pasantias virored 2015

OFERTA DE PASANTÍAS, 2015
De acuerdo con los objetivos de ViroRed se convocan pasantías para
investigadores de laboratorios de los países adheridos.
Las pasantías tienen que realizarse en el presente año, en fechas
propuestas por, o acordadas con, los laboratorios receptores.
Como actividad cofinanciada contemplada como tal en el Convenio de
Adhesión de ViroRed, se establece que CYTED se hará cargo de los gastos de
pasajes de avión ida/regreso para un investigador, así como la cantidad de 250€
en concepto de gastos de formalización de visado, trasporte de ida y vuelta a los
aeropuertos y otros gastos durante el viaje, que se harán efectivos al término de
la estancia. La reserva de los pasajes se realizará desde la Secretaria General de
CYTED. El organismo al que pertenezca el/la pasante garantizará los gastos de
su alojamiento y de su alimentación.
Una vez terminada la estancia, y en un plazo máximo de 30 días, el/la
pasante entregará a CYTED y a ViroRed una memoria (máximo 500 palabras)
acerca de la actividad realizada.
La solicitud se hará en el formulario adjunto, a la que se acompañará una
carta del director de la institución en la que presta servicios el/la solicitante,
comprometiéndose a afrontar los gastos que le corresponda.
FECHA LÍMITE DE RECEPCIÓN DE SOLICITUDES: 25 de julio de 2015.
Se convocan las siguientes pasantías:
1. IDENTIFICACIÓN DE VIRUS RESPIRATORIOS EMERGENTES CON
POTENCIAL PANDÉMICO, MERSCoV E INFLUENZA A(H7N9). DOS
PASANTÍAS
LABORATORIO RECEPTOR
Servicio Virosis Respiratorias
INEI-ANLIS ”Carlos G. Malbrán”, Buenos Aires, Argentina.
TUTORÍA: Dra. Elsa Baumeister
DURACIÓN: 2 semanas
FECHAS PROPUESTAS: 7 a 18 de septiembre de 2015.
OBJETIVOS: Entrenar profesionales de laboratorio en la detección de MERSCoV
e influenza A(H7N9).
ACTIVIDADES ESPECÍFICAS:
- Métodos de extracción de ácidos nucleicos manuales y automatizados
recomendados.
- Introducción a la plataforma de RTPCR en tiempo real.
- Introducción a la secuenciación de ácidos nucleicos.
- Realización del ensayo de RTPCR en tiempo real para screening de MERSCoV.
- Realización del ensayo de RTPCR en tiempo real para confirmación de MERSCoV.
- Análisis de los resultados obtenidos y comparación con resultados esperados.
- Secuenciación directa desde la muestra clínica de diferentes fragmentos de
genoma de MERSCoV
- Análisis de secuencias obtenidas utilizando programas de filogenia.
- Realización del ensayo de RTPCR en tiempo real para detección de influenza
A(H7N9).
- Análisis de los resultados obtenidos y comparación con resultados esperados.
- Secuenciación directa desde la muestra clínica de diferentes fragmentos de
genoma de A(H7N9).
- Análisis de secuencias obtenidas utilizando programas de filogenia.
2. ENTRENAMIENTO EN DIAGNÓSTICO Y CARACTERIZACIÓN
MOLECULAR DE VIRUS CHIKUNGUNYA
LABORATORIO RECEPTOR
Laboratorios de Arbovirus y Serología
Centro Nacional de Microbiología
Instituto de Salud Carlos III
Majadahonda, España
TUTORÍA: Dra. María Paz Sánchez-Seco, Dra. Anabel Negredo, Dr. Fernando de
Ory
DURACIÓN: 2 semanas
FECHAS: 19 a 30 de octubre de 2015.
OBJETIVOS: Formación en técnicas diagnósticas moleculares y mediante
serología de las infecciones por virus Chikungunya
ACTIVIDADES ESPECÍFICAS
- Diagnóstico molecular: métodos genéricos de Alfavirus (nested-PCR). Métodos
específicos de Chikungunya (PCR en tiempo real y convencional en formato
nested)
- Determinación de anticuerpos mediante técnicas de ELISA y de
inmunofluorescencia
- Interpretación de resultados. Diagnóstico diferencial con virus dengue
- Identificación de la mutación A226V
- Epidemiología molecular
3. ESTUDIO DE LA INFECCIÓN RESPIRATORIA POR PICORNAVIRUS
EN LOS PAÍSES INTEGRANTES DE VIRORED
Laboratorio de Virus Respiratorios
Centro Nacional de Microbiología
Instituto de Salud Carlos III
Majadahonda, España
TUTORÍA: Dr. Francisco Pozo
DURACIÓN: 2 semanas
FECHAS: 19 a 30 de Octubre de 2015.
OBJETIVOS: Evaluación de la implicación del EV-68 en infecciones respiratorias
pediátricas en países integrantes de ViroRed y su relevancia con respecto a otros
picornavirus. El diagnóstico específico de EV-68 no se realiza de forma rutinaria
en los laboratorios responsables del diagnóstico etiológico de las infecciones
respiratorias. Los métodos de diagnóstico habituales no diferencian entre
enterovirus y rinovirus.
ACTIVIDADES ESPECÍFICAS
- Desarrollo de una técnica combinada de amplificación genómica que permita
detectar los picornavirus mediante PCR en tiempo real, y la sucesiva
identificación de EV-68, otros enterovirus y rinovirus por diferencias en el
tamaño del fragmento amplificado.
- Producción de plásmidos de DNA que podrán ser utilizados como controles
positivos en el método desarrollado
- Validación de la metodología desarrollada con extractos de ácidos nucleicos que
contengan enterovirus o rinovirus procedentes de colecciones del ISCIII
(España) y del país de origen del solicitante.
4. PRODUCCIÓN DE CONTROLES POSITIVOS PARA SER UTILIZADOS EN
2 MÉTODOS DE PCR PARA DIAGNÓSTICO Y CONFIRMACIÓN DE CoVMERS (upE y ORF1a)
Laboratorio de Virus Respiratorios
Centro Nacional de Microbiología
Instituto de Salud Carlos III
Majadahonda, España
TUTORÍA: Dra. Inmaculada Casas
DURACIÓN: 2 semanas
FECHAS: 19 a 30 de Octubre de 2015.
OBJETIVOS: Entrenamiento para realizar el diagnóstico de CoV-MERS utilizando
dos métodos de amplificación genómica en tiempo real recomendados por la
OMS: PCR en tiempo real diseñada en la región genómica upE y PCR en tiempo
real diseñada en la región genómica ORF1a.
http://www.who.int/csr/disease/coronavirus_infections/WHO_interim_recomme
ndations_lab_detection_MERSCoV_092014.pdf?ua=1
ACTIVIDADES ESPECÍFICAS
- Entrenamiento para la realización de los métodos moleculares establecidos por
la OMS
- Entrenamiento en el uso de RT-PCR genéricas capaces de detectar de manera
complementaria cualquier tipo de CoV humano y que han sido desarrolladas y
validadas en el Laboratorio de Gripe y Virus Respiratorios del CNM
- Producción de plásmidos de DNA de diferentes CoV que podrán ser utilizados
como controles positivos en los métodos genéricos de CoV humanos
mencionados anteriormente
5. ENTRENAMIENTO EN DIAGNÓSTICO Y CARACTERIZACIÓN
MOLECULAR DE VIRUS ZIKA
Centro de Estudos de Vectores e Doenças Infecciosas
(Laboratório Nacional de Referência de Doenças Infecciosas Transmitidas por
Vectores)
Instituto Nacional de Saúde Dr. Ricardo Jorge
Av. Liberdade 5, 2965-575 Águas de Moura, Portugal
TUTORÍA: Dra. Maria João Alves
DURACIÓN: 2 semanas
FECHAS: Noviembre de 2015.
OBJETIVOS: Entrenamiento en diagnóstico y caracterización molecular de virus
Zika
ACTIVIDADES ESPECÍFICAS
- Formación en epidemiología (Flavivirus, Zika)
- Caracterización clínica de infecciones por virus Zika
- Preparación de material de diagnóstico serológico para inmunofluorescencia
- Preparación de material in house (cultivo de células, inoculación, preparación
de láminas).
- Diagnóstico serológico por inmunofluorescencia (determinación de anticuerpos
por técnica de imunofluorescencia indirecta, reacciones cruzadas, interpretación
de resultados)
- Diagnóstico molecular específico por RT-PCR y real-time RT-PCR, y genérico por
RT-PCR Pan-flavivirus y secuenciación.
- Interpretación de resultados. Diagnóstico diferencial con otros virus
- Epidemiología molecular
6. CAPACITACIÓN EN ESTUDIOS ECO-EPIDEMIOLÓGICOS DE
ARBOVIRUS
LABORATORIO RECEPTOR
Instituto de Virología “Dr. J.M. Vanella”
Facultad de Ciencias Médicas
Universidad Nacional de Córdoba
Argentina
TUTORíA: Dra. Marta Contigiani
DURACIÓN: 2 semanas
FECHAS DISPONIBLES: 24 agosto/4 septiembre, o 19/30 octubre
OBJETIVOS: Formar recursos humanos para realizar estudios relacionados al
abordaje de casos, brotes y vigilancia de arbovirus desde una perspectiva
ecosistémica. En concreto, capacitación en metodologías de estudio de
comunidades de vectores y hospedadores y métodos de colecta y toma de
muestras (aves, mosquitos, roedores) y capacitación en técnicas de diagnóstico
clásicas y moleculares aplicables a arbovirus.
ACTIVIDADES ESPECÍFICAS. Toda actividad práctica tendrá su marco teórico.
- Trabajo de campo para entrenamiento de captura de aves y roedores y colecta
de mosquitos.
- Identificación de mosquitos. Preparación de homogeneizados.
- Extracción de ácidos nucleicos. Real Time PCR. Análisis de comunidades de
mosquitos.
- Métodos moleculares.
- Métodos clásicos: aislamiento y tipificación.
- Técnicas serológicas.
- Análisis e interpretación de resultados.