Estudio de la enfermedad en poblaciones acuáticas: Epidemiología
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Estudio de la enfermedad en poblaciones acuáticas: Epidemiología Acuática Ignacio de Blas Facultad de Veterinaria Universidad de Zaragoza ¿Por qué Epidemiología? Directiva 2006/88 relativa a los requisitos zoosanitarios de los animales y de los productos de la acuicultura, y a la prevención y el control de determinadas enfermedades de los animales acuáticos Sistema de vigilancia zoosanitaria (Art. 10): – cualquier aumento de mortalidad (según el tipo de producción) – Enfermedades listadas (dependiendo de la presencia de especies susceptibles) (Anexo IV) – en todas las explotaciones y zonas de cría de moluscos Epidemiología Comparada Terrestres vs Acuáticos Pocas especies susceptibles Muchas especies susceptibles Pequeñas pob. cultivadas Enormes pob. cultivadas Tamaño de población conocido Tamaño de población desconocido Separación silvestre-granja Mezcla silvestre-granja Baja interacción con el ambiente Alta interacción con el ambiente Diagnóstico indirecto (serología) Diagnóstico directo Muestreo no destructivo Muestreo destructivo Preguntas y Respuestas ¿El patógeno está presente? Detección de enfermedad Vigilancia (status libre) Programas de erradicación ¿Cuánta enfermedad hay? Cálculo de Prevalencia Programas de control ¿Qué variables intervienen? Evaluación de factores de riesgo Elementos en estudios epidemiológicos Muestreo Fiabilidad Método de muestreo Tamaño de muestra Cálculo de resultados diagnóstica Deteción de Enfermedades Métodos de muestreo • Probabilísticos (aleatorios) • No probabilísticos × Probabilidad de detección Muestreo de voluntarios Muestreo de conveniencia Muestreo consecutivo (snow-ball) Muestreo por criterios objetivos Decisión 2001/183 Para VHS e IHN: Las inspecciones clínicas deberán efectuarse durante el período comprendido entre octubre y junio o siempre que la temperatura del agua esté por debajo de los 14 °C. Cuando las explotaciones deban ser inspeccionadas clínicamente dos veces al año, los intervalos entre ambas visitas deberán ser de un mínimo de 4 meses. Todas las unidades de producción (estanques, tanques, jaulas de red, etc.) deberán inspeccionarse para comprobar si hay peces muertos, débiles o que actúen de manera anormal. Deberá prestarse especial atención a la zona de desagüe, donde los peces débiles tienen tendencia a acumularse debido a la corriente de agua. Si hay truchas arco iris, toda la muestra estará compuesta de peces de esa especie. Detección de enfermedad: tamaño de muestra ⎛ n = ⎜1− 0.05 ⎜ ⎝ 1 d ⎞ ⎛ − d 1 ⎞ ⎟ ⋅ ⎜N − ⎟ ⎟ ⎝ 2 ⎠ ⎠ n: tamaño de muestra necesario Método de muestreo d: nº de enfermos esperado en la población no probabilístico N: tamaño de población OIE: Manual de Pruebas de Diagnóstico para los Animales Acuáticos Un valor de prevalencia de diseño a nivel de animal (ej., prevalencia de los animales de una jaula) puede ser de: • entre 1% y 5% para infecciones que se trasmiten de forma lenta, y • más del 5% contagiosas. para infecciones más Para una concentración al primer nivel (ej. la proporción de piscifactorías de una zona), se considera como conveniente una prevalencia de hasta el 2%. Detección de enfermedad 10% n 5% 2% 160 160 140 120 100 80 60 60 40 40 20 20 00 5 0 400 875 875 1350 1350 1825 1825 2300 N Fiabilidad diagnóstica Máximo Valor Predictivo Negativo Máxima Sensibilidad Fiabilidad diagnóstica Sensibilidad = P(Positivo | Infectado) Test evaluado Gold standard Positivo Negativo Total Infectado Sano Verdadero Positivo Falso Negativo Falso Positivo Verdadero Negativo Infectado Total Sano Especificidad = P(Negativo | Sano) Fiabilidad diagnóstica Máximo Valor Predictivo Negativo Minimizar Falsos Negativos Máxima Sensibilidad Causas de los Falsos Negativos • Entender la evolución de la enfermedad • Límite de detección diagnóstica • Uso de pools Evolución temporal de la enfermedad 1. Periodo de Latencia Infección Ö Diagnóstico 2. Periodo de Prepatencia Infección Ö Infectante Liberación de patógenos 3. Periodo de Incubación Infección Ö Enfermedad Ab Latencia > Incubación Latencia Infección Síntomas Diagnóstico Incubación Latencia < Incubación Latencia Infección Diagnóstico Incubación Síntomas Latencia > Prepatencia Latencia Infección Eliminación Diagnóstico Síntomas Prepatencia Latencia < Prepatencia Latencia Infección Diagnóstico Prepatencia Eliminación Síntomas Carga patógeno Límite de Detección vs Sensibilidad Límite de detección Resultados negativos Resultados positivoss Carga patógeno Resultados negativos Tiempo Límite de detección Resultados negativos Resultados positivos Resultados negativos Tiempo Consecuencias del pooling Efecto de dilución Ö disminuye Sensibilidad i.e. Nivel de detección ≥ 104 105 0 0 0 0 0 0 0 0 0 = 104 104 0 0 0 0 0 0 0 0 0 = 103 Factores a tener en cuenta: •Nivel de detección •Tamaño del Pool •Carga patógenos en asintomáticos / enfermos •Prevalencia Decisión 2001/183 E1 fluido ovárico o las partes de órganos de un máximo de 10 peces podrán recogerse en un solo tubo estéril que contenga al menos 4 ml de medio de transporte, para constituir una muestra conjunta. El peso del tejido de cada muestra deberá ser de 0,5 gramos como mínimo). Cálculo de Prevalencia Métodos de muestreo • Probabilísticos (aleatorios) • No probabilísticos Máxima representatividad Métodos probabilísticos • Muestreo aleatorio simple o puro • Muestreo sistemático • Muestreo estratificado – Distribución proporcional – Distribución significativa • Muestreo de conglomerados • Muestreo multietápico Muestreo aleatorio simple 15 32 41 17 57 03 23 28 37 38 33 27 Muestreo aleatorio simple 9 1 2 3 4 10 5 6 7 8 11 Muestreo sistemático Muestreo estratificado Muestreo de conglomerados Muestreo multietápico Cálculo de prevalencia: tamaño de muestra P ⋅ (1− P) n = 3.8416 ⋅ 2 E n: tamaño de muestra necesario Prevalencia desconocida P: prevalencia esperada E: error Usar aceptado o precisión P =absoluto 0.5 (50%) Cálculo de prevalencia: tamaño de muestra 20% 400 n400 10% 5% 350 350 300 300 250 250 200 200 150 150 100 100 50 50 00 00 0,25 0.25 0,5 0.50 0,75 0.75 11 P Medidas transversales Población en riesgo Casos Muertos Morbilidad Casos Población en riesgo Mortalidad Muertos Población en riesgo Letalidad Death Mortalidad Casos Morbilidad Consideraciones para el cálculo • Intervalos de confianza (tamaño de muestra) • Impacto de fiabilidad diagnóstica • Uso de pools Cálculo de límites del IC95% Variable cualitativa p ⋅ (1− p) p ± 1.96 ⋅ n Depende del tamaño de muestra ⎛ ⎞ p ⋅ ( 1 − p ) p ⋅ ( 1 − p ) ⎜ p - 1.96 ⋅ ⎟ , p + 1.96 ⋅ ⎜ ⎟ n n ⎝ ⎠ Valores predictivos Valor Pred. Positivo = P(Infectado | Positivo) Test evaluado Gold standard Positivo Negativo Infectado Sano Verdader o Positivo Falso Negativo Falso Positivo Verdadero Negativo Total Positivos Negativos Total Valor Pred. Negativo = P(Sano|Negativo) Prevalencia verdadera vs Prevalencia aparente Pr ev verdadera = Pr ev aparente + Es − 1 Se + Es − 1 Uso de pools: cálculo de prevalencia ⎛ pools positivos ⎞ ⎟⎟ p = 1− ⎜⎜1− pools totales ⎠ ⎝ 1 tamaño de pool Resumen Diferencias metodológicas Método de muestreo Detección Enfermedad Cálculo Prevalencia No probabilistico Probabilistico Criterios objetivos Mínima preval. Tamaño de Tamaño población muestra Fiabilidad diagnóstica Máxima Sensibilidad Aleatorio/Sistemático Preval. esperada Precisión Sensib./Especif. conocidas Factores de riesgo
