El cáncer es un proceso caracterizado por células que se dividen de un modo incontrolado, que invaden y colonizan territorios normalmente reservados para otras células. El cáncer resulta de una combinación de anormalidades genéticas expresadas en un contexto medio-ambiental apropiado. El proceso de tumorigénesis se inicia cuando una célula capaz de replicarse muta un gen que le confiere una ventaja selectiva para crecer y multiplicarse. tejido normal división celular número de células muerte celular diferenciación celular tumor división celular número de células diferenciación celular muerte celular Un tumor es una masa celular derivada de una célula que experimentó un cambio heredable y que le permite crecer en forma desregulada Evidencia en favor del origen monoclonal del cáncer proviene del análisis del patrón de inactivación del cromosoma X en tumores provenientes de ratones hembras. En el embrión, uno de los cromosomas X se inactiva irreversiblemente y al azar. Por lo tanto todos los tejidos constituyen mosaicos de células donde algunas poseen inactivado el cromosoma X paterno (en gris) y otras el cromosoma X materno (en rojo). El análisis de genes ligados a los cromosomas X revela que las células de un tumor (masa central) exhiben el mismo cromosoma X inactivado. Otra evidencia en favor del origen monoclonal del cáncer proviene del análisis de los cromosomas en las células tumorales. Por ejemplo, todos los leucocitos de pacientes con leucemia mielógena crónica exhiben el cromosoma Filadelfia, que resulta de la translocación entre los cromosomas 9 y 22. Las células tumorales pueden, eventualmente, adquirir la capacidad de diseminarse a otros sitios dentro del organismo = cáncer tumor benigno la masa celular es usualmente pequeña y permance localizada en el tejido de origen. • proliferación desregulada • ruptura de las uniones intercelulares tumor maligno = cáncer la masa celular se disemina, usualmente por el sistema vascular, a otras partes del organismo. • ruptura de la membrana basal • degradación de la ECM • inducción de angiogénesis invasión Las células cancerosas exhiben rasgos morfológicos que pueden distinguirse al microscopio Microfotografías de células de cuello uterino obtenidas por raspado (Papanicolaou). Las células normales (A) son grandes, planas, con abundante citoplasma y núcleos áltamente condensados. Las células precancerosas (B) y de carcinoma invasivo (C) exhiben núcleos mas prominentes y escaso citoplasma. El crecimiento de los tumores es difícil de determinar en etapas tempranas Evolución de un tumor mamario Al momento de detectarse por palpación, el tumor ya contiene ~1 billón de células El cáncer es considerado un proceso microevolutivo En la evolución del cáncer ocurren sucesivas rondas de generación de mutaciones y selección, de modo que se acumulan mutaciones en oncogenes y en genes supresores de tumores. Evan & Vousden, Nature 2001 En consistencia con el modo de operación de un proceso microevolutivo, la incidencia del cáncer incrementa marcadamente con la edad Estudios en ratones transgénicos revelan que el desarrollo de tumores requiere de la acción cooperativa de más de un oncogen ratones que solo sobreexpresan myc ratones que solo sobreexpresan ras constitutivamente activo ratones que sobreexpresan myc y ras activo La evolución del cáncer de colon revela una secuencia de mutaciones relativamente predecibles colon con pólipos colon normal Los genes involucrados en el crecimiento maligno se agrupan en dos clases: oncogenes y supresores de tumores Proto-oncogen es un gen normal que por mutación se convierte en un oncogen. Los oncogenes codifican para proteínas hiperactivas que estimulan la proliferación celular. Mutaciones dominantes genes supresores de tumores. Genes cuyas mutaciones inactivan la función de proteínas que inhiben la proliferación celular. Mutaciones recesivas Las proteínas codificadas por los oncogenes y genes supresores de tumores regulan el crecimiento celular a distintos niveles Las proteínas de las clases I IV son potencialmente oncogénicas. Mutaciones activadoras o que incrementan su expresión pueden originar cancer. Son Mutaciones dominantes . Las proteínas de las clases V a la VII actúan como supresoras de tumores. Mutaciones inactivantes en estos genes liberan a la célula de frenos o controles. Son Mutaciones recesivas. Las mutaciones oncogénicas alteran procesos celulares fundamentales Los oncogenes pueden ser identificados mediante sus efectos transformantes en ensayos in vitro La introducción de un oncogen en células normales en cultivo, por ejemplo fibroblastos, provoca alteraciones visibles que son características del fenotipo transformado. oncogen transfección célula normal alteraciones célula transformada - cambio de la morfología (fusiformes) - pérdida de la inhibición por contacto - pérdida de la dependencia del anclaje al substrato - menor dependencia a factores de crecimiento - pérdida de las adhesiones focales microscopía electrónica de barrido de fibroblastos normales (A) y de fibroblastos transformados con el oncogen v-src (B) A B Las células transformadas son fusiformes, con frecuente producción de microvellosidades. El apilamiento de las células resulta de la pérdida de la inhibición por contacto. oncogenes: genes mutados que codifican proteínas capaces de transformar células en cultivo o inducir cáncer en animales proto-oncogen: contraparte normal del oncogen EGFR/PDGFR Ras Src myc etc... Mutaciones activantes en uno solo de los alelos de estos oncogenes promueven tumorigénesis Ras: GTPasa; mutaciones activadoras, bloquean la hidrólisis del GTP Raf: Ser/Thr kinasa; mutaciones activadoras de la catálisis Abl: tirosin-kinasa; translocación cromosómica que genera la forma bcr-Abl constitutivamente activa Crk: proteína adaptadora; sobreexpresión Myc: factor de transcripción; translocación cromosómica que causa sobre-expresión de myc Diferentes mecanismos pueden convertir un proto-oncogen en un oncogen la conversión de un proto-oncogen en un oncogen involucra mutaciones de ganancia de función. mecanismos mutaciones puntuales/deleciones amplificación génica translocaciones cromosómicas ej. c-myc en linfoma de Burkitt ej. oncogen bcr-abl, Trk-tropomiosina Secuencias reguladoras virales pueden convertir un proto-oncogen celular en un oncogen incrementando su expresión: c-myc Los retrovirus que producen leucosis en aves se insertan al azar en los cromosomas. En algunos tumores el DNA del provirus se encuentra adyacente al gen c-myc en dos orientaciones transcripcionales posibles. En ambos casos, los niveles de transcriptos estan significativamente aumentados. Algunos virus contienen oncogenes e inducen cáncer retrovirus oncogénicos: aquellos que transducen un oncogene a la célula huésped (ej. RSV v-src; Harvey sarcoma virus (HSV) H-ras) la actividad del proto-oncogen c-Src esta normalmente reprimida por la fosforilación de la tirosina 527. Algunas oncoproteínas v-Src codificadas por el virus RSV poseen deleciones del terminal carboxilo que incluyen a la tirosina 527. Por lo tanto estas mutantes son constitutivamente activas. Otras mutaciones activadoras incluyen la substitución de Y527 por F. En la kinasa normal, la tirosina 527 es mantenida fosforilada e interacciona con el dominio SH2 de la misma molécula, estabilizando la conformación inactiva de Src. Ciertas proteínas virales mutadas son oncoproteínas que mimetizan factores de crecimiento SFFV (Spleen Focus Forming Virus) es un retrovirus que produce eritroleucemia en ratones. El SFFV codifica la proteína gp55, que se une al receptor de eritropoietina en eritroblastos e induce su proliferación ligando natural Jak2 Jak2 la unión del ligando natural eritropoietina (Epo) dimeriza el receptor Jak2 Jak2 la unión de gp55 mimetiza el ligando natural y también dimeriza y activa el receptor El gen v-sis del virus SSV (Simian Sarcoma Virus) codifica para una proteína homóloga a la cadena beta del PDGF. SSV induce sarcomas en fibroblastos que expresan el receptor de PDGF. Receptores con actividad tirosina-kinasa intrínseca están frecuentemente mutados en diferentes tipos de cáncer mutaciones puntuales, ej. Val Gln convierten el receptor Her2 a su forma oncogénica Neu. Ambas mutaciones producen receptores donde el dominio de tirosina kinasa esta constitutivamente activo, independiente de la presencia del ligando. Otras mutaciones ocurren en el dominio citosólico, p. ej. deleciones que eliminan señales de endocitosis contribuyen a activaciones sostenidas del receptor. las deleciones del dominio extracelular del EGFR producen formas oncogénicas Translocaciones cromosómicas generan una forma oncogénica de Trk Una forma oncogénica del receptor tirosina-kinasa Trk es generada por una translocación cromosómica que reemplaza la porción extracelular de Trk por un segmento de la tropomiosina que media dimerización. La dimerización constitutiva de Trk provoca su activación independiente de la unión al ligando. fosforilación en trans y activación de los dímeros Translocaciones cromosómicas también originan formas hiperactivas de kinasas citosólicas y de factores de transcripción c-Abl Translocación cromosómica en leucemia mieloide crónica (chronic myelogenous leukemia o CML). La translocación puede detectarse por bandeo cromosómico (A) o por FISH (B). La translocación produce una oncoproteína quimera, Bcr-Abl, que exhibe una actividad desregulada de la tirosina kinasa Abl. B A bcr-Abl activación de c-Abl!! c-Abl FISH: Fluorescence in situ hibridization Hiperactivación de c-myc Amplificación de c-myc (FISH) Translocación cromosómica en linfomas de Burkitt que posiciona al gen de c-myc en la región adyacente a elementos de control de inmunoglobulinas. Sobreexpresión de c-myc!! c-myc promueve la expresión de genes involucrados en la transición de G1 a S categorías de genes supresores de tumores: - inhibidores de la proliferación celular, - proteínas de checkpoint, - receptores o transductores que inhiben la proliferación, - proteínas pro-apoptóticas - enzimas reparadoras del DNA CKIs pRb p53 TGFβ APC ATM/ATR Ambos alelos de un gen supresor de tumores deben inactivarse para facilitar el crecimiento de tumores La vía de control de la proliferación mediada por Rb esta alterada en la mayoría de los cánceres humanos Rb y el inhibidor de Cdk p16 son supresores de tumores (en rojo) inactivados por mutación. Las ciclinas D y Cdk4 son proto-oncogenes (en verde) activados por mutación. La ganancia de función de un solo proto-oncogen de esta vía de control promueve la proliferación. p16 Rb tipos de mutaciones descriptas en cáncer • amplificación génica de ciclinas D • deleciones del inhibidor de Cdk4/6 p16 • mutaciones inactivantes de Rb TGFβ restringe el crecimiento de tumores a través de la regulación de la expresión de numerosos genes mutaciones en Smad4 y en el TGF-β R II se han detectado en cáncer de colon y páncreas. TGFβ TGFβ ↓ c-myc ↑ p15 CKI ↑ p21 CKI ↑ PAI-1 (plasminogen activator inhibitor-1) Cdk4/cicl D plasminogen activator Rb plasminogen E2F síntesis proliferación de DNA plasmin degradación de la ECM invasión APC inhibe la señal proliferativa de la β-catenina promoviendo su degradación en el proteosoma Mutaciones que estabilizan β-catenina en el citosol, por ej. de APC, Axina y β-catenina se observan en varios tipos de cáncer incluído el colorectal. Beta catenina estabilizada se transloca al núcleo y en complejo con los factores de transcripción Tcf/Lcf activa la transcripción de genes que promueven proliferación (ej. myc, ciclina D, E2F). La pérdida de función de Rb puede ocurrir por diferentes tipos de mutaciones somáticas la pérdida de función de Rb es causante de retinoblastoma y de varios otros tipos de cáncer Rb y p53 pueden inactivarse por proteínas virales Varios virus de DNA, incluyendo el virus del papiloma humano (HPV), Simian Virus 40 (SV40) y adenovirus producen proteínas que se unen e inactivan a las proteinas p53 y Rb. El HPV es causante del cáncer de cuello de útero. p53 p21CIP Cdk4/6 Rb E2F HPV E2F E7: inactiva Rb E6: inactiva p53 E5: activa el PDGFR p53 es un sensor de la hiperactividad de oncogenes y activa la senescencia o la apoptosis ↑ ras ↑ β-catenina En condiciones normales Mdm2 ubiquitina a p53 y promueve su degradación. ↑ proteínas proapoptóticas: Bax, receptores de Fas, etc La hiperactividad de oncogenes induce la transcripción de p19ARF (ARF). ARF inhibe Mdm2 lo cual estabiliza p53. p53 activa numerosos genes que frenan el ciclo celular y promueven apoptosis. (iARF: Alternative Reading Frame, es un producto de “splicing alternativo” del locus INK4a que codifica para p16INK4a. No confundir con la GTPasa ARF que recluta proteinas de cubierta COPI!) Los efectos oncogénicos de myc y ras sobre la proliferación, la apoptosis o la senescencia dependen del contexto Senescencia: estado no replicativo permanente e irreversible Lowe et al Nature 2004 Inactivación de proteínas pro-apoptóticas e hiperactividad de proteínas anti-apoptóticas RPTKs integrinas receptores que transmiten señales anti-apoptóticas sensores de superficie PTEN es una fosfatasa que contraresta la función de la PI-3K. Es un "tumor suppresor" deleción PI-3k PTEN receptores que transmiten señales pro-apoptóticas Akt FAS-R TNF-R inactivación Bad deleción/ inactivación p53 en rojo se señalan algunas alteraciones observadas en cáncer que confieren resistencia a la apoptosis. Bcl-2 hiperactividad Bax citoc C/APAF caspasa 9 familia de proteínas Bcl-2: cascada de activación de caspasas proapoptóticas (Bax, Bak) antiapoptóticas (Bcl-2, Bcl-XL) Circuitos afectados por mutaciones que promueven cáncer Lodish MCB 2004 La inestabilidad genómica es una característica del cáncer fallas en el "checkpoint" mitótico fallas en los mecanismos de reparación del DNA arresto del ciclo celular inestabilidad genómica fallas en el mantenimiento de los telómeros apoptosis Las células normales que experimentan un daño importante del DNA, que no puede ser reparado, entran en un estado de senescencia prematura o sufren apoptosis. La disfunción de los telómeros y/o la ruptura de cromosomas conducen a ciclos de ruptura y fusión que aumentan la inestabilidad genómica inactivación de checkpoint, ej. mutación de ATM p53 es un sensor de la inestabilidad cromosómica estructural La inestabilidad de los telómeros y la exposición de la doble hebra del DNA induce la activación de una vía apoptótica mediada por p53. Las células cancerosas evitan este destino mediante la re-expresión de la telomerasa. BFB = "Breakage-Fusion-Breakage" (ciclos de ruptura y fusión) La inactivación de p53 elimina el freno al proceso de inestabilidad genómica promovido por los ciclos de ruptura y fusión de cromosomas. Existe un nivel "óptimo" de inestabilidad genómica para el desarrollo del cáncer, que confiere la plasticidad necesaria para evolucionar. apoptosis Las células normales (A) mantienen una tasa de inestabilidad genómica baja que les impide generar la diversidad suficiente para superar la primer barrera selectiva. Un nivel óptimo de inestabilidad genómica (B) asegura la generación de una variedad de mutaciones adecuadas en las células tumorales que les permiten superar las barreras selectivas impuestas por el organismo. Demasiada inestabilidad genómica (C) supera un umbral incompatible con la viabilidad, activándose la apoptosis. p53 también es un sensor de la inestabilidad cromosómica numérica La poliploidía y aneuploidía es común en cáncer. Puede resultar por defectos en la mitosis, fusión celular y endomitosis. Estas alteraciones activan apoptosis mediada por p53. En células cancerosas la apoptosis puede ser inhibida por la sobre-expresión de, por ejemplo Bcl-2. La actividad de p53 conduce al arresto del ciclo celular o a la apoptosis La presencia de extremos libres en la molécula del DNA y el daño producido por radiación UV es sensada por las kinasas ATM y ATR, respectivamente. ATM y ATR fosforilan y activan a las kinasas de "checkpoint" Chk1 y 2 que fosforilan a p53, incrementando su estabilidad y su actividad transcripcional. ATM/ATR degradación en el proteosoma Cdc25 Chk1/2 estrés oncogénico ras, myc, E2F Cdk1 G2/M Cdk2 G1/S ARF transcripción estabilización y localización nuclear p53 p21CIP Cdk4/6 activ efectos independientes de transcripción a t ra nscr ipció n de Rb E2F proteínas pro-apoptóticas (Bax, BID, PUMA, receptores de Fas) inactivación de proteínas anti-apoptóticas (Bcl2, Bcl-xl) activación de proteínas pro-apoptóticas (BAX y BAK) El contexto y el genotipo celular influyen sobre las vías activadas por p53 que determinan la muerte o el arresto del ciclo celular - factores de crecimiento contexto celular (señalización) - integrinas - caderinas adhesión genotipo (mutaciones en genes reguladores del ciclo celular y la apoptosis) daño del DNA, acortamiento de telómeros inestabilidad cromosómica hiperactividad oncogénica arresto temporario o senescencia ↑ p53 apoptosis p16 La senescencia replicativa es inducida por el acortamiento de los telómeros Los fibroblastos humanos normales dejan de proliferar después de ~50-60 divisiones (símbolos verdes) . La expresión forzada de la telomerasa extiende significativamente el potencial replicativo (símbolos rojos) . La re-expresión de la telomerasa contribuye a la inmortalización de las células tumorales Los extremos de los cromosomas de vertebrados poseen numerosas copias de la secuencia TTAGGG (5-20 Kb), agregadas por la enzima telomerasa. La telomerasa deja de expresarse en la mayoria de las células somáticas. Aproximadamente el 80-90% de los cánceres muestran una reactivación de la expresión de la telomerasa. a) La senescencia replicativa de una célula normal es inducida por la pérdida de los telómeros. b) En las células cancerosas la telomerasa es sobreexpresada. acortamiento de los telómeros telomerase telomerase telomerasa En cada replicación del DNA, el extremo 3' de cada cromosoma se acorta ~ 50-100 bp Modelo que involucra la reactivación de la telomerasa en una secuencia de eventos que conduce al cáncer El crecimiento y propagación de los tumores malignos sólidos requiere de la inducción de angiogénesis Angiogénesis es el proceso de formación de vasos a partir de capilares pre-existentes. pericito Los tumores secretan VEGF, un potente factor que induce la angiogénesis a partir de capilares pre-existentes (a). Un evento temprano de la angiogénesis es la disociación de los pericitos y la dilatación de los capilares (b). Las células endoteliales degradan la membrana basal y migran hacia el estroma (c), inducidas por factores del estroma, las células endoteliales proliferan (d), eventualmente, las células endoteliales contactan y se adhieren entre sí, secretan una membrana basal y reclutan pericitos que se asocian a la pared del nuevo capilar (e) Berger & Benjamin, Nature Cancer Rev 2003 Los tumores sólidos inicialmente crecen como nódulos avasculares. En la mayoría de los casos se estabilizan en un estado de latencia ("dormancy") en el cual la tasa de proliferación equilibra a la de apoptosis (a). Eventualmente, y en un modo dependiente del tipo de tumor y del micro ambiente, la masa celular incrementa drásticamente como consecuencia de haber adquirido la capacidad de inducir la angiogénesis ("switch" angiogénico). Los vasos nuevos inducidos por los tumores son frágiles, irregulares y tortuosos. Berger & Benjamin, Nature Cancer Rev 2003 El "switch" angiogénico depende de un balance entre factores angiogénicos y anti-angiogénicos TGF-β Thrombospondin-1 ECM MMP9 VEGF VEGFR endothelial cell proliferation and migration PTP Berger & Benjamin, Nature Cancer Rev 2003 OH normoxia HIF-1 hipoxia VHL proteosoma ↑HIF-1 ↑ factores pro-angiogénicos (VEGF) ↑ genes pro-invasivos (receptor met) acumulación del factor de transcripción HIF-1 (hypoxia-inducible factor-1) Que dispara el "switch" angiogénico? HGF/SF met (RTK) ↑ migración inactivación de p53 ↓ factores anti-angiogénicos ↑ factores pro-angiogénicos En condiciones de oxígeno normal el factor HIF-1 es hidroxilado y ubiquitinado por la proteína supresora de tumores VHL (von Hippel-Lindau), siendo continuamente degradado en el proteosoma. En condiciones de hipoxia y/o inactivación de VHL, HIF-1 se acumula y activa transcripción de factores pro-angiogénicos. La proteína supresora de tumores p53 reprime la expresión de VEGF y promueve la ubiquitinación de HIF-1, por lo tanto mutaciones que inactivan a p53 también contribuyen a que se dispare la angiogénesis. el comportamiento invasivo (maligno) de las células involucra: cambios en la adhesión proteólisis local migración Transiciones epitelio-mesénquima "Epithelial-mesenchymal transitions" (EMT) marcan el inicio de la invasión de carcinomas El proceso de EMT de las células epiteliales se caracteriza por la pérdida de los contactos intercelulares, la pérdida de la polaridad y la adquisición de un fenotipo migratorio. estroma Experimentos in vitro muestran que diversas señales extracelulares inducen EMT Células de carcinoma exhiben EMT cuando se las estimula con distintos factores solubles (TGFβ, EGF, HGF, etc) y componentes de la matriz extracelular colágeno, TGFβ Savagner, Bioessays 2001 El factor HGF/SF induce EMT HGF/SF (Hepatocyte Growth Factor/Scattering Factor) es un factor soluble que promueve motilidad e invasión de células epiteliales in vitro. Actúa activando el receptor tirosín-kinasa met. Birchmeier, Nature MCB 2003 Varias señales externas inducen EMT activando factores de transcripción específicos cytokines Los factores de transcripción Twist, Snail y SIP1 inducen EMT reprimiendo la transcirpción de la caderina-E y activando la transcripción de proteínas pro-invasivas como la caderina-N. Kang & Masagué, Cell 2004 Las células invasivas manifiestan cambios en la expresión de moléculas de adhesión integrinas: Integrinas expresadas en cáncer reconocen el motivo RGD en fibronectina, vitronectina y otras moléculas (ej. α3β1, αvβ3). α3β1 interacciona con laminina, fibronectina y colágeno. αvβ3 interacciona con fibronectina, vitronectina, colágeno, trombospondina. la digestión proteolítica de la matriz exponen sitios crípticos RGD reconocidos por las integrinas α3β1 y αvβ3. caderinas: La inactivación de las caderinas-E y la expresión de caderinas-N es un rasgo característico de carcinomas. La re-expresión de caderina-E inhibe la invasividad en algunos tumores. La invasión requiere de la degradación localizada de la matriz Las células del microambiente tumoral secretan proteasas que degradan la matriz y favorecen la invasívidad. Las proteasas extracelulares pertenecen a dos familias: colagenasas instersticiales degradan colágenos fibrilares (1) Metaloproteinasas de la matriz (MMP) estromelisinas degradan fibronectina, proteoglicanos, col IV gelatinasas (colagenasas tipo IV) degradan col IV, fibronectina, elastina su actividad depende de iones zinc o calcio Las tres clases de metaloproteinasas poseen inhibidores endógenos (tissue inhibitors of metalloproteinasas = TIMPs) (2) Serine proteases Activadores del plasminógeno (PAs). Hay 2 tipos: uPA: urokinase-plasminogen activator asociada a receptores de superficie (uPAR) tPA: tissue-type plasminogen activator secretada - laminina - fibronectina uPA o tPA plasminógeno plasmina activa la plasmina degrada - colágeno IV - vitronectina las serpinas son inhibidores de las serine proteases La invasión involucra un intercambio de señales secretadas por las células del microambiente del tumor El carcinoma invasivo es considerado una patología de poblaciones celulares diversas que habitan el microambiente del tumor. La transición a un carcinoma invasivo es precedida por la activación de fibroblastos, células endoteliales y del sistema inmune que liberan enzimas, citoquinas y factores de crecimiento en una zona localizada denominada "frente de invasión". Liotta & Kohn, Nature 2001 Interacciones moleculares en el microambiente de invasión 3 1) Los fibroblastos secretan HGF/SF que estimulan la motilidad de las celulas tumorales a través de los receptores c-Met. 1 2) Las células tumorales secretan VEGF y bFGF, los cuales se unen a receptores en las células endoteliales e inducen angiogénesis. 3) Los fibroblastos y las células endoteliales producen enzimas latentes como MMPs y uPA, que son activadas en contacto con el invadopodio de la célula tumoral, y degradan la ECM y los ectodominios de las caderinas, promoviendo la invasión. 3 4 2 5 3 6 4) La degradación de la ECM libera factores como el TGFβ y el EGF los cuales promueven angiogénesis y la proliferación de la célula tumoral. 5) La degradación de la ECM expone sitios RGD reconocidos por integrinas involucradas en la motilidad. 6) Las vias activadas en la célula tumoral generan señales de proliferacion, motilidad y anti-apoptóticas. Por ejemplo, la activación de FAK mediada por Met, EGFR e integrinas activa ras, PI-3K, MLCK y β-catenina. Liotta & Kohn, Nature 2001 Friedl & Wolf, Nature Rev Can 2003 Las interacciones del tumor con el tejido huésped modulan la metástasis células de carcinoma de colon humano implante ortotópico (intestino) implante heterotópico (músculo) metástasis el implante heterotópico es rechazado por el órgano huésped. el implante ortotópico facilita el proceso de metástasis Ensayos in vitro para evaluar la invasión invasión de una cama de colágeno ** ** ** en todos los casos la suspensión celular a ensayar corresponde a las células tumorales. PTKs como blancos terapéuticos PTK Ras/ MAPK PI-3K/ Akt Rho caderinas GTPasas anti-apoptosis invasión y motilidad proliferación Zwick et al, Trends in Molecular Medicine, 2002 La clasificación del cáncer es un requerimiento para decidir la terapia a aplicar. Actualmente dicha clasificación se basa en la historia clínica del paciente, la histología del tumor y la expresión de marcadores bioquímicos. Dado que el cáncer es una enfermedad genética debería ser posible su clasificación en base al perfil de expresión específico del transcriptoma. Los chips de DNA permiten analizar niveles de mRNA a escala global (transcriptoma) Muestras de genes ordenadas en un arreglo bidimensional constituye un "chip" de DNA fijación de oligonucleótidos o cDNA gen1 gen2 gen3 gen4 gen5 ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ hibridización con cDNA marcado El chip o microarreglo de DNA consiste en una matriz de cDNAs u oligos pertenecientes a una colección de genes y cuya posición en el arreglo es conocida. El chip se hibridiza con una mezcla de cDNAs de muestras de referencia y experimentales marcadas con fluorescentes diferentes. Los datos obtenidos se emplean para construir perfiles de expresión en relación a una determinada condición o tratamiento. cDNA de muestra de referencia (ej. individuo sano) cDNA de muestra experimental (ej. individuo enfermo) gen1 gen2 gen3 gen4 gen5 ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ resultado Resultado de la hibridización de un chip de ~ 6000 genes de S. cerevisiae Imagen del chip obtenida con un microscopio confocal. Los puntos rojos indican mayor expresión de la muestra experimental respecto de la de referencia; los puntos verdes indican lo opuesto. Patrones de expresión génica en distintos tipos de cáncer En este chip se analizan los niveles de expresión de 1800 genes (ordenados en hileras horizontales) en 142 tumores obtenidos de pacientes diferentes y agrupados de acuerdo al órgano que afectan (columnas verticales). Cada rectangulo (ver inserto) indica el nivel de expresión de un gen particular en un tumor determinado, el rojo indica que la expresión es mayor que el promedio; el verde que es inferior al promedio y el negro indica un valor promedio. conclusión 1: el nivel de expresión de cada gen varía en los distintos tumores (hilera de barras ordenadas de izquierda a derecha). conclusión 2: cada tipo de tumor expresa un perfil de expresión génica característico. Esta información puede ser empleada para tipificar células cancerosas de origen desconocido comparando sus transcriptomas con el de tumores conocidos. MBC Alberts et al 4th ed, p378 Perfiles transcripcionales de dos tipos de leucemia (AML y ALL) De un chip de 6817 genes humanos se identificó un grupo de 50 genes que se expresan diferencialmente en leucemia mieloide aguda (AML) y leucemia linfoblastica aguda (ALL). Este estudio demuestra que el perfil genético basado en microarrays puede ser aplicado para predecir tipos de tumores. Golub TR et al, Science 286,1999 genes: Perfiles transcripcionales de linfomas difusos de células B grandes (DLBCL) Los linfomas DLBCL son clínicamente heterogéneos. El análisis de microarreglos de DNA revela la expresión coordinada de genes en las distintas muestras. Observe que genes que se expresan en centros germinales de células B tienen un patrón de expresión diferencial en dos tipos de linfomas, FL y CLL. Cada columna vertical representa una muestra y cada hilera horizontal representa un gen. Alizadeh et al, Nature 2000 Perfiles transcripcionales asociados a metástasis mal pronóstico genes buen pronóstico buen pronóstico mal pronóstico De un chip de ~25.000 genes humanos se identificaron ~5000 genes se expresan diferencialmente en 98 tumores primarios de mama. De estos se agruparon 70 genes cuya expresión (columnas verticales; rojo indica sobreexpresión, verde indica subexpresión) se emplea como “marcador” para pronosticar metástasis en 78 tumores de mama (hileras horizontales) . Los genes fueron ordenados de acuerdo a sus coeficientes de correlación en dos grupos: buen pronóstico o mal pronóstico. La barra de la derecha indica en negro los pacientes que no desarrollan metástasis y en blanco aquellos con metástasis dentro de los 5 años de tratamiento. van 't Veer et al Nature 2002 from Jake Youngberg