BQTA: VII RESUMEN DEL VIDEO DE LA BIOINFORMÁTICA. En este último apartado sobre bioinformática vamos a tratar de enumerar distintas tareas que son objetivos de la bioinformática y las herramientas informáticas que ofrece en el ámbito de la información genética la bioinformática ofrece herramientas como las que se muestran en la tabla de la imagen y que describo a continuación cuando se dispone de los siguientes datos brutos de secuencias la bioinformática se encarga de su organización almacenamiento y procesamiento con seguridad y confidencialidad con los datos procedentes de secuenciación de proteínas se desarrollan aplicaciones para la localización de determinados patrones o motivos dentro de la secuencia y algoritmos de alineación de secuencias de proteínas la alineación consiste en la comparación de dos o más secuencias de material genético para identificar sus zonas de similitud que podrían poner de manifiesto las relaciones funcionales entre las proteínas en análisis con los datos disponibles sobre estructuras moleculares se efectúan tareas como las siguientes predicción de la estructura de proteínas consiste en a partir del conocimiento en una determinada proteína de la secuencia de sus aminoácidos es decir de su estructura primaria obtener o calcular su estructura secundaria es decir su organización espacial y su estructura terciaria es decir la organización plegada y completa en tres dimensiones en la mayoría de las proteínas esta estructura terciaria determina su función este es uno de los retos más importantes de la bioinformática ya que a partir de este conocimiento se hace posible el diseño de nuevos medicamentos algoritmos de alineación estructural de proteínas es un tipo de alineamiento. La secuencias basado en la comparación de la forma física y disposición tridimensional entre macromoléculas pretende establecer equivalencias entre distintas proteínas lo cual puede facilitar el conocimiento de su funcionalidad otras aplicaciones que se desarrollan tratan de las medidas de la geometría de proteínas y de cálculos superficiales y de volumen de las formas también dentro de los estudios de las estructuras moleculares tienen una gran relevancia las interacciones proteínas se analiza la asociación de proteínas desde el punto de vista de la bioquímica estas interacciones proteína intervienen por ejemplo en la entrada en el interior de las células de señales externas lo que se denomina transducción de señales este proceso juega un papel trascendental en muy diversos fenómenos biológicos y enfermedades como por ejemplo el cáncer además es un interés efectuar simulaciones moleculares que tienen en cuenta los campos de fuerzas los movimientos moleculares y las posibilidades de acoplamiento con datos genómicos se han desarrollado aplicaciones o algoritmos relacionados con alineación de secuencias genéticas se trata de comparar dos o más secuencias de material genético para identificar sus zonas de similitud que podrían poner de manifiesto las relaciones funcionales o evolutivas entre los genes en comparación se pueden comparar genes de seres de la misma o de distinta especie predicción de genes también denominada anotación del genoma o del ADN es el proceso de identificar por medio de algoritmos tramos de material genético que corresponden a una función biológica determinada identificación de zona que corresponden a un gen que codifica una proteína por ejemplo la identificación se suele realizar con ayuda de una biblioteca o base de datos que podríamos denominar gen o teca en ellas se guarda la información específica de genes conocidos cuando se desea obtener la información de un gen desconocido se compara la secuencia de sus bases con la de los genes de la genética pudiendo de esta manera identificar a cuál corresponde montaje o ensamblado del genoma el producto del proceso de secuenciación de un genoma genera archivos que contienen información de millones de fragmentos de secuencias de ADN. FRAGMENTOS DE SECUENCIAS DE ADN. El sembrado consiste en la ordenación y acomodación de dichos fragmentos para obtener una secuencia que represente un genoma completa análisis filogenético el objetivo es asociar alelos con características filo génicas del organismo es a escala genómica pretende la caracterización del contenido en proteínas y rutas metabólicas facilitando con ello el descubrimiento y análisis de la conexión de genes específicos con enfermedades estos censos una vez depurados pasan a formar parte de las genéticas un apartado muy relevante es el de la predicción de la expresión génica se refiere como hemos visto en el apartado anterior a este al descubrimiento del proceso mediante el cual la información codificada en un gen determina el montaje de una molécula de proteína incluye tanto la determinación de patrones de expresión de correlación como la asignación de datos de expresión a datos secuenciales estructurales y bioquímicos otra información de interés fundamental y común con todas las ciencias se refiere al conocimiento de las publicaciones científicas que se obtiene a partir de bases de datos documentales creadas y soportados informáticamente este conocimiento permite estar al día en las nuevas publicaciones sobre este campo y evita la duplicidad innecesaria de esfuerzos y recursos investigando involuntariamente lo que ya está descubierto hay una gran cantidad de recursos informáticos comercializados o del iberá sexo dentro del ámbito de la bioinformática en primer lugar conviene hacer referencia a las grandes bases de datos a las que se tiene acceso a través de internet como ejemplo en las tablas que se muestran en la imagen se incluye una lista de las bases de datos más conocidas sobre procesamiento de secuencias de ADN o ARN o de proteínas. Donde hemos incluido una breve descripción y el año de constitución en la tabla que se muestra ahora se incluye una lista de plataformas y herramientas software para realiza alineamiento múltiple de secuencias tanto de proteínas como de nucleótidos también existe una gran variedad de programas para la realización de análisis genómico por último mostramos aplicaciones para búsquedas e identificación de motivos más detalles sobre esas plataformas y programas incluyendo enlaces a estas herramientas pueden verse en la Wikipedia como resumen y conclusiones podemos decir que el material genético responsable de las características y propiedades vitales de los organismos vivos está constituido por ADN que es la molécula que almacena y transmite la información genética en conjunción con otro tipo de información heterogénea como la contenida en los datos obtenidos de la práctica clínica utilizando técnicas y algoritmos de procesamiento de grandes cantidades de información lo que se denomina big data como bases de datos deductivas aprendizaje en máquinas minería de datos etcétera la bioinformática pretende servir de herramienta. Para otras disciplinas como la biología medicina o la ingeniería genética en materias como por ejemplo identificación de las funciones que realiza un gen determinado obtención de medicamentos permite obtener numerosos medicamentos empleando organismos transgénicos como por ejemplo los casos de la insulina humano y los factores de coagulación terapias génicas supone el estudio de los genomas y de su aplicación en terapias médicas relacionadas con los genes se trata de una técnica en la que se inserta un gen que controla una función determinada en las células de un paciente para corregir un defecto genético o para dotar a las células de una nueva función se están aplicando para tratar distintas enfermedades. Por ejemplo el cáncer la diabetes o el parkinson desarrollo de una medicina de precisión y personalizada consiste en tener en cuenta junto con información diversa del paciente como historia clínica imágenes médicas pruebas diagnósticas y dietética sus características genéticas en el momento de hacer su diagnóstico y tratamiento hay que tener en cuenta que las principales causas de mortalidad tienen factores genéticos se han identificado unos 2000 genes responsables de enfermedades humanas aproximadamente el 10 por ciento del total, la medicina personalizada supone un cambio radical respecto al modelo tradicional de medicina global que se fundamenta en promedios y estudios estadísticos en los que se ignoran las peculiaridades individuales que hacen que la medicina sea más un arte que una ciencia debido al elevado componente empírico y a la falta de reproducibilidad de diagnósticos y tratamientos medicina forense el ADN se usa ampliamente como huella genética para identificar un organismo individual la identificación por adn se fundamenta en que el 99.9 por ciento de los humanos somos genéticamente idénticos diferenciando no sólo en el 0 1% encontrándose las diferencias en regiones cromosómicas concretas agricultura y ganadería permite obtener plantas o animales a los que se les han realizado alguna modificación en su genoma en plantas es posible injertar genes de resistencia herbicidas o que aumentan su valor nutritivo en animales la ingeniería genética se puede aplicar para conseguir un mayor crecimiento y resistencia a condiciones ambientales o para obtener sustancias de interés farmacéutico modelado de la evolución biológica y del origen de la vida se trata de la investigación sobre los cambios a través de las generaciones del material genético y en los caracteres que determinan el fenotipo de los seres vivos y que han originado la biodiversidad en los distintos niveles conceptuales de la biología molecular organismo individual población y especie. CONCLUSIÓN: La explosión de la Bioinformática como disciplina indispensable en muchos campos como la Biomedicina, Agricultura, Alimentación, entre otros muchos, ha propiciado un gran aumento en la demanda de profesionales y ha supuesto la integración en nuevos entornos. Esto ha puesto de manifiesto la necesidad de generar vías de formación de bioinformáticos, como el nuevo grado en Bioinformática o los diferentes masters de formación de postgrado ligados a diferentes universidades tanto públicas como privadas a lo ancho del territorio nacional. BIOINFORMÁTICA 3 La bioinformática es una de las disciplinas científicas que más protagonismo y proyección están teniendo en los últimos años, algo que está siendo aún más visible este año 2020 con su labor fundamental en el manejo e interpretación de datos sobre el SARS-CoV-2. Su labor consiste en investigar, desarrollar y aplicar herramientas informáticas y computacionales para permitir y mejorar el manejo de datos biológicos, gracias al uso de herramientas que reúnen, almacenar, organizar, analizan y permiten interpretar estos datos. El ISCIII dispone de una Unidad de Bioinformática (BU-ISCIII) desde el año 2012, cuya responsable es la investigadora Isabel Cuesta y cuya labor es dar servicio a los centros y unidades del ISCIII y desarrollar proyectos propios de invetsigación. Por ejemplo, su labor en la investigación del #SARSCoV2 está siendo fundamental, facilitando cuestiones tan relevantes como la secuenciación del genoma del nuevo coronavirus y la automatización de test diagnósticos. El uso de la informática, de los lenguajes de programación y de las grandes infraestructuras computacionales son los pilares que usa la bioinformática para recopilar, manejar, almacenar y analizar los datos biológicos, desde los derivados de la secuenciación genómica, proteómica, metabolómica, hasta los datos de imagen, clínicos, epidemiológicos…, desarrollando algoritmos o modelos matemáticos para extraer el máximo conocimiento de los datos y aplicarlo directamente a la resolución de problemas biológicos o biomédicos. Además, la implicación de la bioinformática en la resolución de patologías humanas en el contexto clínico ha provocado la aparición de una nueva disciplina, la Bionformática Clínica, una especialidad multidisciplinar en la que trabajan codo con codo especialistas en biología molecular, genética, informática, matemáticas. ALUMNA: CALDERÓN LEYVA, ANGIE. Nota: Maestro en el segundo módulo yo no puede dar mi examen y lo busque en su debido momento de los cual usted me dijo que me iba a poner un 05 como nota, incluso cuando yo le seguiré que me diera el examen, bueno un grupo de alumnos y yo. Le reintegro fue en el laboratorio que le pedimos que por favor nos diera el examen ahora eso me perjudica ya que nos a puesto 00 en el casillero. Que tenga unas lindas vacaciones.