Octubre 2009 Diagnostic Update Actualidad en el Departamento de Microbiología Actualmente, en el Laboratorio de Referencia IDEXX la mayoría de estudios solicitados corresponden a bacteriología. Además se reciben muestras para estudios de parásitos, hongos y micobacterias. Las muestras para estudio bacteriológico tienen diversas procedencias, pero los dos grandes tipos de cultivos, según su origen, son los cultivos de orina y los cultivos óticos. Existen también otros tipos de cultivo, que aunque también son clínicamente importantes, no llegan a la cantidad numérica de los anteriores. 1. CULTIVOS DE ORINA Las infecciones de vías urinarias se producen generalmente por ascensión de bacterias a través de la uretra. La gran mayoría de las muestras que recibimos son obtenidas mediante cistocentesis, lo que asegura un resultado correcto, sin la presencia de gérmenes contaminantes que aparecen en las muestras obtenidas por micción espontánea o inducida y que pueden dificultar el diagnóstico del laboratorio. Los urocultivos suponen entorno al 25-30 % de los cultivos solicitados en nuestro laboratorio. El 55-60% de estos cultivos son negativos. En las muestras de estos cultivos negativos se realizan siempre estudios microscópicos con el fin de investigar la posible presencia de gérmenes que eventualmente no se recuperen en cultivo por diversas causas, como por ejemplo, algún tratamiento antibiótico previo que haya inhibido su capacidad de crecimiento. Enterobacterias Enterobacterias Streptococcus pyogenes En el resto de urocultivos se aíslan bacterias como agentes etiológicos de los procesos infecciosos y muy esporádicamente se han aislado levaduras. En el caso de los cultivos positivos, la mayoría corresponden a aislamientos de una sola bacteria. En una pequeña proporción se aíslan dos bacterias y en un 1% de los casos se aíslan 3 agentes. La bacteria aislada con más frecuencia en el laboratorio en estas muestras de orina ha sido Escherichia coli. Afortunadamente, la mayoría de los casos corresponden a cepas sensibles a todos los antibióticos, seguido de cepas resistentes únicamente a amoxicilina, o amoxicilina y trimetoprim/sulfametoxazol. También es de resaltar el aislamiento de cepas resistentes a amoxicilina, gentamicina y todas las quinolonas. Los siguientes gérmenes en frecuencia de aislamiento en las orinas remitidas a nuestro laboratorio son Enterococcus spp., Klebsiella spp., Proteus spp., Staphylococcus spp. y en menor grado otras enterobacterias, Streptococcus pyogenes, Streptococcus del grupo viridans y Pseudomonas aeruginosa. En cuanto a los patrones de antibiograma, aparecen frecuentemente resistencias a los antibióticos utilizados con más asiduidad en la clínica como son amoxiclina, amoxicilina + ácido clavulánico y quinolonas. 2. CULTIVOS ÓTICOS La anatomía del conducto auditivo de los perros facilita el problema de las infecciones óticas. Las causas primarias de otitis son las alergias, los parásitos, presencia de cuerpos extraños, exceso de pelo en el canal auditivo, malformaciones anatómicas o trastornos hormonales. Posteriormente a estas causas predisponentes actúan las infecciones producidas por bacterias o levaduras. Las bacterias y algunas levaduras son flora normal Streptococcus spp. Diagnostic Update 3. OTROS CULTIVOS El siguiente gran grupo de muestras lo representan los coprocultivos (un 10% del total). En el 85% no se aíslan patógenos bacterianos y en el 15% se aísla Salmonella o Campylobacter. También es habitual aislar altas concentraciones de Candida spp desplazando la flora bacteriana saprófita. Enterococcus spp. de los oídos de los perros, sin embargo en determinadas situaciones pueden proliferar y producir una infección. Los exudados óticos suponen el 23-26% de los cultivos solicitados en nuestro laboratorio. El 75-80 % de las muestras que recibimos para cultivo bacteriano y micológico son positivas y sólo en el 20-25 % restante no se aíslan gérmenes en el cultivo ni se observan en los estudios microscópicos. Pseudomonas aeruginosa y Staphylococcus spp, son las bacterias aisladas en la amplia mayoría de los casos. Las cepas de Pseudomonas generalmente presentan sensibilidad a todas las quinolonas y la gentamicina y sensibilidad variable a los antibióticos de vía tópica. Sólo se han aislado ocasionalmente algunas cepas multiresistentes. En cuanto a los Staphylococcus, dos tercios son sensibles a todos los antimicrobianos y el resto con patrones variados. Tras estas dos bacterias siguen en frecuencia de aislamiento Malassezia spp y Streptococcus pyogenes (casi siempre sensibles a todos los antibióticos excepto a gentamicina). Los exudados nasales también representan una parte de nuestro trabajo, ya que suponen el 4%. En el 65-70 % de estos cultivos se identifican agentes patógenos y en el resto flora saprófita del tracto respiratorio. Los microorganismos más identificados son Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus spp, y en menos ocasiones E.coli, Enterococcus, Streptococcus, Haemophilus o Pasteurella. Por otro lado, también se procesan muchas muestras de procedencias diversas. Estas muestras suponen un 25% de los cultivos solicitados en nuestro laboratorio, y se corresponden a abscesos, exudados conjuntivales, muestras respiratorias, exudados vaginales, exudados cutáneos, líquidos biológicos, úlceras, etc. Los cultivos son positivos en un 60-70% de los casos para diferentes especies que pueden variar sobre todo en función del origen y localización de la muestra. Por ello es muy importante que el veterinario adjunte siempre estos datos en la petición del laboratorio, ya que agiliza mucho el trabajo conocer los datos clínicos correspondientes a cada caso. Otros gérmenes identificados son Enterobacterias, Enterococcus, Streptococcus viridans, Neisserias, Haemophilus, Acinetobacter, etc. En el caso de las infecciones óticas positivas, el 44-47% corresponde al aislamiento de un germen, en el 26-29% de los casos se aísla dos gérmenes y en el resto 3 microorganismos. Laboratorio de Referencia IDEXX Laboratorio de Referencia IDEXX C/ Plom 2-8, 3º 08038 Barcelona Tel. 93 267 26 60 Fax 93 267 26 70 [email protected] www.vetlabsl.com E039-0909