Variaciones de nutrientes afectan a la microbiota del suelo Microbiología Ambiental, FCQ-UNACH 2020 Definiciones y alcances La remediación orgánica del suelo es una práctica popular usada para aumentar la salud y calidad de los agrosistemas. Se han usado estiércol, composta y desechos de cosechas para incrementar el contenido de materia orgánica y la disponibilidad de carbon. Esto estimula la biomasa microbiana y la actividad enzimática del suelo Se ha observado que la remediación organica del suelo está asociada con la supresión natural de patógenos de plantas Los posibles mecanismos que están involucrados incluyen el incremento de antagonismo microbiano, así como la promoción del crecimiento d las plantas, la activación de la resistencia inducida y a acumulación de compuestos biocidas vegetales. Debido a la complejidad de los materiales que se usan en la remediación orgánica, no se puede deducir si la supresión de los patógenos se debe directamente al incremento de carbon disponible en el ecosistema. Objetivo Explorar los efectos de la adición de compuestos carbonados purificados sobre la composición del microbioma del suelo y la capacidad de enriquecer selectivamente a las comunides antagonistas de patógenos. Los compuestos provienen de exudos de plantas o de los abonos que comunmente se usan para enriquecer al suelo. El género Streptomyces como indicador Streptomyces es un género de bacterias Gram positivas, filamentosas, ubicuas en el suelo. Se conocen como productores de un amplio rango de antibióticos que se usan como antibacterianos y antifúngicos. En la agricultura, las especies de Streptomyces se consideran agentes de biocontrol muy prometedoras por la actividad de antagonistas que les permite suprimir patógenos de plantas muy diversos. La competencia por los nutrientes es el factor principal que promueve la interacción competitive en las especies de Streptomyces. En este trabajo se miden los efectos de la adición de compuestos carbonados sobre los cambios en la población de Stremptomyces y sus funciones como antagonista de patógenos. Metodología Suelo alto en material orgánica (HOM) : 4.8 % y contenido de nitratos10.3 ppm. Suelo bajo en material orgánica (LOM): 1.5% y contenido de nitratos15.2 ppm. Se enriquecieron con: dosis altas y bajas de soluciones estériles de glucose, fructose, ácido málico o una mezcla de ellos. Estos son componentes dominantes de los exudados de las raíces y de los desechos de plantas. Se agregaron los compuestos cada 14 días los primeros 3 meses y después cada mes hasta completar 9 meses. Se midió la densidad de Streptomyces Se probó la inhibición de los patógenos Fusarium oxysporum y Streptomyces scabies Se midió el carbono total (TC), nitrógeno total (TN) y pH del suelo Resultados FIGURE 1 | Effect of carbon amendments on chemical characteristics of lowand high-organic matter soils, including pH (A), and total carbon (B), and total nitrogen (C) content. FIGURE 2 | Effect of carbon amendments on Streptomyces community characteristics of low- and high-organic matter soils, including densities of total (A) and pathogen-inhibitory (B) Streptomyces, and frequency of Streptomyces inhibitory of Streptomyces scabies-Ss (C) and Fusarium oxysporum-Fo (D). Effect of carbon amendments on bacterial communities in low- and high-organic matter soils. FIGURE 5 | Effect of carbon amendments on bacterial community alpha diversity (Shannon H’ index, A) and observed OTU richness (B), and relative abundances of major bacterial phyla (C) in low- and high-organic matter soils
