Universidad Autónoma De Baja California Facultad de ciencias químicas e ingeniería Ciclo Escolar 2023-1 Biología Molecular Profesor: Marco Antonio Ramos Ibarra Semestre : 5to Grupo:452 Resumen del Artículo 1. In Silico Structural Analysis of Serine Carboxypeptidase Nf314. Realizado por: Angeles Garcia Esmeralda Tijuana B.C., jueves 23 de febrero de 2023. Artículo 1. In Silico Structural Analysis of Serine Carboxypeptidase Nf314 por Pablo A. Madero-Ayala,Rosa E. Mares-Alejandre y Marco A. Ramos-Ibarra* Grupo de Investigación en Biotecnología y Biociencias, Facultad de Ciencias Químicas e Ingeniería, Universidad Autónoma de Baja California, Tijuana 22390, México Naegleria fowleri, es un protozoo de vida libre que prolifera en cuerpos de agua dulce, infectan a los humanos como un evento casual cuando nadan en agua contaminada. Tras la inhalación de N. fowleri invade el sistema nervioso central y causa meningoencefalitis amebiana primaria (MAP), una enfermedad rápidamente progresiva y, a menudo, fatal; sin embargo se considera una enfermedad rara, aun así la reducción de su tasa de letalidad obliga a buscar proteínas específicas de patógenos con relación a una estructura-funcion (proteína relacionada con la virulencia en las infecciones por N. fowleri, la serina carboxipeptidasa Nf314) que favorezca su aplicación como dianas para descubrir fármacos nuevos o mejorados contra las infecciones por N. fowleri, mediante herramientas bioinformáticas y experimentos de acoplamiento molecular in silico. Los hallazgos de este documento sugieren que Nf314 tiene un sitio de unión al ligando adecuado para el diseño basado en la estructura de inhibidores específicos, con una postulación de una diana terapéutica fiable para tratar la MAP con fármacos destinados a bloquear la proliferación de patógenos mediante la inhibición de la función de las proteínas. En este caso las proteínas relacionadas son las carboxipeptidasas, las cuales son enzimas que hidrolizan el enlace peptídico C-terminal de proteínas y polipéptidos, liberando residuos de aminoácidos libres. En base a los resultados obtenidos se llegó a la conclusión que los hallazgos revelaron efectivamente un sitio de unión al ligando, de forma receptor-ligando el cual interactúa con moléculas específicas, en este caso tres derivados catalíticos, tomando en cuenta el requerimiento de análisis experimentales para ratificar la estructura de esta proteína y caracterizar su actividad enzimática. Me parece interesante el enfoque computacional en el que se llega a observar estructuralmente in silico, el reconocimiento de esta proteína relacionada con la virulencia de la mano con el área farmacéutica, en el descubrimiento de que Nf314 tiene un potencial como objetivo farmacológico debido a sus ligandos que forman complejos estables con el receptor los cuales desarrollarían un bloqueo de la infección por N. fowleri y evitando la enfermedad desarrollada por este (PAM). Importancia de los estudios moleculares en el descubrimiento de agentes terapéuticos, nuevos o mejorados, para el control farmacológico de infecciones de importancia biomédica. Es de suma importancia buscar, entonces como se vio en el artículo, la extracción de proteína específicas de ciertas cepas de el objetivo a estudiar para llevar a cabo estos estudios, debido a la falta de pruebas de diagnósticos precisas, además de los esfuerzos para desarrollar terapias complementarias y alternativas, es interesante que los datos genómicos/transcriptómicos/proteómicos informan sobre las biomoléculas específicas, la relación para ser utilizadas como dianas farmacológicas. Considero de mucha importancia el uso de este tipo de métodos para los descubrimientos de fármacos, ya que como se sabe el descubrimiento de fármacos es un proceso que conlleva mucho tiempo y presupuesto. Sin embargo con este tipo de técnicas computacionales se lleva a cabo el análisis eficiente de datos, selección de moléculas para su evaluación experimental y estructural, generación de hipótesis para mejorar el entendimiento de los mecanismos de acción de fármacos y diseño de estructuras químicas. Sin embargo el desarrollo de fármacos es complejo ya que se debe iniciar con la identificación de compuestos que se unirán al blanco terapéutico como lo fue en este artículo (Nf314) o que muestran actividad biológica. Además en muchos de estos proyectos, buscan mejorar las propiedades de estos medicamentos, como el hecho de reducir efectos secundarios, aumentando la calidad de estos, fortalecer el diseño de fármacos dirigidos a múltiples dianas moleculares, incluso fortaleciendo la interacción entre disciplinas, lo cual se observa en este artículo, lo cual optimiza la búsqueda de moléculas para el tratamiento y/o prevención de enfermedades.
