Unidad de Secuenciación - Servicios Científico

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Localización de la unidad
 La unidad de secuenciación
se encuentra localizada en la
planta baja del edificio
Severo Ochoa, en el
laboratorio 0,005
Unidad de Secuenciación
 El personal de la unidad es:
 Jose Luis Martínez Fernández.
 Daniel Serna Fuente.
Equipación
 Equipos principales :
Un equipo de electroforesis capilar ABI PRISM® 3130xl Genetic Analyzer.
Un equipo de pcr a tiempo real ABI HT 7900.
 Equipo adicional:
el común a un laboratorio de biología molecular (PCR´s, centrífugas,
micropipetas, cubetas de electroforesis, termobloques,cuantificador de ADN, etc..)
ABI PRISM® 3130xl Genetic
Analyzer
 El equipo de electroforesis capilar se utiliza para:
 Obtener la composición de nucleótidos de fragmentos de ADN.
 Determinación del tamaño de fragmentos de ADN.
ABI PRISM® 3130xl Genetic
Analyzer
Tanto para el análisis de fragmentos como para el de secuencias de ADN previamente se
debe marcar éstas con fluorocromos ya que el sistema de detección del equipo consiste en un
láser como fuente de excitación y una cámara CCD que detecta la emisión de las distintas
moléculas.
ABI PRISM® 3130xl Genetic
Analyzer
 La determinación de la composición de nucleótidos
de un fragmento de ADN consta de varias fases:
 Obtención de la muestra de ADN y amplificación
mediante PCR del fragmento de ADN a estudiar.
 Marcaje con fluorocromos de los distintos nucleótidos
del fragmento amplificado.
 Electroforesis en el equipo.
 Obtención de los resultados y posterior estudio de los
mismos.
ABI PRISM® 3130xl Genetic
Analyzer
ABI PRISM® 3130xl Genetic
Analyzer
ABI PRISM® 3130xl Genetic
Analyzer
 El análisis de fragmentos de ADN es un proceso que a través de
moléculas fluorescentes permite calcular el tamaño relativo de una
molécula de ADN para ello:
 Se amplifica por PCR el fragmento a estudiar utilizando cebadores
marcados con fluorocromos .
 Al resultado de la PCR se le añade un estándar de tamaños que nos permite
comparar entre muestras.
 Electroforesis en el equipo.
 Obtención de los resultados y posterior estudio de los mismos.
ABI PRISM® 3130xl Genetic
Analyzer
7900HT Fast
Real-Time PCR System
 Es un equipo que permite realizar la cuantificación
relativa del nivel de expresión de distintos genes en
una muestra.
7900HT Fast
Real-Time PCR System
Aplicaciones

Entre los campos de aplicación más relevantes de estas técnicas se encuentran los siguientes:

Investigación básica en Genética y Ecología Molecular



Estudios filogenéticos y de evolución de los organismos.

Estudios poblacionales, identificación de especies en estadios larvarios, marcado genético de individuos para
estudios de campo, etc.
Biomedicina

Caracterización molecular de genes con relevancia clínica, susceptibilidad genética a ciertos tipos de cáncer,
detección de mutaciones en oncogenes, etc.

Diagnóstico de enfermedades hereditarias. Consejo genético.

Identificación de individuos, pruebas de paternidad.
Microbiología


Identificación de especies bacterianas, identificación de virus.
Veterinaria y Agroalimentación

Pedigrees, identificación de genes de interés en programas de mejora, conservación de especies en peligro de
extinción, sexado de aves, etc.

Identificación de variedades en vegetales, trazabilidad, detección de fraude (identificación de la especie/s
presentes en la muestra).
Usuarios de la unidad
Grupos de investigación de la universidad de Oviedo de las áreas de ecología,
genética, microbiología, bioquímica, medicina, fisiología vegetal, etc..
Spin-off´s de la universidad.
Y otros centros regionales de investigación como son:
El Centro de Experimentación Pesquera (CEP),
Instituto de Productos Lácteos de Asturias (IPLA)
Servicio Regional de Investigación y Desarrollo Agroalimentario (SERIDA)
El Hospital Universitario Central de Asturias (HUCA),
Instituto Universitario de Oncología del Principado de Asturias (IUOPA)
etc..
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