Secuencias de nucleotidos en Genbank Aproximación preliminar

Secuencias de nucleotidos en Genbank
Aproximación preliminar para no
expertos…
E. García-Barros (2005)*
* Probablemente necesita una revisión y actualización)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi
Pieris brassicae
1
10 11
21
31
41
51
60
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o bien:
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especie, como antes.
Selecciona una secuencia, la
que te interese
Una vez en la ficha de la especie, vas a
la parte de abajo, y copias toda la
secuencia
Una vez en la ficha de la especie, vas a la
parte de abajo, y copias toda la secuencia
(ya sabes, marcas el bloque con el cursor, y
pulsas la tecla derecha del ratón para
copiar)
Vuelves a la página
anterior, y buscas
“Related resources,
BLAST” en la barra
de la izquierda.
Pincha ahí...
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resources, BLAST”
en la barra de la
izquierda. Pincha
ahí...
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“megablast”
En este cuadrito, pegas tu
secuencia. En la primera
línea insertas el símbolo
“>”
>
1 tcacttttaa attgaatttg gggggggttt
gctgtagaca acccaacatt aactcgattt
61 tacacttttc attttcttat accatttatt
attttagcaa taacaataat tcatttatta
121 tttttacatc aaacaggatc
En este cuadrito, pegas tu
secuencia. En la primera
línea insertas el símbolo
“>”
Marca “others”
Pincha en BLAST...
y sigue las
instrucciones
continuará...