Presentacion-laboratorios-vigilancia-ira

Vigilancia de la Infección Respiratoria
Aguda en Colombia
Dirección Redes en Salud Pública
Dirección de Vigilancia y Análisis del Riesgo en Salud Pública
Introdución

Aproximadamente 4.000.000 de muertes por año son notificados con IRA.
(Chonmaitree, 2008)

3,6 millones de casos fatales ocurre en los menores de 5 años.
(Chonmaitree,
2008; Lopez A, 2006; Mathers C, 2008).
 Principal causa de hospitalización y de administración de antibióticos en
menores de 5 años. (Neuzil y Cols, 2003; Navarro-Mari y Cols, 2003)
Instituto Nacional de Salud
Virus Respiratorios “ clásicos”
Virus Sincitial Respiratorio (A, B)
Parainfluenza virus (1, 2, 3, 4A,B)
Coronavirus (229E, OC43)
Rinovirus (100+ serotipos)
& Enterovirus (65 serotipos)
Adenovirus (51+ serotipos)
Instituto Nacional de Salud
Virus respiratorios “emergentes”
descubiertos entre 2002-2012
• Metapneumovirus humano, 2002
•
SARS coronavirus, 2003
• Coronavirus humanos NL63, 2004; HKU1,
2005
• Bocavirus humanos, 2005
•
Mimivirus, 2005
• Adenovirus tipo 14, 2006
•
Rinovirus especie C, 2006
•
WU & KI polyomavirus, 2007
•
Enterovirus 68, 2010
•
Nuevo coronavirus, 2012
MERS
Instituto Nacional de Salud
Virus de influenza tipo A y B
Tipo de virus de
influenza
Influenza A
Características del virus
•
•
•
Puede causar epidemias y pandemias.
Puede infectar a varias especies
La combinación de dos proteínas en la superficie del virus, la
hemaglutinina (HA) y la neuraminidasa (NA), determina los
subtipos
 Hay 16 variedades conocidas de HA
 Hay 9 variedades conocidas de NA
Hay 144 (16x9) combinaciones posibles
Influenza B
• Produce casos mayormente leves
• Puede causar epidemias
• Ocurre sólo en seres humanos
Dos linajes (yamagata y Victoria)
Influenza C
Ocurre sólo en seres humanos
•
•
•
•
•
A / H3
A (H1N1)pdm09
A / H3 sw
A (H5N1)
A (H7N9)
Instituto Nacional de Salud
¿Como lo hacemos?
vigilamos
Ambulatorio (ESI)
Hospitalización (IRAG o IRAGi)
Donde se realiza una vigilancia:
 Nacional
 Centinela
IFI
Técnicas
moleculares
Análisis de datos
RT-PCR en tiempo real (protocolo CDC).
Instituto Nacional de Salud
¿Por que la vigilancia Virológica?
Instituto Nacional de Salud
Antecedentes en Colombia
1997
NIC (WHO
Global Influenza
Surveillance
Network (GISN)
2006
5 centinelas
• Plan anti
pandemia
• 40 UPGDs
• IFI en 12 LSPD.
2009
• Pandemia A
(H1N1)pdm09
• 40 UPGDs
• 15 LSPD con
IFI, 3 con rRTPCR
UPGD centinela:
•Atención médica ambulatoria y/o de hospitalización
•Atención a población menor y mayores de cinco años.
•Pertenezcan a la red pública o privada.
•Cuenten con recurso humano.
•Compromiso institucional y capacidad logística para implementar y desarrollar los procesos
operativos y técnicos de la vigilancia de ESI/IRAG
NIC: Centro Nacional de Influenza
UPGD: Unidad primaria generadora de de datos
Instituto Nacional de Salud
¿Qué es un NIC?
•
Centros Nacionales de
Influenza que hacen parte
de la red de laboratorios
de la OMS
•
En 23 países:
•
•
•
Fuente:OPS/OMS
24 NICs + 6 labs nacionales
= Red Global de Influenza
(GISRS).
RT-PCR / IFI
1 CC-OMS (CDC Atlanta,
USA)
CC-OMS: Centro colaborador de la orgnización Mundial de la Salud
Instituto Nacional de Salud
Red de IRA por laboratorio
LSPD CON CAPACIDAD
DIAGNOSTICA VIGIALNCIA
CENTINELA DE ESI - IRAG
Amazonas
Arauca
Antioquia
Atlántico
Bogotá
Boyacá
Caldas
Cundinamarca
Cesar
Huila
Meta
Quindío
Risaralda
Santander
Nariño
Nte. Santander
Valle
LSPD con Dx IFI
LSPD que remiten mx
LSPD con Dx rRT-PCR
LSP Bogotá
DEPARTAMENTOS QUE
REMITEN MUESTRAS AL INS
EN LA VIGILANCIA
CENTINELA DE ESI-IRAG
Guaviare
Tolima
Bolívar (Cartagena)
Instituto Nacional de Salud
Red de laboratorio para la vigilancia
de influenza
Flu A : qRT-PCR: (protocolo CDC)
- Gen M: influenza A
- Subtipos (Gen H): (H1N1)pdm09, H3
Virus no Flu (21): qRT-PCR (protocolo CDC)
14 laboratorios departamentales
26 UPGD
Instituto Nacional de Salud
Capacidad de laboratorio en
Colombia
Flu A y B: qRT-PCR: (protocolo CDC)
Virus no Flu (19 ) : qRT-PCR (protocolo CDC)
PCR convencional
Aislamiento viral: Flu (MDCK), VSR (Hep-2),
AdV(H292), hMPV (LLMCK-2)
Envió al CDC: Formulación anual de la vacuna
de Influenza
Estandarización de técnicas moleculares para:
Resistencia a Oseltamivir
Linaje de Influenza B
 Estudios: Carga de la enfermedad de influenza –
Efectividad de la vacuna de influenza.
Instituto Nacional de Salud
Sistema de información regional/global
OPS/OMS
Instituto Nacional de Salud
Circulación de influenza en la
region de las Americas
Fuente:OPS/OMS
Instituto Nacional de Salud
Circulación de VSR
Fuente:OPS/OMS
Instituto Nacional de Salud
Algoritmo de información
Médicos / Instituciones Centinelas
Departamentos (LSP)
Instituto Nacional de Salud
Centro Colaborador de Referencia Para la Investigación contra Influenza
CDC de Atlanta, Georgia, USA
Organización Mundial de la Salud
(OMS - Ginebra)/Flunet
Instituto Nacional de Salud
Vigilancia virológica
La recolección de muestras
respiratorias
únicamente
y
semanalmente (100%) en las
UPGDs seleccionadas para la
vigilancia
centinela
en
los
departamentos priorizados.
ESI
(centinela)
Morbilidad
y
mortalidad
<5años
IRA
IRAG
(centinela)
 Monitorear semanalmente los
agentes virales
 Identificar grupos de riesgo
 Implementar medidas de salud
pública
IRAGi
ESI: Enfermedad similar a influenza (ambulatorio)
IRAG: Infecció Respiratoria Aguda Grave (hospitalizado)
IRAG: Infección Respiratoria Aguda Grave inusitada
Instituto Nacional de Salud
Detección por laboratorio
El éxito dependera de:
• Cálidad de la muestra:
• Bien tomada (Celularidad)
• Bien conservada (Viabilidad viral, Integridad de AN)
• Bien enviada (Oportunidad y bioseguridad)
• Momento de la infección en que se toma la mx:
• Dinámica viral
• Respuesta inmune
Instituto Nacional de Salud
Ensayos Virológico
Muestras nasofaríngeas
(siete primeros días de inicio
de los síntomas)
METODOS TRADICIONALES
INMUNOFLUORESCENCIA
IFA / IFD
Fuente: Grupo de Virología –SRNL -INS
CULTIVO CELULAR
METODOS MOLECULARES
rRT-PCR
Fuente: Grupo de Virología –SRNL -INS
Instituto Nacional de Salud
Carga viral
Dinámica Viral
Días de infección
inmunofluorescencia
Aislamiento viral
Instituto Nacional de Salud
Muestra: Hisopado
CORRECTO
INCORRECTO
BAJO
VOLUMEN
HISOPO DE MADERA
Instituto Nacional de Salud
Muestra de Aspirado Nasofaringeo
CORRECTO
INCORRECTO
Instituto Nacional de Salud
Muestras de tejidos postmortem
CORRECTO
INCORRECTO
Instituto Nacional de Salud
muestra: sangre total que envían
con tejidos
INCORRECTO
Instituto Nacional de Salud
Vigilancia Virológica IRA
 En los casos de Enfermedad Similar a Influenza – ESI y/o casos de
Infección Respiratoria Aguda Grave –IRAG: se realiza la recolección de
muestras respiratorias únicamente en las UPGDs seleccionadas para la
vigilancia centinela en los departamentos priorizados. Estas muestras son
procesadas para diagnóstico de Influenza y otros virus respiratorios por la
técnica de inmunofluorescencia y/o rRT-PCR en los respectivos laboratorios
departamentales o distrital de salud pública (LDSP),
Los LDSP capacitados para realizar el diagnóstico de Influenza y otros Virus
Respiratorios por la técnica de Inmunofluorescencia (IFI), deben procesar las
muestras de casos captados en la vigilancia centinela de ESI-IRAG y remitir
mensualmente la información de las muestras procesadas y el control de
calidad indirecto al INS.
Instituto Nacional de Salud
Vigilancia Virológica IRA
En un caso fatal con alta sospecha de muerte por algún agente
respiratorio, se recomiendan cortes de tejido del tracto respiratorio en solución
salina refrigerados para análisis virológico con contra muestra en formol
tamponado al 10% para estudio histopatológico y se deben enviar al INS.
Si es sospecha de un caso de IRAG inusitado se debe recolectar muestra y
enviar al INS
Los Departamentos que no tengan capacidad diagnostica solo deben
recolectar muestras que cumplan con la definición de caso IRAG inusitado
o cuando se trate de un caso fatal.
Instituto Nacional de Salud
100
100%
90
90%
80
80%
70
70%
60
60%
50
50%
40
40%
30
30%
20
20%
10
10%
0
0%
1
3
5
7
9
11 13 15 17 19 21 23 25 27 29 31 33 35 37 39 41 43 45 47 49 51
Otros
Bocavirus
Coronavirus
Rinovirus
Metapneumovirus
Adenovirus
Parainfluenza
Influenza B
A(H3)
A no subtipificado
A(H1N1)pdm09
% Positivos
Fuente: Red Nacional de laboratorios de influenza y otros virus respiratorios
VSR
Instituto Nacional de Salud
Porcentaje de positivos
Numero de muestras positivas
Distribución de virus de influenza y
otros virus respiratorios. Colombia
sem 36
Distribución de influenza (tipos y subtipos).
Colombia. 2015
30
100%
90%
Número de casos positivos
25
80%
70%
20
60%
15
50%
40%
10
30%
20%
5
10%
0
0%
1
3
5
7
9
11 13 15 17 19 21 23 25 27 29 31 33 35 37 39 41 43 45 47 49 51
Semana Epidemiológica
A(H1N1)pdm09
A no subtipificado
A(H3)
Influenza B
Fuente: Red Nacional de laboratorios de influenza y otros virus respiratorios
% positivos a influenza entre total de muestras
Instituto Nacional de Salud
Proporción acumulada de los virus
de influenza y otros virus
respiratorios
Bocavirus
5% Otros A(H1N1)pdm09
1%
5%
Coronavirus
5%
Rinovirus
4%
A(H3)
5%
Flu B
1%
Metapneumovirus
4%
Parainfluenza
12%
Adenovirus
7%
VSR
51%
A(H1N1)pdm09
A no subtipificado
A(H3)
B Victoria
B Yamagata
B linaje no determinado
Parainfluenza
VSR
Adenovirus
Metapneumovirus
Rinovirus
Coronavirus
Bocavirus
Otros
Fuente: Red Nacional de laboratorios de influenza y otros virus respiratorios
Instituto Nacional de Salud
Circulación del virus de influenza y otros virus
respiratorios, Colombia 2010 - 2014
300
N=6.460 muestras
positivas
Número de muestras positivas
250
200
26,5%
39,8%
57,3%
9 12 15 18 21 24 27 30 33 36 39 42 45 48 51 2
5
150
100
50
0
1
4
7 10 13 16 19 22 25 28 31 34 37 40 43 46 49 52 3
6
2013
A(H1N1)pdm09
Metapneumovirus
A no subtipificado
Rinovirus
2014
A(H3)
Coronavirus
influenza B
Bocavirus
Parainfluenza
Otros
8 11 14 17 20
2015
VSR
Muestras Negativas
Adenovirus
Instituto Nacional de Salud
Vigilancia de ESI
Fuente:INS
Instituto Nacional de Salud
Vigilancia de IRAG
Fuente:INS
Instituto Nacional de Salud
Circulación viral en ESI
ESI
2013
2014
2015
Fuente:INS
Instituto Nacional de Salud
Circulación viral de IRAG
IRAG
2013
2014
2015
Fuente:INS
Instituto Nacional de Salud
Resumen
• Los LDSP que han sido capacitados para realizar el diagnóstico de
Influenza y otros Virus Respiratorios por la técnica de
Inmunofluorescencia (IFI), deberán procesar las muestras de casos
captados en la vigilancia centinela de ESI-IRAG, que tengan hasta
7 días de inicio de síntomas, las muestras que tengan más de 7
días de inicio de síntomas deben ser procedas por LSPD
capacitado para realizar PCR o remitirlas al INS.
Por lo anterior, se debe remitir de inmediato las muestras con resultado
positivo para influenza tipo A y B por IFI al LSPD capacitado para PCR o
al INS, con el fin de realizar la debida subtipificación del virus de Influenza
tipo A y confirmación de influenza B
Instituto Nacional de Salud
Resumen
• Los LDSP con capacidad de realizar diagnóstico molecular de Influenza
A, mediante la técnica de PCR en tiempo real (rRT-PCR), deberán
procesar las muestras de todos los casos de IRAG con fecha de inicio
de síntomas hasta 10 días de incio de síntomas , exceptuando los casos
de IRAG inusitado los cuales se deben remitir al INS.
Adicionalmente, las muestras con resultado positivo para Influenza A
que no se puedan subtipificar, es decir, que no correspondan A(H1N1)
pdm09, con el fin identificar otro subtipo del virus de influenza.
Instituto Nacional de Salud
Retos en la vigilancia por laboratorios
 Mejorar el sistema de información desde el nivel local hasta el nivel
nacional articulada la información de vigilancia epidemiológica con la
información del laboratorio.
 Fortalecer la vigilancia virologica y epidemiologica de IRA en cuanto a
captación del caso (ESI/IRAG, IRAGi), recolección, procesamiento,
transporte y notificación y ajuste del caso
 Fortalecer la RNL para que el diagnóstico del laboratorio permita la
detección oportuna de la circulación de agentes virales de interés en
salud pública.
 Hacer retroalimentación de la información desde el nivel nacional
hasta el nivel local
 Descentralizar el diagnóstico molecular influenza a otros laboratorios
del país.
Instituto Nacional de Salud
Agradecimientos
A las UPGDs que son la vital para la vigilancia
centinela de IRA en Colombia.
A los Laboratorios de Salud Pública que hacen
parte de la Red Nacional de Influenza y otros
virus respiratorios del país.
A las referentes de Vigilancia epidemiologica de
los LSP, del INS (Diana Malo y Paola Pulido) y a
los referentes de IRA del Minsterio de Salud.
A las estudiantes y compañeras que han hecho y
hacen parte del grupo de influenza y otros virus
respiratorios del INS
Instituto Nacional de Salud
GRACIAS
Dirección de Redes en Salud Pública
Dirección de Vigilancia y Análisis del Riesgo en Salud Publica
Equipo Funcional IRA
Juliana Barbosa – Erika Ospitia
[email protected] - [email protected]
Diana Malo – Paola Pulido
[email protected]
- [email protected]
Instituto Nacional de Salud
PBX: (57-1) 220 77 00
Bogotá, COLOMBIA
www.ins.gov.co
Línea gratuita nacional: 01 8000 113 400
Instituto Nacional de Salud