Transcripción [Modo de compatibilidad]
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Transcripción y Procesamiento del RNA Transcripción Síntesis de RNA a partir de DNA DNA Transcripción RNA de transferencia tRNA Otros snRNA, snoRNA, siRNA, miRNA RNA mensajero mRNA RNA ribosomal rRNA Estructura química del RNA RNA puede formar estructuras secundarias Transcripción • Solamente los segmentos de DNA que corresponden a genes son copiados a RNA Una de las dos cadenas de DNA es copiada a RNA Cadena codificante Cadena molde La secuencia de RNA es complementaria a la cadena molde e idéntica a la cadena codificante RNA polimerasa procariotes RNAP holoenzima α2ββ´σ ≈ 460 kDa La RNA pol cubre aprox.60 nt 40 upstream y 20 downstream Gen Producto Función rpoA 2 subunidades α (37kDa) ensamblaje de las unidades rpoB Subunidad β(151kDa) Centro catalítico rpoC β´ (157kDa) Centro catalítico rpoD σ (32-90kDa) Reconocimiento del promotor (especificidad) Promotores bacterianos Promotor Secuencia -10 o caja Pribnow TATAAT Secuencia -35 TTGACAT • Secuencias conservadas en promotores de procariontes Promotor fuerte Promotor débil Factores sigma σ Fac. σ σ70 σ32 σ24 σ54 σ28 Gen Masa (kDa) Uso rpoD 70 general rpoH 32 choque térmico rpoE 24 choque térmico rpoN 54 nitrógeno fliA 28 flagelar Etapas de la transcripción Iniciación Elongación Terminación Reconocimiento y formación del complejo cerrado Burbuja de 17pb Elongación Termino de la transcripción Terminadores intrínsecos Termino de la transcripción Dependiente de Rho Fidelidad de la transcripción Las RNA polimerasas no tienen actividad de edición por tanto son menos fieles Transcripción en eucariotes Eucariotes tienen 3 tipos de polimerasas nucleares Tipos Localización Transcritos Copias/ cél I Nucleolo rRNA 18S, 5.8S y 28S 40,000 II Nucleoplasma mRNA 40,000 III nucleoplasma tRNA y rRNA 5S 20,000 Todas las RNA polimerasas eucariotas son proteínas grandes en forma de agregados de 500 kDa ó más. Generalmente tienen de 8 a 14 subunidades Promotores eucariotes Caja TATA o caja Hogness -25 / -35 Elementos regulatorios URE Enhancers • Todas las RNA polimerasas requieren factores transcripcionales basales (TF) Formación del complejo de iniciación RNApol II Factores transcripcionales basales de RNA pol II Polimerasa Promotor Factores transcripcionales basales RNA pol I No tiene caja TATA UBF, SL1 RNA pol III Promotores internos TBP TF III A, TF III B y TF IIIC rRNA 5S TF III B y TF IIIC tRNA También existen factores moduladores PROCESAMIENTO POST-TRANSCRIPCIONAL DEL RNA • RNA ribosómico rRNA • • • • Más abundante en la célula Principal componente de los ribosomas Procariotes 16S, 23S , 5S Eucariotes 18S, 28S, 5.8S, 5S RNA transferencia tRNA Más pequeño ≈75nt Transporta aminoácidos hasta el ribosoma Extremo 3´ tiene el triplete característico CCA Independientemente del aminoácido que transporte Procesamiento RNA transferencia y ribosomal Eucariotes y procariotes Procesamiento RNA ribosomal procariote Región espaciadora 30S Metilación preRNA II II II III II II III Corte específico RNasaIII, RNasaP y Rnasa E II II II III II II III Otras nucleasas II II II III II II III Procesamiento RNA ribosomal eucariote Nucleolo Región espaciadora 45S II II II II II II Los cortes son catalizados por RNAs pequeños del nucleolo snoRNAs y proteínas del spliceosoma II III II II III II II III II II III II III II III Procesamiento RNA transferencia eucariote Cortes endonucleolíticos seguidos reacción de ligación Procesamiento RNA transferencia Procesamiento del extremo 5´ RNasa P Se encuentra en todos los organismos Ribonucleopoteína RNA (ribozima) 377 nt (actividad catalítica) Proteína 20kDa Nucleasas RNasa D Procesamiento extremo 3’ Nucleasas eliminan un grupo de bases RNasa D elimina nucleótidos restantes Procesamiento RNA transferencia tRNA nucleotidiltransferasa Transfiere la secuencia CCA característica de TODOS los tRNA maduros Metilacióno desaminación de bases Bases pseudouracilo y dihidrouracilo Bases modificadas presentes en los tRNA Procesamiento mRNA eucariote Capping Procesamiento mRNA eucariote Poliadenilación 3´ Procesamiento mRNA eucariote Splicing Remoción de intrones Procesamiento mRNA eucariote Splicing Remoción de intrones Splicing alternativo Resumen procesamiento mRNA eucariote
