Elaborado por: Berta Inés Delgado Fajardo LAS PROTEINAS 1. GENERALIDADES La palabra proteína se deriva de la palabra griega proteios que significa “de primera importancia”. Las proteínas son los componentes principales de todas las células del cuerpo. Son mucho más complejas que los carbohidratos y que las grasas. Las plantas sintetizan las proteínas a partir de los materiales presentes en el aire y en el suelo. Los animales no pueden sintetizar las proteínas a partir de esos materiales, y deben obtenerlos a partir de las proteínas de las plantas o de otros animales. Los animales excretan materiales de desecho que contienen muchos compuestos nitrogenados los cuales durante los procesos de descomposición realizados por las bacterias del suelo se convierten en compuestos solubles de nitrógeno. Las plantas usan estos compuestos para la fabricación de más proteínas completando un ciclo en la naturaleza. Una versión simplificada del ciclo de nitrógeno se observa en la figura 1. Proteínas de las plantas Proteínas de los animales Bacterias fijadoras de nitrógeno Nitrógeno del aire Compuesto de nitrógeno soluble Ba cte rias De nit rifi can tes denitrifi cantes Producto de desecho animal Fig. 1. Esquema general del ciclo del nitrógeno La función principal de las proteínas en el cuerpo es la construcción de nuevas células, el mantenimiento de células existentes y el reemplazo de células viejas. Las proteínas son fuentes de energía en el cuerpo, la oxidación de un gramo de proteína produce cuatro calorías. Las proteínas son también necesarias para la formación de varias enzimas y hormonas que se encuentran en el cuerpo. 2. ENLACES PEPTIDICOS Atendiendo el punto de vista químico, las proteínas se definen como sustancias cuaternarias complejas, de alto peso molecular, formadas principalmente por -aminoácidos, ligados por uniones peptìdicas (amìdicas). Estas uniones se establecen por la condensación de dos o más aminoácidos, a través de sus grupos –COOH y –NH2 (-COO- y NH3+) con pérdida de una molécula de agua. Elaborado por: Berta Inés Delgado Fajardo Residuo 1 Residuo 2 Residuo 3 Residuo 4 Residuo 5 Ile Val Glu Gln Gly OH CH3 CH2 CH O O CH2 N H N-terminal O CH2 H N H NH3+ C=O CH3 CH O CH3 CH3 H N N H - O CH2 O CH2 C-terminal C=O NH2 Fig 2. Pentapéptido formado por cinco aminoácidos con cuatro uniones peptídicas Cada unidad de aminoácido en el péptido, se llama residuo. La probabilidad de combinaciones de los 20 aminoácidos que se agrupan en diferente número y orden, es infinita, por lo que es posible la formación de diferentes especies químicas de acuerdo con la secuencia en que se dispongan éstos aminoácidos. Existen por ejemplo cadenas cortas de ocho aminoácidos que forman el polipéptido llamado oxitocina, con acción hormonal y es secretada por la hipófisis. El peso molecular de éste polipéptido es cercano a 1000. Sin embargo la mayoría de las proteínas están formadas por miles de aminoácidos, con altos pesos moleculares. El extremo del péptido con el grupo amino (-NH3+) libre, se llama extremo N-terminal y generalmente se dibuja a la izquierda. El extremo del péptido con el grupo carboxilo libre (COO-) se denomina C-terminal y se dibuja a la derecha. Los péptidos se nombran empezando por el aminoácido del extremo N-terminal y todos los aminoácidos excepto el último se nombran terminados en el sufijo il; el último residuo de aminoácido presente se le coloca el nombre completo del mismo. No debemos confundir el término "polipéptido" con el término "proteína." Polipéptido refiere a la estructura de una cadena única. Cada polipéptido tiene un grupo amino libre (N- terminal y un grupo carboxílico libre (C-terminal). Proteína se refiere a la unión funcional total, creada cuando uno o más polipéptidos se pliegan y llegan a ser unidades funcionales. Algunas proteínas consisten en una cadena de polipéptidos plegada, pero muchas proteínas contienen múltiples polipéptidos, y átomos inorgánicos como el zinc, el hierro y el magnesio. Las proteínas por estar formadas de aminoácidos tienen también un punto isoelectrico el cual es diferente para cada proteína. En el punto isoelectrico las proteínas tienen mínimo de solubilidad, mínima viscosidad y mínima presión osmótica. A un pH por encima del punto isoelectrico las proteínas tienen mas cargas negativas que positivas. A un pH por debajo del punto isoelectrico las proteínas tienen mas cargas positivas que negativas. Elaborado por: Berta Inés Delgado Fajardo 3. COMPOSICION PORCENTUAL DE LAS PROTEINAS La composición de las proteínas se expresa en términos del porcentaje de cada elemento (carbono, nitrógeno, oxígeno, hidrógeno, azufre, fósforo) en una muestra completamente seca. La tabla 1 muestra la composición porcentual general de las proteínas. Tabla 1. Valor porcentual de los elementos presentes en las proteínas Elemento Porcentaje de Cada Elemento Porcentaje promedio de Cada elemento Carbono 50-55 52.5 Oxigeno 20-23 21.5 Nitrógeno 12-20 16 Hidrógeno 6-7 6.5 Azufre 0.2-3 1.6 De acuerdo con lo anterior, si cada 100g de proteína contienen 16g de nitrógeno, entonces la proporción de proteína representad por gramo de nitrógeno será de 6.25. Por esta razón para calcular en general la cantidad de proteína en una muestra, se determina la cantidad de nitrógeno en gramos y se multiplica por 6.25. Sin embargo este calculo no se aplica siempre porque hay proteínas como las globulinas del suero, que tienen el 17.2% de nitrógeno y en consecuencia el factor será 5.85. 4. ESTRUCTURA DE LAS PROTEINAS Cuando proteína que se hidroliza se va rompiendo en unidades más pequeñas hasta formar aminoácidos: Proteina H2O Proteosas H2O Peptonas H2O Polipeptidos H2O Dipeptidos H2O Aminoacidos Las cadenas de aminoácidos se estructuran en cinco niveles: Estructura primaria: comprende los enlaces covalentes entre aminoácidos, los enlaces peptidicos. Todas las proteinas tienen ésta estructura. Estructura secundaria: se refiere a la disposición de la secuencia de aminoácidos en el espacio. Los aminoácidos a medida que van siendo enlazados durante la ´sintesis de proteinas y gracias a la capacidad de giro de sus enlaces, adquieren una disposición espacial estable, denominada estructura secundaria. Estas disposiciones espaciales repetitivas generan hélices- y hélices-. Las uniones no son covalentes Estructura terciaria: Resulta de la disposición de la estructura secundaria de un peptido al plegarse sobre si misma, originando una conformación globular. Esta conformación se mantiene estable gracias a la existencia de enlaces entre las cadenas laterales de los aminoácidos que pueden ser puentes disulfuro, puentes de hidrógeno, interacciones electrostáticas, interacciones hidrofobas. Se forma espontáneamente y depende del tamaño, forma y polaridad de los aminoácidos que forman la proteina, los que interactuan entre si y con el medio en que se encuentran. Las uniones no son covalentes Estructura cuaternaria: Se refiere a las uniones entre diferentes polipéptidos o subunidades (protómeros) de una proteina global con estructura terciaria, para formar un complejo proteico. Las uniones no son covalentes. Estructura quinaria: Las proteinas se agrupan entre si o con otras biomoléculas para formar estructuras supramoleculares que tienen carácter permanente. 4.1. Estructura primaria La estructura primaria de una proteína está determinada por el número de aminoácidos y el orden en que están enlazados, lo que se conoce como secuencia de aminoácidos. Los enlaces peptídico que participan en la estructura de una proteína son covalentes y van constituyendo Elaborado por: Berta Inés Delgado Fajardo un esqueleto o cadena principal de la proteína a partir de la cual emergen las cadenas laterales de cada aminoácido. La estructura primaria es la que determina los niveles superiores de organización. Cys N-terminal N-terminal Phe Val Gly Ile Val Glu Gln Ser Leu Tyr Ile Cys Ser Gln Leu Cys Thr Asn Gln His Leu Cys Gly Ser His Leu Val Glu Asn Tyr Cys Asn C-terminal Tyr Glu Leu Ala Gly Cys Val Leu GluArg Gly Phe Phe Thr Lys Tyr Thr Pro C-terminal Fig.3. Estructura primaria de la insulina formada por dos cadenas polipétidicas El conocimiento de la secuencia de aminoácidos es muy importante para el estudio de su estructura y función. Desde el punto de vista funcional y filogenético es muy importante conocer la secuencia de aminoácidos porque cuánto más alejadas estén las especies en el árbol filogenético, mayores diferencias se observarán en la estructura primaria de las proteínas análogas pudiéndose establecer cómo han ido evolucionando con la aparición de nuevas especies. Es común encontrar que un mismo aminoácido aparece en la misma posición en las especies estudiadas (se conocen como aminoácidos invariantes o conservados) y son los que determinan la función y la estructura de la proteína. Cualquier cambio en ésa posición resulta letal para el organismo. Para la determinación de la secuencia de los aminoácidos en una proteína, los métodos más empleados son: el método de Edman, en el cuál se fundamenta el secuenciador de aminoácidos y el análisis de la secuenciación del DNA, que permite secuenciar una proteina. El método de Edman permite identificar cada aminoácido de la secuencia empezando por el extremo N-terminal. El método utiliza el fenilisotiocianato para generar una reacción con el aminoácido N-terminal del péptido produciendo un derivado feniltiohidantoinico y el resto del péptido sin modificar. De ésta forma se van determinando uno a uno los aminoácidos. Con base en ésta reacción opera el Secuenciador de aminoácidos que permite el análisis e identificación de las proteinas, incluidas posibles modificaciones posttraduccionales. Después que se ha separado el derivado feniltiohidantoinico-aminoácido (PHT-aminoácido, por la sigla en inglés) éstos se analizan por un sistema capilar de cromatografía de líquidos de alta resolución. El sistema permite análisis de proteinas a nivel subpicomolar, pero solamente detecta entre 30 y 50 aminoácidos. Para continuar el análisis del resto de proteina (cuando ésta tiene más de 50 aminoácidos) deberá hidrolizarse para obtener péptidos más pequeños y a partir de ellos realizar el análisis. Elaborado por: Berta Inés Delgado Fajardo 1. Reacción del grupo amino libre (N-terminal) con isotiocianato de fenilo H N N - CH - C - NH resto de cadena peptídica S C O R H H N C S N - CH - C - NH resto de cadena peptídica H O R H N C H S N - CH - C - NH resto de cadena peptídica O R Feniltiourea 2. hidrólisis ácida moderada origina la ciclización y expulsión de la cadena más corta del polipéptido S H C N S C H CH - C - NH resto de cadena peptídica R NH NH H2O NH CH - C - NH O R O resto de cadena peptídica H S H2O C N NH + NH2 resto de cadena peptídica CH - C R O Feniltiohidantoina Peptido con un aminoácido menos El análisis de la secuencia de ADN permite secuenciar una proteina teniendo en cuenta que cada grupo de tres bases de la secuencia del ADN especifica un aminoácido. El código genético (que es el mismo para todos los seres vivos) establece para cada grupo de tres nucleótidos (codón) el aminoácido que codifica. La tabla 2 muestra las primeras bases del codón, representadas por el color verde, el color naranja representa la segunda base y el color gris representa la tercera base. Elaborado por: Berta Inés Delgado Fajardo U C A G U Phe Phe Leu C Ser Ser Ser A Tyr Tyr STOP G Cys Cys STOP U C A Leu Ser STOP Trp G Leu Leu Leu Leu Ile Ile Ile Met Val Val Val Val U U C A G U C A G U C A G Pro Pro Pro Pro Thr Thr Thr Thr Ala Ala Ala Ala C His His Gln Gln Asn Asn Lys Lys Asp Asp Glu Glu A Arg Arg Arg Arg Ser Ser Arg Arg Gly Gly Gly Gly G Tabla 2. Bases que codifican aminoácidos 4.2. Estructura Secundaria La estructura secundaria es una estructura plegada debido a la formación de puentes de hidrógeno que se establecen entre los grupos C=O y NH de los enlaces peptídicos. Las conformaciones resultantes son de menor energía libre y por lo tanto más estables. Existen diferentes conformaciones que determinan la estructura secundaria: Conformación al azar Hélice Hoja Giros Conformación del colágeno Estructuras supersecundarias 4.2.1. Conformación al azar. En algunas proteinas no existen interacciones suficientes para constituir un orden superior al de estructura primaria, en éstos casos se clasifican como proteinas de conformación al azar. En ellas la secuencia de los aminoácidos se divide en subsecuencias que constituyen una región independiente denominada “dominio”. Estos dominios se caracterizan por la presencia del zinc y reciben el nombre de dedos de Zinc. Los dominios zinc fingers son elementos estructurales muy estables cuya particularidad es la coordinación de uno o más átomos de zinc a través de residuos de cisteínas e histidinas. Son muy comunes en proteinas que interaccionan con el ADN. A continuación se presenta un ejemplo general de la estructura de un dominio “dedo de zinc” Elaborado por: Berta Inés Delgado Fajardo C H C Zn C H Zn H C H Fig.4. Estructura general del dominio “dedo de Zinc” 4.2.2. Hélice Se forma al enrollarse helicoidalmente sobre si misma la estructura primaria. El enrollamiento se debe a la formación de enlaces de hidrógeno entre el grupo C=O (C1) del grupo carboxilo y el –NH del cuarto aminoácido que le sigue en la cadena polipeptídica. Para comprender la estructura secundaria llamada hélice- debemos tener claro que un polipétido está formado por una sucesión de planos péptidicos como se muestra en la figura 5. Fig.5. Configuración de los planos péptidicos La cadena peptídico a lo largo del esqueleto carbonado, C, C1 (del grupo carboxílico) y el nitrógeno (del enlace amídico) está en general libre de rotación sin embargo las rotaciones están representadas por los ángulo de torsión llamados phi (), psi (), aunque existe un tercer ángulo de torsión denominado omega (). Ver fig.6. El ángulo omega generalmente es de 180° debido a la interacción de los pares electrónicos libres del grupo carbonilo con el par electrónico del nitrógeno. El ángulo phi () mide el giro en torno al enlace que une al carbono alfa con el nitrógeno del plano anterior. El ángulo psi (): (C1) mide el giro en torno al carbono alfa unido al carbono del plano posterior Elaborado por: Berta Inés Delgado Fajardo Nitrógeno (phi) C C1 Nitrógeno C (psi) C1 Nitrógeno Figura 6. Ángulos de torsión en un segmento de la cadena peptídico La fig.7 es otra representación de un segmento de polipéptido donde se muestran las longitudes de enlace y las repeticiones de los angulos de torsión. Fig.7. Ángulos de torsión y longitudes de enlace en un segmento de polipéptido. La conformación global de un polipéptido está definida por los ángulos phi y psi. No todos los valores están permitidos porque se generarían fuertes choques estéricos. El diagrama de Ramachandran1 se utiliza para establecer los valores permitidos para phi y psi, en los cuales se sitúan la mayoría de los aminoácidos en las proteinas. Para el caso de la hélice-, los valores permitidos están alrededor de -60 y -50. Esta conformación facilita la formación de puentes de hidrógeno entre el grupo carbonilo (C=O) del residuo i y el nitrógeno del residuo i+4, como se observa en la figura 8. las hélices dan una vuelta cada 3.6 aminoácidos y las cadenas laterales salen hacia fuera del cilindro. Las hélices tienen una longitud promedio de 12 aminoácidos y son de configuración R. Las estructuras de hélice- no contienen el aminoácido prolina por el impedimento estérico del anillo y porque el nitrógeno de éste aa no puede formar puentes de hidrógeno. Los aminoácidos Lys y Glu desestabilizan la hélice-, debido a que los puentes de hidrogeno pierden importancia frente a las fuertes interacciones electrostáticas de atracción y repulsión. Por lo anterior la estructura hélice- predomina a valores de pH en que los grupos ionizables no estén cargados. 1 Ramachandran utilizó un modelo computarizado para pequeños polipéptidos, variando sistemáticamente phi y psi con el fin de encontrar la conformación más estable. Elaborado por: Berta Inés Delgado Fajardo Fig.8. Puentes de hidrógeno en una estructura hélice- La estructura hélice- se encuentra en proteinas fibrosas como la miosina (proteina del músculo) la -queratina (proteina del cabello) la lana y las uñas. 4.2.3. Hoja En ésta disposición los aminoácidos forman una cadena en zigzag denominada disposición de lámina plegada o lámina . Esta estructura se genera cuando dos o más aminoácidos consecutivos de una proteina adoptan ángulos phi de -140 y psi de +130. En éste caso aparece solo una hebra . Cuando éstas dos hebras se sitúan una al lado de la otra y forman puentes de hidrógeno entre ellas, se configura la lámina . Todos los grupos C=O y NH, forman puentes de hidrógeno con las hebras adyacentes. Cada lámina tiene un promedio de cinco hebras y cada hebra tiene un promedio de cinco residuos de aminoácidos. Las láminas pueden ser paralelas, antiparalelas y mixtas. Esta estructura se encuentra en la fibroina de la seda. Las láminas paralelas se presentan cuando los enlaces nitrógeno-carbono, tienen el mismo sentido, ver fig. 9 Elaborado por: Berta Inés Delgado Fajardo Fig. 9. Lámina paralela Cuando las hebras tienen diferente sentido, la hoja resultante se denomina antiparalela. Ver fig.10. Fig.10. Lámina antiparalela 4.2.4. Giros Los giros son abundantes en las proteinas globulares y generalmente ocurren en la superficie de la molécula en la región donde el polipéptido forma un enlace por puente de hidrógeno entre el grupo carbonilo, C=O y el hidrógeno del nitrógeno i+3. En éstos giros abunda la Gly, Asn y Pro. Elaborado por: Berta Inés Delgado Fajardo 4.2.5. Estructura del colágeno Es una proteina fibrosa en la que se repiten periódicamente grupos de tres aminoácidos: GlyPro(o hidroxiprolina)-cualquier otro aa. La presencia de la prolina condiciona el enrollamiento de la proteina en forma de hélice levógira. La presencia de la glicina, aa caracterizado por no tener cadena lateral, permite el acercamiento de otras hélices de tal forma que tres hélices levógiras se asocian para formar un helicoide dextrógiro. Las moléculas de colágeno se asocian por interacciones hidrófobas para formar largas filas que están entrecruzadas. El entrecruzamiento se debe a los residuos de lisina que se oxidan y experimentan una condensación aldólica. La estructura triple helicoidal es la responsable de sus fuerzas de tensión. -terminal -terminal x, y: corresponden a los residuos de prolina e hidroxiprolina Fig.11. Estructura del colágeno El colágeno está presente en todos los animales multicelulares y es la proteina más abundante de los vertebrados. Es extracelular, las fibras son insolubles y resistentes a la tensión, está presente en huesos, cartílagos, tendones, ligamentos, piel y vasos sanguíneos. En los mamíferos hay 17 cadenas polipeptídicas diferentes que forman distintos tipos de moléculas de colágeno. 4.2.6. Estructuras supersecundarias Estas clases de estructuras se generan cuando las estructuras secundarias no se combinan al azar sino que antes de alcanzar la estructura terciaria, siguen una serie de patrones que se repiten entre los distintos tipos de proteina. Estos patrones reciben el nombre de motivos estructurales, plegamientos o estructuras supersecundarias. La estructura supersecundaria puede pertenecer a una unidad mayor denominada dominio y puede tener diferente función en proteinas diferentes. Las diferentes estructuras supersecundarias pueden estar formadas solo por hélices, solo por hojas o por una combinación de ambos. En la tabla 3, se relacionan algunos de los modelos de mayor interés. Elaborado por: Berta Inés Delgado Fajardo Tabla 3. Estructuras supersecundarias de las proteinas Estructura Clase de estructura Características supersecundaria supersecundaria formada por ↓ Hélice-giro-hélice Formadas por dos hélices cortas, unidas entre si por un giro (frecuentemente ) Hélices arrolladas (coiled-coil) Está formada por dos hélices largas yuxtapuestas que interaccionan entre si. La interacción puede establecerse a través de leucinas, formándose una especie de cremalleras de leucinas. Mano EF Formada por dos hélices cortas, conectadas por un giro y con un átomo de calcio en el giro. Reciben el nombre porque asemejan una mano cogiendo una bola. Hélices- Importancia Características de las proteínas que interaccionan con el ADN La cremallera sirve para unir dos monómeros con el fin de formar una estructura cuaternaria o para interaccionar con el ADN. Característica de proteínas que unen calcio Esquema estructural Elaborado por: Berta Inés Delgado Fajardo Continuación: Tabla 3. Estructuras supersecundarias de las proteinas Estructura supersecundaria formada por ↓ Clase de estructura supersecundaria Horquilla Meandro Hélices Barril -- Plegamiento de Rosmann Hélices y Hojas Características Importancia Formadas por dos hojas antiparalelas, conectadas por medio de un segmento con estructura al azar Se encuentra frecuentemente en las proteínas pero aun no se le ha descubierto alguna función concreta. Formada por varias hojas antiparalelas , conectadas por un giro y por estructuras al azar. Presente en proteínas globulares. Formada por muchas hojas orientadas de forma antiparalela. Los residuos hidrofóbicos se orientan hacia el interior y la apariencia exterior es similar a un barril. Este dominio se presenta en la proteína que une retinol. Ocho hojas van adoptando la configuración de barril y en su interior alojan el retinol, que solamente deja por fuera el grupo hidroxilo. Formada por dos hojas orientadas paralelamente mediante un segmento y dos segmentos con estructura al azar. Es similar a la estructura - - , pero tiene más de dos subunidades Se encuentra frecuentemente en las proteínas unidas a nucleótidos. Esquema estructural Elaborado por: Berta Inés Delgado Fajardo 4.3. Estructura Terciaria. La estructura terciaria de la proteína es la forma en la que se organizan en el espacio los diferentes tramos de la cadena polipeptídica, que pueden tener una estructura secundaria definida, como las hélices- o las hojas-, o no tenerla. Están representadas por los enrollamientos o superplegamientos de la estructura secundaria, constituyendo formas tridimensionales geométricas muy complicadas que se mantienen por enlaces fuertes. Las fuerzas que mantienen la estructura terciaria son las fuerzas no covalentes y las fuerzas covalentes. Las fuerzas no covalentes son: - Efecto hidrofóbico - Enlaces de hidrógeno - Interacciones iónicas o salinas Las fuerzas covalentes son: - Enlace disulfuro - Enlace amida Desde el punto de vista funcional, esta estructura es la más importante pues, al alcanzarla es cuando la mayoría de las proteinas adquieren su actividad biológica o función. Un ejemplo es la fosfatasa alcalina, proteina con muchos niveles de estructura. Está formada por dos cadenas de polipéptidos que al plegarse contiene regiones considerables de estructuras secundarias y y regiones menos plegadas de espiral aleatoria. Fig.12. Estructura terciaria de la fosfatasa alcalina 4.4. Estructura Cuaternaria La estructura cuaternaria es el nivel de formación en el cual las unidades de estructura terciaria se agregan para formar homomultímeros (formados por subunidades idénticas, ejemplo el dimero de HIV-proteasa) o heteromultímeros (las subunidades no so idénticas, ejemplo la insulina, formada por dos cadenas una alfa y otra beta enlazadas por puentes disulfuro). La estructura cuaternaria es muy común en el caso de las enzimas. Se presenta en las proteinas que contienen múltiples cadenas de polipéptidos. Las fuerzas que mantienen Elaborado por: Berta Inés Delgado Fajardo la estructura cuaternaria son las mismas que estabilizan la estructura terciaria. Un ejemplo es la proteina piruvato deshidrogenada, que se localiza en las mitocondrias, contiene 72 cadenas polipeptídicas. La hemoglobina que se muestra en la figura 13 es otra proteina con estructura cuaternaria. Fig.13. Los cuatro niveles estructurales de la hemoglobina 4.5. Estructura quinaria La estructura quinaria o supramolecular comprende dos grandes grupos: asociaciones entre proteínas y asociaciones con otras biomoléculas. La tabla 4 presenta las clases de proteínas con estructura quinaria según la asociación a la que pertenecen. 5. Clasificación de las proteínas Las proteinas se clasifican según su composición, según su conformación y según su función. Ver tabla 5. Elaborado por: Berta Inés Delgado Fajardo Tabla 4. Estructura quinaria de las proteinas Clase de Asociación Proteína-proteína Compuestos que se asocian Características y -tubulina Forman dímeros que se ensamblan para formar filamentos huecos (microtúbulos) Estructural. Forman parte de: citoesqueleto de las células, del centríolo (que participa en la mitosis) de los cilios y de los flagelos que participan de la motilidad celular. La malla es característica del trombo o coagulo sanguíneo Monómeros de fibrina: se unen por enlaces covalentes para formar la malla tridimensional Proteoglicano también llamado mucopolisacárido : El compuesto glicosídico es superior al 90%. Está formado por dos galactosas y una xilosa N-acetilada que se une a la proteína. ProteinaBiomolécula Proteína-azúcar Peptido glicano: Formado por una trama de estructuras de polisacáridos paralelas (residuos alternos de N-acetilglucosamina y N-acetilmurámico) unidos covalentemente a un tetrapéptido, caracterizado por poseer D-aminoácidos. Los tetrapéptidos se unen a través de un pentapéptido formado por cinco glicinas Esquema Proteina H NH OH OH H OH OH OH O H H OH OH OH O H OH H O H OH H H H H O - C -CH H OH H C=O Proteina Elaborado por: Berta Inés Delgado Fajardo Continuación: Clase de Asociación Tabla 4. Estructura quinaria de las proteinas Compuestos que se asocian Proteínas-Lípidos Proteínasbiomoléculas Proteínas-Ácidos nucleicos Características Esquema Esta asociación origina supramoléculas conocidas como lipoproteínas del plasma sanguineo y de las membranas biológicas Originan las supramoléculas: ribosomas, nucleosomas y virus ARNm Cadenas de aminoácidos Ribosoma Nucleosoma Virus Elaborado por: Berta Inés Delgado Fajardo Tabla 5 Clasificación de las Proteínas Clasificación Simples Según su composición Conjugadas Subclase - Ejemplos Prolaminas: Zeina (maiz), gliadina (trigo), hordeina (cebada) Globulares Gluteninas: Glutenina (trigo), orizanina (arroz) Albúminas: Seroalbúminas (sangre), ovoalbumina (huevo), lactoalbumina (leche) Hormonas: Insulina, prolactina, tirotropina. Enzimas: Hidrolasas, oxidasa, ligasas, liasa, transferasas Colágenos: En tejidos conjuntivos, cartilaginosos Fibrosas Queratinas: En formaciones epidérmicas Elastinas: En tendones y en vasos sanguíneos Fibroinas: En hilos de seda Nucleoproteínas Nucleosomas de la cromatina, ribosomas Lipoproteínas Transportan lípidos en sangre Metaloproteinas Hemoglobina, hemocianina y mioglobina (transportan oxígeno). Citocromos (transportan electrones) Glucoproteinas Ribonucleasa, mucoproteinas, anticuerpos, hormona luteinizante Fosfoproteinas Caseína (leche) Elaborado por: Berta Inés Delgado Fajardo Continuación: Tabla 5. Clasificación de las proteínas Clases Fibrosas (cadenas polipeptídicas alineadas en forma paralela, que se entrecruzan de dos formas diferentes) Según su conformación2 Globulares 2 Hélices- (fibras que se trenzan sobre si mismas) Láminas- Ejemplos y características Colágeno de los Son los principales soportes tendones y estructurales de los tejidos. queratina del Son insolubles en agua y en cabello soluciones salinas diluidas. -queratina de la seda (formación de láminas) Conformaciones de Enzimas cadenas polipeptídicas Hemoglobina enrolladas sobre si mismas. Ovoalbúmina y seroalbúminas Resistentes a los factores que las desnaturalizan Son solubles en agua. Sus principales funciones son el transporte y la catálisis Se entiende por conformación la orientación tridimensional que adquieren los grupos característicos de una molécula en el espacio, en virtud de la libertad de giro de éstos sobre los ejes de sus enlaces Elaborado por: Berta Inés Delgado Fajardo Continuación: Tabla 5. Clasificación de las proteínas Clases Características Proteínas de transporte Transportan: Oxígeno, electrones y CO2 Según su función Proteínas de movimiento coordinado Proteínas estructurales o de soporte Provocan contracciones musculares Colágeno -queratina Anticuerpos Proteínas altamente específicas Proteoreceptores Rodopsina Ejemplos Hemoglobina Citocromos En el caso de la hemoglobina el metal ( hierro) coordina con el oxígeno para su transporte Tienen la capacidad de modificar su estructura de acuerdo con el cambio en el ambiente electroquímico que las rodea Proteínas fibrosas Constituyen la estructura de soporte de muchos tejidos (huesos, tendones) Identifican sustancias extrañas como virus, bacterias y otros organismos. Participan en recepción de impulsos nerviosos Presente en los bastoncillos de la retina del ojo. Participan en la recepción de impulsos nerviosos