TEMA 10: GENÉTICA: LAS LEYES DE MENDEL 1. CONCEPTOS BÁSICOS - Genoma: conjunto de genes de una población Genotipo: conjunto de genes de un individuo Fenotipo: conjunto de caracteres observables de un individuo. El fenotipo es la consecuencia de la interacción del genotipo con el medio ambiente. Gen: fragmento de ADN con información para una proteína Alelos: son las diversas formas posibles para un mismo gen. El alelo más extendido se llama alelo normal o salvaje, y los otros son alelos mutados. En el caso más frecuente y sencillo se presentan dos alelos. Locus: lugar que ocupa el gen en el cromosoma Cromosomas homólogos: es el par de cromosomas que poseen información de los mismos caracteres. Son uno paterno y otro materno. Caracteres cualitativos: son los que presentan dos alternativas claras o alelos. Caracteres cuantitativos: son los que presentan muchas alternativas graduadas entre dos valores extremos. Ej.: la altura. Homocigosis (razas puras para un carácter): se produce cuando los dos genes para el mismo carácter, en los cromosomas homólogos, son portadores del mismo alelo. Heterocigosis (híbridos para un carácter): se produce cuando los dos genes para el mismo carácter, en los cromosomas homólogos, son portadores de alelos distintos. Dominancia/recesividad: un alelo es dominante sobre otro (que se denomina recesivo) cuando en heterocigosis se impone sobre el otro, que queda oculto. Codominancia: un alelo es codominante con otro cuando en heterocigosis aparece un fenotipo intermedio, por tener los dos alelos la misma potencia para expresarse. Mutación es un error en la secuencia de bases del ADN de un gen, que puede traducirse en una alteración de la proteína codificada por el gen. Epigenética: conjunto de procesos que dan lugar al fenotipo a partir de un genotipo y un medio ambiente determinado. 2. METODOLOGÍA EXPERIMENTAL El procedimiento que siguió Mendel para deducir sus leyes consistía en coger guisantes y sembrarlos, seleccionando siempre los que diferían en algún carácter para reproducirlos entre ellos. De esta forma y después de varias generaciones, obtenía razas puras para un carácter (p. e.: guisantes verdes, guisantes rugosos, etc.) Para evitar polinizaciones indeseadas, Mendel cortaba las anteras de las flores y aplicaba el polen que quería en cada estigma con un pincel. Cada grano de polen desarrolla un tubo polínico y fecunda un óvulo. Cuando maduran los óvulos sólo tenemos que contar los guisantes que hemos obtenido de cada tipo. Tendremos una raza pura cuando todos los guisantes de todas las vainas den guisantes del carácter que deseamos. El éxito de la metodología experimental que utilizaba Mendel se basaba en: - Elección de una especie fácilmente reproducible y caracteres bien definidos - Trabajo con muchos individuos - Análisis estadístico de resultados - Diseño de cruzamientos entre individuos que difieren sólo en un carácter - Trabajo estadístico con conteo de resultados y proporciones. El esquema típico de cruzamientos es el siguiente: 3. HERENCIA DE UN SOLO CARÁCTER En primer lugar Mendel cruzó dos variedades homocigóticas (AA x aa) de guisantes, que se diferenciaban por su color. Observó que todas las plantas obtenidas en la 1ª generación filial eran iguales por lo que enunció su primera ley. Ley de la uniformidad de la primera generación filial: “los descendientes del cruce entre dos individuos homocigóticos para un carácter, está formada por individuos iguales entre sí e iguales a uno de los parentales” Tras esto Mendel cruzó los individuos obtenidos entre ellos y obtuvo como resultado que el 75 % de los individuos eran amarillos y el 25 % eran verdes. Y enunció la segunda ley. Ley de la segregación de los caracteres antagónicos en la 2ª generación filial: Los individuos de la F2 son diferentes unos de otros debido a la segregación de los factores responsables de dichos caracteres (alelos) que se separan y reparten entre los distintos gametos”. 3.1. Codominancia Cuando los dos alelos del carácter implicado son equipotentes obtenemos individuos iguales pero distintos a los parentales, y cuyo fenotipo es una mezcla de los parentales. En la F2 obtendremos ¼ de individuos de un fenotipo, ¼ de otro fenotipo y ½ de individuos con el fenotipo intermedio. 4. RETROCRUZAMIENTO O CRUZAMIENTO PRUEBA Es un procedimiento para determinar el genotipo de uno de los parentales cuando tiene el fenotipo dominante. Consiste en cruzarlo con el doble recesivo. Si el resultado es que toda la generación filial es igual significaría que el genotipo buscado era un homocigoto. Si el resultado es que la mitad de la generación es del fenotipo recesivo y la otra mitad del dominante significaría que el genotipo buscado era un heterocigoto. 5. HERENCIA DE DOS CARACTERES Por último Mendel intentó ver si la primera o la segunda ley se veían modificadas cuando se consideraban simultáneamente dos caracteres. Tras el cruzamiento de dos razas puras que se diferenciaban en dos caracteres, obtuvo un dihíbrido en el que se cumplía la primera ley. Después cruzó dos dihíbridos y obtuvo las siguientes proporciones en el fenotipo: 9/16 : 3/16 : 3/16 : 1/16. Considerando cada uno de los dos caracteres por separado se cumplía la segunda ley pues se obtenían ¾ y ¼ de cada uno de los fenotipos en cada carácter considerado. Así Mendel enunció la tercera ley: Ley de la independencia y la libre combinación de los factores hereditarios: “Los distintos caracteres se heredan independientemente unos de otros debido a que los factores responsables de dichos caracteres (alelos) se transmiten a la descendencia por separado y se combinan de todas las maneras posibles”. 6. EXCEPCIONES A LAS LEYES DE MENDEL 6.1. Genes letales Se trata de genes que cuando se expresan provocan la muerte del portador, por tanto modifican las proporciones esperadas por la 2ª ley, es decir, modifican la proporción esperada de 3:1. Sólo se estudian cuando son recesivos, pues si son dominantes ocasionan la muerte de su portador siempre y por tanto desaparecen con su portador. Los recesivos sólo aparecen en homocigosis recesiva dando lugar al nacimiento de una cuarta parte menos de descendientes. 6.2. Series de alelos múltiples: sistema AB0 Se trata de genes con más de dos alelos, que obviamente modifican las proporciones esperadas por la 2ª ley. El grupo sanguíneo tiene tres alelos, de los que A y B son codominantes y dominantes a su vez sobre el grupo 0. (A=B)>0 6.3. Interacción entre genes. Epistasia Se produce interacción entre genes cuando un carácter no depende de un solo gen para expresarse. La epistasia es un caso particular en que la expresión de un gen, llamado epistático, puede anular la expresión de los alelos de otro gen que llamamos hipostático. Por ejemplo aparece un gen epistático en ratones que determina si tienen color o son albinos (C>c). Si en este gen el individuo es cc será albino y por tanto se anula la expresión del otro gen que determina el color (gen hipostático que determina el color: negro o marrón). Si por el contrario el individuo es CC o Cc, se permite la expresión del otro gen y el ratón será negro o marrón. 7. HERENCIA DE 2 CARACTERES QUE ESTÁN EN EL MISMO PAR DE CROMOSOMAS Cuando los dos caracteres estudiados se encuentran en el mismo par de cromosomas homólogos, no se cumplen las leyes de Mendel porque los alelos no se pueden repartir independientemente en los gametos. Entonces estaremos ante el caso de genes ligados y dependiendo de la distancia a la que se encuentren los loci de ambos genes (ubicaciones en el cromosoma), hablaremos de ligamiento absoluto o relativo. En ausencia de sobrecruzamiento las proporciones mendelianas deberían ser 9:3:3:1, pero como se ve en el ejemplo las proporciones fenotípicas que aparecen son 3:1, pues el gen de alelos Aa, está ligado al gen de alelos Bb, es decir van los dos “unidos”, y sólo se pueden separar si hay algún sobrecruzamiento en la meiosis. 7.1. Ligamiento absoluto Se produce cuando la distancia entre ambos loci es tan pequeña que es prácticamente imposible en sobrecruzamiento entre los dos. Por tanto estos dos caracteres se heredan juntos 7.2. Ligamiento relativo Se produce cuando la distancia entre ambos loci es suficientemente grande para que se pueda producir un sobrecruzamiento entre ellos. 8. TEORÍA CROMOSÓMICA DE LA HERENCIA La teoría surge cuando se llega al convencimiento de que los genes están en los cromosomas. Influyen sobre todo los trabajos de T. H. Morgan con la mosca de la fruta (Drosophila melanogaster). Así cuando dos genes se encuentran en distintos pares de cromosomas tienden a heredarse independientemente, siguiendo las leyes de Mendel. Pero cuando dos genes se encuentran en el mismo par de cromosomas están ligados de forma que tienden a heredarse juntos. Morgan comprobó que este ligamiento rara vez es completo pues se ve alterado por el sobrecruzamiento en profase I. 9. HERENCIA DEL SEXO En los animales que tienen reproducción sexual el sexo se hereda por la vía de los cromosomas sexuales (heterocromosomas) que son diferentes en los diferentes grupos se seres vivos: - Los mamíferos tienen un par de cromosomas sexuales: XX (hembras), XY (machos), de forma que los espermatozoides pueden llevar el X o el Y, mientras que todos los óvulos llevan un cromosoma X. Esto hace que el número de varones nacidos sea siempre aproximadamente igual al de hembras. - Las aves y los reptiles tienen también un par de cromosomas, pero el sexo homogamético (con gametos iguales) son los machos, de forma que los machos son ZZ y las hembras ZW. - Algunos insectos tienen un solo tipo de cromosoma sexual. Así cuando el insecto es macho, es X, y cuando es hembra, es XX. 10. HERENCIA LIGADA AL SEXO Los cromosomas sexuales tienen los genes responsables de las diferencias sexuales de machos y hembras. Se habla de genes ligados al sexo porque la mayoría de los genes que pertenecen a uno u otro de estos cromosomas no pueden combinarse independientemente por estar en el mismo cromosoma y en el segmento diferencial. Ambos cromosomas tienen un pequeño segmento homólogo, donde se sitúan los mismos caracteres, pero la mayor porción la constituye el segmento diferencial, donde hay caracteres exclusivos de uno u otro cromosoma. - Genes holándricos: son los caracteres exclusivos del segmento diferencial del cromosoma Y, y la mayoría son caracteres sexuales. Ej. Uno de los caracteres, que en este caso no es sexual, es la hipertricosis de la oreja, carácter típicamente masculino por el que la oreja se llena de pelo. - Genes ginándricos: son los caracteres del segmento diferencial del cromosoma X, y son genes de todo tipo que pueden afectar a la mujer y al varón. Así se conocen varias anomalías asociadas a este cromosoma como la hemofilia o el daltonismo. TEMA 11: GENÉTICA MOLECULAR I: TRANSCRIPCIÓN Y TRADUCCIÓN 1. DIFERENCIAS EN LA EXPRESIÓN GÉNICA ENTRE EUCARIOTAS Y PROCARIOTAS Los genes se expresan cuando se transcriben y se traducen, de forma que la primera etapa de la expresión génica es la transcripción, que consiste en sacar una copia de un fragmento del ADN en forma de ARN. El procedimiento contrario se denomina retrotranscripción y lo realizan enzimas que van dentro de los virus: las retrotranscriptasas. Consiste en fabricar un ADNc a partir del ARN del virus. PROCARIOTAS EUCARIOTAS GENES Continuos Exones + intrones ADN De fácil acceso Difícil acceso. Muy empaquetado ARNpol Un solo tipo LOCALIZACIÓN TIPOS DE GENES MADURACIÓN 3 tipos, una para cada tipo de ARN: polI(r), polII(m) y polIII(t) Transcripción y traducción en el Transcripción en el núcleo y citoplasma traducción en el citoplasma Monocistrónicos (un ARNm lleva Policistrónicos (un solo ARNm da una sola proteína codificada) lugar a muchas proteínas) Sólo se produce en el precursor del Se produce en los tres tipos de ARNt y del ARNr ARN. 2. ELEMENTOS DE LA TRANSCRIPCIÓN EN EUCARIOTAS El proceso de la transcripción consiste en la síntesis de una molécula de ARN y para ello hacen falta los siguientes elementos: - Una cadena de ADN molde: de la doble cadena, una de ellas se denomina hebra informativa y ayuda a la polimerasa a situarse al inicio de la región a transcribir y la otra hebra es la hebra molde, que se lee en dirección 3’ Æ 5’, y a partir de ella se obtiene una copia complementaria en ARN. - Ribonucleótidos de A, G, C y U en su forma activada: ATP, GTP, CTP y UTP. - Una ARN polimerasa. La enzima que sintetiza el ARNm es la ARNpolII, que debe ser capaz de: o Reconocer las secuencias promotoras, con ayuda de los factores de la transcripción. o Reconocer la hebra molde y colocar los ribonucleótidos complementarios o Catalizar el enlace éster o Reconocer secuencias de terminación. 3. ETAPAS DE LA TRANSCRIPCIÓN DEL ARNm EN EUCARIOTAS - - 3.1. Iniciación: Para hacerla posible existen varios tipos de secuencias reguladoras: El promotor: es la región más cercana al inicio de la transcripción y contiene secuencias que indican una cuenta atrás para el inicio de la transcripción, de forma que la polimerasa pueda saber cuándo debe empezar a colocar nucleótidos complementarios. Por ejemplo la secuencia TATA situada en -25. Hay factores proteicos que se unen a estas secuencias y ayudan a la polimerasa a encontrar el sitio de inicio del gen. Secuencias potenciadoras y silenciadoras: se encuentran más lejos del inicio y sobre ellas se sitúan factores activadores o inhibidores de la transcripción. Los factores activadores desempaquetan la cromatina para hacer accesible la hebra molde. 3.2. Elongación: La ARN pol II recorre la hebra molde en dirección 3’ Æ 5’ colocando 30-40 nucleótidos complementarios por segundo 3.3. Terminación: La ARN pol II reconoce secuencias de terminación como TTATTT 4. MADURACIÓN En el ARNm la maduración consiste en modificaciones para proteger los extremos de la hebra, en la eliminación de los intrones y la alteración en algunas secuencias. - El extremo 5’ se protege mediante la adición de una metil-G triP. Este nucleótido terminal constituye una especie de caperuza que protege la hebra de las enzimas nucleasas. - El extremo 3’ se añade una cola de poliadeninas. (unos 170 nucleótidos de A) - Los intrones son fragmentos del gen no codificados, por tanto es preciso eliminarlos y unir los exones, para obtener las proteínas funcionales. A este proceso se le denomina “splicing”. El orden de corte y pegado de exones puede dar lugar a proteínas diferentes. 5. LA TRADUCCIÓN: EL CÓDIGO GENÉTICO La traducción consiste en la descodificación del mensaje genético del ARNm para que pueda sintetizarse una proteína. El código genético consiste en la correspondencia que existe entre los nucleótidos y los aminoácidos. Los aminoácidos están codificados por palabras de tres letras (tripletes o codones) de nucleótidos del ARNm. SEGUNDA BASE U C A G UUU Phe UCU UAU Tyr UGU Cys U P T UUC UCC Ser UAC UGC C R E Leu FIN FIN U UUA UCA UAA UGA A I R UUG UCG UAG UGG Trp G M C U E E CUU CCU CAU His CGU C R R CUC Leu CCC Pro CAC CGC Arg C A A A CUA CCA CAA Gln CGA G CUG CCG CAG CGG U B B AUU ACU AAU Asn AGU Ser C A A AUC Ile ACC Thr AAC AGC A S S AUA ACA AAA Lys AGA Arg A G E E AUG Met ACG AAG AGG U GUU GCU GAU Asp GGU GUC Val GCC Ala GAC GGC Gly C G A GUA GCA GAA Glu GGA G GUG GCG GAG GGG Las características principales del código genético son: - El código está degenerado o es redundante: hay 61 codones para codificar 20 aminoácidos (combinaciones con repetición de 4 elementos tomados de 3 en 3: 43=64), por lo que hay codones sinónimos. - Es universal, pues se utiliza por todos los organismos conocidos. - Todas los tripletes posibles tienen sentido y no son ambiguos, pues cada triplete tiene siempre el mismo significado. - El código es unidireccional, se lee siempre en sentido 5’ Æ 3’ y los tripletes están colocados en serie, sin solapamientos. - En los anticodones se produce el “balanceo”: apareamientos defectuosos de la tercera base del anticodón. Esto permite que haya menos ARNt que tripletes, pues un mismo tipo de ARNt puede unirse a distintos tripletes del ARNm, que se diferencian sólo en la tercera base. La unión de las dos primeras bases complementarias de codón y anticodón es suficiente para establecer el reconocimiento en el ribosoma. No obstante también hay diferentes ARNt con anticodones distintos que aceptan el mismo aminoácido y se denominan isoaceptores. 6. ENZIMAS MEDIADORAS DE LA TRADUCCIÓN La traducción necesita un diccionario que establezca la correspondencia entre tripletes y aminoácidos. Esta correspondencia la establecen las enzimas que cargan los ARNt con los aminoácidos adecuados. Por tanto se deben producir dos reconocimientos específicos: - Aminoacil ARNt sintetasa (enzimas que cargan los ARNt): existen 37 enzimas diferentes de este tipo y cada una es capaz de reconocer un ARNt distinto y cargarlo con su aminoácido específico. Para ello la enzima tiene dos centros activos o lugares de reconocimiento: un lugar para el aminoácido y otro para un bucle lateral del ARNt. Tras coger los dos cataliza el enlace del extremo 3’ del ARNt con el extremo ácido del aminoácido. - Ribosomas: facilitan el reconocimiento codón-anticodón entre el ARNm y el ARNt. 7. ETAPAS DE LA TRADUCCIÓN 7.1. Iniciación: se produce con la formación del complejo de iniciación. Este se construye con la unión de la subunidad pequeña del ribosoma al ARNt iniciador, que va cargado con el aminoácido metionina. Después la subunidad pequeña reconoce la caperuza de metilGTP y se une al ARNm por su extremo 5’. Finalmente se unen las dos subunidades dando lugar al complejo. 7.2. Elongación: consiste en la entrada de sucesivos ARNt cargados con aminoácidos y en la formación de la cadena por la formación de enlaces peptídicos. Estos enlaces son catalizados por la enzima peptidil transferasa que está en el ribosoma. 7.3. Terminación: se produce cuando aparece en la secuencia del ARNm un triplete de STOP. En ese momento un factor proteico de terminación se une al codón de STOP y la cadena de proteína formada se suelta. 8. MADURACIÓN DE LAS PROTEÍNAS Consiste en el plegamiento de la proteína, con formación de enlaces (puentes de S, puentes de H, …) de la estructura terciaria, las modificaciones de aminoácidos, los cortes o eliminaciones de secuencias señal o códigos de destino, la unión de las diversas unidades que forman la estructura cuaternaria y la adición de grupos prostéticos o coenzimas. TEMA 12. GENÉTICA MOLECULAR: LA REPLICACIÓN DEL ADN. MUTACIONES Y CÁNCER 1. CARACTERÍSTICAS DE LA REPLICACIÓN La replicación del ADN consiste en la fabricación de copias exactamente iguales, de forma que se transmita lo más fidedignamente posible la información génica a las células hijas. Para ello es necesario separar las dos hebras en algún punto de la cadena, que denominamos origen de replicación (Ori C). La separación de las dos hebras da lugar a una burbuja de replicación, que está formada por dos horquillas de replicación. Características: Es bidireccional: la cadena se replica simultáneamente en los dos sentidos desde el origen de replicación. Es semiconservativa: cada una de las dos células hijas conserva una hebra. 2. REPLICACIÓN EN PROCARIOTAS Se produce desde un único origen de replicación, abriéndose una burbuja donde las dos hebras del ADN sirven como molde para sintetizar cadenas complementarias. Las horquillas de la burbuja se van separando en sentidos opuestos hasta que termina la replicación al cabo de media hora. A diferencia de esto, en eucariotas hay varios orígenes de replicación y cinco tipos de ADN polimerasa (α, β, γ, σ, ε) 3. ELEMENTOS DEL REPLISOMA El replisoma lo constituye un conjunto de enzimas y proteínas, que junto con la ADN pol se encargan de realizar la replicación. Son: Las helicasas: enzimas que rompen los puentes de hidrógeno para separar las hebras y abrir una burbuja de replicación. Girasas y topoisomerasas: eliminan tensiones al permitir que se desenrolle la doble hélice. Así no se producen superenrollamientos en el resto de la cadena. Una girasa es como dos topoisomerasas: corta las dos cadenas y quita vueltas Proteínas SSBP: se unen a las hebras desenrolladas, impidiendo que formen nuevos puentes de H y vuelvan a hibridarse. ADN pol III: polimeriza, es decir va colocando nucleótidos. La ADN pol II repara el ADN dañado por agentes mutágenos, mientras que la ADN pol I ayuda en la polimerización de los extremos 3’ libres y repara errores. ARN pol: inicia el proceso de replicación. Desoxirribonucleótidos triP de A, G, C y T. 4. PROBLEMAS DE LA ADNpol III EN LA REPLICACIÓN Se presentan varios problemas en el modo de funcionar de la ADN pol III: La ADNpolIII sólo lee en dirección 3’ Æ 5’, y la replicación debe ser bidireccional. La forma de solucionar este problema consiste en dirigirse hacia la horquilla de replicación y volver en dirección 3’ Æ 5’ leyendo y - - polimerizando un fragmento. Después vuelve a irse hacia la horquilla y sintetiza un nuevo segmento (fragmentos de Okazaki) La ADN polIII no sabe empezar a leer, pues su actividad consiste en comprobar en primer lugar si el último nucleótido está bien puesto y en segundo lugar colocar el siguiente complementario. Para resolver este problema, es una ARNpol (primasa) la que empieza siempre la copia, colocando unas decenas de nucleótidos (cebador o primer) y después se retira dejando el sitio a la ADNpolIII. La consecuencia es que quedan siempre fragmentos de ARN en las nuevas hebras y por tanto deben ser eliminados en un segundo momento y sustituidos por fragmentos de ADN, cosa que hace la ADNpolI. En procariotas el ADN es circular y no hay extremos, pero en eucariotas, como consecuencia del problema anterior, los extremos 3’ se quedan sin polimerizar y en cada copia se pierde cierto número de nucleótidos, por lo que el número de copias no puede ser ilimitado. Esta es una de las razones de que la vida de la célula se tenga que acabar. Algunas células como las células madre y las células cancerígenas consiguen resolver este problema con enzimas que se colocan en los extremos 3’ y suministran un soporte sobre el que añadir los nuevos nucleótidos (telomerasas) 5. CORRECCIÓN DE ERRORES Polimerización ERRORES 1/106 AGENTES ADN pol I y III Actividad autocorrectora 1/108 ADN pol I y III Corrección postreplicativa 1/1010 Complejo enzimático del replisoma El primer nivel de corrección lo hacen las polimerasas al tiempo que van polimerizando pues su actividad consiste en comprobar el último nucleótido y después colocar otro nuevo. Si detectan un error en el apareamiento, eliminan el último nucleótido colocado y vuelven a introducir el adecuado (corrección de pruebas). La corrección postreplicativa se realiza tras la sustitución de los cebadores. Para detectar un nucleótido mal colocado, la ADN pol I debe primero diferenciar la cadena molde de la nueva. Esto lo puede hacer porque en la cadena molde están metiladas la adeninas de las secuencias GATC, lo que no ocurre en la nueva cadena durante un tiempo. En caso de encontrar un error, una endonucleasa del complejo corta un segmento que incluye el error y la ADN pol I rellena el hueco. Por último una ligasa une el extremo del fragmento nuevo. 6. MUTACIONES Son alteraciones en el ADN. 6.1. Mutaciones según su alcance Haploides o monoploides: pierden un juego GENÓMICAS: nº de juegos Diploides: especies haploides que ganan un juego (Euploidías) Poliploides: (bastante frecuente en plantas) Nulisomías: en un par hay cero Nº de cromosomas Monosomías: en un par hay uno CROMOSÓMICAS Trisomías: en un par hay tres (Aneuploidías) Delecciones o adiciones: varía el nº de genes Forma Inversiones: varía la disposición de los genes Transposiciones o translocaciones: Id. Delecciones Inserciones GÉNICAS O PUNTUALES Sustituciones Transiciones (pur x pur o pir x pir) Transversiones (pur x pir) 6.2. Mutaciones génicas según sus efectos sobre las proteínas Intrones o chatarra génica SILENCIOSAS tripletes sinónimos Sitio activo: posible efecto letal si la proteína es importante - Cambia 1 aminoácido (sustituciones) Otras zonas: repercusiones variadas PATENTES - Cambian muchos aminoácidos: cambios totales en las proteínas (inserciones o delecciones: cambia el cuadro de lectura) - Cambios en la producción de la proteína (zonas reguladoras, por activación o inhibición de transcripción) 6.3. Mutaciones génicas según su causa - Despurinaciones: pérdida de bases púricas por - Fluctuaciones rotura del enlace N-glucosídico AGENTES térmicas - Desaminaciones: convierten C en U y A en HX FÍSICOS - Rayos UV UVA: produce radicales libres, que son mutágenos UVB: produce dímeros de T y C - Radiaciones ionizantes: rayos γ, rayos X, rayos cósmicos, y partículas subatómicas (protones, etc.): producen la rotura del ADN - Benzopireno: se inserta entre las hebras de ADN (combustiones) AGENTES - Ácido nitroso: induce desaminaciones de C y A QUÍMICOS - Agentes alquilantes: metilan las bases, como las aflatoxinas de Aspergillus (un hongo) - Radicales libres, dioxinas, asbestos, etc. AGENTES BIOLÓGICOS: como bacterias, transposones y virus 7. CÁNCER 7.1. Glosario - Totipotencia: cualidad de las células madre que les permite dividirse indefinidamente y diferenciarse para convertirse en cualquier tejido. Apoptosis: muerte celular programada que puede ser inducida en las células cuando sus mutaciones no pueden ser reparadas. Protooncogenes: son genes normales, pero implicados de una u otra manera en la producción de proteínas que intervienen en la división celular. Cuando estos genes mutan se convierten en oncogenes. Los protooncogenes son genes que codifican para gran diversidad de proteínas: o Genes que codifican para proteínas disparadoras de la división celular (factores de crecimiento celular internos o externos) o Genes que codifican para receptores de membrana de factores de crecimiento externos. o Genes que codifican para proteínas que propagan la señal de crecimiento desde el receptor de membrana hasta el núcleo o Secuencias reguladoras de los genes anteriores, así como los factores potenciadores o silenciadores de esas secuencias. - Genes supresores de tumores: son genes que codifican para proteínas (como la P53), encargadas de reparar mutaciones y si esto no es posible, desencadenar la apoptosis. - Micro ARNs: son pequeños ARNs de 20 a 25 nucléotidos de longitud que pueden controlar la expresión de los oncogenes regulándolos negativamente. - Por esa razón, las mutaciones en los micro ARNs pueden llevar a la activación de los oncogenes. Tumor primario: se llama tumor benigno y puede permanecer así por tiempo indefinido. Al cabo de los años una de cada millón de células sufre alguna mutación y prolifera más. Cuando algunas células mutan y pueden abandonar la masa tumoral para acceder al torrente sanguíneo, se instalan en otros tejidos y producen tumores secundarios. Proceso al que llamamos metástasis. 7.2. Desarrollo del cáncer Son necesarias al menos dos mutaciones sucesivas para dar lugar a un cáncer, una mutación en protooncogenes y otra en genes supresores, aunque habitualmente se producen muchas más mutaciones sucesivas en estirpes celulares en continua división: en los genes de las polimerasas, en enzimas del replisoma, en proteínas del sistema de reparación de errores, etc. Llega un momento en que se digieren las proteínas de anclaje de la matriz y las células cancerígenas migran a otros tejidos, originando tumores secundarios. En los últimos años se ha visto que en muchos cánceres, las mutaciones se han iniciado en las células madre, no en cualquier célula del tejido. Y son estas células madres desprogramadas las que vuelven a reproducir el cáncer, aunque lo eliminemos con cirugía. TEMA 13: BIOTECNOLOGÍA 1. CONCEPTOS BÁSICOS - Biotecnología: procesos tecnológicos que utilizan seres vivos y que implican la manipulación deliberada del material genético, para mejorar el rendimiento de esos seres vivos o bien obtener nuevos productos de ellos. Plásmidos: son pequeños ADN circulares de las bacterias, que no contienen información vital para su funcionamiento. Suelen contener información sobre defensa contra antibióticos. Células madre: son las células del organismo que conservan su capacidad de división indefinida y al mismo tiempo sus descendientes tienen cierta capacidad de diferenciación hasta convertirse en tejidos concretos. A la capacidad de diferenciación y división hasta formar un individuo completo le llamamos totipotencia. CÉLULAS TIPOS Zigoto POTENCIA Totipotente Todas las células del DA LUGAR A: feto y la placenta MADRE Célula Madre embrionaria (del blastocisto) Pluripotente Cualquier célula, pero no puede dividirse hasta formar un individuo completo DIFERENCIADAS Presentan identidad fija Célula madre adulta o histoespecífica Multipotente Ninguna Puede diferenciarse Células iguales en células de una ella familia de tejidos (célula progenitora) que no se dividen indefinidamente Cuando una célula madre adulta se divide, da lugar a una célula madre idéntica y a una célula progenitora. Esta última se diferencia pero no se va a poder dividir indefinidamente. 2. PROCESOS: TÉCNICAS DE INGENIERÍA GENÉTICA Y CELULAR 2.1. Tecnología del ADN recombinante El ADN recombinante es cualquier ADN formado por la unión de fragmentos de origen diferente. Para poder fabricar estas moléculas de ADN son necesarias a técnicas que nos permitan seleccionar, cortar, pegar, reproducir y secuenciar fragmentos de ADN. Las herramientas básicas son: - Endonucleasas de restricción: son enzimas específicas de cada tipo de bacteria cuya función consiste en cortar moléculas de ADN por puntos específicos determinados por la presencia de secuencias típicas. Su función en las bacterias es cortar el ADN vírico cuando se produce una infección. Se conocen más de cien. Las secuencias por las que cortan son secuencias palindrómicas y tras el corte los extremos que quedan pueden volver a unirse (extremos pegajosos o cohesivos) Ej.: ECOR1 es la endonucleasa de restricción de la bacteria E. coli y corta por secuencias AATT. - Ligasas: son enzimas que unen los extremos de los fragmentos de ADN creando enlaces fosfodiéster en los puntos de unión. 2.2. PCR Se denomina “reacción en cadena de la polimerasa” y utiliza polimerasas de bacterias extremófilas que viven en manantiales de altas temperaturas. La técnica se utiliza para obtener una gran cantidad de copias de ADN a partir de unas pocas moléculas. Así cuando hay restos biológicos, por mínimos que sean, podemos extraer ADN de los núcleos celulares y amplificarlo, haciendo muchas copias, de forma que tengamos una cantidad suficiente para estudiarlo. El procedimiento consiste en echar en un tubo de ensayo: el ADN de la muestra, las polimerasas, nucleótidos y cebadores. Tras esto calentamos y enfriamos en ciclos, de forma que al calentar se desnaturalice el ADN, es decir, se separen las hebras, y al comenzar a enfriarse actúen las polimerasas, duplicando el material genético 2.3.Electroforesis en gel Procedimiento que sirve para separar fragmentos de ADN de diversa longitud. Se basa en la capacidad de los fragmentos de ADN para migrar en un gel de agarosa sometido a un campo eléctrico. Los fragmentos de ADN son ligeramente negativos y tienden a migrar hacia el polo positivo. Los más pequeños avanzarán más a través del gel que los más grandes, por lo que obtendremos una columna formada por barras transversales, cada una estará constituida por fragmentos de la misma longitud. (algo similar a un código de barras). Huella génica: como hay fragmentos del ADN que sólo se diferencian de unos individuos a otros en el número de repeticiones de determinadas secuencias fijas (VNTR: repeticiones en tandem en número variable, o microsatélites, como CAGCAGCAGCAGCAGCAG…, que se repiten a veces cientos de veces), podemos comparar muestras de esas zonas en diversos individuos para ver coincidencias 2.4. Clonación del ADN Clonar el ADN significa realizar muchas copias de un fragmento de ADN. Pero el esquema completo de esta técnica consiste en: 1. Seleccionar bacterias con plásmidos de defensa contra un antibiótico concreto haciéndolas vivir en un cultivo con ese antibiótico. 2. Romper sus membranas y centrifugar para extraer los plásmidos; después cortarlos con endonucleasas de restricción. 3. Juntar los plásmidos cortados con las copias de fragmentos de ADN a clonar. Añadimos ligasas y así obtendremos plásmidos recombinantes 4. Introducimos los plásmidos obtenidos en bacterias (transformación) y después seleccionamos las que tienen el plásmido echándolas en un cultivo con el antibiótico. Por este procedimiento podemos obtener bibliotecas de ADN si juntamos muchos plásmidos con todos los fragmentos obtenidos del corte con endonucleasas de restricción del ADN de una célula. Los plásmidos son utilizados como “vectores de expresión” (contenedores adecuados para introducir el gen en otra célula y que se exprese) pero hay otros que son virus o combinaciones de ADN de virus y plásmidos (cósmidos). 3. APLICACIONES 3.1. Producción de proteínas Se realiza mediante la utilización de bacterias transgénicas, a las que se les ha introducido un plásmido con el gen que nos interesa. También se puede hacer con levaduras, que tienen la maquinaria propia de eucariotas. De esta forma se producen hormonas del crecimiento, interferón, insulina o antígenos para la fabricación de vacunas. 3.2. OGM’s En animales se insertan genes en el cromosoma que regula la producción de proteínas de la leche, para que produzcan leche con diversos fármacos. Otra práctica típica es la creación de animales “knockout”: se trata de animales experimentales con un alelo mutante no funcional que inactiva ese gen. De esta manera se puede estudiar el papel de un gen en el organismo. Cuando la modificación genética afecta a todas las células del animal, hablamos de animal transgénico, si sólo afecta a algunas células lo llamamos quimera transgénica. En plantas se ha desarrollado mucho más la creación y comercialización de productos obtenidos con plantas transgénicas. El vector que se utiliza es Agrobacterium, una bacteria capaz de transferir plásmidos con genes a eucariotas de forma natural. De esta forma se han creado: - Plantas con insecticida Bt (obtenido con un gen de Bacilus thuringensis) como maíz o soja - Patatas con amilopectina sólo (sin amilosa), lo que les hace más resistentes - Plantas con resistencia a herbicidas (soja, maíz) - Arroz con vit-A. 3.3.Terapia génica Consiste en transferir genes o modificar su expresión usando vectores. Se puede hacer - In vivo: inyección de genes o de vectores. - Ex vivo: extracción de células de un tejido, inserción de un gen mediante el vector y posterior reimplantación de las células transgénicas en el tejido. 3.4. Terapia celular Consiste en introducir células madre modificadas genéticamente. El procedimiento consiste en: 1. Se extrae un núcleo de una célula del paciente 2. Se inyecta en un óvulo enucleado 3. El “zigoto” así formado forma un blastocisto 4. Cualquier célula del blastocisto se utilizará para generar un tejido para autotransplante. En un primer momento se investigó con la clonación de células embrionarias del blastocisto. En la actualidad también se investiga en la creación de CMPI (células madre Pluripotentes inducidas). Estas células se obtienen a partir de células diferenciadas de la piel, que se reprograman añadiéndole los 4 genes que las diferencian de las células madre pluripotenciales y, en última instancia, también se obtienen añadiéndoles las 4 proteínas que codifican esos genes. De esta forma se intentan evitar los problemas éticos que pueda suscitar la investigación con células embrionarias. 4. IMPLICACIONES ÉTICAS, ECOLÓGICAS Y ECONÓMICAS La ingeniería genética ha despertado múltiples interrogantes. Algunos de ellos ya se han contestado, pero hay otros en los que todavía hay muchos puntos de vista y un gran desacuerdo. 4.1. Implicaciones éticas: debemos contestar a preguntas como: - ¿Es lícita cualquier manipulación? (Ej. Gallinas sin plumas, peces fluorescentes, mascotas a la carta, etc.) - ¿Quién tiene derecho a conocer nuestro ADN? (El Estado, las compañías de seguros, otros particulares, etc. ) - ¿Los consumidores tienen derecho a saber si los alimentos que ingieren contienen transgénicos? 4.2. Implicaciones ecológicas - Difusión de genes a especies silvestres a través del polen - Paso de insecticidas a las cadenas tróficas - Contaminación de las capas freáticas por herbicidas asociados a plantas resistentes genéticamente. - Microorganismos capaces de metabolizar contaminantes 4.3. Implicaciones económicas - Introducción de genes que ahorran abonos (genes nif), insecticidas (genes bt), herbicidas, etc. - Dependencia de las semillas de multinacionales por la introducción de “genes terminator” en las especies comerciales.