La Cofepris tiene como objetivo principal proteger contra los diferentes riesgos a la salud que se puedan presentar, así como cuidar que los productos y servicios que los puedan trasmitir, así como cuidar los factores ambientales que lo puedan alimentar; y en caso de que la emergencia sanitaria ya se este dando saber cómo esta será tratada, regularla y sobre todo darle una solución temprana al problema que se este suscitando, y llevar un control de esta pero sobre todo trabajar en prevenir las diferentes tipos de situaciones que se pueda dar. En México la Cofepris mediante las autoridades correspondientes que tendrán la obligación los diferentes riesgos sanitarios que se puedan suscitar, así como con el compromiso que tendrán de proteger establecer programas y demás políticas que sirvan para llevar una buena practica a nivel internacional para que así en conjunto se puedan prevenir los diferentes sectores que conforman una sociedad y tanto que el sector publico como privado. La Cofepris, aunque trabaja como un organismo autónomo tanto en cuestiones técnicas como administrativas, sigue trabajando en conjunto con la secretaria de salud la cual estará supervisando su funcionamiento. “Conforme a la Ley General de Salud, la Secretaría de Salud ejerce las atribuciones de regulación, control y fomento sanitario, a través de la Cofepris, en lo relativo al control y vigilancia de los establecimientos de salud; la prevención y el control de los efectos nocivos de los factores ambientales en la salud; el control sanitario de productos y servicios, de su importación, exportación y de los establecimientos dedicados al proceso de los productos.” (Reglamento de Control Sanitario de Productos y Servicios, 2001) No solo los productos y/o servicios como tal es importante estar al tanto de y que estos estén regulados si no también los establecimientos donde se pudiera originar o propagar un riesgo sanitario estén en vigilancia de este organismo. Contar con el control sanitario en cada sector en donde el producto o servicio pudiera ponerse en riesgo es necesario, no solo para llevar un control si no también para que tenga una referencia de cómo se trabajara en combatirlo y hacerlo de manera oportuna sin llegar a poner en riesgo a otras partes de las que el producto este siendo dañado. Al igual, saber que incluso en los procesos va incluido el mantener fuera los riesgos sanitarios que se pudieran presentar, así como estos diferentes procesos que se pudieran implementar para prevenirlos y evitarlos.
