GUÍA PARA LAS PRÁCTICAS DE LABORATORIO, TALLER
O CAMPO
Fecha:
10-01-2025
DEPARTAMENTO:
ELÉCTRICA Y ELECTRÓNICA
CARRERA:
ELECTRÓNICA Y AUTOMATIZACIÓN
ASIGNATURA:
Química
PERÍODO:
0CTUBRE 2024 –
MARZO 2025
NIVEL:
DOCENTE:
Ing. Fabián Santana, PhD.
NRC:
2244
PRÁCTICA N°:
LABORATORIO DONDE SE DESARROLLARÁ LA PRÁCTICA
1
Práctica virtual
TEMA DE LA
Aplicación química computacional
PRÁCTICA:
INTEGRANTES:
• Diego Vargas
• Daniel Troya
• Puga Erick
• Alexis Tixe
• Cristian Calapiña
• Michael Muzo
• Jonathan Llugsa
NÚMERO DE
HORAS:
INTRODUCCIÓN:
La visualización de moléculas es esencial en química computacional para analizar estructuras tridimensionales y comportamient os dinámicos.
Software como VMD y Chimera facilita el estudio de sistemas moleculares complejos.
VMD destaca por su capacidad para manejar grandes conjuntos de datos de simulaciones de dinámica molecular y su compatibilidad con
diversos formatos de archivos. Chimera ofrece herramientas para visualización, manipulación de estructuras y análisis cuantit ativos, con una
interfaz intuitiva y extensible.
Este informe explora las funcionalidades, ventajas, y aplicaciones de VMD y Chimera en la investigación molecular.
EQUIPOS:
• Laptop
• Software VMD
• Software Chimera
• Pagina web www.rcsb.org
REACTIVOS:
Dejar en blanco si NO aplica
PRECAUCIONES / INSTRUCCIONES:
1.
2.
3.
4.
MATERIALES E INSUMOS:
Dejar en blanco si NO aplica
MUESTRA / OTROS:
Dejar en blanco si NO aplica
Instalación: Descargue desde sitios oficiales.
Requisitos: Verifique los requisitos del sistema.
Datos: Use formatos compatibles y revise la integridad de los datos.
Uso: Consulte tutoriales y documentación.
ACTIVIDADES POR DESARROLLAR:
1.
Visualización en el programa de Chimera
Código de documento: SEDE-SL-GUI-V1-2023-010
Código de proceso: DOC.2.4.3
Rev. UPDI: 2023-may-04
GUÍA PARA LAS PRÁCTICAS DE LABORATORIO, TALLER
O CAMPO
Fecha:
•
2W26
•
2P16
•
4BTT
•
4BTU
Código de documento: SEDE-SL-GUI-V1-2023-010
Código de proceso: DOC.2.4.3
10-01-2025
Rev. UPDI: 2023-may-04
GUÍA PARA LAS PRÁCTICAS DE LABORATORIO, TALLER
O CAMPO
Fecha:
•
4BTI
2.
•
Visualización en el programa de VMD
2W26
Código de documento: SEDE-SL-GUI-V1-2023-010
Código de proceso: DOC.2.4.3
10-01-2025
Rev. UPDI: 2023-may-04
GUÍA PARA LAS PRÁCTICAS DE LABORATORIO, TALLER
O CAMPO
Fecha:
•
2P16
•
4BTT
•
4BTU
Código de documento: SEDE-SL-GUI-V1-2023-010
Código de proceso: DOC.2.4.3
10-01-2025
Rev. UPDI: 2023-may-04
GUÍA PARA LAS PRÁCTICAS DE LABORATORIO, TALLER
O CAMPO
Fecha:
•
10-01-2025
4BTI
RESULTADOS OBTENIDOS:
El uso de VMD y Chimera permitió una visualización clara y detallada de estructuras moleculares complejas, facilitando el análisis de dinámicas
moleculares y las interacciones moleculares.
CUESTIONARIO
1. Para archivos PPD son en el software Chimera
2. Para archivos .Mol2 son del software de MVD
3. Las dos aplicaciones el cambio de fondo relativamente igual
• Display, Graphics, Colors, BackGraund.
CONCLUSIONES:
VMD y Chimera son herramientas potentes y versátiles para química computacional. Su aplicación mejora significativamente la comprensión de
estructuras moleculares y sus comportamientos.
RECOMENDACIONES:
1.
2.
Capacitación: Se recomienda la formación continua en el uso de estas herramientas para maximizar su potencial.
Actualizaciones: Mantener el software actualizado para aprovechar nuevas funcionalidades y no tener errores al momento de
renderizar
A. INFORMACIÓN DE LA GUÍA
Código de documento: SEDE-SL-GUI-V1-2023-010
Código de proceso: DOC.2.4.3
Rev. UPDI: 2023-may-04
0
