Clase Gen Desarrollo I

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Gené%ca del Desarrollo
Mariana Delfino
Oficina 47
Mariana Delfino
UCR
Nadia Rosenthal, 2009
Biología del Desarrollo
4
6
-­‐3
B
O
S
R
CU -­‐2014!
II
Estudia procesos mediante los cuales se generan organismos y se les da su forma
Eventos regulados por programa interno...
...influenciados por interacción con ambiente
La biología del desarrollo moderna estudia: el control gené%co del crecimiento, la diferenciación celular, la morfogénesis y las células madre
Mariana Delfino
UCR
Organismo
Órgano
Tejido
Células
Organelas
Moléculas
Átomos
Fisiología celular...
¡en el contexto tridimensional apropiado!
Mariana Delfino
UCR
El Plan Corporal “Bauplan”
Aunque existan principios generales para el desarrollo, ¡existen variaciones! (y son informa%vas)
Briony Marshall
Los organismos modelo: -­‐ seleccionados por sus ventajas
-­‐ extrapolamos para entender desarrollo humano
Mariana Delfino
UCR
Variedad de modelos...
Ciencia básica -­‐-­‐-­‐ a ciencia aplicada Mariana Delfino
UCR
Karl Von Baer (Rusia)
padre de la embriología
Leyes de Von Baer de la Embriología, 1828
1. Los caracteres generales del grupo al que pertenece un embrión aparecen durante el desarrollo antes que los específicos.
2. Las relaciones estructurales específicas se forman después de las generales.
3. El embrión no pasa por estadios pertenecientes a otras formas específicas sino que se separa de ellas.
4. El embrión de una forma animal nunca se asemeja al adulto de otra forma animal sino a su embrión.
Delfino
1859: Teoría de la evolución por selección natural -­‐ DMariana
arwin
UCR
Equivalencia gené%ca
¿Todas las celulas de un organismo contienen la misma información (DNA)?
Célula diferenciada es
capaz de generar un organismo
1953
1958
Sir John Gurdon
John%B.%Gurdon%y%Shinya%Yamanaka%
Mariana Delfino
UCR
Equivalencia gené%ca
Ojo de salamandra: -­‐ extracción de la re.na neural promueve regeneración desde RPE.
-­‐ extracción de la lente: nueva lente a par.r del iris (regeneración de Wolff)
Núcleos del iris dorsal comienzan a sinte.zar muchos ribosomas, replican el ADN y hay mitosis. Las células se des-­‐diferencian descartando los melanosomas, que son ingeridos por macrófagos. Las células desdiferenciadas prolifera.vas sinte.zan productos de la lente: las proteínas del cristalino.
Ejemplo de metaplasia o transdiferenciación
Godwin et al.
Mariana Delfino
UCR
Las células somá%cas %enen todas la misma información gené%ca:
equivalencia gené;ca
Las diferencias ocurren por expresión génica diferencial:
los genes son ac%vados por
proteínas reguladoras de genes
o
factores de transcripción
¡Los genes del desarrollo están altamente regulados para
asegurar que se ac%ven en el si%o y momento apropiados!
Mariana Delfino
UCR
Conceptos clave: Ac%vidad o habilidad regulatoria de las células
Des%no prospec%vo o potencial. El des%no potencial siempre es más amplio de que su des%no celular: “cell fate”
El estudio de estos conceptos está en la base de la biologia del desarrollo: Cómo la célula adquiere su des%no celular, su potencial y cómo éste se regula.
Mariana Delfino
UCR
Inicios del s. XX: GenéJca y embriología son campos separados
Reintegración en 1930’s: Salome Gluecksohn-­‐Welsch y Conrad Waddington buscan mutaciones
Gluecksohn-­‐Welsch: Brachyury en ratón (desarrollo posterior y de notocorda afectado)
Waddington: alas malformadas en Drosophila ...”estudio de acción de genes en desarrollo”
...Inicio de la genéJca del desarrollo
paisaje epigené%co
Mariana Delfino
UCR
La biología del desarrollo y la genéJca
1800’s: Embriología descrip%va
1900’s: se redescubren las leyes de Mendel
Evidencia de los “factores mendelianos”:
1900’s : Drosophila, Thomas Hunt Morgan descubre
herencia ligada a cromosomas
1930’s: gené%ca del desarrollo
1960’s: genes codifican proteínas que regulan genes
1970’s: células madre del cordón umbilical
1980’s: Genes Hox y eSCs
1997: oveja Dolly (primer mamífero clonado)
2006: reprogramación celular, iPSCs
La Gené%ca se unió a la Biología Molecular
Delfino
Surgieron modelos de desarrollo en términos de circuitos génicos Mariana
UCR
¿Cómo controlan los genes el desarrollo?
Las interacciones entre células determinan el desarrollo
Ningún proceso del desarrollo puede explicarse solamente como la función de un gen.
Durante el desarrollo ocurren cuatro procesos:
-­‐ emergen patrones (se define el plan corporal)
-­‐ ocurren cambios de forma
-­‐ diferenciación celular
-­‐ crecimiento
¿Cómo ocurren?
Mariana Delfino
UCR
Al mismo %empo que se establecen los ejes corporales,
las células se distribuyen por capas germinales
Las capas germinales: cambio de forma y diferenciación
*Cresta Neural: esqueleto!
Mariana Delfino
UCR
El comportamiento celular es la conexión
entre los genes y los procesos de desarrollo
Las proteínas tejido-­‐específicas son las que hacen a las células dis%ntas entre sí
Los genes del desarrollo están altamente regulados..
¿Por qué?
Mariana Delfino
UCR
El desarrollo es progresivo
R. Kelsh 2006
El des;no celular se determina en momentos dis%ntos para diferentes células
Mariana Delfino
UCR
Mariana Delfino
UCR
Biología del desarrollo = redes génicas + morfogénesis
morfogénesis: adquisición de la forma
En “From egg to embryo” Jonathan Slack escribe: “an explana%on of shape changes during development also requires a substan%al physical and mechanical descrip%on” (Slack, 1991).
Mariana Delfino
UCR
Biología del desarrollo = redes génicas + morfogénesis
morfogénesis: adquisición de la forma
M. Delfino-­‐Machín
Mariana Delfino
Delfino-­‐Machín, et al. 2012
UCR
Procesos de desarrollo embrionario
1. Crecimiento-división celular (replicación ADN)
2. Diferenciación celular- expresión génica diferencial
! ! ! ! ! ! ! ! (regulación de la transcripción)
¿Cómo se organiza la información residente en el ADN
en diferentes niveles para generar
los programas de expresión génica que
subyacen la generación de la diversidad celular?
Niveles de complejidad creciente
Mariana Delfino
UCR
Los genes del desarrollo con%enen regiones controladoras con módulos cis reguladores
Cada módulo con%ene varios si%os de unión para factores de transcripción
La combinación de factores unidos determina si el gen está ac%vo o no
ca. 4-­‐8
A los factores se unen proteínas
co-­‐ac;vadoras y co-­‐represoras
Mariana Delfino
UCR
Las regiones reguladoras o “módulos” funcionan independientemente: un gen puede responder a varios módulos ¡Los genes pueden expresarse en dis%ntos momentos y lugares, en respuesta a señales varias!
(posi.ve and nega.ve feedback loops)
Redes de expresión incluyen bucles de retroalimentación posi%va y nega%va
Mariana Delfino
UCR
Expresión diferencial de genes
Consenso en 1960’s basado en evidencia de equivalencia genómica:
las células se diferencian por expresión diferencial de genes.
Los postulados de la expresión diferencial de genes son:
1) Cada núcleo con;ene el genoma completo que se establece en el huevo fer.lizado. Molecularmente, el ADN de todas las células diferenciadas es idén.co. 2) Los genes no usados en las células diferenciadas no se destruyen ni mutan, pero man.enen su potencial para ser expresados.
3) Solo una proporción pequeña del genoma es expresada en cada célula, y la porción de ARN sinte.zado en cada célula es específico para ese .po celular.
Mariana Delfino
UCR
GenéJca del desarollo: resumen
-­‐ La expresión diferencial de genes crea %pos celulares dis%ntos
-­‐ Los genes suelen estar reprimidos: para ac%var un gen debe inhibirse su represor
Mariana Delfino
UCR
-­‐ Las ARN polimerasas se unen a regiones promotoras con ayuda de los factores de transcripción. FT pueden promover o inhibir la transcripción.
-­‐ Los genes expresados en %pos celulares específicos con%enen secuencias enhancer o potenciadoras que controlan la ac%vidad de éstos genes
-­‐ Los enhancers actúan en combinación
Mariana Delfino
UCR
Modularidad de los Enhancers
-­‐ Secuencias enhancer son las mismas: difieren las combinaciones de FT que se unen
-­‐ Un enhancer puede unirse a varios FT: es la combinación de FT que permite la ac%vación
-­‐ El mismo FT puede ac%var diferentes promotores en combinación con otros FT!
-­‐ Un gen puede tener varios enhancers: ac%vación en dis%ntos tejidos
Mariana Delfino
UCR
Modularidad de los Enhancers (y acJvidad combinada de FT): Pax6 ac%vando genes de cristalina y somasto;na
gracias a dis%ntos enhancers y FT
Mariana Delfino
UCR
“Puede que la audacia sea un don,
pero quizás más precioso es el coraje que viene de cul%var el hábito
de reusar que sea el miedo el que
dicte nuestras acciones”
Aung San Suu Kyi, Nobel de la Paz 1991
Prisionera polí%ca (15 años) en Birmania
Mariana Delfino
UCR
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