GUÍA DOCENTE Producción de enzimas y metabolitos por microorganismos Curso 2007-08 I.- DATOS INICIALES DE IDENTIFICACIÓN Nombre de la asignatura: Producción de enzimas y metabolitos por microorganismos Carácter: Optativa Titulación: Master en Biología Molecular, Celular y Genética Ciclo: Segundo Departamento: Bioquímica y Biología Molecular Profesores: David Barreras Salvador Genovés Marta Tortajada José Vicente Gil Patricia Roig Paloma Manzanares José Antonio Prieto José Manuel Guillamón Profesor responsable: José Vicente Gil Contacto: [email protected] 96-3900022 ext. 2120 II.- INTRODUCCIÓN A LA ASIGNATURA La asignatura “Producción de enzimas y metabolitos por microorganismos” es una asignatura optativa ofertada en las especialidades de Bioquímica y Biología Molecular y de Microbiología del segundo curso del Master en Biología Molecular, Celular y Genética incluido en el Programa Oficial de Postgrado en Biotecnología de la Universitat de València. Consta de 2 créditos teóricos en los que se aborda el estudio de conceptos teóricos básicos sobre la producción de metabolitos por lo tres grupos microbianos de interés en la industria alimentaria (bacterias ácido lácticas, levaduras y hongos filamentosos) como de 1 crédito de prácticas realizado en las instalaciones de una empresa de biotecnología microbiana. III.- VOLUMEN DE TRABAJO Para el cálculo del mismo se ha tomado como referencia un total de 6 semanas de clase en el trimestre. La distribución prevista del trabajo es la siguiente. Asistencia a clases teóricas: 2 horas/semana x 6 semanas = 12 horas/curso. Asistencia a clases prácticas: 5 horas/sesión x 2 sesiones = 10 horas/curso Estudio y preparación de clases de teoría: 2 hora/semana x 6 semanas = 12 horas/curso. Estudio-preparación de clases prácticas: 2 horas /sesión x 2 sesiones = 4 horas curso Preparación de seminarios: 1 seminario/curso = 16 horas/curso. Estudio para preparación de exámenes: 10 horas/examen x 1 examen = 8 horas/curso. Realización de exámenes: 2 horas/curso x 1 examen teórico = 2 horas/curso. Asistencia a tutorías: 1 hora/ semanas 6 semanas = 6 horas curso Asistencia a seminarios y otras actividades: Seminarios de presentación oral de los artículos seleccionados 6 horas/curso. ACTIVIDAD Horas/curso ASISTENCIA A CLASES TEÓRICAS 12 ASISTENCIA A CLASES PRÁCTICAS 10 PREPARACION CLASES TEORICAS 12 PREPARACIÓN CLASES PRÁCTICAS 4 ESTUDIO PREPARACIÓN DE EXÁMENES 12 PREPARACIÓN DE SEMINARIOS 16 REALIZACIÓN DE EXÁMENES 2 ASISTENCIA A TUTORÍAS 6 ASISTENCIA A SEMINARIOS Y ACTIVIDADES 6 TOTAL VOLUMEN DE TRABAJO 80 IV.- OBJETIVOS GENERALES Repasar los antecedentes históricos del empleo de microorganismos como factorías para la producción de compuestos. Describir las técnicas de cultivo de microorganismos con finalidad productiva y el uso de fermentadores. Analizar los procesos de mejora de cepas microbianas. Describir el empleo bacterias para la producción de enzimas y metabolitos de interés industrial. Analizar el empleo de levaduras para la producción industrial de enzimas y metabolitos y producción de biomasa a partir de sustratos alternativos. Estudiar el empleo de los hongos filamentosos para la producción industrial de enzimas y metabolitos y las estrategias de mejora genética para la sobreproducción de proteínas. Analizar los procesos de purificación de recuperación de enzimas y metabolitos de interés industrial. V.- CONTENIDOS TEMA 1: Generalidades. Los microorganismos como factorías celulares. Antecedentes históricos. Cultivo de microorganismos industriales. Claves de los procesos productivos: fermentadores. Mejora de cepas microbianas. Inmovilización. Ingeniería metabólica. Aspectos legales. TEMA 2: Enzimas y metabolitos de interés industrial producidos por bacterias. Introducción. Detoxificación y depuración de aguas. Enzimas extracelulares: desde la cerveza a la lavadora. Biosensores. Polisacáridos: ciclodextrinas y gelificantes de uso alimentario. Ácidos orgánicos y sustancias antagónicas. Nutrientes. Toxinas de utilización industrial. TEMA 3: Enzimas y metabolitos de interés industrial producidos por levaduras. Introducción. Producción de biomasa a partir de substratos alternativos a la melaza. Producción de enzimas heterólogas de interés en panificación. Sobreproducción de nutrientes esenciales: aminoácidos, vitaminas, lípidos y prebióticos. TEMA 4: Enzimas y metabolitos de interés industrial producidos por hongos filamentosos. Producción de antibióticos en hongos filamentosos. Producción industrial de enzimas fúngicos. Estrategias de mejora genética para la producción de enzimas. TEMA 5: Procesos de downstream: recuperación y purificación de enzimas y metabolitos. Introducción. Procesos de downstream: captura, purificación intermedia y pulido. Fase de captura: separación, rotura de células, adsorción en lecho expandido. Fase de purificación y pulido: diseño, procesos cromatográficos, purificación de proteínas de fusión, cuerpos de inclusión. VI.- DESTREZAS A ADQUIRIR Búsqueda y manejo de bibliografía científica como fuente de información principal de la asignatura. Capacidad de comprender la relación entre el conocimiento básico de los procesos metabólicos microbianos con la aplicación industrial Visión de conjunto de las etapas de producción industrial de enzimas y metabolitos. VII.- HABILIDADES SOCIALES Búsqueda de fuentes de información. Utilización de nuevas tecnologías de la comunicación. Destreza en la presentación oral y gráfica de trabajos. Capacidad de discusión y crítica constructiva del trabajo propio y ajeno. VIII.- TEMARIO Y PLANIFICACIÓN TEMPORAL Tema 1 2 Título y contenido Generalidades Enzimas y metabolitos de interés industrial producidos por bacterias 3 Enzimas y metabolitos de interés industrial producidos por levaduras 4 Enzimas y metabolitos de interés industrial producidos por hongos filamentosos 5 Procesos de downstream: recuperación y purificación de enzimas y metabolitos Práctica Purificación de una proteína desde una fermentación industrial FECHA ENERO Martes 15 Generalidades I. Hitos históricos. Cultivo. Jueves 17 Generalidades II. Fermentadores. Mejora de cepas Jueves 24 Enzimas y metabolitos producidos por BAL I Martes 29 Enzimas y metabolitos producidos por BAL II Jueves 31 FEBRERO Martes 5 Jueves 7 Martes 12 Jueves 14 Martes 19 Enzimas y metabolitos producidos por levaduras I Jueves 21 Procesos de downstream: recuperación y purificación I Procesos de downstream: recuperación y purificación II Martes 26 TEMA Enzimas y metabolitos producidos por levaduras II Enzimas y metabolitos producidos por levaduras III Enzimas y metabolitos producidos por hongos fil. I Enzimas y metabolitos producidos por hongos fil. II Enzimas y metabolitos producidos por hongos fil. III Horas 2 2 3 3 2 10 PROFESOR José Vicente Gil José Vicente Gil José Vicente Gil José Vicente Gil Patricia Roig Patricia Roig Patricia Roig Patricia Roig Patricia Roig José Vicente Gil P. Manzanares P. Manzanares Días 28 de febrero y 4, 6, 11 y 13 de marzo se destinarán a seminarios impartidos por investigadores del IATA. Lunes, 10 y miércoles 12 de Marzo de 9 a 14 h. clases prácticas en Biópolis S.L. IX.- BIBLIOGRAFÍA DE REFERENCIA Bibliografía básica. Demain, A.L., Solomon, N.A. (1986). Manual of industrial microbiology and biotechnology. American Society for Microbiology, Washington D.C., USA. Hui, Y.H., Khachatourians, G.G. (1995). Food biotechnology: microorganisms. VCH, California, Estados Unidos. Shetty K., Paliyath G., Pometto A., Levin R.E. (2005) Food Biotechnology: Second Edition, Revised and Expanded, CRC, Taylor & Francis Group, Boca Ratón, New York. Stephanopoulos, G.N., Aristidou, A.A., Nielsen, J. (1998). Metabolic engineering. Academic Press, San Diego, Estados Unidos. Scopes, RK. 1987. Protein Purification. Principles and practice. 2nd Ed. SpringerVerlag. New York, USA. Bibliografía complementaria. Bruno-Barcena JM, Lucca ME, Sineriz F, Ramon D. 2002. pH regulation of enzyme production in Aspergillus nidulans growing in aerobic batch fermenter. Biotech. Lett. 24 (7): 567-572. Raya-Tonetti G, Cordoba P, Bruno-Barcena J, Sineriz F, Perotti N. 1999. Fluidized bed ion exchange for improving purification of lactic acid from fermentation. Biotech. Tech. 13 (3): 201-205. Fukuda H. 1995. Immobilized microorganism bioreactors. Bioprocess Technol. 21:339-75. Schmidt FR. Recombinant expression systems in the pharmaceutical industry. Appl. Microbiol. Biotech. 65 (4): 363-372. Damasceno LM, Pla I, Chang HJ, Cohen L, Ritter G, Old LJ, Batt CA. 2004. An optimized fermentation process for high-level production of a single-chain Fv antibody fragment in Pichia pastoris. Protein Expr. Purif 37 (1): 18-26 Hamilton SR, Bobrowicz P, Bobrowicz B, Davidson RC, Li HJ, Mitchell T, Nett JH, Rausch S, Stadheim TA, Wischnewski H, Wildt S, Gerngross TU. 2003. Production of complex human glycoproteins in yeast. Science. 301 (5637): 1244-1246. Gerngross TU. 2004. Advances in the production of human therapeutic proteins in yeasts and filamentous fungi. Nature Biotech. 22 (11): 1409-1414. Punt PJ, van Biezen N, Conesa A, Albers A, Mangnus J, van den Hondel C. 2002. Filamentous fungi as cell factories for heterologous protein production Trends Biotech. 20 (5): 200-206. X.- METODOLOGÍA Las clases teóricas se desarrollan mediante exposición de los contenidos del temario durante 12 horas por los profesores del curso. Se utilizan presentaciones de apoyo a la explicación, previamente puestas a disposición de los alumnos mediante la plataforma de apoyo a la docencia virtual de la UVEG. Los seminarios consistirán en la exposición por cada uno de los alumnos de un artículo de investigación relacionado con la temática del curso con el apoyo de medios informáticos. Todos los alumnos deben presentar un resumen por escrito de los artículos tratados en todos los seminarios. XI.- EVALUACIÓN DEL APRENDIZAJE Para la valoración precisa del aprendizaje se realizará una prueba escrita correspondiente a los contenidos teóricos. Además se tendrá en consideración la participación de los alumnos en las distintas actividades, la presentación de los resúmenes de los artículos, el nivel y calidad de la presentación del seminario de cada alumno y la participación en las discusiones de los seminarios presentados por otros.