Sesión 10 Estructura y Función del ADN Cromosomas Eucarióticos • Todos los organismos transmiten su ADN a la descendencia cuando se reproducen • En las células, cada doble hélice de ADN está organizada como un cromosoma • Estructura que consiste de ADN y sus proteínas asociadas (histonas). Duplicación de un Cromosoma Cuando la célula se prepara para la división, duplica sus cromosomas para que ambas células hijas tengan una copia de cada cromosoma Luego de que un cromosoma se duplica, cada uno consiste de dos moléculas de ADN (cromátidas hermanas) unidas entre ellas por un centrómero Duplicación de un Cromosoma centrómero una cromátida cromosoma (sin duplicar) cromosoma (duplicado) su cromátida hermana Conceptos Clave • Histona • Tipo de proteína que organiza estructuralmente los cromosomas de una célula eucarionte • Nucleosoma Largo del ADN enrollado alrededor de un conjunto (paquete) de proteínas histona • Cromosoma Estructura compuesta por ADN y proteínas asociadas, lleva una parte o toda la información genética de una célula 1 El ADN dentro del núcleo de una célula eucarionte 2 Puesto que está condensado, un cromosoma duplicado está empacado compactamente en forma de X . Estructura del Cromosoma 3 Al desenredar un cromosoma se obtiene un cilindro hueco formado por el superenrrollamiento de la doble hebra de ADN 4 El enrollamiento consiste de una molécula larga de ADN (azúl) y sus proteínas histonas (púrpura). 5 En intervalos regulares, la molécula de ADN se enrolla dos veces alrededor de un núcleo de proteínas histonas. En esa estructura de “collar de perlas”, la “cuerda” es el ADN y cada “perla” se conoce como nucleosoma 6 La molécula de ADN está formada por dos hebras que se estructuran en una doble hélice Si se extendiera el ADN de 1 célula humana en una hebra, mediría entre 1-2 m La información la da la secuencia de las bases nitrogenadas. En humanos se estiman 20500-22000 genes Según el Proyecto Genoma Humano Empaquetamiento del ADN Estructura: desde ADN →cromosoma El ADN se encuentra empaquetado en los cromosomas que son estructuras compuestas por ADN y proteínas. Las histonas, permiten el enrollamiento del ADN para estructurar los cromosomas. 1 1. ADN (2nm) + Histonas 2. Nucleosoma (10nm) 3. Solenoide (30nm) 4. Fibra de cromatina 5. Cromosoma (700nm 2 3 4 de diámetro) Otras proteínas cohesinas y condensinas 5 Un Cariotipo Humano 22 pares de autosomales y 2 cromosomas X Cariotipo: Imagen del conjunto de cromosomas de un individuo, que se acomodan por tamaño, longitud, forma y localización del centrómero Otro Cariotipo Humano Descubrimiento de la Función del ADN Unos 100 años de experimentos con bacterias y bacteriófagos han proporcionado una sólida evidencia de que el ácido desoxirribonucléico (ADN) es el material hereditario de la vida, no las proteínas En 1869 Johannes Miescher encontró que el núcleo contenía una sustancia ácida compuesta en su mayor parte por nitrógeno y fósforo. Tiempo después esa sustancia fue llamada ácido desoxirribonucleico o ADN. Sesenta años más tarde, Frederick Griffith usó dos cepas de Streptococcus pneumoniae en una serie de experimentos que dieron pistas sobre la herencia Experimentos de Griffith Ratones inyectados con células vivas de cepa R, no murieron. 1 Ratones inyectados con células vivas de cepa S, murieron. 2 Ratones inyectados con células destruidas con calor, no murieron. 3 4 Ratones inyectados con células vivas R adicionadas con células muertas de cepa S, murieron. Griffith aisló dos cepas de Streptococcus pneumoniae, bacteria que causa neumonía: no dañina, rugosa (R) y dañina, lisa (S) La transformación fue permanente y heredable Más pistas…. En 1940, Oswald Avery y Maclyn McCarty trataron de identificar el “principio transformante” de Griffith Separaron los componentes de lípidos, proteínas y ácidos nucleícos de las células de la cepa S. Encontraron que: • Extractos de células S aún transformaban a las células de la cepa R, aún después del tratamiento con enzimas que destruían los lípidos y las proteínas. El principio transformante debían ser los ácidos nucléicos (ARN o ADN). • Los extractos de células de cepa S aún transformaban a las células de cepa R luego de tratamiento con enzimas degradadoras de ARN, entonces el principio transformante debía ser el ADN. Confirmación de la función del ADN • Alfred Hershey y Martha Chase examinaron si el material genético inyectado por bacteriofagos a las bacterias era ADN, proteína o ambos, con base en el hecho de que las proteínas contienen más azufre que fósforo y que el ADN tiene más fósforo que azúfre • bacteriófago • Virus que infecta a las bacterias Bacteriófago ADN dentro de la cubierta protéica Fibra de la cola lámina hueca Bacteriófagos • micrografía de tres virus inyectando ADN en una célula de E. coli Experimento 1 de Hershey–Chase Cubierta protéica del Virus marcada con 35S 35S permaneció fuera de la célula ADN siendo inyectado en la bacteria Los virus no inyectaron proteínas a las bacterias. Experimento 2 de Hershey–Chase ADN viral marcado con radioisótopo 32P 32P permaneció dentro de la célula ADN marcado siendo inyectado a la bacteria Los virus inyectaron ADN en las células, es una evidencia de que el ADN es el material genético del virus Descubrimiento de la Estructura del ADN James Watson y Francis Crick descubrieron la estructura del ADN con base en muchos años de investigación de otros científicos Un nucleótido de ADN tiene un azúcar de cinco carbonos, tres grupos fosfato y una de las cuatro bases nitrogenadas Cómo los cuatro nucléotidos – adenina (A), guanina (G), timina (T) y citosina (C) — se organizan en el ADN fue un rompecabezas que tomó unos 50 años solucionar A principios de la década de 1900, el bioquímico Phoebus Levene identificó la estructura de las bases nitrogenadas y cómo ellas están conectadas al ADN Cuatro Nucleótidos del ADN adenina (A) desoxiadenosina trifosfato guanina (G) desoxiguanosina trifosfato mm Cuatro Nucleótidos del ADN timina (T) desoxitimidina trifosfato citosina (C) desoxicitidina trifosfato Mmm Reglas de Chargaff En los años 50, Erwin Chargaff hizo dos descubrimientos: 1a regla de Chargaff: A = T y G = C (las cantidades de timina y adenina en todos los ADN son iguales, así como las cantidades de citosina y guanina). 2a regla de Chargaff: Las proporciones de adenina y de guanina difieren entre el ADN de especies diferentes Watson y Crick El biólogo norteamericano James Watson y el biofísico británico Francis Crik sospechaban que la molecula de ADN era una hélice Ellos argumentaban eso con base en el tamaño, forma y requerimiento de enlaces de los cuatro nucleótidos del ADN Rosalind Franklin y la primera imágen del ADN La bioquímica Rosalind Franklin había estado trabajando sobre la estructura del ADN, usando cristalografía de rayos X para calcular el tamaño, forma y el espacio entre los elementos repetidos de la molécula • Rosalind Franklin y su imagen de difracción por rayos x- del ADN El primer modelo del ADN • Watson y Crick usaron la información de Franklin para construir un modelo de la hélice de ADN Estructura del ADN • Dentro están las bases apareadas: • A a T, y • G a C 2-nanómetro diámetro 0.34 nanómetro entre cada par de bases 3.4-nanómetro largo de cada giro completo de la doble helice H H H P H H H H H H H P 5P H 2C O 5 P3 H 2C O 3 5 P H H 2C O H 4 1 3 2 HO d H P 5 3 H H H H H H H d d 3 d5 3 O 5 CH2 d 3 O 5 CH2 2 d 34 5 1 O d CH2 A,G,U T,C Nucleótidos NH2 N C C N HC CH C N N O OH HO P O CH2 O Grupo fosfato H Desoxirribosa H o H Ribosa OH H Pentosa H Base nitrogenada En un nucleó)do: } base nitrogenada se une al carbono 1' del azúcar, } grupo fosfato se une al carbono 5' Secuencia de bases del ADN • El órden en el cual se aparean las bases varía tremendamente entre las especies (segunda regla de Chargaff) • Variaciones en la secuencia de bases son la fuente de la diversidad de la vida Watson y Crick 1953 Doble hélice del ADN Doble hélice enrollada hacia la derecha Cadenas antiparalelas y complementarias entre sí La secuencia de una cadena, dicta la secuencia de la otra Replicación y Reparación del ADN El órden de las bases nitrogenadas – secuencia del ADN - en una cadena del ADN es la información genética Las células hijas deben tener una copia exacta del ADN parental Cuando la célula se reproduce, debe contener dos conjuntos de cromosomas: uno para cada una de sus células hijas • El ADN se duplica a sí mismo por replicación del ADN Pasos de la Replicación del ADN 1. Las dos cadenas de una molécula de ADN son complementarias: los nucleotidos se aparean de acuerdo con la regla: G con C y T con A 2. La ADN helicasa rompe los puentes de hidrógeno que mantienen la doble hélice unida, y las dos cadenas de ADN se separan Pasos de la Replicación del ADN (cont.) 3. Cada cadena parental sirve como templado (molde) para el ensamblaje de los nucleótidos de una nueva cadena de ADN, de acuerdo con las reglas de apareamiento de las bases. La ADN polimerasa ensambla una cadena complementaria de ADN en cada una de las cadenas parentales. 4. La ADN ligasa llena cualquier vacío que quede entre las bases de la “nueva” cadena de ADN. Se forma una cadena continua. Replicación del ADN Replicación Semiconservativa del ADN Replicación Semiconservativa del ADN vieja nueva nueva vieja Síntesis de ADN • Cada cadena de ADN tiene un carbono libre 5’ al final de un extremo, y un carbono 3’ al final del otro extremo: • La síntesis del ADN se dá en la dirección 5’ a 3’ Síntesis del ADN La doble hélice del ADN parental se separa en esta dirección Sólo una de las dos nuevas cadenas puede ser ensamblada de manera contínua. La otra cadena forma pequeños fragmentos Llamados fragmentos de Okazaki ADN ligasa sella los huecos Síntesis de ADNR Duplicación del ADN • La duplicación de la cadena líder es con6nua, pero la de la cadena rezagada es discon6nua. • En la cadena rezagada, se sinte)zan fragmentos de Okazaki en la dirección 5' a 3'. • La enzima ADN ligasa une fragmentos de Okazaki con)guos. • El cebador de ARN se sus)tuye por nucleó)dos de ADN • Una ADN polimerasa corrige los errores “Teorema Central de la Biología molecular” Crick Temin 1953-2003 Watson y Crick Craig Venter y Francis Collins Se termina la secuencia completa del Genoma Humano Mecanismos de Reparación del ADN Una molécula de ADN no siempre se replica correctamente, pero las ADN polimerasas “revisan”su propio trabajo • Mecanismos de reparación del ADN corrigen errores, remueven los nucleótidos que no se aparearon correctamente • Cuando los mecanismos de “revisión” y de reparación no corrigen, el error se convierte en una mutación Conceptos Clave • Mecanismo de reparación del ADN • Cualquiera de los varios procesos por los cuales las enzimas reparan el ADN dañado • Ejemplo: Eliminación enzimática y reemplazo de bases incorrectamente apareadas antes del inicio de la replicación. • Mutación • Cambio permanente en la secuencia del ADN. Revisar hasta acá los conceptos estudiados con animaciones del curso y: https://www.youtube.com/watch?v=WtRA-NsERKY http://es.wikipedia.org/wiki/Fragmento_de_Okazaki