Microbiología General Facultad de Ciencias Exactas ANEXO: AISLAMIENTO Y CARACTERIZACION DE BACTERIAS ANAEROBIAS Funciones del oxígeno en la nutrición Como elemento constituyente del agua y componentes orgánicos, el oxígeno es un componente universal de las células y se proporciona en grandes cantidades en el agua. Sin embargo, muchos organismos requieren además oxígeno molecular. Se trata de organismos que dependen de la respiración aeróbica para cubrir sus necesidades energéticas y en los que el oxígeno molecular funciona como agente oxidante terminal. Tales microorganismos se denominan aerobios obligados. En el otro extremo fisiológico están aquellos microorganismos que obtienen su energía mediante reacciones que no implican la utilización de oxígeno molecular y para los cuales esta forma química del elemento no actúa como nutriente. Para muchos de estos grupos fisiológicos el oxígeno molecular actúa como tóxico celular o como inhibidor del crecimiento. Tales microorganismos son anaerobios obligados. Han sido usados varios términos, entre ellos aerobio obligado, anaerobio obligado, anaerobio aerotolerante, anaerobio facultativo y microaerófilo con el fin de subdividir las bacterias en base a su relación con el oxígeno. Estos términos reflejan un espectro continuo de bacterias que no pueden tolerar el oxígeno hasta aquellas que lo necesitan para su crecimiento. Los microorganismos anaerobios pueden ser clasificados en dos grupos principales: l- Anaerobios obligados ll-Anaerobios aerotolerantes Con fines prácticos consideremos las bacterias anaerobias obligadas como aquellas que no se multiplican en la superficie de un medio sólido nutricionalmente adecuado, incubado en aire ambiental o en una incubadora de CO 2 (que contenga 5-10% de CO2 en el aire). Dentro de este grupo se establecen dos categorías: l.a- Anaerobios obligados estrictos Estos microorganismos desarrollan en superficies de agar expuestas a niveles de O2 de 0.03% como máximo. l.b- Anaerobios obligados moderadamente Son bacterias que desarrollan cuando se exponen a niveles de O2 de 2-8%. El término anaerobio aerotolerante (grupo ll), es usado por algunos microbiólogos para describir bacterias anaerobias que tendrán un crecimiento limitado o escaso en agar expuesto al aire ambiente o en incubación con 5-10% de CO2, pero muestran buen crecimiento bajo condiciones anaerobias. Los anaerobios facultativos crecen bajo condiciones anaerobias o aerobias determinadas. Los microaerófilos requieren oxígeno como aceptor terminal, pero no desarrollan en la superficie de medios sólidos con aire (21% de O2) y crecen con escaso desarrollo, si lo hacen, en condiciones anaerobias. Microbiología General Facultad de Ciencias Exactas En el desarrollo de medios y sistemas para el cultivo de anaerobios deben ser considerados dos factores fundamentales que pueden afectar el crecimiento de los anaerobios en el laboratorio. El más importante es el efecto inhibidor del oxígeno atmosférico y sus derivados tóxicos. El segundo factor limitante es el potencial de oxidorreducción (Eh) del medio de cultivo. Resumiendo: Aerobios obligados Microaerófilo Anaerobios facultativo Estricto Obligado Moderadamen te Anaerobio Aerotolera nte Tolerancia al oxígeno Probablemente sean múltiples las razones por las cuales los anaerobios varían en su tolerancia al oxígeno. Una de las razones es que la tolerancia al O2 de muchos anaerobios obligados moderados depende de su producción de enzimas superóxido dismutasa, catalasas y peroxidasas, que son protectoras contra la toxicidad de los productos de oxidorreducción. Una teoría muy difundida es que la exposición al O2 produce una serie de reacciones, mediada por flavoproteínas, que llevan a la producción del radical superóxido (O2-), peróxido de hidrógeno (H2O2) y otros productos de oxidorreducción tóxicos: Sustrato + O2 O2- + O2- + H2O2 + productos tóxicos H2O2 OH- radical hidroxilo, potente oxidante biológico OH- + O2 1O2 singlete Ciertos microorganismos producen enzimas capaces de contrarrestar estos productos tóxicos, como la SUPERÓXIDO DISMUTASA y las CATALASAS. Mediante la superóxido dismutasa (SOD) se transforman los radicales superóxido en oxígeno molecular y peróxido de hidrógeno. O2- + O2- +2H+ SOD H2O2 + O2 Microbiología General Facultad de Ciencias Exactas El peróxido de hidrógeno se convierte inmediatamente en oxígeno y agua, mediante las catalasas. 2H2O2 Catalasa 2 H2O + O2 Otra enzima que destruye el peróxido de hidrógeno es la PEROXIDASA, se diferencia de la catalasa en que no libera oxígeno en la reacción. H2O2 + 2H+ Peroxidasa 2 H2O Potencial de oxidorreducción (Eh) En la naturaleza el límite superior de Eh es + 820 mv, que podría encontrarse en algunos ambientes con oxigenación considerable. En los tejidos humanos sanos con suministro sanguíneo intacto prevalecen condiciones de oxigenación y el potencial redox es de alrededor de + 150 mv. En contraste, el límite inferior de Eh en la naturaleza varía alrededor de –420 mv. Un ambiente anaerobio o un medio de cultivo rico en hidrógeno podría tener ese Eh bajo. El intestino grueso de los humanos, que contiene enormes cantidades de anaerobios estrictos obligados, posee un Eh de alrededor de 250 mv. Por lo tanto, para el cultivo de microorganismos anaerobios es esencial el mantenimiento de un bajo potencial redox. Para tal objetivo se incorporan agentes reductores tales como tioglicolato y Lcisteína. Con el fin de analizar la relación que existe entre Eh y el O 2 sobre la supervivencia y crecimiento de las bacterias anaerobias fueron realizados numerosos estudios de los cuales pudieron extraerse importantes conclusiones. Ha sido ampliamente demostrado que la extracción del O2 de los medios de cultivo, para evitar su toxicidad, es más importante que establecer un bajo Eh. Por lo tanto, el rápido logro y mantenimiento de una baja tensión de O 2 o la ausencia es un requerimiento esencial para el cultivo de anaerobios en sistemas anaerobios moderados, como la jarra de anaerobios o la cámara de guantes. Medios de cultivos para bacterias anaerobias El metabolismo anaeróbico es menos eficiente que el aeróbico para la obtención de energía, por lo tanto los medios de cultivo deben ser más ricos que los de uso común para aerobios o anaerobios facultativos, además requieren una incubación más prolongada. Los medios empleados para la recuperación de anaerobios deben incluir tipos no selectivos y enriquecidos. Microbiología General Facultad de Ciencias Exactas Medios de cultivo no selectivos Por lo general los anaerobios son bacterias muy exigentes. Se emplean medios complejos que llevan: hidrolizados de carne, peptonas, extracto de levadura, hemina, vitaminas, etc. El medio requiere sustancias reductoras como tioglicolato, glucosa, ácido ascórbico, cisteína, hierro, etc. Como ejemplos: Medio de Schaedler Caldo de soja triptona 10 gr Peptona 5 gr Extracto de levadura 5 gr Dextrosa 5 gr Cisteína 0.4 gr Hemina 0.1 gr Tris Buffer 0.7 gr Agar 15.5 gr Agua destilada c.s.p. 1000 ml Ph 7.6 Luego se suplementa con sangre desfibrinada al 5% y vitamina K 10 g/ml. Medio Tioglicolato enriquecido (MTE) Triptona 17 gr Peptona de soja 3 gr Dextrosa 6 gr ClNa 0.5 gr Tioglicolato de Na 0.5 gr Agar 0.7 gr L-cisteína 0.25 gr Sulfito de Na 0,1 gr Hemina 5 gr Solución de 4 ml resarzurina (0.01%) Agua c.s.p 1000ml PH 7.0 Luego de esterilizardo y enfriado se suplementa con 0.1 g/ml de vitamina K y 10 mg/ml de NaHCO3. Medios de cultivo selectivos Por lo general las muestras a procesar para el aislamiento de microorganismos anaerobios contienen mezclas de anaerobios obligados, facultativos y/o aerobios. Las especies presentes en pequeñas cantidades pueden pasar inadvertidas si se usan medios no selectivos. Incorporando distintas sustancias a los medios mencionados anteriormente se obtienen diferentes medios selectivos. Agentes selectivos: Microbiología General Facultad de Ciencias Exactas Violeta de genciana: elimina bacilos esporulados aeróbicos. Azida sódica: inhibe el crecimiento de bacilos Gram positivos esporulados aeróbicos. Fenil etil alcohol: inhibe bacilos Gram negativos aerobios y anaerobios facultativos. Neomicina: inhibe Gram negativas facultativas. Vancomicina+Kanamicina: selecciona bacilos Gram negativos anaerobios. Sistemas anaerobios para el cultivo de bacterias anaerobias Estudios comparativos han demostrado que los siguientes sistemas son satisfactorios para el cultivo e incubación de bacterias anaerobias. 1- Técnica en jarra anaerobia Con catalizador: a-Evacuación-reemplazo b-Método del sobre generador de gas descartable Sin catalizador: Fijación del O2 por limaduras de Fe 2- Técnica de la cámara anaerobia de guante 3- Tubos con película de agar con siembra por estrías en medios PRAS. 1- Técnica en jarra anaerobia Existen diferentes marcas en el mercado por ejemplo: Brewer, GasPak, Oxoid, Mclntosh, entre otras. La jarra Oxoid, utilizada en el TP, es de policarbonato, tiene una capacidad de 3.5 lt, cerrada con una tapa de metal pesado y una abrazadera de metal. El centro de la tapa tiene dos válvulas Schrader y un manómetro. Las válvulas se utilizan en la técnica de evacuación-reemplzo (E/R). En la parte interna de la tapa se ubica el catalizador. La remoción del oxígeno ocurre por reacción con el hidrógeno agregado al sistema en presencia del catalizador. H2 + O2 catalizador H2 El uso de un catalizador activo en cada sistema es importante. La jarra de Brewer, más antigua, utilizaba un catalizador de paladio en la tapa que tenía que ser calentado con una corriente eléctrica para ser activo. La jarra GasPak usa un catalizador en frío compuesto de bolitas de alúmina cubiertas de paladio, que no requieren calentamiento. Microbiología General Facultad de Ciencias Exactas El catalizador en frío es más conveniente para usar y no tiene riesgo de explosión. El catalizador en frío de paladio puede ser inactivado en la jarra por la producción de SH2 u otros productos volátiles de las bacterias. Se recomienda reemplazarlo por uno nuevo o uno reactivado cada vez que se utiliza la jarra. Puede reactivarse mediante el calentamiento en estufa a 160-170°C durante 2 horas. Luego se guarda en un secador. En estos sistemas las condiciones anaeróbicas se producen o bien utilizando un sobre generador de gases o mediante la técnica de evacuación-reemplazo. En la técnica de anaerobiosis por evacuación-reeplazo se extrae el aire de la jarra hasta 51-61 mm Hg, luego se lava con corriente de N2. Este procedimiento se repite dos veces. Por último se llena la jarra con una mezcla anaeróbica de N2:85%, CO2:5% e H2:10%. En la técnica del sobre generador de gases se emplean sobres conteniendo, por ejemplo, ácido cítrico o tartárico, bicarbonato de sodio y borohidruro de sodio. En el momento de utilizarse se corta el extremo del sobre y se hidrata con un volumen de agua, luego se cierra inmediatamente la jarra. En el sistema se producen las siguientes reacciones: C6H8O7 + NaHCO3 Na3(C6H5O7) + 3 H2O + 3 CO2 NaH4 B + 2 H2O NaBO2 + 4 H2 El H2 generado reacciona con el O2 del aire, en presencia del catalizador produciendo H2O. Dentro de la jarra se colocará un indicador de Eh, independientemente de la técnica empleada. Para lo cual se encuentra en el comercio tiras de azul de metileno que en condiciones de anaerobiosis vira del azul al blanco. Una alternativa consiste en colocar dentro de la jarra un tubo de ensayo con unos mililitros de una mezcla de azul de metileno + NaCO3 + glucosa. El indicador es azul cuando está oxidado e incoloro cuando está reducido. El cambio de color ocurre alrededor de los +11 mv. Conjuntamente con el viraje del indicador de Eh ocurre un calentamiento de la tapa de la jarra luego de los 40 minutos y se observa condensación en la superficie interna dentro de los 25minutos. La técnica E/R resulta más económica que el generador de gas y permite que las condiciones de anaerobiosis se establezcan más rápidamente. En los sistemas sin catalizador la anaerobiosis se logra mediante Fe finamente dividido, ácido cítrico, CO3Na2 y tierra silícea como soporte (Kit comercial Merck). En el momento de usar se humedece con un volumen de agua, el O 2 del aire es fijado con avidez por el Fe dando los siguientes productos: Fe(OH)2 + Fe(OH)3 + Fe2O3 + FeO + H2 + CO2 Microbiología General Facultad de Ciencias Exactas En breve tiempo se registra el descenso del O2, creando una atmósfera anaeróbica rica en CO2. La técnica empleada en el TP es una adaptación del Kit comercial. Se utiliza lana de Fe embebida con una solución cúprica (CuSO 4.5H2O al 0.5%, tween 80 0.25%, pH 2). Como generador de CO2 se coloca un tubo conteniendo una solución acuosa de KHCO3 y ácido cítrico. 2-Cámara anaerobia de guante Una cámara anaerobia de guante es un sistema anaerobio autoabastecido que permite procesar muestras y realizar la mayor parte de las técnicas bacteriológicas para aislamiento e identificación de bacterias anaerobias sin exposición al aire. Pueden construirse de diferentes materiales, incluyendo acero, acrílico o fibra de vidrio. La más ampliamente usada es la de plástico vinílico flexible. Una vez adquiridas el funcionamiento de estas cámaras es económico porque permiten el uso de medios convencionales y el costo de los gases es mínimo. Los materiales se colocan y se retiran de una pre-cámara flexible. Las condiciones anaerobias se mantienen por una constante recirculación de la atmósfera dentro de la cámara plástica (85%de N2. 10% de H2 y 5% de CO2) a través de un catalizador de paladio en frío. Microbiología General Facultad de Ciencias Exactas 3-Medios PRAS en tubos arrollados Esta técnica utiliza medios PRAS: medios previamente reducidos y anaeróbicamente esterilizados. El medio se envasa en tubos con tapón de caucho butílico bajo gas libre de O 2 y se esterilizan y mantienen en ambiente anaeróbico. Luego de esterilizados se enfrían en una máquina giratoria lo que resulta en una capa fina de agar en la superficie interna de los tubos. El sistema requiere el agregado de un agente reductor, como L-cisteína en la fórmula del medio de cultivo. Todas las inoculaciones de estos medios sean líquidos o sólidos se realizan bajo corriente de CO2. Cada tubo con PRAS se convierte así en su propia cámara de cultivo anaeróbico y puede ser colocado en un incubador de aire ambiental para su incubación. Permiten la inspección de las colonias en cualquier momento sin la exposición al O2. Distribución en la naturaleza de las bacterias anaeróbicas. Las bacterias anaeróbias están ampliamente distribuidas en la tierra, pantanos, sedimentos de lagos y ríos, océanos, aguas residuales, alimentos y animales. La mayor parte de estas hábitat tienen una tensión de oxígeno baja y un Eh reducido, resultantes de la actividad metabólica de los microorganismos que Microbiología General Facultad de Ciencias Exactas consumen oxígeno a través de la respiración. Si el oxígeno no es reemplazado, se mantienen las condiciones anaerobias en el ambiente. Importancia de las bacterias anaerobias a- En bacteriología clínica: los microorganismos anaerobios pueden dar cualquier tipo de infección, muchas de alta gravedad. Estos microorganismos pueden pasar inadvertidos, ya que lo más común es encontrarlos en cultivos mixtos. bEn el control sanitario de alimentos: como ejemplos Clostridium perfringens y Clostridium Botulinun causan el deterioro de alimentos e intoxicaciones graves. En estos casos es necesario demostrar la presencia de la toxina, el aislamiento y la tipificación del germen. cEn la industria: Fermentación de hidratos de carbono, distintas especies del género Clostridium producen acetona, butanol e isopropanol. Actualmente, la síntesis química ha desplazado en parte al proceso microbiológico. Procesos fermentativos en los que se utilizan bacterias fermentativas y bacterias anaerobias estrictas. B. metanogénicas An. estrictos Hidratos de carbonos An. facultativas Ac. Grasos + alcoholes + CO2 + H2 CH4 Procesamiento y examen de una muestra para el aislamiento de bacterias anaerobias El procesamiento mínimo debe incluir: 1- La observación directa-Características microscópicas. Los frotis de las muestras deben ser examinadas previamente coloreados por la técnica de Gram. Este paso es muy importante porque puede sugerir la presencia de bacterias anaerobias que se caracterizan por su coloración irregular y pleomorfismo. Además orientará sobre los medios selectivos a utilizar y servirá como control de calidad, debiendo recuperarse todos los tipos morfológicos en proporción aproximada a la que se observó. 2Siembra en medios sólidos-Relación con el O2.Se siembra: una placa de agar sangre en aerobiosis, otra en anaerobiosis una tercera placa en microaerofilia. La microaerofilia se logra colocando en un recipiente hermético una vela encendida que al extinguirse dará una atmósfera con 4% de O2 y 5-10% de CO2 aproximadamente. 3Siembra en medios líquidos. Los medios líquidos, como el tioglicolato, deben ser purgados antes de la siembra y suplementarse con vitamina K y CO3HNa. Se inoculan con pipeta Pasteur llegando al fondo y sin introducir aire. Los medios de cultivo líquidos son considerados “el respaldo” de los medios sólidos. Microbiología General Facultad de Ciencias Exactas Los cultivos de bacterias anaerobias son de desarrollo lento, por lo tanto deben incubarse 48 hs. antes de la primera observación. Los cultivos negativos se mantienen en incubación durante dos semanas con observaciones periódicas. 4Aislamiento de las colonias desarrolladas. Deben verificarse la anaerobiosis y observar las características macroscópicas. Realizar la observación microscópica previa coloración de Gram. Siembra en medios selectivos 5Pruebas bioquímicas destinadas a la identificación del microorganismo. Se recurre en primer lugar a un conjunto de pruebas bioquímicas que permiten la identificación en grupos preliminares. Luego, dentro de cada grupo se procede a la identificación definitiva. Existen en el comercio microsistemas completos para la identificación de los anaerobios por ejemplo: API-20ª y Minitek. La identificación de los anaerobios también puede llevarse a cabo mediante el análisis de los productos metabólicos de la fermentación, ácidos volátiles y no volátiles, por cromatografía líquido-gas.