universidad de panamá facultad de ciencias naturales, exactas y

UNIVERSIDAD DE PANAMÁ
FACULTAD DE CIENCIAS NATURALES, EXACTAS Y TECNOLOGÍA
VICE-RECTORIA DE INVESTIGACIÓN Y POSTGRADO
MAESTRÍA EN CIENCIAS BIOLÓGICAS
Panamá, Agosto de 2014
CONTENIDO
1.
Antecedentes .................................................................................................................... 3
2.
Título del Programa y Grado ........................................................................................... 4
3.
Duración del Programa .................................................................................................... 4
4.
Justificación ..................................................................................................................... 4
4.1.
Razones generales ............................................................................................................. 4
4.2.
Biología Molecular ........................................................................................................... 5
4.3.
Biodiversidad y Conservación .......................................................................................... 6
5.
Elementos fundamentales del currículum ........................................................................ 6
5.1.
Objetivos del Programa .................................................................................................... 6
5.1.1. Objetivos generales:.......................................................................................................... 6
5.1.2. Objetivos específicos: ....................................................................................................... 7
6.
Perfil del Egresado ........................................................................................................... 7
7.
Estrategias Metodológicas ............................................................................................... 8
8.
Plan de estudio ................................................................................................................. 8
8.1.
Estructura del Programa de Maestría ................................................................................ 8
PROPEDEUTICO.......................................................................................................... 10
TRONCO COMUN ........................................................................................................ 10
ORIENTACIÓN EN BIOLOGÍA MOLECULAR ......................................................... 11
ORIENTACIÓN EN BIODIVERSIDAD Y CONSERVACIÓN ................................. 12
9.
Descripción de Asignaturas ........................................................................................... 13
tronco comun ................................................................................................................. 23
OPCIÓN EN BIOLOGÍA MOLECULAR ...................................................................... 50
OPCIÓN EN BIODIVERSIDAD Y CONSERVACIÓN ................................................ 90
10.
Unidad ejecutora .......................................................................................................... 132
11.
Modalidad .................................................................................................................... 132
12.
Duración....................................................................................................................... 132
13.
Regimen académico ..................................................................................................... 133
13.1.
Requisitos de Admisión ................................................................................................ 133
13.2.
Requisitos de Selección ................................................................................................ 134
13.3.
Requisitos de Permanencia ........................................................................................... 134
13.4.
Requisitos de Egreso..................................................................................................... 134
14.
Recursos humanos ....................................................................................................... 134
15.
Instalaciones y facilidades ........................................................................................... 135
16.
Costos........................................................................................................................... 136
Orientación en Biología Molecular .............................................................................. 136
Orientación en Biodiversidad y Conservación ............................................................ 137
17.
Candidatos a la nueva promoción ................................................................................ 138
18.
Evaluación del programa (2011).................................................................................. 140
19.
Anexos ......................................................................................................................... 141
Líneas de investigación ................................................................................................ 141
Lista de docentes .......................................................................................................... 142
Lista de Asesores o Directores de Tesis ...................................................................... 145
3
PROPUESTA DE REAPERTURA DE LA MAESTRIA EN CIENCIAS BIOLÓGICAS
1. Antecedentes
La Facultad de Ciencias Naturales durante más de 40 años ha formado biólogos con grado de
licenciatura quienes se han incorporado con éxito en el quehacer nacional en donde se requería
de los profesionales de biología. En los últimos años, los diferentes Departamentos del área de
Biología han tenido un aceptable desarrollo académico, lo que permitío proponer la creación del
programa de maestría en Ciencias Biológicas. Esto responde a una necesidad nacional de tener
profesionales con mayor preparación académica, específicamente con grado de postgrado.
También se ha concluido de manera exitosa las actividades académicas de las primeras
promociones, cuyos estudiantes en han sustentado o están en fase de presentación de sus trabajos
de Tesis.
El programa de Maestría en Ciencias Biológicas se ha abierto a la evaluación por pares externos
y a aceptar, dentro de sus planes de mejora, las recomendaciones que se le hagan. En este
sentido, ya ha establecido un compromiso con la Agencia Centroamericana de Acreditación de
Postgrado (ACAP) en el proceso de evaluación. La Secretaría Ejecutiva de la Agencia
Centroamericana de Acreditación de Postgrado ACAP notificó la acreditación del Programa de
Maestría en Ciencias Biológicas por un periodo de tres años mediante Oficio/101/2014/ACAP
del 15 de julio de 2014. La acreditación supone un Plan de Mejoras.
Se han establecido sistemas de incentivos y la asignación de becas para estudiantes nacionales y
de los ámbitos regional e internacional y se gestionan fondos en otras instituciones como la
SENACYT (Secretaría Nacional de Ciencia y Tecnología) lográndose la consecución de fondos
y licencias para estudios e investigación. Sin embargo, se requiere lograr mayor apoyo
financiero para los estudiantes que aspiren dedicar más tiempo a los estudios, ser estudiantes de
dedicación total a los estudios. Por ello, se decidío participar en la Convocatoria Pública para las
universidades acreditadas en la República de Panamá para presentación de propuestas de
programas de postgrados de investigación, Convocatoria 2014 PFPN001-2014. EL programa de
maestría en Ciencias Biológicas se compromete a realizar los ajustes según recomendaciones de
la SENACYT, resultado de la evaluación por revisores externos, y a incorporar oportunamente
cambios en los contenidos y estrategias didácticas.
4
Finalmente, la Universidad de Panamá se endosa una homologación del sistema de créditos de
postgrado, de manera tal que los programas de maestría cuenten con un mínimo de 50 créditos,
lo que obliga a hacer una revisión del Plan de Estudio y la malla curricular.
El programa de esta propuesta, como respuesta a todo lo anteriormente señalado, presenta un
enfoque que hace énfasis en el desarrollo máximo de destrezas básicas para todos los biólogos, a
través de un tronco central de materias docentes, complementado con cursos e investigaciones
que proporcionarán la especialización necesaria para que puedan generar y desarrollar ideas, de
manera que se puedan enfrentar los problemas biológicos existentes en nuestra sociedad. Los
graduados del programa se insertarán con éxito en programas doctorales y actividades relevantes
en investigación.
2. Título del Programa y Grado
Programa de Maestría en Ciencias Biológicas que conlleva el Grado de Maestría con los énfasis
que se describirán más adelante.
3. Duración del Programa
El Programa de Maestría está diseñado para que el estudiante complete los requisitos mínimos
para optar por el título en un período de dos (2) años. Está estructurado por módulos en
cuatrimestres y se completa con la defensa de una tesis de grado la que debe sustentar dentro del
período definido por el Reglamento General de Estudios de Postgrado vigente.
4. Justificación
4.1. Razones generales
Los avances científicos más connotados de los últimos años y los problemas más apremiantes
que enfrenta la humanidad están íntimamente relacionados con la biología. Por ejemplo, la
escasez de alimentos que se soluciona en parte con el desarrollo de la biotecnología y la
ingeniería genética que permite obtener nuevas variedades; la solución de problemas
biomédicos, mediante el proyecto el genoma humano. El conocimiento y protección de la
biodiversidad a través de la biología de la conservación. A nivel comunitario, el crecimiento de
5
las ciudades y el desarrollo industrial presionan para encontrar una vía que no detenga el
desarrollo de nuestros países y al mismo tiempo conservar los recursos naturales.
Dado estas necesidades se hace necesario la actualización de los profesionales de biología en
estos avances tecnológicos que proporcionaran los conocimientos y herramientas necesarias para
la solución de los mismos.
Este Programa ayudará a la movilidad académica de nuestros docentes que podrán presentar
iniciativas que ofrezcan mayores oportunidades de superación académica, lo que redundará en
beneficios para el país. Además, permitirá elevar la productividad y aporte de los docentes
calificados en el extranjero con profundos conocimientos, subutilizados actualmente por no
existir un mecanismo apropiado de desarrollo. El Programa permitirá, por tanto, mejorar la
eficacia de nuestro personal docente.
Los egresados del programa podrán optar por mejores oportunidades académicas y continuar
estudios superiores conducentes a un doctorado. También se generan oprtunidades de empleo,
tanto en el área estatal como en el sector privado, incluso generando sus propias empresas
consultoras o productivas.
4.2. Biología Molecular
La Biología Molecular es el estudio de la vida a nivel de átomos y moléculas. Los biólogos
comprendieron que un mejor entendimiento de un organismo podría ser obtenido estudiando las
células que lo forman. De esta manera descubrieron las estructuras que forman las células, las
sustancias que requieren las células, los productos que ellas hacen y otras características
celulares.
La Biología Molecular lleva el estudio de la vida, a un siguiente paso, estudia las moléculas que
forman los seres vivos, igual que la química puede hacerlo con cualquier otro tipo de molécula.
Es decir trata de entender las interacciones entre varios sistemas de la célula, incluyendo
interacciones entre los diferentes tipos de DNA, RNA y síntesis de proteínas, así como también
como estas interacciones son reguladas.
El desarrollo de la investigación en biología molecular es utilizada además en la medicina
preventiva (desarrollo de vacunas), en el tratamiento (producción de drogas), en la agricultura
(productos biotecnológicos) entre otros.
Panamá cuenta con áreas calientes de la biodiversidad, el conocimiento de esta es necesaria para
desarrollar políticas apropiadas de conservación de las mismas. Las metodologías de la biología
molecular, la filogenética han permitido la caracterización y conservación de la biodiversidad.
Por ejemplo, los marcadores moleculares pueden ayudar a establecer la extensión de la
diversidad dentro de las especies y establecer las prioridades para la conservación.
6
El propósito de este énfasis no es sólo conocer la tecnología, sino más bien preparar a los
participantes a adquirir las habilidades para enfrentar problemas y retos científicos. Proveer las
herramientas intelectuales para desarrollar un enfoque de biología molecular en problemas de
interés local.
4.3. Biodiversidad y Conservación
Las regiones tropicales y en particular Mesoamérica, son parte de las zonas biológicas con
mayor biodiversidad en el mundo, y por lo tanto un área sumamente importante para los
esfuerzos globales de conservación. Con tan solo el 0,5% de la superficie terrestre, alberga el
7% de las especies de plantas y animales a nivel global. Aunado a ello, el Istmo de Panamá
representa el sitio donde ha ocurrido el “gran intercambio biótico de América”, al constituirse en
el gran puente que permitió el intercambio de especies de los hemisferios Norte y Sur, hace
aproximadamente 3millones de años. Sin embargo, la región se ve afectada por diversas
actividades humanas como la deforestación, la fragmentación de los bosques y la transformación
de uso hacia el desarrollo de obras de infraestructura, actividades mineras, ganaderas, y
agrícolas, así como por los efectos de los cada vez más frecuentes eventos climatológicos
provocados por los cambios globales.
Todo lo anterior, supone nuevos retos para la conservación de la biodiversidad en la región
Mesoamericana, de la cual forma parte el Istmo de Panamá, haciéndose imperioso el
incrementar el capital humano para atender las tareas de investigación, docencia y gestión en
relación a las estrategias de conservación y manejo de la biodiversidad, a los más altos niveles
académicos, científicos y tecnológicos. Esto hará viable, las posibilidades de identificar, plantear
y ejecutar políticas, estrategias de manejo y herramientas que mitiguen los impactos humanos y
optimicen la conservación de la biodiversidad y la sostenibilidad ambiental del país.
5. Elementos fundamentales del currículum
5.1. Objetivos del Programa
1.
5.1.1. Objetivos generales:
Contribuir al desarrollo de la Universidad elevando el nivel docente y académico en el
área de las Ciencias Biológicas.
2.
Fortalecer la capacidad nacional de investigación en ciencias biológicas, fomentar la
generación de conocimiento biológico y estimular su proyección hacia la sociedad.
3.
Formar profesionales con una visión moderna e integral de la biología que les permita
asumir una amplia gama de labores, contribuyendo efectivamente, con sus
conocimientos, al desarrollo de nuestro país.
7
1.
5.1.2. Objetivos específicos:
Formación de recurso humano con capacidad de insertarse exitosamente en programas
doctorales y actividades relevantes en investigación.
2.
Aumentar la capacidad de trabajo en equipo para buscar soluciones a problemas
complejos que afectan la calidad de vida en el país.
3.
Desarrollar la capacidad de los biólogos para integrar las áreas de manejo de recursos
bióticos con el desarrollo agropecuario y ecoturismo.
4.
Contribuir a la aplicación del conocimiento especializado en las actividades
empresariales vinculadas a las tecnologías de avanzada.
5.
Incrementar la calidad académica de biólogos y profesionales de otras ciencias afines.
6.
Mejorar la calidad del docente de las Ciencias Biológicas en el sector educativo y
profesional.
6. Perfil del Egresado
El egresado de este programa de maestría demuestra:
Poseer amplios conocimientos de los principios que fundamentan el análisis
biológico aplicado a los problemas ambientales.
Aplicar y adaptar métodos y procedimientos modernos en el campo de las ciencias
biológicas.
Realizar investigaciones en el campo de las ciencias biológicas en la caracterización
que seleccione además, estará preparado para contribuir en la elaboración de artículos
científicos, exponerlos y debatir sus resultados.
Trasladar la experiencia profesional adquirida a otras actividades vinculadas al sector
productivo, tanto público como privado.
Impartir docencia en ciencias biológicas básicas y aplicadas en las áreas relacionadas
con el programa de maestría a nivel superior.
Realizar análisis crítico de la información científica en el campo de trabajo.
8
Generar empresas consultoras o productivas con las técnicas y conocimientos
adquiridos.
Tener preparación y formación para realizar estudios a nivel superior.
Desarrollar un pensamiento crítico y la capacidad creativa para resolver problemas de
ciencias biológicas básicas y aplicadas en las áreas relacionadas con el programa de
maestría.
Manejar las principales fuentes de información periódica en Ciencias Biológicas y
afines, haciendo énfasis en su especialidad.
7. Estrategias Metodológicas
En el desarrollo de la maestría se utilizarán cursos presenciales, semipresenciales, giras o
estudios de campo, conferencias, seminarios, clases prácticas y de laboratorios, discusiones y
presentaciones de artículos científicos, proyectos y estudios de casos. Se promoverá la
movilidad de estudiantes y docentes investigadores del programa.
Se utilizará un sistema modular que consta de asignaturas básicas en un tronco común y dos
áreas de orientación. Estas asignaturas podrán ser colegiadas o no.
8. Plan de estudio
El régimen académico del plan de estudio es modular y las asignaturas serán impartidas en
cuatrimestres que organizará la coordinación académica. Tiene un total de 54 créditos.
8.1. Estructura del Programa de Maestría
El programa de estudio comprende
Curso propedéutico
Asignaturas obligatorias básicas (para todos los énfasis)
Asignaturas obligatorias especializadas para cada énfasis
9
Las áreas de énfasis son:
Biología Molecular
Biodiversidad y Conservación
Esta maestría, de modalidad académica, está orientada a la investigación y por tanto culmina con un
trabajo de investigación o tesis que será defendido ante un tribunal.
10
MAESTRÍA EN CIENCIAS BIOLÓGICAS
2014
MODALIDAD ACADÉMICA
PROPEDEUTICO
Denominación
Fundamentos de Estadística
Inglés Científico
Metodología de la Investigación científica
Abreviatura
-
H.T.
32
16
16
H.L.
-
H.P.
48
32
32
T.
TRONCO COMUN
Primer Cuatrimestre
Denominación
Abreviatura
Biodiversidad
BIO 701
Bioquímica Avanzada
BIO 702
Biología Celular
BIO 703
Análisis de datos y diseño experimental
BIO 704
en biología
Total
H.T.
32
48
48
32
H.L.
-
H.P.
48
48
T.
80
48
48
Cr.
3
3
3
3
CA
12
Segundo Cuatrimestre
Denominación
Biología Molecular
Genética de la conservación
Biología Evolutiva
Seminario de Tesis I
Total
Abreviatura
BIO 705
BIO 706
BIO 707
BIO 708
H.T.
48
48
32
16
H.L.
H.P.
48
-
T.
Cr.
3
4
2
1
10
CA
11
ORIENTACIÓN EN BIOLOGÍA MOLECULAR
Tercer Cuatrimestre
Denominación
Virología Molecular
Inmunología
Genética microbiana y de eucariotas
superiores
Total
Abreviatura
BIO 710
BIO 711
BIO 712
H.T.
H.L.
48
48
48
H.P.
-
T.
Cr.
CA
3
3
3
-
9
Cuarto Cuatrimestre
Denominación
Abreviatura
H.T.
H.L.
H.P.
T.
Cr.
ADN Recombinante
BIO 713
48
-
3
Bioinformática
Técnicas en Biología Molecular
Total
BIO 714
BIO 715
32
16
64
48
-
3
3
9
Abreviatura
H.T.
H.L.
H.P.
Genética de Poblaciones
BIO 716
32
Biotecnología
Marcadores Moleculares
Seminario de Tesis II
Total
BIO 717
BIO 718
BIO 719
32
32
16
Abreviatura
H.T.
H.L.
H.P.
16
128
-
CA
Quinto Cuatrimestre
Denominación
-
-
T.
48
-
Cr.
CA
3
16
2
2
1
8
Sexto Cuatrimestre
Denominación
Actividad Académica Supervisada
Tesis
Total
BIO 709
BIO 720
T.
Cr.
144
1
5
6
CA
12
ORIENTACIÓN EN BIODIVERSIDAD Y CONSERVACIÓN
Tercer Cuatrimestre
Denominación
Biología de la Conservación
Ecología de Poblaciones
Ecología de Comunidades Naturales
Total
Abreviatura
H.T.
H.L.
H.P.
T.
Cr.
48
48
48
96
96
3
4
4
11
BIO 721
BIO 722
BIO 723
48
48
48
-
Abreviatura
H.T.
H.L.
Prácticas de Campo en Ecología
Tropical
Etología
BIO 724
16
BIO 725
32
Herramientas para Análisis del Paisaje
y Conservación
Total
BIO 726
48
CA
Cuarto Cuatrimestre
Denominación
H.P.
T.
32
48
Cr.
CA
2
32
2
96
4
8
Quinto Cuatrimestre
Denominación
Abreviatura
Conservación de Áreas Silvestres
BIO 727
Protegidas
Conservación y Manejo Sostenible de la BIO 728
Biodiversidad
Seminario de Tesis II
BIO 729
H.T.
H.P.
T.
Cr.
32
32
64
3
32
32
64
3
-
16
1
16
H.L.
-
Total
CA
7
Sexto Cuatrimestre
Denominación
Actividad Académica Supervisada
Tesis
Total
Abreviatura
BIO 709
BIO 730
H.T.
H.L.
H.P.
16
128
-
T.
Cr.
144
1
5
6
CA
13
9. Descripción de Asignaturas
Se propone que esta Maestría tenga un tronco central de cursos que permita la actualización en
áreas básicas para la mayoría de las especialidades que pueden ofrecerse en las condiciones
docentes y de infraestructura de la Universidad. Los cursos serían los siguientes.
PROPEDÉUTICO
Asignatura:
Denominación: FUNDAMENTOS DE ESTADÍSTICA
(No otorga créditos para la Maestría).
JUSTIFICACIÓN
El progreso científico depende no solo del adecuado equipo de campo o laboratorio para obtener
los datos, sino del manejo de buenos métodos de colecta, un buen diseño estadístico, así como
del dominio de las técnicas para su análisis. Este aspecto es general para todas las ciencias y la
biología no es la excepción, por ello es necesario que los estudiantes, tanto de los postgrados
como investigadores interesados, dominen los conceptos teóricos de la estadística básica que les
permitan profundizar en el dominio de herramientas de análisis más avanzadas, de uso en la
actualidad.
DESCRIPCIÓN
Se enseñan las formas de realizar algunas pruebas estadísticas básicas, destacándose aquellos
conceptos básicos para la ejecución y análisis de investigaciones biológicas, desde la
planificación. En la medida de lo posible se emplearán ejemplos de experimentos reales, para
presentar los casos y la forma de abordar los problemas biológicos. Se hace énfasis en el uso de
la estadística descriptiva y el diseño experimental, como ayuda para la interpretación adecuada
de los procesos biológicos de interés; de manera que se hará menos énfasis en demostraciones
matemáticas que frecuentemente causan confusión a los biólogos; intentando destacar lo
positivo y fascinante de los análisis estadísticos al momento de interpretar los resultados de una
investigación. Se dedica un tiempo a la elaboración de tablas y gráficos, de manera que el
alumno adquiera la destreza de aprender a comunicar los resultados de investigaciones
científicas de la manera más sencilla y directa. Por último se abordan medidas de asociación
entre variables, los análisis de correlación y regresión, de manera que el alumno cuente con los
fundamentos estadísticos básicos para adentrarse en estudios más complejos que exigen el
dominio de análisis multivariados, considerados en los cursos más avanzados del programa de
estudios.
14
OBJETIVOS
1. Proporcionar un resumen de los principales conceptos, situaciones y opciones involucradas
en análisis estadísticos de datos biológicos, que les permitan incursionar en el uso de
técnicas más avanzados.
2. Demostrar dominio de los procedimientos y opciones de análisis estadísticos básicos, que le
permitan seleccionar y profundizar en el estudio y utilización de herramientas de análisis
más avanzadas.
CONTENIDOS
Introducción: el método científico; descripción del problema, modelos, hipótesis, el papel del
análisis estadístico. Experimentos y otros ensayos; datos, observaciones y variables;
probabilidad; distribución de probabilidades, distribución de variables, distribuciones
estadísticas (Z, T’ Student, 2, F).
Estimación. tamaño de muestra, diseño de muestreo y análisis de poder:: muestras y
poblaciones; determinación del tamaño de muestra para variables continuas y variables
discretas; análisis de poder estadístico, determinación del tamaño del efecto para variables
continuas y variables categóricas o discretas, cálculo del análisis de poder.
Diseño de muestreo: Muestreo simple y estratificado; parámetros y estadístico. Error estándar e
intervalos de confianza; interpretación de los intervalos de confianza. Métodos para estimación
de parámetros. Pruebas de hipótesis estadísticas clásicas para una y dos poblaciones; pruebas
paramétricas; errores de decisión.
Diseño experimental: principios generales, replicación, control, aleatoriedad, independencia;
tipos de diseño, modelos lineares, factoriales, bloques al azar, anidado, cuadrado latino,
mediciones repetitivas
Exploración gráfica de los datos: Análisis de gráficas, transformación y estandarización de
datos.
Correlación y regresión: análisis de correlación; modelos de correlación paramétrica,
covarianza y correlación; región de confianza paramétrica y no paramétrica. Análisis de
regresión linear simple; análisis de varianza (ANOVA); varianza explicada (coeficiente de
determinación); relación entre regresión y correlación; pruebas de poder en correlación y
regresión.
ESTRATEGIAS METODOLÓGICAS
Presentación dialogada con discusiones entre los participantes.
RECURSOS DIDÁCTICOS
Retroproyectores, proyector de diapositivas, proyector de datos (“data show”), ilustración con material del laboratorio, computadoras, videos, pizarra, tiza multicolor, cámara digital, etc.
EVALUACIÓN
Tres pruebas teóricas parciales, ejercicios cortos y un examen final.
15
REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS
Daniel, Wayne W. 1994. Bioestadística. Editorial LIMUSA, Grupo Noriega Editores. México,
D.F. 666 pp.
México Jongman, R.H.G., Ter Braak, C.J.F. and O.F.R. van Tongeren (Eds.) 2002. Data
Analysis in Community and Landscape Ecology. Cambridge University Press.,UK., reprinted.
299pp.
Guisande González, C., Barreiro Felpeto, A. , Maneiro Estraviz, I., Rivero Alarcón, I., Vergara
Castaño, A.R., y A. Vaasminte Liste. 2006. Tratamiento de Datos. Ediciones Díaz de Santos,
España. 356 pp.
Krebs, Charles J. 1998. Ecological Methodology. Addison Wesley Longman Inc., Second
Edition; USA, Canada. 620pp.
McCune, Bruce and James B. Grace with contribution of Dean L. Urban. 2002. Analysis of
Ecological Communities. MjM Software design, Oregon, USA. 300pp.
.
Murray, Logan. 2010. Biostatistical Design and Analysis using R. A Practical Guide. WileyBlacwell, Singapore. 546pp.
Paton, Steven R., Isabel C. Castro y Pádraig Whelan. 1994. Introducción a la Bioestadística de
Campo. Fundación Charles Darwin para las Islas Galápagos, Ecuador. 143p.
Quinn, Gerry P. and Michael J. Keough. 2002. Experimental Design and Data Analysis for
Biologist. Cambridge University Press, UK. 537pp.
Shaw, Peter. J. 2003. Multivariate Statistics for the Environmental Sciences. Arnold Publishers,
London. 233pp.
16
Asignatura
Denominación: INGLES CIENTÍFICO
Créditos: No otorga créditos
JUSTIFICACION
Todo estudiante de postgrado debe dominar un idioma extranjero en adición a la lengua materna.
Es de relevancia el idioma inglés en el área científica. Para los estudiantes de un postgrado en
Biología es imprescindible el conocimiento de este idioma pues hoy todas las referencias
actualizadas sean libros, artículos son en su mayoría en el idioma inglés. Los congresos y
conferencias a nivel internacional de alto nivel son en inglés.
DESCRIPCION:
El programa está diseñado para desarrollar destrezas de compresión de lecturas en inglés
científico a través de un detallado conocimiento de todos los elementos importantes de una
lectura intensiva científica. Loa elementos importantes de una lectura como conocimiento de
vocabulario científico, estrategias para la lectura y adquisición de nuevo vocabulario, elementos
de cohesión, discernimiento del tópico e idea principal de la lectura serán tratados. El propósito
final es que los estudiantes adquieran el nivel intermedio del Centro de Lenguas de la
Universidad de Panamá
OBJETIVO GENERAL
Al finalizar el curso Inglés Científico el estudiante habrá ampliado sus repertorios lingüístico y
estratégico iniciales a un nivel que le permita enfrentarse como lector a la información contenida
en textos de carácter científico y biológico en inglés.
OBJETIVO ESPECIFICOS
Comprenda las unidades léxicas más frecuentemente encontradas en textos de carácter
científico y biológico.
Reconocer automáticamente el significado de unidades léxicas de la lengua general que
se encuentran con alta frecuencia en el discurso científico y biológico en inglés, y
Reconocer automáticamente el significado del léxico semiespecializado o ‘académico’ de mayor frecuencia en el discurso científico y tecnológico en inglés.
Aplique la técnica de lectura más apropiada a sus propósitos como lector en una
situación dada.
Desarrolle la metacognición, o reflexión sobre el propio conocimiento, como elemento
para la aplicación de estrategias de comprensión de lectura en inglés como lengua
extranjera.
Deduzca las relaciones entre oraciones, y entre partes de un mismo texto, mediante
elementos cohesivos
17
Distinga entre la idea principal, las ideas secundarias y la organización del texto
Identifique el propósito principal del autor e integre información para llegar a una
conclusión.
Se familiarice con las expresiones de medida y magnitud para cuantificar las diferentes
unidades utilizadas en inglés científico
Aplique la información obtenida a través de los contenidos del curso a situaciones
nuevas
CONTENIDOS
Listas de vocabulario general y académico de alta frecuencia en inglés.
Técnicas de lectura rápida: skimmingy scanning
Estrategias de comprensión de lectura y metacognición.
Estrategias para determinar el significado de palabras desconocidas:
o Uso de los indicios contextuales, Categorías gramaticales, Prefijos y sufijos,
Cognados y falsos amigos, Sinónimos y antónimos, El sintagma nominal en el
discurso científico-técnico, y Uso del diccionario
Elementos cohesivos tales como referentes y conectores discursivos, entre otros.
Tópico, idea principal y detalles con enfásis en Biología
Patrones de organización del texto (introducción, desarrollo, conclusión).
Inferencias y conclusiones.
Mapas conceptuales.
Expresiones numéricas: contrastes entre el español y el inglés.
Sistema Anglosajón vs. Sistema Internacional de Unidades.
ESTRATEGIAS METODOLOGICAS
Las clases serán conducidas en inglés tanto como sea posible. Sin embargo, el estudiante puede
expresarse en español tanto en las actividades de clase como en las evaluaciones. Las
actividades de aula tienen como fin primordial el desarrollo del procesos cognitivos que faciliten
que el estudiante se convierta en un lector crítico e independiente, es decir, se espera que el
estudiante pueda, entre otros, comparar, analizar, hacer síntesis, investigar, tomar decisiones,
reflexionar, opinar y resolver problemas a partir de su interacción con los textos. Dicho
desarrollo cognitivo se apoya
en la potencialidad epistémica de la tarea de producción y de su interacción con la lectura. Así,
se aprovecha la experiencia de la escritura como herramienta para aprender, asimilar, revisar y
transformar los modos de comprensión y organización de los textos propios de inglés científico
y técnico. Además, se sirve de la escritura para evaluar lo aprendido por el estudiante.
18
RECURSOS DIDÁCTICOS
Retroproyectores, proyector de diapositivas, proyector de datos (“data show”), ilustración con material del laboratorio, computadoras, videos, pizarra, tiza multicolor, cámara digital, etc.
EVALUACIÓN
Dos pruebas teóricas, ejercicios parciales y un examen final.
BIBLIOGRAFIA
Day, R. & others. 2011. Scientific English: A guide for scientist and other professionals. 3th
edition. Greenwood publishers.
Burnham, N.& Hutson, F. 2007. Scientific English as a Foreign Language. Department of
Physics. Worcester Polytechnic Institute100 Institute Road, Worcester, MA 01609-2280 USA.
http://users.wpi.edu/~nab/sci_eng/ScientificEnglish.pdf
Artículos científicos en temas biológicos
19
Asignatura:
Denominación: METODOLOGÍA DE LA INVESTIGACIÓN
Créditos: No otorga créditos
JUSTIFICACIÓN
El entendimiento de los procesos biológicos, la formulación de estrategias de conservación y la
evaluación del impacto de las actividades humanas sobre el medio ambiente y en especial, sobre
los recursos bióticos, la diversidad de ecosistemas, las especies y sus poblaciones, exige que el
profesional de éste campo maneje ciertas herramientas fundamentales, como son el diseño de
proyectos de investigación, metodología para la toma de datos en el campo y el análisis
estadístico. Lo anterior, ha llevado a identificar la necesidad de fortalecer la capacidad de los
profesionales en ciencias biológicas, primordialmente estudiantes de pre y postgrado, para
interpretar adecuadamente los fenómenos vinculados a la naturaleza, y brindar el tratamiento
correcto a las causas de los problemas. Se requiere de metodologías e instrumentales accesibles
a los estudiantes y de fácil aplicabilidad, en los escenarios reales que se presentan. Para encarar
los problemas mencionados, es necesario fortalecer la investigación científica en el país,
mediante la preparación específica de los futuros profesionales para el análisis y resolución de
problemas mediante la realización de investigaciones científicas, por ello el curso de
metodología de la investigación constituye una herramienta de apoyo importante en su
formación.
DESCRIPCIÓN
El curso consiste de exposiciones magistrales y talleres, sobre los aspectos teóricos y
conceptuales básicos de la metodología de la investigación científica en biología. Los
estudiantes harán una revisión bibliográfica
sobre un tema específico, seleccionado
individualmente, elaborarán preguntas de investigación y discutirán criterios sobre la
elaboración de hipótesis de investigación, selección de muestras y técnicas de muestreo.
También analizarán los criterios y técnicas para la toma de datos; ordenamiento y captura en
ordenador; elaboración de gráficas; análisis de datos; redacción de discusión y redacción de
conclusiones de una investigación. Al finalizar el curso, los estudiantes presentarán una
propuesta de investigación corta sobre un tema de su interés personal o laboral; sustentada de
manera oral y escrita. El seminario constará de una sesión semanal de tres horas cada una, en las
que se combinará las clases presenciales a manera de conferencias o exposiciones dialogadas y
el trabajo en régimen de seminario.
OBJETIVOS
Fortalecer la capacidad de los estudiantes para interpretar adecuadamente los fenómenos
vinculados a la naturaleza, las causas de los problemas en su área de conocimiento, mediante el
manejo de herramientas fundamentales en el diseño de proyectos de investigación, el dominio
20
de las metodologías para la toma de datos en el campo y su tratamiento correcto mediante
análisis estadísticos.
CONTENIDO
I: CONOCIMIENTO CIENTÍFICO, MÉTODO Y PROBLEMAS
1. El método científico, naturaleza, exigencias y condiciones
2. Los problemas científicos. La identificación de problemas de Investigación
científica y el diseño de proyectos.
3. El marco teórico de la investigación y la formulación de problemas científicos.
4. Elementos contenidos en el planteamiento de un problema de investigación
5. Objetivos de una investigación: preguntas de Investigación
6. Justificación de la investigación; criterios para evaluar el valor potencial de una
investigación. Viabilidad y consecuencias de una investigación.
II: LA BUSQUEDA Y ANÁLISIS DE LA INFORMACIÓN CIENTÍFICA
1. La búsqueda de información científica:
2. El análisis de la información científica:
3. Análisis crítico e interpretación de la información científica.
4. La comunicación científica: exigencias en la elaboración del informe de investigación
científica.
III : HIPOTESIS CIENTIFICAS, MUESTREO Y MEDICIÓN DE VARIABLES
1. Las hipótesis científicas:
Cómo se relacionan las hipótesis, las preguntas y los objetivos de una Investigación.
Las hipótesis científicas. Características. Funciones. Carácter probabilístico de las
hipótesis científicas. Tipos de Hipótesis;
2. El muestreo y medición de variables
Concepto de variable como característica o atributo.
Las variables y los indicadores en la medición de variables
Definición del número y tamaño de la muestra.
Delimitación y tipo de muestra.
Recolección de datos, medición.
IV. EL DISEÑO DE LA INVESTIGACIÓN,
1. El diseño de la investigación:
21
Que es un diseño de Investigación. Concepto y función del diseño, objetivos y
condiciones.
Tipos de diseños de investigación: descriptivos y explicativos, experimentales y no
experimentales.
Definición de un Experimento; manipulación de variables dependientes versus
independiente.
V. PROTOCOLO DE INVESTIGACIÓN Y REPORTE
Los pasos y las operaciones en la elaboración de un proyecto o protocolo de
investigación.
La búsqueda bibliográfica y el marco teórico de la investigación.
La selección del diseño y las técnicas de recolección, procesamiento y análisis de los
datos de investigación.
El Análisis de datos; elaboración de gráficos y tablas; aplicación de pruebas
estadísticas; manejo de paquetes estadísticos (Software).
Análisis de resultados; interpretación de los resultados de los análisis estadísticos;
cómo se elabora la discusión y las conclusiones, correspondencia con los objetivos
específicos.
Elementos de un protocolo de investigación: portada, titulo, índice, introducción,
justificación, antecedentes, objetivos, objetivos específicos, metodología, cronograma de
actividades, requerimientos y bibliografía.
Instructivo para la elaboración de protocolos de investigación: de encuesta descriptiva y
encuesta comparativa; de un estudio de revisión de casos; casos y controles; de
perspectiva histórica; protocolo de experimento.
ESTRATEGIAS METODOLÓGICAS
Presentación dialogada con discusiones entre los participantes.
RECURSOS DIDÁCTICOS
Retroproyectores, proyector de diapositivas, proyector de datos (“data show”), ilustración con material del laboratorio, computadoras, videos, pizarra, tiza multicolor, cámara digital, etc.
EVALUACIÓN
Dos pruebas teóricas, ejercicios parciales y un examen final.
REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS
Bernal T. C. 2002. Metodología de la Investigación. Ed Limusa, México.
Cargill, M. y P. O’Connor. 2009. Writing scientific research articles. Strategy and steps. WileyBlackwell, Oxford, UK.
22
Feinsinger, P. 2001. Designing Field Studies for Biodiversity Conservation. The Nature
Conservancy. Island Press; Washington, Covelo, London.
Hernández Sampieri, R. y Otros. 2007. Metodología de la Investigación. Cuarta Edición. Ed.
Mc Graw Hill. México. Libro Digital: http://www.metabase.net/docs/unibe/03624.html
Méndez R. I; Namihira G. 2000. El Protocolo de Investigación (Lineamientos para su
elaboración y Análisis). Ed. Trillas. México.
Quinn, G.P. & M.J. Keough. 2002. Experimental Design and Data Analysis for biologists.
Cambridge University Press.
Sitios WEB:
Búsqueda de Información Científica
http://www.uprm.edu/library/docs/tutorias/BusquedaInformacionCientifica.pdf
http://www.uprm.edu/library/docs/tutorias/BuscandoInformacionConfiableGoogle.pdf
Bravo Salinas,N.H. 2006. El seminario Investigativo – El seminario como práctica
pedagógica para la formación integral. Dirección URL:
http://www.cun.edu.co/docentes/2_taller_pedagogia_CUN_2006A/modelos_de_formacion/3
_estrategias_pedagogicas/3_2_Seminario%20Investigativa/32ELSE_1.DOC.
Flórez Weidinger,L. A. Cómo encontrar información confiable de manera eficaz.
http://bioinformate.uniandes.edu.co/cap1.
Universidad EAFIT 2005. Apuntes de metodología de la investigación - Un resumen de las
principales ideas para el desarrollo de proyectos de investigación. Versión 2.5. 14-052005.Dirección URL:
http://www.controlsystems.net/recursos/i_mas_d/info/apuntes_metodologia_doc.pdf
El seminario Investigativo Alemán. 2002. Dirección URL:
www.iue.edu.co/tmp/des/inv/seminario_investigativo_2002.doc
23
TRONCO COMUN
Asignatura: BIO 701
Denominación: BIODIVERSIDAD
Créditos: 3
JUSTIFICACIÓN
La diversidad biológica o biodiversidad comprende la variedad de ecosistemas y seres vivos sobre
la tierra y los patrones naturales que la conforman, resultado de miles de millones de años de
evolución según procesos naturales y también de la influencia creciente de las actividades del ser
humano. La biodiversidad comprende igualmente y las diferencias genéticas dentro de cada especie
que permiten la combinación de múltiples formas de vida, y cuyas mutuas interacciones con el resto
del entorno fundamentan el sustento de la vida sobre el planeta. A lo largo de la evolución de la vida
sobre la tierra han ocurrido procesos constantes de aparición y desaparición de especies, pero en los
últimos siglos, y particularmente en las últimas décadas, el impacto del ser humano sobre el medio ha
llevado a una tasa de pérdida de especies sin precedentes. La biodiversidad está en crisis
principalmente debido a las acciones humanas sobre su entorno, lo que ha conducido a un acelerado
proceso de destrucción de la biósfera en general. Ello conduce a la necesidad de incrementar el
conocimiento sobre esta materia y fortalecer las capacidades, científicas y tecnológicas que permitan
conocer, valorar, y conservar este valioso recurso natural.
DESCRIPCIÓN
La asignatura Biodiversidad busca proporcionar a los estudiantes del Programa de Maestría en
Ciencias Biológicas los fundamentos sobre las diferentes escalas que comprenden la biodiversidad, lo
mismo que herramientas para su medición, su dimensión en una escala espacial, su relación con
diferentes disciplinas biológicas y físicas, y la situación a nivel local y regional. Un logro final sería
que los estudiantes y egresados diseñen proyectos de investigación relevantes en la búsqueda de
soluciones para la problemática de la biodiversidad, tanto a nivel nacional, como regional.
OBJETIVOS
Comprender la importancia de la biodiversidad para el funcionamiento de los ecosistemas y
su mantenimiento, así como el valor de su conservación y uso.
Aplicar herramientas para medir la biodiversidad a distintos niveles y su aplicación para el
manejo de sistemas y en el desarrollo y evaluación de proyectos, y como objeto de estudio
científico.
24
CONTENIDOS
1. Introducción al estudio de la biodiversidad
Definiciones y conceptos generales sobre biodiversidad
Importancia de la biodiversidad
Niveles de estudio de la biodiversidad (genes, especies, poblaciones, comunidades,
ecosistemas, paisaje)
Cambios en la biodiversidad a través del tiempo y el espacio
Problemática actual.
2. Origen y dimensiones de la Biodiversidad.
Origen de la Biodiversidad.
o Teorías que explican el origen de la biodiversidad
Enfoque biogeográfico
o Deriva continental y sus consecuencias
o Teoría de MacArthur y Wilson; reglas de composición de una comunidad insular;
predicciones; efectos del área, altitud y distancia al continente.
Enfoque ecológico
o Dispersión, colonización, eventos fundadores, radiación adaptativa, aislamiento y
evolución
o Extinciones y diversificaciones.
o Especies invasoras e invasiones biológicas.
3. Estimación de la biodiversidad global
Grupos de organismos biológicos: bacterias, hongos, protozoos; animales, plantas: grandes
contribuyentes a la biodiversidad global
4. Medición de la biodiversidad
Diversidad Alfa
Diversidad Beta
Diversidad Gamma
Métodos para la medición de la biodiversidad
o Selección de Grupos Indicadores
5. Inventarios y monitoreo de la biodiversidad
Importancia de los inventarios de biodiversidad
Consideraciones prácticas para el diseño de muestreo
o Toma de datos en campo
o Almacenamiento y manejo de la información
o
6. Muestreo de la biodiversidad
25
Muestreo, censo y seguimiento
Estrategias de censo y muestreo
Curvas especie-área y rarefacción
Curvas de adecuación del esfuerzo de muestreo
Captura con marcaje y recaptura
7. Descripción de la biodiversidad:
Índices numéricos
Riqueza y rarefacción
Medidas de similitud y de distancia.
8. Conservación de la biodiversidad
Factores que afectan la biodiversidad:
o Extinción de especies,
o El fuego y sus consecuencias sobre la diversidad.
o Fragmentación del paisaje
o Cambio climático
o Especies invasoras
o Especies transgénicas
Valoración económica de la biodiversidad y servicios ambientales
9. Convenios internacionales y marco legal sobre diversidad biológica.
Convención sobre Diversidad Biológica
Relevancia de la biodiversidad en biología de la conservación y en la gestión ambiental.
o Sistema Nacional de Areas Silvestres Protegidas
EVALUACIÓN DE LOS APRENDIZAJES
Lecturas, resúmenes escritos
Presentaciones, debates y talleres
Monografía, prueba sumativa final.
REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS
Badgett, R.D.; M.B. Usher and D.W. Hopkins (Eds.). 2005. Biological Diversity and Function in
Soils. Cambridge University Press, U.K.; 411 p.
Chazdon, R. & T. C. Whitmore. 2002. Foundations of Tropical Forest Biology. The University of
Chicago Press, Chicago. 862 p.
26
Feisinger, P. 2001. Designing field Studies for Biodiversity Conservation. The Nature Conservancy,
Island Press, Washington, Covelo, London. 212p.
Galindo-Leal, C. et al. 2003. The Atlantic Forest of South America: Biodiversity Status, Threats and
Outlook. Island Press, Washington. 488 p.
García, R. 2002. Biología de la Conservación: Conceptos y Prácticas. PNUD, CBM, INBio. Editorial
INBio. 166 p.
Groom, M.J., K.M. Meffe & C.R. Carroll. 2006. Principles of Conservation Biology. Third edition.
Sinauer Associates, Inc. Sunderlads, Massachusetts, USA. 779 p.
Guariguata, M. R. y G. H. Kattan (comp.). 2002. Ecología y Conservación de Bosques Neotropicales.
Libro Universitario Regional. Costa Rica. 691 pp.
Hall, B.G. 2007. Phylogenetics Trees Made Easy: A How-To Manual. 3ra. edición. Sinauer
Associates, Sunderland, Massachusetts
Hanski, I. & M. E. Gilpin. 1997. Metapopulation Biology: Ecology, Genetics, and Evolution.
Academic Press, San Diego, CA. USA. 512 p.
Hubbell, S.P. 2001. The Unified Neutral theory of Biodiversity and Biogeography. Monographs in
populations Biology 32. Princeton University Press, New Jersey. 375p.
Leight, E.G.; Dea, A.; and G.J. Vermeij. 2014. Historical Biogeography of the Isthmus of Panama.
Biological Reviews 89:148-172.
Losos, E. C. and E.G. leigh, Jr. 2004. Tropical Forest Diversity and Dynamism. Findings from a
Large.Scale Plot Network. The University of Chicago Press. USA; 645p.
Moreno, C.E. 2001. Métodos para medir la biodiversidad. M & T-Manuales y Tesis SEA, vol. 1.
Zaragoza, España. 84 p.
Roubik, D.W.; Sakai, S. and A.A.hamid-Karim. 2005. Pollination Ecology and the Rain Forest.
Sarawak Studies. Ecological studies 74. Springer, U.S.A. 307p.
Williams, D.M & M.C. Ebach. 2008. Foundations of Systematic and Biogeography. Springer Science
+ Business Media. New York
World Conservation Monitoring Centre. 1992.Global Biodiversity. Chapman & Hall. 585 pp.
.
Asignatura: BIO 702
Denominación: BIOQUIMICA AVANZADA
27
Créditos: 3
OBJETIVOS GENERALES:
Al finalizar el curso, el estudiante debe ser capaz de interpretar el significado bioquímico y
fisiológico de las rutas metabólicas más importantes de microorganismos; comprender los
mecanismos que regulan las velocidades de rutas metabólicas en condiciones aeróbicas y
anaeróbicas; aplicar el conocimiento bioquímico en otras disciplinas biológicas; obtener
información científica mediante la revisión de literatura primaria actualizada; preparar
presentaciones y comunicarse e interactuar con la comunidad científica.
CONTENIDO:
Módulo No. 1:
Concepto de proteoma
Estructura de alpha-aminoácidos proteicos
Niveles estructurales proteicos
Modificación postraduccional de proteínas
Métodos de purificación de proteínas Enzimas
Cofactores
Clasificación Cinética enzimática
Mecanismos de catálisis de enzimas seleccionadas
Mecanismos de catálisis
Mecanismo de reacción de la Anhidrasa Carbónica
Mecanismo de reacción de la Ribonucleasa Pancreática
Mecanismo de reacción de la Quimotripsina
Enzimas de restricción
Módulo No.2:
Concepto de transducción
Componentes de un sistema de transducción
Sistema de transducción de la adenilato ciclasa
Sistema de transducción de la fosfolipasa C
Respuesta metabólica
Mecanismo de acción de las toxinas de Y. cholerae y B. pertussis
Complejo piruvato deshidrogenasa
Ciclo de Krebs
Fosforilación oxidativa
Cadena respiratoria
Desacopladores Inhibidores
Fotosíntesis
Módulo No.3:
28
Metabolismo de carbohidratos
Absorción de monosacáridos
Glucólisis Vía de las pentosas
Glucogenogénesis
Glucogenolisis
Gluconeogénesis
Vía de Entner-Doudoroff
Ciclo del glioxilato
Metabolismo de lípidos
Lipogénesis
Biosíntesis de fosfolípidos
Biosíntesis de triacilgliceroles Lipólisis B-oxidación de ácidos grasos
Cetogénesis
Cetolisis
Biosíntesis del colesterol
Sales biliares
Metabolismo de proteínas y otros compuestos nitrogenados
Absorción de u-aminoácidos
Metabolismo de o-aminoácidos
Ciclo de la urea
Metabolismo de la cadena hidrocarbonada de u-aminoácidos
Biosíntesis de u-aminoácidos Folato y cobalamina
Metabolismo de compuestos nitrogenados en bacterias
Metabolismo de nucleótidos Síntesis de nucleótidos púricos
Degradación de nucleótidos púricos
Síntesis de nucleótidos pirimidínicos
Degradación de nucleótidos pirimidínicos
Vías de salvamento
Módulo No.4:
Investigación y presentación de temas selectos (Actualizados después de cada promoción)
Sulfur metabolism in microorganisms
Nitrogen metabolism in microorganisms
One-carbon metabolism in microorganisms Signal transduction in microorganisms
Methanotrophs
Photosynthesis in bacteria
Fermentations Bioremediation
Parasite biochemistry Efflrcient or effective microorganisms Nitrifying and denitrifying
bacteria
Topoisomerase of pathogenic protozoa
Cyanide biodegradation
Bacterial celulase
29
BIBLIOGRAFÍA:
1. Campbell MK, Farrel SO. 2014. Biochemistry. 8th. Ed. Cengage Learning, CT, USA
2. Stryer, L.; Berg, J.; Tymoczko, J. Biochemistry.2012, Seventh Edition. W.H. Freeman.
3. Voet, D., Voet J. and Pratt C. Biochemistry. 2011. Fourth Edition. Wiley.
4. Metzler, D. Bioquímica: Las Reacciones Químicas en las Células Vivas; Ediciones
Omega, S.A. Barcelona, España, 1981.
5. Walsh, C. Enzymatic Reaction Mechanisms; W. H. Freeman and Company, New
York,1979.
V. Evaluación:
Pruebas Parciales 40%
Prueba Semestral35%
Presentaciones 25%
Asignatura: BIO 703
Denominación: BIOLOGÍA CELULAR
30
Créditos: 3
JUSTIFICACIÓN
La biología celular es una disciplina básica para el biólogo de la época moderna por cuanto que
le permite la comprensión de procesos fundamentales como el desarrollo de los seres vivos,
cómo el ambiente influye sobre el organismo y a diferenciar el estado de salud de la enfermedad.
El estudio de las estructuras celulares y subcelulares, permite conocer el papel de cada organelo
en el contexto de la regulación de la expresión genética y el desarrollo de enfermedades así
como las bases celulares de la terapia, de la interacción y comunicación celular; del proceso de
envejecimiento y del impacto del ambiente sobre los sistemas biológicos. La Biología Celular es
la base de muchas disciplinas científicas y ofrece un conjunto de técnicas útiles para dilucidar
fenómenos biológicos de la célula como unidad de la vida.
DESCRIPCIÓN
La Biología Celular estudia la estructura y función de la célula. Comprende el origen y
organización de células procariotas y eucariotas y la composición, función e interacción de las
organelas que constituyen dichas células así como los mecanismos bioquímicos y fisiológicos
que explican la señalización intercelular e intracelular. Se estudian procesos como metabolismo
celular, compartimentalización subcelular, flujo de información genética, comunicación celular,
ciclo celular. Se describen aplicaciones de la biología celular a la biología de sistemas, a las
relaciones evolutivas entre genomas diferentes y entre los mecanismos de señalización que
permitirían los conocimientos de sistemas biológicos complejos.
OBJETIVOS
Conocer la organización estructural de las células procariotas y eucariotas.
Integrar la función de cada organela en el funcionamiento de la célula.
Aplicar la biología celular a la biología de sistemas.
CONTENIDO
Células procariotas y eucariotas
o Origen de las células: concepción evolutiva
o Estructura general de las células procariotas
o Estructura general de las células eucariotas: Organelas.
Biomembranas: organización, estructura y funciones
o Técnicas de estudio
o Estructura: lípidos y proteínas
o Funciones
o Transporte
o Señalización
o Excitabilidad
o Endomembranas
31
o Selección y transporte de componentes celulares.
Señales intercelulares
o Generalidades de las señales extracelulares
o Receptores acoplados a proteína G y sus efectores
o Receptores de tirosina cinasa y ras
o Vìas de MAP cinasa
o Segundos mensajeros
o Células excitables
Estructura y función
Propiedades de los canales iónicos.
Técnica de patch-clamp
Biopotenciales
Neurotransmisores, sinapsis y transmisión de impulsos
Receptores
Transducción
EnergéticaCelular
o Oxidación de la glucosa y de los ácidos grasos
o Transporte de electrones y fosforilación oxidativa
o Etapas de la fotosíntesis
o Análisis molecular de la fotosíntesis
o Metabolismo del CO2 durante la fotosíntesis
CicloCelular
o Generalidades del ciclo celular
o Estudios bioquímicos
o Estudios genéticos
o Control del ciclo celular
Mecanismos moleculares que regulan mitosis
o Alteraciones del ciclo celular: bases celulares del cáncer
RECURSOS DIDÁCTICOS:
- Multimedia, videos, pizarra, carteles ilustrativos.
EVALUACIÓN:
Exámenes parciales, presentación de artículos, resumen de artículos, examen final.
Cada estudiante deberá realizar una presentación sobre 3 artículos que el profesor le
proporcionará. Los artículos deberán ser presentados en una exposición de 15 minutos durante
los cuales el estudiante podrá hacer uso de cualquier recurso audiovisual que considere
necesario.
Se suministrará material adicional y complementario a la bibliografía citada. Una vez
entregado este material se espera que el estudiante lea dicho material y esté en capacidad de
hacer un resumen del mismo.
32
REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS:
Bruce Alberts, Dennis Bray, Karen Hopkin, Alexander D Johnson. 2013. Essential Cell
Biology, 4th Edition. Garland Science, NY, USA
Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, David Morgan. Molecular Biology of
the Cell 2014. 6th. Ed. Garland Science, NY, USA
Campbell MK, Farrel SO. 2014. Biochemistry. 8th. Ed. Cengage Learning, CT, USA
Cooper, Geoffrey . The Cell: A Molecular Approach. 2013. 6th Ed. Sinauer Associates, Inc.
MA, USA.
Karp Gerald. Cell and Molecular Biology: Concepts and Experiments. 2013. 7th Ed. Wiley
& Sons. MA, USA.
Lodish Harvey , Berk Arnold , Kaiser Chris A. Krieger Monty. Molecular Cell Biology.
2012. 7th. Ed. NY, USA
Sperelakis Nicholas. Cell Physiology2012. 4th. Ed.Academic Press, MA, USA.
Lim Wendell, Mayer Bruce, Pawson Tony. Cell Signaling. 2014. 1st Ed. Garland Science.
NY, USA.
33
Asignatura: BIO 704
Denominación: ANÁLISIS DE DATOS Y DISEÑO EXPERIMENTAL EN BIOLOGÍA
Créditos: 3
JUSTIFICACIÓN
En las últimas décadas, ha ocurrido un gran desarrollo de paquetes para el análisis estadístico de
datos que incrementan la precisión en el análisis y estimación de parámetros biológicos y
ecológicos. Los métodos ayudan a estimar el tamaño de la muestra adecuada para describir los
fenómenos que se estudian; de manera que se pueda ser más eficiente al realizar los trabajos de
investigación biológica, con el mínimo de trabajo y la máxima precisión. Con el avance de la
moderna biología molecular y la ecología aplicada a la conservación, cada vez se ha hecho más
demandado por la comunidad científica el formar biólogos competentes en el uso de
herramientas de análisis que les permitan hacer una adecuada interpretación y divulgación de los
datos ante la comunidad científica.
DESCRIPCIÓN
El curso está diseñado para estudiantes de grado o investigadores en sistemas biológicos; de
manera que no se abordan demostraciones de teoremas ni argumentos rigurosos de la teoría
estadística que a veces resultan incomprensibles para el biólogo promedio. Sin embargo, el
mismo requiere el dominio previo de un curso introductorio a la estadística, que actualice el
dominio de conceptos básicos como error estándar, varianza y límites de confianza. Se intenta
traducir las recomendaciones estadísticas a un lenguaje biológico, de manera que pueda ser
aplicado en el mundo real para investigar y divulgar los resultados de las investigaciones en
ciencias biológicas. Se provee al estudiante de la mayoría de los principales conceptos
estadísticos y pruebas, empleando ejemplos de datos biológicos de la vida real; evitando el
sobreuso de descripciones matemáticas complejas. Se hacen énfasis en los principios del diseño
y análisis estadístico de datos biológicos, y al mismo tiempo se extiende en horas de práctica
destinadas al uso de los programas (software) de análisis más empleados en la actualidad;
considerando que el biólogo generalmente no elabora sus propios programas de análisis de
datos, sino que acude a software de análisis estadísticos disponibles en el mercado; algunos de
ellos de uso libre disponibles en la web, como PC-ord y R.
OBJETIVOS
1. Dominar los principales conceptos, situaciones y opciones involucradas en análisis
estadísticos de datos biológicos, mediante el uso de técnicas actualizadas.
2. Proveer documentación y herramientas de software que habilite a los estudiantes a
desarrollar un nivel adecuado de capacidad para trabajar con datos reales sobre problemas
biológicos y ambientales, que permitan divulgar los conocimientos arrojados por las
34
investigaciones biológicas realizadas, con el margen de rigurosidad exigido por la
comunidad científica internacional..
CONTENIDOS
Análisis de regresión múltiple: modelos de regresión linear múltiple; análisis de
varianza, diagnóstico de regresión, diagnóstico de gráficas; colinearidad, interacciones
en regresión múltiple; regresión polinomial; modelos no lineares.
Comparando grupos o tratamientos: diseños unifactoriales (de una vía), diagnósticode
ANOVA, comparaciones de medias. Análisis de varianza multifactorial, diseños
anidados; diseños factoriales. Diseños de bloques al azar y mediciones de repetición
simple; diseños de dos factores sin réplica: análisis, interacciones y supuestos; diseños
más complejos, software. Diseños parcialmente anidados, análisis, supuestos,
comparaciones específicas, pruebas de poder; software.
Análisis de covarianza (ANCOVA). Modelos lineares generalizados y regresión
logística, regresión de Poisson; modelos para datos correlacionados. Análisis de
frecuencias; tablas de contingencia; modelos log-lineares.
Introducción a los análisis multivariados: datos, distribuciones y asociaciones,
combinaciones lineares, vectores y valores eigen, derivación de componentes; distancia
multivariada y medidas de dissimilitud; comparación de matrices; estandarización de
datos; análisis de gráfico y datos. Análisis multivariado de varianza (MANOVA) y
análisis de función discriminante. Análisis de componentes principales (PCA), análisis
de correspondencia (DCA), análisis de correspondencia canónica (CCA), análisis de
redundancia. Escalamiento multidimensional y análisis de cluster, escalamiento clásicoanálisis principal coordinado (PCoA); clasificación, análisis de cluster; escalamiento
ordinario y cluster para datos biológicos.
Presentación de resultados: presentación del análisis, exposición de tablas y gráficos,
resúmenes de los datos, presentaciones orales.
ESTRATEGIAS METODOLÓGICAS
Presentación dialogada con discusiones entre los participantes. Talleres prácticos en laboratorio
informático para elaboración de tablas de datos, elaboración e interpretación de gráficos, uso de
software, análisis e interpretación de datos.
RECURSOS DIDÁCTICOS
Proyector de datos (“data show”), computadoras portátiles, software de análisis estadístico;
acceso a la web, videos, tablero blanco, pilotos de colores.
35
EVALUACIÓN
Tres pruebas teóricas y presentación oral de un trabajo final.
REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS
Jongman, R.H.G., Ter Braak, C.J.F. and O.F.R. van Tongeren (Eds.) 2002. Data Analysis in
Community and Landscape Ecology. Cambridge University Press.,UK., reprinted. 299pp.
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Castaño, A.R., y A. Vaasminte Liste. 2006. Tratamiento de Datos. Ediciones Díaz de Santos,
España. 356 pp.
Krebs, Charles J. 1998. Ecological Methodology. Addison Wesley Longman Inc., Second
edition; USA, Canada.620pp.
McCune, Bruce and James B. Grace with contribution of Dean L. Urban. 2002. Analysis of
Ecological Communities. MjM Software design, Oregon, USA. 300pp.
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Murray, Logan. 2010. Biostatistical Design and Analysis using R. A Practical Guide. WileyBlacwell, Singapore. 546pp.
Quinn, Gerry P. and Michael J. Keough. 2002. Experimental Design and Data Analysis for
Biologist. Cambridge University Press, UK. 537pp.
Shaw, Peter. J. 2003. Multivariate Statistics for the Environmental Sciences. Arnold Publishers,
London. 233pp.
36
Asignatura: BIO 705
Denominación: BIOLOGIA MOLECULAR
Créditos: 3
JUSTIFICACIÓN
Relación con el perfil: Esta asignatura constituye una parte de la formación del
estudiante de postgrado debido a que la misma se relaciona con el bloque de
conocimientos definidos en el perfil por competencias. El estudiante de la Maestría en
Ciencias Biológicas debe tener un adecuado conocimiento de la Biología Molecular
ya que el estudio a nivel molecular de los procesos biológicos es hoy hacia donde se
dirige la mayor parte de la investigación biológica, y los procesos entendidos a este
nivel permiten una comprensión amplia y profunda de los sistemas vivos. El conjunto
de conocimientos teóricos prácticos y aplicados que se le proporciona al estudiante
actúa como un catalizador fundamental en la comprensión de muchos de los
desarrollos teóricos que se abordan en diversas asignaturas de la Maestria.
El conocimiento actualizado de las principales técnicas de obtención y análisis del
material biológico es, por tanto, capital para todo estudiante de Ciencias Biologicas.
sean cuales sean sus intereses de especialización futura. La materia de Fundamentos de
Biología Molecular tiene la importante responsabilidad de proporcionar al alumno este
necesario conjunto de saberes teóricos , cuya finalidad última pretende capacitarle para
la manipulación analítica de muestras biológicas
DESCRIPCIÓN
La Asignatura Biología Molecular consta de seis módulos a desarrollar: DNA:
estructura y replicación, Transcripción y procesamiento del ARNm, síntesis de
proteínas, regulación de la expresión génica, mutación, reparación y recombinación,
técnicas de biología molecular.
.
En esta materia se pretende alcanzar un conocimiento general y suficientemente
amplio de los fundamentos teóricos y las principales
técnicas de la biología
molecular.
Módulos que incluye; 6 descritos de la siguiente forma:
1.
2.
3.
4.
5.
6.
DNA: Estructura y replicación.
Transcripción y procesamiento DEL ARNm
Síntesis de proteínas
Regulación de la expresión génica.
Mutación, reparación y recombinación.
Técnicas de biología molecular.
37
SÍNTESIS DE METODOLOGÍA Y EVALUACIÓN
Se propone utilizar metodologías constructivistas, que promuevan la participación
activa de los estudiantes y cuyas evaluaciones formativas y sumativas comprueben la
adquisición de competencias.
COMPETENCIAS QUE DEBERÁN SER ADQUIRIDAS:
Básicas:
o Capacidad de Lectura-escritura.
o Recolecta, organiza y analiza información.
Competencias genéricas:
o
o
o
o
o
Capacidad de abstracción, análisis y síntesis.
Comunicación oral y escrita en lengua nativa.
Capacidad de aplicar los conocimientos en la práctica
Habilidad para trabajar en forma autónoma.
Capacidad de trabajo en equipo
Competencias específicas:
o Comprende sobre las generalidades de la biología molecular explicando de
forma correcta la estructura y función de los ácidos nucleicos. Relaciona el
conocimiento y comprende la replicación del ADN y las diferencias entre
eucariotas y procariotas.
o Relaciona el conocimiento y comprende la transcripción y procesamiento
del ARNm en procariotas y eucariotas.
o Comprende la síntesis de proteínas, identificando los mecanismos y etapas
de la transcripción en procariotas y eucariotas.
o Determina la importancia de la regulación de la expresión del gen a través
de ejemplos tanto en eucariotas como en procariotas.
o Conoce los conceptos básicos de la mutación, reparación y recombinación
del DNA y relaciona estos conocimientos con algunas enfermedades
genéticas.
o Alcanza un conocimiento general y de los fundamentos teóricos y las
principales técnicas de la biología molecular
38
CONTENIDOS
Módulo 1:
DNA: Material genético
1.1. Estructura del ADN
1.3. Replicación semiconservativa
1.4 Características generales de la replicación del ADN.
Módulo 2: RNA: Transcripción y procesamiento del ARNm
2.1 Ácido Ribonucleico(ARN)
2.2. Transcripción
2.2.1. Características generales.
2.2.2. Etapas de la transcripción
2.2.3. Transcripción en eucariotas
2.2.3.1.Iniciacion
2.2.3.2. Elongación.
2.2.3.3. Procesamiento del pre-mRNA en los eucariotas.
2.3 RNA funcionales
2.3.1 RNA nuclear pequeño(snRNA)
2.3.2. Autoempalme de los intrones y el mundo del RNA
2.3.3. RNA de interferencia pequeño(siRNA)
2.3.4. Spliceosoma
2. 3.6 Ribozimas
Módulo 3:
Síntesis de proteínas
3.1. Colinealidad de los genes y las proteínas
3.2. El código genético.
3.3. ARN de transferencia(ARNt)
3 .4 . Ribosomas
3. 5. Proceso de traducción
Módulo 4: Regulación génica
4.1 Regulación transcripcional en procariotas.
4.1.1. 1nduccion y represión
4.1.2. El operón lac
4.1.3. Generalidades la transcripción en el operón triptófano.
4.2. Regulación de la transcripción en eucariotas.
39
4.2.1. Panorama general
4.2.2. Secuencias reguladoras en los genes codificantes de proteínas.
4.2.3. Activadores y represores de la transcripción
4.2.4. La cromatina y la regulación génica en eucariotas.
4.2.5. La epigenética
Módulo 5: Mutación y reparación del ADN
5.1 Mutaciones
5.2 Mecanismo de reparación del DNA
Módulo 6: Técnicas utilizadas en biología molecular y sus
aplicaciones
6.1 Electroforesis en gel
6.2. Endonucleasas de restricción
6.3. Hibridación del ADN.
6.4 Sondas de ADN
6.5 Aislamiento de ADN
6.6 Clonación del ADN
6.7 Oligonucleótidos sintetizados con métodos químicos
6.8 Reacción en cadena de la polimerasa (PCR)
6.9 Huellas de paternidad
6.10. Secuenciación
6.11. Análisis del genoma completo
6.12. Análisis genómico comparativo
METODOLOGÍA Y RECURSOS
Se desarrollara el temario mediante clases expositivas y participativas tipo magistral;
elaboración de mapas conceptuales, investigaciones bibliográficas, discusiones grupales.
EVALUACIÓN
Se evaluarán los conocimientos y habilidades teóricas y prácticas, así como la
participación y trabajo desarrollado por el alumno en todas las actividades docentes de la
asignatura a lo largo del curso. Para esto se utilizarán diferentes modalidades de
evaluación: diagnostica, formativa y sumativa.
La evaluación final se distribuirá de la siguiente forma:
• Examen parciales (mínimo 2), 30%-40%
40
• Otras actividades (trabajos en grupos, seminarios, proyectos etc.) y Laboratorio, 20% 30%
• Examen Final 30%-40%
Se sugiere hacer al final del semestre una evaluación del curso por parte de los
estudiantes con la finalidad de mejorar el proceso enseñanza aprendizaje.
BIBLIOGRAFÍA
Krebs, J., Goldstein, E & Kilpatrick, S. 2014. Genes XI. Jones & Barlett learning
Griffiths J.F., Weesler R F, Lewontin S., Carroll B. Genética. Editorial McGRAWHill/INTERAMERICANA DE ESPAÑA, S.A.U. 2008
Lodish H, Berk A, Matsudaira P, Kaiser C A, Krieger M, Scott M P, Zipursky, S, L,
Darnell J. Biología Celular y Molecular. Editorial Médica Panamericana S. A. 2006
Bretscher A, S L, Ploegh H. Molecular Cell Biology. 6* Edition. U.S.A., W.H.Freeman &
Co Ltd; 2007.
DM Vasudevan, Sreekumari S, Kannan V.Texto de Bioquímica. Editorial Medical
Pubblishers, INC. 2011.
Otras referencias:
Alberts B, Bray D, Hopkin K, Johnson A, Lewis J, Raff M, Roberts K y Walter P.
Introducción a la Biología Celular. 3a Edición. España, Editorial Médica. Panamericana S.A.;
2011.
Alberts B, Jonson A, Lewis J, Raff M, Roberts K, Walter P. Molecular Biology of the
Cell. 5a edition. Garland, Nueva York, EE.UU. 2008
De Robertis E, Hib J. Fundamentos de Biología Celular y Molecular de De Robertis. 4ta
Edición, 2004. Editorial El Ateneo, Argentina
Karp G. Biología Celular y Molecular. Conceptos y Experimentos. 4a edición. México,
Editorial Me Graw-Hill, 2006.
Flanagan, N. (2005), Bioresearch Highlights: Significance of SNPs. Gen, 25:1.
Palladino, M.A. (2006). Understanding The Human Genome Project, 2 Ed. Benjamin
Cummings.
Lodish H, Berk A, Matsudaira P, Kaiser CA, Krieger M, Scott MP, Zipursky SL, Damell
J. Molecular Cell Biology. Fifth Edition. 2003, W. H. Freeman and Company, New York.
41
Paniagua R, Nistal M, Sesma P, Alvarez-Uria M, Fraile B, Anadón R, Saez FJ. Biología
Celular. 3a edición. México, Me Graw- Hill .Interamericana; 2007
Wilson J, Hunt T. Molecular Biology of the Cell: The Problems Book. Fifth Edition. Garland
Science; 2007
Asignatura: BIO 706
Denominación: GENÉTICA DE LA CONSERVACION
CRÉDITOS: 4
JUSTIFICACIÓN
El curso Conservación Genética se ofrece a estudiantes de la Maestría en Biología de la Facultad
de Ciencias Naturales, Exactas y Tecnología de la Universidad de Panamá. El tema de la
Conservación Genética ha venido en desarrollo tras la aparcición de marcadores moleculares que
nos permiten discriminar tanto intra como interspecíficamente a las poblaciones naturales y hacer
uso de esta información para el monitoreo y recuperación de especies (muchas veces endémicas)
en peligro de extinción. El curso analiza y discute los principios de Conservación Genética, tanto
teóricos y prácticos (estudio de casos) e incluye algunas bases para la interpretación de los
análisis moleculares utilizados comúnmente en la medición de la diversidad genética de
poblaciones amenzadas; todo lo cual permitirá al estudiante transmitir su conocimiento con
nuevas estrategias. Es la intención de este programa inculcar en el discente un sentido de análisis
que le permita ser más responsable en la propuesta de planes de manejo de especies en riesgo.
Descripción
El curso Conservación Genética tiene como finalidad el análisis y discusión de los fenómenos
que deben ser considerados para medir la diversidad genética de especies en peligro como base
para la implementación de planes de manejo de especies amenazadas. El programa ha sido
dividido en cuatro módulos: 1) Introducción, 2) ¿Cómo se mide la diversidad genética?, 3)
Consecuencias genéticas del pequeño tamaño poblacional y 4) Manejo genético de las
especies amenzadas. El primer módulo incluye los conceptos básicos de biodiversidad y la
importancia de la conservación genética. En la segunda unidad se abardorán los principales
estadísticos utilizados en la medición de la diversidad genética. La tercera fase hace énfasis en
la influencia que tiene el tamaño poblacional en la diversidad genética de las poblaciones
naturales y el último módulo se enfoca en las opciones de manejo de poblaciones amenzadas
desde el punto de vista genético.
42
COMPETENCIAS
GENERAL:
Utilizarán racionalmente los datos genéticos en los procesos de toma de decisiones
encaminados a la gestión de la biodiversidad en todos sus niveles de manera que
contribuyan a la planificación y ejecución futuros planes de manejo de especies.
ESPECÍFICOS:
1. Definirán conceptos básicos en Conservación Genética.
2. Analizarán los principales métodos de medición de la diversidad genética en las
especies.
3. Comprenderán los efectos de la reducción del tamaño poblacional en la
conservación de especies.
4. Desarrollarán la habilidad de interpretar los resultados obtenidos a través de
métodos estadísticos modernos para proponer planes de manejo de especies
amenazadas.
CONTENIDO
Módulo I - Introducción
1. Niveles de Biodiversidad
2. Marcadores moleculares y genéticos
3. La Diversidad Genética y su importancia
4. Concepto de Conservación Genética
Módulo II ¿Cómo se mide la diversidad genética?
1. Principales estadísticos
2. Equilibrio de Hardy-Weinberg
3. Genética evolutiva en poblaciones naturales
4. Baja diversidad genética en poblaciones amenazadas
Módulo III Consecuencias genéticas del pequeño tamaño poblacional
1. Pérdida de la diversidad genética
2. Efectos al azar y deriva genética
3. Depresión por endogamia
4. Fragmentación poblacional
5. Poblaciones genéticamente viables.
Módulo IV Manejo genético de especies amenazadas (estudio de casos)
1. Resolución de incertidumbres taxonómicas
2. Manejo in situ de especies amenazadas
3. Reproducción controlada y reintroducción
4. Genética molecular forense
43
ESTRATEGIA METODOLÓGICA
Al ser un curso presencial al nivel de maestría, este se centrará en estrategias
andragógicas con apoyo de las TIC´s. La implementación de las innovaciones
tecnológicas no deja de lado estrategias metodológicas que propician el pensamiento
analítico necesario para la construcción y reconstrucción de los contenidos (mapas
conceptuales, cuadros comparativos, plenarias, elaboración de glosarios, etc.).
Se facilitará y recomendará material bibliográfico de apoyo (textos seleccionados), lo
cual no exime a los participantes del uso de los recursos de documentación y bases de
datos a los que se puede tener acceso actualmente. Se introducirá al análisis de
resultados genéticos a través de software de
Se enfatizará en las simulaciones y estudio de casos para promover el análisis de
resultados en la generación de estrategias para la conservación de especies
amenazadas.
RECURSOS DIDÁCTICOS
Proyector de diapositivas
(Datashow)
Computadoras
Artículos científicos
Videos
Carteles ilustrativos
Pizarras
EVALUACIÓN
Inicialmente de completará una evaluación diagnóstica y durante la marcha del curso,
se realizarán evaluaciones formativas. A nivel cuantitativo – sumativo, se propone el
siguiente esquema que se discutirá con los participantes:
CRITERIO
Asistencia y participación activa
Asignaciones individuales (y/o pruebas parciales)
Actividades grupales en clase (talleres)
Proyecto final colectivo
TOTAL
PORCENTAJE
10 %
30 %
20 %
40 %
100 %
44
BIBLIOGRAFÍA
Brown, T. (2008). Genomas. Buenos Aires, Argentina: Médica Panamericana.
Cubero, J. I. (2003). Introducción a la mejora genética vegetal. Madrid, España: Grupo MundiPrensa.
Curtis, H., Barnes, N. S., Schnek, A., & Massarini, A. (2008). Biología. Buenos Aires,
Argentina: Editorial Médica Panamericana.
Frankham, R., Ballou, J., & Briscoe, D. (2009). Introduction to Conservation Genetics.
Cambridge, UK: Cambridge University Press.
Hamilton, M. (2011). Population Genetics. West Susset, UK: Blackwell Publishers.
Hedrick, P. W. (2011). Genetics of Populatios. Ontario, Canadá: Jones & Bartle Publishers.
Pierce, B. A. (2010). Genética: Un enfoque conceptual. Madrid, España: Editorial Médica
Panamericana.
45
Asignatura: BIO 707
Denominación: BIOLOGÍA EVOLUTIVA
Créditos: 2
JUSTIFICACION
La biología evolutiva -el estudio científico de la evolución de los seres vivos- es un campo científico
fundamental, con una sólida tradición científica, consolidado su estudio en la estructura académica de
departamentos e institutos universitarios, y programas de estudio. En los últimos años la biología
evolutiva ha vivido un nuevo impulso relacionado con la aparición de nuevos métodos y técnicas
para la adquisición de datos moleculares, el análisis de la función de genes, el análisis informático de
sistemas complejos, así como la existencia de bases extensas de datos biológicos y el refinamiento en
el análisis de rasgos complejos. Orientando sus estudios hacia los conceptos, los principios, los
métodos, y el uso de los datos rn los diferentes niveles jerárquicos de la organización biológica. Hoy
día, las sociedades humanas modernas, en su complejidad, encaran tremendos desafíos relacionados
con la salud, la producción de alimentos, la cohesión social y la sostenibilidad ambiental, e incluso
los juicios morales con respecto a los cuales fallan las aproximaciones simples, y en los cuales los
estudios de la biología evolutiva pueden contribuir a su entendimiento y comprensión.
DESCRIPCION
La evolución es el proceso básico, unificador de toda la Biología. Se revisan los principales
conceptos y mecanismos de evolución biológica: deriva genética, adaptación y especiación.
Aspectos teóricos y principales métodos utilizados para reconstruir las relaciones de origen de
los organismos (filogenia). Se presenta una reseña histórica de los cambios evolutivos que
originaron los principales grupos de organismos. Analiza los principales procesos de evolución
biológica y su relevancia para originar biodiversidad. Se discuten los procesos que permiten
reconstruir el pasado evolutivo de los principales grupos de organismos e inferir sus posibles
relaciones de origen
OBJETIVOS
Proporcionar una mejor comprensión de la naturaleza humana, y cómo el bienestar y la armonía de
las personas depende de la naturaleza.
Asistir en la solución de problemas específicos, lo que incluye, entre otros casos, la preservación de
la biodiversidad, pues ésta es el resultado de la evolución.
.
46
CONTENIDOS:
Introducción
Moléculas y el origen de la vida
Proteínas y el código genético
Metabolismo celular: cambios para derivar energía
Mecanismos de la evolución
Poblaciones, frecuencia genética y equilibrio genético
Cambios en la frecuencia de genes
Estructura e interacción de las poblaciones
De razas a especies
Cultura y control de la evolución humana
Marco orgánico de la evolución
Registro fósil
Macro y microevolución
Adaptaciones y nicho
Sistemática y clasificación
Filogenia molecular
Evolución en plantas y hongos
Evolución de organismos unicelulares a multicelulares
Evolución en invertebrados
Origen de los vertebrados
Colonización de la superficie terrestre a partir del agua
Evolución de los mamíferos
Evolución de los primates y origen del hombre
47
BIBLIOGRAFIA
Bennet, K. D. 1996. Evolution and Ecology : The Pace of Life. Cambridge University Press. 259
páginas.
Doyle, P. 1996. Understanding Fossils: an Introduction to Invertebrate Paleontology. John Wiley
& Sons. 426 páginas.
Futuyma, D. J. 1986. Evolutionary Biology. Sinauer Ass. 2a edición.
Holmes, E. C. 2003. Error thresholds and the constrains to RNA virus evolution. Trends in
Microbiology 11: 543-546.
Nielsen, C. 2001. Animal Evolution: Interrelationships of the Living Phyla. Oxford University
Press. 2a edición, 568 páginas.
Rambaut, A., D. Posasa, K.A. Crandal & E.C. Holmes. 2004. The causes and consequences of
HIV evolution. Nature Reviews Genetics 5: 52-61.
48
Asignatura: BIO 708
Denominación: SEMINARIO DE TESIS I
Créditos :1
JUSTIFICACION
La necesidad de la presentación de los proyectos de investigación, artículos científicos y la
Escritura de los mismos una prioridad para el investigador, por lo que se requiere de un curso
donde el estudiante adquiere los conocimientos y destrezas para el desarrollo de estas actividades.
DESCRIPCION
La enseñanza de la materia comprende:
Elaboración y discusión del proyecto de trabajo de grado.
Una revisión de la literatura científica sobre tópicos seleccionados y relacionados con aspectos
biológicos. Presentación de un trabajo escrito y discusión oral del mismo, preferiblemente los
avances del trabajo de grado
OBJETIVOS
General:
Conocer las principales técnicas de presentación de los proyectos de investigación y redacción de
artículos científicos.
Específico
Analizar los componentes estructurales de los artículos científicos.
ESTRATEGIAS METODOLOGICAS
. Conferencias magistrales
. Debates
49
. Evaluación de publicaciones
. Perfiles
. Cuadros comparativos
. Trabajo de taller
. Monografías
. Investigaciones
Instrumentos de Evaluación
Formativa: revisión del contrato de aprendizaje de cada participante (que llena al inicio de la
asignatura)
Sumativa
. Evaluación Teoría
50%
. Evaluación Laboratorio
40%
. Apreciación
10%
.Total
100%
Asignatura: BIO 709
Denominación: ACTIVIDAD ACADÉMICA SUPERVISADA
Créditos :1
La participación en eventos académicos de la especialidad y otras aprobadas por el Consejo de
Investigación, tales como talleres organizados por el programa, complementan la formación
investigativa integral. Todos los estudiantes deben publicar (o a lo menos estar aceptado), como
resultado de su investigación, al menos un artículo científico en una revista indexada.
50
OPCIÓN EN BIOLOGÍA MOLECULAR
La Biología Molecular es el estudio de la vida a nivel de átomos y moléculas. Los biólogos
comprendieron que un mejor entendimiento de un organismo podría ser obtenido estudiando las
células que lo forman. De esta manera descubrieron las estructuras que forman las células, las
sustancias que requieren las células, los productos que ellas hacen y otras características
celulares.
La Biología Molecular lleva el estudio de la vida, a un siguiente paso, estudia las moléculas que
forman los seres vivos, igual que la química puede hacerlo con cualquier otro tipo de molécula.
Es decir trata de entender las interacciones entre varios sistemas de la célula, incluyendo
interacciones entre los diferentes tipos de DNA, RNA y síntesis de proteínas, así como también
como estas interacciones son reguladas.
El desarrollo de la investigación en biología molecular es utilizada además en la medicina
preventiva (desarrollo de vacunas), en el tratamiento (producción de drogas), en la agricultura
(productos biotecnológicos) entre otros.
Panamá cuenta con áreas calientes de la biodiversidad, el conocimiento de esta es necesaria para
desarrollar políticas apropiadas de conservación de las mismas. Las metodologías de la biología
molecular, la filogenética han permitido la caracterización y conservación de la biodiversidad.
Por ejemplo, los marcadores moleculares pueden ayudar a establecer la extención de la
diversidad dentro de las especies y establecer las prioridades para la conservación.
El propósito de esta orientación no es sólo conocer la tecnología pero más bien preparar a los
participantes a adquirir las habilidades para enfrentar problemas y retos científicos. Proveer las
herramientas intelectuales para desarrollar un enfoque de biología molecular en problemas de
interés local.
51
Asignatura: BIO 710
Denominación:Virología
Créditos: 3
JUSTIFICACIÓN
La Virología es una ciencia de mucha relevancia para los seres humanos. Virus tales como el
HIV, hepatitis B, papillomavirus y los virus de la gripe representan una amenaza para la salud
humana. Los virus también juegan un papel importante en el desarrollo de diversos tipos de
cáncer, igualmente tienen un efecto económico importante al causar enfermedades en plantas y
animales domésticos.
Algunos virus han sido utilizados para desarrollar enzimas, pesticidas, agentes antibacteriales,
para tipificación de cepas bacterianas, desarrollo de vectores para la producción de proteínas
entre otros.
Mucho del conocimiento básico de la Biología Molecular, Biología Celular y cáncer se ha
derivado de estudios como virus. El establecimiento del DNA como material genético, el
primer factor de transcripción, el primer mejorador de la transcripción eucariota, la primera
secuencia de localización nuclear, los intrones, entre otros son los aportes del conocimiento de
la virología.
Se requiere entender la estructura, replicación y como causan enfermedades. Esto permitirá
desarrollar estrategias de prevención, diagnosis y tratamiento a través de vacunas, anti-virales
y técnicas de diagnóstico.
Todos estos aspectos de la Virología forman parte de la formación de un estudiante de
postgrado en Ciencias Biológicas con énfasis en Biología Molecular.
DESCRIPCIÓN
En el curso se describe la metodología necesaria para estudiar los virus y la estructura
molecular del virus, su genoma, sus proteínas, membranas y cuerpos de oclusión. Se explican
los mecanismos de adhesión y entrada al hospedero y transmisión. Se estudian los mecanismo
de replicación del genoma viral, ensamblaje y salida de hospedero. Comprende igualmente
aspectos de su taxonomía y debido a la gran diversidad que existe entre los virus se destacarán
las descripción de las familias virales más relevantes. Finalmente se incluye aspectos de gran
importancia científica como mecanismos de evasión de la respuesta inmune, virus y cáncer,
52
terapia antiviral, priones entre otros. Se pretende abarcar con esta asignatura desde los aspectos
más básicos de la biología de los virus, hasta los más aplicados y novedosos en terapia génica.
Módulos que incluye; 4 descritos de la siguiente forma:
I. Métodos de estudio y estructura viral
II.
Transmisión Viral, adhesión, entrada y ensamblaje
III.
Clasificación y nomenclatura de los virus
IV. Temas especiales
SÍNTESIS DE METODOLOGÍA Y EVALUACIÓN
Se propone utilizar metodologías constructivistas, que promuevan la participación activa de los
estudiantes y cuyas evaluaciones formativas y sumativas comprueben la adquisición de
competencias.
COMPETENCIAS QUE DEBERÁN SER ADQUIRIDAS:
Básicas:
o Capacidad de Lectura-escritura.
o Recolecta, organiza y analiza información.
Competencias genéricas:
o Capacidad de abstracción, análisis y síntesis.
o Comunicación oral y escrita en lengua nativa.
o Capacidad de aplicar los conocimientos en la práctica
o Habilidad para trabajar en forma autónoma.
o Capacidad de trabajo en equipo
Competencias específicas:
o Comprende la metodología para estudiar los virus
o Comprende la estructura molecular de los virus, como infectan y se replican en la
célula hospedera, como se transmite, evoluciona y causa la enfermedad y como la
infección en el hospedero es prevenida.
o Discute la taxonomía de los virus.
o Conoce las principales familias de virus
o Explica las nueva tendencias del uso de virus en terapia génica, drogas antivirales.
Virus “oncolíticos” para tratar cáncer
53
CONTENIDOS
Módulo I:
Métodos de estudio y estructura viral
Métodos utilizados en Virología
o Introducción
o Cultivo
o Aislamiento
o Centrifugación
o Investigaciones estructurales de células y viriones
o Técnicas electroforéticas
o Detección de virus y componentes virales
o Ensayo de infectividad
o Genética
Estructura viral
o Introducción
o Genomas virales
o Proteínas, capsides
o Membranas de viriones
o Cuerpos de oclusión
o
Módulo II
Transmisión Viral, adhesión, entrada y ensamblaje
Transmisión Viral
o Transmisión de:
Virus de plantas
Virus de vertebrados
Virus de invertebrados
Adhesión, entrada de virus en las células y ensamblaje
o Replicación del genoma
o Ensamblaje y salida de la célula
o Resultados de la infección al hospedero
o Virus en animales
o Bacteriófagos
Módulo III
Clasificación y nomenclatura de los virus
o Clasificación moderna y de Baltimore
54
o
o
o
o
o
Herpes y otros virus de doble cadena
Parvovirus y otros virus de cadena sencilla
Reovirus, Picornavirus
Rhadovirus, Retrovirus
Ephadnovirus, virus emergentes
Módulo IV
Temas Especiales
o Evasión inmune
o Virus y Cancer
o Virus y vacunas
o Drogas antivirales
o Phage terapy
o Priones
METODOLOGÍA Y RECURSOS
Se desarrollara el temario mediante clases expositivas y participativas tipo magistral;
elaboración de mapas conceptuales, investigaciones bibliográficas, discusiones grupales.
EVALUACIÓN
La evaluación del estudiante se regirá por lo establecido en el estatuto Universitario,
Capitulo VIII del Régimen Académico, Sección sexta de la evaluación del aprendizaje,
aprobada en Consejo Académico General Universitario No. 22-08 del 29 de octubre del
2008,
Se evaluarán los conocimientos y habilidades teóricas y prácticas, así como la
participación y trabajo desarrollado por el alumno en todas las actividades docentes de la
asignatura a lo largo del curso. Para esto se utilizarán diferentes modalidades de
evaluación: diagnostica, formativa y sumativa.
La evaluación final se distribuirá de la siguiente forma:
• Examen parciales (mínimo 2), 30%-40%
• Otras actividades (trabajos en grupos, seminarios, proyectos etc.), 20% - 30%
• Examen Final 30%-40%
Se sugiere hacer al final del semestre una evaluación del curso por parte de los estudiantes
con la finalidad de mejorar el proceso enseñanza aprendizaje.
55
BIBLIOGRAFÍA
Alberts B, Jonson A, Lewis J, Raff M, Roberts K, Walter P. Molecular Biology of the Cell.
5a edition. Garland, Nueva York, EE.UU. 2008.
Bernard, D., Dulbecco, R. & others. 1989. Microbiology. Lippincott Williams & Wilkins
Publishers
Cann, A. 2012. Principles of Molecular Virology. Fith edition. Elsevier Ltd.
Carter, J.B & Saunders, V. 2007. Virology. “Principles and applications”. Jonh Wiley & Sons Publishers.
N.J. Dimmock, A.J. Easton and K.N. Leppard. 2009. Introduction to moderm virology.
Jonh Wiley & Sons Publishers.
Shors. T. 2011.Understanding Viruses. 2nd edition. Jones and Bartlett Publishers
56
Asignatura: BIO 711
Denominación: Inmunología
Créditos: 3
I.
JUSTIFICACIÓN
Los organismos vivos son el hábitat ideal e el que pueden crecer otros organismos. Por lo
tanto no es sorprendente que los animales estén sujetos a infecciones por virus, bacterias,
protistas, hongos y parásitos animales. Los vertebrados desarrollaron varios mecanismos que les
permiten reconocer y destruir estos agentes infecciosos. Como resultado, los vertebrados de
muchas células diferentes, algunas de las cuales vigilan el cuerpo mientras son capaces de
desarrollar inmunidad contra los patógenos invasores. La inmunidad deriva de las actividades
combinadas de muchas células diferentes, algunas de las cuales vigilan el cuerpo mientras que
otras se concentran en órganos linfoides, como la medula ósea, timo bazo y ganglios linfáticos.
En conjunto, estas células dispersas y órganos discretos forman el sistema inmunitario del
cuerpo.
Relación con el perfil: Esta asignatura constituye una parte de la formación del estudiante
de postgrado debido a que la misma se relaciona con el bloque de conocimientos definidos
en el perfil por competencias. El estudiante de la Maestría en Ciencias Biológicas con
énfasis en Biología Molecular debe tener un adecuado conocimiento de la Inmunología ya
que a través del diseño de este curso, se pretende transmitir un entendimiento preciso y los
fundamentos básicos del sistema inmunológico, haciendo énfasis en las interconexiones
existentes entre la inmunidad innata y adquirida y sus repercusiones en la salud y en la
enfermedad. Finalmente es mundialmente aceptado que el conocimiento de la inmunología
se requiere para la comprensión y manejo de la gran mayoría de patologías conocidas, tanto
para el entendimiento de sus medios de producción vivos. El conjunto de conocimientos
teóricos y aplicados que se le proporciona al estudiante actúa como un catalizador
fundamental en la comprensión de muchos de los desarrollos teóricos que se abordan en
diversas asignaturas de la Maestría..
II.
DESCRIPCIÓN
La Asignatura Biología consta de seis módulos a desarrollar.
En esta materia se pretende alcanzar un conocimiento general y suficientemente amplio de
los fundamentos teóricos de inmunología. Módulos que incluye; 6 descritos de la siguiente
forma:
1. Introducción y base histológica
57
2.
3.
4.
5.
6.
Moléculas y células que interaccionan con el antígeno
Las respuestas inmunitarias y sus mecanismos efectores.
Inmunidad frente a infecciones.
Alteraciones del sistema inmune.
Aspectos filogenéticos del sistema inmune.
Síntesis de metodología y evaluación
Se propone utilizar metodologías constructivistas, que promuevan la participación
activa de los estudiantes y cuyas evaluaciones formativas y sumativas comprueben la
adquisición de competencias.
III.
Competencias que deberán ser adquiridas:
Básicas:
1. Capacidad de Lectura-escritura.
2. Recolecta, organiza y analiza información.
Competencias genéricas:
1. Capacidad de abstracción, análisis y síntesis.
2. Comunicación oral y escrita en lengua nativa.
3. Capacidad de aplicar los conocimientos en la práctica
4. Habilidad para trabajar en forma autónoma.
5. Capacidad de trabajo en equipo.
Competencias específicas:
1. Proporcionar una introducción inicial integrado y globalizador para los conceptos en
los que se profundizará en el resto del curso
2. Relaciona el conocimiento y comprende Moléculas y células que interaccionan con
el antígeno.
3. Introducir al estudiante en la estructura altamente dinámica del sistema inmune, que
correlaciona con su función de vigilancia sobre el organismo.
4. Analizar las disfunciones más relevantes del sistema inmune.
5. Conocer las alteraciones del sistema inmune.
6. Introducir a los estudiantes en los aspectos básicos de la filogenética del sistema
inmune.
58
V. Contenidos
Módulo 1: Introducción y base histológica
1.1 Introducción a la inmunología
1.1.1. Aproximación histórica a la inmunología.
1.1.2. Visión general del sistema inmune
1.1.3. Inmunidad innata o NATURAL.
1.1.4. Inmunidad adquirida.
1.2.Células del sistema inmune.
1.2.1. Hematopoyesis
1.2.2 Células linfoides.
1.2.3. Fagocitos mononucleares.
1.2.4. Granulocitos
1.2.5. Basófilos
1.3.
Organos y Tejidos del sistema inmune.
1.3.1 Órganos linfoides primarios.
1.3.2. Órganos linfoides secundarios.
1.3.3. Recirculación limfocitaria
Módulo 2: Moléculas y células que interaccionan con el antígeno
2.1 Antígenos
2.2 Anticuerpos
2.3 Interacciones antígeno-anticuerpo
2.4 Organización y expresión de los genes de inmunoglobulinas y diferenciación de las células.
2.5 Complejo principal de histocompatibilidad(MHC)
2.6 Procesamiento y presentación del antígeno.
2.7 Moléculas de superficie de los linfocitos.
2.8 Maduración, activación y diferenciación de las células.
59
Módulo 3: Las respuestas inmunitarias y sus mecanismos efectores.
3.1 Respuesta inmune humoral.
3.2 Respuesta inmune mediada por células.
3.3 Citoquinas.
3.4 Regulación de la respuesta inmune.
3.5 El sistema del complemento
3.6 Visión de conjunto del sistema inmune.
Módulo 4: Inmunidad frente a infecciones.
4.1 Estrategias enfrentadas entre hospedador y parásitos.
4.2 Profilaxis y vacunación.
Módulo 5: Alteraciones del sistema inmune.
1.1
1.2
1.3
1.4
1.5
Reacciones de hipersensibilidad
Inmunodeficiencias.
Autoinmunidad
Transplante y rechazo
Inmunidad frente a tumores
Módulo 6: Aspectos filogenéticos del sistema inmune.
6.1 Evolución del sistema inmune
VI. Metodología y recursos
Se desarrollara el temario mediante clases expositivas y participativas tipo
magistral; elaboración de mapas conceptuales, investigaciones bibliográficas,
discusiones grupales.
VII. EVALUACIÓN
Se evaluarán los conocimientos y habilidades teóricas y prácticas, así como la participación y
trabajo desarrollado por el alumno en todas las actividades docentes de la asignatura a lo largo del
curso. Para esto se utilizarán diferentes modalidades de evaluación: diagnostica, formativa y
sumativa.
La evaluación final se distribuirá de la siguiente forma:
• Examen parciales (mínimo 2), 30%-40%
60
• Otras actividades (trabajos en grupos, seminarios, proyectos etc.) y
Laboratorio, 20% - 30%
• Examen Final 30%-40%
Se sugiere hacer al final del semestre una evaluación del curso por parte de
los estudiantes con la finalidad de mejorar el proceso enseñanza aprendizaje.
VIII. Bibliografía
ABBA, A.K., Lichtman, A.H., POBER, J,S: Inmunologia celular y molecular(terceraedición);
Ed. Interamericana- McGraw Hill(1999)
Delves, P., Seamus, M. , Demis, B., Roitt, I: Inmunologia Fundamentos.12° Edicion. Ed. Medica
Panamericana. 2014.
Fainboin, L., Geffner, J. Introducion a la Inmunologia Humana. Editorial Medica Panamericana.
2011.
Otras referencias:
Alberts B, Bray D, Hopkin K, Johnson A, Lewis J, Raff M, Roberts K y Walter P Introducción a
la Biología Celular. 3a Edición. España, Editorial Médica. Panamericana S.A.; 2011.
Alberts B, Jonson A, Lewis J, Raff M, Roberts K, Walter P. Molecular Biology of the Cell. 5a
edition. Garland, Nueva York, EE.UU. 2008
Karp G. Biología Celular y Molecular. Conceptos y Experimentos. 4a edición. México, Editorial
Me Graw-Hill, 2008.
Flanagan, N. (2005), Bioresearch Highlights: Significance of SNPs. Gen, 25:1.
Palladino, M.A. (2006). Understanding The Human Genome Project, 2 Ed. Benjamin
Cummings.
61
Asignatura: BIO 712
Denominación: GENÉTICA MICROBIANA Y EUCARIOTAS SUPERIORES
Créditos: 3
JUSTIFICACIÓN
La genética microbiana ha jugado un rol único en el desarrollo de los campos de la biología
celular molecular e igualmente ha encontrado aplicación tanto en las medicina, agricultura y en
las industrias farmacéuticas y alimenticia. Los microbios son ideales para estudios combinados
de bioquímica y estudios genéticos y exitosamente han provisto de la información del código
genético y de la regulación de la actividad genética. Los estudios genéticos han sido utilizados
para estudiar la variación en los microbios patogénicos y también para incrementar la
producción de antibióticos a partir de otros microbios.
Los estudiantes de biología o de carreras relacionadas encontrarán situaciones donde los
conceptos de la genética microbiana se aplican. Por ejemplo epidemias en los hospitales o en la
vecindad, producción de productos microbianos recombinantes como la cerveza, hormonas,
agentes bioterroristas, secuenciación de un gen novel encontrado en la naturaleza o inclusive la
enseñanza de la ciencia a nivel medio o universitario.
El estudiante debe no sólo dominar los conceptos básicos de la Genética sino que además debe
estar en capacidad de comprender y distinguir las diferencias de los procesos de transmisión,
organización y regulación de la expresión de la información en organismos eucariotas modelos
como son: C. elegans, S. cerevisiae, A. thaliana, D. melanogaster y H. sapiens. El estudio de
los procesos genéticos en estos organismos le permitirá al estudiante aproximarse al estado del
arte en la genética de eucariotas.
DESCRIPCIÓN
En este curso se tratan aspectos fundamentales y características distintivas de los genomas de
los microorganismos. Se discuten los mecanismos y particularidades del proceso de replicación
en bacterias, bacteriófagos, plásmidos y levaduras. Se estudia la transcripción en procariotas;
se revisa la estructura, función, procesamiento y modificación del ARN. Se aborda el proceso
de traducción y de manera detallada se estudian los elementos participativos en este proceso.
también son discutidos algunos modelos de regulación de la expresión de genes en bacterias.
Se explica el mapeo en bacterias y bacteriófagos. Se estudian los conceptos fundamentales de
la genética de bacteriófagos y de otros virus. Los estudiantes conocerán como la genética
molecular y la tecnología del ADN recombinante pueden ser utilizados para el estudio de
microorganismos
El curso también describe la estructura y función del genoma eucariótico. Se estudia la
organización del genoma, replicación y los mecanismos de la expresión del material genético
62
de eucariotas. Se explican los mecanismos hereditarios de organelos y determinación sexual.
Se describen los métodos para el mapeo genético en eucariotas
CONTENIDOS:
Módulo I: Genoma Microbiano
o Características del genoma microbiano
o Expresión de genes bacterianos
o Mutaciones en bacterias
o Plásmidos y conjugación
o Transformación en bacterias
Módulo II:
o Bacteriófagos
o Recombinación no homologa y transposición
o Base moleculares de la recombinación
o Mecanismos de regulación global
o Análisis genéticos en fagos
o Análisis genéticos en bacterias
Módulo III: Genoma de eucariotas
o Tamaño y estructura
o Marcos abiertos de lectura (ORF)
o Elementos repetitivos
o Elementos de transposición
o “ADN basura”
o cromosomas sexuales
Módulo IV: Control genético del desarrollo y destino de las células
o Genética de organelos
o Herencia extranuclear
Módulo V: Mapeo Genético
o Tipos de mapas
o Mapeo en Drosophila
o Mapeo en levadura
o Mapeo en humanos
ESTRATEGIAS METODOLÓGICAS
Contará con clases magistrales, discusiones grupales, seminarios, prácticas de laboratorio para
lograr el proceso de enseñanza aprendizaje.
63
CRITERIOS DE EVALUACIÓN
Definición – valores de calificación (sumativa)
La nota final del estudiante será determinada porcentualmente de acuerdo a los siguientes
parámetros:
Exámenes Parciales
40%
Seminario de Investigación 10%
Semestral
50 %
BIBLIOGRAFÍA
Dale J.W. and Park S. F. 2010. Molecular Genetics of Bacteria . Fifth Edition. John Wiley &
Sons.
.Cremer, T. and Cremer, M. Chromosome Territories.. Cold Spring Harb Perspect Biol 2010
Forsburg, S. Eukaryotic MCM Proteins: Beyond Replication Initiation.. Microbiology and
Molecular Biology reviews, Mar. 2004, p. 109–131
Jackson, R., Hellen, C. and Pestova, T. The mechanism of eukaryotic translation initiation
and principles of its regulation. NATURE REVIEWS :Molecular cell Biology. Volume 10,
February 2010; 113
Meneely, P. 2009. Advanced Genetic Analysis: Genes, Genomes, and Networks in
Eukaryotes. Oxford University Press.
Snyder, L. and Wendy Champness. 2007. Molecular Genetics of Bacteria Third Edition.
ASM Press
Kadonaga. J. Transcription in eukaryotes., Cell (2004) 116:247.
Singer, R. and David. RNA Processing and Export. Sami Hocine, Grünwald. Cold Spring
Harb Perspect Biol 2010
Vadim O. Chagin, Jeffrey H. Stear and M. Cristina Cardoso. Organization of DNA
Replication. Cold Spring Harb Perspect Biol 2010
64
Asignatura: BIO 713
Denominación: ADN RECOMBINANTE
Créditos: 3
JUSTIFICACIÓN
Las técnicas de Ingeniería Genética, basadas en la tecnología de ADN Recombinante crearon
la habilidad de aislar y manipular genes individuales de genomas complejos para beneficio del
hombre. En las ultimas décadas la tecnología del ADN Recombinante a evolucionado a tal
punto que se ha convertido en unas de las técnicas básicas disponible y aplicable a cualquier
investigación en las Ciencias Biológicas.
DESCRIPCIÓN
En la primera y segunda parte de este curso se discutirán las técnicas y enfoques usados para la
inserción de ADN en plàsmidos, fagos u otros vectores de clonación; la transformación de este
ADN recombinante en la célula huésped, el rastreo y selección de transformantes. Se
explicaran la generación de bibliotecas genéticas y bibliotecas de cDNA y por último se
estudiara la síntesis in Vitro de ADN así como también la clonación por sustracción.
En la tercera parte del curso se estudiaran las nuevas técnicas para el análisis de los genes
como por ejemplo el estudio de la expresión de los genes (Microarrays), transferencia de genes
en celulas de mamíferos y otras técnicas.
COMPETENCIAS
Competencias genéricas: Capacidad de abstracción, análisis y síntesis; Capacidad de
aplicar los conocimientos en la práctica; Capacidad de comunicación oral y escrita,
capacidad de investigación, capacidad de aprender y actualizarse permanentemente.
Competencias específicas :
o Entiende los conceptos fundamentales de las técnicas de la ingeniería genética
o Conoce la metodología de las prácticas de DNA recombinante.
o Entiende los conceptos fundamentales de las técnicas de la ingeniería genética
o Describe la metodología de las prácticas de DNA recombinante
o Comprende las metodología para aislar y ligar los ácidos nucleicos
o Conoce las distintas enzimas que se utilizan como herramientas en la ingeniería
genética
o Conoce los vehículos de clonación utilizados en el DNA recombinante
o Explica los métodos de transformación artificial y natural de los ácidos nucleicos
65
Comprende la metodología para la construcción de bibliotecas genómicas y cDNA
Conoce los métodos de selección y caracterización de recombinantes
Explica la metodología para la expresión de genes clonados
Buscar y seleccionar rigurosamente bibliografía científica aplicada a la ingeniería
genética
o Practicar la honestidad científica en el informe de sus resultados científicos
o
o
o
o
CONTENIDOS
Desarrollo de la Tecnología del ADN Recombinante
Métodos para crear moléculas de ADN Recombinante.
Definición
Corte y reunión de moléculas de ADN
Vectores de Clonación
Estrategias de clonación
Duplicación in vitro de DNA
Selección de Recombinantes y Caracterización
o Selección
o Caracterización de recombinantes
o Nuevas herramientas para estudiar la función del gen:
o Microarrays
o Mutagenesis in vitro
o RFLP
o Expesión de genes eucarióticos en bacteria
o Tecnología del ADN recombinante en eucariótas
o Pirosecuenciación
o Secuenciación de segunda generación
Utilización del ADN recombinante para el análisis de procesos biológicos
Moléculas de reconocimiento inmunológico. El DNA y lucha contra el SIDA
ADN recombinante y evolución
ADN recombinante en la medicina y la industria
Plantas y animales transgénicos importantes en la agricultura
Genomics: Proyectos de secuenciación de genomas
Terapia Genica
66
METODOLOGÍA Y RECURSOS
Para el desarrollo de los temas se seguirán las siguientes estrategias metodológicas:
Exposiciones
Prácticas de laboratorio
Trabajos en grupo
Investigaciones bibliográficas
Se utilizan los siguientes recursos:
Equipo multimedia
Diapositivas
Tablero
Marcadores
Equipo e insumos de laboratorio
CRITERIOS DE EVALUACIÓN
Técnicas y medios de evaluación.
o Integración y rendimiento en las clases Teórico-Prácticas.
o Dos Parciales con evaluación tipo opción múltiple y respuesta ampliada, al final
de la primera y segunda mitad del curso. Incluyen temas estudiados en dichos
lapsos.
o Requisitos de regularidad: 80 % de asistencia a las clases teóricas, parciales
aprobados.
Los exámenes parciales se califican en una escala de 0 a 100 puntos. La aprobación
exige un mínimo de 71 puntos. - Promoción total de la Asignatura: Examen Final:
Se realiza al fin del ciclo lectivo. Se toma un examen teórico escrito sobre la totalidad
de las Unidades del Programa de la Asignatura
Definición – valores de calificación (sumativa)
La nota final del estudiante será determinada porcentualmente de acuerdo a los siguientes
parámetros:
Primer examen parcial………………………..15
Segundo examen parcial……………………..15
Laboratorio...……………………………………30
Examen semestral…………………………… 40
100
67
BIBLIOGRAFIA:
Berg, J., Tymoczko, J. And Stryer, L. 2012. Biochemestry. 7th edition. Mcmillan Education
Brown, T.A. 2010 Gene Cloning & DNA Analysis. 6thedition. Willey & Blackwell
Dale J.W & von Schantz, M. 2007. From genes to genome: Concepts and applications of
DNA technology. Second edition. John Wiley& Sons
Glick, B., Pasternak, J. and Patten, C. 2009. Molecular Biotechnology: Principles and
Applications of Recombinant DNA. 4th Edition.
Green, M.R. 2012. Molecular cloning a laboratory manual. Fourth edition. Cold Spring
Harbor Laboratory pess
Krebs, J., Goldstein, E & Kilpatrick, S. 2014. Genes XI. Jones & Barlett learning
Metzember, S. 2007. Working with DNA. The basics. Garland Science
Nicoll, D. 2008. An introduction to genetic engineering. 3th edition. Cambridge University
press. NY
68
Asignatura: BIO 714
Denominación: BIOINFORMATICA
Créditos: 3
JUSTIFICACIÓN
El estudiante de la orientación de Genética y Biología molecular debe adquirir conocimientos
acerca de las principales bases de datos y servicios en Internet para el análisis de secuencias
de ácidos nucleicos y proteínas. El estudiante principalmente aprenderá a comparar secuencias
de ácidos nucleicos y proteínas y entender cómo se da la similitud de estas en las bases de
datos con el fin de predecir su función y posible estructura y también cómo estas se utilizan
en el análisis filogenético.
DESCRIPCIÓN
La bioinformática es la aplicación de técnicas computacionales para el descubrimiento de
conocimientos de datos biológicos. La secuenciación completa del Genoma Humano y
tecnologías avanzadas (pirosecuenciación, secuenciación de segunda generación,
microarreglos) han proporcionado información biológica sin precedentes.
El foco de la bioinformática es manejar la información que proviene de la industria, de la
instituciones académicas para convertirla en información útil. La utilización de esta permitirá
resolver problemas en biología, diseño efectivo de drogas para vencer enfermedades humanas.
El curso introducirá a las bases de datos biológicos básicos, principios y métodos para el
análisis de secuencias como alineamiento, búsqueda en la base de datos de similaridad,
introducción al análisis filogenético
COMPETENCIAS QUE DEBERÁN SER ADQUIRIDAS:
Competencias genéricas: Capacidad de abstracción, análisis y síntesis; Capacidad de
aplicar los conocimientos en la práctica; Capacidad de comunicación oral y escrita,
capacidad de investigación, capacidad de aprender y actualizarse permanentemente.
Competencias específicas :
o
o
o
o
o
Tiene un conocimiento general de la bioinformática
Busca información en bases de datos para el análisis de secuencias
Conoce la metodología para el alineamiento de las secuencias
Utiliza programas para el análisis de secuencias
Utiliza las herramientas de la bioinformática para la ingenería genética
69
o Aplica las metodologías teóricas y prácticas para el análisis y la solución de
un problema científico
o Entiende y juzga los resultados de una investigación
o Muestra interés permanente en la adquisición de conocimientos de nuevas
metodologías de análisis e instrumentación.
CONTENIDOS
Modulo I: Introducción a la Base de Datos
o Introducción: Conceptos de bioinformática y Biología Molecular
o Pubmed/Medline/Nucleotide en el NCBI para retirar referencias y secuencias de
ácidos nucleicos
Módulo II: Alineamiento y análisis de secuencias
o Alineamientos de dos secuencias
o Alineamientos de secuencias múltiples
Módulo III: Herramientas bioinformáticas para la ingenería genética
o Técnicas de edición y ensamblaje de secuencias
o Búsqueda de ORF
o Detección de sitios de restricción, clonaje e identificación de secuencias de
vectores
o Predicción de Estructuras y función de las Proteínas a partir de secuencias de
núcleotidos
o Diseño y compra de cebadores
Módulo IV: Introducción al análisis filiogéntico
o Construcción de árboles filogenéticos
ESTRATEGIAS METODOLÓGICAS
Para el desarrollo de los temas se seguirán las siguientes estrategias metodológicas:
Exposiciones
Participación en clase, que incluye leer las lecturas, participación individual y en
grupo de los ejercicios asignados durante el semestre.
Entrega de las prácticas de laboratorio durante el semestre
Se utilizan los siguientes recursos:
Equipo multimedia
Computadoras
Internet: Bases de Datos y programas online
Programa DNAMAN
70
CRITERIOS DE EVALUACIÓN
Prácticas asignadas
70%
Presentación de Artículos
Examen Final
5%
25%
BIBLIOGRAFÍA
Claverie J.M.& Notredame, C. 2007. Bioinformatics for Dummies. Wiley –Interscience
Mount, D. 2004 Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis. Cold Spring Harbor
Laboratory Press.
Zvelebil, M.J. & Baum J. O. 2008. Understanding Bioinformatics. Garland Science
71
Asignatura: BIO 715
Denominación: TÉCNICAS EN BIOLOGÍA MOLECULAR
Créditos: 3
JUSTIFICACIÓN
En años recientes, nuestro conocimiento del funcionamiento de sistemas biológicos a nivel
celular y molecular ha incrementado como resultado de los avances en técnicas y metodología
en este campo. Por ejemplo, el análisis de los ácidos nucleicos e ingeniería genética. Al mismo
tiempo estos métodos de análisis mejorados, han permitido a los científicos monitorear e
estudiar las muestras más pequeñas de biomoléculas. Como resultado, el entrenamiento
requerido para el trabajo práctico en Biología Molecular y Celular es diverso, desde las
habilidades para el diseño de las investigaciones prácticas y en el uso apropiado de un gran
número de equipo analítico hasta la presentación oral y escrita de los resultados.
DESCRIPCIÓN
El curso proveerá de un perfil de los principios teóricos sobre la metodología de la Biología
Molecular y Celular, pero hará énfasis en las aplicaciones prácticas de esta información. Se
incluyen las técnicas requeridos para el manejo estéril de cultivos bacterianos y de tejidos
vegetales y animales. También provee el conocimiento teórico-práctico de las técnicas más
importantes utilizadas hoy día en la Biología Molecular, como por ejemplo la cromatografía,
espectrofotometría, electroforesis entre otras. Se presentarán los métodos de análisis mas
relevantes de la Biología Molecular.
COMPETENCIAS GENÉRICAS Y ESPECÍFICAS
Lista y explica las normas de bioseguradad asociadas a las técnicas moleculares
estandares, incluyendo cultivos bacterias, electroforesis, purificación de acidos
nucleicos, PCR entre otras.
Conoce la metodologías para cultivos bacteriales y tejidos, asi como las técnicas bioanalítca actual, como la espectrofotometria, centrifugación entre otras
Explica y practica los principios básicos de las técnicas estériles de cultivo bacterial,
transformación, purificación y cuantificación del DNA
Explica las posibles variaciones del PCR y como sus parametros pueden ser variados
para resolver problemas durante el mismo
72
Planifica un experimento de clonación de DNA que incluye PCR, clonación en un
vector adecuado, transformación, aislamiento de plásmidos, seguido del análisis de
restricción enzimática con electroforesis de agarosa
Entiende la naturaleza de una hipótesis en biología molecular y como esta da respuesta
a preguntas científicas
Examina bibliografía relacionada para la formulación de una hipótesis en biología
molecular
CONTENIDOS
Fundamentos sobre las técnicas de Laboratorio:
o Principios básicos
o Salud y Seguridad
o Principios de la química de las soluciones
o pH y soluciones tampones
Manejo de Células y Tejidos
o Técnicas estériles y cultivo microbiano
o Aislamiento e identificación de microbios
o Tejidos y células vegetales
o Cultivo de tejidos y medidas de crecimiento
o Homeginización y fraccionamiento de las células y tejidos
Técnicas Analíticas
o Métodos inmunológicos
o Isótopos radioactivos, no radioactivos y sus usos
o Espectrofotometria básica
o Centrifugación
o Cromatografía- Métodos de separación, detección y análisis
o Principios y práctica de electroforesis
o Técnicas avanzadas de electroforesis
Ensayos de Biomoléculas y estudio del Metabolismo
o Principios fundamentales
o Ensayos de aminoácidos y proteínas
o Ensayos para lípidos
o Purificación de proteínas
o Ensayos enzimáticos
Biología Molecular-LABORATORIOS
73
o Preparación de soluciones
o Extracción de DNA genómico
o Extracción de plásmidos
o Cuantificación de DNA
o Restricción Enzimática
o PCR
o Electroforesis
o Ligación
o Transformación de DNA-Selección de Recombinantes
Rotación en Instituciones de Investigación en Biología Molecular
METODOLOGÍA Y RECURSOS
Para el desarrollo de los temas se seguirán las siguientes estrategias metodológicas:
Exposiciones
Prácticas de laboratorio
Trabajos en grupo
Investigaciones bibliográficas
Se utilizan los siguientes recursos:
Equipo multimedia
Diapositivas
Tablero
Marcadores
Equipo e insumos de laboratorio
CRITERIOS DE EVALUACIÓN
Técnicas y medios de evaluación.
-
Integración y rendimiento en las clases Teórico-Prácticas.
Dos Parciales con evaluación tipo opción múltiple y respuesta ampliada, al
final de la primera y segunda mitad del curso. Incluyen temas estudiados en
dichos lapsos.
- Requisitos de regularidad: 80 % de asistencia a las clases teóricas, parciales
aprobados.
Los exámenes parciales se califican en una escala de 0 a 100 puntos. La aprobación
exige un mínimo de 71 puntos. - Promoción total de la Asignatura: Examen Final:
74
Se realiza al fin del ciclo lectivo. Se toma un examen teórico escrito sobre la totalidad
de las Unidades del Programa de la Asignatura
Definición – valores de calificación (sumativa)
La nota final del estudiante será determinada porcentualmente de acuerdo a los siguientes
parámetros:
Primer examen parcial………………………..15
Segundo examen parcial……………………...15
Laboratorio...…………………………………40
Examen semestral…………………………… 30
100
BIBLIOGRAFIA
Berg, J., Tymoczko, J. And Stryer, L. 2012. Biochemestry. 7th edition. Mcmillan Education
Bruce A., Johnson, A., Lewis, J., Morgan,D. 2014. Molecular Biology of the Cell. 6th. Ed.
Garland Science, NY, USA
Campbell MK, Farrel SO. 2014. Biochemistry. 8th. Ed. Cengage Learning, CT, USA
Green, M.R. 2012. Molecular cloning a laboratory manual. Fourth edition. Cold Spring
Harbor Laboratory pess
Reed, R.; Holmes, D.; Weyers, J. and Jones, A. 1998. Practical skills in Biomolecular
Sciences. Prentice Hall, England, U.K.
Rajan, K. 2011. Analytical techniques in biochemistry and molecular biology. Springer
75
Asignatura: BIO 716
Denominación: GENÉTICA DE POBLACIONES
Créditos: 3
JUSTIFICACIÓN
Para comprender los procesos que mantienen la variabilidad fenotípica hay que conocer la
estructura genética de las poblaciones (variabilidad genética) y los factores que condicionan
esta variación. La variabilidad genética esta dada por el grado de heterocigocidad que posea la
población. Existen diversas técnicas para detectar la variabilidad genética y métodos
matemáticos-estadísticos para cuantificarla dentro de poblaciones y entre poblaciones. Estos
conocimientos permiten entender la importante relación entre variabilidad genética y el manejo
racional de las poblaciones biológicas, la determinación de la erosión genética y la
conservación de estos recursos naturales.
DESCRIPCIÓN
Principios básicos de la genética de poblaciones. Polimorfismo genético en poblaciones
naturales. Principales técnicas para detectar el polimorfismo proteico y de ADN. Propiedades
principales de los marcadores . Medidas de la variabilidad genética. Reconstrucción de
historias evolutivas a partir de datos de ADN.
Módulos que incluye.
Módulo I: La variación en las poblaciones
Módulo II: Equilibrio Genético
Módulo III: Variación Genética
Módulo IV: Las fuerzas que mantienen y cambian
la variación genética de las poblaciones
COMPETENCIAS QUE DEBERÁN SER ADQUIRIDAS:
Competencias genéricas: Capacidad de abstracción, análisis y síntesis; Capacidad de
aplicar los conocimientos en la práctica; Capacidad de comunicación oral y escrita,
capacidad de investigación, capacidad de aprender y actualizarse permanentemente.
76
Competencias específicas :
o Conocer y comprender los conceptos básicos de la Genética de
Poblaciones, los tipos de poblaciones que se estudian y los procesos genéticos que
mantienen la variación fenotípica de las poblaciones.
o Aplicar , analizar e interpretar los modelos y métodos matemáticos
de análisis de las poblaciones.
o Conocer y aplicar algunos aspectos moleculares de la variación
Genética.
.
CONTENIDOS
Modulo I: La variación en las poblaciones
Caracteres afectados por la variación
Medida de la variación.
o Variación discontinua
o Variación continua
Origen de la variación
o Variación ambiental
o Variación genética
Polimorfismos genéticos
o Caracterización del polimorfismo
o Causas que mantienen a los polimorfismos
o Tipos de polimorfismos
Módulo II:
Equilibrio Genético
Poblaciones y acervo de genes
Frecuencias genotípicas y génicas
Equilibrio genético, Principio de Hardy-Weinberg
Propiedades principales del equilibrio genético
Utilización del principio de Hardy- Weinberg
Distintos casos de la codominancia autosómica
bialélica
Ruptura del equilibrio
77
Módulo III:
Variación Genética.
Importancia de la variación genética
Medida de la variación genética
o Porcentaje de loci polimórficos
o Grado de heterocigocidad de la población
Marcadores moleculares
Genoma eucarionte
Mutación, frecuencia y papel evolutivo
Módulo IV: Fuerzas que mantienen o cambian la variación genética
de las poblaciones
Recombinación y flujo genético
o Recombinación
o Flujo genético
o Proporción de genes introducidos
o Tasa de migración
Sistema de cruzamientos
o Tipos de cruzamientos
o Consanguinidad. Medida y efecto
o Apareamiento asociativo
o Hibridación
o Apareamiento disociativo
Selección Natural
o Concepto moderno y características
o Agentes selectivos
o Eficacia biológica o valor adaptativo
o Niveles de acción de la selección natural
o Tipos de acción de la selección
o Selección natural estabilizante
o Selección natural diversificadora
o Selección natural direccional
78
Deriva Genética
o Concepto y efectos de la Deriva Genética
Tamaño efectivo de la población
o Efecto del fundador
o Efecto cuello de botella
METODOLOGÍA Y RECURSOS
Para el desarrollo de los temas se seguirán las siguientes estrategias metodológicas:
Exposiciones
Lecturas dirigidas
Trabajos en grupo
Investigaciones bibliográfica
Se utilizan los siguientes recursos:
Equipo multimedia
Diapositivas
Tablero
Marcadores
Equipo e insumos de laboratorio
CRITERIOS DE EVALUACIÓN
Técnicas y medios de evaluación.
Integración y rendimiento en las clases Teórico-Prácticas.
Dos Parciales con evaluación tipo opción múltiple y respuesta ampliada, al final
de la primera y segunda mitad del curso. Incluyen temas estudiados en dichos
lapsos.
Requisitos de regularidad: 80 % de asistencia a las clases teóricas, parciales
aprobados.
Los exámenes parciales: se califican en una escala de 0 a 100 puntos. La aprobación
exige un mínimo de 71 puntos.
Examen Final: Se realiza al fin del ciclo lectivo. Se toma un examen teórico escrito
sobre la totalidad de las Unidades del Programa de la Asignatura
Definición – valores de calificación (sumativa)
79
La nota final del estudiante será determinada porcentualmente de acuerdo a los siguientes
parámetros:
Primer examen parcial…………………….....15
Segundo examen parcial……………………..15
Laboratorio...………………………………...30
Examen semestral…………………………... 40_
100%
BIBLIOGRAFIA
Cubero, J. I. (2003). Introducción a la mejora genética vegetal. Madrid, España:
Grupo Mundi-Prensa.
Curtis, H., Barnes, N. S., Schnek, A., & Massarini, A. (2008). Biología. Buenos
Aires, Argentina: Editorial Médica Panamericana.
Frankham, R., Ballou, J., & Briscoe, D. (2009). Introduction to Conservation
Genetics. Cambridge, UK: Cambridge University Press.
Hamilton, M. (2011). Population Genetics. West Susset, UK: Blackwell Publishers.
Hedrick, P. W. (2011). Genetics of Populatios. Ontario, Canadá: Jones & Bartle
Publishers.
Pierce, B. A. (2010). Genética: Un enfoque conceptual. Madrid, España: Editorial
Médica Panamericana.
80
Asignatura: BIO 717
Denominación: BIOTECNOLOGÍA
Créditos: 2
JUSTIFICACIÓN
Esta asignatura se relaciona con el bloque de conocimientos, definidos en el perfil por
competencias de un estudiante graduado de la Maestría en Ciencias Biológicas de la
Universidad de Panamá.
DESCRIPCIÓN
La Biotecnología representa una de las principales áreas de desarrollo científico y
tecnológico en el mundo. Esta disciplina en las últimas décadas ha re-emergido y ha
acaparado la atención de los científicos y gobiernos como posible alternativa para
encontrar soluciones a los tres problemas básicos que enfrenta el hombre: AlimentaciónSalud-Ambiente, uniendo lo tradicional y lo más novedoso desde el punto de vista
científico y técnico.
El curso “Introducción a la Biotecnología”, se presenta como una alternativa del currículo universitario a nivel de postgrado, permitiendo a los estudiantes la adquisición de
conocimientos básicos en Biotecnología. En este curso se proyectara el alcance de esta
nueva rama del saber; la aplicación e integración de principios de las ciencias e ingeniería;
identificación de los campos de acción y los resultados más promisorios; además del
conocimiento de nuevas tecnologías que conllevan a la obtención de productos con
máxima eficiencia, economía y seguridad factible.
Módulos que incluye, 5 descritos de la siguiente forma:
o Módulo I: Introducción a la Biotecnología.
o Módulo II: Disciplinas de apoyo a la Biotecnología.
o Módulo III: Aplicaciones de la Biotecnología
o Módulo IV: Perspectiva de la Biotecnología
o Modulo V: Bioética y Biotecnología.
Síntesis de metodología y evaluación
Se propone utilizar metodologías constructivistas, que promuevan la participación activa de
los estudiantes y cuyas evaluaciones formativas y sumativas comprueben la adquisición de
competencias.
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COMPETENCIAS QUE DEBERÁN SER ADQUIRIDAS:
Competencias genéricas:
Capacidad de razonamiento crítico y autocrítico, capacidad de análisis y de síntesis,
creatividad, iniciativa y espíritu emprendedor, compromiso social y medioambiental,
fluidez y propiedad en la comunicación científica oral y escrita.
Competencias específicas:
Formación teórica en el uso de las herramientas básicas y el material biológico
importantes en Biotecnología.
Formación práctica en técnicas microbiológicas y de biología molecular básicas aplicadas
a la Biotecnología.
Capacidad para aplicar la teoría a la práctica de cualquier actividad biotecnológica.
Competencia técnica y científica en la resolución de problemas relacionados con la
Biotecnología.
Compresión de los problemas sociales y éticos de la Biotecnología.
Resolución mediante Biotecnología de los problemas medioambientales.
Demostrar conocimiento de la literatura científica y técnica en Biotecnología
CONTENIDOS
Módulo 1: Introducción a la Biotecnología:
Definición
Origen
Evolución
Desarrollo
Módulo 2: Disciplinas de apoyo a la Biotecnología
Informática
Ingeniería Química
Física
Genética
Bioquímica
Microbiología
Estadística
Inmunología
Biología Molecular y celular
Matemáticas
Fisiología Humana, animal y vegetal.
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Módulo 3: Aplicaciones de la Biotecnología
Ingeniería genética través de
bioinformatica.
Medio ambientales y acuáticas
- Acuicultura
- Biorremediacion
- Modificaciones transgénicas
la
biología
molecular
- Desarrollo de fármacos
- Bioinformatica
- Exploración de alta capacidad de procesamiento
- Cultivo celular y pruebas humanos
- Biotecnología agrícola
- Cultivos transgénicos
- Localización genética de semillas.
- Animales transgénicos
Deteccion
- Forense
- Huellas digitales de DNA
- Deteccion de enfermedades geneticas
- Identificacion de species
Farmaceuticas/Cuidados de salud
- Biofarmacologia
- Tecnologia de la fermentacion
Módulo 4: Perspectiva de la Biotecnología
Nuevas herramientas para diagnostico de enfermedades.
Capital humano
El negocio de la biotecnología
Organización de una empresa de Biotecnología
Trabajos e Biotecnología
Tendencias en alza en la industria biotecnológica
Módulo 5:
Regulación sobre la aprobación/supervisión
- Food and Drug Administration(FDA)
- Environmental protection Agency(EPA)
- U.S Department of Agriculture(USDA)
- Introduccion a las patentes
y
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- Productos biotecnologicos en el marco legal.
Módulo 6: Biotecnología y Bioética.
Definición de bioética
- Toma de decisiones
Biotecnología y naturaleza
- Células y productos
- Organismos genéticamente modificados
- Creaciones de embriones para la investigación
- Clonación
- Derechos de los pacientes y material biológico.
- Legislación en desarrollo
Economía, papel de la ciencia y comunicación
METODOLOGÍA Y RECURSOS
Se desarrollara el temario mediante clases expositivas y participativas tipo magistral;
elaboración de mapas conceptuales, investigaciones bibliográficas, discusiones grupales.
CRITERIOS DE EVALUACIÓN
Técnicas y medios de evaluación.
La evaluación realizara mediante 2 exámenes parciales escritos, un trabajo
Final y el examen semestral.
Definición – Los valores de calificación serán sumativos:
Parciales: 15% cada uno
Trabajo Final: 30%
Examen Semestral: 40%
BIBLIOGRAFÍA
Aggarwal, S. (2007). What´s Fueling the Biotech Engine? Nature Biotech.,25.
Beyond Borders: The Global Biotechnology Report 2006. Ernst and Young. 2006.
www.ey.com/bryond borders.
Flanagan, N. (2005), Bioresearch Highlights: Significance of SNPs. Gen, 25:1.
Lizeswiski, K. (2006). Metabolomics Plays Crucial Discovery Role. Gen,26.1.
Palladino, M.A. (2006). Understanding The Human Genome Project, 2 Ed. Benjamin
Cummings.
84
Ry to IPO: The Business of Biotecnology. Cambridge, MA: Perseus.obbins-Roth, C.
(2001). From Acadenm
Thieman, W.J., Palladino, M.A. (2010). Introducción a la Biotecnología. 2° Edición.
Editorial Pearson
85
Asignatura: BIO 718
Denominación: MARCADORES MOLECULARES
Créditos: 2 créditos
JUSTIFICACIÓN
A partir de la última década del siglo XX, las técnicas de marcadores moleculares han dado un
vuelco al conocimiento genético de las diferentes especies y han posibilitado localizar genes y
marcadores para hacer más eficiente su selección; es por eso que los marcadores constituyen
una herramienta actual y una alternativa a la transgenesis para obtener nuevas variedades por
métodos tradicionales.
DESCRIPCIÓN
Este curso describe la naturaleza de los diferentes marcadores moleculares y además
proporciona, y explica una serie de protocolos experimentales con aplicación en diversos
campos de la biología y áreas relacionadas. Se discute en adición literatura científica en la cual
se han utilizado marcadores moleculares en la solución de problemas específicos.
La asignatura incluye los siguientes módulos:
Módulo I: Enzimas como marcadores moleculares
Módulo II: Hibridización molecular de marcadores
Módulo III: Marcadores moleculares en bacterias
Módulo IV: Marcadores moleculares en eucariotas
COMPETENCIAS QUE DEBERÁN SER ADQUIRIDAS: (vinculadas al perfil del
egresado).
Competencias genéricas:
o Emplea abstracción, análisis y síntesis
o Aplica conocimientos a la práctica
o Utiliza comunicación oral y escrita
o Capacidad de aplicar los conocimientos en la solución de problemas
o Aplica el trabajo en equipo
o Demuestra uso de las tecnologías de la información y de la
comunicación
o Utiliza la investigación
o Demuestra interés de actualización continua
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Competencias específicas:
o Explica las diferencias entre los distintos tipos de marcadores moleculares
o Reconoce las ventajas y desventajas de cada uno
o Es capaz de decidir qué tipo demarcador molecular se puede utilizar en una
situación concreta
CONTENIDOS
Módulo I: Enzimas como marcadores moleculares
Aloenzimas e isoenzmas
Ventajas y desventajas
Sistemas aloenzimáticos
Aplicaciones y ejemplos
Módulo II: Hibridización molecular de marcadores
Sondas para un solo locus
Sondas para locus múltiples
Ventajas y desventajas
Aplicaciones y ejemplos
Módulo III: Marcadores moleculares en bacterias
Rep-PCR
ERIC-PCR
Genes como marcadores
Sistema de tipaje mediante multilocus (MLST)
ITS
Módulo IV: Marcadores moleculares en eucariotas
SNPs
Microsatelites
PCR-RFLP
AFLP
Genes y secuencias de organelos
METODOLOGÍA Y RECURSOS
Para el desarrollo de los temas se seguirán las siguientes estrategias
metodológicas:
o Clases magistrales
o Discusión de artículos
o Investigaciones bibliográficas
Se utilizan los siguientes recursos:
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o
o
o
o
o
Equipo multimedia
Tablero
Marcadores
Artículos asignados
Investigaciones asignadas
CRITERIOS DE EVALUACIÓN
Para el desarrollo de los temas se seguirán las siguientes estrategias
Definición – valores de calificación (sumativa)
La nota final del estudiante será determinada porcentualmente de acuerdo a los siguientes
parámetros:
Primer examen parcial…………………..……..15
Segundo examen parcial………………..……...15
Participación en la discusión de
artículos...………………………………………15
Proyecto……………………….………………..15
Examen semestral………………………..…… 40_
100
BIBLIOGRAFIA
Avise, J. 2004. Molecular markers, natural history and evolution. Second Edition. Sinauer
Associates inc, publishers, Massachusets, USA
Krebs, J., Goldstein, E & Kilpatrick, S. 2014. Genes XI. Jones & Barlett learning
Lodish H, Berk a, Zipurisky LS, Matsudaira P, Baltimore D, Darnell. J Molecular cell
biology(4ed) W. H. Freeman and Company New York
Cetano-Anolles. 1998. DNA Markers: Protocols, Applicatins and Overviews.
Cornide- Hernandez. 2002. Marcadores Moleculares: Nuevos Horizontes en la Genetica y la
Selección de las Plantas. Editorial Felix Varela.
88
Asignatura: BIO 719
Denominación: SEMINARIO DE TESIS II
Créditos: 1
JUSTIFICACION
El curso de seminario constituye un complemento indispensable en la formación investigadora.
Con ellos el alumno aplica los conocimientos de técnicas y metodologías de investigación a su
propia investigación.
DESCRIPCION
En este curso el estudiante debe presentar los avances de la tesis de grado en forma oral y escrita,
utilizando las metodologías apropiadas para la escritura de todo proyecto de investigación.
OBJETIVOS
Clarificar aspectos básicos relacionados con elaboración de una tesis, el proceso de
redacción y la defensa de la tesis.
Orientar a los estudiantes en el proceso de titulación para obtener el grado de Maestría.
CONTENIDO DEL CURSO:
Revisión de la literatura científica sobre tópicos seleccionados y relacionados con aspectos
biológicos.
Elaboración y discusión de los avances en el proyecto de trabajo de grado.
Presentación de un trabajo escrito y discusión oral del mismo, preferentemente de los
avances del trabajo de grado.
METODOLOGÍA:
Al ser un curso presencial al nivel de maestría, este se centrará en estrategias andragógicas con apoyo de las TIC ́s. Se propone la exposición y evaluación de las tesis como una revisión crítica
de gran cantidad de información que debe ser explicada de forma documentada y fundamentada.
Se promueve un debate de los informes escritos y verbales a fin de pulir lo mayormente posible
el Informe de Tesis.
BIBLIOGRAFÍA
La bibliografía básica estará en función del tema de la tesis.
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Asignatura: BIO 720 / BIO 730
Denominación: Tesis
Créditos: 5
JUSTIFICACION
La Tesis consiste en un trabajo de investigación original sobre un problema relacionado con un
campo científico, tecnológico, humanístico o artístico dado, dentro de las líneas de investigación
de un Programa de Maestría; y constituye un requisito obligatorio para la obtención del grado
de Magíster en Programas de Maestría con la modalidad académica. La Tesis es un aporte al
conocimiento.
DESCRIPCION
En esta asignatura el alumno debe realizar individualmente un trabajo escrito original sobre un
tema de su elección relacionado con los estudios cursados en el programa de Maestría.
La Tesis de Maestría es el resultado de un trabajo de investigación. Debe realizarse un estudio
profundo, con rigor y crítico de la literatura. Es fundamental la correcta elección de las fuentes
bibliográficas utilizadas a fin de que la visión que se tenga del tema de estudio se corresponda
con la existente en la literatura universal.
Los datos experimentales deben cumplir los estándares exigidos para cualquier investigación en
cuanto a estructura, recogida, análisis, etc.
OBJETIVOS
Dar a los estudiantes la oportunidad de realizar una investigación en un área de
conocimiento de las ciencias biológicas, según estándares científicos y académicos
normalmente aceptados.
Permitir que el estudiante ponga en práctica el conocimiento, competencias y sensibilidades
que le permitan mostrar y comprender las características de las problemáticas que se abordan
en las ciencias biológicas.
BIBLIOGRAFÍA
La bibliografía básica estará en función del tema de la tesis.
90
OPCIÓN EN BIODIVERSIDAD Y CONSERVACIÓN
Las regiones tropicales y en particular Mesoamérica, son parte de las zonas biológicas con mayor
biodiversidad en el mundo, y por lo tanto un área sumamente importante para los esfuerzos
globales de conservación. Con tan solo el 0,5% de la superficie terrestre, alberga el 7% de las
especies de plantas y animales a nivel global. Aunado a ello, el Istmo de Panamá representa el
sitio donde ha ocurrido el “gran intercambio biótico de América”, al constituirse en el gran
puente que permitió el intercambio de especies de los hemisferios Norte y Sur, hace
aproximadamente 3millones de años. Sin embargo, la región se ve afectada por diversas
actividades humanas como la deforestación, la fragmentación de los bosques y la transformación
de uso hacia el desarrollo de obras de infraestructura, actividades mineras, ganaderas, y
agrícolas, así como por los efectos de los cada vez más frecuentes eventos climatológicos
provocados por los cambios globales. Todo ello supone nuevos retos para la conservación de la
biodiversidad en la región Mesoamericana, de la cual forma parte el Istmo de Panamá,
haciéndose imperioso el incrementar el capital humano para atender las tareas de investigación,
docencia y gestión en relación a las estrategias de conservación y manejo de la biodiversidad, a
los más altos niveles académicos, científicos y tecnológicos. Esto hará viable, las posibilidades
de identificar, plantear y ejecutar políticas, estrategias de manejo y herramientas que mitiguen
los impactos humanos y optimicen la conservación de la biodiversidad y la sostenibilidad
ambiental del país.
91
Asignatura: BIO 721
Denominación: BIOLOGÍA DE LA CONSERVACIÓN
Creditos: 3
JUSTIFICACION
Las amenazas actuales a la diversidad biológica no tienen precedente, nunca tantas especies han
estado tan amenazadas en un periodo de tiempo tan corto. Esta tendencia tiene entre sus
principales actores al incremento de la población humana, a su demanda de recursos para
satisfacer sus necesidades, a la implementación de tecnologías meramente extractivas, así como
también la inequidad social y económica. Las amenazas que se ciernen sobre las especies se
añaden una a la otra, no actúan de manera independiente, esto es, existe un sinergismo de
amenazas. Finalmente, mucha gente se está dando cuenta que las amenazas sobre el ambiente se
traducen en amenazas sobre la humanidad, dado que dependemos exclusivamente de los recursos
aportados por nuestro entorno para nuestra sobrevivencia. Ante este escenario, surge la Biología
de la Conservación como una ciencia multidisciplinaria para dar respuesta a la crisis ambiental
actual, aanalizando los principios y consideraciones biológicas que deben tomarse en
consideración y que contribuyen como herramientas para la solución a la problemática de la
conservación y manejo de la biodiversidad.
DESCRIPCIÓN
El curso Biología de la Conservación tiene como propósitos, el análisis y discusión de los
principios biológicos de la Conservación los cuales deben sustentar los lineamientos estratégicos
de manejo y conservación.y aborda mecanismos , incluyendo la estructura y sus aplicaciones. El
programa ha sido dividido en seis secciones: La introducción describe el concepto,
características y los principios orientadores de su estudio. La segunda parte se refiere a los
niveles de abordaje del problema de conservación de la biodiversidad, ecosistemas,
comunidades, poblaciones, especies y genes. La tercera sección estudiará las amenazas a la
diversidad de especies, el aislamiento de las poblaciones, y las posibles repercusiones:
especiación, endemismo, causas y consecuencias; situación del endemismo en Panamá, la
extinción de especies y el tamaño mínimo viable de una población; especies exóticas y especies
oportunistas. La cuarta sección se refiere a la fragmentación de los ecosistemas, sus
consecuencias; la teoría de aislamiento geográfico; la composición biológica de los fragmentos;
la heterogeneidad; consecuencias biológicas de la fragmentación, exclusión inicial, barreras y
aislamiento. La quinta y última sección contempla aquellos aspectos biológicos que están
92
relacionados y deben tomarse en consideración para el manejo de los ecosistemas, como son la
definición de áreas de conservación, zonas de vecindad y corredores biológicos.
OBJETIVOS
1.analizar el impacto humano sobre las especies, comunidades y ecosistemas
2.Desarrollar mecanismos prácticos para prevenir la extinción de especies y, en la medida de lo
posible, reintegrarlas en ecosistemas funcionales.
CONTENIDO
Módulo I -
Introducción
Concepto e importancia de la Biología de la Conservación
Características, principios orientadores de la disciplina
Una disciplina integradora ante un problema de actualidad: La pérdida de la diversidad biológica
Módulo 2. Conservación de poblaciones y especies
Tipos y niveles de biodiversidad.
Ecosistemas, especies y genes
Módulo 3. Amenazas a la conservación
El aislamiento de las poblaciones
Posibles repercusiones
Especiación
El endemismo, causas y consecuencias
Situación del endemismo en Panamá
Extinción de especies
Tamaño mínimo viable de una población
Especies exóticas y las especies oportunistas
93
Estado actual
Importancia de su registro y control.
Módulo 4. La fragmentación de los ecosistemas
Consecuencias
Los fragmentos y la teoría de aislamiento geográfico
La composición biológica de los fragmentos
Fragmentación y heterogeneidad
El proceso de fragmentación
Consecuencias biológicas de la fragmentación
Exclusión inicial
Barreras y aislamiento
Efecto de apiñamiento
Extinciones regionales y locales
Cambios en la composición de especies
Módulo 5. El manejo de los ecosistemas
Principios orientadores
Las áreas de conservación:
Sus objetivos, tamaño y forma: una decisión compleja
Representatividad ecológica de las AP
Zona de vecindad
Corredores biológicos
Consideraciones biológicas para la planificación y diseño de
corredores biológicos
Corredores biológicos en áreas privadas
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Monitoreo de corredores biológicos
Impactos y limitaciones
Corredores biológicos en Panamá
ACTIVIDADES DE EVALUACIÓN
- Talleres en clases (presentación y discusión de temas en la clase)
10 %
- Dos pruebas sumativas parciales
30%
- Trabajo final escrito
30%
- Examen final
30 %
REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS
Andrade de Franco, J. L. 2013. The concept of biodiversity and the history of conservation
biology: from wilderness preservation to biodiversity conservation. JHistória (São Paulo)
12/2013; 32(2):21-48.
Chazdon, R. & T. C. Whitmore. 2002. Foundamentations of Tropical Forest Biology. The
University of Chicago Press, Chicago. 862 p.
Dyke, F.V. (2008). Conservation biology. Foundations, concepts, applications. Springer,
segunda edición.
Frank, D. 2013. Biodiversity, conservation biology, and rational choice.Studies in History and
Philosophy of Science Part C Studies in History and Philosophy of Biological and Biomedical
Sciences.
Groom, M.J., K.M. Meffe & C.R. Carroll. 2006. Principles of Conservation Biology. Third
edition. Sinauer Associates, Inc. Sunderlads, Massachusetts, USA. 779 pp.
Krebs, C.J. (2009). Ecology. Benjamin Cummings, San Francisco, sexta edición.
Meffe, K.M. & C.R. Carroll. 1994. Principles of Conservation Biology. Sinauer Associates,
95
Inc. Sunderlads, Massachusetts, USA. 600 pp.
Hanski, I. & M. E. Gilpin. 1997. Metapopulation Biology: ecology, genetics, and evolution.
Academic Press, San Diego, CA. USA. 512 pp.
Proulx, R., Massicotte, P. and M. Pépino. 2013. Googling Trends in Conservation Biology.
Conservation Biology 08.
Pullin, A.S. (2002). Conservation Biology. Cambridge University Press.
Simberloff, D. (1988). The contribution of population and community biology to conservation
science. Ann. Rev. Ecol. Syst. 19, 473-511.
Soulé, M.E. (Ed.). 1986. Conservation Biology: the science of scarcity and diversity. Sinauer
Associates, Inc. Sunderlads, Massachusetts, USA. 584 pp.
Soulé, M.E. & B. A. Wilcox (Ed.). 1980. Conservation Biology: an evolutionary – ecological
perspective. Sinauer Associates, Inc. Sunderlads, Massachusetts, USA. 584 pp.
Verboom, B. & van Apeldoorn, R. (1990). Effects of habitat fragmentation on the red
squirrel, Sciurus vulgaris L.Landscape Ecology, 4, 171-176.
96
Asignatura: BIO 722
Denominación: ECOLOGÍA DE POBLACIONES
Créditos: 4
JUSTIFICACIÓN
A menudo las primeras preguntas que se hace un biólogo que trabaja con diferentes tipos de
organismos, es cuántos hay en un área determinada. A los biólogos, conservacionistas y
planificadores no sólo le interesa los individuos por separado, es imprescindible tener a mano
más información sobre su organismo de interés, por ejemplo conocer la cantidad de individuos,
como se distribuyen por grupos de edad, la proporción por sexo, su distribución en un área
determinada. También es imprescindible para lograr éxito en su gestión conocer las
características del entorno de la población, como son los recursos espaciales (alimento, refugios,
agua, territorio, sitios de reproducción, etc.), lo mismo que las condiciones (temperatura,
precipitaciones, humedad) y, por supuesto, las interacciones con miembros de su misma especie
y con otras especies. Además, el biólogo necesita saber cómo afectan a las poblaciones naturales
esas variables en diferentes ciclos temporales, ya sean diurnos/nocturnos, estacionales o
multianuales. Una herramienta útil para estimar estas características de la población o de las
comunidades es la Ecología de Poblaciones.
Conocer en profundidad las dinámicas que inciden sobre una población natural, ahondando en
sus causas, es una herramienta muy valiosa para preservar la biodiversidad. Se trata de un
estudio complejo, desde luego, pero que tiene una extraordinaria utilidad para entender la tasa de
mortalidad, de natalidad o los flujos migratorios de las especies y de las poblaciones que
impactan directamente en el ecosistema.
DESCRIPCIÓN
El curso Ecología de Poblaciones brinda al estudiante una visión general de esta rama de la
Ecología, la cual tiene como objetivo básico el estudio de los cambios numéricos de las
poblaciones naturales e identificar sus causas y consecuencias. De este modo, el interés en el
estudio de estos cambios numéricos reside en describirlos, explicarlos, predecirlos y analizar sus
consecuencias ecológicas y evolutivas. Para ello, como ciencia que es, la ecología de poblaciones
trabaja con cálculos matemáticos, curvas de crecimiento, fórmulas matemáticas que emanan
directamente de la disciplina demográfica. Los datos deber ser recogidos en el campo para la
realización de censos, así como de los diferentes muestreos necesarios para cubrir todos los
componentes de esta rama de la ecología.
97
OBJETIVO
Analizar los procesos ecológicos que determinan la distribución y abundancia de las
poblaciones naturales.
CONTENIDOS
1.Conceptos básicos en ecología de poblaciones
Definición de ecología de poblaciones: ámbito de estudio
Relación de la ecología de poblaciones con la genética, fisiología, conducta animal y
evolución
2.Parámetros de la población
La población como unidad de estudio
Estimación de los parámetros de la población
Densidad
Natalidad
Mortalidad
Inmigración y Emigración
Limitaciones del análisis de poblaciones
Composición de las poblaciones
3.Técnicas demográficas (Tablas de vida)
Cuadros estadísticos de esperanza de vida
Capacidad innata de incremento en el número de individuos
Distribución de edades
Distribución por categorías diamétrica
Evolución de los rasgos demográficos
4.Crecimiento de las poblaciones
Teoría matemática
Generaciones discretas
Generaciones de traslape
Pruebas de laboratorio para la Teoría Logística
98
Datos de campo acerca del crecimiento de las poblaciones:
o Modelos estocásticos del crecimiento de las poblaciones
o Modelos de distribución
Dinámica de las Poblaciones.
5.Interacciones de las especies (Competencia y depredación)
Competencia por recursos
Modelo matemático
Poblaciones naturales
Evolución de la capacidad competitiva
Generaciones discretas
Generaciones continuas
Evolución de los Sistemas Depredador-Presa
Mecanismos de defensa de las plantas
6.Territorio y ámbito de acción,
Movimientos y migraciones
Distribución espacial
7.Ecología molecular
Estudio en plantas y animales
Hibridación
ADN mitocondrial
El estudio de comunidades bacterianas
Métodos y aplicaciones en plantas y animales
Endogamia, fecundación cruzada y sistemas reproductivos en plantas con flores
Formas de medir la endogamia
Estimaciones de fecundación cruzada en poblaciones naturales de plantas con flores.
Clonación y sus efectos en la Biología de poblaciones.
Definiciones
Tipos de clonación en plantas
Ventajas y desventajas
La especie como unidad evolutiva
Uso de marcadores moleculares para su reconocimiento y delimitación
99
EVALUACIÓN
Prácticas de campo e informes
15%
Trabajo escrito en base a un mínimo de 15 referencias
10%
Presentación oral de trabajo en un seminario
10%
Dos exámenes parciales
30%
Examen final
35%
_________________________________________________________
100%
REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS
Akçakaya, H.R. 2005. RAMAS Gis: Linking spatial data with population viability analysis
(version 5). Applied Biomathematics, Setauket, New York.
Alstad, D. 2001. Populus 5.1: simulations of population biology. Software. Univ. of
Minnesota. http://www.cbs.umn.edu/populus.
Andermeer, J.H., Goldberg, D.E. 2003. Population Ecology: First Principles. Princeton
Universtiy Press pp. 280.
Begon, M., Mortimer, M. & D. J. Thompson. 1996. Population Ecology: a unified study of
animals and plants. 3a. edición. Blackwell Science, Cambridge.
Davis, D.E. & R.L. Winstead. 1987. Estimación de tamaños de poblaciones de vida silvestre. Pp.
233-258, En Manual de Técnicas de Gestión de Vida Silvestre. Cuarta edición en español.
Wildlife Society. Maryland, USA.
Downing, R.L. 1987. Estadísticas vitales de poblaciones animales. Pp. 259-281, En Manual de
Técnicas de Gestión de Vida Silvestre.Cuarta edición en español. Wildlife Society. Maryland,
USA.
Hastings, A. 1997. Population biology. Concepts and Models. Springer-Verlag, New York.
Hanski, I. and Gaggiotti, O.E. 2004. Ecology, genetics and evolution of metapopulations. (eds).
Elsevier Academic Press.
Hodgson, D.J., Townley, S. 2004. Linking management changes to population dynamic
responses: the transfer function of a projection matrix perturbation. Journal of Applied Ecology
41: 115-1161.
Krebs, C.J. 2009. Ecology. Benjamin Cummings, San Francisco, sexta edición.
100
Moreno, C.E. 2001. Métodos para medir la biodiversidad. M & T-Manuales y Tesis SEA, vol. 1.
Zaragoza, España. 84 pp.
Asignatura: BIO 723
Denominación: ECOLOGÍA DE COMUNIDADES NATURALES
Créditos: 4
JUSTIFICACION
Panamá es una de las regiones con mayor diversidad biológica en Mesoamérica, abrigando una
alta diversidad de plantas, animales silvestres y otros organismos por Km de superficie; de allí
que aparezca entre los llamados “puntos calientes” de diversidad. El conocimiento de su
diversidad biológica, así como de los factores ambientales y procesos que permiten la
convergencia, desarrollo y funcionamiento de los ensambles de especies en comunidades bióticas
que caracterizan los ecosistemas, son parte del análisis de este curso. La comprensión de estos
procesos son herramientas importantes para ayudar a comprender las bases ecológicas de la
diversidad biológica a nivel local y regional y ayudar a proponer prioridades de investigación,
monitoreo y manejo.
DESCRIPCION
La ecología de comunidades es el estudio de las poblaciones de distintos organismos que habitan
sincrónicamente un lugar, y su estudio permite hacer aproximaciones a interrogantes que se
plantean en la teoría ecológica como: la comprensión de patrones y procesos que ocurren en las
comunidades, así como la utilización de diferentes recursos por las poblaciones cuáles son las
condiciones que permiten establecer la existencia de competencia, así como las condiciones para
que los depredadores afecten la biodiversidad; la sucesión de especies y el estado de equilibrio.
El uso de escalas espaciales y temporales en las que ocurren los fenómenos comunitarios, así
como el empleo de herramientas estadísticas utilizadas en la ecología de comunidades Este
curso, ofrece la oportunidad de aprender el manejo de herramientas potentes y versátiles, con
particular énfasis en el análisis de datos multivariado, brindando al futuro investigador las
capacidades básicas para analizar aspectos ecológicos de la dinámica de poblaciones,
101
comunidades y ecosistemas de organismos acuáticos continentales. Por último se analizan las
principales amenazas, así como los criterios para la conservación de comunidades naturales.
OBJETIVOS
Fortalecer la capacidad de analizar aspectos ecológicos de la dinámica de comunidades y de las
poblaciones que forman parte de las mismas, tanto en ecosistemas terrestres como acuáticos
continentales.
CONTENIDOS
1. Naturaleza y características de las comunidades:
Concepto de comunidades biológicas. Patrones y procesos causales. Estructura, organización,
dinámica. Ensambles. Escalas.
2. Estructura de las comunidades y su relación con el medio físico:
Componentes. Atributos y parámetros, Asociaciones. Patrones de distribución espacial. Medidas
de la asociación y su significado, análisis de gradientes. Ordenamiento indirecto de gradiente:
análisis de componentes principales y análisis de correspondencias. Ordenamiento directo,
análisis de correspondencias canónicas. Clasificación de comunidades. Método fitosociológico
de Braun-Blanquet. Método de los grupos florísticos de Ellenberg. Clasificaciones numéricas.
3. Diversidad:
Hipótesis. Patrones espaciales de diversidad: hipótesis de causalidad; ejemplos. Indicadores.
Gradientes. Distribución especie-abundancia: modelos biológicos y descriptivos. Riqueza
específica: métodos de estimación. Índices de diversidad. Efectos de la diversidad en el
funcionamiento de ecosistemas: principales hipótesis; experimentación. Diversidad taxonómica y
funcional.
4. Interacciones bióticas:
Nicho ecológico. Teoria de nicho y competencia. Competencia interespecífica.
Depredación, herbivoría y defensas de las plantas contra los herbívoros
El enfoque funcional. Especies claves e interacciones fuertes y débiles. Rol de los mutualismos
en la organización de comunidades y funcionamiento de ecosistemas. Polinización y dispersión
de semillas, agentes e influencia en los atributos de comunidades. Banco de semillas: formación,
diferencias según ecosistemas. Redes de mutualismos.
5. Cambios en la comunidad:
102
Teoría de disturbios. Modelo del equilibrio. Consecuencias ecológicas de los disturbios.
Disturbios naturales y disturbios antrópicos. Sucesión, especies sucesionales pioneras, tempranas
y tardías; patrones de regeneración de diferentes grupos ecológicos. Invasiones biológicas,
causas, características de las especies invasoras y de las comunidades invadidas. Efectos sobre
las comunidades naturales en ambientes acuáticos y terrestres. Estabilidad, relación estabilidaddiversidad. Modelos de simulación; microclima, cambios en el espacio y en el tiempo;
características ecológicas.
6. Organización y producción de las comunidades:
Niveles y trama trófica. Flujo de energía. Producción primaria y secundaria. Estabilidad.
Especies dominantes.
7. Metacomunidades y biogeografía de islas:
Contexto histórico. Relación especie-área. Número de especies y tasa de reemplazo. Teoría del
Equilibrio. Composición de especies. Teoría de ensambles de especies. Distribución anidada:
definición, hipótesis de causalidad, relación con funciones de incidencia, índice de anidamiento.
Aplicación al diseño de reservas naturales. Teoría de Metacomunidades: Conceptos y estructura;
modelos de formación de ensambles.
8. Conservación de comunidades:
Principales amenazas, fragmentación del hábitat y especies invasoras. Criterios para la
conservación de comunidades. Especies clave, especies paraguas. Diversidad genética en
comunidades. Estrategias de conservación: ambientes degradados y matrices antrópicas, áreas
núcleo y corredores. Relación de la biogeografía de islas con el diseño de reservas naturales.
ESTRATEGIAS METODOLÓGICAS
Presentación dialogada con discusiones entre los participantes.
RECURSOS DIDÁCTICOS
Retroproyectores, proyector de diapositivas, proyector de datos (“data show”), ilustración con material del laboratorio, computadoras, videos, pizarra, tiza multicolor, cámara digital, etc.
103
EVALUACIÓN
1) Aprobar dos exámenes parciales teórico-prácticos. 60%.
2). Aprobar los informes de los trabajos prácticos. Cada informe deberá entregarse en tiempo y
forma y ser sustentado oralmente. 10%
3) Asistir al 80% de los trabajos prácticos. Se tomará asistencia al comienzo del trabajo práctico.
5%
4) Presentación de examen final.25%.
REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS
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Características del Bosque y de la Tierra. En: Kalliola, R. y Flores Paitán, S. (eds.), Annales
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Asignatura : BIO 724
Denominación: PRÁCTICAS DE CAMPO EN ECOLOGÍA TROPICAL
Créditos: 2
JUSTIFICACION
El curso representa una oportunidad para los estudiantes de participar de un ambiente de
discusión y análisis de la teoría y la práctica en ecología tropical. Además, constituye el
escenario para sintetizar el marco teóricos detrás de los distintos procesos ecológicos que
influyen en el mantenimiento de la diversidad biológica tropical, y su interpretación a través de
la observación de las relaciones e interrelaciones entre los distintos organismos que forman parte
de la diversidad tropical. Poniendo en práctica y fortaleciendo su capacidad de observación e
interpretación de la naturaleza.
DESCRIPCIÓN
Comprende la revisión de conceptos básicos y de actualidad en ecología tropical, lectura de
artículos y discusión en foros y debates en clases. Visita y estadía en lugares escogidos por su
diversidad de clima, flora y fauna. En cada sitio, habrá caminatas de reconocimiento y proyectos
de grupo dirigidos por profesores. Estos proyectos evaluarán en el campo conceptos ecológicos
y facilitarán el planteamiento de preguntas con el fin de entrenar a los estudiantes para llevar a
cabo proyectos de investigación individual, en los últimos días de cada visita. En las noches
habrá conferencias, sesiones de trabajo, discusiones, y preparación de informes. En todos los
proyectos, se dará énfasis a la concepción teórica del problema, al análisis cuantitativo de los
datos y a su interpretación ecológica y contarán con el apoyo de los profesores, computadoras y
bibliografía-
106
OBJETIVOS
Interpretar los conceptos teóricos, y aplicarlos en el diseño, toma de datos, interpretación
de resultados y sustentación de proyectos de investigación, en ecología tropical.
Reconocer las diferencias en comunidades y ecosistemas tropicales a través de la práctica
de campo.
CONTENIDOS
1. Hipótesis que explican la diversidad en los trópicos
Teoría de los refugios hipótesis de la estabilidad; competencia, depredación,
heterogeneidad del hábitat, teoría de nicho ecológico; la dinámica de claros.
la
2. Técnicas de muestreo y recolección de datos en campo
Diseño y preparación de un diseño de investigación corta ; revisión de las metodologías
de muestreo y análisis sobre un grupo de interés.
3. Interacciones ecológicas
Reconocimiento e interpretación de las Interacciones observadas en los distintos casos de
estudio; planta animal: frugivoría, dispersión de frutos y semillas; ecología de
polinizadores (invertebrados y vertebrados); co-evolución de plantas y animales;
diversidad biológica y funciones en suelos.
4. Estudios de caso
Ecología del Bosque Nuboso (Cordillera de Talamanca; Cerro Jefe; El Gaital, Valle
de Antón):
Características del paisaje y la diversidad;; el viento;; bosque “enano”, disponibilidad de luz, altura del dosel, epífitas, epífilas y hemiepífita. Ventajas de las diferentes estrategias
en relación a la competencia de luz. Formas de crecimiento de plantas y tipos de
comunidad; porte de los árboles, densidad del sotobosque. Análisis de disturbios: la tala,
los incendios, la agricultura, las pendientes y la erosión, otros impactos humanos;
principales especies en peligro de extinción. Flora, principales familias: Asteraceae,
Fabaceae, Poaceae, Apiaceae Ericaceae, Verbenaceae, Scrophulariaceae. Fauna: el
problema del declive de los anfibios.
Ecología del Bosque Lluvioso (Parque Nacional Darién, Soberanía, Portobello,
Chagres y San Lorenzo)
107
Ciclo de nutrientes, la fertilidad del suelo, las micorrizas. Formación del suelo: la textura
del suelo: la cal, arcilla, arena, la estructura y textura del suelo; lixiviación de nutrientes.
Estructura de los bosques: la composición, la cobertura, el perfil, la temperatura; estratos
en un bosque tropical, árboles emergentes, tamaño y forma de la copa de los árboles, la
competencia por luz y su influencia en la estructura del bosque: bejucos, lianas, epífitas,
hemi-epífitas del sotobosque. Caídas de árboles, su origen y sus consecuencias: dosel
interrumpido. Efecto de borde, papel de las especies pioneras. Floración: atracción de
polinizadores; la co-evolución en relación con la floración no sincrónica. Fructificación,
dehiscencia, ganchos, explosivos. La dispersión y depredación de semillas. Flora:
especies de plantas de la selva. Fauna: las especies de animales de la selva. Disturbios y
conservación: situaciones relevantes que afectan a los bosques tropicales, incluyendo la
minería de oro, la explotación forestal, el desarrollo, la invasión humana, la caza.
Ecología del Bosque Seco (P.N. Sarigua y P. N. Cerro Hoya; Punta Garachiné,
Darién)
Características físicas: la alta radiación solar, la humedad baja. Los bosques secos de baja
altitud. Los procesos ecológicos: la competencia y especialización de las especies en la
zona. Productividad, la estacionalidad, ciclo de nutrientes, la fertilidad del suelo. Flora
representativa. La perturbación y conservación: las granjas de camarón, el desarrollo de
las costas, el pastoreo y el fuego, la deforestación y desertificación.
Ecología de Bosques Costeros y Humedales (Oreyzales, manglares y cativales)
Manglares, cativales y oreyzales ; árboles halófitos, zonas de transición, fluctuación de la
marea. Alta productividad, la exportación de detritos de alta importancia, raíces poco
profundas, suelos anaeróbicos y altos en CO2. Especies "vivíparas". Raíces aéreas:
trampas de sedimentos para construir más tierra. Neumatóforos, tolerancia a
concentraciones de sal; suelos arenosos, capacidad de colonización de costas expuestas.
ESTRATEGIAS METODOLÓGICAS
Lectura y discusión de artículos,
sobre estudios de caso.
presentaciones orales, elaboración de resúmenes escritos
108
RECURSOS DIDÁCTICOS
Retroproyectores, proyector de diapositivas, proyector de datos (“data show”), , computadoras, videos, pizarra, tiza multicolor, cámara digital, transporte terrestre y acuático.
EVALUACIÓN
Dos exámenes parciales teóricos (25%)
Llecturas y discusión de artículos (10%)
Asistencia y participación en giras de estudio de caso, reporte y sustentación de informes
(40%)
Preparación, entrega y sustentación de monografía final (25%).
REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS
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Pedro Galindo, Diomedes Quintero, Noris Sallazar, Ruth Sierra. Editorial Universitaria,
Universidad de Panamá, Panamá.
Terborgh, J. 1992. Diversidad y el Bosque Tropical. Scientific American Library, Nueva York.
Asignatura : BIO 725
DENOMINACIÓN : ETOLOGÍA
Créditos: 2
JUSTIFICACIÓN:
La Etología permite entender al animal como un todo, comprende no solo el estudio de la
conducta animal, sino la misma, en condiciones naturales. Esta aproximación permite entonces
aportar, en sentido práctico, al uso sostenible de los recursos animales para diversos fines. En el
campo de la salud, por ejemplo, mediante la búsqueda de nuevas toxinas, drogas y
medicamentos; ya que estos poseen técnicas terapéuticas innatas. Por razones similares, permite
el uso racional de su carne y derivados para la nutrición humana. Así como el mejoramiento de
técnicas de conservación en zoológicos y reservas naturales, con vistas a su conservación. Por
último, la evolución humana está asociada a las técnicas de caza y recolección, condiciones que
crearon una dependencia natural del hombre y las especies que le rodean; afinidad que ha sido
denominada por los etólogos como biofilia.
DESCRIPCIÓN
Se estudian las principales metodologías utilizadas para entender las causas del comportamiento
animal. Se continúa con el estudio de los mecanismos biológicos causales de la conducta
(genético, neuronal, humoral y sensorial), el desarrollo de la conducta, el aprendizaje y la
conducta o etología cognitiva. En tercer término se describen los principales patrones y la
función de la conducta trófica y la defensa antipredatoria. Como cuarto interés se incluye una
descripción de los patrones reproductivos, el cortejo, sistemas de apareamiento y cuidados
parentales. Por último, se repasan los principales desarrollos asociados al entendimiento de la
conducta social en los animales.
110
OBJETIVOS
1- Explicar las principales técnicas de estudio de la conducta animal.
2- Describir los más importantes patrones de conducta y sus causas internas y externas.
3- Explicar los principales mecanismos causales de la conducta animal.
CONTENIDOS
1.Introducción a la etología y sus métodos.
Etología, psicología animal y conducta animal.
Desarrollo y conceptos actuales de Etología.
Materiales y métodos etológicos en el laboratorio y el campo.
(Método descriptivo y Método cuantitativo)
Clasificación de los diversos tipos de conductas (Causal, funcional e histórico).
2.Estímulos, emisores y receptores.
2.1 Clasificación moderna de los receptores.
2.2 Estimulo adecuado y estímulo señal.
3.Conceptos centrales de etología
3.1 Patrones Modales de Acción (PMA).
3.2 Encadenamientos de PMA.
3.3 Estímulo señal y Mecanismos desencadenadores Innatos (MDI).
3.4 Desencadenadores sociales.
3.5 Orientación animal (Taxias y tactismos)
3.6 Conceptos modernos sobre la orientación.
4.Evolución de la conducta.
4Conducta Social.
4.1- Cooperación y comunicación.
4.2- Competencia, Agresión y Conciliación.
4.3- Las especies sociales.
5.Reproducción.
5.1- Procesos reproductores básicos.
5.2- Atracción y Cortejo.
5.3- Sistemas de apareamiento y competencia postcopulatoria.
5.4- Cuidados parentales.
5.5- Fisiología del Comportamiento
111
6.El Sistema Nervioso, el Sistema Endocrino y la Conducta.
6.1 Neuroetología.
6.2 Hormonas y conducta.
7.Desarrollo comportamental.
7.1 Desarrollo comportamental en anfibios.
7.2 Desarrollo comportamental en aves.
7.3 Desarrollo comportamental en mamíferos.
8.Aprendizaje y cognición.
8.1 Evolución del aprendizaje.
8.2 Tipos de aprendizaje
9.Etología cognitiva.
9.1- La etología cognitiva como ciencia.
9. 2- Formación de conceptos.
9. 3- Capacidad de aprender el lenguaje.
9. 4- Capacidad cuantitativa.
9. 5- Memoria y percepción.
9. 6- Procesos cognitivos complejos.
10-
Conducta trófica y antipredatoria.
ESTRATEGIAS METODOLÓGICAS
1- Discusión de artículos científicos relevantes de cada tema.
2- Exposición de algunos aspectos relevantes de la conducta animal (Conferencias
Magistrales).
3- Exposición por especialistas en algunos de los temas a discutir.
4- Visitas de campo para familiarizarnos con los estudios etológicos de campo (Barro
Colorado, Cerro Campana, Parque Zoológico de Summit y otros).
5- Realización de proyectos cortos de investigación por los estudiantes.
112
REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS
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WILSON E.O. 2002. Sociobiology: The New Synthesis. Edición 25 Aniversario. Cambridge:
The Belknap Press of Harvard University Press. 697, pp.
113
Asignatura: BIO 726
Denominación: HERRAMIENTAS DE ANÁLISIS DEL PAISAJE
Créditos : 4
JUSTIFICACIÓN
La investigación en fragmentación de hábitats es desde hace años uno de los campos más
desarrollados dentro de la biología de la conservación , ya que este proceso está afectando a la
biodiversidad a nivel mundial. La fragmentación ha sido descrita tradicionalmente como la
división progresiva de un hábitat a priori relativamente continuo en un conjunto de fragmentos
aislados y de menor tamaño, que quedan embebidos en una matriz de hábitat degradado,
cualitativamente muy diferente al original. Por su parte, la conectividad ecológica, también
llamada conectividad del paisaje, ha sido definida como la facilidad que presenta el territorio
para el movimiento de las especies (individuos y genes) y otros flujos ecológicos entre las
diferentes zonas de hábitat. La conectividad se considera clave para fomentar la persistencia y
variabilidad genética de las poblaciones de flora y fauna, contribuyendo a mitigar los efectos
negativos de la fragmentación de los hábitats y a permitir la adaptación de las especies frente a
los desplazamientos en sus áreas óptimas de distribución debidos a los cambios del clima, de los
usos del suelo y otros factores. Esto se ha llevado a la práctica mediante el fomento, diseño e
implementación de áreas silvestres protegidas y corredores biológicos. La complejidad que
suponen los cambios en el paisaje debidos a la fragmentación requiere llevar un análisis integral
que permita integrar los conocimientos en los procesos de planificación, investigación y
monitoreo para la conservación y el manejo sostenible de la biodiversidad. Adicionalmente exige
la comprensión de la tecnología informática para gestionar y analizar información espacial, que
permita establecer los diagnósticos, elaborar planes de manejo, el monitoreo y la evaluación de
la efectividad de las áreas para la conservación de las especies y ecosistemas representativos.
DESCRIPCIÓN
Se abordan los conceptos fundamentales y las aplicaciones de metodologías, índices y
herramientas informáticas de reciente desarrollo y uso libre, relacionadas con el análisis del
paisaje con fines de realizar estudios sobre fragmentación de hábitat, el cual constituye una de las
más serias amenazas a la biodiversidad y su conservación en la actualidad. Se abordarán los
fundamentos y el manejo de herramientas de interés para el análisis de la conectividad y sus
posibilidades de aplicación. Se estudian ejemplos prácticos, como el papel de los corredores
biológicos. Se analizarán los componentes, aplicaciones y ventajas del uso de Sistemas de
Información Geográfica para el anál
114
isis de datos espacialmente referenciados. Se combinará la discusión de los conceptos básicos y
fundamentos teóricos, con la práctica de metodologías cuantitativas y herramientas de
actualidad; como acceso a la web, uso de software, computador, mapas, GPS y otros equipos.
También se proporcionan datos de ejemplos de situaciones y casos reales de interés, que
permiten la práctica del uso de los paquetes de análisis, su utilización y posibilidades de
aplicación en diversos estudios y procesos tendientes a la conservación y manejo de la
biodiversidad. Cada participante contará con un ordenador individual para su uso durante el
curso. El programa proporcionará las respectivas licencias con fines de enseñanza y también se
hará uso de licencias libres en la web ampliamente utilizadas.
OBJETIVOS
Adquirir conocimientos básicos para el estudio del paisaje como entidad global viva y
dinámica.
Familiarizarse con las herramientas y técnicas más utilizadas en el análisis y diseño del
Paisaje.
Apoyar la toma de decisiones en materia de identificación de prioridades de
investigación, monitoreo, planificación y gestión de la conservación, mediante la
identificación de zonas críticas para el mantenimiento o fomento de la conectividad
ecológica, y la evaluación de los impactos de los cambios en el paisaje.
CONTENIDOS
1. Ecología del Paisaje.
a. Definiciones de Paisaje y sus componentes
- Matriz,
- Parche,
- Corredores
o Dónde y cómo surge la disciplina y sus relaciones con otras disciplinas (Geografía .
Fitosociología, Análisis Regional, etc.)
b. Escalas de análisis en Ecología del Paisaje.
2. Fragmentación de hábitats: patrones y procesos de cambio paisajístico y biológico
a. Causas de los Patrones de Paisajes:
- Factores abióticos,
- interacciones bióticas,
- Cambios en el uso del suelo.
115
c. Consecuencias de la fragmentación
- Fragmentación y Efecto de Borde
- Conectividad y Corredores Biológicos.
3. Modelos conceptuales de paisaje
a. Modelo de islas
b. Modelo de parche-matriz-corredor
c. Modelo de paisaje abigarrado
d. Modelo de paisaje continuo.
4. Heterogeneidad del Paisaje
a. Definición
b. Caracterización.
5. Cuantificación de los Patrones de Paisaje
a. Fragmentación,
b. Conectividad, índices de disponibilidad de hábitat
c. Dinámica de parches.
6.. Análisis de datos espacialmente referenciados mediante Sistemas de Información Geográfica
(SIG).
a. Aplicaciones, planificación ambiental, dinámica del paisaje, evaluación de
impactos; prevención de desastres; agrícola; forestal; catastro.
b. Fuentes de datos geográficos: fuentes primarias y secundarias; bases de datos
espaciales.
Cartografía, principios, definición de mapas, ubicación y sistemas de
coordenadas, cálculo de escalas.
Teledetección
GPS (Sistema Global de Posicionamiento).
7. Aplicaciones
a. La Ecología del Paisaje en el diseño de políticas de conservación. (Estudio de caso:
identificación de las zonas críticas para el mantenimiento de la conectividad del hábitat ).
b. La Ecología del Paisaje en el proceso de ordenamiento territorial. Microcuencassistemas agrícolas y otros elementos de la matriz.
c. Aplicación del modelo al análisis de la fragmentación de bosques en Panamá.
116
ESTRATEGIAS METODOLÓGICAS
Discusiones de lecturas, e investigaciones cortas. Taller sobre uso de SIG. Taller de análisis del
paisaje de un caso de estudio específico.
RECURSOS DIDÁCTICOS
Retroproyectores, proyector de diapositivas, proyector de datos (“data show”), ilustración con material del laboratorio, computadoras, videos, pizarra, tiza multicolor, cámara digital, etc.
EVALUACIÓN
Dos pruebas teóricas y dos talleres o seminarios, de los cuales se obtendrá la ponderación de la
calificación final.
REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS
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www.dices.net (Portal SIG)
www.ncgia.ucsb.edu (Manual SIG, inglés)
119
Asignatura: BIO 727
Denominación: CONSERVACION Y MANEJO SOSTENIBLE DE LA BIODIVERSIDAD
Créditos: 3
JUSTIFICACIÓN
La acelerada deforestación de la selva húmeda tropical, la contaminación de aguas y suelos y la
desaparición y/o amenaza de las especies de flora y fauna silvestres, son algunos de los problemas
causados por dichas actividades. Para encarar estos problemas se requiere contar con profesionales
con una sólida formación en el entendimiento de los procesos evolutivos y ecológicos que la explican,
los problemas relacionados con la pérdida de la biodiversidad la formulación de estrategias de
conservación y la evaluación del impacto de las actividades humanas sobre el medio ambiente y en
especial, sobre la biodiversidad. Ello requieren del conocimiento de ciertas herramientas
fundamentales que proporcionan una combinación de teoría ecológica y metodología aplicada para
evaluar las amenazas a la biodiversidad, así como la comunicación de resultados que apoyen la toma
de decisiones de manejo.
DESCRIPCIÓN
Se analiza la diversidad biológica en la región mesoamericana y en particular en Panamá; la
situación actual, estado de conservación, las amenazas; usos y valores; las políticas, estrategias
de conservación; marco legal e institucional; el sistema de áreas silvestres protegidas;
gobernanza y financiamiento. Para ello, se ofrece al alumno una aproximación a las bases
conceptuales y procedimientos, así como un análisis y discusión de las iniciativas nacionales e
internacionales y su situación normativa. El temario aporta los contenidos básicos y suficientes
para que el alumno progrese hacia los cursos más avanzados que le facultarán para incorporarse
hacia la investigación aplicada y la gestión.
El alumno adquirirá conocimientos relacionados con el concepto de biodiversidad, como los
niveles en los que se organiza, métodos de evaluación, amenazas y factores que contribuyen a su
pérdida, así como el desarrollo del concepto de extinción. En este sentido, se proporcionará
información sobre el estado de las especies vegetales y animales actualmente amenazadas o en
peligro de extinción; así como los hábitats y sitios críticos para la conservación. Se analizarán
ejemplos concretos de especies, valorando el estado actual de sus poblaciones, sus hábitats y las
principales amenazas a las que están sometidos. Así como algunas de las medidas propuestas
para su conservación. Se analizarán las políticas que promueven distintas estrategias de
conservación y gestión de la biodiversidad, tales como los principales acuerdos y convenios
internacionales al respecto (la Convención de Diversidad Biológica, la Conferencia de Río). El
alumno conocerá también las comisiones a nivel de Mesoamérica y Panamá sobre la
120
conservación de los hábitats naturales y de la fauna y flora silvestre y su aplicación en la
normativa legal e institucional.
OBJETIVOS
Adquirir conocimientos básicos sobre la gestión de recursos de flora y fauna, terrestre y acuática,
así como de los ecosistemas naturales.
Manejar las herramientas conceptuales, instrumentales y normativas para la evaluación del
estado de conservación del patrimonio biológico, la planificación y el desarrollo de proyectos
dirigidos a la investigación, la conservación y el manejo de elementos de la biodiversidad y sus
hábitats.
CONTENIDOS
1.Situación actual de la biodiversidad
Diagnósticos e inventarios nacionales
Usos y valores de la biodiversidad,
Especies endémicas, raras, comerciales, exóticas, cultivadas, invasoras.
Estado de conservación de especies y ecosistemas
Listas rojas de especies, metodologías para la incorporación de especies a las
listas.
Ecoregiones, ecosistemas y hábitats críticos para la conservación
2.Valores de la biodiversidad
Recursos de la biodiversidad.
Beneficios sociales
Servicios ecosistémicos
Otros valores de la biodiversidad
3.Pérdida de la biodiversidad
Impacto de actividades humanas, amenazas;
Cambio de uso de la tierra,
121
Fragmentación de hábitats;
Destrucción de hábitats
Vulnerabilidad a los cambios climáticos
Sistemas biológicos terrestres
Sistemas marinos y de aguas continentales
Sistemas de gestión y sistemas humanos
Impactos regionales: América Latina.
4.Alternativas a la pérdida de la biodiversidad
Estrategias y políticas de conservación
Conservación in situ:
Restauración de hábitats
El Sistema de Areas Silvestres Protegidas
Corredores Biológicos
Conservación ex situ:
Bancos de Germoplasma
Técnicas de cultivo in vitro, crioconservación
Jardines Botánicos y Arboretos
Reservas Cinegéticas; tipos de caza, modelos de gestión cinegética
Zoocriaderos, Zoológicos; Acuarios.
Vacíos de información.
5.Marco legal e institucional
Normativa legal en conservación y biodiversidad
Planes de manejo, ordenación y monitoreo
De bosques
Pesca de especies continentales y marinas, períodos de veda
De especies de interés cinegético
De especies amenazadas y en peligro
6.Gobernanza y manejo participativo
Concepto de gobernanza
Principales actores
Fortalecimiento de las capacidades locales
Manejo participativo.
122
7-Financiamiento internacional y local
Mecanismos de Desarrollo Limpio,
Protocolo de Kyoto,
Programa REDD
Bonos verdes
Bonos de carbono.
8.Cambios Climáticos Globales
Mitigación
Áreas silvestres protegidas
Bosques
Humedales continentales
Ecosistemas costero-marinos
Suelos
Adaptación
Áreas silvestres protegidas
Desastres naturales
Disponibilidad de agua
Pesquerías marinas y de agua dulce
Recursos genéticos
Biodiversidad y resiliencia de los ecosistemas.
Oportunidades e implicaciones para la gestión y la gobernanza en las áreas protegidas
Recomendaciones de políticas.
ESTRATEGIAS METODOLÓGICAS
Presentación dialogada con discusiones entre los participantes; estudios de caso; visitas;
entrevistas a actores claves; giras de estudio.
RECURSOS DIDÁCTICOS
Retroproyectores, proyector de diapositivas, proyector de datos (“data show”), ilustración con material del laboratorio, computadoras, videos, pizarra, tiza multicolor, cámara digital, etc.
123
EVALUACIÓN
Dos pruebas teóricas (60%)
Un trabajo monográfico final, sustentado oralmente (40%).
REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS
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126
Asignatura: BIO 728
Denominación: CONSERVACIÓN DE ÁREAS SILVESTRES PROTEGIDAS
Créditos: 3
JUSTIFICACION
Durante mucho tiempo se pensó que protegiendo una superficie determinada de espacio natural,
como las áreas silvestre, se aseguraría la supervivencia de las especies que allí habitan. Sin
embargo, en la actualidad el manejo de las áreas naturales protegidas enfrenta serios problemas
debido a su fragmentación, poniendo en peligro la supervivencia su biodiversidad. Entonces
resulta evidente que es necesario conocer mejor la estructura y funcionamiento de los
ecosistemas protegidos, para lograr un manejo adecuado. Ello requiere un conocimiento de los
principios ecológicos, así como la comprensión de los procesos que operan en el área y la
aceptación del concepto de que el manejo de áreas protegidas es otra forma especializada de uso
de la tierra.
Dado que los espacios naturales son caracterizados principalmente por su biodiversidad, es
importante y necesaria la participación de biólogos en la búsqueda de soluciones a los problemas
planteados. Sin embargo, también es importante que aquellos que participen en el esfuerzo para
mejorar el manejo de las áreas silvestres comprendan los conceptos básicos que las rigen. Es por
esto que deben conocer las técnicas para la planificación y manejo de lo espacios naturales
protegidos; así como, los aspectos legales, sociales y económicos involucrados.
DESCRIPCION
Se proporcionan los conceptos teóricos y las herramientas metodológicas básicas, que permiten
comprender y desarrollar los procesos de planificación necesarios para el buen funcionamiento
de un área protegida. En el curso se incorporan conceptos ecológicos aplicados al manejo de
áreas protegidas, metodologías para la elaboración de planes de manejo, programas de
monitoreo, métodos de manejo participativo, normativa de uso, zonificación, oportunidades de
usos y determinación de la capacidad de carga turística de las áreas silvestres protegidas. Se
examinan los detalles de la planificación y gestión de las áreas silvestres protegidas, una de las
herramientas en la gestión del medioambiente. Se presentarán y discutirán las características y
especificaciones de las distintas figuras de protección de espacios naturales, según la normativa
internacional (parques y reserva naturales; monumentos naturales,etc.) y se analizarán ejemplos
de espacios naturales protegidos en Panamá.
127
OBJETIVOS
Proporcionar a los estudiantes los principales conceptos, principios, métodos y técnicas de
manejo de áreas protegidas, que le permitan participar exitosamente en el manejo de áreas
silvestres.
Ofrecer a conocer a los biólogos un nuevo escenario para la aplicación de sus conocimientos
profesionales, con el propósito de lograr un uso adecuado de las áreas silvestres.
Fomentar el enfoque interdisciplinario y el trabajo en equipo para identificar y resolver los
problemas que afectan a las áreas silvestres protegidas.
CONTENIDOS
Módulo 1. Antecedentes en el manejo de áreas silvestres.
Antecedentes históricos generales del manejo de áreas silvestres.
Antecedentes históricos del manejo de áreas silvestres en Panamá.
Conceptos, definiciones y tendencias relativas al manejo de áreas silvestres.
Módulo 2. Situación de las áreas silvestres en Panamá.
Sistema Nacional de áreas protegidas.
Marco legal e institucional para el manejo de áreas silvestres protegidas.
Conflictos en el manejo de áreas silvestres protegidas.
Módulo 3. La planificación y manejo de áreas silvestres
Conceptos ecológicos aplicados al manejo de áreas protegidas.
Elaboración de Planes de manejo.
Monitoreo de la biodiversidad en áreas protegidas.
Manejo participativo.
Instrumentos de normativa y zonificación.
Capacidad de carga turística de las áreas silvestres protegidas.
Módulo 4. Beneficios sociales, económicos y ambientales de las áreas silvestres.
Las áreas silvestres protegidas y su influencia sobre las comunidades locales.
Las actividades humanas en las zonas de amortiguamiento y en el interior de las áreas
protegidas.
Servicios y beneficios ambientales que ofrecen las áreas protegidas.
Los usos turísticos y recreativos asociados a las áreas silvestres protegidas.
Módulo 5. Evaluación de Planes de manejo y sistemas de áreas protegidas.
Metodología de evaluación.
Efectividad del manejo e Indicadores.
Estudio de caso.
128
ESTRATEGIAS METODOLÓGICAS
Las clases son presénciales, donde el docente presentará los temas centrales para la discusión.
Los estudiantes desarrollarán los temas expuestos mediante discusiones en grupo y lecturas
asignadas. Además, los estudiantes tendrán la responsabilidad de preparar informes, producto de
consultas sobre temas asignados. Como complemento se realizarán estudios de caso, sobre
planes de manejo de bosques naturales. El curso estará basado en una revisión amplia de los
conceptos teóricos, principios, métodos y técnicas de manejo de áreas silvestres protegidas, así
como el estudio de casos exitosos y logros del Sistema Nacional de Áreas Protegidas (SINAP)
de Panamá.
EVALUACIÓN
Participación en análisis de lecturas debates y foros de discusión (35%), sustentación oral de
trabajos de investigación (35%) y presentación de monografía como trabajo final del curso
(35%).
REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS
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131
Asignatura: BIO 729
Denominación: SEMINARIO DE TESIS II
Créditos: 1
JUSTIFICACION
La necesidad de la presentación de los proyectos de investigación, artículos científicos y la
Escritura de los mismos una prioridad para el investigador, por lo que se requiere de un curso
donde el estudiante adquiere los conocimientos y destrezas para el desarrollo de estas actividades.
DESCRIPCION
En este curso el estudiante debe presentar los avances de la tesis de grado en forma oral y escrita,
utilizando las metodologías apropiadas para la escritura de todo proyecto de investigación.
OBJETIVOS GENERALES: Conocer las principales técnicas de presentación de los
proyectos de investigación y redacción de artículos científicos.
OBJETIVOS ESPECÍFICOS:
Revisión de los avances en la formulación del Anteproyecto de Tesis.
Aprobación e inscripción del Anteproyecto de Tesis.
CONTENIDO DEL CURSO:
Elaboración y discusión del proyecto de trabajo de grado.
Revisión de la literatura científica sobre tópicos seleccionados y relacionados con aspectos
biológicos.
Presentación de un trabajo escrito y discusión oral del mismo, preferentemente de los
avances del trabajo de grado.
METODOLOGÍA:
Al ser un curso presencial al nivel de maestría, este se centrará en estrategias andragógicas con apoyo de las TIC ́s. No obstante, la implementación de las innovaciones tecnológicas no deja de
lado estrategias metodológicas que propician el pensamiento analítico. Se propone la exposición
y evaluación de los distintos temas escogidos por los estudiantes y el debate inherente a estos a
132
cada uno de los temas, así como las correcciones en forma de los escritos a fin de pulir lo
mayormente posible sus Anteproyectos de Tesis.
EVALUACIÓN Inicialmente de completará una evaluación diagnóstica y durante la marcha del
curso, se realizarán evaluaciones formativas. A nivel cuantitativo – sumativo, se propone el
siguiente esquema que se discutirá con los participantes:
CRITERIO
PORCENTAJE
Asistencia y participación activa
10 %
Asignaciones individuales
30 %
Actividades grupales en clase (talleres)
20 %
Proyecto final
40 %
TOTAL
100 %
La calificación de este curso está sujeta a la debida inscripción de sus anteproyectos de tesis en la
Vicerrectoría de Investigación y Postgrado.
1. Unidad responsable
Vicerrectoría de Investigación y Postgrado
10.Unidad ejecutora
Facultad de Ciencias Naturales, Exactas y Tecnología
11.Modalidad
El programa propuesto es una Maestría Académica que deberá ser completado con Tesis de
grado. La Coordinación del Programa tomará las providencias para orientar académicamente al
estudiante mediante tutorías.
12.Duración
2 años
133
13.Regimen académico
13.1.
Requisitos de Admisión
Poseer título universitario de Licenciatura en Biología o Ciencias afines.
Demostrar solvencia económica o apoyo de entidad pública o privada que garantice el
financiamiento de los costos en la Maestría.
Someterse a entrevistas con el Comité de Admisión.
Presentar los siguientes documentos personales:
a. Formulario de admisión completo.
b. Tres copias autenticadas del título académico.
c. Tres copias autenticadas del certificado oficial de calificaciones, que incluya la escala de
calificaciones y el sistema de créditos universitarios, incluyendo su traducción al español, si
fuese necesario.
d. Copia de la cédula de identidad personal o un documento equivalente.
e. Tres fotografías tamaño carnet (con el nombre al reverso).
f. Curriculum vitae (datos personales, antecedentes académicos, experiencia docente y
profesional, investigaciones realizadas, publicaciones, asesorías, distinciones académicas,
etc.)
g. Certificado médico de buena salud física y mental.
h. Dos cartas de recomendación de profesionales del área.
i. Constancia del financiamiento, durante del periodo de estudios, de los gastos
personales y de colegiatura.
g) Comprobar un nivel intermedio en inglés como mínimo, determinado por el Centro de
Lenguas de la Universidad.
134
13.2.
Requisitos de Selección
La selección de los aspirantes será efectuada en primera instancia por el Comité de Admisión del
Programa y posteriormente los resultados serán sometidos a la Comisión Académica del
Programa, quien tomará la decisión final. La selección se efectuará tomando en consideración el
cumplimiento de los requisitos de admisión.
La apertura de cada opción estará condicionada a un mínimo de cinco (5) estudiantes. Se espera
que el número de estudiantes admitidos en el programa sea de 10 a 16 estudiantes.
13.3.
Requisitos de Permanencia
Lo establecido en el Reglamento General de Estudios de Postgrado.
13.4.
Requisitos de Egreso
a) Haber aprobado las asignaturas del Plan de Estudio.
b) Mantener, durante sus estudios un índice no menor de 2.0.
c) Comprobar su dominio del uso de la computadora
d) Elaborar y sustentar oralmente ante un Comité Académico designado por la Comisión
Académica, una tesis de grado desarrollada en una de las áreas de Investigación de
Ciencias Biológicas.
e) Haber cumplido con todos los requisitos administrativos y académicos del Programa.
f) Demostrar un dominio del idioma inglés no inferior a 500 en el TOEFL ( Test of English
as a Foreign Language).
14.Recursos humanos
En la Universidad de Panamá laboran profesionales de la Biología con el grado de Doctor y con
grado de Maestría.
El personal docente del programa de maestría será nombrado de conformidad con lo establecido
en el Estatuto y el Reglamento General de Estudios de Postgrado de la Universidad de Panamá.
Para tal fin, serán elegibles los profesores que laboran en los departamentos académicos de la
Universidad de Panamá, centros e institutos de investigación, en la industria, y en las
135
universidades o instituciones nacionales o extranjeras que mantengan acuerdos o convenios de
cooperación con la Universidad de Panamá. Se están cursando invitaciones a profesores del
extranjero, por medio de los convenios y demás acuerdos que tiene la Universidad de Panamá y
la Secretaría Nacional de Ciencia, Tecnología e Innovación. A los profesores invitados se les
ofrecerá hospedaje y un estipendio diario para alimentación y gastos personales menores.
Cuando la selección del docente recaiga en un extranjero, se nombrará también, a título de
homólogo, a un profesor que ejerza la docencia en la Universidad de Panamá.
15.Instalaciones y facilidades
Para desarrollar esta maestría se cuenta con la siguiente infraestructura y recursos:
Laboratorios de Departamentos de la escuela de Biología – FCNET
Laboratorios científicos - Edificio Laboratorios Científicos – Gemelos VIP
Museos de la Facultad de Ciencias Naturales, Exactas y Tecnología
Instituto Especializado de Análisis
Biblioteca Simón Bolívar
Instituto Conmemorativo Gorgas
Instituto de Medicina Forense
Complejo Metropolitano de la Caja del Seguro Social Harmodio Arias Madrid
Colecciones bibliográficas de profesores e investigadores
Recursos de apoyo de SENACYT (Computadores, INTERNET 2, Talleres, Documentación,
etc.)
Laboratorios de STRI apoyado en el convenio con la universidad de Panamá.
Apoyo de Profesores de Universidades extranjeras con las que se mantiene convenios
marcos.
136
16.Costos
Rubro
Costo
Pre-inscripción
B/. 50.00
Matrículas (c/u)
B/. 30.00
Créditos (c/u)
B/. 60.00
Laboratorios (c/u)
B/. 50.00
Inscripción de Tesis
B/. 300.00
Además de los costos arriba mencionados, el estudiante deberá pagar los costos establecidos en
concepto de:
Carnet
B/. 1.00 (anual)
Cafetería
B/. 2.00 (semestral)
Bienestar estudiantil
B/. 1.00 (semestral)
Seguro Colectivo estudiantil
B/. 1.50 (semestral)
Biblioteca
B/. 1.00 (semestral)
Deporte
B/. 1.00 (semestral)
Diploma
B/. 80.00
Créditos Oficiales
B/.
3.00
Paz y Salvo Finanzas
B/.
2.00
Orientación en Biología Molecular
RUBROS
Propedéutico
Pre-inscripción
Matrículas
Créditos
Laboratorio
Carné anual
Servicios Universitarios
Cafetería
CANTIDAD
1 x 225.00
1 x 50.00
6 x 30.00
54 x 60.00
2 x 50.00
2 x 1.00
COSTOS
225.00
50.00
180.00
3240.00
100.00
2.00
4 x 2.00
8.00
137
Bienestar estudiantil
Seguro Colectivo estudiantil
Biblioteca
Deporte
Derecho a Tesis
Diploma
Créditos oficiales
Paz y Salvo Finanzas
TOTAL:
4 x 1.00
4 x 1.50
4 x 1.00
4 x 1.00
1 x 300.00
1 x 80.00
1 x 3.00
1 x 2.00
4.00
6.00
4.00
4.00
300.00
80.00
3.00
2.00
B/. 3,543.00 B/. 4208.00
Orientación en Biodiversidad y Conservación
RUBROS
Propedéutico
Pre-inscripción
Matrículas
Créditos
Laboratorio
Carné anual
Servicios Universitarios
Cafetería
Bienestar estudiantil
Seguro Colectivo estudiantil
Biblioteca
Deporte
Derecho a Tesis
Diploma
Créditos oficiales
Paz y Salvo Finanzas
TOTAL:
CANTIDAD
1 x 225.00
1 x 50.00
6 x 30.00
54 x 60.00
1 x 50.00
2 x 1.00
4 x 2.00
4 x 1.00
4 x 1.50
4 x 1.00
4 x 1.00
1 x 300.00
1 x 80.00
1 x 3.00
1 x 2.00
COSTOS
225.00
50.00
180.00
3240.00
50.00
2.00
8.00
4.00
6.00
4.00
4.00
300.00
80.00
3.00
2.00
B/. 3,543.00 B/. 4158.00
138
17.Candidatos a la nueva promoción
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
Som monn Iglesias
Digna Caicedo Perea
Eric Pérez
Yexenia Cárdenas y.
Adriana Spence Brown
Leonel Rivera
Yazmín Oliveros
Fátima Frías
Marie Mela
Diógenes Anderson
Noemí Ortega
Daisy Serrano
Daisy Ayarza
Karina Beitia
Carlos Bracho
María Magallón
Aurelio Johnson
Erasmo Rodríguez
Eblis Díaz
Luis Camarena
Mahody diaz
Roxana Pimentel
Julia Moreno
Rudolph Hansen
Reyla Barrera
Genaro Winford
Yasury Ruíz
Orlando Ortiz
Kahoris Lasso
Aziel Chavarría
Stephanie Bósquez
Librada Atencio
Ibeth Polo
Isis contreras
Úrsula Vargas
Mireya Rodríguez
Celeste Rubio
Marcos Hugmes
Lany Valdez
Rosa Gálvez
Estefani Martínez
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected],
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
139
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
Christel Ramos
Argelis romero
Amarilis Malter
Yasury Ruíz
Julia Moreno
Leyda Rodríguez
Yoselyn Álvarez
Roselvy barrios
Ana Raquel Lenny
Lissette Jurado
Marcelo Mack
Azael Gonzales
Indira Pinzón
Milex Molinar
Geniva de Nightingale
Joel Sánchez
Yaraví Suarez
Patricia Pérez
Carlos Martínez
Gabriela Pobeda
Celideth Zuñon
Vladimir Loaiza
Máximo Jiménez
Javier Mancilla
Marggie Rodríguez
Martha Gómez
Osiris Murcia
Marcos Hughes
Beatriz Sosa
Lizbeth Chacón
Mayra Contreras
Melvys Vega
Lorena L. Adames T.
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
yaraví[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
[email protected]
140
18.Evaluación del programa (2011)
La Agencia Centroamericana de Acreditación de Postgrado ACAP revisó exhaustivamente el
Informe de Evaluación Externa de la Maestría en Ciencias Biológicas de la Universidad de
Panamá y de su Comité Técnico de Evaluación de forma positiva. La Secretaría Ejecutiva de la
Agencia Centroamericana de Acreditación de Postgrado ACAP notificó en consecuencia la
acreditación del Programa de Maestría en Ciencias Biológicas por un periodo de tres años
mediante Oficio/101/2014/ACAP del 15 de julio de 2014. La acreditación supone un Plan de
Mejoras.
141
19. Anexos
Líneas de investigación
Las líneas que se desarrollan, de acuerdo al nuevo plan de estudio, son Biología Molecular y
Biodiversidad y Conservación. Durante el proceso de acreditación universitaria se recomendó
acotar los diferentes programas de investigación de cada una de las áreas o unidades
académicas. De esta manera, la línea de Biología Molecular tiene como sub-líneas:
1. Polimorfismos genéticos a nivel molecular y celular
2. Biotecnología
Para el énfasis de Biodiversidad y Conservación las sub-líneas de investigación para
desarrollar las investigaciones son:
1.
2.
3.
4.
Diversidad, conservación y utilización de la Flora Panameña
Ecofisiología Vegetal
Sistemática y Diversidad de Vertebrados e Invertebrados
Ecología y Biología de la Conservación de Vertebrados e Invertebrados
142
Lista de docentes
Se presenta a continuación una lista de docentes que en su mayoría pertenecen a la planta de
la Facultad de Ciencias Naturales y Exactas y que se consideran para impartir los cursos.
Igualmente se añaden los docentes del extranjero. La lista no está cerrada.
Propedéutico
Fundamentos de Estadística
Inglés Científico
Profesores
Metodología de la Investigación científica
Dr. Enrique Medianero
Tronco Común
Biodiversidad
Centro de Lenguas-Universidad de Panamá
Mgtr. Jacobo Araúz
Dra. Cristina Garibaldi
Bioquímica Avanzada
Dr. Tomás Diez
Biología Celular
Análisis de datos y diseño experimental en
biología
Dr. José Young
Dr. Enrique Medianero
Dr. Daniel Emmen
Biología Molecular
Mgtr. Olga Chen
Dr. Carlos Ramos
Dra. Magaly de Chial
Genética de la conservación
Dr. Edgardo Díaz
Dra. Gretel Geada (invitada-Cuba)
Dr. Carlos Vergara
Dr. Oscar Puebla (STRI)
Biología Evolutiva
Seminario I
Biología Molecular
Virología Molecular
Dra. Yolanda Águila
Dra. Edna González
Mgtr. James Coronado
Dra. Alex Martínez
Dra. Sara Ahumada
Inmunología
Dra. Lisbeth Salazar (Costa Rica)
Mgtr. Brenda de Mayorga
Genética microbiana y de eucariotas
superiores
Mgtr. Brenda de Mayorga
Dr. Carlos Ramos
Dr. Luis Mejía
Dr. Fernando Carlos Gómez Merino (invitado-
143
México)
ADN Recombinante
Dr. Amador Goodridge
Dr. Carlos Ramos
Dra. Magaly de Chial
Bioinformática
Dr. Luis Mejía
Dra. Diego M. Riaño-Pachón (Invitado-Brazil)
Técnicas en Biología Molecular
Dr. Carlos Ramos
Dra. Magaly de Chial
Dr. Juan Pascale
Gorgas, STRI, Instituto de Medicina Forense,
INDICASAT
Genética de Poblaciones
Dra. Edna González
Dr. Oscar Puebla (STRI)
Biotecnología
Dr. Luis Maroto (invitado de Cuba)
Mgtr. Brenda de Mayorga
Mgtr. Olga Chen
Marcadores Moleculares
Dr. Carlos Ramos
Dr. Ronnie Gavilán
Biodiversidad y Conservación
Biología de la Conservación
Dr. Daniel Emmén
Mgtr. Jorge Mendieta
Mgtr. Jacobo Araúz
Ecología de Poblaciones
Dr. Daniel Emmén
Dr. Omar López
Ecología de Comunidades Naturales
Dr. Omar López
Dr. Luis Cayuela (Invitado España)
Dra. Cristina Garibaldi
Prácticas de Campo en Ecología Tropical
Dr. Omar López
Dr. Daniel Emmen
Dra. Cristina Garibaldi
Conservación de Áreas Silvestres protegidas
Mgtr. Jacobo Araúz
Dr. Eric Flores
Mgtr. Jorge Mendieta
Conservación y Manejo Sostenible de la
Biodiversidad
Dr. Rogelio Sotolongo (invitado Cuba), Mgtr.
Jacobo Araúz
Dra.Cristina Garibaldi
144
Herramientas para Análisis del Paisaje y
Conservación
Dr. Luis Cayuela (invitado España)
Dr. Raúl Martínez
Dra. Cristina Garibaldi
Etología
Dr. César Villarreal
145
Lista de Asesores o Directores de Tesis
Se presenta a continuación una lista de docentes que se proponen como Asesores o
Directores de Tesis, y que pertenecen a la planta de la Facultad de Ciencias Naturales y
Exactas. La lista no está cerrada, se considera la posibilidad de asesores externos con coasesores de nuestra planta docente.
Nombre del Profesor
Carlos Ramos
Magaly de Chial
Edna González
Luis Mejía
José Young
Yolanda Aguila
Jacobo Araúz
Cristina Garibaldi
Daniel Emmen
Dora Quirós
Grado Académico
Ph.D
Ph.D.
Ph.D.
Ph.D.
Ph.D.
Ph.D.
MSc
Ph.D
Ph.D.
Ph.D.