Transcripción Y Procesamiento

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Flujo de información en la célula
Transcripción
•Proceso de síntesis de ARN
dirigido por el ADN.
•Una hebra es copiada (hebra
molde)
•Relacionado con expresión
génica
•Algunas regiones que se
transcriben no son traducidas a
proteínas (ARNr, ARNt, ARNpn)
•Proceso similar a replicación
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Tipos de ARN
Diferencias con replicación:
•Uso de ribonucleótidos
Propiedades comunes:
Todos son producidos por transcripción
Todos cumplen un papel en la síntesis proteica
Generalmente con estructuras secundarias y
terciarias complejas
•Uracilo por Timina
•Adición de nucleótidos por
RNA Polimerasa
•Formación temporal de un
duplex ADN-ARN
•El producto es de cadena
simple
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Características de la transcripción
ARN celulares,
abundancia y
función
Dirigido por una ARN Polimerasa
La transcripción
está fuertemente
regulada.
Apenas un 0.01%
de los genes se
está expresando
en una célula
eucariota en un
momento dado.
66 %
%
80%
80%
10%
10%
44 %
%
Una hebra de ADN sirve de molde
La enzima no requiere cebador
La enzima elonga una cadena en dirección 5`-3`
Formación de enlace 3´-5´fosfodiéster
La síntesis sólo se inicia en secuencias específicas llamadas
promotores
Desenrrollamiento parcial del ADN
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ARN polimerasa bacteriana
Nomenclatura transcripcional
Una hebra de ADN sirve de molde (hebra molde)
•Unica ARNPolimerasa bacteriana
•Multímero de varias subunidades
•subunidad σ70 se une a secuencias
específicas en las posiciones –10 y –35
del promotor
El transcripto es igual a la hebra codificante y complementario a la hebra molde
•la subunidad α queda en posición
upstream
•las subunidades b y b’ se asocian con
el sitio de inicio
(Sense)
CCTTACTTACTGTTACGCCG
GGAATGCCTGACAATGCGGC
• el sitio de inicio de la transcripción es
+1
•downstream = dirección de la
transcripción
(Antisense)
CCUUACUUACUGUUACGCCG
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Promotores bacterianos
Modelo de la ARN Polimerasa bacteriana
El modelo muestra la
interacción de la holoenzima
con el promotor formando el
complejo abierto. Hebra
molde en gris
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Transcripción en bacterias: iniciación
El proceso
de la
transcripción
1. Reconimiento de la hebra molde
Unión de la polimerasa al promotor (Formación de un complejo cerrado)
Formación de una burbuja de ADN de cadena simple (complejo abierto)
2. Iniciación
Síntesis de los primeros 9 o 10 nucleótidos
Varios eventos abortivos, donde el ARN es liberado
Pasado este punto (10 nucleótidos) se libera sigma y comienza la longación
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Terminación transcripcional en bacterias
Transcripción en bacterias: elongación
Reconocimiento de señales particulares que indican donde terminar la síntesis
La burbuja de transcripción se desestabiliza y colapsa liberándose el ARN
Rho dependiente
Rho independiente
proteína Rho se une al ARN
bucle autocomplementario
Varios eventos abortivos, donde el ARN es liberado
Pasado este punto (10 nucleótidos) se libera sigma y comienza la elongación
Adición de nucleótidos al extremo 3´ hidroxilo de la cadena creciente
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Diferencias entre la transcripción
procariota y eucariota
ARN polimerasas eucariotas
INCAPACES DE RECONOCER EL PROMOTOR
ARNm policistrónico
transcripción y traducción
acopladas
ARN Polimerasa única
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ARNm monocistrónico
transcripción y procesamiento
acoplados
3 ARN Polimerasas diferentes
Polimerasa
Pol I
Pol II
Pol III
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localización
nucleolo
nucleoplasma
nucleoplasma
genes transcritos
ARNr
ARNm , ARNpn
ARNt, ARNr 5S
inhibición por a-amanitina
insensible
muy sensible
sensible
La polimerasa II eucariota es similar a la
bacteriana.....
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.....aunque más
compleja
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Transcripción en eucariotas
Iniciación en eucariotas
Proteínas
ARN Polimerasas
Factores de Transcripción
Modificadores
Todas las polimerasas
eucariotas necesitan
Factores Transcripcionales
basales para reconocer los
promotores e iniciar la
transcripción
Polimerasa II
Factores
generales
Factores
específicos
Modificadores
Señales
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Promotores
Potenciadores
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Promotores regulados eucariotas
Factores transcripcionales
Proteínas de unión a sitios específicos de ADN
•Secuencias de
reconocimiento específico
para Factores de
Transcripción
Se asocian a Promotores y potenciadores
Estructura modular:
dominios de activación
•Estructura modular
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dominios de unión al ADN
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Los Factores Transcripcionales son proteínas de
unión al ADN
Potenciadores
Activación de la Transcripción
Reconocen secuencias específicas en promotores y potenciadores
Se ensamblan cooperativamente sobre el ADN mediante interacciones
proteína-proteína
Potenciadores (enhancers)
reguladores en cis
Función a distancia
Independientemente de
orientación
Sitios de union a factores de
transcripción
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Los factores de transcripción específicos colaboran
en el ensamblado del complejo de iniciación
Existen activadores, represores y mediadores
Factores específicos colaboran para colocar los
FBasales en el promotor y éstos posicionan las
polimerasas
La mayoría de los
genes regulados por
factores
transcripcionales
múltiples
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Los factores basales se ensamblan
secuencialmente y posicionan la ARN polimerasa
Elongación en eucariotas, el papel del CTD
CTD- CARBOXI TERMINAL DOMAIN de la RNA Polimerasa II
c/repetidos de 7 péptidos (26-52aa)
Unicos a pol II
Su fosforilación es esencial para la elongación
La fosforilación depende de uno de los factores generales
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PROCESAMIENTO DE ARN EN EUCARIOTAS
El ciclo transcripcional
eucariota
Todo ARN se procesa.
• Los ARNr se transcriben juntos y por corte se
generan fragmentos menores.
• Los ARNt se procesan y sufren modificaciones
de bases.
• Los ARNm sufren 4 tipos de modificaciones:
- Capping.
- Cola poli A.
- Corte y empalme de intrones (Splicing)
- Editing.
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Unidad Transcripcional Ribosomal
Transcripción Y Procesamiento de ARNr
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• Genes dispuestos en tándem: aproximadamente 200 copias
de genes de ARNr en Genoma Humano (Cromosomas con
satélites).
• Transcriptos como un gran precursor policistrónico de 13000 nt (ARNr 45S).
•En interfase se ven como Nucleolos: zonas de transcripción y
unión a proteínas ribosómicas.
•Procesados secuencialmente (degradación de las secuencias intermedias)
•Los transcriptos son metilados
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Transcripción y Procesamiento del ARNt
Modificaciones de bases
en el ARNt
• Transcriptos como mono o policistrónicos
•Los transcriptos son procesados secuencialmente
•Formación del trébol
•Degradación de extremos y adición de brazo aceptor CCA
•Eliminación de intrones
•Modificación de bases
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Procesamiento de los ARN mensajeros
Capping
• Estructura de la Caperuza 5´
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El mecanismo de la Poliadenilación
Poliadenilación en extremo 3´
Proceso secuencial dependiente de :
•Reconocimiento de secuencias en el transcripto
•Interacción ARN-proteinas específicas
•Interacción proteína-proteína
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Hibridación ADNADN-ARN
Corte y empalme (splicing
(splicing)) de intrones y exones
el gen de la ovoalbúmina
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El proceso de corte y empalme
•Ensamblado secuencial de partículas riboproteicas (SNURPs)
•Apareamiento de bases con el mRNA
Tipos de intrones
•Corte y empalme
•Liberación del intrón
U1 snRNP
U2 snRNP
Pre mRNA
intron
GU
A
AG
Salida del
U4, U6, U5
snRNP
intron
Ligacion de
los exones
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Reconocimiento de señales de procesamiento
El spliceosoma
•Estructura riboproteica
encargada del
procesamiento de los
intrones
•Apareamiento de bases del ARN precursor con el ARN del SNURP
•Ensamblado secuencial de partículas riboproteicas (SNURPs)
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El splicing consiste en dos
transesterificaciones sucesivas
Ribozimas
TIPO I Algunos genes de ARNr
• ARN que elimina sus propios intrones
• ARN que elimina intrones de otros ARN
• ARN que cataliza su propia replicación
Estructura terciaria de un intron tipo
I de un ARN de Tetrahymena que
se autoelimina del resto del ARN.
TIPO II Mitocondria y cloroplastos
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Una visión moderna de la expresión génica
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