Servicios

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Plataforma Tecnológica de
Proteómica
La plataforma de Proteómica tiene como objetivo dar apoyo y asesoramiento
técnico y ofrecer servicios en el campo de la Proteómica, tanto a los investigadores de centros públicos como del sector privado; también desarrolla sus propios
proyectos, así como en colaboración.
La plataforma ofrece la tecnología para llevar a cabo análisis mediante espectrometría de masas que van desde la determinación de masas moleculares hasta
análisis proteómicos complejos, como la cuantificación del nivel de expresión
proteica.
La unidad cuenta con infraestructura de última generación y
personal calificado para la realización de servicios e para iniciar
nuevos proyectos. Además, la unidad es parte de ProteoRed-ISCIII, la red Española de Proteómica, que promueve nuevas tecnologías y la excelencia en los servicios ofrecidos por los laboratorios miembros.
La PT de Proteómica se compromete a ofrecer un servicio de
calidad, personalizado y confidencial, con buena comunicación y
flexibilidad.
En la plataforma se lleva a cabo una amplia gama de actividades
rutinarias relacionadas con la identificación de proteínas y el
análisis de expresión diferencial de proteínas, tales como:
Digestión enzimática de las proteínas. Dependiendo de la
secuencia primaria de una proteína diferentes enzimas
pueden ser usadas para obtener péptidos adecuados para ser
analizadas por espectrometría de masas.
Identificación de proteínas mediante la digestión enzimática, análisis por espectrometría de masas y la búsqueda
en base de datos (los motores de búsqueda MASCOT y
Sequest, y los software Proteome Discoverer y Peaks Studio
están disponibles en el laboratorio. Además, tenemos acceso
al motor de búsqueda Phenyx en un servidor privado).
Análisis de huella peptídica y de espectros de fragmentación de
péptidos (MALDI-fingerprinting-MS/MS). Se utiliza para identificar proteínas puras y/o spots de geles 2-DE.
Separación de péptidos por cromatografía líquida acoplada a
espectrometría de masas (LC-MS/MS). Se utiliza para identificar
proteínas en muestras de complejidad moderada/alta, en
términos de número de proteínas.
Identificación y cuantificación relativa del nivel de expresión de proteínas mediante análisis por espectrometría de
masas (LC-MS/MS).
Marcaje isobárico (iTRAQ). Permite la comparación de hasta 8
muestras.
Sin marcaje (label-free).
Identificación y caracterización de modificaciones postraduccionales (PTMs) de proteínas (LC-MS/MS).
Fosforilación con o sin enriquecimiento de fosfopéptidos con
dióxido de titanio (TiO2).
Acetilaciones, metilaciones.
Secuenciación de péptidos por espectrometría de masas
(MS/MS). Una metodología que puede utilizarse para obtener
la secuencia de aminoácidos parcial o completa de péptidos.
Es aplicable para péptidos con masa inferior a 3000 Da.
Determinación de molecular masa por espectrometría de
masas (MALDI-TOF MS). Se aplica a la caracterización de la
masa molecular mediante espectrometría de masas.
Preparación de muestras.
Precipitación de proteínas con el fin de obtener un extracto sin
contaminación de sales o lípidos.
Cuantificación de proteínas totales por Bradford o similar.
Eliminación de interferentes utilizando filtros, membranas,
cartuchos o columnas específicas.
Separación de proteínas mediante electroforesis bidimensional (2-DE). Dependiendo de la complejidad y cantidad de
las muestras, la 2-DE puede hacerse en mini geles (8 x 7 cm)
o en geles grandes (20 x 20 cm).
Análisis de imágenes de geles (como auto-usuario). Se
lleva a cabo comparando el patrón de proteínas y realizando
la cuantificación relativa de la abundancia de proteínas en
diferentes muestras.
Asesoramiento de auto-usuarios de electroforesis
bidimensional y espectrometría de masas. Proporciona
acceso y asesoramiento técnico a grupos públicos y privados
que no tienen la infraestructura para llevar a cabo experimentos de electroforesisis bidimensional y análisis de espectrometría de masas MALDI-TOF.
Tel. +34 934 034 653 · [email protected] · www.pcb.ub.cat
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