Descifrando el RHIZOBIUMOMA de Rhizobium etli CFN42 en

Descifrando el RHIZOBIUMOMA de Rhizobium etli CFN42 en la vida
libre y en la simbiosis con Phaseolus vulgaris
Sergio Encarnación-Guevara
Laboratorio de Proteómica, Programa de Genómica Funcional de Procariotes, Centro de
Ciencias Genómicas, Universidad Nacional Autónoma de México. Av. Universidad s/n
C.P. 62100. Cuernavaca Mor., México.
R. etli es una bacteria gram negativa que posee la capacidad de vivir en vida libre en
la rizosfera y de establecer simbiosis con P. vulgaris. En respuesta a la infección por esta
bacteria, la planta genera un nuevo órgano, llamado nódulo, en el cual la bacteria
diferenciada a bacteroide fija el nitrógeno atmosférico. La Fijación biología del nitrógeno
es un proceso esencial para la vida y este proceso es llevado a cabo en un 70% por
Rizobiaceas. La transformación de una bacteria de vida libre en un bacteroide fijador de
nitrógeno implica una serie de regulados cambios metabólicos y de desarrollo.
Utilizando herramientas de Genómica, Proteómica, Transcriptómica y Metabolómica
que colectivamente hemos llamado Rhizobioma estamos tratando de descifrar las
diferencias y similitudes metabólicas y regulatorias presentes entre estos dos estados
fisiológicos, así como las condiciones metabólicas necesarias que conducen a una bacteria
de vida libre a establecer este tipo de simbiosis. Adicionalmente nuestro estudio ha sido
acompañado por un análisis computacional que ha tenido como meta integrar la
información obtenida mediante estas herramientas "omicas". De esta manera utilizando
secuenciación masiva, electroforesis bidimensional-MALDITOF y cromatografía liquida
acoplada a MS (proteómica), transcriptómica mediante microarreglos y metabolómica (CEMS) hemos identificado más de 2000 proteínas, 1474 genes diferencialmente regulados y
220 metabólitos en los dos estados fisiológicos mencionados. Adicionalmente, utilizando
herramientas computacionales de bioinformática y biología de sistemas hemos podido
descifrar aspectos importantes necesarios para una eficiente fijación de nitrógeno y para la
sobrevivencia de la bacteria en la rizosfera.
Parte de este trabajo ha sido apoyado por los donativos de la DGAPA-UNAM IN206113 y del CONACYT 220790.