ntroducci n a la gen mica de animales dom sticos

FACULTAD DE AGRONOMÍA
UNIDAD DE ENSEÑANZA
UNIDAD DE POSGRADOS Y EDUCACIÓN PERMANENTE
FORMULARIO DE PROPUESTA DE ASIGNATURAS
(curso, seminario, taller, otros)
1. Datos generales de la asignatura
Nombre de la asignatura
Introducción a la genómica de animales domésticos
Abreviación para Bedelía (41
caracteres como máximo)
Genómica de animales domésticos
Nombre de la asignatura en
Inglés
Introduction to genomics of domestic animals
Pregrado
Tec. Agroenergético
Tec. Cárnico
Lic. en Diseño de Paisaje
Grado
Ingeniero Agrónomo
Educación
Permanente
Cupos
Carreras
(Marque las que corresponda)
Nivel
x
Mínimo Máximo
Tec. de la Madera
Lic. en Viticultura y Enología
Ingeniero de Alimentos
Marque si este curso es ofrecido exclusivamente como EP
Diploma y Maestría en Agronomía
Posgrados
Profesionales
Diploma y Maestría en Desarrollo Rural
Sustentable
Académicos
Maestría en Ciencias Agrarias
x
CUPO TOTAL
Modalidad
de
dictado
de
la
asignatura:
(Marque con X lo que corresponda)
A distancia
Presencial
2. Equipo docente
Docente responsable
Nombre (incluir el título académico):
Cargo
(especificar
grado
dedicación horaria global):
Dr. Hugo Naya
docente, Grado 4
Otros Docentes participantes
Nombre (incluir el título académico):
Cargo
(especificar
grado
dedicación horaria global):
Institución y país:
Ing. Agr. Nicolás Frioni
docente, Grado 1 – 20hs
Facultad de Agronomía - Uruguay
x
Nombre (incluir el título académico):
Cargo
(especificar
grado
dedicación horaria global):
docente,
Institución y país:
Nombre (incluir el título académico):
Cargo
(especificar
grado
dedicación horaria global):
docente,
Institución y país:
Docentes colaboradores:
Nombre (incluir el título académico):
Cargo
(especificar
grado
dedicación horaria global):
docente,
Institución y país:
3. Programa de la asignatura
Objetivos
Generales
Específicos


Brindar un acercamiento sobre el uso y aplicación de herramientas de genómica
sobre el área de producción animal.
Realizar técnicas básicas de análisis.




Generar capacidades prácticas sobre sets de datos reales.
Repasar conceptos previos de biología molecular y genómica animal.
Explorar y utilizar bases de datos biológicas.
Alinear secuencias y técnicas de análisis de biomoléculas.
Unidades Temáticas
 Introducción al Linux y R.
 Conceptos básicos de biología molecular, genética y evolución. Conceptos básicos de
genómica, en especial animal (genoma, exoma, transcriptoma, exones e intrones, regiones
reguladoras, microRNAs, etc.)
 Bases de datos biológicas (NCBI, UniProt, ENSEMBL BioMART, etc)
 Alineamiento de secuencias (ADN y proteínas). Alineamiento de dos secuencias,
alineamiento múltiple, algoritmos exactos y heurísticos. Matrices de score. BLAST y
búsqueda de homología por similaridad.
 Análisis composicional y comparativo (aminoácidos, codones y nucleótidos), análisis de
correspondencia, estadísticos.
 Tecnologías de secuenciado masivo y sus aplicaciones. Análisis de calidad de secuencias,
ensamblado, mapeo, “variant calling”. Introducción a la transcriptómica.
 Genómica de poblaciones y sus aplicaciones en animales domésticos. Aplicaciones de
genómica a la genética cuantitativa.
Metodología
 Carga horaria: 40 hs presenciales (2 clases de 4 horas por semana) + 20 horas de trabajos
domiciliarios.
 Modalidad: Teórico/Práctico. Lectura de artículos y materiales complementarios, con

trabajos domiciliarios.
Evaluación: Cuestionarios, Presentación de artículos y Trabajo final
Evaluación
Pregrado/
Grado
Sistema de prueba de evaluación
Evaluación continua
Pruebas parciales
Pruebas parciales y Seminario
trabajo
Monografía
Revisión bibliográfica
Trabajos prácticos
Exoneración (*)
Otros (especificar):
Posgrado y
Educación
Permanente
(*)Reglamento del Plan de Estudio de Ingeniero Agrónomo. Artículo Nº15, literal B "...al menos el 80% del puntaje exigido ...y
más el 50% del puntaje de cada prueba de evaluación...".
Bibliografía
1) Introduction to Genomics [2012] Arthur M. Lesk
2) Primer to Analysis of Genomic Data Using R (Use R!) [2015] Cedric Gondro
3) Equine Genomics [2013] Bhanu P. Chowdhary
Frecuencia con que se ofrece la asignatura
(anual, cada dos años, a demanda)
Cada dos años.
Cronograma de la asignatura
Año:
2015
Semestre:
Fecha de inicio
Martes
4/8
Fecha de finalización
Localidad:
Sayago
Bimestre
Jueves 3/9
Días y Horarios
Salón:
A definir
martes y jueves de
8:00 a 12:00
Asignatura presencial - Carga horaria (hs. demandada al estudiante)
Exposiciones Teóricas
Talleres
Actividades Grupales o
individuales de preparación
de informes
Otras (indicar cual/es)
Total
20
Teórico - Prácticos
Seminarios
Presentaciones orales,
defensas de informes
o evaluaciones
20
10
Prácticos (campo o laboratorio)
Excursiones
Lectura o trabajo domiciliario
60
Asignatura a distancia (indique recurso a utilizar)
Video-conferencia:
Localidad emisora
Localidad receptora
10
Plataforma Educativa (AGROS u otra)
Materiales escritos
Internet
Total de horas (equivalente a presencial): 40
Interservicio (indique cuál/es)
Otros datos de interés:
POR FAVOR NO COMPLETE LA SIGUIENTE INFORMACIÓN, la misma será completada por
las Unidades Técnicas (UE / UPEP / Bedelía)
Créditos de Grado:
Código
Grado:
de
la
asignatura
Resolución del Consejo
cursos de Grado Nº:
Año que entra en vigencia:
Departamento o Unidad:
Créditos de Posgrados:
de
para
Código de la asignatura de Posgrado:
Resolución del CAP para cursos de
Posgrados: