1 BIOQUÍMICA Licenciatura en Biología Prácticas Curso

BIOQUÍMICA
Licenciatura en Biología
Prácticas
Curso 2006-2007
7-15 de Mayo 2007
Departamento de Bioquímica Vegetal y Biología Molecular
Universidad de Sevilla
Los avances en programas informáticos que pueden ser manejados desde
ordenadores personales, permite la creación de un cuerpo informático de
apoyo al alumno no solo en cuanto a la simple visualización de moléculas,
sino también para el manejo interactivo de estas.
Todas las formas de vida están basadas en prácticamente las mismas
reacciones bioquímicas. El conjunto de todas las reacciones que suceden
en una célula se le denomina metabolismo. A este conjunto de reacciones
que suceden en forma secuencial y que dan lugar a un compuesto o a una
función integran un camino metabólico y se le da un nombre específico.
En esta práctica se iniciara el estudiante en el uso de Internet como
herramienta en el aprendizaje del metabolismo de la célula, También
se harán demostraciones en el uso del CD BioROM instalado en el
ordenador.
Recordamos que no es necesario tener conexión a Internet para consultar
los contenidos del CD BioROM, salvo si se quieres navegar por la
colección de enlaces externos.
A continuación están listadas algunas de las páginas que pueden servir
para consultas de metabolismo:
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http://www.expasy.org/cgi-bin/show_thumbnails.pl
NOTA: RESUMENES DE RUTAS DE BIOQUÍMICA. Ni de coña me voy a pillar
esto, ya tengo bastante con los apuntes. Está bastante completito. Tiene acceso a
NCBI.
http://www.gwu.edu/~mpb/
NOTA: es más simple pero más esquemática. No tiene acceso a NCBI.
http://ull.chemistry.uakron.edu/Pathways/index.html
NOTA: Es más esquemática aún.
http://home.wxs.nl/~pvsanten/mmp/main.htm
NOTA: Es demasiado esquemático y solo es una foto, que no se puede
interaccionar con ella ni es multimedia ni nada.
http://bcs.whfreeman.com/lehninger/default.asp
NOTA: Esta bien porque tiene videos explicativos de las rutas metabólicas y de las
técnicas de las prácticas, como las electroforesis o las cromatografías. Están
además narradas.
http://bcs.whfreeman.com/biochem5/
NOTA: Está tan bien como el de legninger.
http://www.brenda.uni-koeln.de/index.php4
NOTA: Sirve más para gente que esté haciendo la tesis, debido a la gran cantidad
de información.
http://www.genome.ad.jp/kegg/
NOTA: Referencias de las enzimas de las rutas metabólicas, a PM, pI, Genes de los
que proceden y especies, etc… demasiado compleja y completa.
http://www.biopsicologia.net/n1.php4
NOTA: Simple pero suficiente, correcta y esquemática: funcional.
http://www.biorom.uma.es
(biorom 2007) NOTA: Es completísimo
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Problema 1: Conversión de la glucosa
¡Correcto!
La glicolisis lleva a la producción de ____________ y dos moléculas de ATP. En ausencia de
oxígeno, la fermentación conduce a la producción de ______________. La glicolisis más el ciclo
del ácido cítrico pueden convertir los carbonos de la glucosa hasta _________ , almacenando
energía como ATP, _____________ y ___________.
A. ácido láctico, piruvato, CO2, NADH, FADH2
B. piruvato, ácido láctico, CO2, NADH, FADH2
En la glicolisis, la glucosa de seis carbonos se transforma en dos moléculas de
piruvato, cada una con tres carbonos. En la fermentación, el piruvato es reducido por
NADH hasta ácido láctico. En el ciclo del ácido cítrico, los carbonos de la glucosa se
convierten a CO2 y los átomos de H son usados para reducir a NAD+ y FAD formando
NADH y FADH2.
C. CO2, NADH, FADH2, ácido láctico, piruvato
D. O2, ácido láctico, piruvato, FADH2
E. glucosa, ácido láctico, CO2, NADH, FADH2
Productos de la glicolisis
En la glicolisis, la glucosa de seis carbonos se transforma en dos moléculas de piruvato, cada uno
con tres carbonos. El resumen de la glicolisis se presenta abajo, la glucosa se convierte en dos
moleculas de piruvato, rindiendo 2 ATP y 2 NADH.
Productos de la fermentación
En la fermentación, el piruvato se descarboxila a acetaldehído, y el acetaldehído es reducido por el
NADH, produciendo etanol. La fermentación ocurre en ausencia de oxígeno, y está diseñada para
regenerar el NAD+ y que la glicolisis pueda continuar. Nótese que en ausencia de oxígeno el NADH
no puede generar energía.
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Productos de la glicolisis + el ciclo del ácido cítrico
La glicolisis produce dos moléculas de piruvato por cada molécula de glucosa. En presencia de
oxígeno (condiciones aeróbicas), el piruvato entra en la mitocondria y es metabolizado a CO2 y
H2O en el ciclo del ácido cítrico. Una combinación de la glicolisis y del ciclo del ácido cítrico oxida
la glucosa a CO2 produciendo ATP y reduciendo los transportadores de electrones a NADH y
FADH2. La reacción que se recoge mas abajo resume las acciones de la glicolisis y del ácido cítrico.
Problema 2: Productos de la glicolisis
¡Correcto!
En el final de la glicolisis, cada molécula de glucosa ha rendido 2 moléculas de _______, 2
moléculas de ________, y un total de 2 moléculas de _________.
A. FAD; NAD+; ADP
B. CO2; NAD+; ADP
C. ácido láctico; etanol; CO2
D. piruvato; NADH; ATP
La glicolisis es la conversión de glucosa a dos moléculas de piruvato, rindiendo un total de 2 ATP y
2 NADH. Recuérdes que se necesitan 2 ATP para iniciar la glicolisis y se producen 4 ATP en la
ruta, dando una ganancia neta de 2 ATP.
E. H2O; CO2; ATP
Problema 3: Trematol
¡Correcto!
El trematol es un veneno metabólico derivado de una planta venenosa llamada raíz blanca de
serpiente. Las vacas se comen esta planta concentrando el veneno en su leche. El veneno inhibe las
enzimas hepáticas que convierten el ácido láctico en otros compuestos metabólicos.
¿Por qué el ejercicio físico aumenta los síntomas del envenenamiento por trematol?
¿Por qué desciende el pH de la sangre en las personas que han ingerido trematol?
A. El ejercicio físico provoca el incremento de la producción de ácido láctico por la fermentación, y
la sobreproducción de ácido láctico desciende el pH de la sangre cuando las enzimas hepáticas
están bloqueadas.
Durante el ejercicio, nuestros músculos producen ácido láctico desde el piruvato por
fermentación, consiguiendo la regeneración del NAD+ para continuar la producción de ATP por
la glicolisis. Como el metabolismo del ácido láctico es bloqueado por tremetol, el ácido
sobreproducido sale a la sangre, descendiendo su pH.
B. El ejercicio físico aumenta el metabolismo, y la cadena de transporte electrónico, bombea H+
fuera de la mitocondria aumentando el pH de la sangre.
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