BIOQUÍMICA GENERAL CLASE # 14 Unidad V: Ácidos Nucleicos OBJETIVOS CONTENIDOS Conceptuales Procedimentales Actitudinales Conceptuales Procedimentales Actitudinales Analizar el concepto, composición y propiedades de los ácidos nucleicos. Utilizar el concepto, composición y propiedades de los ácidos nucleicos. Análisis del concepto, clasificación, composición y función de los ácidos nucleicos. Utilización del concepto, composición y función de los ácidos nucleicos. Clasificar los polímeros de ADN y ARN y sus funciones. Diferenciar las estructuras y funciones de los Nucleósidos y nucleótidos de ADN y ARN. Aprovechar la composición, clasificación, estructuras, propiedades y funciones de los ácidos nucleicos para ponerlos en práctica en su desarrollo profesional. Clasificación de los polímeros de ADN y ARN. Diferenciación de las estructuras y funciones de los Nucleósidos y nucleótidos de ADN y ARN. Aprovechamiento de la composición, clasificación, estructuras, propiedades y funciones de los ácidos nucleicos para ponerlos en práctica en su desarrollo profesional. Exponer las funciones de ADN y ARN en los seres vivos. Enunciar las funciones de ADN y ARN en los seres vivos. Exposición las funciones de ADN y ARN en los seres vivos. Interpretar las estructuras de polímeros de ADN y ARN en los seres vivos. Emplear las estructuras de polímeros de ADN y ARN en la resolución de ejercicios. Interpretación de las estructuras de polímeros de ADN y ARN en los seres vivos. Enunciación de las funciones de ADN y ARN en los seres vivos. Empleo de las estructuras de polímeros de ADN y ARN en la resolución de ejercicios. BIOQUÍMICA GENERAL CLASE # 14 ÁCIDOS NUCLEICOS INTRODUCCIÓN Todas las células contienen la información necesaria para realizar distintas reacciones químicas mediante las cuales las células crecen, obtienen energía y sintetizan sus componentes. Está información está almacenada en el material genético, el cual puede copiarse con exactitud para transmitir dicha información a las células hijas. Sin embargo estas instrucciones pueden ser modificadas levemente, es por eso que hay variaciones individuales y un individuo no es exactamente igual a otro de su misma especie (distinto color de ojos, piel, etc.). De este modo, podemos decir que el material genético es lo suficientemente maleable como para hacer posible la evolución. La información genética o genoma, está contenida en unas moléculas llamadas ácidos nucleicos. Existen dos tipos de ácidos nucleicos: ADN y ARN. El ADN guarda la información genética en todos los organismos celulares, el ARN es necesario para que se exprese la información contenida en el ADN; en los virus podemos encontrar tanto ADN como ARN conteniendo la información (uno u otro nunca ambos). COMPOSICIÓN QUÍMICA Y ESTRUCTURA DE LOS ÁCIDOS NUCLEICOS Los elementos que constituyen los ácidos nucleicos son: Carbono, Hidrógeno, Oxígeno, Nitrógeno y Fósforo. Por hidrólisis total estos ácidos producen: aminas heterocíclicas (Purinas o Pirimidinas), un azúcar de cinco átomos de carbono (Ribosa o Desoxirribosa) y ácido fosfórico. BIOQUÍMICA GENERAL CLASE # 14 AZÚCARES EN LOS ÁCIDOS NUCLEICOS En el ADN se encuentra el azúcar β-D-desoxirribosa y en el ARN el azúcar es β-D-ribosa, ambas se encuentran en un sistema anular furanósico. BASES NITROGENADAS EN LOS ÁCIDOS NUCLEICOS Las bases nitrogenadas son moléculas cíclicas y en la composición de dichos anillos participa, además del carbono, el nitrógeno. Estos compuestos pueden estar formados por uno o dos anillos. Aquellas bases formadas por dos anillos se denominan bases púricas (derivadas de la purina). Dentro de este grupo encontramos: Adenina (A), y Guanina (G). Si poseen un solo ciclo, se denominan bases pirimidínicas (derivadas de la pirimidina), como por ejemplo la Timina (T), Citosina (C), Uracilo (U). Estos derivados de la purina y la pirimidina son las bases que se encuentran con mayor frecuencia en los ácidos nucleicos. Bases púricas y pirimídicas: BIOQUÍMICA GENERAL CLASE # 14 a) En el ADN se encuentran cuatro bases nitrogenadas: Dos purinas; Adenina y Guanina, y dos pirimidínicas; Citosina y Timina. b) En el ARN se encuentran también cuatro bases nitrogenadas: Dos purinas; Adenina y Guanina, y dos pirimidínicas; Citosina y Uracilo. Existen algunas bases que fueron modificadas para desempeñar funciones muy específicas en las células. Existen otras bases nitrogenadas que son menos frecuentes, algunas de ellas están metiladas. En eucariontes estas bases metiladas participan del control de la expresión genética. Por ejemplo: LOS FOSFATOS Los fosfatos más comunes son los ortofosfatos. (Con el prefijo "orto" se suelen denominar los ácidos más hidratados). Contienen el anión PO43 . Los ortofosfatos se encuentran ampliamente distribuidos en la naturaleza, sobre todo en forma de apatita y forman parte esencial de dientes y huesos. En la materia viva el fósforo aparece siempre en forma de ion fosfato soluble (ortofosfato); el cual como igualmente se puede obtener de reacciones inorgánicas, en las ecuaciones bioquímicas se abrevia Pi (fosfato inorgánico). Además del Pi, en las reacciones puede aparecer implicado el pirofosfato (P2O74−) que se abrevia PPi. De la hidrólisis del segundo se obtiene el primero. Esa hidrólisis es muy exotérmica, y muy endotérmica la formación del puente entre átomos de fósforo, y es en eso en lo que se basa la función de los transferidores biológicos de energía, señaladamente el ATP. BIOQUÍMICA GENERAL CLASE # 14 Estructura de un fosfato orgánico: ESTRUCTURA DE LOS NUCLEÓSIDOS Un nucleósido es una molécula orgánica que integra las macromoléculas de ácidos nucleicos que resultan de la unión covalente entre una base heterocíclica con una pentosa que puede ser ribosa o desoxirribosa. Ejemplos de nucleósidos son la citidina, uridina, adenosina, guanosina, timidina. Los nucleósidos pueden combinarse con un grupo fosfórico (ácido fosfórico: H3PO4) mediante determinadas quinasas de la célula, produciendo nucleótidos, que son los componentes moleculares básicos del ADN y el ARN. Los nucleósidos pueden ser de dos tipos, dependiendo de la pentosa que contengan: Ribonucleósidos: la pentosa es la ribosa Desoxirribonucleósidos: la pentosa es la 2-desoxirribosa Base nitrogenada Nucleosido Desoxinucleosido Adenosina A Desoxiadenosina dA Guanosina G Desoxiguanosina dG Adenina Guanina BIOQUÍMICA GENERAL CLASE # 14 Timina 5-Metiluridina m5U Desoxitimidina dT Uridina U Desoxiuridina dU Citidina C Desoxicitidina dC Uracilo Citosina ESTRUCTURA DE LOS NUCLEÓTIDOS Los ácidos nucleicos resultan de la polimerización de monómeros complejos denominados nucleótidos. Un nucleótido está formado por la unión de un grupo fosfato al carbono 5’ de una pentosa. A su vez la pentosa lleva unida al carbono 1’ una base nitrogenada. Estructura del nucleótido monofosfato de adenosina (AMP) BIOQUÍMICA GENERAL CLASE # 14 Nucleótidos de importancia biológica ATP (adenosin trifosfato): Es el portador primario de energía de la célula. Esta molécula tiene un papel clave para el metabolismo de la energía. La mayoría de las reacciones metabólicas que requieren energía están acopladas a la hidrólisis de ATP. ATP (Adenosin trifosfato) AMP cíclico: El AMP cíclico (3’, 5´adenosinmonofosfato AMPc) es un derivado atípico pero importante de la adenosina que se encuentra en la mayor parte de a células animales, este media una serie de diversas señales estructurales de considerable importancia para el funcionamiento del organismo. El AMPc se forma a partir de ATP. BIOQUÍMICA GENERAL CLASE # 14 POLINUCLEÓTIDOS Existen dos clases de nucleótidos, los ribonucleótidos en cuya composición encontramos la pentosa ribosa y los desoxirribonucleótidos, en donde participa la desoxirribosa. Los nucleótidos pueden unirse entre sí, mediante enlaces covalentes, para formar polímeros, es decir los ácidos nucleicos, el ADN y el ARN. Dichas uniones covalentes se denominan uniones fosfodiéster, el grupo fosfato de un nucleótido se une con el hidroxilo del carbono 5’ de otro nucleótido, de este modo en la cadena quedan dos extremos libres, de un lado el carbono 5’ de la pentosa unido al fosfato y del otro el carbono 3’ de la pentosa. Estructura de un poli ribonucleótido NOMBRES DE LAS BASES, NUCLEÓSIDOS Y NUCLEÓTIDOS BIOQUÍMICA GENERAL CLASE # 14 Base nitrogenada Fuente Nucleósido Nucleótido Adenina ARN ADN Adenosina 2-Desoxiadenosina 5-fosfato de adenosina 5-fosfato de Desoxiadenosina Guanina ARN ADN Guanosina 2-Desoxiguanosina 5-fosfato de guanosina 5-fosfato de Desoxiguanosina Citosina ARN ADN Citidina 2-Desoxicitidina 5-fosfato de citidina 5-fosfato de Desoxicitidina Uracilo ARN Uridina 5-fosfato de Uridina Timina ADN 2-Desoxitimidina 5-fosfato de Desoxitimidina ÁCIDO DESOXIRRIBONUCLEICO (ADN). Los ácidos nucleicos fueron aislados por primera vez en 1869, sin embargo no fue hasta mucho después que se conoció su función. A principio de siglo pasado, los científicos que querían explicar cómo se transmitía y se almacenaba la información genética se enfrentaron a un problema, era el ADN o las proteínas los que portaban la información genética. Se sabía que el ADN constaba de solo cuatro tipo de monómeros, frente a los 20 aminoácidos que se encuentran formando parte de las proteínas, de manera que se pensaba que era demasiado sencillo como para guardar la información, por lo cual se le asignaba una función estructural. La evidencia que ha servido para esclarecer la función del ADN, ha procedido, por un lado, del hecho que la cantidad de ADN de una especie es constante, sin importar la edad, sexo, factores nutricionales o ambientales. Por otra parte, la cantidad de ADN tiene mayoritariamente una relación directa con la complejidad del organismo, así como también se observa que los gametos de los individuos con reproducción sexual poseen solo la mitad del ADN que posee cualquier de sus células somáticas. Sin embargo esto por si solo no confirmó la función del ADN. Por ello se llevaron a cabo una serie de experimentos que lo demostraron en forma concluyente. BIOQUÍMICA GENERAL CLASE # 14 En 1928, Griffith experimentó con distintas cepas de bacterias, una de ellas era la forma llamada lisa (L), rodeada de una cápsula de polisacáridos y causante de neumonía en los ratones. En contraste las cepas rugosas, no contenía el polisacárido y no era virulenta. Griffith experimentó con ratones. A unos inyectándoles cepas lisas muertas por calor, a otras cepas rugosas vivas y a otras una mezcla de cepa R viva con cepa L muertas por calor, en este último caso los ratones morían de neumonía, es decir que las células rugosas se habían transformado en cepas virulentas. En 1944 se demostró que ese principio transformador era el ADN y no las proteínas. EXPERIMENTO DE GRIFFITH Otra serie de experimentos realizados en 1952 por Hershey y Chase, demostraron en forma indiscutible que el ADN es el material genético. Trabajaron con virus llamados bacteriófagos; los bacteriófagos, están formados por ADN y proteínas, las proteínas forman una cubierta y en su interior se aloja el ADN. Se cultivaron virus en un medio que contenía fósforo radiactivo, de manera que al sintetizar su ADN, la molécula quedaba marcada radiactivamente. Otros virus se hicieron crecer en medio con azufre radiactivo, quedando marcadas radiactivamente las proteínas. Los virus tienen un mecanismo de acción muy particular, ya que no ingresan a la célula que infectan sino que solo inyectan su material genético. Luego se pusieron en contacto los virus que poseían las proteínas radiactivas con un cultivo de bacterias y lo mismo se hizo con los virus que tenían el ADN marcado. Experimento de Hershey y Chase BIOQUÍMICA GENERAL CLASE # 14 Si la información genética estaba contenida en el ADN la marca radiactiva debía estar en el interior de las bacterias de este último grupo, por el contrario si eran las proteínas las que cumplían dicha función la marca radiactiva estaría adentro de las bacterias del primer grupo. El resultado del experimento confirmó que el ADN era la molécula que buscaban, ya que se encontraba la marca radioactiva en el interior de las bacterias que se pusieron en contacto con ADN marcado. Una vez establecida su función faltaba determinar su estructura, como era posible que esa estructura repetitiva almacenara las distintas instrucciones. COMPOSICIÓN DE BASES DEL ADN: Muestras de ADN aisladas de diferentes tejidos de una misma especie tienen la misma proporción de bases heterocíclicas, pero muestras de diferentes especies pueden presentar grandes diferencias en la proporción de bases. Por ejemplo; En el ADN humano la proporción es: 30% de Adenina y 30% de Timina 20% de Guanina y 20% de Citosina REGLAS DE CHARGAFF: Existen algunas generalizaciones importantes respecto a los patrones de composición de bases nitrogenadas en el ADN, independiente de su origen. Estas generalizaciones han llegado a conocerse como las reglas de Chargaff, las cuales son las siguientes; 1. El número de bases purínicas (A + G) esta en equilibrio con el número de bases pirimidínicas (T + C); es decir, la razón aritmética entre purinas y pirimidinas es muy próximo a 1. (Purina/pirimidina = 1). 2. El número de residuos de Adenina está en equilibrio con el número de residuos de Timina; es decir, entre Adenina y Timina la razón aritmética es muy cercana a 1. (A/T = 1). 3. El número de residuos de Guanina está en equilibrio con el número de residuos de Citosina; es decir; la razón aritmética entre Guanina y Citosina es muy cercana a 1. (G/C = 1). MODELO DE WATSON Y CRICK PARA EL ADN En 1953 Watson y Crick propusieron el modelo de doble hélice, para esto se valieron de los patrones obtenidos por difracción de rayos X de fibras de ADN, y de los postulados enunciados por Chargaff que estableció que la cantidad de adenina de una molécula de ADN era igual a la cantidad de timina de la misma molécula y que la cantidad de guanina era igual a la cantidad de citosina, es decir que el contenido de purinas era igual al de pirimidinas. “El ADN consiste en dos cadenas de poli nucleótidos arrolladas entre si, formando una doble hélice. Las cadenas se forman opuestas y son mantenidas juntas por puentes de hidrógenos BIOQUÍMICA GENERAL CLASE # 14 entre pares de bases específicas; Adenina y Timina forman puentes de hidrógenos entre si; Guanina y Citosina forman puentes de hidrógenos entre si”. La complementariedad de pares de bases explica porque Adenina y Timina, Citosina y Guanina se encuentran siempre en cantidades iguales. El modelo de la doble hélice establece que las bases nitrogenadas de las cadenas se enfrentan y establecen entre ellas uniones del tipo puente de hidrógeno. Este enfrentamiento se realiza siempre entre una base púrica con una pirimídica, lo que permite el mantenimiento de la distancia entre las dos hebras. La Adenina se une con la timina formando dos puentes de hidrógeno y la citosina con la guanina a través de tres puentes de hidrógeno. Las hebras son antiparalelas, pues una de ellas tiene sentido 5’ 3’, y la otra sentido 3’ 5’. El modelo de Watson y Crick, describe a la molécula del ADN como una doble hélice, enrollada sobre un eje, como si fuera una escalera de caracol y cada diez pares de nucleótidos alcanzan para dar un giro completo. Excepto en algunos virus, el ADN siempre forma una cadena doble. BIOQUÍMICA GENERAL CLASE # 14 FACTORES QUE ESTABILIZAN LA DOBLE HÉLICE Los puentes de hidrógeno entre las bases tienen un papel muy importante para estabilizar la doble hélice, si bien individualmente son débiles hay un número extremadamente grande a lo largo de la cadena. Las interacciones hidrofóbicas entre las bases también contribuyen con la estructura. Los grupos fosfatos que se encuentran en el exterior de la doble hélice pueden reaccionar con el agua aportando mayor estabilidad. BIOQUÍMICA GENERAL CLASE # 14 ÁCIDO RIBONUCLEÍCO (ARN). El ácido ribonucleíco se forma por la polimerización de ribonucleótidos. Estos a su vez se forman por la unión de: a) un grupo fosfato. b) ribosa, una aldopentosa cíclica y c) una base nitrogenada unida al carbono 1’ de la ribosa, que puede ser citosina, guanina, adenina y uracilo. Esta última es una base similar a la timina. En general los ribonucleótidos se unen entre sí, formando una cadena simple, excepto en algunos virus, donde se encuentran formando cadenas dobles. La cadena simple de ARN puede plegarse y presentar regiones con bases apareadas, de este modo se forman estructuras secundarias del ARN, que tienen muchas veces importancia funcional, como por ejemplo en los ARNt (ARN de transferencia). BIOQUÍMICA GENERAL CLASE # 14 Estructura del ARN. Características. 1. Es un ácido nucleico de un solo filamento. 2. Contiene el azúcar D-ribosa. 3. Contiene la base Uracilo en lugar de Tiamina. 4. No cumple con las reglas de Chargaff por poseer una sola cadena. TIPOS DE ARN; Se conocen tres tipos principales de ARN y todos ellos participan de una u otra manera en la síntesis de las proteínas. Ellos son: El ARN mensajero (ARNm), el ARN ribosomal (ARNr) y el ARN de transferencia (ARNt). BIOQUÍMICA GENERAL CLASE # 14 ARN mensajero (ARNm) Consiste en una molécula lineal de nucleótidos (monocatenaria), cuya secuencia de bases es complementaria a una porción de la secuencia de bases del ADN. El ARNm dicta con exactitud la secuencia de aminoácidos en una cadena polipeptídica en particular. Las instrucciones residen en tripletes de bases a las que llamamos codones. Son los ARN más largos y pueden tener entre 1000 y 10000 nucleótidos. La conversión en proteínas de la información contenida en un segmento de ADN llamado gen, comienza con la síntesis de moléculas de ARNm. Estas moléculas de ARNm tienen como función fundamental llevar el mensaje genético desde el núcleo celular hasta los ribosomas, que son los que descifran el mensaje. Biosíntesis de ARNm. 1. La cadena de ADN que contiene el gen se llama cadena de información. 2. La cadena complementaria de la de información se llama cadena patrón y sólo está se transcribe en ARNm. 3. La cadena de ARNm producida es una copia casi exacta de la cadena de información, con la salvedad que el ARNm formado se encuentra la base nitrogenada Uracilo en vez de Timina. La orientación de la ARN polimerasa determina cuál de las dos cadenas de ADN actuará de patrón. BIOQUÍMICA GENERAL ARN ribosomal (ARNr) Este tipo de ARN una vez transcripto, pasa al nucleolo donde se une a proteínas. De esta manera se forman las subunidades de los ribosomas. Aproximadamente dos terceras partes de los ribosomas corresponde a sus ARNr. ARN de transferencia (ARNt) Este es el más pequeño de todos, tiene aproximadamente 75 nucleótidos en su cadena, además se pliega adquiriendo lo que se conoce con forma de hoja de trébol plegada. El ARNt se encarga de transportar los aminoácidos libres del citoplasma al lugar de síntesis proteica. En su estructura presenta un triplete de bases complementario de un codón determinado, lo que permitirá al ARNt reconocerlo con exactitud y dejar el aminoácido en el sitio correcto. A este triplete lo llamamos anticodón. CLASE # 14