Universidad de Puerto Rico Recinto Universitario de Mayagüez Departamento de Biología

Universidad de Puerto Rico
Recinto Universitario de Mayagüez
Colegio de Artes y Ciencias
Departamento de Biología
Programa de Biología, Pre-médica, Microbiología Industrial
Prontuario Oficial
Micología Superior - BIOL 6642
Horas créditos: 3
Requisitos previos:
Horas contacto: 2 horas conferencia y 3 laboratorio semanales
Requisitos concurrentes:
Descripción del curso en español:
Discusión de literatura reciente en micología. Conferencias y discusión de temas relacionados con
fisiología de hongos y su metodología.
Descripción del curso en inglés:
Discussion of current literature in mycology. Lectures and discussion of topics in fungal physiology and
its methods.
Objetivos:
Al terminar el semestre se espera que los estudiantes puedan:
1. Aplicar sus conocimientos sobre micología básica, características y clasificación de los hongos.
2. Examinar diferentes procesos fisiológicos y genéticos en los hongos.
3. Resumir los datos más importantes en artículos científicos del campo de la micología.
4. Preparar un informe de laboratorio completo.
Bosquejo de contenido:
Temas a cubrir
Introducción – Clasificación de los hongos
Crecimiento y diferenciación – hifa, micelio, diferenciación, dimorfismo
Reproducción – zoosporas, esporas, conidias, latencia
Nutrición – fuentes de carbono, nitrógeno, fósforo
Tropismos – fototropismo, gravitropismo, ritmos circadianos
Hormonas
Genética – sistemas de incompatibilidad, parasexualidad, reproducción asexual
Técnicas moleculares – PCR, RFLPs, microsatélites, secuenciación de ADN, FISH
Relaciones simbióticas – líquenes, micorrizas, otros
Biocontrol y bioremediación
Total de horas: (deben ser equivalentes a las horas crédito del curso)
Horas
contacto
3
3
4
3
2
2
4
4
3
2
30
Advanced Mycology Biol 6642 – Prontuario – Pag. 1
Estrategias instruccionales:
conferencia
discusión
cómputos
laboratorio
seminario con presentación formal
seminario sin presentación formal
taller de arte práctica viaje tesis
problemas especiales
investigación
otros, especifique:
taller
tutoría
Recursos mínimos disponibles:
Revistas científicas primarias en la Biblioteca General del Recinto.
Computadoras y proyectores para presentaciones en PowerPoint.
Los estudiantes utilizaran los equipos disponibles en el Laboratorio de Micología Tropical.
Estrategias de evaluación y su peso relativo:
Porcentaje
30
40
exámenes de conferencia (2)
trabajos de laboratorio
monografías
portafolio
diario reflexivo
20
examen final
otros: Informe de laboratorio
10
TOTAL: 100%
100
Sistema de calificación:
cuantificable (de letra)  no cuantificable
Bibliografía:
Artículos en Revistas científicas disponibles en la Biblioteca General o asignados por el profesor.
Después de identificarse con el profesor y la institución, los estudiantes con impedimento recibirán
acomodo razonable en sus cursos y evaluaciones. Para más información comuníquese con Servicios a
Estudiantes con Impedimentos en la Ofician del Decano de Estudiantes (Q-019), 787-265-3862 ó 787832-4040 x 3250 ó 3258.
Prontuario preparado por Dr. Matías J. Cafaro, Agosto 2005.
Incluye anejos:
Si

No

Advanced Mycology Biol 6642 – Prontuario – Pag. 2
Anejo 1
Información relevante al curso de Micología Superior 6642
Información sobre el profesor:
Dr. Matías J. Cafaro
Oficina: Biología 203
Teléfono: 787- 832-4040 ext. 3950
Correo electrónico: [email protected]
Horas de oficina:
Martes 4:00 PM – 5:00 PM
Jueves 2:30 PM – 5:00 PM
Evaluación y calificaciones:
Este curso esta basado en los trabajos de laboratorio y en la lectura de artículos científicos relacionados
con temas específicos en la micología actual.
Se ofrecerán dos exámenes parciales durante la hora de conferencia. Exámenes de reposición se
ofrecerán al final del semestre solamente a estudiantes que hayan presentado excusas adecuadas (ver
Ausentismo). Al finalizar el semestre se ofrecerá un examen final con valor de 100 puntos. El trabajo
de laboratorio será evaluado mediante los informes presentados y la participación en los mismos. Todo
estudiante deberá presentar un informe final de laboratorio cuyas instrucciones serán explicadas en la
conferencia.
La nota final de cada estudiante será basada en el porcentaje de los puntos posibles en el curso que el
estudiante recibe:
90 – 100% = A
80 – 89% = B
70 – 79% = C
60 – 69% = D
0 – 59% = F
Normas a seguir en el salón de clases y laboratorios:
No se permite en el salón de clases:
 fumar, comer o ingerir bebidas.
 el uso de “beepers”, celulares y/o “walkman”.
 si decide salir a hablar por teléfono en medio de la clase, dicha acción será considerada como
una tardanza y si el estudiante permanece más de 10 minutos fuera del salón, se adjudicará una
ausencia.
 la presencia de niños y otras personas no matriculadas en el curso.
 juegos de mano ni el uso de vocabulario indebido.

Los estudiantes deben asumir una posición de orden, seriedad y responsabilidad hacia los
instructores, profesores y personal no docente.
Advanced Mycology Biol 6642 – Prontuario – Pag. 3

Los instructores asignarán los microscopios a ser usados por los estudiantes durante el
semestre. Estos les explicarán las reglas para el manejo de los mismos. Se le notificará al
instructor cualquier anomalía que observe en cualquiera de los equipos que vaya a utilizar o
esté utilizando tan pronto como detecte el fallo. Los estudiantes deberán revisar que los
microscopios sean dejados con el objetivo de baja magnificación, que el cable este recogido y
que no se queden laminillas colocadas. Las laminillas deberán dejarse en la bandeja
correspondiente.

Una vez terminada su tarea, remueva todo el material utilizado, devuelva todo el equipo a su
lugar, recoja todos los desperdicios y deposítelos en los zafacones o donde se le indique para
que las mesas y sus alrededores se mantengan limpios. No se permitirán a los estudiantes salir
del laboratorio hasta que el laboratorio este limpio y recogido. Es responsabilidad del
estudiante y no del instructor limpiar y recoger todo lo que usaron. Recuerde colocar las
banquetas o sillas bajo las mesas.
Asistencia:
La asistencia a clases es obligatoria. Los estudiantes deben asistir a todas las clases y ser puntuales.
Tres tardanzas sin justificación equivalen a una ausencia.
Tardanzas mayores de 15 minutos serán consideradas como ausencia.
Ausencias sin excusa se tomarán en cuenta al determinar las calificaciones finales para estudiantes
cerca del límite entre dos notas.
Los exámenes se realizarán en los días y horas indicadas. En caso de ausentarse a los mismos,
deberá presentar una excusa justificada en un término máximo de dos días laborables a partir
del día de la presentación. En caso contrario se le asignará puntaje 0 por la ausencia.
Si la ausencia es por enfermedad, se requiere una excusa médica (preferiblemente del Departamento de
Servicios Médicos del RUM) solo así se le dará una reposición. Como evidencia para futuras
reclamaciones deberá entregar copia de la excusa.
Advanced Mycology Biol 6642 – Prontuario – Pag. 4
Anejo 2
Información relevante al curso de Micología Superior 6642
Date
Thu.
11th
August
Tue.16th
August
Thu.
18th
August
Tue.23rd
August
Thu.
25th
August
Tue.30th
August
Thu. 1st
Sept.
Tue.6th
Sept.
Thu.8th
Sept.
Tue.13th
Sept.
Topics
Introduction. Course
description. Characteristics
of fungi. Classification –
Kingdom Fungi and allies
Classification: concepts,
phylogenies, taxonomy
Classification: Fungal
Phyla: Chytridiomycota,
Zygomycota,
Glomeromycota,
Ascomycota,
Basidiomycota
Growth and differentiation:
cell wall, organelles,
hyphae, mycelium, tissue
formation
Growth and differentiation:
apical tip growth, the
Spitzenkorper, turgor
pressure, growth kinetics
Growth and differentiation:
yeast growth, budding,
dimorphism, sporulation
Papers
Bills et al 2005. Phylogeny of the
fungal kingdom and fungal-like
organisms. Mycol. Ser. 22: 27-48
Lutzoni et al 2004. Assembling the
fungal tree of life: progress,
classification, and evolution of
subcellular traits. American Journal
of Botany 91: 1446-1480
LABS
Wk 1: General lab
techniques. Media,
autoclave, plate
preparation,
inoculation
techniques. Isolation.
Lew et al 2004. Turgor regulation in
hyphal organisms. Fungal genetics
and biology 41: 1007-1015
Momany 2002. Polarity in
filamentous fungi. Current Op.
Microb. 5: 580-585
Hornby et al 2004. Inoculum size
effect in dimorphic fungi:
extracellular control of yeastmycelium dimorphism in
Ceratocystis ulmi. AEM 70: 13561359
Reproduction I: sporulation Beakes et al 1992. Comparative
in lower fungi zoospores,
ultrastructural ontogeny of
sporangiospores,
zoosporangia of Zygorhizidium
zygospores,
affluens and Z. planktonicum, chytrid
chlamydospores
parasites of the diatom Asterionella
formosa. Mycol. Res. 96: 1047-1059
Reproduction II: Ascospore Gamundi & Ranalli 1963. Apothecial
and basidiospore
development in Ascobolus
development
stercorarius. Trans. Br. Mycol. Soc.
46: 393-400
Reproduction III: conidia
Roncal & Ugalde 2003. Conidiation
development
induction in Penicillium. Res.
Microbiol. 154: 539-546
Reproduction IV: dormancy Dijksterhuis et al 2002. Trehalose
degradation and glucose efflux
precede cell ejection during
Wk2: Isolation of
fungi from different
sources. Start growth
curves
Wk3: Growth
curves, protein
concentration,
exoenzymes
Wk4: Vitamin
Deficiency
Advanced Mycology Biol 6642 – Prontuario – Pag. 5
germination of heat-resistant
ascospores of Talaromyces
macrosporus. Arch. Microbiol. 178
:1–7
Thu.15th
Sept.
Nutrition: Carbon
degradation, exoenzymes,
cellulases, xylanases,
ligninases
Magnelli & Forchiassin 1999.
Regulation of the cellulase complex
production by Saccobolus
saccoboloides: induction and
repression by carbohydrates.
Mycologia 91: 359-364.
Tue.
Nutrition: Nitrogen sources, Brearley et al 2005. Nitrogen
20th
usage, transport
nutrition and isotopic discrimination
Sept.
in tropical ectomycorrhizal fungi.
Res. Microbiol. 156: 184-190
Thu.
Nutrition: Phosphorus
Ryan & Graham 2002. Is there a role
22nd
translocation,
for arbuscular mycorrhizal fungi in
Sept.
microelements
production agriculture? Plant and
Soil 244: 263-271
Tue.
Phototropism, circadian
Lakin-Thomas & Brody 2004.
27th
rythms
Circadian rhythms in
Sept.
microorganisms: New complexities.
Ann. Rev. Microbiol. 58: 489-519
Thu.
Gravitropism
Moore et al 1996.
29th
Gravimorphogenesis in agarics.
Sept.
Mycol. Res. 100: 257-273
Tue. 4th Hormones in Achlya
Raper 1939. Sexual hormones in
Oct.
Achlya. American J. Botany 26: 639650
th
Thu. 6
Genetics: Mating systems,
James et al 2004. The genetic
Oct.
outcrossing
structure and diversity of the A and B
mating-type genes from the tropical
oyster mushroom, Pleurotus djamor.
Fungal Genet. Biol. 41:813-825.
Tue.
Genetics: sexual
Varga & Toth 2003. Genetic
11th Oct. differentiation,
variability and reproductive mode of
heterokaryosis
Aspergillus fumigatus. Infection,
Genetics & Evolution 3: 3-17.
Thu.
Genetics: Parasexuality,
Pontecorvo letter
13th Oct. vegetative incompatibility
Tue.
Genetics: Asexuality
18th Oct.
Thu.
Molecular techniques: PCR, James & Vilgalys 2001. Abundance
20th Oct. RFLPs, microsatellites
and diversity of Schizophyllum
commune spore clouds in the
Caribbean detected by selective
sampling. Mol. Ecol. 10: 471-479.
Tue.
Molecular techniques:
Wk5: Induce
dimorphism, effects
of temperature on
growth
Wk6: Phototropism
in Phycomyces or
Pilobolus
Wk7 Antibiotic
production
Wk8: Mating of
Ascobolus
Wk9: Development
of apothecia
Wk10: Genetics with
Aspergillus nidulans
Wk11: Genetics with
Advanced Mycology Biol 6642 – Prontuario – Pag. 6
25th Oct. cloning, protoplast
transformation
Thu.
Molecular techniques:
27th Oct. DNA sequencing and
analyses
Tue. 1st
Nov.
Molecular techniques: in
situ hybridization
Thu. 3rd
Nov.
Symbiotic relationships:
Definitions, fungal
parasites, commensals,
mutualists
Symbiotic relationships:
Lichens
Tue. 8th
Nov.
Thu.
10th
Nov.
Tue.
15th
Nov.
Thu.
17th
Nov.
Symbiotic relationships:
Mycorrhizae
Symbiotic relationships:
Complex systems
Biocontrol and
bioremediation
Aspergillus nidulans
Down 2002. Fungal family trees –
finding relationships from molecular
data. Mycologist 16: 51-58
Baker et al 2004. Methabollicaly
active eukaryoyic communities in
extremely acidic mine drainage.
Applied and Environmental
Microbiology 70: 6264-6271.
Herre et al 1999. The evolution of
mutualisms: exploring the paths
between conflict and cooperation.
TREE 14: 49-53.
Lutzoni et al 2001. Major fungal
lineages are derived from lichen
symbiotic ancestors. Nature 411:
937-940
Redecker et al 2001. Glomalean fungi
from the Ordovician. Science 289:
1920-1921
Currie et al. 2003. Ancient tripartite
coevolution in the attine ant-microbe
symbiosis. Science 299: 386-388
Jamal et al 2002. Arbuscular
Mycorrhizal Fungi Enhance Zinc and
Nickel Uptake from Contaminated
Soil by Soybean and Lentil. Int. J.
Phytoremediation 4: 205-221
Wk12: PCR
amplification
Wk13: Restriction
fragment analysis
Wk14: Basidiobolus
ranarum isolation
and culture
Advanced Mycology Biol 6642 – Prontuario – Pag. 7