Lycée Jean D’Alembert, abril 2010 Las enzimas restrictivas. Alumnos: Alvaro Valderama, Joaquin Vasquez y Juan Carlos Diaz Curso: 1ere S, 3º medio B Profesor: Jeremias González Resumen En este trabajo vamos a hablar de las enzimas restrictivas y sus funciones en el organismo. Para esto investigaremos en internet para tratar de comprender lo más posible sobre todo lo relativo a las enzimas restrictivas o enzimas de restricción. Realizamos ese trabajo con el fin de comprender mejor algunos conceptos vistos en clases y a la vez profundizar en un tema que no hemos estudiado anteriormente. Esto a su vez, con el complemento de las presentaciones de nuestros compañeros, nos ayudara a tener una visión general de los temas vistos en clases. Primeramente, hablaremos sobre lo visto en clases y qué relación podría tener con nuestro tema de investigación. Luego, presentaremos lo investigado, hablaremos de el descubrimiento, las funciones que cumple, las características y los usos prácticos que ha tenido. Finalmente concluiremos resumiendo lo aprendido y relacionándolo nuevamente con los contenidos vistos en clases. Desarrollo En clases, hemos estudiado que las enzimas son proteínas que aceleran y hacen más eficiente un proceso biológico dentro del organismo. Las proteínas están codificadas en el código genético, mediante el mensajero ARN la información genética puede salir del núcleo. Existen distintos tipos de enzimas y nosotros en este trabajo investigaremos acerca de una de ellas. Werner Arber, Daniel Nathans y Hamilton O. Smith ganaron un premio Novel en 1978 por haber descubierto las enzimas de restricción también conocidas como endonucleasas, lo cual fue muy útil en distintos campos de la biología y específicamente en la medicina. Las enzimas restrictivas son enzimas cuya función principal es proteger a las bacterias para llevar a cabo eso cortan una secuencia palindrómica de ADN de un virus en un punto específico. Esto significa que cada enzima reconoce un sitio particular del ADN, es decir que reconoce una secuencia particular de nucleótidos. Esa secuencia específica para cada enzima se denomina “sitio de restricción”. Una vez que la enzima reconoce estos sitios, se posiciona sobre la molécula de ADN y corta dentro o en torno de esa secuencia. Este corte puede tener dos formas: ser un corte romo, donde los cortes en ambas hebras de la cadena de ADN coinciden o un corte cohesivo o escalonado, donde el corte en ambas hebras difiere un poco en la secuencia. Estas enzimas fueron descubiertas en microorganismos. De hecho, se encuentran sólo en organismos procariotas. Cuando una secuencia de ADN (por lo general de un virus) entra a la célula con el fin de modificar el genoma y los funcionamientos de esta célula. Las enzimas restrictivas logran destruir esta secuencia de ADN sin destruir el ADN propio de la bacteria. Las enzimas de restricción son susceptibles a cambios de temperatura, pH, etc. Existen 3 tipos de enzimas restrictivas que describiremos. Tipo 1: Es una enzima con función de restricción (Cortar) y modificar (metilla) al momento de reconocer el ADN corta al azar en cualquier lugar de arriba hacia abajo o de abajo hacia arriba. Utilizan ATP para moverse entre otras. Tipo 2: Solo tiene la función de restricción, solo corta. El corte se efectúa en el sitio de reconocimiento específico o cerca de el dado el tipo de corte que es resistente y predecible. Una enzima del tipo 2 solo puede cortar a una secuencia específica de ADN. Gracias a esto se usan en el clonaje de genes ya que cortando lugares específicos se pueden recuperar secuencias especificas. Además esta propiedad es la que permite que la enzima no destruya el ADN de la bacteria que la contiene, ya que la secuencia de ADN que la enzima reconoce para cortar no coincide con ninguna secuencia que este contenida en el genoma de la bacteria. Tipo 3: Es una enzima oligometrica que realiza todas estas funciones. Aplicándolas lejos del punto de reconocimiento dejando extremos cohesivos. Necesitan 2 secuencias de reconocimiento en orientación opuesta a la misma cadena de ADN, estas también usan ATP. Una enzima de restricción típica de Tipo 2 es la EcoRI. Esta enzima reconoce y corta el ADN siempre que localiza la secuencia de bases 5’-GAATTC-3’, una secuencia palíndroma. La enzima EcoRI hidroliza los enlaces fosfodiéster que unen las bases G y A de cada hebra, de este modo los cortes que crea son escalonados. Los extremos pueden permanecer asociados por puentes de hidrógeno o desnaturalizarse produciendo entonces segmentos independientes, que se re asocian muy fácilmente, por lo que tales extremos reciben el nombre de extremos cohesivos o extremos pegajosos. Las enzimas de restricción tienen diferentes usos que son de gran importancia en investigaciones en biología molecular y en las técnicas que emplea la biotecnología como: 1. Hacer mapa de restricción de un plásmido o bacteriófago. El ADN se corta con varias enzimas de restricción, solas y en parejas, para determinar el número de sitios de corte y sus posiciones relativas en la molécula, el orden y la distancia entre ellos. 2. Fragmentar ADN para separación por electroforesis. Los fragmentos obtenidos después de la actuación de las distintas enzimas de restricción, se pueden separar por tamaños mediante la técnica de electroforesis y así estudiar los distintos fragmentos. Las endonucleasas se nombran a partir de las bacterias de las que son extraídas, su nombre está dado según el género y la especie de la bacteria de donde se extrajo por primera vez esta enzima. La primera letra representa el género de la bacteria, las próximas dos indican la especie, una cuarta letra indica la cepa, y un número al final indica la cantidad de enzimas que se han aislado de esa cepa. Por ejemplo tenemos el tipo de enzima restrictiva mas usada: Eco RI E = género Escherichia co = especie coli R = cepa RV 13 I = primera endonucleasa aislada de esta cepa Existen varios factores que son importantes al momento de trabajar con enzimas de restricción o cualquier tipo de enzima y que pueden afectar la actividad de ellas mimas: 1. Pureza del ADN – la reacción de enzimas es muy dependiente de la pureza, contaminantes como proteínas, fenol, cloroformo, etanol, EDTA, SDS, altas concentraciones de sal, etc. inhiben la endonucleasa. 2. Temperatura y pH – las enzimas son muy sensitivas a temperatura y pH en lo que respecta a su estabilidad y actividad. 3. Las ADNsas degradan el ADN en presencia de Mg++ . 4. Contaminantes con carga (-). 5. ADN contaminado con otro ADN. 6. Grados de metilación – algunas endonucleasas son inhibidas por metilación. 7. Tipo de molécula de ADN– si el ADN no tiene la secuencia que es reconocida por la enzima accesible, esta no puede cortar el material genético. Por ejemplo si el ADN está demasiado enrollado el lugar de restricción no va a estar accesible para la enzima. Conclusión. Hemos visto que son las enzimas de restricción, como funcionan y para que se pueden usar. La información vista en clases coincide con esto. La enzima restrictiva funciona al “acelerar” y “facilitar” que el ADN se corte. Estudiamos los tres tipos de enzimas restrictivas y vimos como se usan en la industria farmacéutica: estas enzimas permiten cortar pequeños pedazos de ADN que nos permiten luego insertarlos en alguna otra célula y así producir alguna proteína en particular. En conclusión, encontramos este trabajo un trabajo productivo, que aparte de darnos a conocer el tema de las enzimas de restricción, también no ayudo a conocer y manejar aun mejor el conocimiento sobre las enzimas en general. Sin embargo en internet nos costó encontrar información, ya que esta era más bien escasa, aunque luego de una selección de esta, logramos presentar el desarrollo de más arriba. Sin embargo, entender la información en internet para poder desarrollarla en nuestro trabajo, nos ayudo a comprender aun mejor los temas tratados en esta investigación.