YAU FLORES ELIZABETH GLOSARIO ACTIVIDAD ENZIMÁTICA. 1.- Activador enzimático: molécula o ion que al unirse a la enzima produce un aumento en la velocidad de la reacción catalizada. 2.- Afinidad: Estabilidad del complejo ES. Nos indica la capacidad que tiene la enzima para formar un complejo con un determinado sustrato. 3.- Apoenzima: es la parte proteica de una holoenzima, es decir, una enzima que no puede llevar a cabo su acción catalítica desprovista de los cofactores necesarios, ya sean iones metálicos (Fe2+, Zn2+, Mo2+, etc) u orgánicos, que a su vez puede ser una coenzima o un grupo prostético dependiendo de la fuerza de sus enlaces con la apoenzima. La apoenzima es por tanto catalíticamente inactiva hasta que se le une el cofactor adecuado. 4.- Catalizador: es una sustancia química, simple o compuesta, que modifica la velocidad de una reacción química, interviniendo en ella pero sin llegar a formar parte de los productos resultantes de la misma. 5.- Cinética enzimática: estudia la velocidad de las reacciones químicas que son catalizadas por las enzimas. El estudio de la cinética de una enzima permite explicar los detalles de su mecanismo catalítico, su papel en el metabolismo, cómo es controlada su actividad en la célula y cómo puede ser inhibida su actividad por fármacos o venenos o potenciada por otro tipo de moléculas. 6.- Coenzima: son pequeñas moléculas orgánicas no proteicas que transportan grupos químicos entre enzimas. A veces se denominan cosustratos. Estas moléculas son sustratos de las enzimas y no forman parte permanente de la estructura enzimática En el metabolismo, las coenzimas están involucradas en reacciones de transferencia de grupos (como la coenzima A y la adenosina trifosfato (ATP)), y las reacciones redox (como la coenzima Q10 y la nicotinamida adenina dinucleótido (NAD+)).Las moléculas de coenzima son a menudo vitaminas o se hacen a partir de vitaminas. Muchas coenzimas contienen el nucleótido adenosina como parte de su estructura, como el ATP, la coenzima A y el NAD+. Esta estructura común puede reflejar un origen evolutivo como parte de los ribozimas en un antiguo mundo de ARN. 7.- Cofactor: componente no protéico, termoestable y de bajo peso molecular, necesario para la acción de una enzima. El cofactor se une a una estructura proteica denominada apoenzima, y a este complejo se le denomina holoenzima. Entre los cofactores mencionables se encuentran: Iones metálicos (Fe2+, Cu2+, K+, Mn2+, Mg2+, entre otros) y moléculas orgánicas. El ion metálico puede actuar como: Centro catalítico primario. Grupo puente para reunir el sustrato y la enzima, formando un complejo de coordinación Agente estabilizante de la conformación de la proteína enzimática en su forma catalíticamente activa. 8.- Concentración salina: la concentración de sales del medio es crucial para una óptima actividad enzimática. Una elevada concentración o una ausencia de sales en el medio pueden impedir la actividad enzimática, ya que las enzimas precisan de una adecuada concentración de iones para mantener su carga y su estructura. 9.- Constante de Michaelis Km : se define como la concentración a la que la velocidad de la reacción enzimática es la mitad de la Vmax. En efecto, si KM = [S], la ecuación de Michaelis-Menten se reduce a: v = Vmax/2. El valor de KM da idea de la afinidad del enzima por el sustrato: A menor KM, mayor afinidad del enzima por el sustrato, y a mayor KM, menor afinidad. KM se define como (k2+k3/k1), donde las reacciones 2 y 3 destruyen el complejo ES, mientras que la reacción 1 lo forma. Así, si KM es grande, el complejo ES es inestable pues predomina la tendencia a destruirlo (poca afinidad hacia el sustrato), y si KM es pequeña, el complejo ES es estable, ya que predomina la tendencia a formarlo (gran afinidad hacia el sustrato). 10.- Constantes o parámetros cinéticos: son las constantes en las ecuaciones de velocidad, están formadas por constantes de velocidad de los pasos que constituyen la reacción catalizada. 11.- Constante catalítica Kcat: se le conoce como el número de recambios porque indica el número de ciclos catalíticos por sitio activo y por unidad de tiempo, solo puede conocerse cuando se tiene a la enzima pura y por lo tanto se conoce su concentración. Kcat= Vmax/ [E]total ó Kcat =Vmax/ [sitios activos] 12.- Ecuación de Michaelis –Menten: describe como la velocidad de la reacción depende del equilibrio entre la [S] y la constante k2. Leonor Michaelis y Maud Menten demostraron que si k2 es mucho menor que k1 (aproximación del equilibrio) se puede deducir la siguiente ecuación: Esta famosa ecuación es la base de la mayoría de las cinéticas enzimáticas de sustrato único. La representación gráfica de la ecuación de Michaelis-Menten (v0 frente a [S]0) es una hipérbola. La Vmax corresponde al valor máximo al que tiende la curva experimental, y la KM corresponde a la concentración de sustrato a la cual la velocidad de la reacción es la mitad de la Vmax. 13.- Energía de activación: al valor de la energía que es necesario aplicar (en forma de calor, electricidad o radiación) para que dos moléculas determinadas colisionen y se produzca una reacción química entre ellas. 14.- Enzimas: son moléculas de proteínas que tienen la capacidad de facilitar y acelerar las reacciones químicas que tienen lugar en los tejidos vivos, disminuyendo el nivel de la "energía de activación" propia de la reacción. Generalmente, las enzimas se nombran añadiendo la terminación "asa" a la raíz del nombre de la sustancia sobre la que actúan. Las enzimas no reaccionan químicamente con las sustancias sobre las que actúan (que se denominan sustrato), ni alteran el equilibrio de la reacción. Solamente aumentan la velocidad con que estas se producen, actuando como catalizadores. La velocidad de las reacciones enzimáticas dependen de la concentración de la enzima, de la concentración del sustrato (hasta un límite) y de la temperatura y el PH del medio. 15.- Enzima alostérica: es una enzima cuya actividad está regulada mediante un centro alostérico, que es un sitio, distinto del centro activo de la enzima, al que se une un regulador (llamado regulador alostérico) de manera reversible y no covalente. La unión de este regulador modifica la estructura tridimensional de la enzima y llega a afectar la configuración del sitio activo, por lo que aumenta o disminuye su actividad, según el caso. 16.- Especificidad: Es la capacidad que tiene una enzima de discriminar entre posibles sustratos. 17.- Especificidad absoluta: cuando las enzimas solamente catalizan la reacción en la que participa un sustrato. 18.- Especificidad de grupo: cuando las enzimas catalizan la reacción en la que participa un grupo de sustratos con ciertas características químicas y geométricas comunes. 19.- Espectrofotometría: permite detectar cambios en la absorbancia de luz por parte del sustrato o del producto (según la concentración de estos). 20.- Grupo prosteico: cuando la coenzima se une fuertemente a la enzima ya sea por medio de enlaces covalentes o interacciones no covalentes. Las proteínas con grupo prostético reciben el nombre de heteroproteínas (o proteínas conjugadas). 21.- Holoenzima: es una enzima que está formada por una proteína (apoenzima) y un cofactor, que puede ser un ion o una molécula orgánica compleja unida (grupo prostético) o no (una coenzima). En resumidas cuentas, es una enzima completa y catalíticamente activa. 22.- Inhibidor enzimático: son moléculas que reducen o anulan la actividad enzimática. Estos inhibidores pueden unirse a las enzimas de forma reversible (la desaparición del inhibidor restaura la actividad enzimática) o irreversible (el inhibidor inactiva permanentemente a la enzima). 23.- inhibidores Isostéricos: ejercen su acción sobre el centro activo, puede ser de dos tipos reversible e irreversible. 24.- Inhibidores alostéricos: ejercen su acción sobre otra parte de la molécula, causando un cambio conformacional con repercusión negativa en la actividad enzimática. 25.- Inhibidor reversible: se unen a las enzimas mediante interacciones no covalentes tales como los puentes de hidrógeno, las interacciones hidrofóbicas y los enlaces iónicos. Los enlaces débiles múltiples entre el inhibidor y el sitio activo se combinan para producir una unión fuerte y específica. Al contrario de lo que ocurre con el sustrato y los inhibidores irreversibles, los inhibidores reversibles generalmente no experimentan reacciones químicas cuando se unen a la enzima y pueden ser eliminados fácilmente por dilución o por diálisis. Se clasifican según el efecto de variar la concentración del substrato de la enzima en el inhibidor. 26.- Inhibición competitiva: el sustrato y el inhibidor no se pueden unir a la misma enzima al mismo tiempo. Esto generalmente ocurre cuando el inhibidor tiene afinidad por el sitio activo de una enzima en el que también se une el sustrato; el sustrato y el inhibidor compiten para el acceso al sitio activo de la enzima. Este tipo de inhibición se puede superar con concentraciones suficientemente altas del sustrato, es decir, dejando fuera de competición al inhibidor. Los inhibidores competitivos son a menudo similares en estructura al sustrato verdadero. En la gráfica de dobles recíprocos: No cambio en Vmax Si cambia Km 27.-Inhibición mixta: el inhibidor se puede unir a la enzima al mismo tiempo que el sustrato. Sin embargo, la unión del inhibidor afecta la unión del sustrato, y viceversa. Este tipo de inhibición se puede reducir, pero no superar al aumentar las concentraciones del sustrato. Aunque es posible que los inhibidores de tipo mixto se unan en el sitio activo, este tipo de inhibición resulta generalmente de un efecto alostérico donde el inhibidor se une a otro sitio que no es el sitio activo de la enzima. La unión del inhibidor con el sitio alostérico cambia la conformación (es decir, la estructura terciaria o la forma tridimensional) de la enzima de modo que la afinidad del sustrato por el sitio activo se reduce. En la gráfica de doble recíprocos se altera tanto el valor de la Vmax como el de la Km. 28.- Inhibición no competitiva: es una forma de inhibición mixta donde la unión del inhibidor con la enzima reduce su actividad pero no afecta la unión con el sustrato. Como resultado, el grado de inhibición depende solamente de la concentración de inhibidor. En la gráfica de doble recíprocos se altera tanto el valor de la Vmax como el de la Km. 29.- Inhibición acompetitiva: un inhibidor que no es capaz de unirse a la enzima libre, es decir sólo se une al complejo Enzima-Sustrato. Lo anterior puede deberse a que la unión del sustrato expone o crea sitios de acceso o unión para el inhibidor, en el o fuera del sitio activo. Una vez que el inhibidor se une la enzima se previene la formación de producto. El inhibidor acompetitivo altera la Km de la enzima. 30.- Inhibidor irreversible: Los inhibidores irreversibles son generalmente específicos para un tipo de enzima y no inactivan a todas las proteínas. No funcionan destruyendo la estructura proteínica, sino alterando específicamente la estructura tridimensional del sitio activo inhabilitándolo. Por ejemplo, el pH y las temperaturas extremas causan la desnaturalización de casi todas las proteínas, pero este no es un efecto específico. De forma similar, algunos tratamientos químicos no específicos destruyen la estructura de la proteína: por ejemplo, si son sometidas a una elevada concentración de ácido clorhídrico, el cual hidrolizará los enlaces peptídicos que mantienen unidos los aminoácidos de las proteínas. 31.- LDH: El LDH es una enzima que se encuentra en muchos tejidos del cuerpo, pero es mayor su presencia en el corazón, hígado, riñones, músculos, glóbulos rojos, en el cerebro y en los pulmones. La LDH tiene una gran variedad de isoenzimas con leves diferencias en su estructura, que sugieren diferentes orígenes por cada tejido: La LDH1 del corazón, músculos, y hematíes La LDH2 del sistema retículo endotelial y leucocitos La LDH3 de los pulmones La LDH4 de los riñones, placenta y páncreas. La LDH5 del hígado y músculo 32.- Modelo del estado estacionario: la concentración del complejo enzimasustrato es pequeña y constante a lo largo de la reacción. 33.- pH: el rango de pH óptimo también es muy variable entre diferentes enzimas. Si el pH del medio se aleja del óptimo de la enzima, esta verá modificada su carga eléctrica al aceptar o donar protones, lo que modificará la estructura de los aminoácidos y por tanto la actividad enzimática. 34.- Reacción que cataliza la lactato deshidrogenasa: La reducción del piruvato para formar lactato es reversible y dependiente de la presencia de una coenzima. 35.- Reacción de orden cero: la velocidad de formación del producto es independiente de la concentración de sustrato: v = k. reacción a concentraciones altas de sustrato se representa como una línea recta pero con pendiente casi igual a cero. 36.- Reacción de primer orden: la velocidad de formación de los productos es directamente proporcional a la concentración del sustrato: v = k [A]. Así, en la reacción: sacarosa + agua glucosa + fructosa La velocidad de hidrólisis de la sacarosa es, en todo momento, proporcional a la concentración de sacarosa. Dicho matemáticamente, donde [A] es la concentración de sacarosa a cada tiempo (t) y k es la constante de proporcionalidad. Se dice que ésta es una reacción de primer orden. 37.- Reacción de segundo orden: es aquella en la que la velocidad de formación del producto depende: - de la concentración de dos sustratos (como en una reacción de condensación): v = k [A1] [A2] -del cuadrado de la concentración de un único sustrato (reacción de dimerización): v = k [A]2 Se representa como una línea recta con pendiente positiva y diferente de cero tabla 1. ORDEN CERO PRIMER ORDEN SEGUNDO ORDEN Expresión diferencial de la velocidad Ecuación integrada de la [A] = -kt + [A]0 velocidad Vida (t1/2) Ln[A] = -kt + Ln[A]0 media Representación que da lugar a [A] vs t una recta Ln[A] vs t 1/[A] vs t Signo de pendiente negativo Positivo Significado de la -k pendiente -k K Significado de la ordenada en el [A]0 origen Ln[A]0 [A]0 es eb la negativo b 1/b 38.- Representación doble recíproca o de Lineweaver-Burk: Para determinar gráficamente los valores de KM y Vmax es más sencillo utilizar la representación doble recíproca (1/v0 frente a 1/[S]0), ya que es una línea recta. Esta representación doble recíproca recibe el nombre de representación de LineweaverBurk . Es una recta en la cual: La pendiente es KM/Vmax La abscisa en el origen (1/v0 = 0) es -1/KM La ordenada en el origen (1/[S]0 = 0) es 1/Vmax De esta forma, a partir de los datos experimentales se puede calcular gráficamente, los valores de KM y Vmax de un enzima para diversos sustratos. 39.- Sitio activo o centro catalítico: porción de la enzima que específicamente se une o reacciona con el sustrato. 40.- Sustrato: una molécula sobre la que actúa una enzima. El sustrato se une al sitio activo de la enzima, y se forma un complejo enzima-sustrato. El sustrato por acción de la enzima es transformado en producto y es liberado del sitio activo, quedando libre para recibir otro sustrato. La ecuación general es la siguiente: E + S ⇌ ES → EP ⇌ E + P donde E = enzima, S = sustrato(s), P = producto(s) 41.- Temperatura: las enzimas son sensibles a la temperatura pudiendo verse modificada su actividad por este factor. Los rangos de temperaturas óptimos pueden llegar a variar sustancialmente de unas enzimas a otras. Normalmente, a medida que aumente la temperatura, una enzima verá incrementada su actividad hasta el momento en que comience la desnaturalización de la misma, que dará lugar a una reducción progresiva de dicha actividad. 42.- Unidad de actividad enzimática (U): es la cantidad de enzima que cataliza la conversión de 1 µmol de sustrato por minuto. Se utiliza también en combinación con otras unidades (U/mg de proteína o U/mL) para señalar, respectivamente, la actividad enzimática específica o la concentración de actividad enzimática. 60 x 106 U equivalen a un katal, la unidad del Sistema Internacional de Unidades para actividad catalítica. Se calcula con la siguiente fórmula: Abs m * Vol. ensayo mL * F min Actividad mmol min 1 mg 1 M 1 cm1 * b cm * mg proteína m: es la pendiente de la recta (Abs/t) en unidades de abs / min : es el coeficiente de extinción molecular para el NADH, 6.22 x 103 M-1 cm-1. b: es la distancia de la celda, que corresponde a 1 cm Vensayo: es el volumen total del ensayo. F: es el factor de dilución para la enzima 43.- Velocidad de una reacción: puede determinarse bien midiendo la aparición de los productos o la desaparición de los reactivos. Al seguir la velocidad de aparición de producto (o de desaparición del sustrato) en función del tiempo se obtiene la llamada curva de avance de la reacción, o simplemente, la cinética de la reacción. A medida que la reacción transcurre, la velocidad de acumulación del producto va disminuyendo porque se va consumiendo el sustrato de la reacción. 44.- Velocidad inicial de la reacción: es igual a la pendiente de la curva de avance a tiempo cero. Si representamos v0 frente a [S]0 obtenemos una gráfica como la siguiente Que presenta un comportamiento exponencial. 45.- Velocidad máxima: es la velocidad límite a la que tiende la reacción catalizada por enzimas a concentraciones saturantes del sustrato, es decir cuando toda la enzima esta como ES. Vmax= k cat [E]total Complejo enzima-sustrato El efecto de saturación del enzima por el sustrato condujo a los primeros investigadores de la cinética enzimática, incluso antes de que se conociera la naturaleza proteica de los enzimas, a formular la hipótesis, hoy corroborada, de que el enzima y el sustrato se combinan de modo transitorio para formar un complejo enzima-sustrato (Figura 14.5) en el que se alcanza el estado de transición con mayor probabilidad que en la reacción no catalizada. Una vez alcanzado dicho estado el complejo enzima-sustrato se descompone para dar lugar a los productos y el enzima libre según se refleja en la siguiente ecuación: ESTADO DE TRANSICION La teoría cinética química establece que las reacciones químicas transcurren molécula a molécula de modo que una reacción tal como R (reactivos) → P (productos) tiene lugar porque una determinada fracción de la población de moléculas R, en un instante dado, posee energía suficiente como para alcanzar un estado activado llamado estado de transición, en el que es muy fácil que se rompan o se formen uno o más enlaces químicos para formar los productos P. Es frecuente confundir el estado de transición con un intermediario de reacción; sin embargo este estado no es ninguna especie química concreta, sino que podría definirse con más exactitud como un "momento molecular fugaz", altamente inestable, en el que uno o más enlaces químicos están muy próximos a romperse o a formarse CENTRO ACTIVO El centro activo es una cavidad existente en la superficie del enzima que está forrada interiormente por una serie de restos de aminoácidos. Por regla general los aminoácidos que forman parte del centro activo no se encuentran contiguos en la cadena polipeptídica, sino ocupando posiciones a veces muy alejadas en la misma. El hecho de que estos aminoácidos coincidan próximos entre sí sobre el centro activo no es más que una consecuencia del plegamiento característico de la cadena polipeptídica, es decir, de la conformación tridimensional nativa de la proteína enzimática. Puede resultar útil, aunque no siempre posible, distinguir entre los aminoácidos que forman parte del centro activo dos categorías: a) Aminoácidos catalíticos.- Son uno o más aminoácidos cuyas cadenas laterales R poseen unas 4 peculiaridades químicas tales que los facultan para desarrollar una función catalítica. Constituyen el verdadero centro catalítico del enzima. b)Aminoácidos de unión.- Son una serie de aminoácidos cuyas cadenas laterales R poseen grupos funcionales que pueden establecer interacciones débiles (puentes de hidrógeno, interacciones iónicas, etc.) con grupos funcionales complementarios de la molécula de sustrato. Su función consiste en fijar la molécula de sustrato al centro activo en la posición adecuada para que los aminoácidos catalíticos puedan actuar Kcat/KM: La razón Kcat/Km conocida como la constante de especificidad de una enzima, define la eficacia catalítica y el grado de evolución de una enzima. Este valor no puede superar el límite de difusión de dos substancias que van a reaccionar que es de 108-109 M-1s-1. Vmax indica aquella velocidad máxima alcanzable por una cantidad determinada de enzima a concentraciones saturantes de substrato. La Vmax es igual al producto de la constante de catálisis Kcat por la concentración total de enzima presente [Eo], permite obtener el valor de Kcat conociendo la enzima presente ACTIVIDAD ENZIMATICA Un enzima, por tanto, lo que hace no es más que acelerar la velocidad de una reacción química, de tal forma que ésta se realiza de forma prácticamente instantánea. La aceleración de una reacción química por medio de un enzima se produce gracias a la unión del sustrato susceptible de la reacción con el enzima determinado. Esta unión se produce mediante el perfecto acoplamiento entre el sustrato y el centro activo del enzima, formándose una estructura intermedia llamada complejo enzima-sustrato, imprescindible para que pueda llevarse a cabo la catálisis enzimática. Durante la formación de este complejo tiene lugar la transformación química del sustrato, ayudada por los aminoácidos catalíticos presentes en el centro activo. Como se la mide la actividad enzimática: La medida de la actividad de una enzima requiere determinar el consumo de S o la aparición de un P de la reacción en función del tiempo. La determinación cuantitativa de S o de P puede hacerse por diferentes métodos analíticos según el caso: espectrofotométricos (los más comunes), volumétricos, potenciométricos, radioquímicos, espectrofluorométricos. Independientemente del método utilizado, puede suceder que para, por ejemplo, una reacción enzimática: , pueda medirse Q en presencia de los otros componentes de la mezcla de reacción. En este caso, la reacción enzimática podría seguirse continuamente en función del tiempo. COMO SE REPRESENTA LA ACTIDAD La velocidad de una reacción enzimática varía al aumentar la temperatura de acuerdo a lo indicado en la Fig. 3, donde se representa una típica curva de actividad enzimática/temperatura. Tal dependencia refleja un doble efecto de la temperatura: positivo a bajos valores, debido al incremento general que experimenta la velocidad de cualquier reacción química al hacerlo la temperatura, y negativo a valores altos, debido a la desnaturalización térmica del enzima. Qué características generales tienen las enzimas Las enzimas presentan una serie de características notables como las siguientes: 1. Son proteínas que poseen un efecto catalizador al reducir la barrera energética de ciertas reacciones químicas. 2. Influyen sólo en la velocidad de reacción sin alterar el estado de equilibrio. 3. Actúan en pequeñas cantidades. 4. Forman un complejo reversible con el sustrato. 5. No se consumen en la reacción, pudiendo actuar una y otra vez. 6. Muestran especificidad por el sustrato. 7. Su producción está directamente controlada por genes. Por qué aumenta la velocidad en las reacciones catalizadas por las enzimas? Al contrario que las reacciones químicas, las enzimas se saturan. Esto significa que a mayor cantidad de sustrato, mayor número de centros catalíticos estarán ocupados, lo que incrementará la eficiencia de la reacción, hasta el momento en que todos los sitios posibles estén ocupados. En ese momento se habrá alcanzado el punto de saturación de la enzima y, aunque se añada más sustrato, no aumentará más la eficiencia. Cómo es un gráfico que explique cómo se efectúa una reacción catalizada por una enzima? Una reacción química A===>B tiene lugar porque cierto número de moléculas A se encuentran con la suficiente energía como para alcanzar un estado activado, que denominamos estado de transición, en el que es muy probable que se establezca o se rompa algún enlace químico y se forme entonces el producto P. La velocidad de una reacción será proporcional a la concentración de moléculas en ese estado de transición. Por eso hay 2 métodos generales mediante los cuales se puede acelerar la velocidad de una reacción química: -Elevar la temperatura: pues se incrementa el n1 de moléculas capaces de alcanzar el estado de transición (en muchas reacciones químicas la velocidad se duplica cada 10 1C de aumento de la T). -Añadir un catalizador: que se combina con los reaccionantes de forma transitoria y produce un estado de transición con menor energía de activación. (Nota: la energía libre de activación es la diferencia entre la energía libre -G- de 1 mol de sustancia en el estado de transición y la de 1 mol de sustancia en el estado inicial). Energía libre de activación (ΔGº) calculada para La descomposición de peróxido de hidrógeno a 20 ºC. La catalasa acelera la v de la reacción más de 108 veces. Condiciones log ΔGº(Kcal/mol) Sin catalizar 18 Catalizada con Pt coloidal 13 Catalizada por catalasa 7 Las enzimas aceleran la v de las reacciones por el segundo sistema. Actúan como catalizadores al disminuir la energía de activación de las sustancias reaccionantes. En toda reacción enzimática intervienen dos elementos: por una parte, la enzima; por otra, el sustrato (sustancia o sustancias que, mediante una reacción catalizada por la enzima, se transformará en otro producto o productos). Cuando se forman los productos de la reacción se regenera el catalizador libre. Otro análisis El modelo de ajuste inducido es el más utilizado al realizar estudios de interacción enzima31 sustrato. Este modelo propone que las interacciones iniciales entre la enzima y el sustrato son relativamente débiles, pero suficientes para producir ciertos cambios conformacionales en la enzima, que estabilizan e incrementan la fuerza de la interacción. Estos cambios conformacionales implican a una serie de aminoácidos catalíticos del centro activo, en los cuales se producen los enlaces químicos correspondientes entre la enzima y el sustrato. Después de la unión, uno o más mecanismos de catálisis disminuyen la energía del estado de transición de la reacción, por medio de una ruta alternativa a la reacción. Los mecanismos de catálisis se clasifican acorde a diferentes criterios: catálisis covalente, catálisis por proximidad y alineación de orbitales, catálisis ácido-base general, catálisis por iones metálicos y catálisiselectrostática. Los estudios de cinética enzimática no permiten obtener el tipo de catálisis utilizada por una enzima. Sin embargo, algunos datos cinéticos pueden proporcionar una serie de indicios que lleven a realizar otro tipo de estudios dirigidos a determinar dicho tipo de catálisis. Por ejemplo, en un mecanismo de ping-pong la cinética del estado pre-estacionario puede estar sugiriendo una catálisis de tipo covalente. Por otro lado, variaciones en el pH pueden producir efectos drásticos en la Vmax pero no en la Km, lo que podría indicar que un residuo del centro activo precisa un estado concreto de ionización para que se pueda llevar a cabo la catálisis enzimática. Que diferencia hay entre cinética de equilibrio químico rápido y cinética del estado estacionario? La cinética química es el área de la química que tiene que ver con la rapidez o velocidad con que ocurre una reacción. Este modelo cinético adopta la hipótesis del estado estacionario, según la cual la concentración del complejo enzima-sustrato es pequeña y constante a lo largo de la reacción. Por tanto, la velocidad de formación del complejo enzimasustrato (v1) es igual a la de su disociación (v2+ v3): v1 = v2 + v3 ACTIVIDAD ENZIMÁTICA Se define la unidad de actividad enzimática (U) como la cantidad de enzima que cataliza la conversión de 1 µmol de sustrato en un minuto. La actividad específica es el número de unidades de enzima por miligramo de proteína (U/mg prot) o por mililitro de disolución (U/ml). Recientemente, el Sistema Internacional de unidades (SI) ha definido la unidad de actividad enzimática como la cantidad de enzima que transforma 1 mol de sustrato por segundo. Esta unidad se llama katal (kat). Como 1 mol son 106 µmoles y 1 minuto son 60 segundos, resulta que 1 katal equivale a 60 x 106 U. Esta unidad es muy grande, de forma que se utilizan frecuentemente los submúltiplos como el microkatal (µkat, 106 kat) o el nanokatal (nkat, 10-9 kat). Cuando se conoce el peso molecular del enzima puro y el número de centros activos por molécula de enzima, las medidas de actividad enzimática permiten calcular el número de recambio del enzima, o sea, el número de reacciones elementales que realiza el enzima por cada centro activo y por unidad de tiempo Fuentes. http://www.ehu.es/biomoleculas/enzimas/enz3.htm http://www.scribd.com/doc/19002681/actividad-enzimatica http://www.worldlingo.com/ma/enwiki/es/Enzyme_inhibitor http://www.biologia.edu.ar/metabolismo/enzimas.htm