UNIDAD 1 LABORATORIO DE BIOLOGÍA MOLECULAR Y CITOGENÉTICA Página 1 BIOLOGÍA MOLECULAR Y CITOGENÉTICA Unidad 1 Biología Molecular y Citogenética Contenido I. INTRODUCCIÓN ............................................................................................................. 4 II. LABORATORIO DE BIOLOGÍA MOLECULAR ................................................................... 6 1. EQUIPAMIENTO GENÉRICO ................................................................................... 6 2. EQUIPAMIENTO ESPECÍFICO PARA BIOLOGÍA MOLECULAR ................................. 8 3. ESTRUCTURA DEL LABORATORIO DE BIOLOGÍA MOLECULAR ............................ 10 4. CONDICIONES DE TRABAJO Y PREVENCIÓN DE LA CONTAMINACIÓN................ 12 5. USO EFICIENTE DE LOS RECURSOS ...................................................................... 13 III. LABORATORIO DE CITOGENÉTICA Y CULTIVOS CELULARES ...................................... 14 1. EQUIPAMIENTO ESPECÍFICO PARA CULTIVOS CELULARES.................................. 14 2. EQUIPAMIENTO ESPECÍFICO PARA CITOGENÉTICA ............................................. 16 3. ESTRUCTURA DEL LABORATORIO DE CITOGENÉTICA.......................................... 17 4. TÉCNICA ASÉPTICA............................................................................................... 17 IV. SEGURIDAD EN EL LABORATORIO ............................................................................ 18 1. SEGURIDAD QUÍMICA .......................................................................................... 19 2. BIOSEGURIDAD .................................................................................................... 20 Página 2 En este capítulo se muestra cómo debe organizarse un laboratorio de citogenética o biología molecular para tener un grado de eficiencia óptimo. También se describen a grandes rasgos las operaciones técnicas que se llevan a cabo, así como los protocolos que mantienen las condiciones recomendables de seguridad. Unidad 1 Biología Molecular y Citogenética GLOSARIO BÁSICO: Área o zona estéril: Conjunto de instalaciones libres de patógenos. Ácidos nucleicos (AN): Grandes moléculas formadas por la repetición de monómeros (nucleótidos) que cumplen la función de almacenar la información genética. Existen dos tipos básicos: ácido desoxirribonucleico (ADN) y ácido ribonucleico (ARN). Fluorescent in situ hibridation (FISH): técnica citogenética de marcado de cromosomas mediante la cual éstos se hibridan con sondas que emiten fluorescencia y permiten la visualización, distinción y estudio de cromosomas, así como de las anomalías que pueden presentar. Cultivo celular: es el proceso mediante el que células, ya sean células procariotas o eucariotas, pueden cultivarse en condiciones controladas. Estudio citogenético (cariotipo): consiste en el análisis detallado de los cromosomas que forman la dotación de diversas células que proceden de una muestra cultivada de un único individuo. Los cromosomas de una misma célula se agrupan en pares homólogos y se disponen según un orden establecido. Los distintos cromosomas se distinguen por su patrón de bandas característico. Cromosoma: estructura que condensa todo el contenido del núcleo de una célula eucariota. Está formada por la asociación de ADN y Proteínas. Organigrama: resumen o esquema de la organización de una entidad, de una empresa o de una tarea. Procedimiento normalizado de trabajo (PNT): es el protocolo técnico detallado de cada uno de los procesos que se realizan en el laboratorio. Incluye materiales, reactivos, equipos, y detalles de manipulación de las muestras. Reacción en cadena de la polimerasa (PCR): técnica de biología molecular que permite amplificar de forma exponencial pequeñas cantidades de ADN. Página 3 Unidad 1 Biología Molecular y Citogenética I. INTRODUCCIÓN La biología molecular es la parte de la biología que estudia los procesos vitales de los seres vivos en función de las características de su estructura molecular. Estudia, por tanto, la composición, la estructura y la función de las moléculas más importantes. Esta ciencia está relacionada con otras áreas de conocimiento como la Bioquímica, la Citología, o la Genética. En concreto, la biología molecular se ocupa solo de dos macromoléculas: los ácidos nucleicos y las proteínas, estando aceptado en la actualidad que la denominación de biología molecular se reserve para el estudio de ácidos nucleicos (ADN y ARN). De manera equivalente, la disciplina que estudia específicamente las proteínas es la proteómica. Por su parte, la citogenética es una disciplina derivada de la genética que estudia la función y el comportamiento de los cromosomas en la célula. La citogenética y la biología molecular son dos campos de la genética. De hecho, no existen como unidades asistenciales reguladas, y el RD 1277/2003 de 10 de octubre define la Unidad de Genética como la "unidad asistencial que, bajo la responsabilidad de un facultativo con formación adecuada, está dedicada a la realización de pruebas genéticas y emisión de dictámenes con fines diagnósticos". Por tanto, ambas unidades Página 4 (biología molecular y citogenética) quedan incluidas dentro de la UNIDAD de GENÉTICA. Unidad 1 Biología Molecular y Citogenética Cada laboratorio cuenta con un equipamiento propio, y habitualmente se diferencian áreas "sucias" y "limpias" para evitar la contaminación. Dicha contaminación suele proceder de las muestras que se procesan, de la contaminación de equipos, superficies de trabajo, pipetas, refrigeradores, guantes, gradillas, o incluso lápices marcadores… Para disminuir los riesgos, es fundamental no mezclar equipamiento, es decir, utilizar el material propio de cada área. DIRECTOR TÉCNICO También es importante el papel que cumple el personal de laboratorio. Un organigrama se estructura en niveles de creciente responsabilidad y a través de él se canaliza todo el flujo de información respecto al proceso analítico de cada una de las muestras que llega al laboratorio. DIRECTOR DE LABORATORIO Debe existir un director de laboratorio o un jefe de servicio con amplia experiencia y formación, que coordine las secciones del laboratorio, actúe de enlace con el director técnico y proporcione una atención directa a los clientes. También se encargará de la COORDINADOR DE ÁREA validación de nuevas metodologías y de supervisar las técnicas en uso. Bajo la supervisión del responsable de laboratorio es fundamental la figura del coordinador de área o jefe de sección. Cada COORDINADOR TÉCNICO coordinador controla y gestiona las técnicas y el personal asociado a cada tipo de muestra. Se encarga de analizar la recepción de muestras, los estudios que se realizan en ellas, las anomalías y la PERSONAL TÉCNICO elaboración de los informes. Finalmente, el coordinador técnico se encarga de supervisar y organizar el equipo humano que trabaja recepcionando y analizando las muestras en el laboratorio. También realiza la gestión de stock de reactivos. Este esquema suele estar presente en laboratorios con gran volumen de trabajo (grandes hospitales, por ejemplo); sin embargo, en laboratorios de pequeño o mediano tamaño, ciertas categorías pueden fusionarse. Todos los protocolos técnicos y PNT deben ser autorizados por el director y el coordinador de área correspondiente y han de ponerse en conocimiento y a disposición de todo el personal. Se Página 5 reevaluarán anualmente y los cambios que se realicen en ellos se tendrán que notificar. Unidad 1 Biología Molecular y Citogenética La selección y formación/adaptación del personal es fundamental para el correcto funcionamiento del laboratorio. Los valores a destacar serían personas metódicas, ordenadas, responsables, aptas para el trabajo en equipo y con iniciativa. Todos deben conocer perfectamente los PNT que se utilizan habitualmente. Las funciones del personal técnico serán variadas y deberán estar perfectamente definidas para evitar errores (según el área de trabajo): calibración, limpieza y mantenimiento de equipos, recepción e identificación de muestras, puesta en marcha de cultivos, inventario y control, procesado de cultivos, preparación de reactivos, almacenamiento de muestras… II. LABORATORIO DE BIOLOGÍA MOLECULAR El laboratorio de biología molecular se organiza alrededor de la técnica de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR). Esta técnica, permite obtener un gran número de copias de un fragmento de ADN (amplificación del ADN) que servirán para distintos fines: clonación, identificación de material genético, análisis funcional de genes, diagnóstico de trastornos hereditarios…La veremos con más detenimiento más adelante en la asignatura. Debido a esta técnica empleada, donde se suelen obtener un gran número de copias de un fragmento concreto de ADN partiendo de una cantidad mínima de material genético, es indispensable que el flujo de trabajo sea UNIDIRECCIONAL para evitar posibles contaminaciones. Además, como veremos más adelante, las salas de trabajo estarán separadas. De manera general, podemos encontrar en los laboratorios de biología molecular o citogenética un equipamiento genérico común con otros laboratorios, y un equipamiento específico para la realización de las técnicas exclusivas, cómo la PCR. 1. EQUIPAMIENTO GENÉRICO Algunos de los equipos genéricos pueden incluir modificaciones para ser utilizados en biología molecular, pero por regla general, se pueden encontrar similares en cualquier laboratorio: Autoclave: Aparato para esterilización de materiales por vapor (presión y temperatura elevadas). Es imprescindible para trabajar con microorganismos y en cualquier procedimiento de biología molecular (en condiciones asépticas). Casi la totalidad del material fungible del laboratorio reduciendo costes. Unidad 1 Biología Molecular y Citogenética Página 6 laboratorio puede adquirirse estéril (en bolsas cerradas), o bien esterilizarlo en el propio Baño termostático, placa calefactora o termobloque: Para biología molecular es necesario que se pueda regular con precisión 95oC -100oC para desnaturalizar ADN. Centrífuga: Equipo que aplica una gran fuerza centrífuga a la muestra acelerando el proceso de sedimentación de sus componentes como técnica de separación. El rotor de la centrífuga debe estar adecuado a los volúmenes que se manejan en biología molecular y lo habitual es que permitan centrifugar desde tubos Eppendorf (PCR: 200 μl) hasta tubos de 50 ml. Debido a las particularidades de la separación por centrifugación de los componentes celulares, las velocidades de giro deben ser muy elevadas y durante un tiempo prolongado. Esto origina calentamiento de la muestra y, por consiguiente, estos equipos deben estar refrigerados. Cabina de bioseguridad: Se utilizan cabinas verticales de flujo laminar de clase II. Su cometido es la protección de la muestra y de la persona que manipula la muestra. Como cualquier equipo de laboratorio, para asegurar su funcionamiento es necesario que tenga un mantenimiento periódico (filtros, lámpara UV, aspiración…). Espectrofotómetro: Este aparato analiza la concentración de una muestra en función de la absorción de luz en una determinada longitud de onda (absorbancia). Para proteínas y ácidos nucleicos, es preciso que abarque el rango de longitudes de onda ultravioleta y que el volumen de la cubeta de muestra sea de 1µl. Incubador: También llamado estufa. Es un equipo clásico de los laboratorios de microbiología. Para trabajar con cultivos celulares, requieren de un ambiente controlado con una humedad alta y una presión parcial de CO2 elevada. Microscopio: En biología molecular la microscopía óptica es claramente insuficiente. Por este motivo debe contar con un microscopio de fluorescencia para las técnicas de hibridación in situ fluorescente (FISH). Actualmente, estos microscopios llevan asociados sistemas de captura de imágenes para su tratamiento y archivo. Congelador: Es totalmente necesario contar con un sistema que garantice la conservación de leer las recomendaciones comerciales), mientras que las muestras deben hacerse en Unidad 1 Biología Molecular y Citogenética Página 7 reactivos, enzimas y muestras. Las enzimas se almacenan a -20o C (aunque siempre debemos ultracongeladores a -80o C (proporcionan una mayor viabilidad, por ejemplo, para muestras de ADN que deben ser conservadas durante más de veinte años por cadena de custodia). Por tanto, la temperatura de conservación varía dependiendo del tiempo que va a tardar en emplearse el reactivo o la muestra y las condiciones de laboratorio. Purificación agua: El laboratorio de biología molecular requiere un suministro permanente de agua de calidad ultrapura tipo I. El agua ultrapura tiene un nivel máximo de impureza de 1µg/l (rango de ppb) mucho menos que otros reactivos empleados. Los botes dispensadores de agua ultrapura deben rellenarse a diario y por ningún motivo deben contener otro líquido. El sistema de purificación suele ser una resina de intercambio iónico que garantiza un aporte continuo de agua a un precio bastante asequible. 2. EQUIPAMIENTO ESPECÍFICO PARA BIOLOGÍA MOLECULAR En biología molecular, el equipamiento específico permite realizar la técnica de PCR y analizar los productos obtenidos (ADN amplificado). La infraestructura principal para el análisis de ácidos nucleicos por PCR consta del termociclador, equipo de electroforesis y un visualizador de geles. Complementariamente, se pueden encontrar los extractores de ácidos nucleicos y los secuenciadores. Estos últimos son equipos automatizados que se estudian en las unidades de extracción (3) y secuenciación (8) respectivamente. Termociclador: Es el equipo en el que se lleva a cabo la técnica de la PCR. Esta técnica se basa en la sucesión de ciclos de incubación a temperaturas diferentes. Como resultado, el fragmento de ADN de estudio es copiado por la ADN polimerasa miles de veces. El termociclador se compone de un bloque de incubación termostatizado. Tiene múltiples pocillos donde se colocan los microtubos de PCR y su cometido es mantener la temperatura programada, durante cada uno de los ciclos de PCR. Esta temperatura oscila entre 4o C y 96o C. Para calentar y enfriar de manera homogénea el bloque, los termocicladores actuales se basan en el efecto Peltier. Se produce entre dos semiconductores unidos por dos soldaduras. Cuando una corriente eléctrica continua los atraviesa, uno de ellos se calienta y el otro se enfría. Si la polaridad de la corriente se invierte, se invierte el calentamiento/enfriamiento de cada semiconductor. Gracias a este efecto, los bloques pueden calentarse y enfriarse rápidamente a la temperatura programada, y de manera homogénea. tapa de los microtubos de PCR y evitar que se condense en ella el agua evaporada de la mezcla. Unidad 1 Biología Molecular y Citogenética Página 8 La tapa del bloque es otro elemento importante. Está termostatizada a 103o C para calentar la Esto supondría una alteración de la concentración de los reactivos y por tanto del desarrollo de la reacción. La PCR a tiempo real "Real-Time PCR" (no se debe confundir con la RT-PCR) consta de un tipo especial de termociclador que incorpora un sistema láser y detectores de fluorescencia. Durante el desarrollo de la reacción, el láser mide la síntesis de los productos amplificados en tiempo real. La PCR en tiempo real permite cuantificar el nivel de producto obtenido en cualquier momento de la amplificación. Esta PCR a tiempo real se conoce también como PCR cuantitativa. *La PCR en tiempo real, permite prescindir de la electroforesis necesaria para el análisis de los productos amplificados en la PCR tradicional. Equipo de electroforesis: Esta técnica de biología molecular permite separar moléculas con carga neta en función de su tamaño, su carga y su estructura tridimensional (forma). Se fundamenta en la migración que experimentan las moléculas cuando son colocadas en un campo eléctrico. Los fragmentos de ADN amplificados (producto de la PCR) deben ser separados para su identificación. Para ello se colocan en un gel de agarosa o de poliacrilamida. La elección de uno u otro depende del tamaño de las moléculas, siendo la agarosa la elección para moléculas de mayor tamaño y la acrilamida para moléculas más pequeñas. La electroforesis en gel de agarosa es más rápida, pero tiene menos poder de resolución. El equipo de electroforesis consta de un soporte de plástico donde se solidifica el gel elegido que se coloca en una cubeta. La cubeta puede ser vertical u horizontal y contiene un tampón de electroforesis que donde está sumergido el gel (evita que se modifique el PH y se afecte a las cargas de las moléculas). En los extremos del gel y también en contacto con el tampón, se encuentran los electrodos positivo y negativo. La electroforesis se complementa con una fuente de alimentación de corriente continua, que permite graduar el voltaje y la intensidad. Visualizador de geles: Este dispositivo permite visualizar las bandas de ácidos nucleicos o proteínas obtenidas en la electroforesis. Para su visualización, se realiza una tinción fluorescente con bromuro de etidio que emite una luz anaranjada cuando está unido al ADN. Este producto es mutagénico y cancerígeno, por lo que se utilizan alternativas tales como el El visualizador de geles consta de un transiluminador de luz ultravioleta donde se colocan los geles para visualizar la separación y un sistema de captura de imágenes. Unidad 1 Biología Molecular y Citogenética Página 9 RedSafe®. También fluorescente con luz UV, en este caso verde. Debido al riesgo que supone para el técnico la exposición a la luz UV, el transiluminador se encuentra dentro de una cámara oscura, de forma que solo se puede visualizar el resultado por la captura de imagen. En modelos antiguos, el transiluminador no está dentro de una cámara oscura, siendo necesario el uso de gafas de protección y reducir el tiempo de exposición al mínimo. En la asignatura de Técnicas Generales de Laboratorio se estudian las bases y los procedimientos de la electroforesis en detalle en la tercera evaluación. 3. ESTRUCTURA DEL LABORATORIO DE BIOLOGÍA MOLECULAR Como hemos dicho, los equipos y la estructura del laboratorio giran en torno a la técnica de PCR. Previamente a la reacción en cadena de la polimerasa deben prepararse los reactivos y purificarse los ácidos nucleicos. Después de amplificarse mediante la PCR, el resultado de la misma debe ser analizado mediante electroforesis. Cada actividad debe realizarse en un área determinada e independiente del laboratorio para evitar contaminación. Cada una de ellas debe contar con su propio equipamiento y material de trabajo, de manera que no sean intercambiables. El laboratorio de biología molecular debe contar como mínimo con cuatro áreas independientes. Preferiblemente en salas independientes. Preparación de Reactivos Página 10 Preparación de muestras y Extracción Unidad 1 Biología Molecular y Citogenética Preparación de reactivos: Es el área LIMPIA del pre-PCR laboratorio. No hay ADN ni muestra. Aquí se prepara la mezcla de reacción para la PCR. Cuenta con una cabina de REACTIVOS EXTRACCIÓN ADN bioseguridad y a ser posible presión positiva (evita que entre contaminación). Forma parte del proceso que se entiende como pre-PCR. NO NO O Extracción o preparación de las muestras: Es el área SUCIA. Debe contar con una cabina de bioseguridad de clase II y un espectrofotómetro. Lo ideal es que tenga PCR presión negativa (evita que la contaminación se disperse). Es el otro proceso que forma parte de la pre-PCR NO PCR o de amplificación: Sala con los termocicladores y un Post-PCR espacio de trabajo para añadir a la mezcla de trabajo la muestra de ADN. Es una sala SUCIA, por contener muestras procesándose. Post-PCR o electroforesis: Dispone de los equipos de electroforesis y visualización de geles. Es una sala SUCIA por tener productos génicos. El visualizador de geles y el microscopio de fluorescencia se suelen situar en una dependencia que se pueda oscurecer. PRE-PCR POST-PCR Es de vital importancia que las muestras y los reactivos preparados tengan un flujo unidireccional, desde las áreas limpias hacia las áreas sucias y nunca al revés (Pre-PCR PCR post PCR). Este flujo de trabajo implica que cada área de trabajo sea autónoma, debiendo disponer de su propio equipo (neveras, cabinas, centrífugas, etc.) pues no es posible el intercambio entre salas. Unidad 1 Biología Molecular y Citogenética Página 11 Tampoco es intercambiable el material de trabajo, como las pipetas, puntas de pipetas, guantes, rotuladores, gafas de protección batas desechables, etc. 4. CONDICIONES DE TRABAJO Y PREVENCIÓN DE LA CONTAMINACIÓN El termino contaminación debe ser entendido como la introducción accidental de elementos extraños que alteran su pureza. El resultado de la contaminación es un resultado erróneo o la ocasiones, si se contamina el procedimiento no se podrá volver a repetir, por ello, debemos prestar especial cuidado. Deben ser tenidos en consideración (como posible contaminación): 1. Ácidos nucleicos extraños a la muestra analizada 2. Enzimas, como las nucleasas, que degradan los ácidos nucleicos El origen de la contaminación es variable, siendo las fuentes más habituales: Ambiente. Microorganismos o material genético no amplificado proveniente de aerosoles debidos a la manipulación de muestras (pipeteo, centrifugas…). Personal técnico: células epidérmicas, pelos, guantes contaminados… Superficies de trabajo: Carryover o contaminación por arrastre de ADN del propio laboratorio. Contaminación por los reactivos y/o material fungible: La esterilización no garantiza la presencia de ADN o nucleasas. Para PCR además de estéril debe estar libre de ADN y libre de DNAasa / RNAasa. Una vez identificadas las fuentes de contaminación, se debe proceder a anularlas o prevenirlas. La separación física de las estancias y el flujo unidireccional de las muestras son unas de las medidas que ya se han estudiado, muy importantes para evitar contaminaciones. Para evitar la contaminación por nucleasas provenientes de reactivos, se deben usar solo aquellos certificados como libres de tales enzimas. La presencia de ADN en los mismos no se certifica y por ello se debe llevar un control de los lotes, fechas de apertura, caducidad, factores de dilución etc. Además, se deben realizar controles negativos en todas las técnicas (emplear Se denomina técnica aséptica al conjunto de actividades encaminadas a prevenir la contaminación por microorganismos, ácidos nucleicos y nucleasas. Unidad 1 Biología Molecular y Citogenética Página 12 reactivos libres de contaminación y compararlos con los que vamos a emplear). En el siguiente esquema se detallan las actuaciones más importantes de técnica aséptica para el laboratorio de biología molecular: LAVADO DE MANOS USO DE EQUIPOS DE PROTECCIÓN INDIVIDUAL (EPI): Guantes, mascarilla, bata… DESCONTAMINACIÓN DE SUPERFICIES: Luz ultravioleta, Hipoclorito sódico, DNA Zap (Esta mezcla es capaz de degradar instantáneamente altos niveles de ADN y ARN contaminantes de las superficies). PREVENCION CARRYOVER: Uso de cabinas de flujo laminar clase II. PREVENCIÓN CONTAMINACIÓN AMBIENTAL: Flujo unidireccional de muestras. 5. USO EFICIENTE DE LOS RECURSOS El laboratorio de biología molecular es un laboratorio muy específico con costes muy elevados, en infraestructuras, equipos y reactivos. Es imprescindible establecer un sistema de gestión de los recursos y contar con indicadores de calidad que permitan comprobar que las técnicas efectuadas funcionan correctamente. El uso eficiente de los recursos abarca los siguientes puntos: Recursos humanos: Adiestramiento y formación continua para adecuar los conocimientos del personal del laboratorio a los procedimientos utilizados en biología molecular. Técnicas: Todos los procedimientos deben estar estandarizados en protocolos normalizados de trabajo (PNT) desde la recepción de la muestra hasta la emisión de informes. Además, estos informes deben revisarse de forma continuada. Infraestructuras y equipos: Incluyendo un plan de mantenimiento (diario, semanal o mensual, según proceda) que incluya el calibrado y limpieza de equipos Reactivos: Asegurando la trazabilidad de los mismos desde su recepción hasta su consumo o eliminación (etiquetado, fecha de caducidad, temperatura de conservación…). Gestión ambiental: Contando con un código de buenas prácticas medioambientales (GEP: Good Enviromental Practiques) para minimizar el riesgo de impacto ambiental negativo por su actividad. Entre ellas cabe citar el uso de lámparas de bajo consumo, aislamiento térmico, y gestión adecuada de residuos. Unidad 1 Biología Molecular y Citogenética Página 13 III. LABORATORIO DE CITOGENÉTICA Y CULTIVOS CELULARES Se trata de dos laboratorios con objetivos y campos de investigación diferentes. En el laboratorio de cultivos celulares se logran las condiciones adecuadas para el crecimiento y propagación de células eucariotas de organismos pluricelulares en medios de cultivo artificiales bajo condiciones controladas. Por su parte, en el laboratorio de citogenética, se estudian los cromosomas de las células eucariotas. La citogenética humana abarca desde el estudio de la morfología de los cromosomas hasta el enfoque molecular de los mismos. El laboratorio de citogenética puede considerarse una especialización del laboratorio de cultivos celulares, donde encontramos áreas específicas para la obtención de células en mitosis y para el estudio de los cromosomas metafásicos. Los laboratorios de citogenética, cultivos celulares y biología molecular comparten un problema común: La contaminación por microorganismos. En el área de biología molecular, dicha contaminación supone una alteración de la pureza por inclusión de ADN exógeno. En los cultivos celulares, la contaminación por microorganismos supone la muerte del cultivo pues la velocidad de crecimiento de los organismos procariotas es muy superior a la de las células eucariotas. Además del problema de contaminación por microorganismos, los laboratorios de cultivos celulares y citogenética también deben implementar una política de calidad y gestión de recursos similar a la del laboratorio de biología molecular De la misma forma que en el laboratorio de Biología molecular, en este laboratorio encontraremos equipamiento común a otros laboratorios y equipamiento específico; por un lado, para técnicas de cultivos celulares y por otro, para técnicas de citogenética. 1. EQUIPAMIENTO ESPECÍFICO PARA CULTIVOS CELULARES Cabina de flujo laminar: Se trata de una infraestructura donde se realizan todos los procesos y manipulaciones de cultivos celulares. Preparación de medios, siembras, cambios de medio etc. Las cabinas de flujo laminar de clase II disponen de un filtro HEPA (High Effciency 99.95%. Esto supone que el aire dentro de dichas cabinas está libre de partículas y también libre de microorganismos incluidos bacterias, hongos, esporas y levaduras. Unidad 1 Biología Molecular y Citogenética Página 14 Particle Arresting) que retienen partículas de tamaño superior a 0.2 µm con una eficacia del El aire es circulado desde la rejilla de trabajo hacia la parte superior de la cabina por la parte trasera. Una vez filtrado, vuelve una parte (70%) al interior de la cabina en forma laminar creando una cortina de aire estable que impide: 1- La entrada de contaminantes del exterior 2- La salida del cultivo al exterior, protegiendo al trabajador y al medio ambiente. El 30% del aire que no se recircula al interior de la cabina, es expulsado al exterior, a través de otro filtro HEPA. Incubador de CO2: Esta estufa de incubación dispone de sistema de control de temperatura, recirculación de aire y control de CO2. El CO2 se suministra en botellas presurizadas y se inyecta en el interior del incubador, manteniendo en todo momento una concentración constante de este gas. El control de la humedad en los incubadores antiguos no existe como tal y para ello se coloca una bandeja de agua en el nivel más bajo para. Si bien se consigue un nivel de humedad elevado, que impide la evaporación del medio de cultivo, esta bandeja se contamina con mucha facilidad y no es la solución ideal. Los incubadores actuales incluyen un sistema de inyección de agua estéril. La recirculación de aire garantiza que la temperatura sea homogénea en el interior del incubador. **Incubador Roller: Dispositivo que permite que las botellas de cultivo giren lentamente y Página 15 las células crecen en toda la superficie. Unidad 1 Biología Molecular y Citogenética Microscopio invertido: La observación de las células se realiza por técnicas de microscopía convencional. Sin embargo, el tamaño de los frascos de cultivo impide el uso del microscopio habitual. El microscopio invertido se caracteriza por tener la fuente de luz por encima de la platina y el revolver de objetivos por debajo. Como resultado, el espacio de trabajo encima de la platina es mucho mayor. Para mejorar la visualización de las células en vivo, se utiliza un sistema de contraste de fases, pues de manera natural, carecen de color. Criogenia: Este equipo permite conservar a largo plazo y de forma viable líneas celulares. El equipo de criogenia está constituido por un contenedor de nitrógeno líquido. De manera centralizada, existe un tanque nodriza para rellenar los contenedores. 2. EQUIPAMIENTO ESPECÍFICO PARA CITOGENÉTICA Como ya hemos visto, el laboratorio de citogenética es una especialización del laboratorio de cultivos celulares. El equipo específico de citogenética se centra en el estudio microscópico y análisis de imagen de las células en metafase. Para ello, es imprescindible contar con un equipo de análisis de imagen microscópica. Este equipo consta básicamente de: - Microscopio óptico convencional: de luz transmitida. - Cámara digital acoplada al microscopio. - Software para análisis de imagen específico para el reconocimiento del patrón de Página 16 bandas y el emparejamiento de cromosomas. Unidad 1 Biología Molecular y Citogenética Además, es habitual disponer de otro microscopio convencional de fluorescencia para estudios de viabilidad, morfología celular e hibridación in situ fluorescente (FISH). El equipo común del laboratorio de citogenética, es el habitual de biología celular y de muchos otros laboratorios biomédicos. Incluye equipos de esterilización, equipo de agua ultrapura, Congeladores de -20ºC y -80ºC, placas calefactoras, pipeteadores automáticos, centrífugas, pHmetros, etc. 3. ESTRUCTURA DEL LABORATORIO DE CITOGENÉTICA La estructura del laboratorio está definida para minimizar el riesgo de contaminación. Al igual que en el laboratorio de biología molecular, se aplica la separación física de áreas "limpias" y "sucias". El laboratorio de citogenética debe contar como mínimo con tres salas: Sala de cultivos: Área LIMPIA del laboratorio donde se realizan procedimientos relacionados con el cultivo celular. Debe tener un sistema que suministre aire filtrado y dispondrá de los incubadores, campanas de flujo laminar y el microscopio invertido. Laboratorio convencional: Área SUCIA. En ella se realizan todos los procedimientos que no están relacionados con el cultivo, tales como cariotipo, extensiones, tinciones etc. Dispondrá del resto del equipamiento salvo el equipo de criogenia. El microscopio de fluorescencia se ubica en un compartimiento que se pueda oscurecer. Sala de frio: Donde se localizan los congeladores y el equipo de criogenia. Idealmente, esta sala debería ser una cámara frigorífica para minimizar el consumo de nitrógeno. 4. TÉCNICA ASÉPTICA Las áreas estériles son zonas libres de agentes patógenos (o se encuentran en cantidades muy reducidas). Las normas para mantener estas condiciones son de obligado cumplimiento e incumben al personal, a las instalaciones y a los equipos. Las técnicas asépticas, realizadas en el laboratorio de citogenética, están dirigidas a evitar la contaminación del cultivo por microorganismos: la campana de flujo laminar tiene un protocolo bien definido. Entre los puntos más importantes cabe citar: Unidad 1 Biología Molecular y Citogenética Página 17 a. Todas las manipulaciones se deben realizar dentro de la campana de flujo laminar. El trabajo en 1. Lavado frecuente de manos 2. Uso de guantes y bata desechables 3. Uso de reactivos estériles, no intercambiables con otras salas 4. No mecheros en la cabina. Generan turbulencias que alteran el flujo laminar 5. Colocar dentro de la cabina solo el material que se va a utilizar 6. No abrir el embalaje estéril hasta su momento de uso 7. Retirar el material fungible utilizado de la cabina 8. Limpieza de las cabinas con desinfectante al final de cada sesión de trabajo 9. Luz germicida UV después de la limpieza 30 min 10. Mantenimiento programado de la cabina y comprobación de los filtros HEPA 11. En la sala de cultivos no se permiten visitas b. Restringir el acceso a todo el personal que no sea imprescindible c. Todo el personal debe recibir una formación específica, previa al inicio de trabajo en su sección. d. Seguir un protocolo estricto de manipulación de muestras y cultivos celulares. e. Es necesario reglamentar el equipo de trabajo (EPI) y seguir unas pautas establecidas de cambios y lavados. f. Los equipos de aire acondicionado deben estar equipados con filtros especiales a fin de evitar propagación de agentes patógenos. g. Es necesario desinfectar diariamente poyatas y suelos. IV. SEGURIDAD EN EL LABORATORIO El diseño del laboratorio responde a exigencias de prevención de la contaminación de las muestras. De manera simultánea, deben satisfacerse criterios de seguridad. La seguridad en el laboratorio hace referencia a la prevención de la exposición del personal a agentes nocivos y también impedir la liberación de estos al exterior. Según la naturaleza de los agentes, podemos hablar de exposición a agentes químicos y Página 18 exposición a agentes biológicos. Unidad 1 Biología Molecular y Citogenética 1. SEGURIDAD QUÍMICA El RD 363/1995 establece el reglamento sobre la clasificación, envasado y etiquetado de sustancias peligrosas. Las buenas prácticas de laboratorio (BPL) referidas a seguridad química deben incluir medidas para prevenir la exposición (cutánea, inhalación o ingestión) almacenamiento seguro y gestión de los residuos que generen. La ficha de seguridad (FDS) se suministra por el distribuidor del producto y se guarda en el laboratorio para su consulta por todo el personal. Aporta información relativa a la composición, manipulación, peligro, vía de exposición, efectos tóxicos, almacenamiento, eliminación y primeros auxilios. Como ejemplos de sustancias peligrosas habituales en los laboratorios de biología molecular y Inflamables: Alcoholes (isopropanol, etanol, metanol) Tóxicos: acrilamida, azida, DAB (diaminobencidina), tetrametil-urea Carcinógenos: Acrilamida, DAB, formaldehido Múgatenos: Acrilamida, Bromuro de etidio Incompatibilidades para el almacenamiento de productos químicos Unidad 1 Biología Molecular y Citogenética Página 19 citogenética se pueden mencionar los siguientes: 2. BIOSEGURIDAD Conjunto de normas aplicables a la prevención de la exposición accidental del personal a gentes biológicos potencialmente peligrosos (patógenos y toxinas) o su liberación al medio ambiente. Cualquier muestra biológica debe considerarse potencialmente peligrosa y deben adoptarse medidas mínimas de protección en referencia al uso de equipos de protección individual. El principal problema de bioseguridad en biología molecular lo plantean los organismos modificados genéticamente (GMO). El RD 178/2004 establece el marco jurídico para la utilización confinada, liberación y comercialización de organismos modificados genéticamente. En virtud del riesgo para la salud humana y el medio ambiente, se clasifican las actividades de laboratorio en 4 tipos: tipo 1: Riesgo nulo tipo 2: Riesgo bajo tipo 3: Riesgo moderado tipo4: Riesgo alto El propio Real decreto en su anexo I establece los criterios para la evaluación del riesgo y los procedimientos de protección y confinamiento mínimos, según las actividades desarrolladas en el laboratorio. ** CURIOSIDAD: El virus de la hepatitis B es la infección más frecuente entre el personal de laboratorio. Por este motivo, todos los empleados deberán vacunarse, excepto si ya lo han hecho Página 20 con anterioridad. Unidad 1 Biología Molecular y Citogenética Página 21 Unidad 1 Biología Molecular y Citogenética