Universidad Nacional del Litoral Facultad de Ciencias Agrarias R. P. Kreder 2805 – CP3080 Esperanza, Santa Fe. Argentina Programa de Centros Asociados para el Fortalecimiento de Posgrados. Convenio CAFP-BA entre la Universidad Federal Rural de Río de Janeiro, la Universidad Nacional del Sur, y la Universidad Nacional del Litoral INTRODUCCIÓN AL USO DE MARCADORES MOLECULARES APLICADOS AL MEJORAMIENTO VEGETAL. Información general Fecha: 12 al 16 de noviembre de 2012 Docentes: Dra. Marina Díaz (UNS) Dr. Antonio Garayalde (UNS – CERZOS – CONICET) Dr. Gerardo Cervigni (UNL – CEFOBI – CONICET) Dr. Pablo A. Tomas (FCA – UNL) Duración: 45 hs totales (3 UCAs) Arancel: $700.Modalidad: Presencial - Teórico-práctico con evaluación final. Lugar de realización: Laboratorio de Biología Aplicada y Biotecnología - Facultad de Ciencias Agrarias - Universidad Nacional del Litoral - Kreder 2805 – (3080) Esperanza, Santa Fe, Argentina. Tel./Fax: 03496-426400 Email: [email protected] Objetivos Objetivo general Suministrar los conocimientos básicos acerca del uso de los marcadores moleculares de ADN y de la genética molecular aplicados al mejoramiento vegetal. Objetivos específicos 1 Universidad Nacional del Litoral Facultad de Ciencias Agrarias R. P. Kreder 2805 – CP3080 Esperanza, Santa Fe. Argentina Conocer los diferentes tipos de marcadores moleculares, su desarrollo, elección, aplicación y tipo de información que brindan para el mejoramiento genético vegetal. Conocer como las herramientas moleculares, estadísticas y bioinformáticas se integran para comprender la estructura de los genomas Ejercitar las técnicas básicas más extendidas en la manipulación del ADN y la utilización de marcadores moleculares. Destinado a : estudiantes de posgrados en Agronomía, Biología y Bioquímica Temario 1. Aspectos generales de los marcadores moleculares. Importancia del estudio y análisis del genotipo y su relación con el fenotipo. Tipos de marcadores genéticos. Modo de herencia y variantes alélicas. Base molecular de los diferentes marcadores de ADN: RAPD, RFLP, AFLP, SSR, SCAR, CAPS, STS, EST, SNP. Nivel de polimorfismo, ventajas y desventajas de cada tipo de marcador. 2. Herramientas de Bioinformática Introducción a la Bioinformática. Tipos y organización de las bases de datos biológicas. Búsqueda de secuencias en bases de datos. Servidores de acceso público (NCBI; EBI). Alineamiento de 2 secuencias (BLAST y sus derivados), parámetros de calidad del alineamiento: Identidad, E-value y score. Alineamientos múltiples (Clustal W). Identificación de regiones conservadas. Gene Onthology (GO). Edición de secuencias y análisis de cromatogramas. Identificación de marcadores mediante el alineamiento de secuencias. 3. Utilización de los marcadores moleculares en estudios de diversidad genética. Análisis de la estructura genética en poblaciones y accesiones. Índices de diversidad genética. Análisis de datos moleculares mediante técnicas numéricas. Cálculo de distancia genética. Correlación de matrices de distancia entre diferentes tipos de datos. Aplicación en programas de conservación y uso de recursos fitogenéticos. 4. Selección asistida por marcadores moleculares. Identificación genotípica y de híbridos. Estudios de segregación y nivel de homocigosis. Selección asistida en métodos de retrocruza. Pureza varietal. Complementación de técnicas biotecnológicas: PCR, RT-PCR (Reverse Transcriptase 2 Universidad Nacional del Litoral Facultad de Ciencias Agrarias R. P. Kreder 2805 – CP3080 Esperanza, Santa Fe. Argentina – PCR) y northern blots para la detección de los transgenes y sus niveles de expresión. 5. Mapeo genómico Análisis de caracteres cuantitativos. Poblaciones de Mapeo. Bases teóricas del desequilibrio de ligamiento. Construcción de mapas genéticos. Métodos de mapeo de regiones genómicas (QTL) asociadas a caracteres de interés. Mapeo de QTL en poblaciones biparentales. Actividades Prácticas: extracción y cuantificación de ADN; diseño de cebadores; amplificación por PCR; electroforesis; registro y análisis de los datos. Uso de programas específicos en mapeo genético e identificación de regiones genómicas de interés. Evaluación: presentación de monografía posteriormente a la finalización del curso. Cupo máximo: 20 participantes. Cupo mínimo: 5 participantes. Informes: Consultas sobre trámites, alojamiento y envío de ficha de inscripción a: Secretaría de Posgrado de la Facultad de Ciencias Agrarias Tel: 03496-420639 int 161 [email protected] P. Kreder, 2805. CP: S3080HOF – Esperanza, Prov. de Santa Fe, Argentina. Consultas: Ing. Agr. Pablo Tomas – [email protected] 3