Caenorhabditis elegans Qué fue lo que maravilló a la comunidad científica de este gusano tan discreto? Buscando un organismo modelo para el estudio de desarrollo animal , Sydney Brenner …….. “--Excerpts from Proposal to the Medical Research Council, 1963 Sydney Brenner http://www.dailymotion.com/video/x72v4a_c-elegans-ungusano-nobel_school C. elegans: el gusano elegido! Cultivado facilmente Tiempo corto de generación : 3 días Es pequeño: 1 mm Pocas células: Los adultos 959 hermafrodita (XX) o 1031 (XO) Susceptible de análisis genetico: El genoma es pequeño-100 Mb Transparente: Anatomía de C. elegans • ES UN NEMATODO •Organismo multicelular simple •Alargado en forma de tubo •Recubierto por cutícula -959 células somáticas organizadas formando órganos y sistemas simples 302 son neuronas 95 son miocitos pared en la hermafrodita 1031células somáticas 381 son neuronas en el macho 1% de la población Anatomía de C. elegans Tiene un sistema digestivo formado por estoma (o boca), faringe e intestino Pharynx Intestine (yellow) Gonad (pink) Anus Rectum También dispone de órganos sexuales (gónadas) Vulva Epidermis Sistema nervioso rudimentario head anterior ~1 mm tail posterior Es movil, se alimenta, defeca, pone huevos, forma larvas dauer, tiene respuesta sensitiva al tacto, al sabor , olor y a la temperatura, otros comportamientos complejos como apareamiento, comportamiento social, aprendizaje y memoria (Rankin, 2002; de Bono, 2003). boca Variedad de tejidos (nervioso, intestinal, muscular). Pseudoceloma esqueleto hidrosttico Cuticula Seccion del cuerpo circular: cavidad pseudoceloma no es de origen mesodermico • Tienen sexos separados • Las hembras son más grandes que los machos • Tamaños varían entre milímetros y metros • La mayoría son ovíparos (producen huevos Macho XO •Dimorfismo sexual: hermafroditas XX (útiles para mantener línea homocigota) y machos X0 (0,2% población, útiles para realizar cruzas). Sistema reproductor del macho túbulo que comienza como testículo, seguido de la vesícula seminal, vas deferente, conducto eyaculatorio y termina en una apertura llamada cloaca Favorece la variabilidad genética C. elegans gonadas: tiene un sistema reproductivo eficiente , tienen oviductos, ovarios y una cavidad para almacenar el esperma Similitudes del Sistema nervioso Tiene dos sistemas nerviosos independientes el somático de 282 neuronas y dos anillos alrrededor de la faringe y al final del cuerpo de unas 20 neuronas comunicados entre sí Caenorhabditis elegans •Cultivo en laboratorio: •En placas Petri sobre pasto de E. coli OP50 (auxótrofa para uracilocrecimiento lento). Suplemento de colesterol (esencial). C. elegans como modelo de estudio •Muy importante : pueden conservarse congeladas en 15% de glicerol a -80°C por largos períodos de tiempo C. elegans como modelo de estudio •Sistema nervioso sencillo (302 neuronas). Cerebro primitivo en región anterior: anillo neural. Mapa completo de conexiones neuronales. Estudios de comportamiento. C. elegans como modelo de estudio •Microscopía: cuerpos transparentes en todas las etapas de desarrollo: fusiones transcripcionales y traduccionales a GFP, otros fluoróforos. Localización. 400x 1000x 1000x Cepa AA278 daf9::GFP L2-L3 120x Cepa AA278 daf9::GFP L2-L3 1000x C. elegans como modelo de estudio •Tiempo de generación corto (3 días a 20°C). Dependiente de la temperatura. •Ciclo de vida alternativo: dauer. C. elegans como modelo de estudio 22°C http://www.dailymotion.com/video/x72v4a_c-elegans-ungusano-nobel_school C. elegans como modelo de estudio •Genoma completo secuenciado (1998). Diploides para 5 autosomas + cromosoma sexual X (diploide o haploide). •40% de genes relacionados con enfermedades humanas se encuentran presentes en el nematodo. -100 Mb, 19 000 genes, ~5 000 essential. Algunas técnicas… • Microscopía de fluorescencia • Knock-down de genes por RNA de interferencia • Western blot • qRT-PCR • Análisis genético: mutantes, cruzas • Microinyección •Estrategia de ARN de interferencia (RNAi) para el estudio de la función génica. FUNCIÓN ¿Cuál es el rol natural del iRNA en la célula? PROTECCIÓN Este mecanismo actúa como un sistema inmune a nivel celular. REGULACIÓN Este sistema regula la expresión de genes, especialmente en el desarrollo. MECANISMO RNA de interferencia A A siRNA se introduce en la célula B siRNA se acopla RISC (RNA induced silencing complex) y se le remueve la hebra sentido B C C iRNA se une al RNAm Slicer Ago 2 corta el RNAm D D Se evita traducción y se silencia el gen •Efecto sistémico: dsRNA capaz de cruzar las paredes intestinales y dispersarse a tejidos somáticos y gónadas. •Bibliotecas RNAi. • Descubierto por Sydney Brenner(1963). • Describió las primeras mutantes Brenner(1974). • Se determinaron los linajes post embriogenicos (Sulston and Horwitz,1976). • Muerte celular programada( Horwitz, 1982). • Se determinaron los linages celulares completos( Deppe et al, Sulston 1983). • Se estableció en forma complete la conectividad del Sistema nervioso(1986). • Se descubrieron los mecanismos de RNAi y miRNA en el gusano (1991-98) • (Nobel Prize: Fire, Mello 2006). • Se empleó por primera vez la GFP(1994) (Nobel Prize: Chalfie, 2008). • Fue el primer animal cuyo genoma se secuenció completamente (97Mb,now 100.3Mb).28 5/21/2015 Uso para estudio de enfermedades[editar] Estudio de la obesidad Muchos de los genes implicados en la regulación lipídica de C. elegans se han conservado en humanos. Se han encontrado genes implicados en regulación de la función intestinal, metabolismo y apetito cuya inactivación mediante RNAi causa reducción de la obesidad o incremento del almacenamiento lipídico, según el caso.El estudio de la obesidad en C. elegans se puede realizar fácilmente mediante tinción de sus grasas, cuantificación y estudio de su evolución tras la exposición de diversas sustancias. Estudio de la diabetes C. elegans es similar a la humana y regula tanto el metabolismo como el desarrollo y la longevidad. Los mutantes de C. elegans con defectos metabólicos en esta vía de señalización permiten el estudio de compuestos capaces de resolver estos defectos. Estudio del envejecimiento C. elegans es una excelente elección para estudiar el envejecimiento debido a su corta vida media, la facilidad para inducir estrés oxidativo y los parecidos con el proceso de envejecimiento humano. Los factores genéticos y ambientales que afectan a C. elegans son similares a aquellos que afectan a humanos, principalmente estrés oxidativo junto a restricción calórica y sarcopenia. Estudio del Alzheimer El progresivo envejecimiento de la población ha aumentado el interés por el estudio de la enfermedad de Alzheimer. Existen gusanos transgénicos que desarrollan agregadosamiloides de diferentes tamaños, parecidos a los que 5/21/2015 Kavya Leo 29 aparecen en cerebros afectados de Alzheimer. El estudio estos agregados ha convertido a C. elegans en un Desarrollo de drogas. C. Elegans Versus cells and other model organisms C.elegans Living test tube experiments in disease relevant genetic backgrounds experiments in complex multi-cellular physiology amenable to high throughput screening in an entire animal model Ventajas del uso de C. elegans frente a otros modelos Ahorro en tiempo: la esperanza de vida de C. elegans es de 2-3 semanas frente a 2-5 años de ratones. Esto permite obtener resultados en menos tiempo. Ahorro en costes: el mantenimiento y estudio de C. elegans en laboratorio es más barato y sencillo que otros modelos animales como ratones o mosca de la fruta. Ahorro en espacio, frente a otros modelos animales de mayor tamaño como ratones. Mayor valor estadístico: el grupo habitual de trabajo es de 300 individuos para C. elegans frente a 30-50 en ratones, aumentando la fiabilidad de los resultados. Permite añadir una etapa intermedia entre estudios in vivo y ensayos clínicos para ciertos modelos de enfermedades de los que no existe modelo en ratones. The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2002 "for their discoveries concerning ’ genetic regulation of organ development and programmed cell death'" Sidney Brenner H. Robert Horvitz John Sulston A SHORT HISTORY OF C. elegans RESEARCH 5/21/2015 Kavya Leo 33 Síntesis de lípidos en C. elegans: rol en el desarrollo Composición de ácidos grasos de C. elegans 20 18 20:5 17 18:1 n7 17Δ 15 14 19 16 18:2 18:0 19Δ Columna wax Espectro de GCMS del primer estadío larval de C. elegans (x1,000,000) 4.5 4.0 18:1n7 18:2n6 18:0 3.5 3.0 16:0 PUFAs wt 17Δ 2.5 Pod-2 2.0 1.5 1.0 Fas-n1 0.5 0.0 7.5 10.0 12.5 15.0 17.5 20.0 22.5 25.0 27.5 30.0 32.5 35.0 Pod-2 ARNi N2 Fasn-1 Aumento 12,6 X Comparación fenotípica Fasn-1 Pod-2 EV Aumento 6,3X Tipo de AG Huevos Control pod-2 fasn-1 Ramificados 14.30±1.1 8.93±1.1 1.67± 2.17± Ciclo 15.13±0.7 30.15±6.3 19.59± 19.41± SFA 11.85±1.8 17.54±0.8 53.14± 51.16± MUFA 26.77±1.9 12.87±8.1 17.55± 20.27± 18:1 n9 2.57±0.2 3.00±0.9 3.37± 3.01± PUFA 29.39±0.2 27.52±0.7 4.68± 3.98± Muchas Gracias