PRIMER PARCIAL BIOLOGIA MOLECULAR Yesid Santiago Agreda España c.c: 1007311937 1) Estructuras alternativas a Watson y Crick ESTRUCTURA DE UN B-ADN Watson y Crick (1BNA) En esta estructura regular de ADN se puede evidenciar el apareamiento de bases plateado por Watson y Crick, que se basa en el reconocimiento mutuo de la Adenina (A) por la Timina (T) y de la Citosina (C) por la Guanina (G). La capacidad de estas bases en formar enlaces de hidrogeno por un donador y un aceptor le otorga a el apareamiento entre A:T dos enlaces de hidrogeno y tres al apareamiento entre C:G. A-T G-C Z-DNA con emparejamiento de bases G:T wobble (1vtt) En esta secuencia de Z-DNA está formada por dos hélices anti paralelas, se puede observar dos emparejamientos erróneos que no concuerdan con la forma propuesta por Watson y Crick ya que en dos pares de bases están conformadas por la unión de una G y una T del tipo Wobble, ya que una de las bases como el G que según Watson y Crick debería estar emparejado con una C esta emparejado con una T formando entre ellas dos puentes de hidrogeno. G-T DNA paralelo apareamiento entre Pirimidinas y Hoogsteen (5vxq) Esta estructura de DNA está conformada por dos cadenas paralelas y la mayoría de sus ácidos nucleicos son T, A y C. Etas bases forman un apareamiento de dos piramiditas iguales asimétricas como: T:T y C:C, los puentes de hidrogeno formados son: dos para T:T y tres para C:C. Estas interacciones entre bases no concuerdan con las planteadas por Watson y Crick ya que las T deberían aparearse con A y C con G. Por otra parte Existe un apareamiento Hoogsteen entre un par de bases A:T al final de la secuencia, este apareamiento no es isomorfo como os Watson, dado que se forman en la hendidura mayor. T-T T-A DNA con formación wobble inversa (6j37) En esta estructura además de encontrar un apareamiento de homo piramiditas asimétricas entre T:T, explicadas anteriormente también se encontró una wobble inversa que a diferencia de la wobblen regular esta interactuando con una base igual, aunque una de ellas ha rotado 180° T-T 2) RNA transferecia: (4pj5) Este RNA de transferencia al ser una cadena sencilla necesita formar apareamientos entre sus propieas bases, como se ve en la imagen 1, esto genera un plegamiento en una forma particular, a diferencias de algunos tRNA, el que se muestra a continuaion no aparea el inicio de la secuancia (5’) con las bases del final (3’), por el contrario forma los primeros bucles al corto tiempo de iniciada la secuancia, como se puede ver en la imagen 2 y 3. Estos bucles generan interacciones entre ellos lo cual a su vez genera un plegamiento, ya las bases desapareadas que se encuentran señaladas en ell recuafro de la imagen 2 y 3 forman puentes de hidrogeno entre ellas, las bases que conforman generalmente estas interacciones son la G:C, e total hay 5 bucles, de los cuales dos interactuan entre si por enlaces de hidrogeno como se muestra en la imagen 6. Por otra parte se puede observar que el inicio y el final de la cadena se encuentran, tiene conecciones muy particulares puesto que una de sus bases siempre esta generando una coneccion con una parte de la cadena diferente a la que inicio a hacer el apareamiento tradicional, Lo cual le da un nuevo plegamiento. Imagen 1 magen 2 Imagen 4 Imagen 6 Imagen 3 Imagen 5 3) DNA con estructura cuádruple (6kvb) En esta estructura se puede observar dos agrupaciones de cuatro guaninas continúas llamada Gquadruplex, no se puede identificar ni una rotación dextrógiro ni levógiro dado que estas estructuras solo contienen una hebra corta de ADN. Se pueden observar en la imagen 1, en el plegamiento de esta molécula un bucle que se forma a la mitad (recuadro rojo) de la cadena, que se origina por la respectiva unión de las guaninas, y otro bucle (recuadro azul) al borde. Los enlaces entre guaninas son enlaces Hoogsteen de hidrógenos, la que permite su estabilidad.
