Clase 15 2014 Mejoramiento asistido.pdf

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AGROBIOTECNOLOGIA
CURSO 2014
Mejoramiento asistido por
marcadores moleculares
Lic. Mariano Bulos
Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular
Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
Universidad de Buenos Aires
-
Indice
Introducción
-La necesidad de producir más
-Interacción entre progreso genético y manejo
-Mejoramiento genético: definición, procesos y factores
-Mejoramiento y Marcadores
Selección asistida por Marcadores Moleculares
-Implementación, consideraciones y ejemplos
Conversiones
-Método Convencional de Retrocruzas: Implementación y
Consideraciones Genéticas
-Conversiones Asistidas por Marcadores Moleculares:
Implementación y Ejemplos
Diversidad Genética
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
-Cuantificación y estructuración de la diversidad genética:
Métodos de análisis y relación entre ellos
-Análisis por Marcadores Moleculares. Ejemplos.
Mejoramiento Molecular
El Mejoramiento Hoy
Referencias
Introducción
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
La necesidad
de producir
más.
“Los agricultores del mundo de hoy están alimentando a más del
doble de gente que en 1950 con la misma cantidad de tierra”
(Will, G., 1995)
El incremento de los rendimientos de los cultivos se ha logrado
por ganancia genética (Gg), ganancia por manejo (prácticas
agronómicas, Gm) y por la interacción entre ambas (Ig*m).
IR= Gg + Gm + Ig*m
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Rendimiento (qq/ha)
Interacciones
entre progreso
genético y
manejo
100
90
80
70
60
50
40
30
20
10
0
Trigo
convencional
Trigo enano
Arroz
convencional
Arroz enano
0
40
80
120
160
Nitrógeno (kg/ha)
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Se ha mejorado y se debe continuar mejorando
para obtener genotipos que permitan maximizar el
aprovechamiento de la interacción entre la oferta
edafoclimática y las tecnologías biológica, química
y agronómica.
Una definición
de
mejoramiento
genético
Conjunto de principios científicos, métodos,
técnicas y estrategias aplicadas a la obtención
de genotipos o grupos de genotipos con
características deseables según objetivos
previamente definidos
Proceso fundamental
Cambio adaptativo por sustitución alélica bajo
selección, seguido por el aislamiento de los
productos diferenciados
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Procesos del
mejoramiento
genético
Un ciclo de selección
Recombinación
Evaluación
Selección
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Factores
determinantes
del progreso
genético
k²A
Gy=
y P
Ref.: Lush, 1945; Eberhart, 1972
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Mejoramiento y
marcadores
Aplicaciones
1.- Selección asistida
2.- Conversiones
3.- Organización, mantenimiento e incremento de la
diversidad genética.
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Selección Asistida por
Marcadores Moleculares
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Selección
asistida por
Marcadores
Moleculares
S R H R H H R H R RH R H RH H H
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Marcadores
Moleculares
Departamento de
Biotecnología
Metodologías de Extracción de ADN
Marcadores
Moleculares
El tipo de extracción varia de acuerdo a las
necesidades específicas de cada proyecto
Manual
SDS
Papel Nucleico
Automática
Partículas Magnéticas
Departamento de
Biotecnología
Metodologías de
Extracción de ADN
Marcadores
Moleculares
Porque distintos métodos de extracción?
Manual
SDS
Permite obtener grandes cantidades de ADN con
buena calidad y un costo muy bajo. Implica mayores
tiempos que el resto de los métodos.
Papel Nucleico
Es extremadamente sencillo el muestreo y la
extracción a partir del papel. Disminuye
notablemente los volúmenes de consumibles y se
almacena a temperatura ambiente. Es más caro que
el método de SDS.
Departamento de
Biotecnología
Metodologías de
Extracción de ADN
Automática
Partículas Magnéticas
Tiene mejor calidad que el método de SDS y además
permite obtener una gran cantidad de muestras por dia.
Es, en este momento, el método más caro.
Marcadores
Moleculares
Departamento de
Biotecnología
Diferentes clases de Marcadores
Moleculares
&
Ejemplos de su Aplicación
Marcadores
Moleculares
De un Punto
Multipunto
Permiten conocer
información sobre
un único punto del
genoma
Permiten conocer
información de
varios puntos del
genoma al mismo
tiempo
Dentro de nuestro laboratorio…
Departamento de
Biotecnología
Diferentes clases
de Marcadores
Moleculares
De un Punto
Multipunto
SSRs
SCARs
SNPs
ISSRs
TRAPs
SRAPs
RGAs
HMWG (prot)
Gliadinas (prot)
Marcadores
Moleculares
De un Punto
SSRs
- Es la tecnología más utilizada dentro del laboratorio.
-Utilizado en:
- Conversiones, para recuperar el trasfondo
genético de las líneas recurrentes
- Selección Asistida, cuando el SSR esta ligado a
algún carácter de importancia
- Diversidad Genética, permitiendo analizar un
gran número de locus de los cuales se conoce su
ditribución dentro del genoma
Departamento de
Biotecnología
Diferentes clases
de Marcadores
Moleculares
- Control de Calidad Genética, para establecer si la
semilla es F1 en la producción de híbridos dado su
natulareza codominante
De un Punto
SSRs
Marcadores
Moleculares
Plataformas
Las plataformas de análisis varían de acuerdo
al tipo de resultado buscado.
Agarosa
Poliacrilamida
Secuenciador Automático
Departamento de
Biotecnología
Diferentes clases
de Marcadores
Moleculares
Conversiones
Control de Calidad
Mapeo
Selección Asistida
Análisis de Diversidad
Identidad de Germoplasma
Conversiones
Selección Asistida
Análisis de Diversidad
Identidad de Germoplasma
Conversiones
Selección Asistida
Marcadores
Moleculares
De un Punto
SNPs
- Es principalmente utilizada para selección asistida
- Las plataformas varían de acuerdo al método de detección
del SNP
-Visualización en geles de agarosa
- Cortes con enzimas sitio específico
- Cortes con endonucleasas (Cel I)
- Presencia/Ausencia (PCR directa)
-Visualización en Real Time PCR
-Sybr Green
-TaqMan
Departamento de
Biotecnología
Diferentes clases
de Marcadores
Moleculares
-Visualización en Plataforma Fluidigm
- TaqMan (96 x 96)
Marcadores
Moleculares
De un Punto
SNPs
Departamento de
Biotecnología
Diferentes clases
de Marcadores
Moleculares
(WO 2008/124431) HERBICIDE-RESISTANT SUNFLOWER PLANTS WITH MULTIPLE HERBICIDE
RESISTANT ALLELES OF AHASL1 AND METHODS OF USE
Sala, Bulos, Echarte, Singh, Weston, Whitt
Marcadores
Moleculares
De un Punto
SNPs
1
1
2
2
3
3
4
4
5
5
6
6
7
7
8
8
1 – 122 homo
2 – WT homo
3 – 205 homo
4 – 197 homo
5 – 122/197
6 – 122/WT
7 – 122/205
8 – 122 homo
Departamento de
Biotecnología
Diferentes clases
de Marcadores
Moleculares
(WO 2008/124431) HERBICIDE-RESISTANT SUNFLOWER PLANTS WITH MULTIPLE HERBICIDE
RESISTANT ALLELES OF AHASL1 AND METHODS OF USE
Sala, Bulos, Echarte, Singh, Weston, Whitt
Marcadores
Moleculares
De un Punto
SCARs
- Es principalmente utilizada para selección asistida
- Las plataformas utilizadas pueden ser
-Visualización en geles de agarosa
-Presencia/Ausencia (PCR directa)
Departamento de
Biotecnología
Diferentes clases
de Marcadores
Moleculares
- Visualización en Real Time PCR
-Sybr Green
Este sirve también para predecir la cigosis
del locus bajo análisis
Marcadores
Moleculares
Multipunto
Se utilizan en rondas finales de
conversiones para establecer
identidad
Se utilizan en proyectos de mapeo
para la saturación de regiones que
contienen QTLs
Departamento de
Biotecnología
Diferentes clases
de Marcadores
Moleculares
Marcadores
Moleculares
Multipunto Proteínas
Gliadinas
Departamento de
Biotecnología
Diferentes clases
de Marcadores
Moleculares
HMWG
Se utilizan en control de calidad de lotes de trigo, análisis de breeder
Seed, confirmación de off type provenientes de fenoles (Campaña09
se analizaron hasta el día de hoy unas 3800 muestras entre dic y abril)
Se utilizan para selección asistida para alta calidad panadera
Marcadores
Moleculares
Departamento de
Biotecnología
Diferentes clases
de Marcadores
Moleculares
Ensayos inmunológicos
Strips
Se utilizan en control de calidad de lotes de maíz para asegurar la
presencia de los caracteres incorporados y descartar presencias
adventicias
Se utilizan para selección durante conversiones y etapas de endocría
Marcadores
Moleculares
Departamento de
Biotecnología
Diferentes clases
de Marcadores
Moleculares
Ensayos inmunológicos
ELISA Cuantitativo
Se utilizan en control de calidad de lotes de maíz para asegurar una
cantidad mínima de proteína transgénica
Consideraciones
para su
implementación
• El tipo de marcador: basado en hibridación o
en PCR, dominante o codominante.
Dificultades y resolución.
• La distancia entre el marcador y el gen de
interés.
• La existencia de múltiples fuentes para el
carácter de interés.
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Cuando usar
marcadores para
Selección Asistida
• Selección en enfermedades de baja heredabilidad
• Ausencia de métodos efectivos de selección
• Ausencia de patógeno o presencia errática
• Selección individual (ej.: calidad panadera,
resistencia a Fusarium) en generaciones
tempranas
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
• Piramidizar genes
Ejemplos de
Selección Asistida
en dferentes
cultivos
Especie
Caracter
Tipo de Marcador
Soja
Resistencia a Cercospora sojina
SSR
SSR y SNP
SSR
(1)
(2)
(3)
Resistencia a Puccinia graminis
SCAR
(4)
Resistencia a Puccinia striiformis
Calidad Panadera
SSR
(5)
(6)
Porcentaje de Proteina en Grano
Resistencia a Fusarium graminearum
SSR
SSR
Dureza del grano
SCAR
(7)
(8)
(9)
Maíz
Resistencia a Mal de Rio IV
SSR
(10)
Sorgo
Fact. de Rest. de la Fertilidad Polínica
SSR
(11)
Girasol
Fact. de Rest. de la Fertilidad Polínica
SCAR
(12)
Resistencia a Puccinia helianthi
SCAR
(13)
Resistencia a Nematodo del Quiste
Resistencia a Phytophtora sojae
Trigo
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Referencia
HMWG y SCAR
Conversiones
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Método
Convencional de
Retrocruzas
Definición:
Método de mejora consistente en el
cruzamiento repetido de la progenie híbrida
derivada de una cruza con uno de sus
parentales.
Objetivo:
Mejorar al recurrente en una característica para
la cual es deficiente
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Esquema general
Método
Convencional de
Retrocruzas
R
D
x
R
x
R
x
RC2
F1
RC6
@
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
R
x
RC1
Línea R con el carácter del
Dador incorporado
Método
Convencional de
Retrocruzas
Recuperación del trasfondo genético del padre recurrente
En ausencia de selección y ligamiento:
RPR= (1-0.5(n+1))*100
% de genoma recurrente
Generación
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
F1
BC1F1
BC2F1
BC3F1
BC4F1
BC5F1
BC6F1
50
75
87,5
93,75
96,88
98,4
99,2
Método
Convencional de
Retrocruzas
Implementación
Control genético del carácter a incorporar
Caso 1: Herencia monogénica, carácter favorable controlado
por alelo dominante, seleccionable antes de floración.
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
- Estación 1: Padre R (rr) x Dador (RR)
- Estación 2: F1 (Rr), X Recurrente
- Estación 3: RC1F1 (Rr:rr), Rr X Recurrente
- Estación 4: RC2F1 (Rr:rr); Rr X Recurrente
- Estación 5: RC3F1 (Rr:rr), Rr X Recurrente
- Estación 6: RC4F1 (Rr:rr), Rr X Recurrente
- Estación 7: RC5F1 (Rr: rr), Rr X Recurrente
- Estación 8: RC6F1 (Rr:rr), @ Rr
- Estación 9: RC6F2 (RR: Rr:rr), @ RR y Rr, cosecha individual
- Estación 10: Familias RC6F3, descartar segregantes,
restantes se seleccionan y reemplazarán al recurrente
Método
Convencional de
Retrocruzas
Caso 2: Selección del carácter, controlado por alelo
dominante, después de floración.
- Idem caso 1 pero primero se cruza, luego se evalúa y se
descarta.
Caso 3: Carácter controlado por alelo recesivo.
- Incluir @ o testcross y análisis de progenie en cada
generación para diferenciar los individuos Rr y RR
Otros casos, como por ejemplo, que se necesite gran
cantidad de semilla para evaluar cada genotipo.
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Método
Convencional de
Retrocruzas
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Efecto del Ligamiento
Probabilidad de eliminar un gen indeseable
ligado al gen de interés:
1 – (1-p)(n+1)
p
5retrocruzas
0.5
0.20
0.10
0.02
0.01
0.98
0.74
0.47
0.11
0.006
Conversiones
asistidas por
Marcadores
Moleculares
D R
Segregantes en retrocruza 1 (RC1)
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
% de Sim ilitud en Retrocruza 1
Nro de Individuos
Conversiones
asistidas por
Marcadores
Moleculares
Variación dentro de la misma
generación de retrocuzas
40
30
20
10
0
40-45 45-50 50-55 55-60 60-65 65-70 70-75 75-80 80-85
% de Sim ilitud
Nro de Individuos
% de Sim ilitud Retrocruza 2
60
40
20
0
86-88
88-90
90-92
92-94
94-96
%de Sim ilitud
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
98,0-98,5
98,5-99,0 99,0-99,5 99,5-100
100
96-98
Conversiones
asistidas por
Marcadores
Moleculares
Extracción de ADN
X
Amplificación del marcador de interés
Descarte de individuos sin alelo de interés
X
X
Amplificación de marcadores para el resto del genoma
Lectura de Geles
Cálculo de similitudes genéticas con respecto al padre recurrente
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
84,3 67,6 ............................... 74,3
Planta seleccionada para
cruzar con el padre
recurrente
Conversiones
asistidas por
Marcadores
Moleculares
Línea elite
r
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Línea dadora
R
Conversiones
asistidas por
Marcadores
Moleculares
Mejoramiento por retrocruzas : recuperación del padre recurrente
Tradicional
RC1
RC2
RC3
RC4
75.0
RC6
R
R
98.5
99.3
R
R
R
RC5
R
87.5
93.8
96.9
Asistido por marcadores moleculares
RC1
Agrobiotecnología
RC2
RC3
R
R
98.0
100
R
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
85.5
Conversiones
asistidas por
Marcadores
Moleculares
Mejoramiento por retrocruzas : arrastre por ligamiento
Tradicional
F1
RC1
R
R
1
RC2
RC100
R
R
2
RC20
3
R
21
100
Asistido por marcadores moleculares
F1
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
R
RC1
R
1
2
RC2
R
3
Conversiones
asistidas por
Marcadores
Moleculares
Resultados Experimentales
% similitud con recurrente
100
90
80
70
60
58 proyectos
finalizados
50
40
30
20
10
0
P
F1
BC1
BC2
BC3
BC4
Agrobiotecnología
Teórico
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Obtenido
BC5
BC6
Conversiones
Ejemplo 1
Conversiones para un carácter complejo
Resistencia a Mal de Río Cuarto en Maíz
Dificultades de selección por tolerancia
Necesidad de sembrar en zonas endémicas
Presencia del vector y su variabilidad
Variabilidad ambiental
Agrobiotecnología
Dificultad para discernir entre escape y tolerancia
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Dificultades en la cría del vector
Conversiones
Ejemplo 1
Disección de un carácter complejo
mediante marcadores moleculares
8
7
6
5
4
3
2
1
0
GMA
PAS
SSR1
SSR2
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Conversiones
Ejemplo 1
Marcadores SSRs flanqueantes de un QTL
1 2
3 4 5
R S R R S R R
SSR1
1
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
2
3
4
5
6
7
6 7
1 2
3 4 5
R S R R S R R
SSR2
6 7
Conversiones
Ejemplo 1
Análisis Fenotípico de los productos
de Conversión
Hibrido
Descripción
AX888
Original – Susceptible MRCV
27,8
Heterocigoto para los 3 QTLs hallados
19,3
Homocigoto para los 3 QTLs hallados
9,4
AX888 M1
Resultados de la conversion
AX888 MRCV
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
% de Ataque Severo
Conversiones
Ejemplo 2
Conversiones para otro carácter complejo
Calidad Panadera en Trigo
Genes Involucrados
Marcadores para tales Genes
Resultados de Conversiones
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Conversiones
Ejemplo 2
Ubicación Genómica de algunos Genes
Relacionados con la calidad panadera en Trigo
Gli-A1
Gli-B1
Gli-R1
Gli-D1
Glu-A3
Glu-B3
Gli-A3
Gli-B3
Gli-R3
Gli-D3
Glu-A1
Glu-B1
Glu-B1
Glu-D1
Glu-D3
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
1A
1B
1BL/1RS
1D
Conversiones
Ejemplo 2
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Análisis de Gluteninas de Alto Peso Molecular
en SDS-PAGE
Conversiones
Ejemplo 2
Análisis de Gluteninas de Alto Peso Molecular
en SDS-PAGE
1
2
2*
5
6
7
8
9
10
12
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
17
18
13/16
Contribución de cada alelo para el W
2* = 1 > nulo
13/16 > 7/8 > 7/9 = 17/18 > 7/0 > 6/8
5/10 > 3/12 = 2/12 > 4/12
Conversiones
Ejemplo 2
Detección de la translocación Trigo/Centeno (1B/1R)
1,5Kb
P
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
A
P
P
A
P
P
P
P
Conversiones
Ejemplo 2
Análisis Fenotípico del producto de
Conversión
Genotipo
Original
Convertido
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Gluteninas
de Alto PM
Translocación
1B/1R
W
Resultados
de la conversion
0 , 6+8 , 5+10
Presente
190
1 , 7+8 , 5+10
Ausente
350
Vol. de Pan
870
980
Diversidad Genética
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Diversidad
Genética
Grupos heteróticos: métodos de análisis, inclusión de
líneas en cada grupo
Grupos reproductivos
Otras estructuras: origen geográfico, programa de
mejora, ciclo, etc. El problema de la estructura
basada en producto: MG en soja, trigos invernales
y primaverales, soft y hard; maíz tropical y
templado, etc
Estimaciones indirectas de la estructura de la
diversidad entre y dentro de grupos:
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
- Método fenotípicos
- Método genealógico
- Métodos basados en el uso de MM
- Relaciones entre métodos y con el agrupamiento
basado en aptitud combinatoria
Análisis
Fenotípico
- Caracteres morfoagronómicos, estados, diversidad.
- Interacción con el ambiente en su expresión.
Repetibilidad.
- Análisis: métodos multivariados.
- Interpretación de los resultados, outliers.
- Conclusiones: ventajas y desventajas.
- Utilidad:
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
 Conocimiento de la diversidad disponible para
seleccionar el germoplasma
 Caracteres discriminantes
 Cultivos relativamente nuevos
Análisis
Genealógico
- Mapas genealógicos del cultivo
- Coeficiente de coascendencia. Definición y reglas para su
estimación
- Supuestos en los que se basa el cálculo de
coascendencias.
- Matriz básica de datos y análisis multivariado.
- Utilidad:
 Estructura genealógica del germoplasma
 Base genética del germoplasma
 Tamizado de caracteres: ancestros vs germoplasma
derivado.
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Análisis por
Marcadores
Moleculares
- Tipos de marcadores a usar
- Estimación cuantitativa de la diversidad global
– PIC= 1-  pi²
– D= 1-   pi²
– D (Nei, 1987)= n(1-  pi²)/ (n-1)
- Similitud genética entre genotipos
– SMC= m/(m+n)
– Construcción de MBD y análisis multivariado
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Análisis por
Marcadores
Moleculares
Precisión de la estimación de distancias genéticas
en función del número de marcadores utilizados
(Bar-Hen & Charcosset, 1994)
Dist.
0%
10%
30%
50%
10
0-30,8
0,2-44,5
6,6-65,2
18,8-81,2
20
0-16,8
1,2-31,7
11,8-54,3
27,2-72,8
30
0-11,5
2,1-26,5
14,7-49,4
31,3-68,7
50
0-7,1
3,3-21,8
17,8-44,5
35,6-64,4
100
0-3,6
4,9-17,6
21,2-40
39,9-60,1
200
0-1,8
6,2-15
23,7-36,9
42,9-57,1
Nro de
Marcadores
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Relaciones entre
métodos de
análisis
Comparación entre Distancias Morfologicas y Moleculares
0.2500
Dist. Molecular
0.2000
0.1500
0.1000
0.0500
0.0000
3.0000
8.0000
13.0000
Dist. Morfologica
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
18.0000
23.0000
Relaciones entre
métodos de
análisis
Aporte de los genomas parentales
Contribución de 40-3-2
Genealogía
Molecular
Método
Resultados de la 0,50
conversion
Derivados de F2
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
0,211**
Retrocruza Modificada
0,25
0,058**
Derivados de BC1
0,25
0,263ns
Análisis por
Marcadores
Moleculares
Ejemplo
Análisis de Germoplasma de Soja
Vy
VI
VII,
VIII y
IX
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
III y
IV
Análisis por
Marcadores
Moleculares
Ejemplo
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Análisis por
Marcadores
Moleculares
Ejemplo
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Análisis de Germoplasma de Sorgo
Análisis por
Marcadores
Moleculares
Ejemplo
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Investigación de impacto de estrategias de mejora
sobre la diversidad o sobre la estructuración de la
diversidad:
el caso de la soja transgénica resistente a glifosato y de
la introducción a Argentina del germoplasma europeo de
trigo
Análisis por
Marcadores
Moleculares
Ejemplo
Diversidad Genética en Variedades de Soja
Convencionales y Resisitentes a Glifosato
- Los cultivares transgénicos muestran una diversidad (D=0.474)
similar a la de los cultivares convencionales (D=0.445; t=0.134 ns)
- El promedio de similitud genética (SG) entre cultivares resistentes es
similar a la SG existente entre cultivares resistentes y
susceptibles.
- Los cultivares transgénicos actuales presentan una diversidad
(D=0.493) similar que la que presentaban las variedades de soja
en Argentina antes de 1996 (D=0.469, t=0.456).
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
El transgen para resistencia a glifosato fue introgresado en
todos los grupos de madurez cultivados en Argentina
manteniendo un mínimo de contribución de la línea 40-3-2 y,
por ende, manteniendo la performance agronómica y la
diversidad genética del germoplasma original.
Análisis por
Marcadores
Moleculares
Ejemplo
Impacto de la introducción de germoplasma Europeo
sobre la estructuración de la diversidad genética del trigo
en la Argentina
GAT
GEU
GNT
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
NUEVOS TRAITS
Creación de nuevos
traits:
aproximaciones
Objetivo: identificación de mutantes con caracteristicas
agronómicas deseadas
Población mutante
Agente de selección
Efectivo
Herbicidas
Departamento de
Biotecnologia
Toxina
No efectivo
Resistencia a
patgenos
heladas
sequia
Molecular Breeding
Genética directa
Genética reversa
Secuenciacion
Genética directa
Departamento de
Biotecnologia
Molecular Breeding
Genética directa:
Selección de mutantes CL-PLus
Selección de mutantes
Genética directa
Departamento de
Biotecnologia
Molecular Breeding
Caracterización molecular
Desarrollo del trait
Agente selectivo no efectivo
Genética reversa
Genética reversa
Genes candidatos potencialmente
asociados a un trait
Mutantes para los genes candidatos
Evaluación
Secuenciación de 30.000
individuos para identificación
de mutantes
Mutantes individualizados
Departamento de
Biotecnologia
Molecular Breeding
A T G C C T A G G C T G C C T
T A C G G A T C C G A C G G A
Genética reversa
Genética reversa
TILLING
Departamento de
Biotecnologia
Molecular Breeding
Identificación del individuo mutante
Otras
aplicaciones
Departamento de
Biotecnologia
Molecular Breeding
TILLING y ECO-TILLING para generar plataformas
de marcadores moleculares
Mejoramiento Molecular
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Diseño de
Germoplasma
Se basa en la armonización de trasfondos genéticos de
alto rendimiento, creados por selección en ambientes
agronómicos de máxima oferta potencial, con caracteres
que incrementan el rango de adaptación, la estabilidad o la
calidad del producto de esos trasfondos.
Esos caracteres están gobernados por genes mayores y
su introgresión se monitorea por tecnología de marcadores
moleculares.
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Diseño de
Germoplasma
Dadora
Lineas elite
F1
BC1
Recombinación
BC2
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Nuevas
Variedades
convertidas
Interacción entre
los programas de
mejora
Convencional y
Molecular
Poblaciones experimentales
Materiales producidos durante los
programas de conversión
DATOS
DATOS FENOTIPICOS
MOLECULARES Materiales del programa de mejora
(ciclos de selección recurrente)
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Localización y validación de QTLs y genes
El Mejoramiento Hoy
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
El Mejoramiento
Hoy
Mejoramiento molecular
Programa convencional
Germoplasma base
Conversiones
Genes/QTLs
Cruzamiento
Genotipos elite pero
deficientes en uno o
más caracteres
Evaluación
Selección
Genotipos elite
Agrobiotecnología
Marcadores
moleculares
y
mejoramiento
genético
Nuevas Variedades
Descargar