 Las aplicaciones del cultivo in vitro de células de mamíferos Tema 9 La tecnología del ADN 9.1 Las herramientas disponibles 9.2 La extracción del ADN 9.3 Las nucleasas y las enzimas de restricción 9.4 La electroforesis del ADN 9.5 Hibridización y sondas génicas 9.6 La técnica de Southern 9.7 La técnica de Fingerprint 9.8 La síntesis y amplificación del ADN 9.9 Síntesis de oligonucleótidos 9.10 Síntesis de ADNc 9.11 La reacción en cadena de la polimerasa 9.12 Los arrays o matrices Tema 10 La ingeniería genética 10.1 El nacimiento de la biotecnología moderna 10.2 Las primeras experiencias 10.3 Mitos y realidades 10.4 Las bibliotecas de genes 10.5 La construcción de un microorganismo recombinante 10.6 Obtener el gen 10.7 Transferir el gen 10.8 Identificar a los microorganismos o células "combinantes" 10.9 La construcción de plantas transgénicas 10.10 Transferencia de los genes a las células vegetales 10.11 El problema de los marcadores de selección 10.12 Células y animales transgénicos 10.13 La transferencia génica a células animales 10.14 Los animales transgénicos Tema 11 Aplicaciones de la Biotecnología II 11.1 Biotecnología y salud: Los Medicamentos 11.2 La industria de medicamentos 11.3 Los principios activos de las plantas 11.4 Los antibióticos 11.5 Las proteínas recombinantes 11.6 Los medicamentos personalizados 11.7 Patentes y genéricos 11.8 Biotecnología y salud: Los Nuevos Tratamientos 11.9 El progreso de la inmunoterapia 11.10 La lucha contra el cáncer U N I V E R S I D A D D E 5 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA 11.11 La terapia génica 11.12 Los trasplantes 11.13 La medicina regenerativa III. ACTIVIDADES A REALIZAR DIRECTAMENTE EN LA COMUNIDAD. i. Nombre del proyecto al que tributa la asignatura. ii. Contribución de la asignatura al proyecto. iii. Actividades a realizar durante el semestre para la implementación del proyecto. Trabajo a realizar por los estudiantes Elaboración de un proyecto de obtención de un producto donde intervenga una microrganismo o parte de él Localidad, aula o laboratorio Laboratorio Universidad de Aquino Bolivia Incidencia social Obtención de un producto Biotecnológico que ofrezca una alternativa cotidiana. Fecha Durante todo el semestre. IV. EVALUACIÓN DE LA ASIGNATURA. ● Procesual o formativa. Se evaluará al estudiante con calificaciones entre 0 a 40 puntos independientemente de la cantidad de actividades realizadas, repasos escritos, trabajos grupales, Trabajo de Investigación, desarrollo y presentación de los workpaper y los GIP. • Resultados de los procesos de aprendizaje o sumativa (examen parcial final) Se realizarán 3 evaluaciones parciales con contenido teórico y práctico sobre 40 puntos cada uno. Los parciales consistirán en un examen escrito con un valor de 60 puntos de la nota del final. V. BIBLIOGRAFÍA • MUÑOZ de Malajovich María Antonia. “Biotecnología”. Edit. Univ. Nacional del Quilmes. 2da Edición. Argentina. 2.012. • THIEMAN W. y PALLADINO M. “Introducción a la Biotecnología”. PEARSON. 2ª Edición. Madrid – España 2.010. • BISANG R., CAMPI M., CESA V. “Biotecnología y Desarrollo”. CEPAL. Naciones Unidas 2.009. • BORZANI Walter. “Biotecnología Industrial”. Editora Edgard Blucher LTDA. Brasil 2.008. • RENNEBERG Reinhard. “Biotecnología para Principiantes”. Editorial Reverte. España 2.008. • BUEREN Juan. “Curso de Biotecnología Aplicada”. 7ma Edición. Sanidad y Ediciones. España 2.007. • BOLÍVAR Z. Francisco. “Fundamentos y casos exitosos de la biotecnología moderna”. 2ª Edición. México 2.007. • MUÑOZ de Malajovich María. “Biotecnología y Vida Cotidiana”. ArgenBio. Argentina. 2.007. • KREUZER H. “ADN Recombinante y Biotecnología - Guía para Estudiantes”. 1a edición. Edit. Aula Magna. España. 2.004. U N I V E R S I D A D D E 6 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA VI. PLAN CALENDARIO. PROGRAMA DE AVANCE DE LA MATERIA CARRERA: BIOQUÍMICA Y FARMACIA MATERIA: BIOTECNOLOGÍA SEMESTRE: 6to SEMANA 1 2 3 FECHA 06 al 11 de Marzo 13 al 18 de Marzo 20 al 25 de Marzo Nº DE LA UNIDAD 1 2 3 U N I V E R S I D A D CONTENIDO OBSERVACIONES Tema 1 ¿Qué es la biotecnología? 1.7La biotecnología tradicional 1.8La biotecnología moderna 1.9Las definiciones de "biotecnología" 1.10 El impacto de la biotecnología 1.11 Biotecnología y desarrollo 1.12 Cronología de algunos acontecimientos en la historia de la biotecnología Tema 2 Las células y los cromosomas 2.10 La célula como unidad de los seres vivos 2.11 Unidad estructural 2.12 Unidad funcional 2.13 Relación entre las estructuras celulares y su función 2.14 Las técnicas de laboratorio 2.15 Toda célula proviene de otra preexistente 2.16 Los cromosomas 2.17 La teoría cromosómica de la herencia 2.18 Las células y los cromosomas como agentes biológicos Tema 3 Los microorganismos 3.13 La diversidad microbiana 3.14 Las bacterias 3.15 Las eubacterias 3.16 Las arqueobacterias 3.17 Los protozoarios 3.18 Las algas 3.19 Los hongos 3.20 Los virus D E 7 A Q U I N O D E Elaboración de: - Work Paper # 1. Elaboración de: - Work Paper # 2. - GIP # 1. Elaboración de: - Work Paper # 3. - GIP # 2. B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA 4 5 6y7 8 27 de Marzo al 01 de Abril 03 al 08 de Abril 10 al 22 de Abril 3.21 Las técnicas de laboratorio 3.22 El cultivo y la identificación de microorganismos 3.23 Los microorganismos como agentes biológicos Tema 4 Las enzimas y los anticuerpos 4.13 Las proteínas 4.14 Estructura 4.15 Algunas técnicas de laboratorio 4.16 Las enzimas 4.17 La catálisis enzimática 4.18 Los diversos tipos de enzimas 4.19 Importancia económica 4.20 Los anticuerpos 4.21 La molécula de anticuerpo 4.22 La producción de anticuerpos en el organismo 4.23 La producción de anticuerpos en el laboratorio 4.24 El empleo de los anticuerpos 4 Tema 5 Los ácidos nucleicos y los genes 5.11 Los ácidos nucleicos 5.12 La doble hélice 5.13 El código genético 5.14 La expresión génica 5.15 La regulación de la expresión génica 5.16 Células procariontes 5.17 Células eucariontes 5 5 6 U N I V E R S I D A D 5.18 La genómica 5.19 El genoma humano 5.20 Las herramientas básicas Tema 6 Aplicaciones de la Biotecnología I 6.16 Biotecnología y salud: Las Vacunas 6.17 Las vacunas y la prevención de enfermedades infecciosas 6.18 La vacunación D E 8 A Q U I N O D E Elaboración de: - Work Paper # 4. - GIP # 3. Elaboración de: - Work Paper # 5 - GIP # 3. . 1ER PARCIAL Elaboración de: - Work Paper # 6 - GIP # 4 B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA 6.19 Los diferentes tipos de vacunas 6.20 La aprobación de una vacuna 6.21 La producción de vacunas 6.22 Las vacunas y la erradicación de la enfermedad 6.23 Las enfermedades emergentes 6.24 El bioterrorismo 24 al 29 de Abril 9 10 11 12 y13 01 al 06 de Mayo 6 08 al 13 de Mayo 15 al 20 de Mayo 22 de Mayo al 03 de Junio 7 7 8 U N I V E R S I D A D 6.25 Biotecnología y salud: Las Pruebas de Diagnóstico 6.26 Las pruebas de rastreo 6.27 La tipificación de tejidos 6.28 La práctica forense 6.29 El diagnóstico de las enfermedades infecciosas 6.30 El diagnóstico de las enfermedades genéticas Tema 7 Los procesos fermentativos 7.13 Los procesos fermentativos y la industria 7.14 Los microorganismos industriales 7.15 Nociones sobre el metabolismo 7.16 Las cepas industriales 7.17 La selección de la materia prima 7.18 Los procesos tradicionales 7.19 Los procesos sumergidos 7.20 Los fermentadores o biorreactores 7.21 El cambio de escala 7.22 La operación del proceso 7.23 La recuperación del producto 7.24 Los procesos fermentativos en la industria de biofertilizantes Tema 8 El cultivo de células y tejidos 8.10 La micropropagación de plantas 8.11 Las etapas D E 9 A Q U I N O D E Ela boración de: - Work Paper # 6 - GIP # 4 Elaboración de: - Work Paper # 7 - GIP # 4 Elaboración de: - Work Paper # 7 2DO PARCIAL B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA 8.12 14 15 16 17 05 al 10 de Junio 12 al 17 de Junio 19 al 24 de Junio 26 de Junio al 01 de Julio Los medios de cultivo 8.1 Las diferentes modalidades 8.2 El mejoramiento y la conservación de la biodiversidad vegetal 8.3 La difusión de la tecnología 8.4 El cultivo de células animales 8.5 La manipulación in vitro de las células animales 8.6 Las aplicaciones del cultivo in vitro de células de mamíferos 8 9 9 10 U N I V E R S I D A D Tema 9 La tecnología del ADN 9.13 Las herramientas disponibles 9.14 La extracción del ADN 9.15 Las nucleasas y las enzimas de restricción 9.16 La electroforesis del ADN 9.17 Hibridización y sondas génicas 9.18 La técnica de Southern 9.19 La técnica de Fingerprint 9.20 La síntesis y amplificación del ADN 9.21 Síntesis de oligonucleótidos 9.22 Síntesis de ADNc 9.23 La reacción en cadena de la polimerasa 9.24 Los arrays o matrices Tema 10 La ingeniería genética 10.15 El nacimiento de la biotecnología moderna 10.16 Las primeras experiencias 10.17 Mitos y realidades 10.18 Las bibliotecas de genes 10.19 La construcción de un microorganismo recombinante 10.20 Obtener el gen 10.21 Transferir el gen D E 10 A Q U I N O D E Elaboración de: - Work Paper # 8 Elaboración de: - Work Paper # 9 Elaboración de: - Work Paper # 9 Elaboración de: - Work Paper # 10 B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA 10.22 Identificar a los microorganismos o células "combinantes" 10.23 La construcción de plantas transgénicas 10.24 Transferencia de los genes a las células vegetales 10.25 El problema de los marcadores de selección 10.26 Células y animales transgénicos 10.27 La transferencia génica a células animales 10.28 Los animales transgénicos 18 y19 20 03 al 15 de Julio 11 Tema 11 Aplicaciones de la Biotecnología II 11.14 Biotecnología y salud: Los Medicamentos 11.15 La industria de medicamentos 11.16 Los principios activos de las plantas 11.17 Los antibióticos 11.18 Las proteínas recombinantes 11.19 Los medicamentos personalizados 11.20 Patentes y genéricos 11.21 Biotecnología y salud: Los Nuevos Tratamientos 11.22 El progreso de la inmunoterapia 11.23 La lucha contra el cáncer 11.24 La terapia génica 11.25 Los trasplantes 11.26 La medicina regenerativa 17 al 22 de Julio U N I V E R S I D A D EXAMEN FINAL EXAMEN DE 2DO TURNO D E 11 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA VII. WORKPAPER PROGRAMA DE CONTROL DE CALIDAD WORK PAPER # 1 TÍTULO: MOLÉCULAS INFORMACIONALES DE LA CÉLULA VIVA ÁCIDOS NUCLEICOS Y PROTEÍNAS FECHA DE ENTREGA: 4ª semana PERÍODO DE EVALUACIÓN: 5ª semana I. OBJETIVO GENERAL - Aplicar los conocimientos adquiridos esta unidad en la interpretación de las funciones de los ácidos nucleicos. II. FUNDAMENTO TEORICO LA CÉLULA VIVA; COMPONENTES Y FUNCIONES Todos los seres vivos estamos integrados por una o más células, que conforman nuestro organismo. Los seres vivos más sencillos, los llamados procariontes, están constituidos por una sola célula, es decir son organismos unicelulares. Los demás, son organismos que se denominan eucariontes. Muchos de los eucariontes, tales como el hombre y las plantas, son organismos pluricelulares, aunque también hay eucariontes unicelulares, como la levadura. Los procariontes, que incluyen a las bacterias y a las arqueas, son organismos sencillos en los cuales su material genético no se encuentra contenido por una membrana nuclear, como es el caso de los eucariontes, y por lo tanto el material genético está en contacto directo con el citoplasma celular. Los cromosomas bacterianos son relativamente sencillos, comparados con los de los ecuariontes, y para su duplicación no requieren de procesos de meiosis y mitosis que sí requieren los cromosomas de los organismos eucariontes. Las células procariontes están incluidas y delimitadas por membranas resistentes o semirrígidas, que les dan forma (esférica, cilíndrica, elongadas, etc.), les protege del exterior y controla el paso de materiales del exterior de la célula al citoplasma celular y viceversa. Las membranas están compuestas principalmente por lípidos y proteínas, y de hecho están formadas por dos capas, la interna y la externa. El citoplasma bacteriano es una solución acuosa en el que se llevan a cabo las reacciones bioquímicas de la célula procarionte. Contiene al material genético, en la mayor parte de los casos un solo cromosoma —aunque hay procariontes con varios cromosomas—, a los ribosomas, al conjunto de proteínas —y entre ellas, enzimas involucradas en la síntesis del material genético y de las mismas proteínas— a otras macromoléculas biológicas (lípidos y carbohidratos), y al conjunto de moléculas involucradas en el metabolismo de la célula. Los ribosomas son estructuras esféricas compuestas de RNA y proteína, en los cuales se lleva a cabo la síntesis de proteínas, tal y como veremos más adelante. Cada ribosoma está compuesto por dos moléculas grandes de RNA ribosomal —llamadas 70S y 50S—, y varias moléculas más pequeñas de RNA, como el 5S. Además, cada ribosoma tiene del orden de 50 proteínas diferentes. La bacteria tiene U N I V E R S I D A D D E 12 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA varios cientos de ribosomas que se localizan en la parte interna de la membrana celular, para llevar a cabo la función de la síntesis de proteínas. Las células eucariontes son células que tienen en promedio un tamaño de varios miles de veces mayor al de las células procariontes y cuya estructura, organización y complejidad es también mucho mayor que el de las bacterias. Las células de los organismos eucariontes tienen una membrana plasmática que las delimita pero que también permite la comunicación con las otras células del organismo. Al igual que en los procariontes, la membrana está compuesta por lípidos y proteínas e incluye una gran cantidad de subestructuras y organelos celulares entre los que destacan los siguientes: La mitocondria. Es el organelo celular responsable del proceso de la síntesis biológica del ATP (adenosin trifosfato), que es la molécula que provee la energía para la mayor parte de las reacciones de biosíntesis en la célula. El ATP se sintetiza enzimáticamente mediante un proceso conocido con el nombre de fosforilación oxidativa. La mitocondria posee su propio material genético (que es un solo cromosoma), en donde reside la información para sintetizar muchas de las proteínas involucradas en este proceso. Muchos biólogos consideran que la mitocondria tuvo su origen en un procarionte primitivo, que se asoció en algún momento de la evolución, con el precursor de la célula eucarionte que hoy existe. Una célula eucarionte tiene del orden de 150 mitocondrias. Las células de las plantas, además de las mitocondrias, contienen también los cloroplastos, que son organelos involucrados en el proceso de la fotosíntesis. Los cloroplastos también contienen su propio material genético y también se cree que tienen un origen procarionte. El proceso de la fotosíntesis es fundamental para la vida en la Tierra, y permite fijar la energía solar a través de un pigmento conocido con el nombre de clorofila (que además es responsable del color de las plantas) y a través de este proceso generar también ATP, como molécula de alta energía, para llevar a cabo las funciones celulares. El retículo endoplásmico. Es un organelo cuya función primaria es la de asociarse a los ribosomas para servir de soporte en la síntesis de las proteínas. Los ribosomas de las células eucariontes son similares a aquellos de los procariontes, aunque son de mayor tamaño y están asociados formando estructuras de varios cientos de ellos, llamados polirribosomas, donde se sintetizan las proteínas. El aparato de Golgi. Es un organelo celular ligado al retículo endoplásmico, donde muchas de las proteínas (y otras macromoléculas) sintetizadas en el retículo, son incorporadas en el aparato de Golgi, que también es una estructura de origen membranal, y que permite exportar y procesar las proteínas sintetizadas. Otro tipo de organelo muy importante en la célula cuya función está involucrada en la degradación de los productos proteicos (y de otro tipo de metabolitos), son los llamados lisosomas, que son estructuras membranales que contienen enzimas con la capacidad de degradar macromoléculas biológicas. El citoesqueleto celular. Es un organelo que está formado por microtúbulos y microfilamentos de proteínas estructurales como la actina, la miosina y la tubulina. Estas estructuras son las responsables de darle forma y organizar el citoplasma de la célula, dependiendo de la función de la célula y del tipo de estructuras celulares involucradas. CUESTIONARIO DEL WORK PAPER Complementar la lectura en el capítulo I (páginas 19 a 56) de BOLÍVAR Z. Francisco. Fundamentos y casos exitosos de la biotecnología moderna. 2ª Edición. México 2.007. 1. 2. 3. 4. 5. 6. Qué son los cromosomas Qué son los genes Esquematice todos los cromosomas humanos Cómo se componen y organizan los genes en los cromosomas Cómo es la estructura del ADN En el ADN cómo se realiza el apareamiento de bases complementarias U N I V E R S I D A D D E 13 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA 7. 8. 9. 10. 11. 12. 13. 14. 15. Cómo se realiza la replicación del ADN Explique el dogma central de la biología Realice en una tabla el código genético Por qué el código genético es universal Cómo se sintetizan las proteínas Qué es una mutación Qué tipos de mutación existen Cómo es la estructura de las proteínas Qué funciones cumplen las proteínas U N I V E R S I D A D D E 14 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA PROGRAMA DE CONTROL DE CALIDAD WORK PAPER # 2 TÍTULO: INGENIERÍA GENÉTICA LAS HERRAMIENTAS MOLECULARES Y LOS MÉTODOS PARA AISLAR, CARACTERIZAR Y MANIPULAR EL DNA FECHA DE ENTREGA: 4ª Semana PERÍODO DE EVALUACIÓN: 5ª semana I. OBJETIVO GENERAL - Aplicar los conocimientos adquiridos esta unidad en la interpretación de los métodos para aislar, y manipular el ADN. II. FUNDAMENTO TEORICO LA MANIPULACIÓN IN VITRO DEL MATERIAL GENÉTICO La ingeniería genética, llamada también metodología del DNA recombinante, es un conjunto de herramientas y métodos que permiten la manipulación in vitro —la edición molecular— del material genético de los organismos vivos. Esta poderosa metodología está sustentada en dos grandes tipos de herramientas celulares. La primera de ellas son las enzimas que utiliza la propia célula en sus procesos internos para el manejo de su material genético. El otro tipo de herramientas son los vehículos moleculares de clonación de DNA, que son moléculas de DNA que permiten la replicación de fragmentos de ácido nucleico incapaces de hacerlo en forma autónoma. La ingeniería genética está también soportada por un conjunto de métodos que permiten aislar, caracterizar y manipular el DNA entre los que resaltan las técnicas de secuenciación del ácido desoxirribonucleico, mediante las cuales es posible determinar la secuencia nucleotídica del DNA. La sofisticación de estas técnicas de secuenciación ha permitido, como veremos más adelante, la determinación de las secuencias de varios genomas, incluyendo el humano, en tiempos muy cortos. Existen también técnicas de síntesis química de oligonucleótidos que son fragmentos pequeños de DNA, que indudablemente son herramientas fundamentales para modificar, editar y detectar de manera muy fina y específica el DNA y finalmente, la técnica de reacción en cadena de polimerasa o PCR que es una metodología que permite la amplificación de cualquier fragmento de DNA, generando varios billones de copias idénticas a este fragmento de DNA en pocas horas. Las herramientas y técnicas señaladas y algunas otras auxiliares que se presentan en este capítulo, integran la metodología que permiten el aislamiento, manejo y edición del material genético de los seres vivos, llamada ingeniería genética o del DNA recombinante. Por su significado se describen con mayor detalle las más importantes. LAS HERRAMIENTAS CELULARES; ENZIMOLOGÍA DE ÁCIDOS NUCLEICOS A principios de 1970, habían sido ya descritos los principales mecanismos en la célula involucrados en la utilización de la información genética para sintetizar las proteínas, y así se establecía sólidamente el dogma central de la biología moderna. U N I V E R S I D A D D E 15 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA Estos dos mecanismos, el de transcripción del DNA en RNA y el de traducción de RNA en proteína, así como el mecanismo de replicación del DNA, que han sido descritos con detalle en el capítulo anterior, han permitido conocer cómo participa un gran número de proteínas en el interior de la célula, las cuales tienen diferentes actividades enzimáticas y funcionales, algunas de ellas involucradas en el manejo de su propio material genético. Así, han sido descritas enzimas, que son moléculas de proteínas con actividades biológicas, que permiten cortar las uniones covalentes fosfodiester en las cadenas del DNA, como verdaderas “tijeras moleculares”. A estas enzimas se les conoce con el nombre genérico de nucleasas y entre ellas destacan las endonucleasas de restricción, las cuales reconocen secuencias específicas de nucleótidos en el DNA y luego proceden al rompimiento de algunas de las uniones covalentes en estas secuencias. Las enzimas que llevan a cabo la función contraria a las nucleasas, o sea el formar uniones covalentes fosfodiester entre moléculas de DNA, reciben el nombre genérico de ligasas de DNA. Éstos son dos de los ejemplos más importantes del tipo de enzimas que tienen como sustrato a los ácidos nucleicos. En este capítulo se presenta una descripción de las principales enzimas utilizadas por la célula para manejar sus propios ácidos nucleicos. Es relevante señalar que muchas de estas herramientas celulares han sido purificadas y hoy son utilizadas para manejar o modificar, in vitro —es decir en el tubo de ensayo en el laboratorio— el DNA y el RNA de cualquier organismo. Las enzimas que tienen como sustrato los ácidos nucleicos son las herramientas fundamentales de la ingeniería genética, ya que a través de su uso es posible modificar y editar a nivel molecular el DNA de cualquier organismo. Los principales tipos de enzimas utilizadas en la ingeniería genética se describen a continuación. CUESTIONARIO DEL WORK PAPER Complementar la lectura en el capítulo II (páginas 57 a 84) de BOLÍVAR Z. Francisco. Fundamentos y casos exitosos de la biotecnología moderna. 2ª Edición. México 2.007. 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. Qué son las nucleasas y que función tienen Qué funciones cumplen las fosfatas, las cinasas y las ligasas del ADN Funciones de las polimerasas del ADN Qué técnicas existen para la generación y separación de fragmentos de ADN Cómo se realiza la síntesis química del ADN Explique acerca de la reacción en cadena de la polimerasa o PCR Qué características debe poseer el vector de clonación sea fácil de manejar Cómo se realiza la clonación molecular de ADN de un plásmido U N I V E R S I D A D D E 16 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA PROGRAMA DE CONTROL DE CALIDAD WORK PAPER # 3 TÍTULO: CIENCIA GENÓMICA, PROTEÓMICA Y BIOINFORMÁTICA EL GENOMA, EL TRANSCRIPTOMA Y EL PROTEOMA HUMANO FECHA DE ENTREGA: 4ª semana PERÍODO DE EVALUACIÓN: 5ª semana I. OBJETIVO GENERAL - Aplicar los conocimientos adquiridos esta unidad en la interpretación de los métodos para aislar, y manipular el ADN. II. FUNDAMENTO TEORICO GENES INTERRUMPIDOS EN EUCARIONTES; SÍNTESIS Y PROCESAMIENTO DE RNA El avance de las metodologías de la ingeniería genética, a principios de la década de los años ochenta en el siglo pasado, cataliza un esfuerzo muy importante encaminado al aislamiento y la caracterización de genes de organismos superiores incluyendo el humano, con el objetivo general de entender en detalle la organización y la expresión de los genes. Así, utilizando diferentes estrategias y metodologías, se aísla un primer conjunto de DNA complementarios a partir de copiar moléculas de RNA mensajeros específicos, los cuales fueron, a su vez, utilizados para aislar los genes correspondientes a partir directamente del DNA cromosomal. Sorpresivamente, muchos de los genes cromosomales de organismos superiores resultaron tener un mayor número de nucleótidos, es decir un mayor tamaño, que los DNA complementarios correspondientes utilizados para aislarlos. Tras un análisis cuidadoso de estos resultados, que incluyó la determinación de la secuencia del material genético, fue posible concluir que, a diferencia de las bacterias, la mayor parte de los genes que codifican para proteínas en los organismos superiores están constituidos por dos tipos de regiones de DNA. El primer tipo son regiones que codifican para una proteína, llamadas “exones”, y el segundo tipo son regiones de DNA que no codifican para esa proteína, a las cuales se les denominó “intrones”. El DNA complementario, obtenido a partir de RNA mensajeros, sólo lleva o está constituido por las regiones de DNA que son los exones, y por eso siempre es de menor tamaño que el gene a nivel del DNA cromosomal, el cual lleva también los intrones. Hoy sabemos que las células de organismos superiores, han desarrollado mecanismos muy sofisticados para procesar el RNA que se produce durante la transcripción de un gene en el núcleo de la célula. La transcripción del DNA en RNA, genera una molécula de RNA que es copia fiel del DNA transcrito. En el caso de las bacterias, las moléculas de RNA mensajero son directamente traducidas en proteínas. Sin embargo, en el caso de los organismos eucariontes, la mayor parte de los transcritos de RNA mensajero son procesados, para ser transformados en los RNA mensajeros maduros que se traducen en proteína a nivel de los ribosomas. Es importante señalar que en términos generales, el procesamiento del RNA premensajero, puede ser realizado de manera alternativa para el caso de varios genes, en cuanto a los fragmentos del RNA premensajero que son removidos. De hecho, se ha reportado que al menos 38% de los genes humanos que codifican para proteínas pudieran tener un procesamiento diferente y alternativo de su RNA premensajero, lo que implica que a partir de un RNA de este tipo se pudieran generar al menos dos U N I V E R S I D A D D E 17 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA RNA mensajeros diferentes (del mismo RNA premensajero) y de esta manera generar, a su vez, al menos dos proteínas diferentes a partir de un gene. EL GENOMA, EL TRANSCRIPTOMA Y EL PROTEOMA DEL ORGANISMO VIVO Con toda esta información y gracias al mejoramiento y sofisticación continuos de las técnicas del DNA recombinante, en particular la aparición de técnicas poderosas de amplificación de DNA (PCR) y de secuenciación automática de DNA, hoy es posible analizar, inclusive sin clonar, genes de cualquier organismo, incluyendo los del hombre. A través de ello, inició la etapa o la era del genoma, en la cual el esfuerzo ya no se concentra solamente en genes aislados, sino en el análisis del conjunto de todos los genes presentes en un organismo. En el caso de las bacterias, organismos unicelulares, su genoma lo conforman los 3 000 a 5 000 genes que se localizan en sus cromosomas, dependiendo de la especie. En el caso de los humanos, tenemos entre 20 000 y 25 000 genes que codifican para proteínas localizados en las 46 cintas de DNA, los 46 cromosomas que conforman nuestro genoma, que por cierto es diploide (23 pares de cromosomas), lo cual quiere decir que tenemos la información genética por duplicado, una parte proveniente de nuestro padre y la otra de nuestra madre. Al inicio de la era del genoma, el objetivo fue conocer primeramente cuál era la secuencia de nucleótidos de todos los genes de un organismo y con ello iniciar el análisis de cómo están organizados y localizados todos los genes en los cromosomas; es decir, el objetivo global era contribuir a determinar los “mapas genéticos” de los seres vivos. Asimismo, se busca también conocer cómo se regulan y en qué tipo de procesos celulares participan los genes y sus productos. En geografía, un mapa es la posición que guarda un país con respecto a los otros países en el planeta. En genética, un mapa es la posición que guarda un gene con respecto a los otros genes en las cintas de DNA que forman los cromosomas de un determinado organismo. El genoma es, pues, el conjunto de todos los pares de nucleótidos, que incluyen el total de los genes y otras secuencias de DNA que se encuentran en nuestros cromosomas. El transcriptoma es el conjunto de todos los transcriptos de RNA que se pueden generar a partir del genoma. Los transcriptos de RNA están involucrados en muchas funciones celulares ya sea directamente como moléculas biológicas activas de RNA, o indirectamente a través de las proteínas que codifican los RNA mensajeros. El conocimiento del genoma y de su transcripción han avanzado y hoy sabemos que existen además de los RNA ribosomales (rRNA) y de transferencia (tRNA), muchísimos transcritos de RNA pequeños tales como microRNA, iRNA, snRNA, codificados por genes que frecuentemente están entre genes que codifican para proteínas. Muchos de estos RNAs pequeños juegan papeles importantes en la regulación de la traducción de los RNA mensajeros de genes que codifican para proteínas. Además, algunos de estos RNAs pequeños aparentemente se asocian a la eucromatina inhibiendo la transcripción y se han asignado también posibles papeles en la diferenciación celular a estos RNA pequeños. Así, aparentemente el número de transcritos de RNA pequeños pudiera superar al de los transcritos de RNA mensajero en los genomas del eucarionte. El proteoma de un organismo es el conjunto de todas las proteínas que puede sintetizar ese organismo a partir de la información localizada en sus genes, que codifican proteínas. Los humanos tenemos poco más de veinte mil genes que codifican para proteínas en cada célula de nuestro organismo, lo cual implica que podemos fabricar en nuestro organismo al menos veinte mil proteínas (ya que el procesamiento diferencial de ciertos transcritos de RNA premensajeros de algunos genes humanos permitirá sintetizar más proteínas; ver más adelante). En cambio, las bacterias que tienen entre tres y cinco mil genes que codifican para proteínas en su genoma (dependiendo de la especie), no tienen intrones (por lo que no tienen procesamiento diferencial de sus transcritos de RNA), y por ello son capaces de sintetizar un proteoma de sólo 3000 a 5000 proteínas. CUESTIONARIO DEL WORK PAPER Complementar la lectura en el capítulo III (páginas 85 a 116) de BOLÍVAR Z. Francisco. Fundamentos y casos exitosos de la biotecnología moderna. 2ª Edición. México 2.007. 1. Realice un cuadro comparando genomas de distintos organismos 2. Qué son los microarreglos 3. A qué se refiere el genoma, el transcriptoma y el proteoma humano U N I V E R S I D A D D E 18 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. Qué características importantes presenta el genoma humano Cuál es el impacto de la información genómica en la salud Cómo se aplica el diagnóstico genético Realice un cuadro indicando unas 20 enfermedades genéticas más comunes A qué se refiere la farmacogenómica Cómo se realiza la terapia génica Esquematice el uso de los genes humanos en medicina U N I V E R S I D A D D E 19 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA PROGRAMA DE CONTROL DE CALIDAD WORK PAPER # 4 TITULO: MANIPULACIÓN GENÉTICA DE ANIMALES TRANSGÉNESIS Y CLONACIÓN FECHA DE ENTREGA: 10ª semana PERÍODO DE EVALUACIÓN: 11ª semana I. OBJETIVO GENERAL - Aplicar los conocimientos adquiridos esta unidad en la interpretación de los métodos de clonación y transgénesis. II. FUNDAMENTO TEORICO DISEÑO Y CONSTRUCCIÓN DE LOS PRIMEROS ANIMALES TRANSGÉNICOS El funcionamiento de los organismos vivos está gobernado por conjuntos de genes. Diferencias en su contenido, variaciones e incluso la manera en que se organizan éstos a lo largo de los cromosomas, determinan las características de cada una de las especies. Alterando esta disposición, se puede modificar el desempeño original de los organismos. La posibilidad de alterar este proceso puede darse al transferir un gene responsable de determinada característica en un organismo hacia otro, al cual se le pretende incorporar la nueva característica. De allí el nombre de organismo transgénico o genéticamente modificado (OGM). Este tipo de tecnología permite transferir información genética de plantas, bacterias o virus hacia otros organismos, combinar genes de vegetales con otros vegetales, de animales entre sí o de vegetales con animales, superando las llamadas “barreras naturales” que diferencian a unas especies de otras. Las técnicas para construir microorganismos transgénicos han sido descritas en capítulos anteriores y en éste nos concentraremos inicialmente en describir las técnicas involucradas en la construcción de animales transgénicos, y continuaremos con la descripción del uso de estos organismos. Los animales transgénicos son aquellos en los que al inicio de su desarrollo embrionario sus genomas fueron modificados por la inserción de fragmentos de DNA para introducir, eliminar, cambiar o combinar características genéticas deseables de la misma u otra especie. Los animales transgénicos se han empleado por años para estudiar la función de los genes o para generar modelos de estudio de enfermedades humanas. También han llegado a convertirse en biorreactores industriales productores de biológicos para uso humano, como son las hormonas y otras proteínas de importancia médica; e inclusive se están empleando en la producción de órganos, diseñados especialmente para transplantes y que no presentan los problemas del rechazo inmune. También han sido empleados en investigaciones sobre el desarrollo, las patologías y el diseño de tratamientos, entre otros. Uno más de los campos donde se está investigando intensamente es en el área pecuaria, generando transgénicos para el mejoramiento de la calidad y cantidad de los alimentos de origen animal. U N I V E R S I D A D D E 20 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA En la actualidad, los animales transgénicos aún no han sido tan estudiados como sus equivalentes en plantas, que incluso ya están en el mercado. Sin embargo, resultan muy relevantes por las contribuciones que aportan al avance del conocimiento de la fisiología y genética de los animales y sus extrapolaciones a la raza humana. En ciertos casos, los resultados que arrojan algunos modelos animales tradicionales empleados para investigar las causas y desarrollo de las enfermedades del hombre, no han sido favorables, y por ello se tiene que recurrir a realizar la investigación en otra especie o modelo con alguna característica especifica; es aquí donde el estudio de los animales transgénicos se diversifica y se profundiza. Los primeros adelantos que hicieron posible la transgénesis animal se remontan al desarrollo de las técnicas de ingeniería genética para la construcción de plásmidos recombinantes y de manipulación y cultivo de embriones. Los primeros ensayos para generar ratones transgénicos tuvieron su inicio en 1980, y consistieron en la inyección de DNA de ratón en uno de los pronúcleos (generalmente el masculino por ser el de mayor tamaño) de un cigoto de la misma especie. Con esto se inició una nueva era en la manipulación genética de embriones de mamíferos. En 1981 se demostró la integración y transmisión estable a través de la línea germinal de genes inyectados en pronúcleos de cigotos de ratón obtenidos por fertilización in vitro. El paso siguiente consistió en demostrar que también se podían obtener ratones transgénicos que incorporaran en su genoma un gene de otra especie. Pero tal vez el experimento más dramático consistió en demostrar que el producto de un transgene, el correspondiente a la hormona del crecimiento (GH), inducía un cambio fenotípico dramático en el ratón transgénico. CUESTIONARIO DEL WORK PAPER Complementar la lectura en el capítulo V (páginas 131 a 166) de BOLÍVAR Z. Francisco. Fundamentos y casos exitosos de la biotecnología moderna. 2ª Edición. México 2.007. 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. Cómo surge el auge de la transgénesis experimental Qué metodología se utiliza para la construcción de animales transgénicos Explique la técnica de la microinyección Explique la técnica de la sonicación y electroporación Explique los métodos químicos usados en la transgenie Cómo se utilizan los virus y células estaminales en la transgenie Con qué fines se construyen animales transgénicos, explique dos en el campo de la investigación 8. De ejemplos explicando la utilización de los animales transgénicos con fines comerciales 9. Cómo se aplica la industria biotecnológica de animales transgénicos 10. Explique los distintos métodos de clonación y las aplicaciones de la clonación U N I V E R S I D A D D E 21 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA PROGRAMA DE CONTROL DE CALIDAD WORK PAPER # 5 TÍTULO: PLANTAS TRANSGÉNICAS FECHA DE ENTREGA: 10ª semana. PERÍODO DE EVALUACIÓN: 11ª semana I. OBJETIVO GENERAL - Aplicar los conocimientos adquiridos esta unidad en la interpretación del fundamento de las plantas transgénicas. II. FUNDAMENTO TEORICO LA IMPORTANCIA DE LAS TÉCNICAS DE FITOMEJORAMIENTO PARA INCREMENTAR LA PRODUCCIÓN AGRÍCOLA La permanente necesidad de disponer de satisfactores que atiendan las demandas humanas de alimento, vestido y obtención de materias primas para la elaboración de diversos productos, ha sido la causa de que, desde el surgimiento de la agricultura, las plantas de interés para el hombre hayan sido cultivadas, seleccionadas y consecuentemente mejoradas en características tales como mayor rendimiento, calidad nutricional, facilidad de cultivo y resistencia a los agentes bióticos o abióticos que las afectan. El fitomejoramiento tiene sus bases en los experimentos realizados hace más de un siglo por Gregor Mendel, en los que concluyó que las características de los organismos están dadas por factores discretos heredables (genes), y no son resultado, como se creía anteriormente, de la mezcla azarosa de las cualidades de los progenitores. Con este conocimiento comenzó, entre los cultivos de mayor importancia, el método tradicional de producción de cultivares mejorados mediante cruzas dirigidas entre individuos, de la misma especie o de especies estrechamente relacionadas. Los individuos sobresalientes son seleccionados en ciclos subsecuentes de cultivo, hasta que después de numerosos eventos de cruzas y retrocruzas, aunadas a laboriosas pruebas de campo, se obtiene una generación portadora de la característica deseada que es reconocida como una nueva variedad. Todo el proceso de selección va acompañado de colectas, tanto de semillas como de plantas completas, que son almacenadas en bancos de germoplasma quedando a disposición para posteriores usos. Cabe destacar que una importante limitante de todo proyecto de producción de nuevas variedades vegetales es la incompatibilidad sexual entre las especies de plantas seleccionadas como progenitores y que, si la divergencia genética entre las especies involucradas es muy grande, la probabilidad de obtener semillas viables de tal cruza es demasiado baja y mayor será el número de generaciones requerido para incorporar en la progenie el carácter elegido. La técnica descrita, también conocida como fitomejoramiento tradicional, se ha empleado ancestralmente y sus logros resultan innegables. Sin embargo, dichos métodos, además de resultar ya insuficientes para incrementar la producción agrícola a un ritmo que permita satisfacer la creciente demanda de alimentos impuestas por el permanente crecimiento demográfico, tienen el inconveniente de haber producido variedades vegetales extremadamente dependientes de agroquímicos, cuyo uso desmedido impacta negativamente al ambiente. U N I V E R S I D A D D E 22 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA Los objetivos principales de los programas de fitomejoramiento actuales siguen siendo aumentar el rendimiento, disminuir las pérdidas ocasionadas por plagas y enfermedades y reducir los costos de producción. Sin embargo, ahora también se tiene interés de emplear los cultivos agrícolas para generar productos de alto valor agregado para usos en la industria química, alimenticia y farmacéutica. Así, hoy en día la ingeniería genética, definida como la manipulación en el laboratorio de la información genética de un organismo utilizando las técnicas de la biología molecular, se presenta como una poderosa alternativa para obtener cultivares transgénicos que superen en su productividad y calidad a sus contrapartes obtenidas por métodos tradicionales. La ingeniería genética permite el acceso y la manipulación directa de la información genética de cualquier ser vivo, e incluso posibilita la creación de genes sintéticos. Por ello, esta tecnología, rompe con las barreras impuestas por la incompatibilidad sexual y hace posible introducir en plantas, genes provenientes no sólo de otras especies vegetales evolutivamente distantes, sino incluso de hongos, virus, bacterias y animales; esta modificación se lleva a cabo en un ciclo. Lo anterior se basa en el principio de que el código genético de los organismos vivos es universal. Es por ello que la obtención de plantas transgénicas (portadoras de un gene ajeno o heterólogo) empleando alguna de las técnicas disponibles para tal efecto, representa hoy en día uno de los medios más versátil y preciso para producir variedades vegetales mejoradas. MÉTODOS DE TRANSFORMACIÓN GENÉTICA DE PLANTAS Con las metodologías del DNA recombinante ahora es posible la producción de organismos modificados genéticamente o transgénicos, en los que se han insertado genes heterólogos mediante su manipulación en el laboratorio. Particularmente en plantas, el poder introducir nueva información genética requiere que se cumpla con los siguientes dos requisitos: a) disponer de un método para la regeneración in vitro de la especie de interés, y b) contar con un método de transformación eficiente para la misma. Puesto que las técnicas de cultivo de tejidos hacen posible que a partir de cualquier célula o tejido se puedan regenerar plantas completas, su uso resulta indispensable para la regeneración de individuos transgénicos que contengan la nueva información genética. En lo que a transformación se refiere, es necesario contar con un método que permita tanto la introducción del material genético que se pretende incorporar, como su integración estable, funcional y heredable en el genoma vegetal. Las plantas transgénicas que se han logrado obtener a la fecha, provienen del uso de diversos métodos de transformación genética. Entre ellos se tiene un método biológico y por lo tanto natural, basado en el empleo de una bacteria que vive en todos los suelos del mundo llamada Agrobacterium tumefaciens. Debido a que inicialmente se pensó que el sistema basado en Agrobacterium sólo se podía aplicar a un número limitado de especies vegetales (ahora se sabe que puede no sólo transformar todas las especies vegetales sino también otros organismos como hongos), surgió la necesidad de desarrollar métodos de transformación genética alternativos. Entre estos métodos alternativos se pueden mencionar protocolos fisicoquímicos de transformación directa, como la electroporación de protoplastos y los tratamientos con polietilenglicol y cloruro de calcio, y métodos físicos, como el bombardeo con micropartículas recubiertas de DNA. CUESTIONARIO DEL WORK PAPER Complementar la lectura en el capítulo VI (páginas 167 a 193) de BOLÍVAR Z. Francisco. Fundamentos y casos exitosos de la biotecnología moderna. 2ª Edición. México 2.007. 1. Cómo se realiza el fitomejoramiento mediante ingeniería genética 2. Qué es la biobalística 3. Indique y explique las aplicaciones de la genética de plantas 4. Explique a qué se refiere las plantas como biorreactores 5. Cómo se realiza la producción de vacunas orales en plantas transgénicas U N I V E R S I D A D D E 23 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA 6. Qué aspectos de bioseguridad están relacionados con la siembra y consumo de productos transgénicos 7. Qué aspectos éticos deben comentarse y mencionarse sobre la producción y uso de plantas transgénicas y su posible efecto en la biodiversidad U N I V E R S I D A D D E 24 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA ROGRAMA DE CONTROL DE CALIDAD WORK PAPER # 6 TÍTULO: INGENIERÍA BIOQUÍMICA FECHA DE ENTREGA: 10ª semana PERÍODO DE EVALUACIÓ: 11ª semana I. OBJETIVO GENERAL - Estudiar los fundamentos de la ingeniería genética. II. FUNDAMENTO TEORICO LA MISIÓN DE LA INGENIERÍA BIOQUÍMICA Como ha sido señalado en capítulos anteriores, la biotecnología tiene como característica inherente conjuntar diferentes disciplinas del conocimiento para aprovechar las capacidades de seres vivos con la finalidad de proporcionar bienestar al ser humano. Una de estas disciplinas es la ingeniería bioquímica, la cual estudia el procesamiento de materiales de origen biológico para generar bienes y servicios. Los materiales biológicos que competen a la ingeniería bioquímica son primordialmente aquellos derivados de microorganismos, células, o sus partes. La ingeniería bioquímica se distingue de otras disciplinas afines de la biología por la aplicación de principios físicos y químicos para lograr una comprensión cuantitativa de las transformaciones biológicas. El objetivo de la ingeniería bioquímica es contribuir a la generación de productos a los menores costos, mejor calidad y mayor seguridad posibles tanto para el ser humano como para el medio ambiente. Para esto, el tema central de atención es el diseño y operación de bioprocesos eficientes y reproducibles mediante la integración de las ciencias biológicas con diversas ingenierías como la mecánica, eléctrica, económica e industrial. El presente capítulo ofrece una perspectiva general de la ingeniería bioquímica, resumiendo algunos temas principales de esta disciplina, tales como la estequiometría y la cinética del crecimiento celular y producción de productos, los fenómenos de transportes aplicados al diseño de biorreactores, el escalamiento, la instrumentación y el control de bioprocesos. A lo largo de las diversas secciones se presentan los conceptos más relevantes, ofreciendo en la medida de lo posible ejemplos específicos de casos representativos. El capítulo es sólo una introducción somera ya que las materias tratadas son amplias y complejas, por lo que muchas de éstas requieren descripciones más profundas y completas para una descripción cabal. Además, varios temas fundamentales de la ingeniería bioquímica, tales como catálisis enzimática, las bioseparaciones y la economía de bioprocesos, no son abordados. LOS ORÍGENES DE LA INGENIERÍA BIOQUÍMICA Y LOS BIOPROCESOS La ingeniería bioquímica e ingeniería de bioprocesos son disciplinas relativamente recientes. Surgen de la microbiología industrial y tienen como cimiento la combinación de los principios de las ingenierías química y mecánica con los de la microbiología, bioquímica y biología. U N I V E R S I D A D D E 25 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA Entre los primeros bioprocesos desarrollados se encuentra el tratamiento de aguas de desecho. Hacia 1850, era práctica común en Inglaterra rociar campos con efluentes municipales como método para su eliminación. De ahí surgieron inicialmente los primeros filtros percoladores; sin embargo, el aumento continuo de los volúmenes a tratar hacía necesarios métodos más intensivos. Surgió así la aireación de las aguas de desecho como método para eliminar olores desagradables. Más tarde se empezaron a operar los reactores de forma cíclica (llenado y vaciado), permitiendo que la biomasa adherida a paredes no escapara del tanque de oxidación, con lo que se lograba mejorar sustancialmente la eficiencia del tratamiento. La aplicación de conceptos incipientes de diseño de reactores y estrategias de operación condujo en 1912 al desarrollo de los sistemas de tratamiento de aguas por lodos activados, principio que hasta la fecha aún se usa. Además de los tratamientos aerobios (en presencia de oxígeno), ya desde finales del siglo XIX se producía biogas al tratar aguas de desecho mediante fosas sépticas en China e India, dos de los países que en la actualidad más han explotado la digestión anaerobia a gran escala. Sistemas tecnificados de digestión anaerobia (en ausencia de oxígeno) empezaron a aparecer desde los años 1930’s en Inglaterra y Alemania. En la actualidad, los sistemas de tratamiento de aguas constituyen los bioprocesos más grandes del mundo ya que el volumen de los reactores empleados fácilmente rebasa los millones de litros. Otro proceso que data de principios del siglo XX es la producción de proteína de origen microbiano llamada también unicelular como suplemento alimenticio. La primera producción industrial de proteína unicelular para propósitos nutritivos se remonta a la Alemania de la primera Guerra Mundial. A mediados de los años treinta, durante la segunda Guerra Mundial, Alemania ya producía 15 000 toneladas por año de levadura que era utilizada en dietas tanto de civiles como de militares. Hacia mediados de los años setenta, el proceso de producción de proteína unicelular se constituye como una verdadera insignia de la ingeniería de bioprocesos ya que representa la escala más grande alcanzada para una fermentación axénica (población de una sola especie de microorganismo, a diferencia de los sistemas de tratamiento de aguas que están basados en poblaciones mixtas), con una producción de 15 000 toneladas al año en un solo fermentador de 1 500 metros cúbicos de volumen y 60 metros de alto. El proceso se basaba en la producción de levaduras metilotróficas como Methylophilus methylotropus que utilizan metanol derivado del petróleo como fuente principal de carbono. El caso de la proteína unicelular es quizás uno de los ejemplos más espectaculares de la ingeniería bioquímica, por lo monumental de las instalaciones, procesos, equipos y servicios requeridos, así como por el reto que consistió el traslado de los estudios experimentales iniciales en fermentadores de 5 L al complejo industrial de gran escala. Asimismo, el proceso de producción de proteína unicelular también representa una de las lecciones más interesantes sobre lo crítico que pueden resultar las interrelaciones técnicas y económicas, ya que finalmente el aumento en el precio del petróleo y la disponibilidad de otras fuentes de proteína vegetal más baratas, tales como la soya, ocasionaron que el proceso perdiera viabilidad comercial. CUESTIONARIO DEL WORK PAPER Complementar la lectura en el capítulo IX (páginas 249 a 297) de BOLÍVAR Z. Francisco. Fundamentos y casos exitosos de la biotecnología moderna. 2ª Edición. México 2.007. 1. 2. 3. 4. Cómo es actualmente la ingeniería bioquímica moderna Cuáles son las principales disciplinas que sustentan a la ingeniería bioquímica Qué ámbitos de estudios competen a la ingeniería bioquímica moderna Cómo se realiza el cultivo de microorganismos, células y tejidos para la regeneración de productos 5. Cómo se aplica la cinética del crecimiento celular y producción de metabolitos 6. A qué se refiere el traslado del laboratorio a la industria 7. Cómo se realiza la instrumentación, control y optimización de los bioprocesos U N I V E R S I D A D D E 26 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA VIII. GIP´S PROGRAMA DE CONTROL DE CALIDAD GUÍA DE INVESTIGACIÓN PRÁCTICA - GIP # 1 TÍTULO: PREPARACIÓN DE SOLUCIONES A UTILIZAR EN EL LABORATORIO DE BIOTECNOLOGÍA FECHA DE ENTREGA: 1ª y 2ª semana PERÍODO DE EVALUACIÓN: 3ª semana I. OBJETIVO GENERAL - Aplicar los conocimientos adquiridos en la preparación correcta de las soluciones a utilizarse en la asignatura durante el semestre. II. FUNDAMENTO TEORICO SOLUCIÓN QUÍMICA: Es una mezcla homogénea de dos o más sustancias. La sustancia disuelta se denomina soluto y está presente generalmente en pequeña cantidad, en comparación con la sustancia donde se disuelve denominada solvente. La concentración de una solución expresa la relación de la cantidad de soluto a la cantidad de solvente. Las soluciones poseen una serie de propiedades que las caracterizan: 1. Su composición química es variable. 2. Las propiedades químicas de los componentes de una solución no se alteran. 3. Las propiedades físicas de la solución son diferentes a las del solvente puro: la adición de un soluto a un solvente aumenta su punto de ebullición y disminuye su punto de congelación; la adición de un soluto a un solvente disminuye la presión de vapor de éste. CLASES DE DISOLUCIONES: De acuerdo con la concentración de las soluciones, ellas pueden ser analizadas en términos cualitativos y cuantitativos dependiendo de su estado: A. Disoluciones empíricas o Cualitativas: No toman en cuenta la cantidad numérica de soluto y disolvente presentes, y dependiendo de la proporción entre ellos se clasifican de la siguiente manera: Disolución diluida: Es aquella en donde la cantidad de soluto que interviene está en mínima proporción en un volumen determinado. Disolución concentrada: Tiene una cantidad considerable de soluto en un volumen determinado. Disolución insaturada: No tiene la cantidad máxima posible de soluto para una temperatura y presión dados. Disolución saturada: Tienen la mayor cantidad posible de soluto para una temperatura y presión dadas. En ellas existe un equilibrio entre el soluto y el solvente. Disolución sobresaturada: es la solución en la cual no es posible disolver más soluto. U N I V E R S I D A D D E 27 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA B. Disoluciones valoradas o Cuantitativas: A diferencia de las disoluciones empíricas, las disoluciones valoradas cuantitativas, sí toman en cuenta las cantidades numéricas exactas de soluto y solvente que se utilizan en una disolución. Este tipo de clasificación es muy utilizada en el campo de la ciencia y la tecnología, pues en ellas es muy importante una alta precisión. Las medidas más utilizadas para expresar la concentración de las disoluciones cuantitativas son: a. Porcentaje masa a masa (%m/m) b. Porcentaje masa a Volumen (%m/v) c. Porcentaje Volumen a Volumen (%v/v) d. Partes por Millón (ppm) e. Molaridad (M) f. Normalidad (N) g. Molalidad (m) h. Fracción Molar (f molar) MATERIALES. 1.- Balanza analítica. 2.- Matraces aforados de 100 ml. 3.- Vaso de precipitado varias medidas. 4.- Probeta de 20, 50 y 100 ml. 5.- Varillas de vidrios. 6.- Espátulas. 7.- Pipeta de 1, 2 y 5 ml. 8.- Propipetas. 9.- Picetas. 10.- Cajas Petri 11.- Vidrio reloj 12.- Embudos de vidrio 13.- Pipetas Pasteur PARA ESTA PRÁCTICA TRAER: De acuerdo al número de estudiantes y grupos de prácticas, los grupos tendrán que traer en la 2da semana: • 3 frascos de vidrio de 100 ml, color ámbar, tapa rosca y etiquetas • 100 g de glucosa en polvo (A1, B1, C1) • 100 ml de etanol al 70% (A2, B2, C2) • 100 ml de alcohol isopropílico (A3, B3, C3) PROCEDIMIENTO. REALIZAR TODOS LOS CÁLCULOS PARA LA PREPARACIÓN DE 100 ml DE SOLUCIÓN: 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. Solución de Glucosa al 0,60 M Solución de Glucosa al 1,40 M Hidróxido de sodio al 0,75 M Hidróxido de sodio al 5 % Acetato de sodio 1,5 M Sulfato cúprico al 1 % Permanganato de potasio al 0,05 M U N I V E R S I D A D D E 28 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA 8. Etanol al 50 % a partir de etanol al 70 % 9. Alcohol Isopropílico al 40 % a partir de alcohol isopropílico al 90% 10. Ácido clorhídrico 2 M a partir de una solución concentrada al 42,5% de pureza y una densidad de 1,35 g/ml RESULTADOS. CUESTIONARIO. 1. Investigue fundamento de soluciones o reactivo trabajo, para realizar: uremia, proteinemia y albuminemia. 2. Convierta la concentración del NaOH al 5% en molaridad, y convierta también el NaOH 0,75 M a %. 3. Prepare 250 ml de ácido sulfúrico 1 M a partir de un ácido concentrado al 40% y densidad 1,5 g/ml 4. Investigue y explique la utilidad de la cromatografía en las soluciones 5. Investigue y explique las diferentes unidades químicas para expresar la concentración de las soluciones 6. Investigue y explique las diferentes unidades físicas para expresar la concentración de las soluciones 7. ¿Qué es una dilución? ¿En el laboratorio de serología para qué se utiliza? 8. Si tenemos permanganato de potasio al 0,05 M y se realizan sucesivas diluciones 1/2, 1/4, 1/8, 1/16, cuanto será la molaridad de cada una de las diluciones? 9. Indique al menos 3 factores que afectan la solubilidad de las soluciones. 10. Realice un cuadro con ejemplos de soluciones: sólido-sólido, sólido-líquido, sólido-gas; líquido-sólido, líquido-líquido, líquido-gas; gas-sólido, gas-líquido, gas-gas. U N I V E R S I D A D D E 29 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA PROGRAMA DE CONTROL DE CALIDAD GUÍA DE INVESTIGACIÓN PRÁCTICA - GIP # 2 TÍTULO: LAS LEVADURAS COMO ESPONJANTE DE LA MASA PANARIA FECHA DE ENTREGA: 3ª semana PERÍODO DE EVALUACIÓN: 4ª semana COMPETENCIAS Aplica los conocimientos adquiridos sobre la intervención de los microorganismos en los procesos de fermentación para obtener un producto determinado. INDICADORES Prepara cuatro masas panarias con diferentes cantidades de ingredientes cada una. Compara los volúmenes alcanzados por cada masa y explica la razón de las diferencias. I. OBJETIVO GENERAL - Evaluar el papel que desempeñan los microorganismos (levaduras) como esponjante de la masa panaria. II. FUNDAMENTO TEORICO A partir de harina de trigo y de una suspensión de levadura se prepara la masa, a la que se añade glucosa o sacarosa. Se vierte en la probeta y en ella se determina cuantitativamente la esponjosidad de la masa por el aumento de volumen que experimenta. Es una medida de la fuerza de la levadura. Duración 1,5 horas. MATERIALES y EQUIPOS. Levadura (Saccharomyces cerevisiae) Glucosa o sacarosa Harina de trigo 4 vasos de precipitados de 250 ml 4 probetas de 250 ml 1 matraz Erlenmeyer de 250 ml 2 probeta de 50 ml 1 probeta de 100 ml 1 balanza de precisión 4 espátula 4 varillas de vidrio 2 Picetas con agua destilada 4 cajas Petri PARA ESTA PRÁCTICA TRAER: • 200 g de harina • 20 g de glucosa en polvo U N I V E R S I D A D D E 30 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA • 20 g de levaduras PROCEDIMIENTO. - Numerar los vasos precipitados de 1 a 4 Añadir a cada uno 50 g de gramo de harina Añadir 10 g de glucosa (o sacarosa) a cada vaso de 1-3 Vaso 1 añadir 45 ml de agua Vaso 2 añadir 30 ml de agua Preparar la suspensión de levaduras: suspender por agitación 20 g de levadura + 200 ml de agua en el matraz Erlenmeyer. Pasar la suspensión de levadura: vaso 1 15 ml. Vaso 2 30 ml. Vaso 3 60 ml. Vaso 4 60 ml Mezclar la masa con la varilla de vidrio Numerar las probetas 1-4 Añadir la masa a las probetas correspondientes Leer y anotar la altura de la masa en cada probeta al principio y a intervalos de 10 minutos, durante 30 minutos RESULTADOS. CUESTIONARIO. 1.- Investigue otras especies de Saccharomyces. 2.- En la práctica realizada, ¿mencione y explique al menos 3 factores que pueden haber influido en los resultados? 3.- En la práctica ideal, ¿explique cuál de las probetas debió alcanzar el mayor volumen? 4.- En la práctica, ¿cuál podría ser la diferencia en los resultados si se utilizará azúcar común (sacarosa) en lugar de glucosa? 5.- Qué productos metabólicos sintetiza Saccharomyces cerevisiae? 6.- Saccharomyces cerevisiae también es capaz de fermentar almidón? La fermentación de almidón, ¿se realiza gracias a cuál enzima? 7.- ¿De qué depende el aumento del volumen de las masas, en la práctica realizada? 8.- En las fermentaciones alcohólicas, la cantidad de CO2, eliminado, ¿con qué compuesto se halla relacionado? 9.- Realice con fórmulas químicas la glucólisis. 10.- Realice con fórmulas químicas el ciclo de Krebs. U N I V E R S I D A D D E 31 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA PROGRAMA DE CONTROL DE CALIDAD GUÍA DE INVESTIGACIÓN PRÁCTICA - GIP # 3 TÍTULO: PREPARACIÓN DE LECHE ÁCIDA: YOGURT FECHA DE ENTREGA: 4ª semana PERÍODO DE EVALUACIÓN: 5ª semana I. OBJETIVO GENERAL - Obtener leche ácida a través de la intervención de microorganismos que fermentan azucares. II. FUNDAMENTO TEORICO Se inocula y se incuba la leche fresca pasteurizada con el cultivo iniciador del yogurt. Las bacterias lácticas presentes en el yogurt producen ácido láctico a partir del azúcar de la leche. El ácido láctico libera caseína y la precipita. Duración 20 horas. MATERIALES y EQUIPOS. Mechero Trípode Malla de amianto Termómetro Algodón Alcohol Hornilla eléctrica PARA ESTA PRÁCTICA TRAER: • 1 litro de leche pasteurizada • 6 cucharadas de leche en polvo • 1 vasito con yogurt natural • 1 termo con capacidad mínima de un litro *imprescindible para realizar la práctica* • 1 olla casera de al menos un litro • 1 cuchara grande para batir PROCEDIMIENTO. 1.-Colocar en un recipiente un litro de leche y llevar a fuego lento hasta que llegue a los 45º C 2.- Agregar 6 cucharadas de leche entera en polvo y mezclar hasta homogeneizar completamente. 3.- Agregar el contenido de un vasito de yogurt natural que contenga los lactobacilos requeridos. Mezclar y homogeneizar. U N I V E R S I D A D D E 32 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA 4.-Verter la mezcla en un termo e incubar durante 10 horas. 5.- Pasada las 10 horas verter en un recipiente abierto y llevar a refrigerar, en ese instante se puede añadir los saborizantes, colorantes, esencias y frutas deseadas. 6.- Dejar en la heladera otras 10 horas, para poder consumir el producto. RESULTADOS. CUESTIONARIO. 1.- Cuál es la importancia reconocida al lactobacillus bulgaricus, y en qué país desarrolla mejor, por qué? 2.- Qué diferencias existe entre probiótico y prebiótico, de ejemplos de cada uno. 3.- Qué sucedería si se incumplen las horas de incubación en el termo. 4.- Explique mediante fórmulas y reacciones químicas la fermentación láctica. 5.- Qué es el yogurt griego y por qué se llama así? 6.- Investigue el nombre de las bacterias lácticas termófilas que se hallan en el cultivo iniciador (yogurt)? 7.- ¿Según su experiencia, qué tipos de yogures podría preparar su grupo y como lo haría? 8.- Qué acción o efecto ocasiona el enfrío brusco? ¿Y por qué es necesario este paso? 9.- Investigue como se preparan el yogurt en alguna industria local 10.- Dibuje las bacterias que se utilizan en la preparación de leche ácida, son Gram (+) o Gram (-)? U N I V E R S I D A D D E 33 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA PROGRAMA DE CONTROL DE CALIDAD GUÍA DE INVESTIGACIÓN PRÁCTICA - GIP # 4 TÍTULO: AUTOCALENTAMIENTO DEL HENO A PARTIR DE BACTERIAS TERMÓFILAS FECHA DE ENTREGA: 6ª y 7ª semana PERÍODO DE EVALUACIÓN: 8ª semana I. OBJETIVO GENERAL - Evaluar el mecanismo involucrado en los microorganismos termófilos en la generación de calor, explicando el fundamento. II. FUNDAMENTO TEORICO El heno fresco se humedece artificialmente, se introduce en el termo que se cierra herméticamente. Comenzará el desarrollo de bacterias termófilas. El autocalentamiento se podrá observar por el aumento de temperatura producido en el interior del recipiente. Duración 12 días. MATERIALES y EQUIPOS. Heno secado al aire - peptona 10 g - lactosa o leche en polvo 10 g - fructosa o azúcar 5 g - agua 500 ml 2 probetas de 250 o 500 ml 4 vasos precipitados o metálicos de 500 ml 4 espátulas 4 varillas de vidrio 1 bolsa de algodón 1 termo 2 termómetros 4 cajas Petri 2 Picetas con agua PARA ESTA PRÁCTICA TRAER: • Una bolsa de heno seco, cortado *imprescindible para hacer la práctica* • Un termo que no vayan a usar durante dos semanas • Algodón • 5 gramos de azúcar • 10 g leche en polvo U N I V E R S I D A D D E 34 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA PROCEDIMIENTO. - Cortar el heno en fragmentos de unos 3 cm de longitud Macerar en el medio de cultivo durante una hora aproximadamente Colocar en el termo una capa de algodón Extraer el heno del medio de cultivo, dejarlo escurrir y colocarlo en el termo entre varias capas de algodón Introducir el termómetro en la capa de heno y medir la temperatura inicial Dejar incubar en el termo durante 12 días. Medir la temperatura del heno en el interior del termo cada 2 días hasta el día 12 Elaborar un gráfico día vs temperatura y explicar. RESULTADOS. CUESTIONARIO. 1.- Cuál es considerada la bacteria más resistente del mundo según el Libro Guinness de los Records? 2.- Investigue acerca de la bacteria Thermus aquaticus? 3.- ¿Qué interés industrial o práctico, tiene la presente práctica? 4.- Verifique y explique por qué sucede el aumento de temperatura? 5.- De acuerdo a su práctica indique cuanto °C alcanzó el calentamiento entre el 6º y el 10º día de espera. ¿Hasta qué temperatura llego el último día? 6.- Investigue qué tipo de bacterias termófilas son las que se encuentran en el heno. 7.- Investigue acerca del Dominio Archeae. 8.- ¿Cuántos tipos de células procariotas existen, explique las diferencias? 9.- Cuánto debió ser la temperatura máxima alcanzada por las bacterias termófilas del heno…. ¿Su grupo de práctica alcanzó esa temperatura… si, no por qué? 10.- Investigue los siguientes organismos extremófilos: Acidófilo. Barófilo. Endolito. Halófilo. Hipertermófilo. Hipolito. Litoautotrofo. Metalotolerante. Oligotrofo. Osmófilo. Poliextremófilo. Psicrófilo o criófilo. Radio-resistente. Termófilo. Xerófilo. U N I V E R S I D A D D E 35 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA PROGRAMA DE CONTROL DE CALIDAD GUÍA DE INVESTIGACIÓN PRACTICA - GIP # 5 TÍTULO: EXTRACCIÓN DE ADN A PARTIR DE UNA MUESTRA VEGETAL FECHA DE ENTREGA: 8ª semana de clases PERÍODO DE EVALUACIÓN: 9ª semana I. OBJETIVO GENERAL - Desarrollar técnicas convencionales para la extracción de ADN de una muestra vegetal. II. FUNDAMENTO TEORICO La extracción de ADN de una muestra celular se basa en el hecho de que los iones salinos son atraídos hacia las cargas negativas del ADN, permitiendo su disolución y posterior extracción de la célula. Se empieza por lisar (romper) las células mediante un detergente, vaciándose su contenido molecular en una disolución tampón en la que se disuelve el ADN. En ese momento, el tampón contiene ADN y todo un surtido de restos moleculares: ARN, carbohidratos, proteínas y otras sustancias en menor proporción. Las proteínas asociadas al ADN, de gran longitud, se habrán fraccionado en cadenas más pequeñas y separadas de él por acción del detergente. Sólo queda, por tanto, extraer el ADN de esa mezcla de tampón y detergente, para lo cual se utiliza alcohol isoamílico o isopropílico. MATERIALES Y REACTIVOS. Muestra vegetal 1,5 g Cloruro de sodio 5 g Bicarbonato de sodio 5 ml Lauril sulfato de sodio 120 ml Agua 50 ml Alcohol isopropílico 1 centrífuga 1 matraz Erlenmeyer 250 ml 2 Picetas con agua 4 cajas Petri 2 espátulas 1 probeta de 250 ml 4 morteros con pilones 4 varillas de vidrio 8 pipetas Pasteur 4 probetas de 10 ml 8 tubos grandes de 20 ml 8 tubos de centrífuga U N I V E R S I D A D D E 36 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA 2 gradillas PARA ESTA PRÁCTICA TRAER: • Para esta práctica traer cada subgrupo una muestra vegetal distinta…. • 50 ml de champú • Alcohol isopropílico PROCEDIMIENTO. 1. Preparar el tampón con los siguientes reactivos y mantener en la nevera o en un baño de hielo triturado: − 120 ml de agua destilada − 1,5 g de NaCl, preferiblemente puro. − 5 g de bicarbonato sódico. − 5 ml de detergente líquido. 2. Elegir la muestra que va a proporcionar el ADN entre los vegetales y cortar en cuadraditos unos 2030g. 3. Triturar la muestra con un poco de agua en el mortero. Así se romperán muchas células. 4. Mezclar en un recipiente limpio 5 ml del triturado celular con 10 ml del tampón y agitar vigorosamente durante 5 minutos. Separar después los restos vegetales más grandes del caldo molecular centrifugando a baja velocidad por 5 minutos y después pipetear el sobrenadante. 5. Retirar 5 ml del caldo molecular a un tubo de ensayo y añadir 5 ml de alcohol isopropílico enfriado a 0ºC. Se debe dejar escurrir lentamente el alcohol por la cara interna del recipiente, teniendo éste inclinado. El alcohol quedará flotando sobre el tampón. 6. Introducir una varilla estrecha hasta justo debajo de la separación entre el alcohol y el tampón. Remover la varilla hacia delante y hacia atrás y poco a poco se irán enrollando los fragmentos de mayor tamaño de ADN. Pasado un minuto retirar la varilla atravesando la capa de alcohol con lo cual el ADN quedará adherido a su extremo con el aspecto de un copo de algodón mojado. O en algunos casos caerá y se observará como una neblina. RESULTADOS. CUESTIONARIO. 1. ¿Explique en forma resumida la función de cada paso realizado en el procedimiento de la extracción de ácidos nucleicos? 2. ¿Dibuje todas las bases nitrogenadas y azúcares que conforman los ácidos nucleicos? 3. En cuanto a las mutaciones, investigue cuáles aminoácidos son sustituidos para que se produzca la anemia de células falciformes y el enanismo acondroplásico y en qué tripletes se localizan estos cambios. 4. Investigue como se realiza la extracción de genes en Ingeniería Genética 5. Investigue en ingeniería genética, como se introduce un nuevo gen de una especie a otra. 6. Explique de forma esquemática: Duplicación, Transcripción, Traducción. 7. Recorte un cuadro del código genético, y explique cómo se lo utiliza. 8. Investigue acerca de la enzimas de restricción o endonucleasas, tipos y funciones de éstas. 9. Indique utilizando el código genético, que aminoácidos corresponden a los siguientes tripletes o codones de bases nitrogenadas: U-U-A; C-U-G; G-G-G; CUA; UGA. 10. Realice la fórmula química de los aminoácidos con cadenas laterales alifáticas. U N I V E R S I D A D D E 37 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA PROGRAMA DE CONTROL DE CALIDAD GUÍA DE INVESTIGACIÓN PRACTICA - GIP # 6 TITULO: IDENTIFICACIÓN DE ÁCIDO ASCÓRBICO EN CÁSCARA DE NARANJA FECHA DE ENTREGA: 9ª semana PERÍODO DE EVALUACIÓN: 10ª semana I. OBJETIVO GENERAL - Identificar la presencia de ácido ascórbico obtenido de la maceración de las cáscaras de naranja. II. FUNDAMENTO TEORICO El ácido ascórbico, es un nutriente esencial para los humanos. Una baja ingesta causa una enfermedad, por deficiencia, conocida como escorbuto. Este ácido está presente en forma natural en muchas frutas y verduras, además, estos alimentos son ricos en vitaminas antioxidantes, compuestos fenólicos y carotenos. La FDA, clasifica al ácido ascórbico sintético como un aditivo alimenticio generalmente reconocido como seguro. Se adiciona a una amplia variedad de alimentos, tanto por razones nutricionales como técnicas. Entre las funciones del ácido ascórbico, están la fijación del oxígeno: cuando los alimentos se embotellan o se enlatan estos contienen oxígeno, que podría reaccionar con varias moléculas del alimento, provocando rancidez, pérdida de color, entre otras características. Al agregar ácido ascórbico, este fija o elimina el oxígeno. Además, la fijación de radicales libres y control del pardeamiento, hacen que esta vitamina sea uno de los aditivos más empleados en la industria de los alimentos. MATERIALES Y REACTIVOS. Permanganato de potasio Papel pH en tiras 2 Picetas con agua destilada 1 matraz Erlenmeyer de 250 ml 4 mecheros de alcohol 4 trípodes 4 malla de amianto 4 vasos precipitados de 250 ml 4 pinzas de madera 12 tubos de ensayo 2 gradillas 4 embudos de plástico 16 papel filtro circular U N I V E R S I D A D D E 38 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA 8 pipetas Pasteur PARA ESTA PRÁCTICA TRAER: • • Para esta práctica traer cáscara de naranja macerada en alcohol al 50 % por un lapso de 4-5 días. El permanganato de potasio preparado en la primera práctica PROCEDIMIENTO. • • • • • • Filtrar el macerado. Del producto obtenido del macerado medir el pH (comprobando así que tenga un pH ácido), luego llevar a baño maría hasta completa evaporación del alcohol. Al polvo resultante añadir 2ml de agua destilada formando una suspensión. En un Erlenmeyer aparte se prepara una solución de permanganato de potasio. Añadir en un tubo 2 ml de permanganato de potasio, y agregar 2 ml de la suspensión anterior, gota a gota, verificando el color con cada una. Si el color violeta del permanganato de potasio se decolora (cambio de color), quiere decir, que hay presencia de ácido ascórbico (Vitamina C) en la cáscara de naranja. RESULTADOS. CUESTIONARIO. 1. Realice las fórmulas químicas del ácido ascórbico y del ácido deshidroascórbico. 2. Investigue qué microorganismos producen ácido ascórbico. 3. Explique cómo se realiza la hidroxilación de la prolina y lisina en hidroxiprolina e hidroxilisina respectivamente. 4. Investigue acerca de la obtención de ácido cítrico a partir de Aspergillus niger. 5. Investigue técnicas analíticas utilizadas para la determinación del ácido ascórbico, teniendo en cuenta las propiedades fisicoquímicas de la molécula. 6. Investigue acerca del Bacillus thuringiensis y su importancia en biotecnología. 7. Investigue algas como por ejemplo la Spirulina y la Dunaliella y su utilización en biotecnología. 8. Investigue acerca del arroz dorado y cómo se incluye en éste la vitamina A. 9. Investigue acerca de la obtención de penicilina a partir de Penicilium notatum y otras especies. 10. Realice un cuadro indicando las 10 vitaminas hidrosolubles y sus respectivas formas activas o coenzimas de cada una de ellas, además de la función de la coenzima. U N I V E R S I D A D D E 39 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA PROGRAMA DE CONTROL DE CALIDAD GUÍA DE INVESTIGACIÓN PRACTICA - GIP # 7 TITULO: ELABORACIÓN DE QUESO DE UNTAR FECHA DE ENTREGA: 13ª semana PERÍODO DE EVALUACIÓN: 14ª semana I. OBJETIVO GENERAL - Obtener un producto derivado de la leche utilizando bacterias durante el preceso. II. FUNDAMENTO TEORICO Este tipo de queso se puede elaborar añadiendo un agente acidificante a la leche (limón o vinagre) o empleando bacterias ácido lácticas. El empleo de las bacterias ofrece la ventaja de que es la lactosa (azúcar de la leche) la que se metaboliza produciendo un sabor, una textura y una digestibilidad superior a la del producto obtenido por la simple acidificación. Como consecuencia de la fermentación, en la cual las bacterias degradan el azúcar de la leche (lactosa) se obtiene ácido láctico. Un aumento en la acidez de la leche estimula la acción de enzimas que causan la coagulación de las proteínas lácticas (fundamentalmente caseína) y esto resulta en la formación de estructuras de mayor tamaño que se separan de la parte acuosa de la leche (suero). Además, la acidez inhibe el desarrollo de gérmenes indeseables, incluyendo los potencialmente patógenos. El queso que se obtiene en este caso tiene un sabor marcadamente ácido y su estructura es muy blanda. Nota: se puede probar aumentar o disminuir las dosis de fermento, los tiempos de acidificación y de cuajado, trabajar a diferentes temperaturas y dejar madurar el queso bajo diferentes circunstancias para llegar a realizar una gama amplia de productos. MATERIALES. 1 litro de leche Olla grande para el baño María si la temperatura es inferior a 22 ºC Recipiente de plástico, acero inoxidable o vidrio. No se recomienda la porcelana, ni el aluminio, ni cualquier recipiente que pueda ser afectado por la acción del ácido o no se pueda limpiar con facilidad. Gasa Fermento (bacterias lácticas). Se pueden adquirir o emplear un yogur comercial ácido. Cucharón Colador Cuchillo de punta Cuchara sopera Termómetro (rango de 0ºC a 100ºC) U N I V E R S I D A D D E 40 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA PROCEDIMIENTO. Pasteurizar la leche si se trabaja con leche no comercial: calentar la leche hasta 70ºC al baño María nunca directamente- y mantener esta temperatura de 1 a 3 minutos. Enfriar rápidamente introduciendo el recipiente de la leche en agua fría. Bajar la temperatura hasta los 30ºC. U N I V E R S I D A D D E 41 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA Cuando el queso tenga la consistencia deseada es posible añadirle condimentos (sal, pimienta, ajo, orégano, finas hierbas, etc.), y luego se envasa en un recipiente hermético para colocarlo en la heladera donde se conservará hasta 10 días. RESULTADOS. U N I V E R S I D A D D E 42 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA PROGRAMA DE CONTROL DE CALIDAD GUÍA DE INVESTIGACIÓN PRACTICA - GIP # 8 TITULO: FABRICACIÓN DE UNA HOJA DE PAPEL FECHA DE ENTREGA: 14ª semana PERÍODO DE EVALUACIÓN: 15ª semana I. OBJETIVO GENERAL - Fabricar hojas de papel, de diferentes tamaños, formas y colores; utilizando hojas recicladas, en beneficio del medio ambiente. II. FUNDAMENTO TEORICO La pulpa de celulosa o pasta de celulosa es el material hecho a base de madera más utilizado para la fabricación de papel. las maderas utilizadas para este fin son conocidas como maderas pulpables, que generalmente son maderas blandas como la picea, el pino, el abeto y el alerce, pero también maderas duras como el eucalipto y el abedul. Los efectos ambientales más evidentes de la producción de la pulpa de celulosa vienen del impacto sobre los bosques y los subproductos generados en el blanqueo. El número de árboles consumidos depende del tipo del papel a fabricar y del proceso de producción utilizado. Se estima que se necesita aproximadamente 24 árboles para producir una tonelada de papel utilizando el proceso Kraft. No es tan eficiente como otros procesos, pero tiene la gran ventaja de producir energía eléctrica en excedente, la cual por haber sido producida a partir de biomasa, no genera un aporte neto de dióxido de carbono a la atmósfera, una de las fuentes del calentamiento global. MATERIALES. · La materia prima: el papel a reciclar. · Una licuadora. · Una tela donde formar la hoja de papel. Se puede usar un bastidor con una tela de fibra. El bastidor puede ser rectangular, o se podría usar uno de los que existen en el comercio para bordados. · Papel filtro para secar la hoja formada. · Un rodillo o palo de amasar del tamaño del bastidor. PROCEDIMIENTO. 1. Picar manualmente en trozos pequeños el papel a reciclar (aproximadamente 6 gramos) 2. Remojar el papel picado en más o menos un litro de agua. 3. Disgregar en licuadora la mezcla de agua y papel. Se obtiene una suspensión de fibras en agua. 4. Tomar una muestra homogénea de suspensión (aproximadamente 400 ml) y agregarla al bastidor, sobre la tela. 5. Dejar que drene, moviendo manualmente. U N I V E R S I D A D D E 43 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA 6. Cuando ya se vea formada una hoja húmeda de papel poner sobre ella el papel secante, y pasar el rodillo. 7. Retirar la hoja formada y dejar secar Variaciones: a.- Teñir con algún colorante vegetal las fibras al formar la suspensión para obtener papel de color. b.- Tapar algún sector de la tela con gotas de vela (se puede dibujar un logo por ejemplo) y este dibujo quedará en el papel. RESULTADOS. U N I V E R S I D A D D E 44 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA PROGRAMA DE CONTROL DE CALIDAD GUÍA DE INVESTIGACIÓN PRÁCTICA - GIP # 9 TÍTULO: EXTRACCIÓN DE PIGMENTOS DE PLANTAS VERDES FECHA DE ENTREGA: 15ª semana PERÍODO DE EVALUACIÓN: 16ª semana I. OBJETIVO GENERAL - Realizar la extracción de pigmentos vegetales utilizando los solventes adecuados y aplicando técnicas cromatográficas en papel. II. FUNDAMENTO TEORICO La clorofila es un pigmento encargado de dar el característico color verde a las plantas y transformar la energía de la luz solar en energía química, es decir, es el responsable de la vida en este planeta La fotosíntesis hace que las plantas fabriquen su propia materia orgánica a partir del CO2 del aire, utilizando como fuente de energía la luz solar. Las hojas contienen varios pigmentos fotosintéticos, capaces cada uno de ellos de absorber luz de distinta longitud de onda, lo que permite que la fotosíntesis tenga una mayor eficacia. Entre ellos están la clorofila A (verde azulado) y la clorofila B (verde amarillento), carotenos (amarillo anaranjado), xantofilas (amarillo) y antocianos (rosado). En esta práctica vamos a separar y caracterizar cada uno de estos pigmentos utilizando la técnica de la cromatografía en papel. La cromatografía es una técnica que permite separar mezclas de sustancias. En ella siempre hay una fase móvil (en este caso etanol) y una fase estacionaria (en este caso papel de filtro); la mezcla de pigmentos se distribuye entre las dos fases según su afinidad química, lo que permite separar sus componentes porque cada uno se desplaza a distinta velocidad. MATERIALES. · Mortero · Embudo · Frasco · Papel de filtro · Tiza blanca · Alcohol · Hojas de espinaca · Gotero · Otras hojas verdes U N I V E R S I D A D D E 45 A Q U I N O D E B O L I V I A FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE BIOQUÍMICA Y FARMACIA PROCEDIMIENTO. 1. Lavar las hojas de espinacas, cortarlas en pedacitos, y colocarlas en un mortero, junto con el alcohol. 2. Triturar la mezcla hasta que el disolvente adquiera un color verde intenso. 3. Filtrar con un embudo y papel de filtro. Se puede colocar esta solución a baño María durante unos minutos para concentrarla. A) Separación en tiza 1. Colocar medio centímetro de altura del filtrado en una placa de Petri. 2. Sumergir dentro del extracto la base ancha de la tiza, y dejarla entre 3 y 5 minutos. 3. Pasado ese lapso, retirar la tiza, y colocarla en un vaso que contenga ½ centímetro de altura de alcohol. Atención: es importante que la línea de extracto en la tiza no quede sumergida en el alcohol. 4. Dejar la tiza en el alcohol y observar qué sucede. B) Separación en papel de filtro 1. Cortar una tira de papel de filtro de unos 10 centímetros de alto. 2. Colocar con el gotero una gota del extracto, a un centímetro del borde. Dejarlo secar. Colocar luego sobre esa gota otra, y dejarla secar. Repetir esto, colocando entre 8 y 10 gotas de extracto. 3. Sumergir la tira de papel en un frasco con alcohol y esperar una hora. Atención: es importante que la línea de extracto en el papel no quede sumergida en el alcohol. 4. Observar los resultados. RESULTADOS. CUESTIONARIO. Señale y nombra los pigmentos separados en la tira de papel. 1.¿Por qué se separan los pigmentos? 2. ¿Cuál es la función de los pigmentos en las plantas? 3. Las flores también son estructuras pigmentadas. ¿Qué función tienen estos pigmentos? U N I V E R S I D A D D E 46 A Q U I N O D E B O L I V I A