Fisiología microbiana

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Fisiología
microbiana
M. en C. Ricardo Hernández Delgadillo
CELULA
Complejo estructural y funcional
altamente organizado, autodelimitado
por una barrera de permeabilidad
(membrana
citoplásmica),
que
intercambia materia y energía con el
medio
(metabolismo),
en
forma
estrictamente controlada (regulación).
METABOLISMO
Es la actividad química, osmótica y
quimiosmótica, catalizada por enzimas,
a través de la cual las células
intercambian materia y energía con el
medio.
FUNCIONES DEL METABOLISMO
Abastecimiento
... de materia y energía.
Biosíntesis
... de bloques de construcción.
Polimerización
... de macromoléculas.
Ensamble
... de estructuras celulares.
ABASTECIMIENTO
Fuente de energía.
Energía de hidrólisis:
ATP, PEP, etc.
Donador de electrones.
Energía redox:
NADPH, ferredoxina, etc.
Fuente de carbono.
Precursores biosintéticos:
Glucosa-6-fosfato
Fosfo-enol-piruvato
Succinil-CoA
Dihidroxi-acetona-fosfato
Piruvato
Oxalacetato
Gliceraldehído-3-fosfato
Acetil-CoA
Eritrosa-4-fosfato
Glicerato-3-fosfato
-ceto-glutarato
Ribosa-5-fosfato
REQUERIMIENTOS NUTRICIONALES
Fuente de energía
Fototrofía
Luz
Quimiotrofía
Compuestos oxidables
Donador de electrones
Litotrofía
Compuesto inorgánico
Organotrofía
Compuesto orgánico
Fuente de carbono
Autotrofía
Carbono oxidado: CO2
Heterotrofía
Carbono reducido: C(H2O)
REQUERIMIENTOS NUTRICIONALES
Aceptor de electrones
Respiración
Tomado del ambiente
Fermentación
Construido por la célula
Factores de crecimiento
Prototrofía
Sin deficiencias biosintéticas
Auxotrofía
Con deficiencias biosintéticas
Fuente de nitrógeno
Sales minerales
Agua
CLASIFICACION METABOLICA
autotrofía
lito
Foto
organo
heterotrofía
mixotrofía
autotrofía
heterotrofía
mixotrofía
autotrofía
lito
Quimio
organo
heterotrofía
autotrofía
heterotrofía
mixotrofía
FOTOLITOAUTOTROFIA
metabolismo central
Fuente de energía
Fototrofía
Donador de electrones
Fotofosforilación (FACTe-)
Fotorreducción
Litotrofía
Fuente de carbono
Autotrofía
ATP
Cadena invertida
NADPH
metabolismo periférico
Precursor
biosintético
interconversión
Precursores
biosintéticos
FOTOLITOHETEROTROFIA
metabolismo central
Fuente de energía
Fototrofía
Donador de electrones
Fotofosforilación (FACTe-)
Fotorreducción
Litotrofía
Fuente de carbono
Heterotrofía
ATP
Cadena invertida
NADPH
metabolismo periférico
Precursor
biosintético
interconversión
Precursores
biosintéticos
FOTOORGANOAUTOTROFIA
metabolismo central
Fuente de energía
Fototrofía
Donador de electrones
Fotofosforilación (FACTe-)
Fotorreducción
Organotrofía
Fuente de carbono
Autotrofía
ATP
Cadena invertida
NADPH
metabolismo periférico
Precursor
biosintético
interconversión
Precursores
biosintéticos
FOTOORGANOHETEROTROFIA
metabolismo central
Fuente de energía
Fototrofía
Donador de electrones
Fotofosforilación (FACTe-)
metabolismo periférico
Organotrofía
Fuente de carbono
Heterotrofía
ATP
Fotorreducción
Cadena invertida
NADPH
interconversión
Precursores
biosintéticos
Precursor
biosintético
QUIMIOLITOAUTOTROFIA
metabolismo central
Fuente de energía
Quimiotrofía
Respiración (FACTe-)
ATP
Cadena invertida
NADPH
Donador de electrones
Litotrofía
Fuente de carbono
Autotrofía
metabolismo periférico
Precursor
biosintético
interconversión
Precursores
biosintéticos
QUIMIOLITOHETEROTROFIA
metabolismo central
Fuente de energía
Quimiotrofía
Respiración (FACTe-)
ATP
Cadena invertida
NADPH
Donador de electrones
Litotrofía
Fuente de carbono
Heterotrofía
metabolismo periférico
Precursor
biosintético
interconversión
Precursores
biosintéticos
QUIMIOORGANOHETEROTROFIA
Fuente de energía
metabolismo central
metabolismo periférico
Respiración
(FACTe-)
Quimiotrofía
ATP
Fermentación
(FANS)
Donador de electrones
Organotrofía
Precursor
biosintético
Glc-6-P DHasa
NADPH
interconversión
Precursores
biosintéticos
Fuente de carbono
Heterotrofía
FERMENTACION
Fuente de energía
(compuesto orgánico)
Productos de
la fermentación
(alcoholes) (ácidos)
ADP + Pi
NAD+
ATP
ATP + H2O
NADH
ADP + Pi
Fosforilación a
nivel de sustrato
Fosforilación a
nivel de sustrato
aceptor de electrones
fumarato; FACTe-
RESPIRACION
Fuente de energía
(compuesto orgánico)
Productos de
la respiración
ADP + Pi
NAD+
ATP + H2O
ATP + H2O
NADH
ADP + Pi
Fosforilación a
nivel de sustrato
Fosforilación
acoplada a CTe-
CO2
aceptor de
electrones
REACCIONES ACOPLADAS
DH2
D+
A+
AH2
Estructura de
alta energía
proceso
exergónico
ADP
ATP
estructura
acoplante
proceso
endergónico
Pi
H2O
FOSFORILACION A NIVEL DE SUSTRATO
G°’ = -49.3 kJ/mol
CHO
CO-P
Pi
HCOH
CH2-P
COOH
HCOH
NAD+
Gliceraldehído-3-fosfato
CH2-P
NADH
HCOH
CH2-P
ADP
Glicerato-1,3-bifosfato
Glicerato-3-fosfato
ATP + H2O
G°’ = +30.6 kJ/mol
G°’ = +0.2 kJ/mol
G°’ = -18.5 kJ/mol
G°’ = -18.7 kJ/mol
FOSFORILACION ACOPLADA A CTe-
H+
lado 1
e-
lado 2
DH2
ADP + Pi
D+
A+
AH2
ATP + H2O
H+
Membrana transductora de energía
Cadena transportadora de electrones
ATP sintetasa
COMPLEJOS MITOCONDRIALES
succinato
NADH
CoQ
FMN+
FAD+
FeSa
FeS1
FeSb
FeS2
FeS3
FeS4
Complejo I
ADP + Pi
Cit b660
Cit b662
Cit c
FeS
Cit c1
Complejo III
Cit a
Cit a3
ADP + Pi
ATP + H2O
Cit b680
Complejo II
Complejo IV
ATP + H2O
FeSc
ADP + Pi
ATP + H2O
O2
ENERGIA METABOLICA
Son las formas de la energía que
participan en los procesos celulares, a
saber:
energía de hidrólisis
energía redox
gradientes electroquímicos
SISTEMA ADENILATO
Fuente de
energía
ADP
Pi
productos
metabólicos
conservación
ATP
utilización
H2O
utilización
adenilato cinasa
pirofosfatasa
membrana citoplásmica
trabajo
biológico
AMP
PPi
METABOLISMO PERIFERICO
Es la vía de conversión de la fuente
de carbono a un primer precursor
biosintético.
El metabolismo periférico
intrinsecamente catabólico.
heterotrófico
es
El
metabolismo
periférico
intrinsecamente anabólico.
autotrófico
es
METABOLISMO CENTRAL
Son la vías de...
transformación de la fuente
energía en energía metabólica y...
de
la conversión de los productos del
metabolismo periférico en los demás
precursores biosintéticos.
Anaplerosis I.
Glucosa-6-P
Glucosa
Eritrosa-4-P
Dihidroxiacetona-P
Ribosa-5-P
Gliceraldehído-3-P
Glicerato-1,3-BiP
CO2
Fosfoenolpiruvato
Succinil-CoA
Oxalacetato
CO2
Piruvato
Acetil-CoA
-ceto-glutarato
Anaplerosis II.
Glucosa-6-P
Gluconato-6-P
Fructosa-6-P
Ribosa-5-P
Eritrosa-4-P
Dihidroxiacetona-P
Malato
Succinil-CoA
Gliceraldehído-3-P
Glicerato-1,3-BiP
Acetato
CO2
Acetil-CoA
Glioxilato
Fosfoenolpiruvato
Oxalacetato
Isocitrato
CO2
Piruvato
-ceto-glutarato
ESQUEMA Z
(-)
FeS
Fd
FMN+
Feofitina
e-
NADP+
Potencial redox (V)
Plastoquinoa
e-
Complejo
e-
Cit bf
Plastocianina
eH+
eATP
PS II
(+)
H 2O
O2 + H +
PS I
NADPH
FORMAS METABOLICAS
Catabolismo... metabolismo degradativo.
Anabolismo... metabolismo constructivo.
Anfibolismo... metabolismo simultaneamente
catabólico y anabólico.
Anaplerosis... metabolismo de incorporación de
carbono no oxidable, para la
formación de precursores
biosintéticos.
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