PROGRAMA DE BIOLOGIA MOLECULAR – Segundo SEMESTRE 2023
Semana
Fecha
18 Julio
19 Julio
1
20 julio
(festivo)
Según grupo
2
25 Julio
26 Julio
27 Julio
Día
M
Mi
J
1 Agosto
2 Agosto
3 Agosto
4
P
J
T
5
M
Mi
J
9 Agosto
Mi
17 Agosto
6
L2 + E1
M
según grupo
15 Agosto
16 Agosto
22 Agosto
23 Agosto
24 Agosto
T
M
Mi
8 Agosto
10 Agosto
P
L1
Según grupo
3
Plenaria
Taller
J
M
Mi
P
T
P
Contenido
Profesor
Introducción - DNA como material genético - Estructura y propiedades de los
ácidos nucleicos.
Fabio
Prelecturas Karp. Capítulo 10.5 + vías experimentales; Watson: Parte 1. Capítulo 2; Parte 2 .
Capítulo 4.
T1: Flujo de la información genética - Estructura y propiedades de los ácidos
nucleicos. Taller autónomo a realizar y traer resuelto el 27 de julio
Laboratorio 1: Cálculos de conversión de unidades, diluciones y
concentraciones.
ADN en su contexto celular. Organización del genoma. Estructura básica del
gen. Watson: Parte 3. Capítulo 8 p. 199-208.
T2: Organización del genoma. Cromosomas y cromatina. Estructura básica
del gen. Dogma central
Laboratorio 2: Manejo de micropipetas – Evaluación 1 Lab: cálculos
Replicación del DNA / Lesiones & Reparación de ADN
Prelecturas: Karp: Capítulo 13. Watson: Parte 3. Aparte final “Terminación de la replicación” del
capítulo 8 y Capítulo 9.
T3: Replicación del DNA
Técnicas de estudio del Ácidos Nucleicos (Blottings, PCR , qPCR)
Prelecturas: Karp: capítulo 18.13. Dale J. “From Genes to Genomes”- 3rd edition (WilleyBlackwell): capítulo 4: PCR
T +Q
Quiz 1: Replicación - T4: PCR y variantes
L3
Laboratorio 3: Extracción de ADN de soya
Recombinación de DNA & Transferencia horizontal de material genético
P
Prelecturas: Artículo “Bacterial Gene Swapping in Nature”. Miller R.V. Curtis H. Biología (7ª
edición): sección 3 capítulo 13
Fabio & Ziv
Fabio &
Claudia
Fabio
Fabio y
Claudia
Fabio /Ziv
Claudia
Claudia y
Pilar
Ziv
Claudia y
Ziv
Pilar
Mayra
J
T
T5: Transposición Recombinación y Transferencia Horizontal de ADN
Mayra, Ziv
& Johana
Ma
Mi
P
Integración de conceptos: ADN, estructura del gen – mantenimiento
integridad de la información & recombinación – técnicas de estudios del ADN
Johana
J
T
PRIMER PARCIAL
Fabio,
Claudia, Ziv
& Mayra
Según grupo
7
29 Agosto
30 Agosto
31 Agosto
8
Según grupo
5 Septiembre
6 Septiembre
7 Septiembre
Según grupo
9
10
19 Septiem.
20 Septiem.
21 Septiem.
Según grupo
26 Septiem.
27 Septiem.
28 Septiem.
11
12
13
L4
M
Mi
J
P
T
P
J
T
T8: Traducción y código genético – ORF - Mutaciones y efectos en proteína
L7
Laboratorio 7: Análisis de una secuencia de un operón
Modificaciones postraduccionales - Electroforesis de proteínas & Western
Blot
M
Mi
P
J
Johana
Johana y
Pilar
todos
Javier
Johana
T
SEGUNDO PARCIAL EN HORARIO DE TALLER
M
19 Octubre
Javier
Integración conceptos: Dogma central – Mutaciones
10 Octubre
11 Octubre
Mi
Pilar &
Wilson
P
J
M
Pilar
Javier y
Claudia
M
Mi
J
Pilar y
Mayra
Wilson
Quiz 3: Traducción /mutaciones - T9: Modificaciones postraduccionales Western blot
3 Octubre
4 Octubre
5 Octubre
Mi
Pilar
Prelecturas: Alberts. Biología Molecular de la célula. Capítulo 12.
T+Q
17 Octubre
18 Octubre
Prelecturas: Watson: Parte 4 capítulo 14 “ Ayuste del RNA”
T +Q
J
12 Octubre
T6: Estructura gen procariota & eucariota - Unidad transcripcional - Promotor
y Terminador– Mutaciones promotor -EMSA
Laboratorio 5: PCR: detección presencia de soya en alimentos –
Transcripción II & Maduración RNA - Northern Blot y RT-PCR
Quiz 2: Transcripción – T7: Transcripción y maduración del ARN- Northern
Blot & RT-PCR
11 al 15 de Septiembre: XVII Congreso de Investigación Javeriano
Laboratorio 6: Electroforesis PCR. Evaluación 2 Lab: Extracción ADN,
L6+E
Electroforesis & PCR
M
Traducción & código genético –Mutaciones & impacto en el fenotipo
P
Prelecturas: Karp capítulo 11.8 - Artículo “The price of silent mutations”
Mi
J
Johana
Prelecturas: Watson: Parte 4, capítulo 13 “ Mecanismos de transcripción”
L5
M
Mi
Laboratorio 4: Electroforesis de ADN
Transcripción I: estructura gen procariota y eucariota / Mecanismos de
transcripción
P
T
P
T
Regulación de la expresión génica I
Pilar Javier
& Johana
Wilson
Prelecturas:
Watson: Parte 5, capítulo 18 “Regulación génica en los procariotes”
T10: Regulación de la expresión génica I
Regulación de la expresión génica II.
Prelecturas: Watson: Parte 5 capítulo 19 “Regulación génica en los eucariontes” – Karp:
Capítulo 11.5 “RNA reguladores pequeños y vías de desactivación de RNA”
T11: Regulación de la expresión génica II
Ziv y
Wilson
Wilson
Wilson &
Claudia
Según grupo
14
24 Octubre
25 Octubre
26 Octubre
Laboratorio 8: Transformación & clonación
M
Mi
P
DNA recombinante & ingeniería genética
Prelecturas: Karp: capítulos 18.12, 18.15 y 18.16
Fabio
J
T+Q
Q4: Regulación - T12: DNA recombinante & Ingeniería genética
Pilar &
Fabio
L9+E
Laboratorio 9: Evaluación 3 Lab: transformación & clonación Resultados Blue/White Screening - Ejercicio screening DNA
recombinante
todos
Introducción a las ómicas - Secuenciación & genómica
Prelectura: Artículo “Genomes for all”.
Ziv
Según grupo
15
31 Octubre
1 Noviembre
2 Noviembre
16
17
7 Noviembre
8 Noviembre
9 Noviembre
16
Noviembre
Claudia
& Wilson
L8
M
P
Mi
T13: Secuenciación de ADN y Genómica /genotecas.
José y
Wilson
J
T
M
Mi
P
Genómica funcional: transcriptómica & proteómica
Prelectura: Artículo Proyecto Encode3
Wilson
J
T
T14: Transcriptómica & Proteómica
Javier y
Wilson
J
E
EXAMEN FINAL EN HORARIO DE TALLER
Ziv , Fabio
y Wilson
P: clases presenciales magistrales en plenaria – Auditorio Principal 54-400 - Edificio Jesús Emilio Ramírez
Corresponde a una clase magistral de 1 h a la semana con el tema principal a trabajar esa misma semana en taller. La misma clase
magistral se dictará en dos días diferentes según número de clase de teoría inscrito:
Martes 12m-1pm: Número de clase 3703
Miércoles 8-9 am: Número de clase 3688
T: Talleres presenciales en grupo según horario y con su respectivo tutor: jueves 11-1pm o 2-4 pm (todas las semanas).
L: Laboratorios presenciales - Salones de prácticas de docencia Edificio 50 o 51. Sólo en 9 semanas específicas (ver programa)
según horario y con su respectivo tutor: lunes 9-11am, miércoles 1-3pm, miércoles 4-6 pm o viernes 1-3 pm.
Lecturas / Prelecturas: Consisten en lecturas seleccionadas (capítulos de libros o artículos) relacionadas con las clases magistrales o
talleres. Estas lecturas previas se deben realizar antes de cada taller de los días jueves. Son un importante complemento de la clase
magistral.
Talleres:
Consisten en espacios de consolidación de conceptos y profundización en donde se privilegiará el trabajo autónomo y en grupo, la
discusión y la participación activa para desarrollar habilidades analíticas, propositivas e interpretativas en torno a la realización de ejercicios
y problemas de biología molecular.
A cada taller se debe llegar habiendo leído las lecturas recomendadas de la semana, y habiendo realizado todos los ejercicios cortos del
“pretaller” y repasado el glosario.
En 4 semanas definidas (ver programa), se realizarán evaluaciones de tipo quiz al inicio del taller y sobre los temas especificados, para un
total de 4 notas de taller (Q1 a Q4)
Laboratorios:
Consisten en un total de 9 prácticas de laboratorio repartidas a lo largo del semestre.
Todos los laboratorios son de asistencia obligatoria y concentrarán las evaluaciones de laboratorio asociadas.
Será indispensable haber leído y entendido la guía, y haber realizado el prelaboratorio respectivo según el caso, antes de cada práctica. Se
entregará al tutor un diagrama de flujo resumido de las actividades que se realizarán y identificando el objetivo de cada laboratorio.
Se realizarán evaluaciones de las prácticas de laboratorio (fundamentos, procedimientos, cálculos, resultados o análisis) en las fechas
definidas en el programa para un total de 3 notas de laboratorio (ver programa). Algunas prácticas están relacionadas entre sí, por lo que las
evaluaciones podrán estar asociadas a más de una práctica.
Nota: Para asistir a las prácticas de laboratorio, será obligatorio el uso de bata antifluido, gafas de seguridad y guantes nuevos
desechables.
Adicionalmente se solicita respetar la puntualidad al ingresar a la práctica, así como normas adicionales de bioseguridad dentro de
un laboratorio de prácticas en ciencias biológicas: por ejemplo, evite exponer celular/tabletas o pertenencias a agentes de riesgo
químico o biológico durante la realización de la práctica. Recuerde obedecer siempre a su sentido común.
Exámenes escritos (parciales y examen final): se presentarán presencialmente en los espacios de taller, en forma individual y en fecha y
horario predefinido (ver programa).
Constarán de preguntas de selección múltiple, verdadero/falso, correspondencias, o abiertas, relacionadas con cualquiera de los temas del
periodo evaluado, así como de ejercicios - problemas analíticos similares a los trabajados en taller.
Ponderación de las distintas calificaciones (asistencia obligatoria):
- Exámenes escritos: 65% repartidos de la siguiente manera: Parcial 1: 20%, Parcial 2: 20% y Examen final: 25%
- Quices de taller: 4 quices, 20% - Quices de Laboratorios:
3 evaluaciones, 15%.
0
