PROYECTO DIUBB 081415 3/I TITULO:

PROYECTO DIUBB 081415 3/I
TITULO:
EVALUACIÓN DE CARACTERÍSTICAS ENERGÉTICAS Y ELABORACIÓN DE INTERFAZ WEB QUE
PERMITA UNA IDENTIFICACIÓN ENTRE ZONAS DE INTERACCIÓN PROTEÍNA-PROTEÍNA
TRANSITORIAS Y PERMANENTES.
Investigador Principal
Tatiana Gutiérrez B.
Facultad
Ciencias Empresariales
Departamento
Sistemas de Información
E-Mail
[email protected]
OBJETIVOS:
Obtener de manera automática una clasificación de los complejos de proteína-proteína. En base a resultados
obtenidos en trabajos anteriores.
Desarrollar una interfaz web que pueda contener los algoritmos creados, para tener acceso público al método
de clasificación de interacciones transitorias y permanentes.
RESUMEN
La mayoría de los procesos biológicos dependen de interacciones entre proteínas, sean estas permanentes o
de corta duración. Las interacciones entre proteínas han sido extensamente estudiadas pero aún no es
posible predecir exitosamente las posibles zonas de interacción de una proteína con otra, asimismo no es
posible predecir la estabilidad de la interacción. En estudio previo se evaluó métodos para identificar
características de interfaces de interacción proteína-proteína, que permitan diferenciar entre interacciones
transitorias y permanentes. Se identifican la contribución energética de cada complejo, utilizando la aplicación
Fastcontact, con una posterior selección de características, para evaluar la posibilidad de separación de las
clases a través de un ranking de las más influyentes en la interacción. Se estudió la precisión de la
clasificación, con los métodos de Loog-Duin, Rueda-Herrera, clasificador Bayesiano, y máquina de soporte
de vectores. Estos resultados obtuvieron una alta precisión en la separabilidad de las clases. Con esto se
quiere obtener de manera detallada aquellas energías relevantes para la clasificación de las clases, como son
las cadenas que conforman al complejo y los aminoácidos que las componen. Para esto se debe hacer uso
nuevamente del aplicación Fastcontact la cual entrega los detalles energéticos de un complejo y luego este
será procesado por los algoritmos, basados en las características identificadas en la investigación anterior
[Gutierrez2007] y situados en una página web que permita a cualquier usuario identificar si su complejo es
transitorio o permanente.